Expertgruppen för medicinsk mikrobiologi 2010 Kåre Bondesson Uppsala Maria Brytting Stockholm (SMI) Eva Hedvall Malmö Torbjörn Kjerstadius Karlstad Ilona Lewensohn-Fuchs Stockholm Inger Ljungström Stockholm (SMI) Kerstin Malm Örebro Magnus Thore Västerås (SMI) Ordförande Christina Welinder-Olsson Göteborg Avgågna: Sture Löfgren och Ralfh Wollin EQUALIS-representanter Eva Burman, Karin Dahlin-Robertsson och Keng-Ling Wallin. 2010-02-17 Magnus Thore 1
Bakteriologi Vad har vi lärt oss av utskicken 2009? Blododling (bakt + svamp) 4 utskick Fecesodling Sputumodling Urinodling Antikroppsbestämning Syfilis (Lues)diagnostik Nukleinsyradetektion GAS 1 utskick 1 utskick 1 utskick 5 utskick 1 utskick 5 utskick 2 utskick 2010-02-17 Magnus Thore 2
Vad har vi lärt oss av utskicken 2009? Virologi 16 utskick Diagnostik av herpes simplex, Varicella-zoster, morbilli, parotit, influensa, calicivirus, parvo B19, RSV, HIV/HTLV, CMV/EBV, adeno-rota, blodsmittescreen) Isolering Antikroppsbestämning Antigendetektion Nukleinsyrapåvisning (influensa) (9 olika virus) 2010-02-17 Magnus Thore 3
EQUALIS-utskick 2009 Blododling Sputumodling Urinodling HP-antigen i feces Magnus Thore 2010-02-17 Magnus Thore 4
Blododlingsutskick 2009, EQUALIS Utskick 4 gånger/år Frystorkade prover för detektion och identifiering av bakterier och jästsvamp. 2010-02-17 Magnus Thore 5
Blododlingsutskick 2009, EQUALIS 2009 06/1&2; Haemophilus influenzae, Clostridium perfringens 2009 20/1&2; Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes 2009 40/1&2; Pasteurella multocida, Streptococcus oralis 2009 48/1&2; Escherichia coli+candida albicans, 0 mikroorganism 2010-02-17 Magnus Thore 6
Blododlingsutskick 2009 06/1 NPU ATCC33391 Haemophilus influenzae (CCUG57574) 27 CFU/ampull Stigande CRP hos 76-årig kvinna, nyligen cytostatikabehandling. H influenzae - Minimikriterier: infektioner utom pneumoni är anmälningspliktig och drabbar ett hundratal/år. Oftast äldre med nedsatt immunförsvar. Serotyper andra än b eller ej typbara. Barnvaccination sedan 1993. Beskrivs i flera artiklar i referensmetodiken (CNS, Hudmjukdelar, NLI) 27/27 labb svarade H. influenzae Beskriv gärna använd metodologi! 2010-02-17 Magnus Thore 7
http://referensmetodik.smi.se/w/huvudsida 2010-02-17 Magnus Thore 8
Blododlingsutskick 2009 20/2 NPU ATCC12344 Streptococcus pyogenes (CCUG58107) 13 CFU/ampull 81-årig kvinna med feber >40 grader. Streptococcus pyogenes. Accepterad nomenklatur enligt referensmetodiken: Streptococcus pyogenes S. pyogenes Grupp A streptokocker (GAS) Invasiva infektioner är anmälningspliktiga Minimikriterier : Betahemolys på blodagar, (bacitracinpositiv möjlig screening, specificitet <80 %), agglutination (Lancefieldantigen A ) 25/27 labb svarade S. pyogenes (eller motsvarande) 2/27 labb angav annan diagnos 2010-02-17 Magnus Thore 9
