MAX Enteric Viral Panel 443985 P0231(03) 2018-06 Svenska Revisionshistorik Revision/ Datum Avsnitt (03) 2018-06 Innehållsförteckning Principer för metoden Tabell över reagenser och material Varningar och försiktighetsbeaktanden Bruksanvisning/Provberedning Resultattolkning Analytisk inklusivitet Tabell 10 Sida 16 30/spansk översättning: Sammanfattning av ändringar Lade till innehållsförteckning på EN och ES. Uppdaterade beskrivningen av öglan så att den överensstämmer med förpackningens etikett. Uppdaterade beskrivningen av öglan så att den överensstämmer med förpackningens etikett. Lade till Krävs för användning tillsammans med analysen. Lade till ny andra punkt. Uppdaterade beskrivningen av öglan så att den överensstämmer med förpackningens etikett. Förtydligande av partiell UNR-tolkning Korrigerade detektionsgränsen för testade stammar. Korrigerade kolumnrubrikerna. Lade till spansk översättning. 1
MAX Enteric Viral Panel 443985 P0231(03) Avsedd för in vitro-diagnostik 2018-06 För användning tillsammans med BD MAX-systemet Svenska 4 I AVSEDD ANVÄNDNING BD MAX Enteric Viral Panel (enterisk viral panel) som utförs på BD MAX-systemet är ett automatiserat in vitro-diagnostiskt test för direkt kvalitativ detektion och differentiering av enteriska virala patogener. BD MAX Enteric Viral Panel detekterar nukleinsyror från Norovirus GI och GII Rotavirus A Adenovirus F40/41 Sapovirus (genotyper I, II, IV, V) Humant astrovirus (hastro) Testning utförs på icke-konserverade mjuka till diarréaktiga eller Cary-Blair-konserverade avföringsprover från symtomatiska patienter med misstänkt akut gastroenterit, enterit eller kolit. Testet utförs direkt på provet genom användning av polymeraskedjereaktion (PCR) i realtid för amplifiering av en relevant gens mål-dna/rna. I testet används fluorogena genspecifika hybridiseringsprober för detektion av det amplifierade DNA:t. Detta test är avsett att användas, i kombination med kliniska symptom, laboratorieresultat och epidemiologisk information, som ett stöd för differentialdiagnostik av infektioner från norovirus GI och GII, rotavirus A, adenovirus F40/41, sapovirus (genotyper I, II, IV, V) och hastro. Resultaten av detta test bör inte användas som enda underlag för diagnos, behandling eller andra patientbehandlingsbeslut. Positiva resultat utesluter inte blandinfektion med andra organismer som inte detekteras med detta test och utgör kanske inte den enda eller definitiva orsaken till patientens sjukdom. Negativa resultat vid fastställandet av klinisk sjukdom kompatibel med gastroenterit kan bero på infektion av patogener som inte detekteras med detta test eller icke-infektiösa orsaker, såsom t.ex. ulcerös kolit, kolon irritabile (IBS) eller Crohns sjukdom. SAMMANFATTNING OCH FÖRKLARING AV FÖRFARANDET Organismer som kan orsaka enteriska sjukdomar utgör en signifikant orsak till morbiditet och mortalitet över hela världen. Enteriska patogener kommer in i kroppen via mag-tarmkanalen och sprids vanligtvis via kontaminerat livsmedel och vatten eller via kontakt med uppkastningar eller avföring. CDC (Center for Disease Control and Prevention (USA)) uppskattar att 48 miljoner sjukdomsfall i USA varje år är livsmedelsrelaterade, vilket resulterar i 128 000 sjukhusvistelser och 3 000 dödsfall. 1 I utvecklingsländerna orsakar dessa sjukdomar cirka 2 miljoner dödsfall årligen hos unga barn. 2 Var och en av de sjukdomsalstrande agenserna kan ge något olika symptomatologi, inklusive kramper eller smärta i magen, bristande aptit, illamående eller kräkningar dock resulterar alla i diarré. 3 Upprepade diarréanfall och bestående diarrésjukdom stör tarmens funktion och upptagningsförmåga, vilket kan leda till undernäring och tillväxthämning hos barn. 4 2
BD MAX Enteric Viral Panel kan, när den utförs på BD MAX-systemet, generera ett resultat för BD MAX Enteric Viral Panel-målen för 24 prover på cirka 3 timmar. BD MAX Enteric Viral Panel detekterar samtidigt de patogener som orsakar gastroenterit på grund av norovirus GI och GII, rotavirus A, adenovirus F40/41, sapovirus (genotyper I, II, IV, V) och hastro. Analysen innehåller en provbearbetningskontroll. BD MAX Enteric Viral Panel automatiserar testprocessen och minimerar antalet åtgärder från operatören från den tidpunkt då provet placeras i BD MAX-systemet tills resultaten är tillgängliga. Ett mjukt till diarréaktigt avföringsprov samlas in och transporteras till laboratoriet, homogeniseras och samlas in i ett BD MAX Enteric Viral Panel Sample Buffer Tube (provbuffertrör). Provbuffertröret placeras i BD MAX-systemet och följande automatiserade förfarande utförs: virushöljena lyseras, DNA/RNA extraheras på magnetiska kulor och koncentreras. Sedan tillsätts en alikvot av eluerat DNA/RNA till PCR-reagenserna som innehåller de genspecifika primrarna som används för att amplifiera de genetiska målen i BD MAX PCR Cartridge (PCR-kassett), om de finns. I analysen ingår också en provbearbetningskontroll. Provbearbetningskontrollen finns i extraktionsröret och genomgår extraktions-, koncentrations- och amplifieringsstegen för att övervaka förekomsten av inhiberande substanser samt instrument- eller reagensfel. Det behövs inga ytterligare åtgärder från operatören när det kliniska provet, BD MAX Unitized Reagent Strip (sammansatt reagensremsa) och BD MAX PCR-kassetten har laddats i BD MAX-systemet. BD MAX-systemet automatiserar lyseringen av provet, extraktionen och koncentrationen av DNA/ RNA, reagensrehydreringen, amplifieringen av nukleinsyrorna och detektionen av målnukleinsyrasekvensen med användning av polymeraskedjereaktion (PCR) i realtid. Amplifierade mål detekteras med hydrolysprober märkta med dämpade fluoroforer. Amplifieringen, detektionen och tolkningen av signalerna görs automatiskt av BD MAX-systemet. PRINCIPER FÖR METODEN Avföringsprover samlas in från patienter och transporteras till laboratoriet icke-konserverade i en ren behållare eller konserverade i Cary-Blair-transportmedium. En ögla förs in till öglans djup i provet och exprimeras med en snurrande rörelse till ett BD MAX-provbuffertrör som ingår i BD MAX Enteric Viral Panel-kitet. När arbetslistan har genererats och provet laddats på BD MAX-instrumentet tillsammans med en BD MAX Enteric Viral Panel Unitized Reagent Strip (sammansatt reagensremsa) och en PCR-kassett startas körningen och