P0194(02) Svenska

Transkript

1 För in Vitro-diagnostik För användning tillsammans med BD MAX-systemet P0194(02) Svenska AVSEDD ANVÄNDNG BD MAX GC rt PCR är en PCR-analys i realtid (rt) och också ett in vitro-diagnostiskt test avsett för testning av Neisseria gonorrhoeae (GC)-positiva resultat från BD ProbeTec GC Q x Amplified DNA Assay (analys med DNA-amplifiering) som utförs på BD Viper-systemet med XTR-teknik. Analysen kan användas för detektion av GC-DNA i residualurinprover från kvinna eller man eller endocervikala, vaginala eller (hos män) uretrala residualpinnprover som har visat positivt resultat för GC med BD ProbeTec GC Q x Amplified DNA Assay. SAMMANFATTNG OCH FÖRKLARING AV FÖRFARANDET I Europa är gonorré den näst vanligaste sexuellt överförda bakterieinfektionen efter klamydiainfektioner. Under 2011 rapporterades fall av gonorré i majoriteten av EU-medlemsstaterna och frekvensen uppskattades till 12,6 per personer. Män rapporterades vara infekterade tre gånger så ofta som kvinnor med en genomsnittlig frekvens bland män på 21,2 per och 7,6 per bland kvinnor. Fyrtiotvå procent av fallen gällde unga vuxna. 1 Nukleinsyreamplifieringstest (NAAT) är mer känsliga än odling, möjliggör testning av en rad olika provtyper och kan klara längre transporter och förvaring. 2 Sensitiviteten är hög för symptomatisk och asymptomatisk infektion, både för prover som tas på klinik och som tas själv. Enligt europeiska (IUSTI) och brittiska (PHE) riktlinjer för detektion av Neisseria gonorrhoeae ska det använda testprotokollets positiva prediktiva värde (PPV) överstiga 90 % när NAAT används för att detektera Neisseria gonorrhoeae. PPV påverkas av specificiteten i den NAAT som används och av prevalensen hos den testade populationen. Om PPV inte överskrider 90 % rekommenderas att positiva prover genomgår bekräftande test som upprepas med en NAAT som inriktar sig på en annan sekvens. 3 PRINCIPER FÖR METODEN BD MAX GC rt PCR är utformat för användning med följande residualprover som har visat positivt resultat för GC med BD ProbeTec GC Q x Amplified DNA Assay: urinprover, antingen rena utan konserveringsmedel eller i en Urine Preservative Transport (UPT) (urinkonserveringstransport), eller endocervikala, vaginala eller (hos män) uretrala pinnprover. Proverna tas och transporteras till analyslaboratoriet i de provtagnings- och transportenheter som utvecklats för BD ProbeTec GC Q x Amplified DNA Assay, och under tids- och temperaturförhållanden som har funnits bevara målnukleinsyrans egenskaper. Dessa förhållanden beskrivs i bipacksedeln till BD ProbeTec GC Q x Amplified DNA Assay. När ett positivt resultat erhålls från ett prov med BD ProbeTec GC Q x -analysen med DNA-amplifiering överförs en alikvot från det tillämpliga BD ProbeTec GC Q x -provröret för BD Viper-systemet till ett BD MAX UVE Sample Buffer Tube (UVE-provbuffertrör). Detta BD MAX UVE-provbuffertrör försluts sedan med ett punkterbart membranlock. Efter att en arbetslista har skapats laddas BD MAX UVEprovbuffertrören, Unitized Reagent Strips (sammansatta reagensremsor) och BD MAX PCR Cartridge (PCR-kassett) i BD MAXsystemet. Användaren klämmer också fast BD MAX GC rt PCR Extraction Tubes (extraktionsrör) och Master Mix Tubes (mastermixrör) på sina respektive platser på den sammansatta reagensremsan. BD MAX-ställen laddas i BD MAX-systemet och körningen initieras. I BD MAX GC rt PCR ingår en provbearbetningskontroll som en av extraktionsrörets komponenter. Provbearbetningskontrollen övervakar reagensernas egenskaper och de processteg som ingår i extraktion, amplifiering och detektion av DNA samt eventuell förekomst av analysinhiberare. Nukleinsyror som frigörs från målorganismerna fångas på magnetiska affinitetskulor. Kulorna med de bundna nukleinsyrorna tvättas och nukleinsyrorna elueras med en kombination av värme och ph. Eluerat DNA neutraliseras och överförs till mastermixröret för att rehydrera PCR-reagenserna. Efter rekonstituering dispenserar BD MAX-systemet en bestämd volym PCR-färdigt prov innehållande extraherade nukleinsyror i BD MAX PCR Cartridge (kassetten). Mikroventiler i BD MAX PCR Cartridge (kassetten) försluts av systemet innan PCR initieras för att bibehålla amplifieringsblandningen och förebygga avdunstning och kontamination. De amplifierade DNA-målen detekteras med hydrolysprober (TaqMan), märkta i ena änden med ett fluorescerande färgämne (fluorofor), och i den andra med ett inhiberande fragment. Prober märkta med olika fluoroforer används till att detektera målanalyten och provbearbetningskontrollen i olika optiska kanaler i BD MAX-systemet. När proberna är i sitt nativa tillstånd inhiberas fluorescensen i fluoroforen p.g.a. dess närhet till inhiberaren. I närvaro av mål-dna hybridiserar dock proberna till sina komplementära sekvenser och hydrolyseras av DNA-polymerasens 5-3 -exonukleasaktivitet när den syntetiserar den begynnande strängen längs DNA-mallen. Till följd av detta separeras fluoroforerna från inhiberarmolekylerna och fluorescens avges. Mängden fluroescens som detekteras står i direkt proportion till mängden motsvarande probe som hydrolyseras. BD MAX-systemet övervakar dessa signaler vid varje PCR-cykel och tolkar data i slutet av reaktionen för att ge kvalitativa testresultat (d.v.s. positiva eller negativa). 1

