Bakteriologisk odling

Transkript

1 Bakteriologisk svampar; ögon- och öroninfektioner Vanligtvis glaskropp, hornhinna, sekret, kammarvätska, kornealskrap Aerob/anaerob Ej påvisade/ Påvisad svampar; genitala infektioner svampar; djupa sårinfektioner svampar; ytliga sårinfektioner svampar; bröstmjölksgivare Sekret Spiral Aerob/anaerob Vanligtvis ascites, aspirat, biopsi, dialysat, dränage, fostervatten, intravaskulär kateter, led-, pericard- och pleuravätska, punktat samt vävnad (ej protesinfektion) 1(8) Aerob/anaerob Vanligtvis sekret och bröstmjölk Aerob/anaerob Bröstmjölk Kvantitativ aerob/anaerob Ej påvisade/ Påvisad Ej påvisade/ Påvisad Ej påvisade/ Påvisad CFU/L, Tjänlig/ Otjänlig GBS Vanligtvis sekret Aerob/anaerob Ej påvisad/ Påvisad Listeria Vanligtvis sekret, vävnad och vätska Aerob Ej påvisad/ Påvisad Övre luftvägar, nedre luftv, sputum, Aerob/anaerob kvantitativ

2 bakterier; luftvägs infektioner bronklavage, borstprov samt kvalitativ Streptokocker; svalg Övre luftvägar Anaerob Relevanta bakterier; svalg Övre luftvägar Aerob/anaerob utvidgad svamp svamp vid cystisk fibros Relevanta anaeroba bakterier Sputum Sputum Benmärg, biopsi, nedre luftvägar, pericardvätska, perineum, punktat, rectum, sektionsmaterial, ytliga och djupa inf, öronsekret 2(8) Aerob/anaerob kvantitativ Aerob/anaerob kvantitativ Anaerob Inkubator Anaerobklocka Ej påvisade/ Påvisade Ej representativt/ Tveksamt representativt/ Representativt Ej påvisade/ Påvisade Ej representativt/ Tveksamt representativt/ Representativt Relevanta bakterier i blod Blod, blodprodukter, benmärg, leukocyter Aerob/anaerob Bactec FX

3 Vitek 2XL Bakterier och svampar CAPD-vätska, glaskropp, keratit, likvor, Direktmikroskopi nedre luftv, punktat, sekr. djupa inf Relevanta bakterier i likvor Likvor Aerob/anaerob Cytospincentrifug Anaerobbox Vitek 2XL Salmonella Shigella Campylobakter Feces Special Säkerhetsbänk Clostridium difficile Feces Special Anaerobbox UV-lampa Neisseria gonorrheae Uretra, rectum, cervix, svalg och öga Special Inkubator Legionella Sputum, BAL, borstprov, trakealsekret/ Special bronksekret, pleuravätska Urin Urin Kvantitativ aerob/anaerob 3(8) CFU/L

4 Bordetella pertussis Nasofarynxsekret, nasofarynxsaspirat Special Inkubator Bordetella parapertussis Arcano bacterium Sekret tonsiller Special Inkubator haemolyticum MRSA, VRE Feces, perineum, rectum, sekret ytliga inf, Special Inkubator urin, övre luftvägar. MR Feces, perineum, rectum, urin, sår Special Inkubator Resistensbestämning Bakterie- eller jästsvampkultur MIC-bestämning med E- test Anaerobbox Känslighet enligt SIRsystemet Borste/BAL Borste/ BAL Aerob/anaerob Legionella- antigen Urin Antigenpåvisning med immunokromatografiskt test Pneumokock- antigen Urin Antigenpåvisning med immunokromatografiskt test Artbestämning av relevanta bakterier i sparsam/ måttlig/ riklig mängd Bakteriekultur Masspektrometri Bakteriebestämning på artnivå Molekylärbiologisk diagnostik 4(8)

5 Mycoplasma genitalium Genitalia, urin Nukleinsyrapåvisning Abbott m2000sp Abbott m2000rt Bordetella pertussis Nasofarynxsekret, nasofarynxsaspirat Nukleinsyrapåvisning BioRobot EZ1 CFX96 Mycoplasma pneumoniae Nedre luftvägar, nasofarynxaspirat, svalg, sputum Nukleinsyrapåvisning BioRobot EZ1 CFX96 Chlamydia pneumoniae Nedre luftvägar, nasofarynxaspirat, svalg, sputum 5(8) Nukleinsyrapåvisning BioRobot EZ1 CFX96 Legionella pneumophila Nedre luftvägar, sputum Nukleinsyrapåvisning BioRobot EZ1 CFX96 Chlamydia trachomatis Uretra,cervix, vagina,rectum, luftvägar,öga, Nukleinsyrapåvisning Abbott m2000sp Neisseria gonorrhoeae PCR urin Abbott m2000rt Mycobacterium tuberculosiskomplexet Benmärg, biopsi, likvor, nedre luftv., pericardvätska, punktat, ytliga och djupa inf, urin, övre luftv Nukleinsyrapåvisning Abbott m2000sp Abbott m2000rt Enterohemorragisk E coli Feces Nukleinsyrapåvisning Rotor-Gene EHEC Clostridium difficile toxin Feces Nukleinsyrapåvisning GeneXpert Neisseria gonorrhoeae PCR Uretra,cervix, vagina,rectum, luftvägar,öga, Nukleinsyrapåvisning GeneXpert urin MRSA Urin, sår, feces, ljumske, svalg, näsa Nukleinsyrapåvisning Rotor-Gene