inga ytterligare åtgärder från operatören behövs. BD MAX-systemet automatiserar provberedningen, inklusive lysering av målorganism, extraktion och koncentration av DNA/RNA, reagensrehydrering, amplifiering av målnukleinsyrasekvensen och detektion med hjälp av realtids-pcr. Tolkningen av signalen utförs automatiskt av BD MAX-systemet. I analysen ingår också en provbearbetningskontroll som ingår i extraktionsröret och som genomgår extraktions-, koncentrationsoch amplifieringssteg. Provbearbetningskontrollen övervakar eventuell förekomst av potentiella inhiberande substanser samt system- eller reagensfel. Efter enzymatisk viruslysering vid förhöjd temperatur fångas de frigjorda nukleinsyrorna med magnetiska affinitetskulor. Kulorna, tillsammans med de bundna nukleinsyrorna, tvättas och nukleinsyrorna elueras. Eluerat DNA/RNA neutraliseras och överförs till Master Mix Tubes (mastermixrör) för att rehydrera PCR-reagenserna. Efter rehydrering dispenserar BD MAX-systemet en bestämd volym PCR-färdig lösning i BD MAX PCR-kassetten. Mikroventiler i BD MAX PCR-kassetten försluts av systemet för att förebygga avdunstning och amplikonkontamination innan omvänt transkriptas-pcr initieras för att konvertera RNA till cdna och efterföljande realtids-pcr. De amplifierade DNA-målen detekteras med hydrolysprober (TaqMan), märkta i ena änden med ett fluorescerande färgämne (fluorofor) och i den andra med ett inhiberande fragment. Prober märkta med olika fluoroforer används för att detektera amplikonerna för virusmålen (norovirus GI och GII, rotavirus A, adenovirus F40/41, sapovirus (genotyper I, II, IV, V) och hastro) och amplikonerna för provbearbetningskontrollen i fyra olika optiska kanaler på BD MAX-systemet. När proberna är i sitt ursprungliga tillstånd inhiberas fluorescensen i fluoroforen på grund av dess närhet till inhiberaren. I närvaro av mål-dna hybridiseras dock proberna till sina komplementära sekvenser och hydrolyseras av DNA-polymerasens 5 3 -exonukleasaktivitet när den syntetiserar den begynnande strängen längs cdna-mallen. Till följd av detta separeras fluoroforerna från inhiberarmolekylerna och fluorescens avges. BD MAX-systemet övervakar dessa signaler vid varje cykel och tolkar data i slutet av programmet för att rapportera de slutliga resultaten. REAGENSER OCH MATERIAL REF Innehåll Kvantitet 443985 BD MAX Enteric Viral Panel Master Mix (mastermix) (D6) Torkad PCR-mastermix som innehåller DNA-polymeras, nukleotider samt primrar och prober som är specifika för provbearbetningskontrollen och målen. BD MAX Enteric Viral Panel Master Mix (mastermix) (D5) Torkad PCR-mastermix som innehåller DNA-polymeras, nukleotider samt primrar och prober som är specifika för provbearbetningskontrollen och målen. BD MAX Enteric Viral Panel Unitized Reagent Strips (sammansatta reagensremsor) Reagensremsor som innehåller alla flytande reagenser och pipettspetsar för engångsbruk som behövs för provbearbetning och DNA-/RNA-extraktion. BD MAX Enteric Viral Panel Extraction Tube (extraktionsrör) (D4) Torkad extraktionsreagens som innehåller magnetiska DNA-/RNA-affinitetskulor, proteinas K och provbearbetningskontroll BD MAX Enteric Viral Panel Sample Buffer Tube (provbuffertrör) BD MAX Disposable Inoculation Loops (inympningsöglor om 5 µl för engångsbruk) (krävs för användning tillsammans med analysen) 24 tester (2 12 rör) 24 tester (2 12 rör) 24 tester 24 tester (2 12 rör) 24 tester (2 12 rör) Membranlock 25 30 3
UTRUSTNING OCH MATERIAL SOM KRÄVS MEN EJ MEDFÖLJER BD MAX PCR Cartridges (PCR-kassetter) (BD Diagnostic Systems kat. nr 437519) VWR Multi-Tube Vortexer (vortexblandare för flera rör) eller motsvarande (VWR, kat. nr 58816-115) Vortex Genie 2 eller motsvarande (VWR, kat. nr 58815-234) Nalgene Cryogenic Vial Holder (kryogen flaskhållare) (VWR, kat. nr 66008-783) Ställ kompatibelt med en vortexblandare för flera rör (t.ex. kryogen flaskhållare eller motsvarande) Labbrock och handskar för engångsbruk, utan talk Tidur eller timer För avföringsprover av icke-konserverad typ: Torra, rena behållare för insamling av prover av flytande eller lös avföring. För avföringsprover av konserverad typ: Cary-Blair-transportmedium (15 ml). VARNINGAR OCH FÖRSIKTIGHETSBEAKTANDEN Fara H360 Kan skada fertiliteten eller det ofödda barnet. P280 Använd skyddshandskar/skyddskläder/ögonskydd/ansiktsskydd. P201 Inhämta särskilda instruktioner före användning. P202 Använd inte produkten innan du har läst och förstått säkerhetsanvisningarna. P308+P313 Vid exponering eller misstanke om exponering: Sök läkarhjälp. P405 Förvaras inlåst. P501 Innehållet/behållaren ska kasseras i enlighet med lokala/regionala/nationella/internationella bestämmelser. BD MAX Enteric Viral Panel är endast avsedd för in vitro-diagnostik. BD MAX Disposable Inoculating Loops (inympningsöglor för engångsbruk) krävs för användning med BD MAX Enteric Viral Panel och medföljer analyskitet. Generella öglor, oavsett typ och volym, rekommenderas inte för användning och har inte validerats med prestanda hos BD MAX Enteric Viral Panel. Kommunala och statliga regler och riktlinjer för anmälan om anmälningspliktiga sjukdomar uppdateras kontinuerligt och omfattar en rad organismer som det är viktigt att övervaka och undersöka utbrott av. 5,6 Laboratorier är ansvariga för att följa det statliga och/eller lokala regelverket angående anmälningspliktiga patogener och bör vända sig till lokala och/eller statliga folkhälsolaboratorier när det gäller riktlinjer för inlämning av isolat och/eller kliniska prover. Denna produkt kan endast användas på BD MAX-systemet. Använd inte utgångna reagenser och/eller material. Använd inte kitet om etiketten som förseglar ytterkartongen är bruten vid mottagandet. Använd inte reagenserna om skyddspåsarna är öppna eller trasiga vid mottagandet. Använd inte reagenserna om torkmedel saknas eller är trasigt inuti reagenspåsarna. Ta inte bort torkmedlet ur reagenspåsarna. Förslut reagensskyddspåsar med blixtlåset omedelbart efter varje användning. Tryck ut överflödig luft ur påsarna innan de försluts. Skydda reagenserna mot värme och fuktighet. Långvarig exponering för fuktighet kan påverka produktens prestanda. Använd inte reagenser om folien har öppnats eller skadats. Blanda inte reagenser från olika påsar och/eller kit eller loter. Alternera inte och återanvänd inte lock eftersom