2 REAGENSER OCH MATERIAL REF Innehåll Kvantitet BD MAX GC rt PCR Master Mix (B1) 24 test Torkad PCR Master Mix som innehåller DNA-polymeras, nukleotider och primrar och prober som (2x12 rör) är specifika för GC-provbearbetningskontrollen. BD MAX GC rt PCR Sammansatta reagensremsor som innehåller alla flytande reagenser och pipettspetsar för 24 test engångsbruk som behövs för provbearbetning och DNA-extraktion BD MAX GC rt PCR Extraction Tubes (B2) Torkade magnetiska affinitetskulor 'Torkad proteinas K Torkad provbearbetningskontroll 24 test (2x12 rör) BD MAX UVE Sample Buffer Tubes 24 rör Membranlock 25 MATERIAL SOM KRÄVS MEN EJ MEDFÖLJER BD MAX System (BD Kat. nr ). BD MAX PCR Cartridges (BD Kat. nr ). Vortex Genie 2 (VWR Kat. nr ) eller motsvarande. Kalibrerad pipett. Sterila pipettspetsar för engångsbruk. Lämplig personskyddsutrustning för hantering av mikrobiologiska prover inklusive labbrock, skyddsglasögon och engångshandskar. VARNGAR OCH FÖRSIKTIGHETSBEAKTANDEN BD MAX GC rt PCR är avsedd för in vitro-diagnostik. När det positiva provet för BD ProbeTec GC Q x -analysen med DNA-amplifiering har överförts till ett BD MAX UVE-provbuffertrör måste all BD MAX GC rt PCR-testning slutföras inom 5 dagar. Använd inte utgångna reagenser och/eller material. Använd inte kitet om etiketten som förseglar ytterkartongen är bruten vid mottagandet. Använd inte reagenserna om skyddspåsarna är öppna eller trasiga vid mottagandet. Använd inte reagenserna om torkmedel saknas eller är trasigt inuti reagenspåsarna. Ta inte bort torkmedlet ur reagenspåsarna. Förslut skyddspåsar med blixtlåset omedelbart efter varje användning. Tryck ut överflödig luft ur påsarna innan de försluts. Skydda reagenser mot värme och fuktighet. Långvarig exponering för fuktighet kan påverka produktens prestanda. Använd inte reagenserna om folien har öppnats eller skadats. Blanda inte reagenser från olika påsar och/eller kit eller loter. Alternera inte och återanvänd inte lock eftersom kontamination som kan äventyra testresultaten kan uppstå. Kontrollera att de sammansatta reagensremsorna är korrekt fyllda (se till att vätskorna finns på rörens botten) (se figur 1). Undersök de sammansatta reagensremsorna för att säkerställa att alla pipettspetsar finns på plats (se figur 1). Hantera kemiska lösningar försiktigt eftersom de kan göra streckkoden på mastermix- och extraktionsrören oläslig. God laboratorieteknik är avgörande för att den här analysen ska fungera korrekt. På grund av testets höga analytiska känslighet måste stor noggrannhet iakttas för att bevara materialens och reagensernas färskhet. I fall där andra PCR-tester också utförs i samma generella område i laboratoriet måste försiktighet iakttas för att säkerställa att BD MAX GC rt PCR-analysen, eventuella övriga reagenser som behövs för testningen och BD MAX-systemet inte kontamineras. Undvik alltid mikrobiell kontamination och kontamination med deoxyribonukleas (DNas) av reagenserna. Byt handskar innan reagenser och kassetter hanteras. Förebygg kontamination av miljön med amplikoner genom att inte bryta isär BD MAX PCR-kassetterna efter användning. Förseglingarna på BD MAX PCR-kassetterna är utformade för att förebygga kontamination. Laboratoriet ska rutinmässigt utföra miljövervakning för att minimera risken för korskontamination. Om BD MAX GC rt PCR-analysen görs utanför de rekommenderade tidsintervallen kan resultatet bli ogiltigt. Analyser som inte utförts inom specificerade tidsintervall bör upprepas. Ytterligare kontroller kan testas i enlighet med riktlinjer eller krav i lokala, kommunala, statliga och/eller nationella bestämmelser eller från ackrediteringsorganisationer. Hantera alltid prover som om de vore smittförande och i enlighet med säkra laboratorieförfaranden, till exempel de som beskrivs i CLSI Document M29 4 och i Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories 5. Använd skyddskläder och engångshandskar vid hantering av alla reagenser. Tvätta händerna noggrant efter testets utförande. Pipettera inte med munnen. Rök, drick, tugga eller ät inte i områden där prover eller kitreagenser hanteras. Kassera oanvända reagenser och avfall i enlighet med lokala, kommunala och/eller statliga bestämmelser. Se BD MAX-systemets användarhandbok 6 för ytterligare varningar, försiktighetsbeaktanden och förfaranden. 2

3 FÖRVARING, HANTERING OCH STABILITET BD MAX GC rt PCR-kit är stabila vid 2 25 C fram till det angivna utgångsdatumet. Använd inte kit eller dess komponenter efter angivna utgångsdatum. Blanda inte kitkomponenter från olika partier. BD MAX GC rt PCR Master Mix och Extraction Tubes levereras i förslutna påsar med ett torkmedel. Skydda produktkomponenterna genom att omedelbart återförsluta påsarna efter att de öppnats. Påsinnehållet (mastermix och extraktionsrör) är stabila i upp till 7 dagar efter första öppnandet och återförslutningen. Mastermix Kitkomponenter Temperatur Stabilitet Försluten påse (oöppnad) 2 25 C till det tryckta utgångsdatumet Öppen påse (återförsluten) 2 25 C 7 dagar a Extraktionsrör Försluten påse (oöppnad) 2 25 C till det tryckta utgångsdatumet Öppen påse (återförsluten) 2 25 C 7 dagar a Remsa 2 25 C till det tryckta utgångsdatumet Provbuffertrör 2 25 C till det tryckta utgångsdatumet a Efter att originalförseglingen har brutits ska påsen som innehåller torkmedel förslutas noga med blixtlåset efter varje användning och förvaras vid lämplig temperatur. BRUKSANVISNG Provtagning, transport och förvaring BD MAX GC rt PCR är utformat för användning med GC-positiva pinn- och urinresidualprover som har tagits, transporterats, förvarats och testats enligt instruktionerna i bipacksedeln till BD ProbeTec GC Q x Amplified DNA Assay. BD MAX GC rt PCR kan användas för testning av GC-positiva residualprover från följande provtagnings- och transportenheter: Provpinnar 1. Vaginal Specimen Transport for the BD ProbeTec Q x Amplified DNA Assays (Kat. nr ). 2. BD ProbeTec Collection Kit for Endocervical or Lesion Specimens (Kat. nr ). OBS! Lesionsprover har inte utvärderats för användning med BD MAX GC rt PCR. Kliniska prestanda har inte fastställts. 3. Male Urethral Specimen Collection Kit for the BD ProbeTec Q x Amplified DNA Assays (Kat. nr ). Urin 1. Urine Preservative Transport for the BD ProbeTec Q x Amplified DNA Assays (UPT) (Kat. nr ). 2. Ren urin (utan konserveringsmedel). Använd endast residualpinn- och urinprovalikvoter från BD Viper-rör som har visat positivt resultat med BD ProbeTec GC Q x -analysen med DNA-amplifiering på BD Viper-systemet med BD MAX GC rt PCR. Använd rena handskar vid hantering av GC-positiva residualprover och BD MAX UVE-provbuffertrör. Byt omedelbart handskar om de kommer i kontakt med provet för att undvika kontamination. OBS! Ett (1) BD MAX UVE-provbuffertrör, ett (1) membranlock, ett (1) mastermixrör, ett (1) extraktionsrör och en (1) sammansatt reagensremsa krävs för varje prov och/eller extern kontroll som ska testas. Överföring av residualprover i BD ProbeTec Q x -spädningsvätska till BD MAX UVE-provbuffertrör OBS! Efter positivt testresultat med BD ProbeTec GC Q x -analysen med DNA-amplifiering på BD Viper-systemet ska residualprover i Q x - spädningsvätska förvaras vid 2 30 C och överföras till BD MAX UVE-provbuffertrör inom 5 dagar. 1. Ekvilibrera det GC-positiva Q x -residualprovet till omgivande temperatur. Ta bort locken på både BD MAX UVE-provbuffertröret och GC-positivt Q x -prov. Använd en kalibrerad pipett med en steril pipettspets för engångsbruk till att blanda pinnprovet varsamt och överföra 500 µl till BD MAX UVE-provbuffertröret. RÖRET FÅR INTE FYLLAS FÖR MYCKET ELLER FÖR LITE. 2. Kassera pipettspetsen i en behållare för biologiskt riskavfall. Använd inte samma pipettspets till mer än ett prov. 3. Förslut BD MAX UVE-provbuffertröret med ett punkterbart blått membranlock. 4. Märk BD MAX UVE-provbuffertröret med patientuppgifter och datum för beredningen. OBS! Var noga med att inte täcka för streckkoder på röret. 5. Vortexblanda BD MAX UVE-provbuffertröret kort så att prov och reagens blandas ordentligt. 6. Proverna är nu klara för testning på BD MAX-systemet. Överföring av urinresidualprover till BD MAX UVE-provbuffertrör OBS! Efter att ha visat positivt resultat för GC med BD ProbeTec GC Q x -analysen med DNA-amplifiering på BD Viper-systemet ska urinresidualprover i Q x UPT- eller BD Viper-provrör förvaras vid 2 30 C och överföras till BD MAX UVE-provbuffertrör inom 5 dagar. 1. Ekvilibrera residual-upt- eller BD Viper-provröret till omgivande temperatur. Ta av locken från både BD MAX UVE-provbuffertröret och UPT- eller BD Viper-provröret. Använd en kalibrerad pipett med en steril pipettspets för engångsbruk till att blanda urinprovet varsamt och överföra 1 ml till BD MAX UVE-provbuffertröret. RÖRET FÅR INTE FYLLAS FÖR MYCKET ELLER FÖR LITE. 2. Kassera pipettspetsen i en behållare för biologiskt riskavfall. Använd inte samma pipettspets till mer än ett prov. 3. Förslut BD MAX UVE-provbuffertröret med ett punkterbart blått membranlock. 4. Märk BD MAX UVE-provbuffertröret med patientuppgifter och datum för beredningen. OBS! Var noga med att inte täcka för streckkoder på röret. 5. Vortexblanda BD MAX UVE-provbuffertröret kort så att prov och reagens blandas ordentligt. 6. Proverna är nu klara för testning på BD MAX-systemet. 3

