MAX VAGINAL PANEL 443712 Avsedd för in vitro-diagnostik P0223(05) För användning tillsammans med BD MAX-systemet 2018-03 Svenska 4 I INDIKATIONER BD MAX Vaginal Panel (vaginalpanel) om körs på BD MAX-systemet är ett automatiserat in vitro-diagnostiskt test för direkt kvalitativ detektion av mål-dna från bakterier som förknippas med bakteriell vaginos (rapporterade kvalitativa resultat baserade på detektion och kvantifiering av markörer för målorganismer), Candida-species som förknippas med vulvovaginal candidiasis och Trichomonas vaginalis från vaginala pinnprover från patienter som har symtom på vaginit/vaginos. Testet använder polymeraskedjereaktion (PCR) i realtid för amplifikationen av specifika DNA-mål samt fluorogena målspecifika hybridiseringsprober för att detektera och differentiera DNA från: Bakteriell vaginos-markörer (individuella markörer ej rapporterade) Lactobacillus spp. (L. crispatus och L. jensenii) Gardnerella vaginalis Atopobium vaginae BVAB-2 (Bacterial Vaginosis Associated Bacteria-2) Megasphaera-1 Candida spp. (C. albicans, C. tropicalis, C. parapsilosis, C. dubliniensis) Candida glabrata Candida krusei Trichomonas vaginalis BD MAX Vaginal Panel är avsedd som hjälp vid diagnosticering av vaginala infektioner hos kvinnor med kliniska symtom som tyder på bakteriell vaginos, vulvovaginal candidiasis och trichomoniasis. SAMMANFATTNING OCH FÖRKLARING AV FÖRFARANDET Vaginit, ett av de vanligaste gynekologiska problemen inom klinisk medicin, svarar för miljoner läkarbesök årligen. 1,2 De tre huvudsakliga infektionsorsakerna för vaginit utgörs av bakteriell vaginos (BV), vaginit orsakad av jästsvamp (candidiasis) och T. vaginalis-vaginit (trichomoniasis). 2 Bakteriell vaginos är det vanligaste infektiösa vaginala besväret och står för 40 till 50 procent av fallen hos kvinnor i barnafödande ålder. 2 Väteperoxidproducerande Lactobacillus-species är viktiga medlemmar i den normala tarmfloran och är allmänt kända för att minska hos patienter som lider av vaginos. Minskningen av dessa bakterier snarare än deras kolonisering av vagina är en erkänd markör för vaginos. 3,4 I motsats till denna minskning av Lactobacillus-species finns det en ökning av välkända species av anaerober som Atopobium vaginae och Gardnerella vaginalis. 4 Kolonisering inträffar även med ej odlingsbara anaeroba organismer som BVAB-2 och Megasphaera-1. 3 Ytterligare mikroorganismer som Prevotella, Lachnospira, Sneathia, Mobiluncus, Mycoplasma hominis och Ureaplasma spp. har också hittats hos kvinnor med bakteriell vaginos. 5 Dessa organismer associeras dock mindre med BV på grund av sin relativt låga prevalens, sensitivitet och/eller specificitet. 3,6,7 Bakteriell vaginos förknippas med en hög förekomst av endometrit och bäckeninflammation efter abort och gynekologiska procedurer i den allmänna populationen. Bakteriell vaginos är också förknippat med sena missfall, prematur vattenavgång, prematur födsel och har en stark koppling till ökad risk för HIV och andra sexuellt överförda sjukdomar. 8,9 Även om det är känt att asymptomatiska kvinnor kan ha en mikrobiell flora som stämmer med bakteriell vaginos så är behandling ofta inte indikerad i aktuella riktlinjer för dessa patienter. 1
Sjutton (17) till 39 procent av kvinnor med symtomatisk vaginit får diagnosen vulvovaginal candidiasis 9 Flera epidemiologiska studier tyder på att Candida albicans ligger bakom 65 till 90 % av fallen av vulvovaginal candidiasis 10 15 och att species som inte är Candida albicans kan ligga bakom upp till 30 % av vulvovaginala candidiasis-episoder. 13,14,15 Bland dessa species är de som oftast omtalas i litteraturen C. glabrata, C. parapsilosis och C. tropicalis. C. glabrata och C. krusei är de huvudsakliga Candidaspecies som är resistenta mot fluconazolbaserad behandling av svamp. 8,16,17 Vulvovaginal candidiasis är vanligen förknippad med höga Candida-koncentrationer men kan associeras med lägre koncentrationer hos kvinnor med predisponerande faktorer som förändrar den vaginala miljön. 18,19 Komplikationer av vulvovaginal candidiasis är sällsynta. Korioamnionit vid graviditet och vulvart vestibulitsyndrom har rapporterats. 2 Kvinnor kan även vara koloniserade med Candida spp. och vara asymptomatiska. Trichomoniasis, som orsakas av Trichomonas vaginalis, är en av de vanligaste sexuellt överförda infektionerna över hela världen med över 170 miljoner fall varje år. 20 Fyra (4) till 35 procent av kvinnorna med symtomatisk vaginit får diagnosen trichomoniasis. 9 Denna sjukdom är förknippad med flera hälsoproblem, t.ex. prematur födsel, låg födslovikt och underlättande av sexuell överföring av HIV. 1 Läkarna diagnosticerar traditionellt vaginit med användning av en kombination av symtom, läkarundersökning, ph-mätning av vaginalsekret och lukttest. När de kombineras har dessa tester en sensitivitet och specificitet på 81 respektive 70 % för bakteriell vaginos; 84 respektive 85 % för vulvovaginal candidasis och 85 respektive % för trichomoniasis vid jämförelse med en molekyläranalys. 