kontamination som kan äventyra testresultaten kan uppstå. Kontrollera att de sammansatta reagensremsorna är korrekt fyllda (se till att vätskorna finns på rörens botten [se figur 1]). Undersök de sammansatta reagensremsorna för att säkerställa att alla pipettspetsar finns på plats (se figur 1). Hantera kemiska lösningar försiktigt eftersom de kan göra streckkoden på mastermix- och extraktionsrören oläslig. God laboratorieteknik är avgörande för att den här analysen ska fungera korrekt. På grund av den höga analytiska känsligheten hos detta test så bör extrem försiktighet iakttas för att bevara renheten hos alla material och reagenser. I de fall där andra PCR-test genomförs i samma generella område i laboratoriet måste försiktighet iakttas för att säkerställa att BD MAX Enteric Viral Panel, eventuella ytterligare reagenser som krävs för testningen och BD MAX-systemet inte kontamineras. Undvik alltid mikrobiell kontamination och kontamination med deoxyribonukleas (DNas) och ribonukleas (RNas) av reagenserna. Byt handskar innan reagenser och kassett hanteras. Förebygg kontamination av miljön med målamplikoner genom att inte bryta isär BD MAX PCR-kassetten efter användning. Förseglingarna på BD MAX PCR-kassetterna är utformade för att förebygga kontamination. Laboratoriet ska rutinmässigt bedriva miljöövervakning för att minimera risken för korskontamination. Utförs BD MAX Enteric Viral Panel utanför de rekommenderade tids- och temperaturområden som rekommenderas för transport och lagring av prov kan detta ge ogiltiga resultat. Analyser som inte utförts inom de angivna tids- och temperaturområdena bör upprepas. Ytterligare kontroller kan testas i enlighet med riktlinjer eller krav i lokala, regionala och/eller nationella bestämmelser eller från ackrediteringsorganisationer. 4
Hantera alltid prover som om de vore smittförande och i enlighet med säkra laboratorieförfaranden, till exempel de som beskrivs i CLSI-dokument M29 7 och i Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories. 8 Använd skyddskläder och engångshandskar vid hantering av alla reagenser. Tvätta händerna noggrant efter utförande av testet. Pipettera inte med munnen. Rök, drick eller ät inte i områden där prover eller kitreagenser hanteras. Kassera oanvända reagenser och avfall enligt nationella, statliga och lokala bestämmelser. Se BD MAX-systemets användarhandbok 9 för ytterligare varningar, försiktighetsbeaktanden och förfaranden. FÖRVARING OCH STABILITET Insamlade prover, antingen icke-konserverad avföring eller avföring som lagras i 15 ml Cary-Blair-transportmedium, ska förvaras mellan 2 C och 25 C under transport. Skydda mot exponering för stark värme. Prover kan förvaras i upp till 120 timmar (5 dagar) vid 2 8 C eller i upp till 48 timmar vid 2 25 C före testning. BD MAX Enteric Viral Panel-mastermix är stabilt vid 2 25 C fram till det angivna utgångsdatumet. Använd inte utgångna komponenter. BD MAX Enteric Viral Panel Master Mix Tubes (mastermixrör) levereras i förseglade påsar. Skydda produkten från fukt genom att omedelbart återförsluta påsarna efter att de öppnats. Mastermixrör är stabila i upp till 14 dagar vid 2 25 C efter första öppnandet och återförslutningen av påsen. BRUKSANVISNING Provtagning och -transport Proceduren för provtagning måste följas noga för att få ett korrekt prov. Flytande eller mjuka avföringsprover samlas in med hjälp av en torr och ren behållare enligt följande procedur: 1. Icke-konserverade prover: Överför det flytande eller mjuka avföringsprovet till en torr och ren behållare. Undvik kontamination med vatten eller urin och undvik att få med toalettpapper eller tvål i provet. Märk behållaren och transportera den till laboratoriet i enlighet med institutionens standardförfaranden (se avsnittet Förvaring och stabilitet). 2. Cary-Blair-konserverade prover: Överför det flytande eller mjuka avföringsprovet till en transportanordning om 15 ml i enlighet med tillverkarens instruktioner. Undvik kontamination med vatten eller urin och undvik att få med toalettpapper eller tvål i provet. Märk behållaren och transportera den till laboratoriet i enlighet med institutionens standardförfaranden (se avsnittet Förvaring och stabilitet). Provberedning OBS! Ett (1) provbuffertrör, ett (1) membranlock, två (2) mastermixrör (D6 och D5), ett (1) extraktionsrör (D4) och en (1) sammansatt reagensremsa krävs för varje prov och varje extern kontroll som ska testas. Ta ut det antal komponenter som krävs ur respektive skyddspåsar eller kartonger. Avlägsna överskottsluft och förslut med blixtlåset för att lagra öppnade påsar med mastermix eller extraktionsrör. 1. Märk ett streckkodat BD MAX-provbuffertrör (genomskinligt lock) med lämplig providentifiering. Täck inte, skriv inte eller sätt någon etikett över 2D-streckkoden. 2. Vortexblanda icke-konserverade eller Cary-Blair-konserverade prover vid hög hastighet under 15 sekunder. 3. Ta bort det genomskinliga locket från provbuffertröret och ympa på följande sätt: a. För in en inympningsögla för engångsbruk tills hela slingan är nedsänkt i provet. För inte in längre än öglans längd eftersom ytterligare avföring som finns på skaftet kan överbelasta PCR-reaktionen. b. För in den laddade öglan i provbuffertröret och exprimera provet med en snurrande rörelse. OBS! Hela provet behöver inte avlägsnas från öglan. Den resulterande lösningen i provbuffertröret bör vara tefärgad. 4. Återförslut det ympade provbuffertröret med ett membranlock. 5. Placera provbuffertröret i ett ställ som är kompatibelt med en vortexblandare för flera rör, om sådan finns tillgänglig (t.ex. kryogen flaskhållare eller motsvarande). 6. Förbered eventuella ytterligare prover för testning genom att upprepa steg 1 till 5 och säkerställ att dina handskar är rena innan du hanterar ytterligare prover. 7. Vortexblanda alla beredda prover samtidigt vid maximal hastighet under en (1) minut med en vortexblandare för flera rör. 8. Fortsätt till avsnittet Användning av BD MAX-systemet för att utföra testning av BD MAX Enteric Viral Panel på BD MAX-systemet. Användning av BD MAX-systemet OBS! Se Användarhandbok för BD MAX-systemet 9 för detaljerade anvisningar (se avsnittet Användning ). OBS! Testning av BD MAX Enteric Viral Panel måste utföras omedelbart efter vortexblandningssteget ovan (se Provberedning, steg 7). Om omtestning krävs måste provet/proverna vortexblandas på nytt. 1. Starta BD MAX-systemet (om det inte redan är på) och logga in genom att ange <user name> (användarnamn) och <password> (lösenord). 2. Handskar måste bytas innan reagenser och kassetter hanteras. 3. Ta ut önskat antal sammansatta reagensremsor ur BD MAX Enteric Viral Panel-kitet. Knacka försiktigt varje sammansatt reagensremsa mot en hård yta för att säkerställa att alla vätskor finns på rörens botten. 4. Ta ut önskat antal extraktionsrör och mastermixrör ur deras skyddspåsar från BD MAX Enteric Viral Panel-kitet. 5. Tryck ut överflödig luft och förslut påsarna med blixtlåset. 5