4 OBS! Pinn- och urinprover i BD MAX UVE-provbuffertrör kan förvaras i upp till 5 dagar vid 2 30 C innan de testas. OBS! Om prover måste transporteras ska temperaturen hållas inom det angivna området för att säkerställa stabilitet. För utrikes frakt ska proverna märkas i enlighet med gällande lokala, kommunala, statliga och/eller nationella och internationella bestämmelser avseende transport av kliniska prover och etiologiska/infektiösa agens. ANVÄNDA BD MAX-SYSTEMET OBS! Se BD MAX-systemets användarhandbok6 för detaljerade anvisningar (avsnittet Användning ). 1. Starta BD MAX-systemet (om det inte redan är på) och logga in genom att ange <user name> (användarnamn) och <password> (lösenord). 2. Byt handskar innan reagenser och kassetter hanteras. 3. Ta ut önskat antal sammansatta reagensremsor ur BD MAX GC rt PCR-kitet. Knacka försiktigt varje sammansatt reagensremsa mot en hård yta för att säkerställa att alla vätskor finns på rörens botten. 4. Ta ut önskat antal extraktionsrör och mastermixrör ur deras skyddspåsar. Tryck ut överflödig luft och förslut påsarna med blixtlåset. 5. För varje prov som ska testas ska en (1) sammansatt reagensremsa placeras på BD MAX-systemets ställ med början i position 1 i ställ A. 6. Kläm fast ett (1) extraktionsrör (vit folie) i varje sammansatt reagensremsa i position 1 enligt figur Kläm fast ett (1) mastermixrör (grön folie) i varje sammansatt reagensremsa i position 2 enligt figur 1. Figur 1. Kläm fast BD MAX GC rt PCR-mastermix- och extraktionsrör i de sammansatta reagensremsorna. 8. Klicka på körningsikonen och ange lotnumret för BD MAX GC rt PCR-kitet (för lotspårning) genom att skanna streckkoden med skannern. OBS! Upprepa steg 8 varje gång en ny kit-lot används. 9. Navigera till arbetslistan. Använd rullgardinsmenyn och välj <BD MAX GCrtPCR>. 10. Fyll i ID för provbuffertrör, patient-id och accessionsnummer (om tillämpligt) i arbetslistan genom att skanna streckkoden med skannern. 11. Markera det tillämpliga kit-lotnumret (finns på ytterkartongen) på rullgardinsmenyn. 12. Upprepa steg 9 till 11 för alla återstående provbuffertrör. 13. Placera BD MAX UVE-provbuffertrören i BD MAX-systemets ställ som motsvarar de sammansatta reagensremsorna som sattes samman i steg 5 till 7. OBS! Proverna kan förvaras i upp till 5 dagar vid 2 30 C. Ekvilibrera förvarade prover till omgivande temperatur innan testning. 14. Sätt tillämpligt antal BD MAX PCR-kassetter i BD MAX-systemet (se figur 2). Varje kassett kan användas till upp till 24 prover. BD MAX-systemet väljer automatiskt position och rad i BD MAX PCR-kassetten för varje körning. BD MAX PCR-kassetter kan användas flera gånger tills alla banor har utnyttjats. Maximera användningen av BD MAX PCR-kassetter genom att välja Run Wizard (Körningsguide) under fliken Worklist (Arbetslista) i 2000 Sample Mode (Läge med prover) och tilldela banor. Se BD MAX-systemets användarhandbok6 för mer information. 4

5 Figur 2. Ladda PCR-kassetter 15. Ladda ställ i BD MAX-systemet (figur 3). Figur 3. Ladda ställ i BD MAX-systemet 16. Stäng BD MAX-systemets lock och klicka på <Start> (Starta) för att påbörja bearbetningen. 17. Kontrollera resultaten omedelbart efter körningen eller förvara BD MAX UVE-provbuffertrören vid 2 30 C i upp till 5 dagar tills resultaten har kontrollerats. OBS! OBS! Om ett membranlock skadas under körningen ska det bytas ut mot ett nytt innan provet förvaras. Beredda BD MAX UVE-provbuffertrör kan förvaras i upp till 5 dagar vid 2 30 C. Om resultatet är Obestämt (IND (OBEST.)), Olöst (UNR (OLÖST)) eller Ofullständigt (INC (OFULLST.)) måste testet upprepas från samma BD MAX UVE-provbuffertrör (se Upprepa testförfarande ). Om en extern kontroll misslyckas, ska alla prover testas om med nypreparerade externa kontroller (se Kvalitetskontroll ). 5

