Genetik vid polyneuropatier Christina Jern
Information lagras i DNA 2 m DNA i varje cell Bara 3 cm kodar för protein
Det humana genomet februari 2001 The International Human Genome Mapping Consortium The Celera Genomics Sequencing Team
CCGAGTGCGGGGGTTCATGCTTGTAATCCCAGTATTCTGACAGGCTGTGGTGGGCGGATCACGAGGATTCAAGACCAGCTTGGCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGTGCACCTAT TACTCAGGAGGCTGAGATACAAGAATCGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAGAGTCTGTTTCAGAAAAAAAAAGAAAAAGAAAATGACATAGAGTTCACATT ATAAAGGTTTTGGAACAGCCCCACCCACTCATTTGCATATTATCTAAGACTGTAGCAGTGTCTTTGTGGTCTGCAAAGCCTAAAATATTTCCTATCTGGCAGGGTGCCGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCG CGAGGTCAGTAGATTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTAGGCATAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTCGGAG AGTTGCAGGATGCACTGCACTCCAGCATGAAAACAGAGGAGACTCCGTCTCAAAATAAATAAATAATAAAAATAAAATAACGATTTTTTTTAAAGCAGATTGGTCATTTTATTTTATTTATTTATTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGT TGGAGTGCAGCGGTGTGATCACAGCTCACTGTAGCTTTGACCTTTCCGGGCTCAGGTTATCCTCCCACTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGAAACTACAGGTGTACACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTAATTTTTGTAGCGACAGGGTTTT GTCTTCCTGTTTTCAACAGGTTTTCCTGTTGCCCAGGCTGGTCTGGAACACGTGGGCTCAAGAGATCCACCTGCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCCTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGA CTGTCACACAGGCTGGAATGCAGTGGCACAGTCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTAGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGTTGGGACCACAATAGTCCCCCCACAACACCCAGCTAATTTTTGTATTCTTTTTT TGGAGTCTGGCTCCCGTGGTGCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACCGTAACCTCCACCACTTGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTT AGTAGAGACGAGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGCATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTT TGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCTCAAAGTGCTATCTATTTTTTAATGGAAAAGTTCACCAATCCTGGCGCCAGGTGATTGCTTCTAACTGCTGCAGTGTATGGGATAGTGTATAGTACG TAGTTTACTTGCTGGTTCCCCTGAAGATTGTCCCTGTGCTCAGTTATTCTAGGCACTGAGGATACAGCAAAGGAGCCGAGAAAAGTCCTTTCCCTCTGGGAGCTTATAGTGGCCGGTGCTGGGTTCAGATCCCTTATTCAGCATAGACTCC ACTTGATGTCAATGGTTGTTTGAATCCTCACAATAATTTTATAACATTGTCTCCATTTTTCAGGTAAGGAAACCAGCTCAGAAGCGCCAGGATGGGCTTTGAGATCCACCCCAGACTGGCTATGGCACCTGGGCTCTTAGCTCCTTGCTCT CTGCACAGCTTGGCCAATCCTCCACCTGTCTCATTCCCACCTTCCTAATTTTTGCCTTTCTGATGAGTGTAAAATGCTCTCTCATAACGCCATCTTTGTTTGCATTTCTCCGATATCTCCCGAGTTTGAATATTTCTGGAATCTGAGCTCT ATTTGCTTCTTTAAATCAAACTAGTATGTTTTCTAAACAAGGTGAAAAAACATTTTAACAAAGAAGTTTGCAGACATTTCCATACGTGCCTCCCTCTGCTGCAACTTGAGGCACATGTTCTAGAAAAGAGACACATAGGTCTTGGTGTAAC CCAGACCACGTGGGGCCAAGTTCAAGTCACCCACCAGACTTGAGACTTCTCCCAAATCACTGACAGCTCTAGGGCTCTATTTCCTCCTCTGTAAAATGGGGGTAGTAAGAGTATGGACCTCATATCATAGGATTATGGGGACAATTAAAGT CTGTGATTGTGCCACTGCACTCCACCCTGGGCAACAGATGGAGACCCTGTTTTAAAAAAACCCATTAAAACCACCTCACCCGGCCGAGTGCGGGGGTTCATGCTTGTAATCCCAGTATTCTGACAGGCTGTGGTGGGCGGATCACGAGGAT TACTCAGGAGGCTGAGATACAAGAATCGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAGAGTCTGTTTCAGAAAAAAAAAGAAAAAGAAAATGACATAGAGTTCACATT