9, 21 BD MAX Vaginal Panel är utformad för att användas med BD MAX UVE Specimen Collection kit (provtagningskit). Proverna transporteras till testlaboratoriet i BD MAX UVE Sample Buffer Tubes (provbuffertrör). Provbuffertrören vortexblandas för att celler ska frigöras från provtagningspinnen ut i bufferten. Provbuffertrör, sammansatta reagensremsor och PCR-kassetter laddas i BD MAX-systemet. Ingen ytterligare åtgärd från användaren är nödvändig och följande automatiserade procedurer sker. Cellerna lyseras och DNA extraheras, fångas och koncentreras på magnetkulor. Efter ett elueringssteg tillsätts DNA till reagenserna, som innehåller specifika primers och prober som används för att amplifiera och detektera de genetiska målen, om förekommande. Vid amplifieringen utförs detektionen och tolkningen automatiskt av BD MAX-systemet med användning av PCR i realtid. Varje extraktionsrör innehåller provbearbetningskontroll som övervakar reagensernas egenskaper och de processteg som ingår i extraktion, amplifiering och detektion av DNA samt kontroll av eventuell förekomst av analysinhiberare. PRINCIPER FÖR METODEN En kombination av reagenser för lysering och extraktion används för att utföra cellysering och DNA-extraktion. Nukleinsyror som frigörs från målorganismerna fångas på magnetiska affinitetskulor. Kulorna med de bundna nukleinsyrorna tvättas och nukleinsyrorna elueras med en kombination av värme och ph-variation. Eluerat DNA neutraliseras och överförs till mastermixrören för att rehydrera PCR-reagenserna. Efter rekonstituering dispenserar BD MAX-systemet en bestämd volym PCR-färdig lösning innehållande extraherade nukleinsyror i PCR-kassetten. Mikroventiler i kassetten försluts av systemet innan PCR initieras för att bibehålla amplifieringsblandningen och förebygga avdunstning och kontamination. De amplifierade DNA-målen detekteras med hydrolysprober (TaqMan), märkta i ena änden med ett fluorescerande färgämne (fluorofor), och i den andra med ett inhiberande fragment. Prober märkta med olika fluoroforer används till att detektera målanalyterna i olika optiska kanaler i BD MAX-systemet. När proberna är i sitt nativa tillstånd inhiberas fluorescensen i fluoroforen p.g.a. dess närhet till inhiberaren. I närvaro av mål-dna hybridiseras dock sonderna till sina komplementära sekvenser och hydrolyseras av DNA-polymerasens 5' 3'-exonukleasaktivitet när den syntetiserar den begynnande strängen längs DNA-mallen. Till följd av detta separeras fluoroforerna från inhiberarmolekylerna och fluorescens avges. Mängden fluorescens som detekteras i de två optiska kanalerna som används för BD MAX Vaginal Panel står i direkt proportion till mängden motsvarande prob som hydrolyseras. BD MAX-systemet övervakar dessa signaler vid varje cykel av PCR och tolkar data i slutet av reaktionen för att ge kvalitativa testresultat för respektive analyt för vaginitmålen (dvs. positiva eller negativa) och positiva eller negativa BV-resultat erhålls från kombinationen av markörsignaler för bakteriell vaginos. REAGENSER OCH MATERIAL Innehåll Kvantitet BD MAX Vaginal Panel - Vaginitis Master Mix (vaginitmastermix för vaginalpanel) (C4) 24 tester Torkad PCR-mastermix som innehåller DNA-polymeras, primrar och prober som är specifika för mål- och (2 12 rör) provbearbetningskontrollen. BD MAX Vaginal Panel - Vaginosis Master Mix (vaginosmastermix för vaginalpanel) (C5) 24 tester Torkad PCR-mastermix som innehåller DNA-polymeras, primrar och prober som är specifika för mål- och (2 12 rör) provbearbetningskontrollen. BD MAX Vaginal Panel Reagent Strips (reagensremsor för vaginalpanel) Sammansatta reagensremsor som innehåller alla flytande reagenser och pipettspetsar för engångsbruk som 24 tester behövs för provbearbetning och DNA-extraktion. BD MAX Vaginal Panel - Extraction Tubes (extraktionsrör för vaginalpanel) (C6) Torkade magnetiska affinitetskulor 24 tester Torkat lytiskt enzym (2 12 rör) Torkad provbearbetningskontroll Membranlock 25 2
UTRUSTNING OCH MATERIAL SOM KRÄVS MEN EJ MEDFÖLJER BD MAX System (system) (BD, kat. nr. 441916) BD MAX UVE Specimen Collection kit (provtagningskit) (BD, kat. nr. 443376) BD MAX PCR Cartridges (kassetter) (BD, kat. nr. 437519) BD MAX UVE Sample Buffer Tubes (provbuffertrör) (BD, kat. nr. 443420) VWR* vortexblandare för flera rör (VWR kat. nr. 58816-115) NALGENE kryotisk flaskhållare (VWR, kat. nr. 66008-783) Rekommenderat medium för odling av externa kontroller: Sabouraud dextroagar (Deep Fill), (t.ex. BD, kat. nr. 221180 eller 221278) eller Sabouraud dextroagar (Deep Fill), Emmons (t.ex. BD, kat. nr 221867 eller 221849), Columbia anaerob fårblodsagar (t.ex. BD, kat. nr. 221928). Engångshandskar, utan talk VARNINGAR OCH FÖRSIKTIGHETSBEAKTANDEN BD MAX Vaginal Panel är avsedd för in vitro-diagnostik. Om patienttagna vaginalpinnprover inte överförs till ett BD MAX UVE Sample Buffer Tube omedelbart måste de överföras inom 2 timmar efter tagningen när de förvarats i 2 30 C. Förvärm inte prover före användning av BD MAX Vaginal Panel. Använd inte utgångna reagenser och/eller material. Använd inte kitet om etiketten som förseglar ytterkartongen är bruten vid mottagandet. Använd inte reagenserna om skyddspåsarna är öppna eller trasiga vid mottagandet. Använd inte reagenserna om torkmedel saknas eller är trasigt inuti reagenspåsarna. Ta inte bort torkmedlet ur reagenspåsarna. Förslut reagensskyddspåsar med blixtlåset omedelbart efter varje användning. Tryck ut överflödig luft ur påsarna innan de