6 KVALITETSKONTROLL Med förfaranden för kvalitetskontroll övervakas analysens prestanda. Laboratorierna måste fastställa antal, typ och frekvens för testning av kontrollmaterial enligt riktlinjer eller krav i lokala, kommunala, statliga och/eller nationella bestämmelser eller från ackrediteringsbyråer. För allmänna riktlinjer för kvalitetskontroll kan användaren konsultera CLSI MM03 7 och EP Material till externa kontroller tillhandahålls inte av BD. Externa positiva och negativa kontroller används inte av BD MAXsystemets programvara för tolkning av testresultat. Externa kontroller behandlas som om de vore patientprover. (Se tabellen i avsnittet Resultattolkning för tolkning av analysresultat från externa kontroller.) 2. En (1) extern positiv kontroll och en (1) extern negativ kontroll bör köras minst dagligen tills adekvat processvalidering uppnås på BD MAX-systemet i varje laboratoriemiljö. Kontrolltestning vid färre tillfällen ska ske i enlighet med tillämpliga föreskrifter. 3. Den externa positiva kontrollen används för att övervaka förekomsten av större reagensfel. Den externa negativa kontrollen är avsedd för att detektera reagens- eller miljökontamination (eller överföring) av målnukleinsyror. 4. Kontrollstammar bör testas i enlighet med riktlinjer eller krav i lokala, statliga och/eller kommunala bestämmelser eller från ackrediterade organisationer i syfte att kontrollera effektiviteten hos hela analysprocessen. 5. Olika typer av externa kontroller rekommenderas så att användaren kan välja den som passar kvalitetskontrollprogrammet i deras laboratorium bäst. a. Kommersiellt tillgängligt kontrollmaterial (t.ex. en Neisseria-stam av icke-gonokocktyp) eller ett tidigare karakteriserat prov som är känt negativt. BD rekommenderar att den externa negativa kontrollen bereds före den externa positiva kontrollen i syfte att minska risken för kontamination på grund av kontrollberedningen. b. Extern positiv kontroll: Kommersiellt tillgängligt kontrollmaterial (t.ex. en Neisseria gonorrhoeae-referensstam (ATCC 19424)) eller ett tidigare karakteriserat prov som är känt positivt. För beredning av suspensioner för extern kontroll rekommenderas det att frystorkade stammar av Neisseria gonorrhoeae American Type Culture Collection (ATCC) som erhållits från ATCC rehydreras i fosfatbuffrad koksaltlösning (PBS) till en slutlig spädning på 10-6 av den ursprungliga cellstammen. Späd därefter lösningen på 10-6 genom att överföra 150 µl till ett BD MAX UVE-provbuffertrör för en slutlig koncentration på Alla externa kontroller bör ge förväntade resultat (positiva för en extern positiv kontroll eller negativa för en extern negativ kontroll) och inga misslyckade externa kontroller (olösta eller ofullständiga resultat). 7. En extern negativ kontroll som ger ett positivt testresultat är indikativt för felaktig provhantering och/eller kontamination. En extern positiv kontroll som ger ett negativt resultat är indikativt för felaktig provhantering/beredning. Granska provhanterings- /beredningstekniken. 8. En extern kontroll som ger ett olöst, obestämt eller ofullständigt resultat är indikativt för ett reagens- eller BD MAX-systemfel. Kontrollera om några felmeddelanden visas på BD MAX-systemets bildskärm. Se avsnittet Översikt över systemfel i BD MAXsystemets användarhandbok 6 för tolkningar av varnings- och felkoder. Om problemet kvarstår, använd reagenser från en oöppnad påse eller använd ett nytt analyskit. 9. Varje extraktionsrör innehåller en provbearbetningskontroll som är en plasmid med en syntetisk mål-dna-sekvens. Provbearbetningskontrollen övervakar effektiviteten i insamling, tvättning och eluering av DNA under provbearbetningen, samt effektiviteten i amplifiering och detektion av DNA under PCR-analysen. Om resultatet av provbearbetningskontrollen inte uppfyller acceptanskriterierna rapporteras provresultatet som olöst. Ett olöst resultat är indikativt för en provrelaterad inhibering eller ett reagensfel. Upprepa prov som rapporteras som olöst enligt avsnittet Upprepa testförfarande nedan. RESULTATTOLKNG Resultat finns på fliken Results i fönstret Results (Resultat) på BD MAX-systemets bildskärm. Testresultaten tolkas automatiskt av BD MAX-systemets programvara. Resultaten kan kallas NEG (negativt), POS (positivt) eller UNR (olöst) baserat på målets amplifieringsstatus och provbearbetningskontrollen. IND (obestämt) eller INC (ofullständigt) resultat beror på ett BD MAX-systemfel. Resultat tolkas så som visas i tabell 1. Tabell 1. BD MAX GC rt PCR-resultattolkning BD VIPER- RESULTAT RAPPORTERAT BD MAX- RESULTAT BD MAX-TOLKNG POS. GC-POS. GC-DNA detekterat POS. GC-NEG. Inget GC-DNA detekterat POS. GC-UNR. Olöst resultat Ingen målamplifiering, ingen amplifiering av provbearbetningskontrollen POS. OBEST. Obestämt resultat p.g.a. BD MAX-systemfel (med varnings- eller felkoder) a POS. INC. Ofullständig körning (med varnings- eller felkoder) a a Se avsnittet Felsökning i BD MAX-systemets användarhandbok för tolkningar av varnings- och felkoder. 6

7 GC POS. (GC-DNA detekterat) Fluorescenssignal detekteras för GC-mål och Provbearbetningskontrollen ignoreras eftersom GC-målamplifiering åsidosätter denna kontroll. GC NEG. (GC-DNA inte detekterat) Fluorescenssignal detekteras inte av BD MAX GC rt PCR för målet och fluorescenssignal detekteras för provbearbetningskontrollen. GC UNR (Olöst resultat) Fluorescenssignal detekteras inte för GC-målet och fluorescenssignal detekteras inte för provbearbetningskontrollen (inhiberande prov eller reagensfel). IND (Obestämt resultat) BD MAX-systemfel med varnings- eller felkoder. Se avsnittet Felsökning i BD MAX-systemets användarhandbok 6 för tolkningar av varnings- och felkoder. INC (Ofullständig körning) BD MAX-systemfel med varnings- eller felkoder. Se avsnittet Felsökning i BD MAX-systemets användarhandbok 6 för tolkningar av varnings- och felkoder. UPPREPA TESTFÖRFARANDE OBS! Det finns endast tillräckligt med provvolym i BD MAX UVE-provbuffertröret för en upprepad körning. BD MAX UVE-provbuffertrör som förvaras vid 2 30 C ska testas om inom 5 dagar från överföringen av det GC-positiva Qx-residualprovet till BD MAX UVEprovbuffertröret. Ekvilibrera förvarade prover till omgivande temperatur innan testning. Testa om prover enligt avsnittet Användning av BD MAX-systemet. OLÖST RESULTAT Olösta resultat kan uppstå om ett inhiberande ämne förhindrar korrekt amplifiering av mål eller provbearbetningskontroll. Prover kan testas om från sina motsvarande BD MAX UVE-provbuffertrör inom de tidsramar som anges ovan. Börja om från avsnittet Användning av BD MAX-systemet. OBESTÄMT RESULTAT Obestämda resultat kan uppstå i händelse av systemfel. Prover kan testas om från sina motsvarande BD MAX UVE-provbuffertrör inom de tidsramar som anges ovan. Börja om från avsnittet Användning av BD MAX-systemet. För tolkningar av varnings- och felkodmeddelanden, se BD MAX-systemets användarhandbok 6 (avsnittet Felsökning ). OFULLSTÄNDIGT RESULTAT Ofullständiga resultat kan uppstå om provberedningen eller PCR inte kunde slutföras. Prover kan testas om från sina motsvarande BD MAX UVE-provbuffertrör inom de tidsramar som anges ovan. Börja om från avsnittet Användning av BD MAX-systemet. För tolkningar av varnings- och felkodmeddelanden, se BD MAX-systemets användarhandbok 6 (avsnittet Felsökning ). EXTERNT KONTROLLFEL Externa kontroller bör ge förväntade resultat när de testas. Om prover måste testas om p.g.a. ett felaktigt resultat från en extern kontroll ska de testas om från sina BD MAX UVE-provbuffertrör tillsammans med nyberedda externa kontroller inom de tidsramar som anges ovan. Börja om från avsnittet Användning av BD MAX-systemet. PROCEDURENS BEGRÄNSNGAR 1. BD MAX GC rt PCR kan endast användas med prover som har visat ett positivt resultat med BD ProbeTec GC Q x -analysen med DNA-amplifiering som testats med hjälp av BD Viper-systemet med XTR-teknik. Analysen ska inte användas med prover som visar negativa resultat med BD ProbeTec GC Q x -analysen med DNA-amplifiering eller andra typer av kliniska prover. 2. BD MAX GC rt PCR har inte utvärderats för användning tillsammans med någon annan molekylär metodik. 3. BD MAX GC rt PCR får endast användas på BD MAX-systemet av utbildad personal. 4. BD MAX GC rt PCR är utformat för användning endast med urinprov från man eller kvinna, uretrapinnprover från man samt vaginala och endocervikala pinnprover som transporteras och förvaras enligt anvisningarna på bipacksedeln till BD ProbeTec GC Q x Amplified DNA Assay och som har identifierats som positiva av BD Viper-systemet. 5. Vid ett positivt BD Viper GC-resultat och ett negativt BD MAX GC-resultat ska tolkning göras i kombination med andra laboratorieoch kliniska data som läkaren har tillgång till 6. God laboratorieteknik är avgörande för att den här analysen ska fungera korrekt. På grund av testets höga analytiska känslighet måste stor noggrannhet iakttas för att bevara materialens och reagensernas färskhet. 7. Ett BD MAX GC rt PCR-resultat indikerar inte nödvändigtvis förekomst av viabla organismer. Ett positivt resultat är indikativt för förekomst av GC-DNA. 8. Som med alla PCR-baserade in vitro-diagnostiska test kan extremt låga nivåer av målet under analysens detektionsgräns detekteras utan att resultaten är reproducerbara. 9. Falskt negativa resultat kan uppstå p.g.a. förlust av nukleinsyra under transport, överföring eller förvaring av proverna, eller p.g.a. inadekvat lysering av bakterieceller. Provbearbetningskontrollen har lagts till för att bidra till identifiering av prover som innehåller inhiberare av PCR-amplifiering och som kontroll för reagensens egenskaper och analyssystemet i helhet. Provbearbetningskontrollen indikerar inte om nukleinsyran har förlorats p.g.a. inadekvat transport, överföring eller förvaring av proverna, eller om bakterieceller har lyserats adekvat. 10. BD MAX GC rt PCR-resultat kan ibland vara olösta p.g.a. ogiltig provbearbetningskontroll eller obestämda eller ofullständiga p.g.a. instrumentfel, och därmed behöva omtestning vilket kan medföra fördröjning av slutliga resultat. 7

