Expertgruppen för medicinsk mikrobiologi EQUALIS-representanter Eva Burman, Karin Dahlin-Robertsson och Keng-Ling Wallin.

Transkript

1 Expertgruppen för medicinsk mikrobiologi 2010 Kåre Bondesson Uppsala Maria Brytting Stockholm (SMI) Eva Hedvall Malmö Torbjörn Kjerstadius Karlstad Ilona Lewensohn-Fuchs Stockholm Inger Ljungström Stockholm (SMI) Kerstin Malm Örebro Magnus Thore Västerås (SMI) Ordförande Christina Welinder-Olsson Göteborg Avgågna: Sture Löfgren och Ralfh Wollin EQUALIS-representanter Eva Burman, Karin Dahlin-Robertsson och Keng-Ling Wallin Magnus Thore 1

2 Bakteriologi Vad har vi lärt oss av utskicken 2009? Blododling (bakt + svamp) 4 utskick Fecesodling Sputumodling Urinodling Antikroppsbestämning Syfilis (Lues)diagnostik Nukleinsyradetektion GAS 1 utskick 1 utskick 1 utskick 5 utskick 1 utskick 5 utskick 2 utskick Magnus Thore 2

3 Vad har vi lärt oss av utskicken 2009? Virologi 16 utskick Diagnostik av herpes simplex, Varicella-zoster, morbilli, parotit, influensa, calicivirus, parvo B19, RSV, HIV/HTLV, CMV/EBV, adeno-rota, blodsmittescreen) Isolering Antikroppsbestämning Antigendetektion Nukleinsyrapåvisning (influensa) (9 olika virus) Magnus Thore 3

4 EQUALIS-utskick 2009 Blododling Sputumodling Urinodling HP-antigen i feces Magnus Thore Magnus Thore 4

5 Blododlingsutskick 2009, EQUALIS Utskick 4 gånger/år Frystorkade prover för detektion och identifiering av bakterier och jästsvamp Magnus Thore 5

6 Blododlingsutskick 2009, EQUALIS /1&2; Haemophilus influenzae, Clostridium perfringens /1&2; Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes /1&2; Pasteurella multocida, Streptococcus oralis /1&2; Escherichia coli+candida albicans, 0 mikroorganism Magnus Thore 6

7 Blododlingsutskick /1 NPU ATCC33391 Haemophilus influenzae (CCUG57574) 27 CFU/ampull Stigande CRP hos 76-årig kvinna, nyligen cytostatikabehandling. H influenzae - Minimikriterier: infektioner utom pneumoni är anmälningspliktig och drabbar ett hundratal/år. Oftast äldre med nedsatt immunförsvar. Serotyper andra än b eller ej typbara. Barnvaccination sedan Beskrivs i flera artiklar i referensmetodiken (CNS, Hudmjukdelar, NLI) 27/27 labb svarade H. influenzae Beskriv gärna använd metodologi! Magnus Thore 7

8 Magnus Thore 8

9 Blododlingsutskick /2 NPU ATCC12344 Streptococcus pyogenes (CCUG58107) 13 CFU/ampull 81-årig kvinna med feber >40 grader. Streptococcus pyogenes. Accepterad nomenklatur enligt referensmetodiken: Streptococcus pyogenes S. pyogenes Grupp A streptokocker (GAS) Invasiva infektioner är anmälningspliktiga Minimikriterier : Betahemolys på blodagar, (bacitracinpositiv möjlig screening, specificitet <80 %), agglutination (Lancefieldantigen A ) 25/27 labb svarade S. pyogenes (eller motsvarande) 2/27 labb angav annan diagnos Magnus Thore 9