försluts. Skydda reagenserna mot värme och fukt. Långvarig exponering för fukt kan påverka produktens prestanda. Använd inte reagenser om folien har öppnats eller skadats. Blanda inte reagenser från olika påsar och/eller kit eller loter. Alternera inte och återanvänd inte lock eftersom kontamination som kan påverka testresultaten kan uppstå. Kontrollera att de sammansatta reagensremsorna är korrekt fyllda (se till att vätskorna finns på rörens botten) (se figur 2). Undersök de sammansatta reagensremsorna för att säkerställa att alla pipettspetsar finns på plats (se figur 2). BD MAX PCR Cartridges får endast användas för en körning. Hantera kemiska lösningar försiktigt eftersom de kan göra streckkoden på mastermix- och extraktionsrören oläslig. God laboratorieteknik är avgörande för att den här analysen ska fungera korrekt. På grund av den höga analytiska känsligheten hos detta test så bör extrem försiktighet iakttas för att bevara renheten hos alla material och reagenser. I fall där andra PCR-tester också utförs i samma generella område i laboratoriet måste försiktighet iakttas för att säkerställa att BD MAX Vaginal Panel, eventuella övriga reagenser som behövs för testningen och BD MAX-systemet inte kontamineras. Undvik alltid mikrobiell kontamination och kontamination med deoxyribonukleas (DNas) av reagenserna. Byt handskar innan reagenser och kassetter hanteras. Förebygg kontamination av miljön med amplikoner genom att inte bryta isär BD MAX PCR Cartridges efter användning. Förseglingarna på BD MAX PCR Cartridges är utformade för att förebygga kontamination. Laboratoriet ska rutinmässigt bedriva miljöövervakning för att minimera risken för korskontaminering. Utförande av BD MAX Vaginal Panel utanför de rekommenderade tidsområdena kan ge ogiltiga resultat. Analyser som inte utförts inom angivna tidsområden för stabilitet bör upprepas med ett nytt prov. Ytterligare kontroller kan testas i enlighet med riktlinjer eller krav i lokala, kommunala, statliga och/eller nationella bestämmelser eller från ackrediteringsorganisationer. Hantera alltid prover som om de vore smittförande och i enlighet med säkra laboratorieförfaranden, till exempel de som beskrivs i CLSI-dokument M29 22 och i Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL). 23 Använd skyddskläder och engångshandskar vid hantering av alla reagenser. Tvätta händerna noggrant efter testets utförande. Pipettera inte med munnen. Rök inte, drick inte, tugga inte och ät inte i områden där prover eller kitreagenser hanteras. Kassera oanvända reagenser och avfall i enlighet med lokala, statliga, landstings- och/eller kommunala bestämmelser. Se Användarhandbok för BD MAX-systemet 24 för ytterligare varningar, försiktighetsbeaktanden och förfaranden. 3
FÖRVARING OCH STABILITET Provstabilitet Tagna prover ska överföras till BD MAX UVE Sample Buffer Tubes enligt beskrivningen i bipacksedeln i provtagningskitet. Prover i BD MAX UVE Sample Buffer Tubes kan förvaras i maximalt 8 dagar vid 2 30 C eller i maximalt 14 dagar vid 2 8 C innan de testas. Lagring av kitkomponenter Reagenserna och komponenterna i BD MAX Vaginal Panel är stabila vid 2 25 C fram till det angivna utgångsdatumet. Använd inte utgångna komponenter. BD MAX Vaginal Panel Master Mixes och Extraction Tubes levereras i förslutna påsar. Skydda produkten från fukt genom att omedelbart återförsluta påsarna efter att de öppnats. Reagensrör är stabila i upp till 14 dagar vid 2 25 C efter första öppnandet och återförslutningen av påsen. Orekonstituerade BD MAX Master Mixes och Extraction Tubes är stabila i upp till 24 timmar vid 2 25 C efter att de tagits ur sina skyddspåsar. BRUKSANVISNING Transport och beredning av prov OBS! Använd rena handskar när komponenterna i BD MAX UVE Specimen Collection kit och prover hanteras. Byt handskar omedelbart om de kommer i kontakt med prover för att undvika kontaminering av andra prover. Prover ska endast tas med BD MAX UVE Specimen Collection kit och i enlighet med bipacksedeln för BD MAX UVE Specimen Collection kit. Om proverna ännu inte har överförts till BD MAX UVE Sample Buffer Tube ska de beredas för testning enligt instruktionerna nedan. Överföring av vaginala pinnprover till BD MAX UVE Sample Buffer Tube: OBS! Pinnprover måste överföras från provtagningshylsan till BD MAX UVE Sample Buffer Tube direkt (föredras) eller inom 2 timmar efter tagningen när de förvarats i 2 30 C. OBS! En sammanfattning av arbetsflödet för överföring av pinnprovet finns i figur 1. 1. Ta av locket på BD MAX UVE Sample Buffer Tube och för in provtagningspinnen helt i röret så att änden når botten. 2. Håll pinnen i locket och bryt försiktigt av skaftet vid brytskåran. Var försiktig så att innehållet i röret inte stänker eller kontamineras. 3. Dra åt locket på BD MAX UVE Sample Buffer Tube ordentligt. Om provtagningspinnens skaft skulle vara för långt för att röret ska kunna stängas säkert, be om ett nytt prov med en ny provtagningspinne. 4. Märk BD MAX UVE Sample Buffer Tube med patientuppgifter och datum/tid för provtagningen. OBS! Var noga med att inte täcka för streckkoder på röret. 5. Fortsätt direkt med provberedning. Figur 1: Överföring av pinnprover till BD MAX UVE Sample Buffer Tube 1. För in provtagningspinnen helt i röret så att änden når botten. 2. Bryt försiktigt av skaftet vid brytskåran. 4