8 11. Som med alla in vitro-diagnostiska test beror positiva och negativa prediktiva värden i hög grad på prevalens. BD MAX GC rt PCR prestanda kan variera beroende på prevalens och den population som testas. 12. BD MAX GC rt PCR behöver använda två (2) optiska kanaler från BD MAX-systemet; VIC-kanalen (530/565 nm) och ROX-kanalen (585/630 nm). Prestanda hos de övriga optiska kanalerna har inte fastställts med denna analys. 13. BD MAX GC rt PCR ger kvalitativa testresultat. Inga paralleller har dragits mellan amplifieringskurvornas form och den kliniska belastningen. 14. Vid 0,4 % v/v helblod (i urinmatris), 6,5 µl/ml RepHresh vaginalgel och 12,5 µl/ml Metronidazol interfererade antiprotozooikumgel (i pinnprovsmatris) med BD MAX GC rt PCR (se tabell 8 och 9). FÖRVÄNTADE VÄRDEN Prevalensen av prover som är positiva för Neisseria gonorrhoeae beror på patientpopulationen. Bland faktorerna ingår typ av klinik, patientålder, riskfaktorer och kön. Den övergripande sammansatta sensitiviteten och specificiteten beräknades enligt avsnittet om kliniska prestanda nedan, och från detta beräknades det hypotetiska negativa prediktiva värdet (NPV) och positiva prediktiva värdet (PPV) i tabell 2. Tabell 2: Hypotetiskt negativt prediktivt värde (NPV) och positivt prediktivt värde (PPV) Prevalens Sammansatt sensitivitet Sammansatt specificitet Sammansatt PPV Sammansatt NPV 0,25 % 97,5 % 100 % 100 % 100 % 0,5 % 97,5 % 100 % 100 % 100 % 1,0 % 97,5 % 100 % 100 % 100 % 2,0 % 97,5 % 100 % 100 % 99,9 % 5,0 % 97,5 % 100 % 100 % 99,9 % 10,0 % 97,5 % 100 % 100 % 99,7 % 15,0 % 97,5 % 100 % 100 % 99,6 % 20,0 % 97,5 % 100 % 100 % 99,4 % 30,0 % 97,5 % 100 % 100 % 99,0 % 40,0 % 97,5 % 100 % 100 % 98,4 % 50,0 % 97,5 % 100 % 100 % 97,6 % KLISKA PRESTANDA De sammansatta resultatens kliniska prestanda bestämdes av BD MAX GC rt PCR för de GC-positiva resultaten från BD Vipersystemet med BD ProbeTec GC Q x Amplified DNA Assay. De GC-negativa resultaten på BD Viper-systemet med BD ProbeTec GC Q x Assay betraktades som sammansatt negativa. En undersökande studie utfördes med kliniska och konstruerade residualprover från kvinnor och män tagna på olika platser. Proverna togs med följande BD Viper-provtagningsenheter: BD ProbeTec Q x Collection Kit for Endocervical and Lesion Specimens (provtagningskit för endocervikala och lesionsprover), Vaginal Specimen Transport for the BD ProbeTec CT/GC Q x Amplified DNA Assays (vaginalprovstransport), Male Urethral Specimen Collection Kit for the BD ProbeTec CT/GC Q x Amplified DNA Assays (provtagningskit för uretraprover på män) eller Urine Preservative Transport for the BD ProbeTec Q x Amplified DNA Assays (urinkonserveringstransport). Okonserverad eller ren urin testades också. Alla kliniska prover som testades var frysta, och de konstruerade proverna var en blandning av färska och frysta. Totalt 420 provresultat utvärderades (tabell 3 och 4). Av dessa var 210 kliniska prover och 210 var konstruerade prover. Både kliniska och konstruerade provgrupper innehöll 105 positiva och 105 negativa resultat från BD Viper-systemet med BD ProbeTec GC Q x Amplified DNA Assay. De 210 konstruerade proverna genererades från antingen kliniska negativa prover (endocervikala och kvinnligt UPT-urin) eller från friska patientdonatorer (ren urin och självtagna vaginala pinnprover). Positiva konstruerade prover genererades genom innokulering av Neisseria gonorrhoeae (ATCC-stam 19424) vid 3 ggr. den analytiska detektionsgränsen. Alla konstruerade positiva och negativa prover testades på BD Viper-systemet med BD ProbeTec GC Q x Amplified DNA Assay. Efter testning på BD Viper-systemet bearbetades alla prover internt och testades på BD MAX-system. Den sammansatta sensitiviteten och specificiteten beräknades jämfört med patientinfektionsstatus (PIS) för de kliniska proverna och jämfört med förväntat resultat för de konstruerade proverna. Komparativa referensmetoder som definierade PIS omfattade tre test från två olika kommersiellt tillgängliga NAAT från minst två olika provtyper. Den sammansatta sensitiviteten och specificiteten för varje prov tillsammans med 95 % konfidensintervall rapporteras i tabell 3. Den övergripande sammansatta sensitiviteten och specificiteten var respektive 97,5 % (94,3 % 98,9 %) och 100 % (98,3 % 100 %). 8