6. För varje prov som ska testas ska en (1) sammansatt reagensremsa placeras på BD MAX-systemets ställ med början i position 1 i ställ A. 7. Kläm fast ett (1) extraktionsrör (D4) (vit folie) i varje sammansatt reagensremsa i position 1 enligt figur 1. 8. Kläm fast ett (1) BD MAX Enteric Viral Panel-mastermixrör (D6) (grön folie) i varje sammansatt reagensremsa i position 2 enligt figur 1. 9. Kläm fast ett (1) BD MAX Enteric Viral Panel-mastermixrör (D5) (blå folie) i varje sammansatt reagensremsa i position 4 enligt figur 1. Figur 1: Kläm fast BD MAX Enteric Viral Panel-extraktionsrör och BD MAX Enteric Viral Panel-mastermixrör i de sammansatta reagensremsorna 10. Klicka på fliken Run (Kör) och sedan på underfliken Inventory (Förteckning) och skriv in lotnumret för BD MAX Enteric Viral Panel-kitet och lotnumret för BD MAX Enteric Viral Panel-mastermixen (för spårbarhet av loten) genom att antingen skanna streckkoden med skannern eller genom manuell inmatning. OBS! Upprepa steg 10 varje gång en ny kit-lot används. 11. Gå till Worklist (Arbetslista). Använd rullgardinsmenyn och välj <BD MAX ENT VIR 49>. 12. Välj rätt lotnummer för kitet (finns på ytterkartongen till BD MAX Enteric Viral Panel) samt lotnumret för BD MAX Enteric Viral Panel-mastermixen i rullgardinsmenyn. 13. Ange ID för BD MAX Enteric Viral Panel-provbuffertröret, patient-id och accessionsnummer (i förekommande fall) i Worklist (Arbetslista), antingen genom att skanna streckkoden med skannern eller genom manuell inmatning. 14. Upprepa steg 13 för alla återstående provbuffertrör. 15. Sätt provbuffertrören i BD MAX-systemets ställ som motsvarar de sammansatta reagensremsorna som sattes samman i steg 6 till 9. OBS! Sätt provbuffertrören i provstället med 1D-streckkodsetiketterna vända utåt (det underlättar skanning av provbuffertrören vid inloggning av proverna). 16. Sätt i det antal BD MAX PCR-kassetter som behövs i BD MAX-systemet (se figur 2): Varje BD MAX PCR-kassett kan användas till 1 körning med upp till 12 prover, alltså sammanlagt 12 prover. BD MAX-systemet kommer automatiskt att välja plats och rad på BD MAX PCR-kassetten inför varje körning. BD MAX PCR-kassetterna används baserat på körningar OCH ställ (1 körning per kassett och 1 kassett per ställ). För att maximera användningen av BD MAX PCR-kassetter vid användning av 2000 Sample Mode (Läge med 2000 prover) väljer du Run Wizard (Körningsguiden) under fliken Worklist (Arbetslista) för tilldelning av banor. Se BD MAX-systemets användarhandbok 9 för mer information. Figur 2: Ladda BD MAX PCR-kassetter 6
17. Ladda ställ i BD MAX-systemet (se figur 3). Sida A Sida B Figur 3: Ladda ställ i BD MAX-systemet 18. Stäng BD MAX-systemets lock och klicka på <Start> (Starta) för att påbörja bearbetningen. 19. Kontrollera resultaten omedelbart efter körningen eller förvara provbuffertrören vid 2 8 C i upp till 5 dagar (120 timmar) ELLER vid 2 25 C i högst 48 timmar tills resultaten har kontrollerats. OBS! Om ett membranlock skadas under körningen ska det bytas ut mot ett nytt innan provet förvaras. OBS! Beredda BD MAX-provbuffertrör kan förvaras vid 2 8 C i högst 120 timmar (5 dagar) ELLER vid 2 25 C i högst 48 timmar. Om resultatet är Indeterminate (IND) (Obestämt), Unresolved (UNR) (Olöst) eller Incomplete (INC) (Ofullständigt), eller om ett externt kontrollfel inträffar, måste ett test från det beredda provbuffertröret upprepas inom denna tidsram (se avsnittet Upprepa testförfarande). KVALITETSKONTROLL Förfaranden för kvalitetskontroll används för att övervaka analysens prestanda. Laboratorier måste fastställa antal, typ av och intervall för tester av kontrollmaterial i enlighet med riktlinjer eller krav utfärdade av lokala, landstings-, statliga och/eller kommunala bestämmelser eller från ackrediteringsorganisationer i syfte att kontrollera effektiviteten hos hela analysprocessen. Allmänna riktlinjer för kvalitetskontroll finns i dokumenten MM3 10 och EP12 11 från Clinical Laboratory Standards Institute. 1. Externa kontrollmaterial tillhandahålls inte av BD. Externa positiva och negativa kontroller används inte av BD MAX-systemets programvara för tolkning av testresultat. Externa kontroller behandlas som om de vore patientprover. (Se tabell 2 för tolkning av den externa kontrollens analysresultat.) 2. En (1) extern positiv kontroll och en (1) extern negativ kontroll bör köras minst dagligen tills adekvat processvalidering uppnås på BD MAX-systemet i varje laboratoriemiljö. Minskad frekvens av kontrolltestning ska göras i enlighet med tillämpliga föreskrifter. 3. Den externa positiva kontrollen används för att övervaka förekomsten av större reagensfel. Den externa negativa kontrollen är avsedd för att detektera reagens- eller miljökontamination (eller överföring) av målnukleinsyror. 4. Olika typer av externa kontroller rekommenderas så att användaren kan välja den som är mest lämplig för kvalitetskontrollprogrammet i deras laboratorium. a. Extern negativ kontroll: Kommersiellt tillgängligt kontrollmaterial eller ett sedan tidigare karakteriserat prov som fastställts vara negativt. BD rekommenderar att den externa negativa kontrollen framställs före den externa positiva kontrollen för att minska risken för förorening till följd av kontrollberedningen. b. Extern positiv kontroll: Kommersiellt tillgängliga kontrollmaterial, t.ex. ZeptoMetrix-stammarna som anges nedan (se tabell 1), eller sedan tidigare karakteriserade prover som fastställts vara positiva. Tabell 1: Kommersiellt tillgängliga stammar för extern positiv kontroll Stam för extern positiv kontroll Rekombinant norovirus GI eller GII Rotavirus A Adenovirus F40 eller F41 Humant astrovirus typ 4 eller typ 8 Artikelnummer ZeptoMetrix 0886CF eller 0887CF ZeptoMetrix 0841CF eller 0810281CF ZeptoMetrix 0884CF eller 885CF ZeptoMetrix 0810276CF eller 0810277CF För beredning av extern kontrollsuspension rekommenderas att respektive virusodlingsvätska späds med en spädning på 1:10 i TE-buffert. Inokulera 5 μl av virussuspensionen i det motsvarande provbuffertröret. Bearbeta och testa som ett prov (se avsnitten Provberedning och Användning av BD MAX-systemet). 7