3. Sätt på locket ordentligt på röret. 4. Märk röret med patientinformation. Beredning av provmaterial OBS! 1 membranlock krävs för varje prov och varje extern kontroll som ska testas. 1. Placera provbuffertrören i en NALGENE kryogen flaskhållare och vortexa på maximal hastighet i 1 minut med vortexblandaren för flera rör. Om körningen inte kan startas inom 4 timmar efter detta vortexblandningssteg, vortexa igen vid maximal hastighet under 1 minut med vortexblandaren för flera rör innan körningen startas. 2. Ta av locket från provbuffertröret och tryck försiktigt pinnen mot rörets insida så att överflödig vätska pressas ut. OBS! Om ett pinnprov inte fångas upp av locket, försök inte avlägsna det från provbuffertröret. Provtagningspinnen kan vara kvar i provbuffertröret under hela PCR-körningen. 3. Ta ur pinnen och locket som sitter ihop från röret och kassera dem i en behållare för biomedicinskt avfall. Observera att den mikrobiella koncentrationen från vaginala prover kan vara mycket hög. Försiktighetsåtgärder bör iakttas för att undvika kontamination under just detta steg i provberedningen. 4. Återförslut röret med ett blå membranlock. 5. Fortsätt direkt med användningen av BD MAX-systemet. Förvärm inte provrören före användning av BD MAX Vaginal Panel. ANVÄNDNING AV BD MAX-SYSTEMET OBS! Se Användarhandbok för BD MAX-systemet 24 för detaljerade anvisningar (avsnittet Användning). OBS! Testning av BD MAX Vaginal Panel måste utföras inom 4 timmar efter vortexsteget ovan (se avsnittet Provberedning, steg 1 3). Om omtestning krävs måste provet/proverna vortexblandas på nytt. OBS! 1 vaginitmastermix (C4), vaginosmastermix (C5), 1 extraktionsrör (C6) och 1 sammansatt reagensremsa för BD MAX Vaginal Panel krävs för varje prov och varje extern kontroll som ska testas. 1. Starta BD MAX-systemet (om det inte redan är på) och logga in genom att ange <user name> (användarnamn) och <password> (lösenord). 2. Byt handskar innan reagenser och kassetter hanteras. 3. Ta ut det antal sammansatta reagensremsor som krävs ur BD MAX Vaginal Panel-kitet. Knacka försiktigt varje sammansatt reagensremsa mot en hård yta för att säkerställa att alla vätskor finns på rörens botten. 4. Ta ut önskat antal extraktionsrör och mastermixrör ur deras skyddspåsar. Tryck ut överflödig luft och förslut påsarna med blixtlåset. 5. För varje prov som ska testas ska 1 sammansatt reagensremsa placeras i BD MAX-systemets ställ med början i position 1 i ställ A. 6. Kläm fast 1 extraktionsrör (vit folie) i varje sammansatt reagensremsa i position 1 enligt figur 2. 7. Kläm fast 1 vaginosmastermix (grön folie) i varje sammansatt reagensremsa i position 2 enligt figur 2. 8. Kläm fast 1 vaginitmastermixrör (blå folie) i varje sammansatt reagensremsa i position 4 enligt figur 2. 5
Figur 2: Kläm fast BD MAX Vaginal Extraction Tubes och BD MAX Master Mix Tubes i de sammansatta reagensremsorna. 9. Klicka på Kör-ikonen och ange kitets lotnummer för BD MAX Vaginal Panel antingen genom att skanna streckkoden med streckkodsläsaren eller genom att föra in det manuellt. OBS! Upprepa steg 9 varje gång en ny kit-lot används. 10. Navigera till arbetslistan. Använd rullgardinsmenyn och välj <BD MAX Vaginal 46>. 11. Fyll i ID för provbuffertrör, patient-id och accessionsnummer (om tillämpligt) i arbetslistan, antingen genom att skanna streckkoden med skannern eller manuellt. 12. Markera det tillämpliga kit-lotnumret (finns på ytterkartongen) på rullgardinsmenyn. 13. Upprepa steg 10 till 12 för alla återstående provbuffertrör. 14. Sätt provbuffertrören i BD MAX-systemets ställ som motsvarar de sammansatta reagensremsorna som sattes samman i steg 5 till 8. 15. Sätt tillämpligt antal av BD MAX PCR Cartridge i BD MAX-systemet (se figur 3). Varje kassett rymmer 12 prover som testats mot vaginos- och vaginitpanelerna under totalt 24 PCR-reaktioner per kassett. BD MAX-systemet väljer automatiskt position och rad i PCR-kassetten för varje körning. Figur 3: Ladda BD MAX PCR Cartridges 6
16. Ladda ställ i BD MAX-systemet (se figur 4). Sida A Sida B Figur 4: Ladda ställ i BD MAX-systemet. 17. Stäng BD MAX-systemets lock och klicka <Start> (Starta) för att påbörja bearbetningen. 18. Kontrollera resultaten omedelbart efter körningen eller förvara provbuffertrören enligt den temperatur och de tider som anges i Upprepa testförfarande (nedan) tills resultaten kontrollerats. OBS! Om ett membranlock skadas under körningen ska det bytas ut mot ett nytt innan provet förvaras. OBS! Efter körningen avslutats kan provbuffertrören som innehåller proverna förvaras: maximalt 5 timmar vid 2 30 C eller maximalt 120 timmar vid 2 8 C. Om resultatet är obestämt (IND), olöst (UNR) eller ofullständigt (INC), eller om ett externt kontrollfel inträffar måste testet från det beredda provbuffertröret upprepas (se avsnittet Upprepa testförfarande ). Om en extern kontroll misslyckas, ska alla prover testas om med nypreparerade externa kontroller (se Kvalitetskontroll ). KVALITETSKONTROLL Procedurer för kvalitetskontroll övervakar analysens prestanda. Laboratorierna måste fastställa antal, typ och frekvens för testning av kontrollmaterial enligt riktlinjer eller krav i lokala, kommunala, statliga och/eller nationella bestämmelser eller från ackrediteringsorganisationer. För allmänna riktlinjer om kvalitetskontroll kan användaren konsultera dokumenten MM3, C24 and EP12 från Clinical Laboratory Standards Institute. 