Equalis kvalitetssäkringsprogram 2018 Meticillinresistenta Staphylococcus aureus Christina Welinder Olsson Equalis användarmöte 12 mars 2019
Meticillinresistenta Staphylococcus aureus MRSA 2018:01A-E Molekylärbiologisk metodik 18 laboratorier (inkl 4 lab mol+odl) Detektion av nuc gen/sa442 S. aureus meca gen - för meticillin-resistens orfx+ SCCmec samtidig detektion S.aureus resp meticillin-resistens Odlingsdiagnostik (utan molekylärbiologi) 2 laboratorier Fenotypisk detektion samt resistensmetodik ev kompletterat med molekylärbiologi från externt laboratorium 2
5 prov, ampuller, med varierande innehåll MRSA, MSSA, KNS Planerat arbetssätt Dag 0 Dag 1 37 C 16 tim + 2ml buljong 100 mikrol Dag 0 Kontroll av sensitivitet PCR Kontroll av anrikningsbuljong 3
Avsikt Molekylärbiologisk metod Testa hela analyskedjan inklusive anrikningsbuljong, sensitivitet och specificitet för molekylärbiologisk metod kunna ge snabba, ffa negativa, svar till vården Med PCR dag 0 (utan anrikning) testas ffa sensitivitet PCR metodik Odling på platta dag 0 (om växt så snabbare isolera koloni) Med PCR/odling dag 1 testas anrikningsbuljongen Närvaro av MSSA: vid för låg antibiotika konc i buljongen svårt skilja MRSA från MSSA vid isolering av koloni dag 1 Närvaro av KNS: finns meca positivitet växer dessa också i buljongen och kan störa vid verifiering av MRSA koloni Flera laboratorier har gått över till screening via chromagarplattor 4
Molekylärbiologisk metod för MRSA screening (tot 18 laboratorier har lämnat svar) Prov 2018:01A-E Konc S.aureus Nuc-gen pos Konc MRSA Nuc-gen pos Misstänkt MRSA dag 0 Förväntat svar dag 1 A B C D E CFU/ml CFU/ml CFU/ml CFU/ml CFU/ml - - 5,3x10 3 4,4x10 3 3x10 6 S. argenteus - 4x10 2 3x10 2 4x10 3-0/18 1/18 1/18 2/18 6/18 18/18 18/18 17/18 18/18 10/18 Id S. argenteus I alla prov finns dessutom S. lugdunensis + S. epidermidis i varierande mängd. 5
Prov E: Vad är rätt svar? Stapfylococcus argenteus beskrevs först 2002 som en klon av Staphylococcus aureus Benämns 2011 som en egen art (prod ej staphyloxantin) Beskrivs i flera nyligen publicerade artiklar som lika patogen som Staphylococcus aureus Förekommer mellan 0,16% (Europa) - 18,6% (Asien) i olika stamkollektioner Ref gruppen bakteriologi rekommenderar att inte specifikt justera metodik för att undvika detektion av Staphylococcus argenteus 6
Använder ditt laboratorium Maldi-tof för artbestämning Staphylococcus aureus innan MRSA besvaras? 1. Ja 2. Nej, använder annan verifieringsmetod t. ex. PCR 3. Vet ej Svara via Mentometer i www.trippus.net/mikro2019
Summering Metod Molekylär 18 laboratorier: Dag 0: Nuc positivitet kunde gärna detekteras av fler lab i prov E men har sannolikt en förklaring i primerdesign. Alla Nuc gener är inte identiska. Dag 1: Prov B och D, 18/18 laboratorier hittar MRSA efter anrikning. Dag 1: Prov C, 17/18 laboratorier hittar MRSA efter anrikning Dag 1: Inget laboratorium påvisar MRSA i prov A Dag 1: Åtta laboratorier anger prov E felaktigt som MRSA. (S. argenteus) Metod odling 2 laboratorier: Båda två laboratorierna anger prov E felaktigt som MRSA Ett laboratorium detekterar inte MRSA i prov B och C 8
Equalis kvalitetssäkringsprogram 2018 Vancomycinresistenta enterokocker Christina Welinder Olsson Equalis användarmöte 12 mars 2019
Vancomycinresistenta Enterokocker, VRE 2018:01/A - E Prov B: vana positiv stam med högt MIC för vancomycin Prov D och E: vanb producerande stam (den stam som orsakat utbrott på flera sjukhus i Sverige under 2018) i två olika koncentrationer Prov C: Vancomycin-variabel Enterokock (VVE) E. faecium som inte fenotypiskt uttrycker den vana gen som den bär på. Proven förväntades på lab analyseras efter anrikning i vancomycininnehållande buljong med efterföljande PCR för vana/vanb, och utodling på selektiv agar. 10
Vancomycinresistenta Enterokocker, VRE 17 svarande laboratorier prov innehåll Korrekt resultat 2018:01/A E. coli ATCC 25922 Neg:17/17 2018:01/B E. faecium CCUG 36804 + E. coli ATCC 25922 2018:01/C E. faecium (VVE) + E. coli ATCC 25922 2018:01/D E. faecium + E. coli ATCC 25922 Pos:17/17 Neg:17/17 Pos:16/17 2018:01/E E. faecium + E. coli ATCC 25922 Pos:16/17 11