5. Alla externa kontroller ska ge förväntade resultat (positivt för extern positiv kontroll och negativt för extern negativ kontroll) och inga misslyckade externa kontroller (olösta, obestämda eller ofullständiga resultat). 6. En extern negativ kontroll som ger ett positivt testresultat är indikativt för fel på provhanteringen och/eller att en förorening har inträffat. Granska provhanteringstekniken för att undvika sammanblandning och/eller kontamination. En extern positiv kontroll som ger ett negativt resultat är indikativt för felaktig provhantering/beredning. Granska provhanterings-/beredningstekniken. 7. En extern kontroll som ger ett olöst, obestämt eller ofullständigt resultat är indikativt för ett reagens- eller BD MAX-systemfel. Kontrollera om några felmeddelanden visas på BD MAX-systemets bildskärm. Se avsnittet Översikt över systemfel i BD MAX-systemets användarhandbok 9 för tolkningar av varnings- och felkoder. Om problemet kvarstår, använd reagenser från en oöppnad påse eller använd ett nytt BD MAX Enteric Viral Panel-kit. 8. Varje BD MAX Enteric Viral Panel-extraktionsrör innehåller en provbearbetningskontroll som är en armerad RNAkonstruktion med en syntetisk mål-rna-sekvens. Provbearbetningskontrollen extraheras, elueras och amplifieras tillsammans med eventuellt DNA/RNA i det bearbetade provet, vilket säkerställer analysens förutsägbarhet. Med hjälp av provbearbetningskontrollen övervakas effektiviteten i insamling, tvättning och eluering av DNA/RNA under provbearbetningen, samt effektiviteten i konverteringen av RNA till DNA och amplifiering och detektion av DNA-målet under PCR-analysen. Om resultatet av provbearbetningskontrollen inte uppfyller kriterierna för godkännande rapporteras provresultatet som olöst. Eventuella positiva (POS) analysresultat rapporteras dock och inga mål anges som negativa (NEG). Detta rapporteras per mastermix. Ett olöst resultat är indikativt för en provrelaterad inhibering eller ett reagensfel. Upprepa eventuellt prov som rapporterats som olöst enligt avsnittet Upprepa testförfarande nedan. RESULTATTOLKNING Resultat finns på fliken <Results> (Resultat) i fönstret <Results> (Resultat) på BD MAX-systemets bildskärm. Testresultaten tolkas automatiskt av BD MAX-systemets programvara. Resultaten rapporteras för var och en av analyterna och för provbearbetningskontrollen. Ett testresultat kan kallas NEG (negativt), POS (positivt) eller UNR (olöst) baserat på målets amplifieringsstatus och provbearbetningskontrollen. Vid ett delvist UNR-resultat, där ett eller flera mål har ett POS-resultat och alla andra mål har UNR-resultat, kommer målet med ett UNR-resultat inte att kallas NEG. Detta rapporteras per mastermix. Tolkningen av resultat för BD MAX Enteric Viral Panel beskrivs nedan i tabell 2. RAPPORTERAT ANALYSRESULTAT NoV POS RoV POS AdV POS hastv POS SaV POS NoV NEG RoV NEG AdV NEG hastv NEG SaV NEG NoV UNR RoV UNR AdV UNR hastv UNR SaV UNR Indeterminate (IND) Incomplete (INC) Tabell 2: Tolkning av resultat från BD MAX Enteric Viral Panel TOLKNING AV RESULTAT RNA för Norovirus GI eller GII detekterat RNA för rotavirus A detekterat DNA för adenovirus F40/F41 detekterat RNA för hastro detekterat RNA för sapovirus genotyp I, II, IV eller V detekterat Inget RNA från norovirus detekterat och provbearbetningskontroll detekterad Inget RNA från rotavirus A detekterat och provbearbetningskontroll detekterad Inget DNA från adenovirus F40/F41 detekterat och provbearbetningskontroll detekterad Inget RNA från hastro detekterat och provbearbetningskontroll detekterad Inget RNA från sapovirus genotyp I, II, IV eller V detekterat och provbearbetningskontroll detekterad. Inget RNA från norovirus GI eller GII detekterat och ingen provbearbetningskontroll detekterad (indikativt för ett inhiberande prov eller reagensfel) Inget RNA från rotavirus A detekterat och ingen provbearbetningskontroll detekterad (indikativt för ett inhiberande prov eller reagensfel) Inget DNA från adenovirus F40/F41 detekterat och ingen provbearbetningskontroll detekterad (tyder på inhiberande prov eller reagensfel) Inget RNA från hastro detekterat och ingen provbearbetningskontroll detekterad (indikativt för ett inhiberande prov eller reagensfel) Inget RNA från sapovirus genotyp I, II, IV eller V detekterat och ingen provbearbetningskontroll detekterad Obestämt resultat på grund av BD MAX-systemfel (med varnings- eller felkoder a ) Ofullständig körning (med varnings- eller felkoder a ) a Tolkningar av varnings- och felkoder finns i avsnittet Felsökning i Användarhandbok för BD MAX-systemet. 9 8
UPPREPA TESTFÖRFARANDE OBS! Det finns endast tillräckligt med provvolym i provbuffertröret för en upprepad körning. Provbuffertrör som förvaras i 2 25 C måste testas om inom 48 timmar efter den första ympningen av provbuffertröret med provet. Alternativt kan provbuffertrör som förvaras i 2 8 C testas om inom 120 timmar (5 dagar) efter den första ympningen av provbuffertröret med provet. Återstående avföringsprov kan också användas för upprepat test inom 120 timmar (5 dagar) efter insamlingen om det förvaras vid 2 8 C eller inom 48 timmar om det förvaras vid 2 25 C. OBS! Nya prover kan testas vid samma körning som de upprepade proverna. OLÖST RESULTAT Olösta resultat kan uppstå om en provrelaterad inhibering eller ett reagensfel förhindrar att målet eller provbearbetningskontrollen amplifieras korrekt. Om provbearbetningskontrollen inte amplifieras rapporteras provet som UNR, medan positiva (POS) analysresultat rapporteras och alla andra mål anges som UNR. BD MAX-systemet rapporterar resultat för respektive mål separat och ett UNR-resultat kan erhållas för ett eller flera BD MAX Enteric Viral Panel-mål. Vid ett fullständigt UNR-resultat där alla mål har ett UNR-resultat måste testet upprepas. Vid ett partiellt UNR-resultat för BD MAX Enteric Viral Panel, där ett eller flera mål har ett POS-resultat