25,26,27 1. Externa kontrollmaterial tillhandahålls inte av BD. Externa positiva och negativa kontroller används inte av BD MAX-systemets programvara för tolkning av testresultat. Externa kontroller behandlas som om de vore patientprover. BD MAX UVE Sample Buffer Tube behövs för att bereda externa kontroller. (Se tabellen i avsnittet Tolkning av resultat för tolkning av analysresultat från externa kontroller.) 2. En extern positiv kontroll och en extern negativ kontroll bör köras minst dagligen tills adekvat processvalidering uppnås på BD MAX-systemet i varje laboratoriemiljö. Varje målkontrollstam bör därefter testas. Minskad frekvens av kontrolltestning ska göras i enlighet med tillämpliga föreskrifter. 3. Den externa positiva kontrollen används för att övervaka förekomsten av större reagensfel. Den externa negativa kontrollen är avsedd för att detektera reagens- eller miljökontamination (eller överföring) av målnukleinsyror. 4. Kontrollstammar bör testas i enlighet med riktlinjer eller krav i lokala, statliga och/eller kommunala bestämmelser eller från ackrediterade organisationer i syfte att kontrollera effektiviteten hos hela analysprocessen. 5. Olika typer av externa kontroller rekommenderas så att användaren kan välja den som passar kvalitetskontrollprogrammet i deras laboratorium bäst. a. Extern negativ kontroll: En suspension av kommersiellt tillgängligt kontrollmaterial (t.ex. Lactobacillus iners (ATCC 55195)] i ett BD MAX UVE Sample Buffer Tube eller ett tidigare karakteriserat prov som är känt negativt. BD rekommenderar att den externa negativa kontrollen framställs före den externa positiva kontrollen för att minska risken för förorening till följd av kontrollberedningen. b. Extern positiv kontroll: En suspension av kommersiellt tillgängligt kontrollmaterial nedan i ett BD MAX UVE Sample Buffer Tube (tabell 1) eller ett tidigare karakteriserat prov som är känt positivt. 7
Tabell 1: Kommersiellt tillgängliga material för extern kontroll Vaginitpanel Vaginospanel a En blandning av Gardnerella vaginalis och Atopobium vaginae Positiva kontroller Trichomonas vaginalis ATCC 30001 Candida albicans ATCC 10231 Candida glabrata ATCC 2001 Candida krusei ATCC 6258 BV positiv extern kontroll a Negativa kontroller Lactobacillus iners ATCC 55195 Om odlingar av kontrollorganismer används: (1) Bered startkulturerna med kontrollorganismer enligt beskrivningen i tabellen Beredning av extern kontroll nedan. (2) För alla andra kontroller än Trichomonas vaginalis, bered 0,5 McFarland cellsuspension i fosfatbuffrad koksaltlösning (PBS) från färsk odling. (3) Genomför seriella spädningar i tabell 2 med PBS för att erhålla den slutliga rekommenderade spädningen för varje organism. (4) För BV positiv kontroll, blanda en lika stor volym av 0,5 McFarland-suspensionen med Gardnerella vaginalis ATCC 14018 och av 0,5 McFarland-suspensionen med Atopobium vaginae ATCC BAA-55. Vortexa i 5 10 sekunder vid maxhastighet. Ingen extra blandning behövs för andra kontroller. (5) Tillsätt 150 µl av den slutliga spädningen eller suspensionen eller blandningen till BD MAX UVE Sample Buffer Tube och sätt tillbaka det blå membranlocket på röret. (6) Placera provbuffertrören i en NALGENE kryogen flaskhållare och vortexa på maximal hastighet i 1 minut med vortexblandaren för flera rör. Om körningen inte kan startas inom 4 timmar efter detta vortexblandningssteg, vortexa igen vid maximal hastighet under 1 minut med vortexblandaren för flera rör innan körningen startas. (7) Bearbeta den externa kontrollen som om det är ett patientprov enligt proceduren som anges i avsnittet Användning av BD MAX-systemet. Kontrollorganism Tabell 2: Beredning av externa kontroller Startkultur Beredning av suspension i PBS Slutlig spädning Trichomonas vaginalis ATCC 30001 Använd ATCC-stam Från ATCC-stam 1/0 a Candida albicans ATCC 10231 Färsk odling på Sabouraud-platta 0,5 McFi PBS 1/20 b Candida glabrata ATCC 2001 Färsk odling på Sabouraud-platta 0,5 McFi PBS 1/ c Candida krusei ATCC 6258 Färsk odling på Sabouraud-platta 0,5 McFi PBS 1/20 c Lactobacillus iners ATCC 55195 Färsk odling på anaerobisk blodagarplatta 0,5 McFi PBS Ingen spädning c Gardnerella vaginalis ATCC 14018 Färsk odling på anaerobisk blodagarplatta 0,5 McFi PBS Ingen spädning: kombinera en lika stor volym av Atopobium vaginae ATCC BAA-55 Färsk odling på anaerobisk blodagarplatta 0,5 McFi PBS 0,5 McF suspension c a En hel flaska Trichomonas vaginalis ATCC 30001 kan beredas till slutlig spädning, delas upp på alikvoter om 200 μl, frysas och användas för rutintestning. b Nyberedning måste alltid användas för Candida albicans ATCC 10231. c Suspension kan beredas till slutlig spädning, delas upp på alikvoter om 200 μl, frysas och användas för rutintestning. 