ACKREDITERING AV MALDI-TOF FÖR MASTITPATOGENER. Anna Eriksson, labingenjör Enheten för bakteriologi, Mastilaboratoriet

Transkript

1 ACKREDITERING AV MALDI-TOF FÖR MASTITPATOGENER Anna Eriksson, labingenjör Enheten för bakteriologi, Mastilaboratoriet

2 Mastit (juverinflammation) Är den mest förlustbringande sjukdomen bland Sveriges mjölkkor och utgör utslagsorsak hos ca 1/4 av korna. Under ett år drabbas drygt 60 procent av korna av mastit i någon form. Sjukdomen är av komplex natur med många faktorer inblandade. Vid de flesta mastiter föreligger en bakteriell infektion. Mastiter kan vara av subklinisk eller klinisk karaktär.

3 Antalet mjölkkor i Sverige har sedan början av 60-talet sjunkit från cirka till nuvarande nivå på kor. Den enskilda kons produktion har under motsvarande period fördubblats och hennes värde har därigenom ökat

4 ORSAKER TILL PROVTAGNING Klinisk juverinflammation Subklinisk juverinflammation Besättningsundersökning Efter kalvning, för att kunna gruppera Kontroll efter behandling Försäljning Inför sinläggning

5 Mastit- ett kostsamt problem Veterinärbesök Mediciner Kasserad mjölk Extra skötsel, förändrade rutiner Produktionsbortfall Ökad nyrekrytering

6 2011 odlades ca juverdelsprover på mastitlaboratoriet SVA Provtyper: Mjölk i provrör Mastistrip Verifiering av platta Övrigt (miljöprover etc) PCR

7 MALDI-TOF till SVA Inköpt SVA december 2011 Mars 2012 MALDI-TOF grupp (6 pers) Kemist expert (Ulf Bondesson) Veterinär (Erik Eriksson) 4 användare (Anna Eriksson, Annica Landén, Lena Lundgren, Eva Säker) Utvärdering av MALDI-TOF för typning av bakterier - Zoonotiska agens - Veterinärmedicinsk intressanta bakterier

8 UTVÄRDERING MALDI-TOF GRUPPEN 1. Typa väl definierade referensstammar 2. Typa bakterier i utvalda små projekt 3. Typa bakterier med MALDI-TOF från rutindiagnostik parallellt med ordinarie typning

9 Projekt Fiskbakterier från svenska vatten Staph hyicus Enterokocker Dichelobacter nodosus Staph intermedius/pseudointermedius

10 Projekt forts. Baktrutin aerob/anaerob Campylobacter Mastitrutin Koagulasnegativa stafylokocker

11 Mastitrutinstammar Stafylokocker namn rutin namn MALDI-TOF antal min score max score Staph. aureus Staph. aureus 50 2,179 2,472 KNS Staph. chromogenes 6 2,242 2,399 KNS Staph. cohnii 3 1,954 2,008 KNS Staph. epidermidis 4 2,142 2,259 KNS Staph. haemolyticus 2 2,014 2,069 KNS Staph. hominis 1 2,254 2,254 KNS Staph. sciuri 1 2,111 2,111 KNS Staph. simulans 5 2,181 2,359 KNS Staph. warneri 1 2,127 2,127

12 Mastitrutinstammar namn rutin namn MALDI-TOF antal min max Str. dysgalactiae Str. dysgalactiae 17 2,113 2,392 Str. uberis Str. uberis 14 2,034 2,309 E. coli E. coli 9 2,247 2,439 Arc. pyogenes Trueperella pyogenes 3 2,006 2,118 Enterococcus spp Lactococcus garvieae 1 2,168 2,168 Enterococcus spp Enterococcus faecalis 1 2,468 2,468 Candida Jäst palmioleophila 2 2,121 2,233 Klebsiella pneumoniae Klebsiella pneumoniae 1 2,487 2,487 Citrobacter freundii Citrobacter freundii 1 2,433 2,433 Coryne. bovis Coryne. bovis 1 2,004 2,004

13 Referensstammar Namn MALDI best match Score value Bacillus cereus Bacillus cereus 2,367 Bacillus subtilis Bacillus subtilis 1,955 Bordetella Bordetella bronchiseptica bronchiseptica 2,504 Candida albicans Candida albicans 2,108 Citrobacter freundii Citrobacter freundii 2,224 Clostridium difficile Clostridium difficile 2,326 Clostridium sporogenes Clostridium sporogenes 2,375 Enterococus feacalis Enterococcus faecalis 2,425 Erysipelothrix Erysipelothrix rhusiopathiae rhusiopathiae 2,015 Eschericha coli Escherichia coli 2,479

14 Fusob.necroph.ssp.nec. Fusob.necroph.ssp.nec. 2,233 Haemophilus influenzae Haemophilus influenzae 2,256 Histophilus somni Histophilus somni 2,113 Klebsiella pneumoniae Klebsiella pneumoniae 2,54 Klebsiella oxytoca Klebsiella oxytoca 2,387 Lactobacillus acidophilus Lactobacillus acidophilus 2,376 Listeria Monocytogenes Listeria monocytogenes 2,378 Mannheimia granulomatis Mannheimia granulomatis 2,226 Pasteurella multocida Pasteurella multocida 2,504 Proteus mirabilis Proteus mirabilis 2,507 Pseudomonas aeuroginosa Pseudomonas aeruginosa 2,517 Salmonella Dublin Salmonella anatum 2,477 Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus 2,384

15 Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus 2,403 Staphylococcus intermedius Staphylococcus intermedius 2,269 Staphylococcus pseudointermedius Staphylococcus intermedius 2,178 Staphylococcus simulans Staphylococcus simulans 2,272 Streptococcus agalactiae Streptococcus agalactiae 2,423 Streptococcus canis Streptococcus canis 2,129 Streptococcus dysgalactiae Streptococcus dysgalactiae 2,306 Streptococcus uberis Streptococcus uberis 2,163 Streptococcus zooepidemicus Streptococcus zooepidemicus 2,543 Truperella pyogenes Trueperella pyogenes 2,042 Yersinia entercolitica Yersinia entercolitica 2,348 Yersinia pseudotuberkulosis Yersinia pseudotuberculosis 2,279

16 Sammanfattning Fungerar mkt bra för bakterier inom mastitdiagnostik Bra även för de flesta bakterier klinisk veterinärmedicin Problem Skilja på vissa typer av bakterier Vissa bakterier Viktiga fiskbakterier Dichelobacter nodosus Lösning Förbättringar i databasen i samarbete med Bruker Daltonics Samarbete medandra veterinärinstitut

17 Tack för att ni lyssnade