ATAAAGGTTTTGGAACAGCCCCACCCACTCATTTGCATATTATCTAAGACTGTAGCAGTGTCTTTGTGGTCTGCAAAGCCTAAAATATTTCCTATCTGGCAGGGTGCCGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCG CGAGGTCAGTAGATTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTAGGCATAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTCGGAG AGTTGCAGGATGCACTGCACTCCAGCATGAAAACAGAGGAGACTCCGTCTCAAAATAAATAAATAATAAAAATAAAATAACGATTTTTTTTAAAGCAGATTGGTCATTTTATTTTATTTATTTATTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGT TGGAGTGCAGCGGTGTGATCACAGCTCACTGTAGCTTTGACCTTTCCGGGCTCAGGTTATCCTCCCACTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGAAACTACAGGTGTACACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTAATTTTTGTAGCGACAGGGTTTT GTCTTCCTGTTTTCAACAGGTTTTCCTGTTGCCCAGGCTGGTCTGGAACACGTGGGCTCAAGAGATCCACCTGCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCCTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGA CTGTCACACAGGCTGGAATGCAGTGGCACAGTCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTAGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGTTGGGACCACAATAGTCCCCCCACAACACCCAGCTAATTTTTGTATTCTTTTTT TGGAGTCTGGCTCCCGTGGTGCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACCGTAACCTCCACCACTTGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTT AGTAGAGACGAGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGCATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTT TGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCTCAAAGTGCTATCTATTTTTTAATGGAAAAGTTCACCAATCCTGGCGCCAGGTGATTGCTTCTAACTGCTGCAGTGTATGGGATAGTGTATAGTACG TAGTTTACTTGCTGGTTCCCCTGAAGATTGTCCCTGTGCTCAGTTATTCTAGGCACTGAGGATACAGCAAAGGAGCCGAGAAAAGTCCTTTCCCTCTGGGAGCTTATAGTGGCCGGTGCTGGGTTCAGATCCCTTATTCAGCATAGACTCC ACTTGATGTCAATGGTTGTTTGAATCCTCACAATAATTTTATAACATTGTCTCCATTTTTCAGGTAAGGAAACCAGCTCAGAAGCGCCAGGATGGGCTTTGAGATCCACCCCAGACTGGCTATGGCACCTGGGCTCTTAGCTCCTTGCTCT CTGCACAGCTTGGCCAATCCTCCACCTGTCTCATTCCCACCTTCCTAATTTTTGCCTTTCTGATGAGTGTAAAATGCTCTCTCATAACGCCATCTTTGTTTGCATTTCTCCGATATCTCCCGAGTTTGAATATTTCTGGAATCTGAGCTCT ATTTGCTTCTTTAAATCAAACTAGTATGTTTTCTAAACAAGGTGAAAAAACATTTTAACAAAGAAGTTTGCAGACATTTCCATACGTGCCTCCCTCTGCTGCAACTTGAGGCACATGTTCTAGAAAAGAGACACATAGGTCTTGGTGTAAC CCAGACCACGTGGGGCCAAGTTCAAGTCACCCACCAGACTTGAGACTTCTCCCAAATCACTGACAGCTCTAGGGCTCTATTTCCTCCTCTGTAAAATGGGGGTAGTAAGAGTATGGACCTCATATCATAGGATTATGGGGACAATTAAAGT GGCGGAATGTGCTTGTTGTCCCATCTACTTGGTACGACAAGGTGGGAGGATCACCTGAGGGGCATGGCTGGTGTGAGCTGTGATTGTGCCACTGCACTCCACCCTGGGCAACAGATGGAGACCCTGTTTTAAAAAAACCCATTAAAACCAC AACATGGTGAAACCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGTGCACCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGATACAAGAATCGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTG ATAAAGGTTTTGGAACAGCCCCACCCACTCATTTGCATATTATCTAAGACTGTAGCAGTGTCTTTGTGGTCTGCAAAGCCTAAAATATTTCCTATCTGGCAGGGTGCCGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCG CGAGGTCAGTAGATTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTAGGCATAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTCGGAG AGTTGCAGGATGCACTGCACTCCAGCATGAAAACAGAGGAGACTCCGTCTCAAAATAAATAAATAATAAAAATAAAATAACGATTTTTTTTAAAGCAGATTGGTCATTTTATTTTATTTATTTATTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGT TGGAGTGCAGCGGTGTGATCACAGCTCACTGTAGCTTTGACCTTTCCGGGCTCAGGTTATCCTCCCACTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGAAACTACAGGTGTACACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTAATTTTTGTAGCGACAGGGTTTT GTCTTCCTGTTTTCAACAGGTTTTCCTGTTGCCCAGGCTGGTCTGGAACACGTGGGCTCAAGAGATCCACCTGCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCCTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGA CTGTCACACAGGCTGGAATGCAGTGGCACAGTCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTAGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGTTGGGACCACAATAGTCCCCCCACAACACCCAGCTAATTTTTGTATTCTTTTTT TGGAGTCTGGCTCCCGTGGTGCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACCGTAACCTCCACCACTTGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTT AGTAGAGACGAGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGCATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTT TGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCTCAAAGTGCTATCTATTTTTTAATGGAAAAGTTCACCAATCCTGGCGCCAGGTGATTGCTTCTAACTGCTGCAGTGTATGGGATAGTGTATAGTACG TAGTTTACTTGCTGGTTCCCCTGAAGATTGTCCCTGTGCTCAGTTATTCTAGGCACTGAGGATACAGCAAAGGAGCCGAGAAAAGTCCTTTCCCTCTGGGAGCTTATAGTGGCCGGTGCTGGGTTCAGATCCCTTATTCAGCATAGACTCC ACTTGATGTCAATGGTTGTTTGAATCCTCACAATAATTTTATAACATTGTCTCCATTTTTCAGGTAAGGAAACCAGCTCAGAAGCGCCAGGATGGGCTTTGAGATCCACCCCAGACTGGCTATGGCACCTGGGCTCTTAGCTCCTTGCTCT CTGCACAGCTTGGCCAATCCTCCACCTGTCTCATTCCCACCTTCCTAATTTTTGCCTTTCTGATGAGTGTAAAATGCTCTCTCATAACGCCATCTTTGTTTGCATTTCTCCGATATCTCCCGAGTTTGAATATTTCTGGAATCTGAGCTCT ATTTGCTTCTTTAAATCAAACTAGTATGTTTTCTAAACAAGGTGAAAAAACATTTTAACAAAGAAGTTTGCAGACATTTCCATACGTGCCTCCCTCTGCTGCAACTTGAGGCACATGTTCTAGAAAAGAGACACATAGGTCTTGGTGTAAC CCAGACCACGTGGGGCCAAGTTCAAGTCACCCACCAGACTTGAGACTTCTCCCAAATCACTGACAGCTCTAGGGCTCTATTTCCTCCTCTGTAAAATGGGGGTAGTAAGAGTATGGACCTCATATCATAGGATTATGGGGACAATTAAAGT GAGGGGCATGGCTGGTGTGAGCTGTGATTGTGCCACTGCACTCCACCCTGGGCAACAGATGGAGACCCTGTTTTAAAAAAACCCATTAAAACCACCTCACCCGGCCGAGTGCGGGGGTTCATGCTTGTAATCCCAGTATTCTGACAGGCTG TACTCAGGAGGCTGAGATACAAGAATCGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAGAGTCTGTTTCAGAAAAAAAAAGAAAAAGAAAATGACATAGAGTTCACATT ATAAAGGTTTTGGAACAGCCCCACCCACTCATTTGCATATTATCTAAGACTGTAGCAGTGTCTTTGTGGTCTGCAAAGCCTAAAATATTTCCTATCTGGCAGGGTGCCGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCG CGAGGTCAGTAGATTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTAGGCATAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTCGGAG ATTTGCTTCTTTAAATCAAACTAGTATGTTTTCTAAACAAGGTGAAAAAACATTTTAACAAAGAAGTTTGCAGACATTTCCATACGTGCCTCCCTCTGCTGCAACTTGAGGCACATGTTCTAGAGTAGAGTGATGATGATGATAGCGTAGT CTGGGCCAAGTTCAAGTCACCCACCAGACTTGAGACTTCTCCCAAATCACTGACAGCTCTAGGGCTCTATTTCCTCCTCTGTAAAATGGGGGTAGTAAGAGTATGGACCTCATATCATTGGTGTGTGAGAGAGTGTTGTGTGGTGGGGAT TTTGTGATCACAGCTCACTGTAGCTTTGACCTTTCCGGGCTCAGGTTATCCTCCCACTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGAAACTACAGGTGTACACCACCATACCTGGCTAATATATCTGTGCATGCTGACAGHTGATAGACAGTTTTGT TTCCTGTTTTCAACAGGTTTTCCTGTTGCCCAGGCTGGTCTGGAACACGTGGGCTCAAGAGATCCACCTGCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCCTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGGCTTTCA
DNA Nukleotider: A, T, C, G Mutationer: Basutbyte (2/3) Deletion / insertion Duplikation
Vilken gen skall jag testa? Debutålder Neurofysiologi, patologi Kliniska särdrag; motoriska vs sensoriska symtom, övre vs nedre extremiteten Symtom utöver neuropati Släktträd
Släktträd vid autosomalt dominant arv
Autosomalt dominant arv En sjuk person har vanligtvis en sjuk förälder Drabbar båda könen lika Ärvs både från far och mor
Förälder Könsceller Barn
Släktträd vid autosomalt recessivt arv
Autosomalt recessivt arv Sjuka personer har vanligen friska föräldrar Föräldrar till sjuka är vanligen bärare av anlaget Drabbar båda könen lika Efter ett par fått ett sjukt barn, har varje kommande barn 25% risk att bli drabbad av samma sjukdom Typisk sjukdom: Duchennes muskeldystrofi och Beckers myotoni
Släktträd vid X-bundet recessivt arv
X-bundet recessivt arv Drabbar vanligen män / pojkar Drabbade män har vanligen friska föräldrar där mamman är frisk bärare, och ibland har modern manliga släktingar med samma sjukdom Det finns ingen far-son transmission Söner till kvinnliga bärare löper 50% risk att ärva sjukdomen
Far Spermier
X-bundet dominant arv Drabbar män svårare än kvinnor Det finns ingen far-son transmission
Typ Ärftlighet Andel CMT1 Dominant ca 50 % CMT2 Dominant 20-40 % CMTX X-bunden 10-20 % CMT4 Recessiv Ovanlig CMT intermediär Dominant Ovanlig
CMT1 CMT1A 70-80% PMP22 17p11 Duplikation Punktmut Peripheral myelin protein 22 CMT1B 5-10% MPZ 1q22 Myelin protein zero CMT1D EGR2 10q21 Early growth response protein 2 CMT1F NEFL 8p21 Neurofilament triplet L protein CMT1C LITAF 16p13 Neurofilament triplet L protein och > 12 andra gener
PMP 22 = peripheral myelin protein 22 transmembranöst strukturprotein P0 = myelin protein zero adhesionsmolekyl
HNPP HNPP PMP22 80 % deletion Peripheral myelin protein 22 HNPP PMP22 20 % punktmutationer Peripheral myelin protein 22
17p11.2-p12 REP Meios, överkorsning PMP22 REP recombinational hotspot
CMT1A duplikation HNPP deletion REP Obalanserad överkorsning PMP22 REP Hereditary Neuropathy with liability to Pressure Palsies
CMT2 CMT2A 30% MFN2 1p36 Mitofusin 2 CMT2I CMT2J 10% MPZ 1q22 Myelin protein zero och > 10 andra gener
CMTX CMTX 90% GJB1 Xq13.1 Gap junction beta-1 protein (connexin 32) och > 7 andra gener
Vad gör Klinisk genetik i Göteborg idag? PMP22 duplikation / deletion PMP22 DNA-sekvens MPZ DNA-sekvens GJB1 DNA-sekvens Skickar DNA för analys
2007 ISBN: 0670063584
En persons genetiska kod 6 miljarder bokstäver och 4 miljoner variationer PLoS Biology 2007
2010 Apr 1;362(13):1181-91.
Genetisk variation If it were not for the great variability among individuals Medicine might as well be a science and not an art Sir William Osler, 1892
Single Nucleotide Polymorphism, SNP 10 miljoner SNPs i det humana genomet En SNP per 100-300 baser
Klinisk genetik Diagnostik av sällsynta ärftliga sjukdomar och missbildningar Genetisk vägledning
Genetisk vägledning Ibland vid symtomatisk DNA-analys Alltid vid presymtomatisk testning Ofta vid riktad fosterdiagnostik
Tack för uppmärksamheten!