9 Tabell 3: Sammansatt sensitivitet och specificitet Kön Provtyp Sensitivitet 95 % KI Specificitet 95 % KI Endocervikalt a 92,6 % (25/27) (76,6 %, 97,9 %) 100 % (33/33) (89,6 %, 100 %) Kvinnor Ren urin b 100 % (30/30) (88,6 %, 100 %) 100 % (30/30) (88,6 %, 100 %) UPT-urin c 89,3 % (25/28) (72,8 %, 96,3 %) 100 % (32/32) (89,3 %, 100 %) Vaginalt d 100 % (30/30) (88,6 %, 100 %) 100 % (30/30) (88,6 %, 100 %) Ren urin e 100 % (30/30) (88,6 %, 100 %) 100 % (30/30) (88,6 %, 100 %) Män Uretra f 100 % (30/30) (88,6 %, 100 %) 100 % (30/30) (88,6 %, 100 %) UPT-urin g 100 % (27/27) (87,5 %, 100 %) 100 % (33/33) (89,6 %, 100 %) Totalt Sammanlagt 97,5 % (197/202) (94,3 %, 98,9 %) 100 % (218/218) (98,3 %, 100 %) Proverna i tabell 3 består av både kliniska och konstruerade prover med både positiva och negativa resultat: a) Endocervikala 48 kliniska och 12 konstruerade b) Ren urin, kvinna 60 konstruerade c) UPT-urin, kvinna 42 kliniska och 18 konstruerade d) Självtagna vaginala 60 konstruerade e) Ren urin, man 60 konstruerade f) Uretra, man 60 kliniska g) UPT-urin, man 60 kliniska Individuella NAAT-resultat, PIS-resultat och BD MAX GC rt PCR-resultat rapporteras i tabell 4 för alla avvikande resultat. Tabell 4: Avvikande resultat Urin, kvinna NAAT 1 endo NAAT 1 urin NAAT 2 endo NAAT 2 urin PIS BD MAX GCrtPCR Avvikande E/T + - Avvikande E/T + - Avvikande E/T + - Kvinna, endo a Avvikande E/T a Ett andra avvikande endocervikalt prov från kvinna konstruerades, och därför är ingen jämförelse mellan NAAT och PIS tillgänglig. Av de 420 urin- och pinnprover som testades på BD MAX GC rt PCR var andelen olösta, obestämda och ofullständiga resultat under initial och upprepad testning följande: Två prover (2/420) (0,5 %) rapporterades som olösta efter initial testning. Andelen olösta efter upprepad testning var 0 % (0/420). Inga prover (0 %) rapporterades som obestämda efter initial testning. Arton prover (18/420) (4,3 %) rapporterades som ofullständiga efter initial testning. Andelen ofullständiga efter upprepad testning var 0 % (0/420). Analytisk sensitivitet Den analytiska sensitiviteten (detektionsgräns, eller LoD) för BD MAX GC rt PCR i provmatris med ren urin och vaginalt pinnprov bestämdes enligt följande: positiva prover bereddes genom att spetsa poolat urin från kvinna och poolad vaginalpinnprovsmatris med flera koncentrationer av Neisseria gonorrhoeae-bakteriesuspensioner (ATCC 19424) som kvantifierats från odling. Alikvoter på en (1) ml av de spetsade minipool-suspensionerna för urin och alikvoter på 0,5 ml av de spetsade minipoolsuspensionerna för vaginalpinnprovsmatris överfördes till ett BD MAX UVE-provbuffertrör. Varje matrissuspension testades i replikat om 24 per LoD-koncentration med 3 BD MAX-system och 3 olika produktionsloter av BD MAX GC rt PCR. Den analytiska sensitiviteten (LoD), definierad som den lägsta koncentrationen vid vilken 95 % av alla replikat visade positivt resultat, varierade från 66,2 till 109,5 celler/ml (tabell 5). Tabell 5: Detektionsgräns för BD MAX GC rt PCR GC-stam Prov LoD-koncentration (celler/ml) 95 % Cl Urin 66,2 (45,7, 95,5) ATCC Vaginalpinnprov 109,5 (81,0, 147,9) 9

10 Analytisk inklusivitet En studie av analytisk inklusivitet genomfördes med olika Neisseria gonorrhoeae-stammar som är vanligt förekommande i urogenitalprover, under beaktande av geografiskt ursprung, genotyp (vild typ och mutanter) och temporala olikheter. Trettio (30) olika stammar testades, inklusive stammar från offentliga samlingar och välkarakteriserade kliniska isolat. Dessa 30 stammar testades vid 3 ggr. LoD i ren urin och vaginalpinnprovsmatriser. BD MAX GC rt PCR identifierade korrekt alla 30 av de Neisseria gonorrhoeaestammar som testades. Analytisk specificitet/korsreaktivitet BD MAX GC rt PCR utfördes på prover som innehöll fylogenetiskt besläktade Neisseria-arter eller andra organismer (bakterier, virus) som sannolikt kan finnas i urogenitala eller anatomiska regioner där Neisseria gonorrhoeae-infektioner kan förekomma. Bakterieceller, jästsvampar och parasiter testades i BD MAX UVE-provbuffertrör vid 1 x 10 6 celler/ml, och virus testades vid 1 x 10 5 virala partiklar eller genomiska motsvarigheter/ml. 100 % (102/102) av bakteriestammar, jästsvampar och parasiter som testades i BD MAX UVE-provbuffertrör vid 1 x 10 6 CFU/mL, celler/ml, genomiskt DNA cp/ml eller elementära kroppar/ml, gav negativa resultat med BD MAX GC rt PCR (se tabell 6). 100 % (6/6) av virus som testades vid 1 x 10 5 virala partiklar eller genomiska motsvarigheter/ml, gav negativa resultat med BD MAX GC rt PCR (se tabell 6). 100 % (59/59) av andra Neisseria-stammar än Neisseria gonorrhoeae som testades i BD MAX UVE-provbuffertrör vid 1 x 10 6 celler/ml, gav negativa resultat med BD MAX GC rt PCR (se tabell 7). Tabell 6: BD MAX GC rt PCR specificitetsresultat (bakterier, jästsvampar och virus) Organism Resultat a Organism Resultat a Achromobacter xerosis - HPV11 - Acinetobacter calcoaceticus - Kingella kingae - Acinetobacter lwoffi - Klebsiella oxytoca - Actinomyces israelii - Klebsiella pneumoniae - Actinomyces pyogenes - Lactobacillus adicophilus - Aerococcus viridans - Lactobacillus brevis - Aeromonas hydrophilia - Lactobacillus jensenii - Agrobacterium radiobacter - Lactobacillus lactis - Alcaligenes faecalis - Legionella pneumophilia - Bacillus subtilis - Leuconostoc paramensenteroides - Bacteriodes ureolyticum - Listeria monocytogenes - Bacteroides fragilis - Micrococcus leutus - Bifidobacterium adolescentis - Moraxella lacunata - Bifidobacterium brevis - Moraxella osloensis - Branhamella catarrhalis - Morganella morganii - Brevibacterium linens - Mycobacterium smegmatis - Campylobacter jejuni - Mycoplasma genitalium - Candida albicans - Mycoplasma hominis - Candida glabrata - Pentatrichomonas hominis - Candida parapsilosis - Peptostreptococcus anaerobius - Candida tropicalis - Peptostreptococcus productus - Chlamydia pneumoniae - Plesiomonas shigelloides - Chlamydia psittaci (2) - Propionibacterium acnes - Chlamydia trachomatis serovar H - Proteus mirabilis - Chromobacterium violaceum - Proteus vulgaris - Citrobacter freudii - Providencia stuartii - Clostridium perfringens - Pseudomonas aeruginosa - Corynebacterium genitalium biovar1 - Pseudomonas fluorescens - Corynebacterium xerosis - Pseudomonas putida - Cryptococcus neoformans - Rahnella aquatilis - 10