och alla andra mål har ett UNRresultat, bör testet upprepas enligt beskrivningen ovan. I sällsynta fall kan avvikande resultat observeras när ett upprepat test körs för de mål som inledningsvis rapporterades som POS. I så fall bibehålls eventuellt positivt resultat. Prover kan upprepas från sina motsvarande provbuffertrör inom de tidsramar som anges ovan. Vortexblanda proverna under en (1) minut och börja om från avsnittet Användning av BD MAX-systemet. Återstående avföringsprov kan också användas för upprepade test med ett nytt provbuffertrör inom de tidsramar som anges ovan. Starta om från avsnittet Provberedning. OBESTÄMT RESULTAT Obestämda resultat kan erhållas vid systemfel. Prover kan upprepas från sina motsvarande provbuffertrör inom de tidsramar som anges ovan. Vortexblanda proverna i en (1) minut och börja om enligt avsnittet Användning av BD MAX-systemet. Återstående avföringsprov kan också användas för upprepade test med ett nytt provbuffertrör inom den tidsram som anges ovan. Starta om från avsnittet Provberedning. Tolkningar av varnings- och felkodsmeddelanden finns i Användarhandbok för BD MAX-systemet 9 (se avsnittet Felsökning ). OFULLSTÄNDIGT RESULTAT Ofullständiga resultat kan erhållas om beredningen av provmaterialet eller PCR:en misslyckades. Prover kan upprepas från sina motsvarande provbuffertrör inom de tidsramar som anges ovan. Vortexblanda proverna i en (1) minut och börja om enligt avsnittet Användning av BD MAX-systemet. Återstående avföringsprov kan också användas för upprepade test med ett nytt provbuffertrör inom den tidsram som anges ovan. Starta om från avsnittet Provberedning. Tolkningar av varnings- och felkodsmeddelanden finns i Användarhandbok för BD MAX-systemet 9 (se avsnittet Felsökning ). EXTERNT KONTROLLFEL Externa kontroller ska ge förväntade resultat vid testning. Om prover måste upprepas p.g.a. ett felaktigt resultat från extern kontroll ska de upprepas från sina provbuffertrör tillsammans med nyberedda externa kontroller inom de tidsramar som anges ovan. Vortexblanda proverna i en (1) minut och börja om enligt avsnittet Användning av BD MAX-systemet. ODLING AV PROVMATERIAL Odling och identifiering av organismer från positiva prover bör utföras i enlighet med laboratorieprocedurerna. PROCEDURENS BEGRÄNSNINGAR Denna produkt får endast användas med BD MAX-systemet. Denna produkt är endast avsedd för användning med icke-konserverade och Cary-Blair-konserverade humana avföringsprover. Avföringsprover från rektala bomullstoppar eller fast avföring har inte validerats med BD MAX Enteric Viral Panel. Felaktiga testresultat kan uppstå till följd av felaktig provtagning, hantering, förvaring, tekniskt fel, sammanblandning av prover eller på grund av att antalet organismer i provet är lägre än testets analytiska sensitivitet. Om BD MAX Enteric Viral Panel resulterar i IND, INC eller UNR (för ett eller flera mål) bör testet upprepas. Ett positivt resultat från BD MAX Enteric Viral Panel indikerar inte alltid förekomst av viabla organismer. Det indikerar dock förekomst av mål-dna/rna. Mutationer eller polymorfismer i primer- eller probbindande regioner kan påverka detektionen av nya eller okända målvarianter, vilket kan ge ett falskt negativt resultat med BD MAX Enteric Viral Panel. BD MAX Enteric Viral Panel detekterar norovirus GI och GII på samma gång och skiljer inte mellan arter. BD MAX Enteric Viral Panel detekterar adenovirus F40 och F41 på samma gång och skiljer inte mellan arter. BD MAX Enteric Viral Panel detekterar sapovirusets genotyper I, II, IV och V på samma gång och skiljer inte mellan arter. Som med alla PCR-baserade test kan extremt låga nivåer av målet under analysens detektionsgräns detekteras utan att resultaten är reproducerbara. Falskt negativa resultat kan uppstå p.g.a. förlust av nukleinsyra till följd av felaktig provtagning, transport eller förvaring av proverna, eller p.g.a. inadekvat viruslysering. Provbearbetningskontrollen har lagts till i testet för att bidra till identifiering av prover som innehåller inhiberare av PCR-amplifiering och som en kontroll för att reagenserna är felfria och för analyssystemet i sin helhet. Provbearbetningskontrollen indikerar inte om nukleinsyra har gått förlorad på grund av felaktig provtagning, transport eller förvaring av proverna, eller om virushöljena har lyserats adekvat. 9
Resultat från BD MAX Enteric Viral Panel bör användas som ett komplement till kliniska observationer och annan information som finns tillgänglig för läkaren. Som med alla in vitro-diagnostiska test beror positiva och negativa prediktiva värden i hög grad på prevalens. Prestanda hos BD MAX Enteric Viral Panel kan variera beroende på den prevalens och population som testas. Resultat från BD MAX Enteric Viral Panel kan eventuellt påverkas av samtidig läkemedelsbehandling, vilket kan minska mängden närvarande mål. Provbuffertröret har inte utformats för att stödja organismers livsduglighet. Om odling krävs måste denna göras från det ursprungliga provet. Utförandet av detta test har inte fastställts för övervakande av behandling av infektioner med norovirus GI och GII, rotavirus A, adenovirus F40/F41, sapovirus (genotyper I, II, IV, V) och hastro. Detta test är ett kvalitativt test och det tillhandahåller inte kvantitativa värden och anger inte mängden närvarande organismer. Prestanda för detta test har inte utvärderats med immunsupprimerade personer eller patienter utan symptom på gastrointestinal infektion. Effekten av interferens orsakad av andra substanser har endast utvärderats för de substanser som anges i denna information. Potentiell interferens har inte utvärderats för andra substanser än de som beskrivs i avsnittet om interferens nedan. Interferens av andra substanser än de som beskrivs i avsnittet om interferens nedan kan leda till felaktiga resultat. Adenovirus typ 1 som förknippas med infektioner hos människa har visat sig ha potential att korsreagera med BD MAX Enteric Viral Panel. Korsreaktivitet med andra organismer än de som anges i avsnittet Analytisk specificitet nedan har inte utvärderats. KLINISKA PRESTANDA Kliniska prestanda för BD MAX Enteric Viral Panel fastställdes i en intern, simulerad klinisk studie med kliniskt erhållna prospektiva och retrospektiva prover. Den kliniska studien bestod av 2 239 prover, varav 1 048 prover utan konserveringsmedel och 1 191 Cary-Blair-konserverade prover. Prestandaresultaten från den simulerade kliniska studien presenteras nedan för respektive mål i tabell 3 till 7. Tabell 3: Prestanda för norovirus: Kombinerade provtyper Referensmetod BD MAX Totalt P N P 137 7 144 N 9 1 287 1 296 Totalt 146 1 294 1 440 PPA : 93,8 % (88,7 %, 96,7 %) NPA : 99,5 % (98,9 %, 99,7 %) Tabell 4: Prestanda för rotavirus: BD MAX P Referensmetod N Totalt Kombinerade provtyper P 105 6 111 N 0 1 308 1 308 Totalt 105 1 314 1 419 PPA : % (96,5 %, %) NPA : 99,5 % (99,0 %, 99,8 %) 10