6. Externa kontroller bör ge förväntade resultat. a. En extern negativ kontroll som ger ett positivt testresultat är indikativt för fel på provhanteringen och/eller att en förorening har inträffat. Granska provhanteringstekniken för att undvika sammanblandning och/eller kontamination. b. En extern positiv kontroll som ger ett negativt resultat är indikativt för problem med provhantering/beredning. Granska provhanterings-/beredningstekniken. c. En extern kontroll som ger ett olöst, obestämt eller ofullständigt resultat är indikativt för ett reagens- eller BD MAXsystemfel. Kontrollera om några felmeddelanden visas på BD MAX-systemets bildskärm. Se avsnittet Översikt över systemfel i Användarhandbok för BD MAX-systemet 24 för tolkningar av varnings- och felkoder. Om problemet kvarstår, använd reagenser från en oöppnad påse eller använd ett nytt analyskit. 7. Varje extraktionsrör innehåller en provbearbetningskontroll som är en plasmid med en syntetisk mål-dna-sekvens. Provbearbetningskontrollen övervakar effektiviteten i insamling, tvättning och eluering av DNA under provbearbetningen, samt effektiviteten i amplifiering och detektion av DNA under PCR-analysen. Om resultatet av provbearbetningskontrollen inte uppfyller acceptanskriterierna rapporteras provresultatet som olöst för denna mastermix. Varje mastermix innehåller sina egna provbearbetningskontroller. På så vis bestäms olösta resultat oberoende av varje mastermix. Ett olöst resultat är indikativt för en provrelaterad inhibering eller ett reagensfel. Upprepa prov som rapporteras som olöst enligt avsnittet Upprepa testförfarande nedan. 8
RESULTATTOLKNING Resultat finns på fliken Resultat i fönstret Resultat på BD MAX-systemets bildskärm. Testresultaten tolkas automatiskt av BD MAX-systemets programvara. Ett testresultat kan kallas NEG (negativt), POS (positivt) eller UNR (olöst) baserat på målets amplifieringsstatus och provbearbetningskontrollen. IND (obestämt) eller INC (ofullständigt) resultat beror på ett BD MAX-systemfel. Resultat tolkas så som visas i tabell 3. Rapporterade analysresultat (Vaginitmastermix) TV POS TV NEG Cgroup POS Cgroup NEG Cgla POS Cgla NEG Ckru POS Ckru NEG UNR Tabell 3: Tolkning av resultat från BD MAX Vaginal Panel Tolkning av resultat Trichomonas vaginalis-dna detekterat Inget Trichomonas vaginalis-dna detekterat Candida-grupp-DNA detekterat (Candida albicans och/eller Candida tropicalis och/eller Candida parapsilosis och/eller Candida dubliniensis) Ingen Candida-grupp detekterad (Candida albicans och/eller Candida tropicalis och/eller Candida parapsilosis och/eller Candida dubliniensis) Candida glabrata-dna detekterat Inget Candida glabrata-dna detekterat Candida krusei-dna detekterat Inget Candida krusei-dna detekterat Olöst inhiberande prov eller reagensfel Inget mål detekterat och ingen amplifiering av provbearbetningskontrollen IND Obestämt resultat p.g.a. BD MAX-systemfel (med varnings- eller felkoder a ) INC. Ofullständig körning (med varnings- eller felkoder a ) Rapporterade analysresultat (Vaginosmastermix) BV POS BV NEG UNR Tolkning av resultat Vaginospanel-DNA detekterat. Detektion av markörkombinationer relaterade till bakteriell vaginos: Gardnerella vaginalis och/eller L. crispatus och/eller L. jensenii och/eller Atopobium vaginae och/eller BVAB-2 och/eller Megasphaera-1 Detektion av markörkombinationer relaterade till normal vaginal flora Olöst inhiberande prov eller reagensfel Inget mål detekterat och ingen amplifiering av provbearbetningskontrollen IND Obestämt resultat p.g.a. BD MAX-systemfel (med varnings- eller felkoder a ) INC Ofullständig körning (med varnings- eller felkoder a ) a Se avsnittet Felsökning i Användarhandbok för BD MAX-systemet 24 för tolkningar av varnings- och felkoder. UPPREPA TESTFÖRFARANDE OBS! Det finns endast tillräckligt med provvolym i provbuffertröret för en upprepad körning. För provbuffertrör som förvarats vid 2 30 C måste omtestningen initieras inom 5 timmar efter körningens slut. Alternativt kan för provbuffertrör som förvarats vid 2 8 C omtestningen initieras inom 120 timmar (5 dagar) efter körningens slut. OBS! Nya prover kan testas i samma körning som de upprepade proverna. OBS! I den händelse UNR- och IND-resultat påverkar endast en mastermix, måste testningen upprepas med båda mastermixarna fastklämda på remsan. Om upprepningen ger ett annat rapporterbart resultat för ett givet mål, ska alla positiva resultat rapporteras. OLÖST RESULTAT Olösta resultat kan uppstå om en provrelaterad inhibering eller ett reagensfel förhindrar att målet eller provbearbetningskontrollen amplifieras korrekt. Prover kan upprepas från sina motsvarande provbuffertrör inom de tidsramar som anges ovan. Vortexblanda proverna i 1 minut och börja om enligt avsnittet Användning av BD MAX-systemet. 9