6 PIRO MRSA Urin, sår, feces, ljumske, svalg, näsa Nukleinsyrapåvisning GeneXpert ESBL-genotyp Relevanta bakterier Nukleinsyrapåvisning EZ1, 2720 Thermal cycler (ABI) ESBL-Carba (entero Relevanta bakterier Nukleinsyrapåvisning GeneXpert bacteriaceae) Bakterier och jästsvamp Blod Nukleinsyrapåvisning FilmArray Fecespaketet; Salmonella, Campylobacter jejuni/coli, Shigella/EIEC, Yersinia enterocolitica och EHEC Feces Nukleinsyrapåvisning QiaSymphony PIRO CFX384 6(8) VRE Van A/Van B Relevanta bakterier Nukleinsyrapåvisning GeneXpert Bakterier och jästsvamp Likvor Nukleinsyrapåvisning FilmArray Helgenomsekvensering av bakterier Relevanta bakterier (isolat) Sekvensering (NGS) MiSeq Bakteriebestämning på art-, sub- och genotypnivå Mykologi Svamp Hud, sår, luftvägar, borstar, biopsimaterial, Special Inkubator likvor, öra etc. Svamp Biopsi, glaskropp, konjunktiva, nedre luftvägar, punktat, sekr.ytliga inf. och Direktmikroskopi

7 öronsekr Dermatofyt Hud, hår, naglar. Special Inkubator Jästsvamp Biopsi, glaskropp, konjunktiva, nedre luftvägar, punktat, sekr.ytliga inf. och öronsekr etc. Special Inkubator Parasitologi Springmask Feces i Cystor och maskägg Feces i Schistosoma-ägg Urin i Oocysts (Cryptosporidium och Cyclospora) Feces i Malaria Blod i Serologi Neuroborrelia Serum Likvor Antikroppsbestämning (IgG/IgM) 7(8) Liaison Fyndet talar ej för aktiv intratekal antikroppsproduktion. Fyndet talar för aktiv intratekal antikroppsproduktion. ej påvisade (värde..)/ PÅVISADE. (värde..)/gränsvärde. (värde..) ej påvisade/ PÅVISADE Borrelia Serum Antikroppsbestämning (IgG/IgM) Liaison Syfilis Syfilis TP Blod Antikroppsbestämning Architect (IgG/IgM) Syfilis RPR Serum/likvor Antikroppsbestämning Plattskak ej påvisade/ PÅVISADE

8 (titer ) Syfilis TPPA Likvor/serum och plasma Antikroppsbestämning Plattskak ej påvisade/ PÅVISADE (titer ) Mycoplasma pneumoniae serologi Blod Antikroppsbestämning (IgG/IgM) Liaison Ej påvisade (titer < 1/40)/ PÅVISADE (titer ) Helicobacter pylori-antigen Feces Antigenbestämning Liaison ej påvisade/ PÅVISADE Clostridium difficle toxin Feces Antigenbestämning Liaison ej påvisade/ PÅVISADE Tuberkulosdiagnostik Mykobakterier Mykobakterier Benmärg, blod, biopsi, faeces, likvor, luftv, pericardvätska, punktat, ytliga och djupa inf, urin Benmärg, biopsi, likvor, pericardvätska, punktat, ytliga och djupa inf, luftv Special Bactec MGIT 960 Bactec 9050 Inkubator Säkerhetsbänk Direktmikroskopi Säkerhetsbänk Provtagning omfattas inte av ackrediteringen. Om laboratoriet ändå själv utför provtagning omfattas provningen inte av ackrediteringen. Verksamhet utanför de egna laboratorielokalerna, s.k. fältverksamhet, ingår inte i ackrediteringen. Ackrediteringsomfattningen är flexibel enligt vad som anges i detta beslut. Det ackrediterade organet skall alltid kunna tillhandahålla en uppdaterad lista över den aktuella omfattningen för sin ackreditering. 8(8)