Ackrediteringens omfattning - klinisk mikrobiologi

Transkript

1 Ackrediteringens omfattning - klinisk mikrobiologi Intern riktlinje Komponent/Undersökning Klinisk bakteriologi Clostridium difficile ribotypning Corynebacterium diphtheriae typning och toxinbestämning EHEC realtids-pcr Legionella pneumophila sekvensbaserad typning Legionella species artbestämning sekvensering av mip-genen Legionella species artbestämning med MALDI-TOF feces svalg, sår feces, blod, urin, livsmedel, miljöprov sputum,, borstprov, bronksekret, trakealsekret Sputum,, borstprov, bronksekret, trakealsekret sputum,, borstprov, bronksekret, trakealsekret PCR Biokemi Toxintest Sekvenator Ribotyp lika/olika Toxin påvisat/ ej påvisat Virulensgener påvisade/ e Mätosäkerhet FOLK Kvalitativ 6908 Kvalitativ 548 Kvalitativ 6773 Sekvenstyp Kvalitativ 4796 Kvalitativ 4797 Masspektrometri MALDI Biotyper Kvalitativ 7000 Utfärdat av: Charlotte Uggla Reg nr: FOLK4120 Version: 17 Godkänt av: Karin Tegmark-Wisell Giltigt från: Sidan 1 av 7

2 Mycobacterium tuberculosis komplexet typning Mycobacterium tuberculosis komplexet spoligotypning Mycobacterium tuberculosis komplexet resistensbestämning sputum,, biopsi, bronkialsekret, pleuravätska, vävnadsprov, abscess, punktat, ventrikelsköljvätska urin sputum,, biopsi, bronkialsekret, pleuravätska, vävnadsprov, abscess, punktat, ventrikelsköljvätska urin sputum,, biopsi, bronkialsekret, pleuravätska, vävnadsprov, abscess, punktat, ventrikelsköljvätska urin fragmentanalys hybridisering CCD-kamera Sekvenstyp Kvalitativ 6212 Spoligo octalnummer Fluorescens Bactec MGIT 960 Känslig/ Resistent (modifierad SIR) Pertussis IgG antitoxin (PT) ELISA Resistensbestämning diskdiffusion Diskdiffusion Resistensbestämning gradienttest Gradienttest Kvalitativ 3589 Kvalitativ 108 IU/mL CV <15% 842 mm SIR mg/l SIR Individuella acceptansgränser enl. EUCAST ± 1 spädningssteg av riktvärde Reg nr: FOLK4120 Version: 17 Sidan 2 av 7

3 Salmonella typning Staphylococcus aureus - nuc, meca/mecc, PVL Staphyloccus aureus spa-typning Streptococcus pyogenes typning Streptococcus pneumoniae typning geldiffusion Streptococcus pneumoniae typning agglutination Streptococcus pneumoniae typning kapselsvällning feces, blod, urin, sår, abscess, miljöprov blod, likvor, svalg, cervix, sår nasopharynx, sputum, hörselgång, sinus, blod, likvor nasopharynx, sputum, hörselgång, sinus, blod, likvor nasopharynx, sputum, hörselgång, sinus, blod, likvor Agglutination Serotyp Kvalitativ 329 PCR Geldiffusion Microchip-baserat elektroforessystem Resistensgen, Toxingen Kvalitativ 1811 Sekvenstyp Kvalitativ 4009 Sekvenstyp Kvalitativ 6988 påvisad samt serotyp/ Kvalitativ 107 Agglutination Serotyp Kvalitativ 5762 Kapselsvällning Faskontrastmikroskop Serotyp Kvalitativ 5792 Reg nr: FOLK4120 Version: 17 Sidan 3 av 7

4 Klinisk parasitologi Cryptosporidium/Cyclospora/Cytoisospora Feces Sputum Echinococcus spp Ig Ziehl-Neelsenfärgning Mätosäkerhet Kvalitativ 728 ELISA Arbiträr enhet CV <15% 747 Fecesparasiter, cystor och maskägg Feces Koncentrering Leishmania spp mikroskopi Plasmodium Ig Pneumocystis jiroveci mikroskopi Hud Blod (EDTA) Sputum Bronkialsekret Pleuravätska Ascites Trakealsekret Munsköljvätska Vävnadsprov Giemsafärgning Echinococcus spp IgG Western Blot Påvisad/ Kvalitativ 749 Entamoeba histolytica Ig ELISA Arbiträr enhet CV <15% 729 Entamoeba histolytica IgG Titer ± 1 titersteg 730 Entamoeba histolytica/dispar Feces Abscessmaterial Kvalitativ 7894 FOLK Kvalitativ 731 Kvalitativ 735 Titer ± 1 titersteg 737 Kvalitativ 739 Reg nr: FOLK4120 Version: 17 Sidan 4 av 7

5 Pneumocystis jiroveci realtids-pcr Sputum Bronkialsekret Pleuravätska Ascites Trakealsekret Munsköljvätska Vävnadsprov Schistosoma spp ägg Urin Membranfiltrering Schistosoma spp Ig ELISA Schistosoma spp Ig Toxocara IgG Toxoplasma Amnionvätska material Cerebrospinalvätska Blod (EDTA) Glaskropp Toxoplasma gondii IgM Toxoplasma gondii IgG Trypanosoma cruzi Ig ELISA Påvisad/ Kvalitativ 1554 Kvalitativ 740 ELISA Arbiträr enhet CV <15% 741 Titer ± 1 titersteg 742 ELISA Påvisad/ Kvalitativ 758 Kvalitativ 5498 ISAGA Påvisad/ Kvalitativ 748 Agglutination Titer ± 1 titersteg 743 Kvalitativ 1043 Reg nr: FOLK4120 Version: 17 Sidan 5 av 7

6 Klinisk virologi Enterovirus inklusive Poliovirus Enterovirus genotypning Influensavirus A och B typning, subtypning och linjetypning Influensavirus Komponent/Undersökning Mässlingvirus IgG Parotitvirus IgG Feces Svalgprov Feces Svalg feces, likvor, svalg, svalgsköljvätska Näsprov Nasofarynx Obduktionsmaterial Nasofarynx Svalgprov Cellkultur från: Nasofarynx Svalg Isolering på cellkultur PCR och sekvensering Isolering på vävnadskultur ELISA ELISA PCR Extraktionsrobot påvisad samt typ/ Påvisad/ Mätosäkerhet FOLK Kvalitativ 1643 Kvalitativ 6837 Kvalitativ 4305 Kvalitativ 1473 miu/ml CV 28 % 2635 Titer CV 22 % 2636 Reg nr: FOLK4120 Version: 17 Sidan 6 av 7

7 Puumalavirus IgM Rabiesvirus IgM/IgG Rubellavirus IgG TBE-virus IgM ELISA Påvisad/ Kvalitativ 1282 Neutralisationstest IU/mL ± 0,4 IU/mL 1629 ELISA IU/mL CV 30 % 2637 ELISA Påvisad/ Kvalitativ 1126 Reg nr: FOLK4120 Version: 17 Sidan 7 av 7