Blododlingsutskick 2009 40/2 NPU ATCC3037 Streptococcus oralis (CCUG58449) 5 CFU/amp 40-årig man med brännskada, stigande feber S. oralis hör till S. mitis-gruppen tillsammans med minst 8 andra arter (plus pneumokocker). Bakterierna beter sig kliniskt likartat, finns i munhålan, GI-kanalen och kvinnliga genitalia. Enstaka fynd i blod oftast förorening, men kan ge endokardit. Minimikriterier saknas. Kommersiella brickor och sekvensering otillförlitliga. Försök bara att klassificera alfastreptokocker till grupp, arten oftast fel! (ASM-manual) 1/24 labb svarade S. oralis 9/24 labb svarade andra arter inom gruppen 8/24 labb svarade alfastreptokocker eller annat 2010-02-17 Magnus Thore 10
Streptococcus anginosus gruppen Streptococcus mitis -gruppen Streptococcus salivarius -gruppen (S. anginosus, S. constellatus, S. intermedius) (S. mitis, S. sanguinis, S. parasanguinis, S. gordonii, S. cristacus, S. oralis, S. infantis, S. peroris, S. pneumoniae!!) (S. salivarius, S. vestibularis) Streptococcus mutans gruppen Streptococcus bovis -gruppen (S. mutans, S. sobrinus, S. criceti, S. ratti + 5 andra djurarter) (S. equinus, S. gallolyticus, S. lutetiensis, S. alactolyticus) 2010-02-17 Magnus Thore 11
Blododlingsutskick 2009 48/1 NPU ATCC11775 Escherichia coli (CCUG58927) 100 CFU/ampull och Candida albicans (CCUG 58928) 10 CFU/ampull 72-årig kvinna med sarkoidos, feber och hosta som kräver IVA-vård Medeldetektionstiden för E. coli var 10-13 timmar, jästsvamp kräver inkubering två dygn eller mer enligt tidigare utskick. Förlängd inkubationstid rekommenderas vid misstanke om jästsvamp. Bactecsystemet har särskilda svampflaskor. 24/25 labb identifierade E. coli 0/25 labb identifierade jästsvampen 2010-02-17 Magnus Thore 12
Sputumutskick 2009-18/1-5 Fem fingerade sputumprov för odling; två ampuller innehöll Legionella pneumophila, de övriga pneumokocker (två ampuller) och H. influenzae. 13/16(23)deltagare angav att man följer referensmetodiken (I2, 2:a upplagan, 2005) 2/16 tvättar sputum (OBS! Signifikansgränser) 15/16 sputolysinbehandlar sputum Relevansgräns tvättat prov: 10 8 CFU/L Relevansgräns otvättat prov: 10 9 CFU/L Gäller ej Legionella! 2010-02-17 Magnus Thore 13
2010-02-17 Magnus Thore 14
Sputumutskick 2009-18/1-5 2009-18/1-2; Pneumoni i samband med hotellvistelse Kreta (L. pneumophila cirka10 8 CFU/L). 13/13 svarade korrekt på renkulturen (amp 1) 10/13 svarade korrekt när kontaminerande flora tillsats (amp 2) 10 labb skulle ha skickat till annat labb Alla med förväntat svar angav att fynden var relevanta. 2010-02-17 Magnus Thore 15
Urinodling utskick 2009-10/1-4 Fyra ampuller med KNS Gardnerella vaginalis Lactobacillus crispatus Escherichia coli 10 7 CFU/L 3x10 7 CFU/L 6x10 7 CFU/L 5x10 6 CFU/L 2010-02-17 Magnus Thore 16
2010-02-17 Magnus Thore 17
2010-02-17 Magnus Thore 18
Urinodling utskick 2009-10/1-4 Fyra ampuller med KNS Gardnerella vaginalis Lactobacillus crispatus Escherichia coli 10 7 CFU/L 3x10 7 CFU/L 6x10 7 CFU/L 5x10 6 CFU/L KNS; 24/27 korrekt diagnos, 6 ansåg fynd relevant Gardnerella; 22/27 korrekt diagnos, 9 ansåg fynd relevant Lactobacillus; 19/27 korrekt diagnos, 1 ansåg fynd relevant E. coli: 27/27 korrekt diagnos, 22 ansåg fynd relevant 2010-02-17 Magnus Thore 19
2010-02-17 Magnus Thore 20
2010-02-17 Magnus Thore 21