10 Blododlingsutskick /2 NPU ATCC3037 Streptococcus oralis (CCUG58449) 5 CFU/amp 40-årig man med brännskada, stigande feber S. oralis hör till S. mitis-gruppen tillsammans med minst 8 andra arter (plus pneumokocker). Bakterierna beter sig kliniskt likartat, finns i munhålan, GI-kanalen och kvinnliga genitalia. Enstaka fynd i blod oftast förorening, men kan ge endokardit. Minimikriterier saknas. Kommersiella brickor och sekvensering otillförlitliga. Försök bara att klassificera alfastreptokocker till grupp, arten oftast fel! (ASM-manual) 1/24 labb svarade S. oralis 9/24 labb svarade andra arter inom gruppen 8/24 labb svarade alfastreptokocker eller annat Magnus Thore 10

11 Streptococcus anginosus gruppen Streptococcus mitis -gruppen Streptococcus salivarius -gruppen (S. anginosus, S. constellatus, S. intermedius) (S. mitis, S. sanguinis, S. parasanguinis, S. gordonii, S. cristacus, S. oralis, S. infantis, S. peroris, S. pneumoniae!!) (S. salivarius, S. vestibularis) Streptococcus mutans gruppen Streptococcus bovis -gruppen (S. mutans, S. sobrinus, S. criceti, S. ratti + 5 andra djurarter) (S. equinus, S. gallolyticus, S. lutetiensis, S. alactolyticus) Magnus Thore 11

12 Blododlingsutskick /1 NPU ATCC11775 Escherichia coli (CCUG58927) 100 CFU/ampull och Candida albicans (CCUG 58928) 10 CFU/ampull 72-årig kvinna med sarkoidos, feber och hosta som kräver IVA-vård Medeldetektionstiden för E. coli var timmar, jästsvamp kräver inkubering två dygn eller mer enligt tidigare utskick. Förlängd inkubationstid rekommenderas vid misstanke om jästsvamp. Bactecsystemet har särskilda svampflaskor. 24/25 labb identifierade E. coli 0/25 labb identifierade jästsvampen Magnus Thore 12

13 Sputumutskick /1-5 Fem fingerade sputumprov för odling; två ampuller innehöll Legionella pneumophila, de övriga pneumokocker (två ampuller) och H. influenzae. 13/16(23)deltagare angav att man följer referensmetodiken (I2, 2:a upplagan, 2005) 2/16 tvättar sputum (OBS! Signifikansgränser) 15/16 sputolysinbehandlar sputum Relevansgräns tvättat prov: 10 8 CFU/L Relevansgräns otvättat prov: 10 9 CFU/L Gäller ej Legionella! Magnus Thore 13

14 Magnus Thore 14

15 Sputumutskick / /1-2; Pneumoni i samband med hotellvistelse Kreta (L. pneumophila cirka10 8 CFU/L). 13/13 svarade korrekt på renkulturen (amp 1) 10/13 svarade korrekt när kontaminerande flora tillsats (amp 2) 10 labb skulle ha skickat till annat labb Alla med förväntat svar angav att fynden var relevanta Magnus Thore 15

16 Urinodling utskick /1-4 Fyra ampuller med KNS Gardnerella vaginalis Lactobacillus crispatus Escherichia coli 10 7 CFU/L 3x10 7 CFU/L 6x10 7 CFU/L 5x10 6 CFU/L Magnus Thore 16

17 Magnus Thore 17

18 Magnus Thore 18

19 Urinodling utskick /1-4 Fyra ampuller med KNS Gardnerella vaginalis Lactobacillus crispatus Escherichia coli 10 7 CFU/L 3x10 7 CFU/L 6x10 7 CFU/L 5x10 6 CFU/L KNS; 24/27 korrekt diagnos, 6 ansåg fynd relevant Gardnerella; 22/27 korrekt diagnos, 9 ansåg fynd relevant Lactobacillus; 19/27 korrekt diagnos, 1 ansåg fynd relevant E. coli: 27/27 korrekt diagnos, 22 ansåg fynd relevant Magnus Thore 19

20 Magnus Thore 20

21 Magnus Thore 21