11 Organism Resultat a Organism Resultat a Cytomegalovirus - Rhodospirilium rubrum - Deinococcus radiodurans - Saccharomyces cerevisiae - Derxia gummosa - Salmonella minnesota - Eikenella corrodens - Salmonella typhimurium - Enterobacter aerogenes - Serratia marcescens - Enterobacter cloacae - Staphylococcus aureus, icke-protein A - Enterococcus avium - Staphylococcus aureus, protein A - Enterococcus faecalis - Staphylococcus epidermidis - Enterococcus faecium - Staphylococcus saprophyticus - Erwinia herbicola (Escherichia vulneris) - Streptococcus agalactiae (grupp B) - Erysipelothrix rhusiopathiae - Streptococcus bovis - Escherichia coli - Streptomyces griseus - Fuseobacterium meningosepticum - Streptococcus mitis - Fuseobacterium nucleatum - Streptococcus mutans - Gamella haemolysans - Streptococcus pneumoniae - Gardnerella vaginalis - Streptococcus pyogenes (grupp A) - Haemophilus ducreyi - Streptococcus salivarius - Haemophilus influenzae - Streptococcus sanguis - Herpes Simplex-virus 1 - Trichomonas vaginalis - Herpes Simplex-virus 2 - Trichomonas tenax - HPV 16 - Ureaplasma urealyticum - HPV 18 - Vibrio parahaemolyticus - HPV 6 - Yersinia enterocolitica - a - indikerar att BD MAX GC rt PCR gav negativa resultat Tabell 7: BD MAX GC rt PCR specificitetsresultat (Neisseria-arter) Organism Resultat a Organism Resultat a Neisseria cinerea (3) b - Neisseria meningitidis D (1) b - Neisseria denitrificans (1) b - Neisseria meningitidis W135 (1) b - Neisseria elongate (3) b - Neisseria meningitidis Y (1) b - Neisseria flava (1) b - Neisseria mucosa (3) b - Neisseria flavescens (2) b - Neisseria perflava (3) b - Neisseria lactamica (9) b - Neisseria polysaccharea (1) b - Neisseria meningitidis A (4) b - Neisseria sicca (4) b - Neisseria meningitidis B (2) b - Neisseria subflava (15) b - Neisseria meningitidis C (5) b - a - indikerar att BD MAX GC rt PCR gav negativa resultat b siffran inom parentes anger antalet testade stammar Interfererande substanser Fyrtiofem (45) biologiska och kemiska substanser som kan förekomma i urogenitala prover utvärderades för potentiell interferens med BD MAX GC rt PCR (tabell 8 och 9). Fem (5) organismer (Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis, Eschericia coli, Gardnerella vaginalis och Candida albicans) testades också med hög koncentration för att utvärdera bakteriell interferens. I denna studie ingick antibiotika-, analgetika-, antifungal-, hormonella och preventivpooler innehållande kombinationer av de olika kemikalier eller biologiska organismer som testades vid en koncentration som kan förekomma i urogenitala prover. Poolade Neisseria gonorrhoeae negativa prover med ren urin eller vaginalpinnprovsmatris och poolade Neisseria gonorrhoeae positiva prover med ren urin eller vaginalpinnprovsmatris vid 3 ggr. LoD testades med den högsta mängd av varje förening som troligt kan finnas i proven, eller med interfererande organismer (1 x 10 5 CFU eller organismer/ml av varje stam). Resultaten av interferenstestningen för BD MAX GC rt PCR beskrivs i tabell 8 och 9. OBS! Koncentrationerna som återges i tabell 8 och 9 är de slutliga koncentrationer som testades i UVE-provbuffertrören och som reflekterar de olika provalikvotvolymerna för urin- och vaginalprovtyperna. 11

12 Tabell 8: Exogena och endogena substanser testade för interferens i urin med BD MAX GC rt PCR Noretindron (8 ng/ml) Substans (slutlig koncentration i UVE-provbuffertrör) 17-α-etinylestradiol (0,48 ng/ml) 4-acetamidofenol (80 µg/ml) Acetylsalicylsyra (260,8 µg/ml) Naproxen (200 µg/ml) Ibuprofen (200 µg/ml) Humanserumalbumin (0,4 mg/ml) Glukos (0,48 mg/ml) Amoxicillintrihydrat (30,08 µg/ml) Metronidazol (48 µg/ml) Tetracyklinhydroklorid (6 µg/ml) Azitromycin (4,8 µg/ml) Ceftriaxon (324,4 µg/ml) Sulfametoxazol (160 µg/ml) Trimetoprim (16 µg/ml) Erytromycin (24 µg/ml) Escherichia coli (1,44 x 10 6 organismer/ml) Gardneralla vaginalis (1,44 x 10 6 organismer/ml) Candida albicans (1,44 x 10 6 organismer/ml) Chlamydia trachomatis (4 x 10 5 EB/mL) Trichomonas vaginalis (4 x 10 5 celler/ml) Slem (bovint cervikalt) 2 % v/v Helblod (0,4 % v/v) Sperma (2 % v/v) Leukocyter (1 x 10 6 celler/ml) Fenazopyridinhydroklorid (80 µg/ml) Högt ph (ph9, NaOH) Lågt ph (ph4, HCl) Bilirubin (0,08 mg/ml) Underlivsdeodorant (0,68 % v/v) Talkpuder (1,32 % v/v) a : Ingen rapporterbar interferens med BD MAX GC rt PCR. b I: Rapporterbar interferens med BD MAX GC rt PCR. c [ ] Maximal koncentration där interferens inte observerades med BD MAX GC rt PCR Resultat a,b I [ 0,1 % v/v] c Tabell 9: Exogena och endogena substanser testade för interferens i vaginalmatris med BD MAX GC rt PCR Substans (slutlig koncentration i UVE SBT-rör) VCF c preventivskum (12,5 µl/ml) VCF c preventivfilm (12,5 µl/ml) Conceptrol c preventivgel (12,5 µl/ml) Gyne-Lotrimin 3 c (12,5 µl/ml) Monistat c 3 (12,5 µl/ml) Tioconazol 1 (12,5 µl/ml) Vaginal klådstillande kräm (12,5 µl/ml) Vaginal glidmedelsvätska vattenbaserad (12,5 µl/ml) RepHresh c vaginalgel (6,25 µl/ml) Preparation H c hemorrojdgel (12,5 µl/ml) Antiviral (Zovirax Acyklovir) (12,5 µl/ml) AntiProtozoal (Metronidazol) (12,5 µl/ml) Sköljning (12,5 µl/ml) Underlivsdeodorant (12,5 µl/ml) Resultat a,b I I 12