Detektion av i svensk sjukvård nu cirkulerande stammar av VRE Summering: 18 deltagande laboratorier (1 lab har ej svarat) Samtliga laboratorier som levererat resultat har rapporterat korrekt resultat på prov A, D och E och de allra flesta hade rätt på de övriga 2 proverna. Bara tre felaktigheter kunde noteras tillhörande prov D och E. Inget lab detekterade VRE i prov C Detta utskick ger stöd för att deltagande laboratorier har en god förmåga att detektera VRE med de metoder som används. 12
Eftersom det finns risk att stammar av VVE typ utvecklar fenotypisk resistens och att de inte upptäcks med fenotypiska metoder har det förslagits att alla invasiva E. faecium ska testas med molekylärbiologisk analys avseende vana/vanb för att utesluta att isolatet har variabel vancomycinresistens. Gör ditt laboratorium detta? 1. Ja 2. Ja - i perioder 3. Nej, aldrig 4. Vet ej Svara via Mentometer i www.trippus.net/mikro2019
VRE 2018 Prov Stam i provmaterial Resistensmekanism VAN MIC resultat 2018:01/A E. coli ATCC 25922 - - Neg: 17/17 2018:01/B E. faecium CCUG 36804 + vana >256 mg/l VRE påvisad: 17/17* E. coli ATCC 25922 2018:01/C E. faecium (VVE) + E. coli ATCC 25922 vana - VRE ej påvisad 2018:01/D 2018:01/E E. faecium + E. coli ATCC 25922 E. faecium + E. coli ATCC 25922 vanb 8-32 mg/l VRE påvisad vanb 8-32 mg/l VRE påvisad 14
Equalis kvalitetssäkringsprogram 2018 Urinodling Annika Wistedt Equalis användarmöte 12 mars 2019
Urinodling 2018:01 Prov Förväntat resultat, CFU/L Rätt art Rätt mängd Relevant A S.saprophyticus, 2x10 7 22/22 <10 6 1/22 >10 6 7/22 >10 7 12/22 >10 8 2/22 Ja 22/22 Tveksamt - Nej - 16
Urinodling 2018:01 Prov Förväntat resultat, CFU/L Rätt art Rätt mängd Relevant A S.saprophyticus, 2x10 7 22/22 <10 6 1/22 >10 6 7/22 >10 7 12/22 >10 8 2/22 B E.coli, 1x10 7 22/22 <10 6 3/22 >10 Text 6 18/22 >10 7 1/22 >10 8 - Ja 22/22 Tveksamt - Nej - Ja 19/22 Tveksamt 3/22 Nej - 17
Urinodling 2018:01 Prov Förväntat resultat, CFU/L Rätt art Rätt mängd Relevant A S.saprophyticus, 2x10 7 22/22 <10 6 1/22 >10 6 7/22 >10 7 12/22 >10 8 2/22 B E.coli, 1x10 7 22/22 <10 6 3/22 >10 Text 6 18/22 >10 7 1/22 >10 8 - C K.pneumoniae, 4x10 7 Enterobacter, sp.nov. 3x10 7 22/22 (2/22) <10 6 1/22 >10 6 5/22 >10 7 15/22 >10 8 1/22 Ja 22/22 Tveksamt - Nej - Ja 19/22 Tveksamt 3/22 Nej - Ja 12/22 Tveksamt 6/22 Nej 4/22 18
UK Standards for Microbiology Investigations (UK SMI) 19 https://www.gov.uk/government/collections/standardsfor-microbiology-investigations-smi
Urinodling 2018:01 Prov Förväntat resultat, CFU/L Rätt art Rätt mängd Relevant A S.saprophyticus, 2x10 7 22/22 <10 6 1/22 >10 6 7/22 >10 7 12/22 >10 8 2/22 B E.coli, 1x10 7 22/22 <10 6 3/22 >10 Text 6 18/22 >10 7 1/22 >10 8 - C K.pneumoniae, 4x10 7 Enterobacter, sp.nov. 3x10 7 22/22 (2/22) <10 6 1/22 >10 6 5/22 >10 7 15/22 >10 8 1/22 D C.freundii, 6x10 7 19/22 <10 6 - >10 6 3/22 >10 7 15/22 >10 8 3/22 Ja 22/22 Tveksamt - Nej - Ja 19/22 Tveksamt 3/22 Nej - Ja 12/22 Tveksamt 6/22 Nej 4/22 Ja 12/21 Tveksamt 1/21 Nej - 20
Art och bedömning av ESBL Klass A kromosomalt betalaktamas Klass C kromosomalt betalaktamas 21
Instruktioner för urinodling extern kontroll Utförande av analys Tillsätt 1 ml PBS eller buljong till varje ampull Odla ut och inkubera som om det vore ett urinprov i rutindiagnostiken Identifiera fynden till den nivå ni gör i rutindiagnostiken Kvantifiera samtliga fynd i CFU/L Registrera resultaten på Equalis online. Ange samtliga fynd i rapporten även om detta skiljer sig från er normala rutin. Ange er bedömning av klinisk relevans för varje fynd i relation till anamnes. Fynd som ej hade ingått i er kliniska svarsrapport kan anges som EJ relevant. Ange i rapporten vilket medium som används för bedömning av kvantitet (namn och fabrikat) 22
Hur anger ni mängd i svarsrapporten för urinodling? 1. CFU/L 2. CFU/mL 3. Rikligt/ måttligt/ sparsamt 4. Inget av ovanstående Svara via Mentometer i www.trippus.net/mikro2019
Hur kommunicerar ni tveksamma fynds relevans till beställaren? 1. Genom att inte ange art, tex blandflora 2. Genom att inte resistensbestämma 3. Genom att kommentera fynden 4. Samtliga ovanstående 5. På annat sätt Svara via Mentometer i www.trippus.net/mikro2019