OBESTÄMT RESULTAT Obestämda resultat kan uppstå i händelse av att larm om systemfel eller reagensfel uppstår. Prover kan upprepas från sina motsvarande provbuffertrör inom de tidsramar som anges ovan. Vortexblanda proverna i 1 minut och börja om enligt avsnittet Användning av BD MAX-systemet. Tolkningar av varnings- och felkodmeddelanden finns i Användarhandbok för BD MAX-systemet 24 (avsnittet Felsökning). OFULLSTÄNDIGT RESULTAT Ofullständiga resultat kan uppstå om provberedningen eller PCR inte kunde slutföras. Prover kan upprepas från sina motsvarande provbuffertrör inom de tidsramar som anges ovan. Vortexblanda proverna i 1 minut och börja om enligt avsnittet Användning av BD MAX-systemet. För tolkningar av varnings- och felkodmeddelanden, se Användarhandbok för BD MAX-systemet 24 (avsnittet Felsökning). EXTERNT KONTROLLFEL Externa kontroller ska ge förväntade resultat vid testning. Om prover måste upprepas p.g.a. ett felaktigt resultat från extern kontroll ska de upprepas från sina provbuffertrör tillsammans med nyberedda externa kontroller inom de tidsramar som anges ovan. Vortexblanda proverna i 1 minut och börja om enligt avsnittet Användning av BD MAX-systemet. PROCEDURENS BEGRÄNSNINGAR BD MAX Vaginal Panel är avsedd att användas endast med BD MAX UVE Specimen Collection kit. BD MAX Vaginal Panel får endast användas med BD MAX-systemet av utbildad personal. BD MAX Vaginal Panel har inte validerats för vaginalpinnprover tagna av patienter i hemmet. Provtagning och analys av patienttagna vaginalpinnprover med BD MAX Vaginal Panel är inte avsett att ersätta undersökning av läkare. Vaginala infektioner kan vara orsakade av andra agens eller så kan samtidiga andra infektioner förekomma. Hälsovårdsmyndigheternas rekommendationer ska konsulteras avseende testning av ytterligare sexuellt överförda sjukdomar hos patienter med positivt resultat för bakteriell vaginos eller T. vaginalis med BD MAX Vaginal Panel. Ytterligare mikroorganismer som inte detekteras av BD MAX Vaginal Panel, t.ex. Prevotella, Lachnospira, Sneathia, Mobiluncus, Mycoplasma hominis och Ureaplasma spp., har även hittats hos kvinnor med bakteriell vaginos, men är mindre associerade med BV på grund av sin relativt låga prevalens, sensitivitet och/eller specificitet. 3,6,7 Patienter under 18 år har inte utvärderats. Ett positivt Cgroup-resultat kan bero på en eller flera Candida-species. Glidmedel eller andra produkter som innehåller substanser som karbomer kan öka den ej rapporterbara frekvensen som erhålls med BD MAX Vaginal Panel. Interferens med BD MAX Vaginal Panel observerades vid förekomst av följande substanser: Conceptrol vaginal preventivgel, Clotrimazole vaginalkräm, Monistat 3 kräm, Vagisil kräm, Replens vaginal fuktgel, Surgilube, McKesson Lubricating Jelly, Aquasonic Clear, metronidazol och leukocyter. Följande substanser befanns interferera vid nivåer över de angivna koncentrationerna: Preparation H Hemorrhoidal Cream (> 0,8 μl/ml), Zovirax aciklovir 5 % kräm (> 3,1 μl/ml), VCF preventivskum (> 3,1 μl/ml), KY Jelly Personal glidmedel (> 12,5 μl/ml), MUKO Lubricating Jelly (> 3,3 μl/ml), helblod (> 12,5 μl/ml eller > 1,25 % v/v). Interferens av BD MAX Vaginal Panel observerades vid förekomst av följande mikroorganismer: Lactobacillus amylovorus, Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus, Lactobacillus kefirgranum och Lactobacillus helveticus, som alla kan användas i probiotika. Interferens av Lactobacillus kefiranofaciens har ej fastställts. Korsreaktivitet med BD MAX Vaginal Panel kan observeras för följande organismer: Lactobacillus acidophilus, som detekterats i mänsklig avföring, Trichomonas tenax, en symbiotisk organism i munhålan. Följande organismer befanns korsreagera över de angivna koncentrationerna: Olsenella uli (> 6,6 x 10 4 CFU/mL) och Atopobium rimae (> 4,4 x 10 4 CFU/mL), båda isolerade från munhålan; Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis (> 3,9 x 10 3 CFU/mL), detekterat i mänsklig avföring; Pichia fermentans (> 6,0 x 10 3 CFU/mL), från kaffebönor och frukt. Alla stammar som testades i inklusionsstudien detekterades. Men tre (3) av 10 testade Gardnerella vaginalis-stammar och 1 av 5 Lactobacillus crispatus-stammar detekterades enbart vid höga koncentrationer (9 X LoD respektive 5 x LoD). Effekterna av andra möjliga variabler, såsom vaginal sekretion, användning av tamponger och variabler avseende provtagning har inte fastställts. Som med många diagnostiska tester ska resultaten från BD MAX Vaginal Panel tolkas i kombination med andra laboratoriedata och kliniska data som läkaren har tillgång till. Candida-species kan förekomma som en symbiotisk organism med en betydande procentandel hos kvinnor och resultat från BD MAX Vaginal Panel ska beaktas i kombination med annan klinisk information och patientinformation för att fastställa sjukdomsstatus. Kombinationer av bakteriell vaginos-markörer som genererar positiva resultat kan förekomma som en symbiotisk organism hos en betydande procentandel kvinnor och därför ska positiva resultat för bakteriell vaginos beaktas i kombination med annan klinisk information och patientinformation för att fastställa sjukdomsstatus. Felaktiga testresultat kan uppstå till följd av felaktig provtagning, hantering, förvaring, tekniskt fel, sammanblandning av prover eller p.g.a. att antalet organismer i provet är lägre än testets analytiska känslighet. God laboratorieteknik är avgörande för att den här analysen ska fungera korrekt. På grund av den höga analytiska känsligheten hos detta test så bör extrem försiktighet iakttas för att bevara renheten hos alla material och reagenser. Ett positivt resultat innebär inte alltid förekomst av livsdugliga organismer. Ett positivt resultat är indikativt för förekomst av mål-dna. 10