Tabell 5: Prestanda för adenovirus: BD MAX P Referensmetod N Totalt Kombinerade provtyper P 29 0 29 N 0 1 452 1 452 Totalt 29 1 452 1 481 PPA : % (88,3 %, %) NPA : % (99,7 %, %) Tabell 6: Prestanda för sapovirus: BD MAX P Referensmetod N Totalt Kombinerade provtyper P 56 9 65 N 8 1 340 1 348 Totalt 64 1 349 1 413 PPA : 87,5 % (77,2 %, 93,5 %) NPA : 99,3 % (98,7 %, 99,6 %) Tabell 7: Prestanda för humant Astrovirus: BD MAX P Referensmetod N Totalt Kombinerade provtyper P 52 3 55 N 4 1 423 1 427 Totalt 56 1 426 1 482 PPA : 92,9 % (83,0 %, 97,2 %) NPA : 99,8 % (99,4 %, 99,9 %) Ej rapporterbar frekvens Den initiala frekvensen av olösta resultat för de 1 724 prospektiva proverna som utvärderades i denna studie var 0,9 % av de Cary-Blair-konserverade proverna och 2,2 % av de icke-konserverade proverna. Frekvensen för olösta resultat efter ett validerat upprepningstest var endast 0,1 % av de Cary-Blair-konserverade proverna och 1,3 % av de icke-konserverade proverna (se tabell 8). Av de 1 724 prospektiva prover som utvärderades i denna studie rapporterades initialt 0,5 % av de Cary-Blair-konserverade proverna och 1,6 % av de icke-konserverade proverna som obestämda. Efter ett validerat upprepningstest förblev 0,1 % av de Cary-Blair-konserverade proverna och inga av de icke-konserverade proverna obestämda (se tabell 8). Av de 1 724 prospektiva prover som utvärderades i denna studie rapporterades initialt 0,1 % av de Cary-Blair-konserverade proverna och 0,4 % av de icke-konserverade proverna som ofullständiga. Efter ett validerat upprepningstest förblev 0,1 % av de Cary-Blair-konserverade proverna och inga av de icke-konserverade proverna ofullständiga (se tabell 8). Tabell 8: Frekvenser av ej rapporterbara för kombinerat mål (totalt) Kombinerat mål Frekvens olösta prover Frekvens obestämda prover Frekvens ofullständiga prover Total frekvens Provmaterialtyp Initial EVP Slutlig EVP Initial EVP Slutlig EVP Initial EVP Slutlig EVP Initial EVP Slutlig EVP Cary-Blairkonserverade 0,9 9/952 (0,5, 1,8) 0,1 1/943 (0,0, 0,6) 0,5 5/952 (0,2, 1,2) 0,1 1/943 (0,0, 0,6) 0,1 1/952 (0,0, 0,6) 0,1 1/943 (0,0, 0,6) 1,6 15/952 (1,0, 2,6) 0,3 3/943 (0,1, 0,9) Ickekonserverade 2,2 17/772 (1,4, 3,5) 1,3 10/762 (0,7, 2,4) 1,6 12/772 (0,9, 2,7) 0,0 0/762 (0,0, 0,5) 0,4 3/772 (0,1, 1,1) 0,0 0/762 (0,0, 0,5) 4,1 32/772 (3,0, 5,8) 1,3 10/762 (0,7, 2,4) Kombinerade 1,5 26/1 724 (1,0, 2,2) 0,6 11/1 705 (0,4, 1,2) 1,0 17/1 724 (0,6, 1,6) 0,1 1/1 705 (0,0, 0,3) 0,2 4/1 724 (0,1, 0,6) 0,1 1/1 705 (0,0, 0,3) 2,7 47/1 724 (2,1, 3,6) 0,8 13/1 705 (0,4, 1,3) 11
Analytisk inklusivitet En mängd olika målstammar för BD MAX Enteric Viral Panel-analysen ingick i denna studie. Urvalskriterierna för stammarna inkluderade prevalens, serotyp och geografisk plats, om tillämpligt. Femtioåtta (58) stammar testades, inklusive stammar från offentliga samlingar och välkarakteriserade kliniska isolat. Inklusivitetstestningen omfattade 22 stammar av norovirus GI och GII, 5 stammar av rotavirus, 10 stammar av adenovirus F40/F41, 11 stammar av sapovirus och 10 stammar av hastro. Dessa stammar testades vid 3 LoD (detektionsgränsen) för motsvarande stam i icke-konserverad avföringsmatris. BD MAX Enteric Viral Panel identifierade korrekt alla 58 av de stammar som testades vid den initiala testningen. Analytisk sensitivitet Den analytiska sensitiviteten (detektionsgräns eller LoD) för BD MAX Enteric Viral Panel fastställdes enligt följande: Varje målorganism bereddes och kvantifierades innan de inkluderades i denna studie. Separata ympöglor doppades i respektive organismberedning och överfördes sedan till ett provbuffertrör som redan innehöll fekal matris (med eller utan konserveringsmedel) som tidigare fastställts vara negativ för alla de mål som detekteras med BD MAX Enteric Viral Panel. Varje organism testades med minst 20 replikat per provtyp (med eller utan konserveringsmedel), av två operatörer, med tre olika produktionsloter av BD MAX Enteric Viral Panel. LoD för en viss organism bekräftades genom testning av minst 20 ytterligare replikat vid den fastställda LoD-koncentrationen. Den analytiska sensitiviteten (LoD) definieras som den lägsta koncentrationen vid vilken minst 95 % av alla replikat förväntas visa positivt resultat (se tabell 9). Tabell 9: Detektionsgräns för enskilda mål för BD MAX Enteric Viral Panel Målorganism Norovirus Rotavirus Adenovirus Humant astrovirus Sapovirus Stam LoD utan konserveringsmedel (cp/ml i avföring) LoD för Cary-Blairkonserverade (cp/ml i avföring) GI 6,28E + 06 4,71E + 06 GII 2,49E + 05 2,49E + 05 WA 6,46E + 03 1,29E + 04 Va70 1,16E + 04 5,82E + 03 F40 6,89E + 04 2,75E + 05 F41 8,16E + 04 1,22E + 05 typ 4 1,75E + 07 3,49E + 07 typ 8 5,23E + 06 2,09E + 07 GI 6,51E + 07 6,51E + 07 GII 1,94E + 06 1,94E + 06 Analytisk specificitet (korsreaktivitet och exklusivitet) BD MAX Enteric Viral Panel utfördes på prover som innehöll fylogenetiskt besläktade arter och andra organismer (bakterier, virus, parasiter och jäst) som kan förekomma i avföringsprover. Bakterieceller, jästsvampar, parasiter och virus testades i provbuffertröret vid 10 6 CFU, celler eller genomekvivalenter/ml i avföring eller 10 5 PFU/mL i avföring eller TCID50/mL i avföring. Sammanlagt testades 112 organismer. De flesta av bakteriestammarna, jästsvamparna, parasiterna och virusen som testades gav negativa resultat med BD MAX Enteric Viral Panel. Adenovirus typ 1 som är förknippat med sjukdom hos människa gav positiva resultat med BD MAX Enteric Viral Panel. Inga positiva resultat noterades dock vid 1,0 x 10 4,8 TCID50-enheter/mL i avföring för denna stam. Störande substanser Trettiotvå (32) biologiska och kemiska ämnen som ibland kan finnas i avföringsprover utvärderades för potentiell interferens med BD MAX Enteric Viral Panel. I denna studie ingick en antibiotikablandning som bestod av en kombination av sju olika antibiotika eller analgetika som testades samtidigt. Dessa antibiotika eller analgetika omfattade natriumnaproxen, dinatriumceftriaxon, erytromycin, metronidazol, sulfametoxazol, tetracyklinhydroklorid och trimetoprim. Hydrokortisonkräm befanns interferera vid nivåer över 25 % volym/volym. Vaccinet RotaTeq gav som förväntat också positiva resultat eftersom vaccinet kan finnas kvar i avföringen i upp till 9 dagar efter vaccinationen. 