13 Progesteron (5 ng/ml) Östradiol (0,3 ng/ml) Slem (bovint cervikalt) (1,25 % v/v) Sperma (1,25 % v/v) Helblod (7,5 µl/ml) Leukocyter (2,5x10 5 celler/ml) Substans (slutlig koncentration i UVE SBT-rör) Chlamydia trachomatis (2,5 x 10 5 EB/mL) Trichomonas vaginalis (2,5 x 10 5 celler/ml) a : Ingen rapporterbar interferens med BD MAX GC rt PCR. b I: Rapporterbar interferens med BD MAX GC rt PCR. c Märken är varumärken som tillhör sina respektive ägare. Resultat a,b Precision Inom laboratorieprecision utvärderades för BD MAX GC rt PCR på en (1) plats. Varje provmatrispanel testades dubbelt, 2 körningar per dag under 12 dagar av 2 olika tekniker. Varje provmatrispanel innehöll vaginalpinnprovs- eller ren urinmatris. Positiva och negativa prover jämfördes med förväntade resultat. Följande koncentrationer användes för målorganismen i varje panelmedlem: Måttligt positivt (MP): 3x LoD Lågt positivt (LP): 1,5x LoD Sant negativt (TN): Negativa prover (inget mål) Precisionsstudieresultat för BD MAX GC rt PCR beskrivs i tabell 10. Tabell 10: Precision för BD MAX GC rt PCR Provtyp Nivå Totalt Procent korrekt 95 % KI Urin Negativt 72 (72/72) 100 % (96,4 %, 100 %) 1,5x LoD 72 (67/72) 93,1 % (86,4 %, 96,6 %) 3x LoD 72 (72/72) 100 % (96,4 %, 100 %) Sammanlagt 216 (211/216) 97,7 % (95,3 %, 98,9 %) Provpinne Negativt 71 (71/71) 100 % (96,3 %, 100 %) 1,5x LoD 72 (68/72) 94,4 % (88,2 %, 97,5 %) 3x LoD 72 (72/72) 100 % (96,4 %, 100 %) Sammanlagt 215 (211/215) 98,1 % (95,9 %, 99,2 %) Kombinerat Totalt 431 (422/431) 97,9 % (96,4 %, 98,8 %) Reproducerbarhet Reproducerbarhetspanelen bestod av 3 koncentrationer enligt följande: Måttligt positivt (MP): 3x LoD Lågt positivt (LP): 1,5x LoD Sant negativt (TN): Negativa prover (inget mål) För reproducerbarhet från instrument till instrument testades 3 replikat av varje provtyp vid varje koncentration på vardera av 3 BD MAX-instrument, med 2 körningar per dag under 5 dagar. Reproducerbarhet från instrument till instrument utvärderades med ett parti BD MAX GC rt PCR-reagenser. Resultaten för reproducerbarhet från instrument till instrument för BD MAX GC rt PCR beskrivs i tabell 11. För reproducerbarhet från parti till parti testades 3 replikat av varje provtyp vid varje koncentration av 2 operatörer med 3 produktionspartier på ett enda BD MAX-instrument under 5 dagar. Reproducerbarhet från parti till parti för BD MAX GC rt PCR beskrivs i tabell

14 Tabell 11: Reproducerbarhet från instrument till instrument för BD MAX GC rt PCR Provtyp Nivå Totalt Procent korrekt 95 % KI Urin Negativt 90 (90/90) 100 % (97,1 %, 100 %) 1,5x LoD 90 (87/90) 96,7 % (92,0 %, 98,7 %) Provpinne 3x LoD 90 (90/90) 100 % (97,1 %, 100 %) Negativ 90 (90/90) 100 % (97,1 %, 100 %) 1,5x LoD 90 (81/90) 90,0 % (83,6 %, 94,1 %) 3x LoD 90 (86/90) 95,6 % (90,5 %, 98,0 %) Tabell 12: Reproducerbarhet från parti till parti för BD MAX GC rt PCR Provtyp Nivå Totalt Procent korrekt 95 % KI Urin Negativt 90 (90/90) 100 % (97,1 %, 100 %) 1,5x LoD 90 (84/90) 93,3 % (87,6 %, 96,5 %) Provpinne 3x LoD 90 (90/90) 100 % (97,1 %, 100 %) Negativt 90 (90/90) 100 % (97,1 %, 100 %) 1,5x LoD 90 (71/90) 78,9 % (71,0 %, 85,1 %) 3x LoD 90 (74/90) 82,2 % (74,7 %, 88,9 %) Överföring/korskontamination En studie utfördes för att undersöka potentialen för överföring/korskontamination mellan hög bakteriell belastning av Neisseria gonorrhoeae och negativa prover under hela BD MAX GC rt PCR-arbetsflödet. Tolv (12) replikat av en högt positiv panelmedlem (1 x 10 6 celler/ml) och 12 replikat av den negativa panelmedlemmen (inget mål) testades i varje körning genom att alternera negativa och positiva prover. Sex (6) körningar i följd på 3 BD MAX-instrument testades i totalt 18 körningar med 24 prover. Av 216 rapporterbara negativa resultat erhölls inga falskt positiva resultat. REFERENSER 1. European Centre for Disease Prevention and Control. Sexually transmitted infections in Europe Stockholm: ECDC; IUSTI / WHO. (2012) European Guideline on the Diagnosis and Treatment of Gonorrhoea in Adults. 3. Health Protection Agency. (2012). Detection of Neisseria gonorrhoeae using Molecular Methods. UK Standards for Microbiology Investigations. P 6 Issue Clinical Laboratory Standards Institute. Protection of laboratory workers from occupationally acquired infections; Approved Guideline Document M29 (refer to the latest edition). 5. Centers for Disease Control and Prevention, and National Institutes of Health. Biosafety in microbiological and biomedical laboratories. Chosewood L.C. and Wislon D.E. (eds) (2009). HHS Publication No. (CDC) BD MAX-systemets användarhandbok (se den senaste versionen) BD Diagnostics, Sparks, MD, USA. 7. Clinical Laboratory Standards Institute. Molecular Diagnostic Methods for Infectious Diseases; Approved Guideline Document MM03 (refer to the latest edition). TILLGÄNGLIGHET American Type Culture Collection (ATCC) University Boulevard Manassas, VA , USA. ATCC nr Neisseria gonorrhoeae 14

15 Den här produkten säljs på licens. Köpet av produkten medför ingen rätt att använda den för vissa tillämpningar inom blod- och vävnadsscreening eller vissa industriella tillämpningar. Köparen av denna produkt får använda produkten för amplifiering och detektion av nukleinsyrasekvenser för att tillhandahålla human in vitro-diagnostik. Inget allmänt patent eller annan licens av något slag utöver den här specifika användningsrättigheten medges genom köpet. BD Diagnostics teknisk service: Kontakta närmaste BD-representant. GeneOhm Sciences Canada, Inc Boul. du Parc Technologique Québec (QC), G1P 4S5, Canada Benex Limited Pottery Road, Dun Laoghaire Co. Dublin, Ireland Tillverkad i Kanada. *Märken är varumärken som tillhör sina respektive ägare. BD, BD:s logotyp och alla andra varumärken tillhör Becton, Dickinson and Company BD. 15