12 Resultaten uppvisade ingen rapporterbar interferens med någon annan testad substans (se tabell 10). Vidare utvärderades mikroorganismer som kan förekomma endogent i avföringsprover för potentiell interferens med BD MAX Enteric Viral Panel. Fem (5) organismer testades vid hög koncentration (1 10 6 celler/ml i avföring). Resultaten uppvisade ingen rapporterbar interferens med någon testad mikroorganism (se tabell 11). 12
Tabell 10: Endogena och kommersiella exogena ämnen som testats med BD MAX Enteric Viral Panel Varumärkesnamn eller beskrivning Resultat Varumärkesnamn eller beskrivning Resultat Fekalt fett NI Spermiedödande glidmedel NI Humant DNA NI Suppositorier (glycerin) NI Slem NI Vagisil NI Humant helblod NI Laxeringsmedel NI Hydrokortisonkräm I Diarréhämmande medel (lösning) NI Antiseptiska våtservetter NI Diarréhämmande medel (tablett) NI Lavemang, mineralolja NI Antibiotikablandning NI Hemorrojdgel NI Syraneutraliserande medel NI Nystatinkräm NI Icke-steroida antiinflammatoriska medel (NSAID) NI Topisk antibiotika NI RoV-vaccin (rotavirus reassortant ATCC VR-2195 och VR-2415) NI I: Rapporterbar interferens med BD MAX Enteric Viral Panel vid höga koncentrationer. NI: Ingen rapportbar interferens med BD MAX Enteric Viral Panel. Tabell 11: Mikroorganismer som testats för interferens med BD MAX Enteric Viral Panel Mikroorganism Salmonella typhimurium Escherichia coli Proteus vulgaris Enterococcus faecalis Peptostreptococcus anaerobius NI: Ingen rapportbar interferens med BD MAX Enteric Viral Panel. Resultat Blandinfektion/kompetitiv interferens Interferensstudien för blandad infektion/konkurrensbetonad interferens utformades för att utvärdera förmågan hos BD MAX Enteric Viral Panel att detektera låga positiva resultat vid förekomsten av andra mål vid höga koncentrationer. En blandning med 2 av 3 organismer (norovirus, rotavirus, adenovirus) för mastermix D6 eller en blandning med 1 av 2 organismer (sapovirus, hastro) för mastermix D5 bereddes vid den 95:e percentilen som observerades under den kliniska prövningen för att simulera en hög klinisk belastning som fungerar som höga mål i BD MAX Enteric Viral Panel-provbuffertröret. Analyten för BD MAX Enteric Viral Panel som inte fanns i blandningen med höga mål tillsattes i provbuffertröret vid en koncentration av 2 respektive LoD vilket representerade ett mål med låg belastning tillsammans med 5 µl icke-konserverad avföring och testades för att simulera blandinfektioner. I närvaro av höga belastningar detekterades alla organismer som motsvarade sina respektive beredningar för simulerade blandinfektioner framgångsrikt av BD MAX Enteric Viral Panel. Precision Precisionen inom laboratoriet utvärderades för BD MAX Enteric Viral Panel på ett laboratorium. Testet utfördes under 12 dagar, med två körningar per dag (en vardera av två operatörer), alltså totalt 24 körningar. Fem specifika målorganismer, vid olika koncentrationer, användes för att skapa panelmedlemmarna för denna studie. Panelmedlemmarna innehöll norovirus, rotavirus, adenovirus, sapovirus och hastro. Följande värden användes som spetsade nivåer för målorganismerna i varje panelmedlem: Måttligt positiv (MP): 2,99 LoD Lågt positiv (LP): 1,99 LoD Sant negativ (TN): Inget mål NI NI NI NI NI 13
Till varje panelmedlem tillsattes negativ icke-konserverad avföringsmatris. Sant negativa prover innehöll inget mål. Resultaten sammanfattas enligt mål och koncentration i tabell 12. Tabell 12: Resultat för precisionsstudie med en lot av BD MAX Enteric Viral Panel Kategori Norovirus Överensstämmelse med förväntade resultat Rotavirus Adenovirus Sapovirus Humant astrovirus TN (192/192) (98,0, ) 99,5 191/192 (97,1, 99,9) (192/192) (98,0, ) (192/192) (98,0, ) (192/192) (98,0, ) LP MP Reproducerbarhet Studien av reproducerbarhet mellan laboratorier genomfördes på tre (3) kliniska laboratorier med en (1) reagenslot. Två (2) operatörer utförde två (2) körningar per dag under fem (5) olika dagar (i följd eller inte i följd), alltså sammanlagt 30 körningar. Panelerna som användes var samma som beskrivs i avsnittet Precision ovan. Den procentuella överensstämmelsen för reproducerbarhet mellan laboratorier var % för TN för alla mål och varierade från 97,8 till % och 96,7 till % för LP respektive MP. Resultaten sammanfattas i tabell 13. Resultaten för kvantitativ reproducerbarhet mellan laboratorier och efter mål presenteras i tabell 13. CT-poäng och cykel-ep är interna kriterier som användes för att fastställa ett slutligt analysresultat och valdes som ett sätt att bedöma analysens kvantitativa reproducerbarhet. Medelvärden för CT-poäng och medelvärden för cykel-ep med varianskomponenter (SD och % CV) visas i tabell 14. Tabell 13: Resultat från reproducerbarhetsstudie mellan laboratorier med en lot med BD MAX Enteric Viral Panel Kategori Norovirus Rotavirus Överensstämmelse med förväntade resultat Adenovirus Sapovirus Humant astrovirus TN (360/360) (360/360) (360/360) (360/360) (360/360) LP 97,8 (88/90) 98,9 (89/90) MP 96,7 (87/90) Tabell 14: Resultat för kvantitativ reproducerbarhet mellan laboratorier för BD MAX Enteric Viral Panel PCRvärde CTpoäng Cykel- EP Parameter Norovirus Rotavirus Adenovirus Sapovirus Humant astrovirus SPC för MM1 SPC för MM2 LP MP LP MP LP MP LP MP LP MP TN TN N 90 90 88 90 90 90 90 87 89 90 90 90 Medelvärde 29,8 29,6 32,3 31,3 28,5 28,6 29,1 28,6 28,9 27,7 26,8 27,5 SD 0,41 0,43 0,66 0,52 0,65 0,62 0,44 0,50 0,45 0,32 0,27 0,37 % CV 1,4 1,4 2,0 1,7 2,3 2,2 1,5 1,7 1,6 1,2 1,0 1,3 N 90 90 88 90 90 90 90 87 89 90 90 90 Medelvärde 4 553,4 4 129,3 737,5 925,2 1 067,0 1 097,1 754,2 962,5 3 165,7 4 785,5 8 581,7 7 667,9 SD 1 269,47 1 769,10 359,91 382,36 564,59 498,22 305,02 315,07 1 163,93 1 266,39 1 161,23 1 948,77 % CV 27,9 42,8 48,8 41,3 52,9 45,4 40,4 32,7 36,8 26,5 13,5 25,4 14