BD MAX Vaginal Panel kan inte användas för att bedöma huruvida behandlingen varit framgångsrik eller misslyckad, eftersom målnukleinsyror kan kvarstå även efter antimikrobiell behandling. Som med alla PCR-baserade test kan extremt låga nivåer av målet under analysens detektionsgräns detekteras utan att resultaten är reproducerbara. Falskt negativa resultat kan uppstå p.g.a. förlust av nukleinsyra till följd av felaktig provtagning, transport eller förvaring av proverna, eller p.g.a. inadekvat cellysering. Provbearbetningskontrollen har lagts till för att bidra till identifiering av prover som innehåller inhiberare av PCR-amplifiering. Provbearbetningskontrollen indikerar inte om nukleinsyran har förlorats på grund av inadekvat provtagning, transport eller förvaring av proverna, eller om bakterieceller har lyserats adekvat. Vid mycket låga koncentrationer kan falskt negativa Candida glabrata-resultat förekomma för prover som innehåller mer än en analyt. Vid mycket låga koncentrationer kan falskt negativa Candida spp.-resultat förekomma för prover som innehåller mer än en BV-analyt vid höga koncentrationer. Vid mycket låga koncentrationer kan falskt negativa Candida spp., C. krusei eller C. glabrata-resultat förekomma för prover som innehåller höga koncentrationer av T. vaginalis. Detta test är ett kvalitativt test och det tillhandahåller inte kvantitativa värden och anger inte mängden närvarande organismer. FÖRVÄNTADE VÄRDEN I den kliniska studien med BD MAX Vaginal Panel erhölls rapporterbara resultat, från prover som var godkända på prov- och PCR-nivå, från 10 olika geografiska platser. Prover tagna av klinikpersonal var totalt 1 685, för bakteriell vaginos och 1 700 för andra analysmål. Självtagna prover var totalt 1 705, för bakteriell vaginos och 1 709 för andra analysmål. Antalet och procentandelen positiva fall per mål, som fastställdes med BD MAX Vaginal panel, presenteras i tabell 4. Tabell 4: BD MAX Vaginal Panel positivitetsfrekvens efter kliniktyp Provtagningstyp Tagna av klinisk personal Självtagna Kliniktyp STD / HIV Preventivmedelsrådgivning OB/Gyn Totalt STD / HIV Preventivmedelsrådgivning OB/Gyn Totalt Bakteriell vaginos 72,7 % (224/308) 60,7 % (683/1 125) 20,6 % (52/252) 56,9 % (959/1 685) 74,6 % (229/307) 60,1 % (687/1 143) 22,0 % (56/255) 57,0 % (972/1 705) Cgroup a 34,0 % (105/309) 33,3 % (379/1 138) 29,6 % (75/253) 32,9 % (559/1 700) 33,9 % (104/307) 35,1 % (403/1 147) 34,5 % (88/255) 34,8 % (595/1 709) Candida glabrata 2,6 % (8/309) 1,2 % (14/1 138) 2,0 % (5/253) 1,6 % (27/1 700) 2,3 % (7/307) 1,7 % (19/1 147) 2,4 % (6/255) 1,9 % (32/1 709) Candida krusei 0,3 % (1/309) 0,1 % (1/1 138) 0,8 % (2/253) 0,2 % (4/1 700) 0,0 % (0/307) 0,0 % (0/1 147) 0,0 % (0/255) 0,0 % (0/1 709) Trichomonas vaginalis 15,9 % (49/309) 7,5 % (85/1 138) 0,4 % (1/253) 7,9 % (135/1 700) 16,0 % (49/307) 7,7 % (88/1 147) 0,4 % (1/255) 8,1 % (138/1 709) a Candida albicans, Candida tropicalis, Candida parapsilosis och/eller Candida dubliniensis KLINISKA PRESTANDA Kliniska prestanda för analysen utvärderades i en studie som genomfördes vid 10 geografiskt spridda provtagningsplatser, inklusive 7 som enbart utför provtagning och 3 som även utför testning med BD MAX Vaginal Panel. Två (2) referenslaboratorier utförde BD MAX Vaginal Panel och/eller referensmetodstestning. För vuxna kvinnor som gett sitt samtycke och som hade symtom på vaginit eller bakteriell vaginos, togs ett självtaget pinnprov och ett som togs av klinisk personal med användning av BD MAX UVE Specimen Collection Kit och testades oberoende. Tre (3) ytterligare vaginala pinnprover togs för referensmetodstestning. Tre (3) referensmetoder utfördes för varje patient: 1) Status för bakteriell vaginos bestämdes med en kombination av Nugent Score och Amsels kriterier. Proverna med normal flora enlige Nugent Score betraktades som negativa. De med BV-flora betraktades positiva medan de med intermediär flora delades upp i positiva och negativa kategorerier med hjälp av Amsels kriterier. Prover som var positiva för 2 av 3 följande kriterier betraktades som positiva enligt Amsels kriterier: vaginalt ph > 4,5, förekomst av clue cells och positivt lukttest. 2) Candida-status bestämdes genom selektivt (Candida)-kromogent medium och odling med Sabouraud Dextrose Emmons platta följt av PCR-amplifiering och dubbelriktad sekvensering av its2-genen för identifiering av Candida-species. 3) Trichomonas vaginalis-status bestämdes av mikroskopisk visualisering av rörliga trichomonader i våtpreparat i koksaltslösning av vaginalsekret och genom odling. Något positivt resultat var tillräckligt för att betrakta provets referensmetod som positiv för Trichomonas vaginalis. 11
Totalt 1 763 patienter ingick i studien. Av dessa ansågs 1 740 patienter vara godkända och 23 ansågs vara ej godkända enligt protokollkriterierna. För prover som tagits av klinikpersonal var antalet godkända prover med rapporterbar referensmetod och resultat med BD MAX Vaginal Panel 1 559 för bakteriell vaginos, 1 618 för Candida och 1 600 för Trichomonas vaginalis. För självtagna prover var antalet godkända prover med rapporterbar referensmetod och resultat med BD MAX Vaginal Panel 1 582 för bakteriell vaginos, 1 628 för Candida och 1 610 för Trichomonas vaginalis. BV-prestandaresultat Bakteriell vaginos efter plats och övergripande prestandaresultat visas i Tabell 5. Känslighet och specificitet var 90,5 respektive 85,8 % för vaginala pinnprov som tagits av klinikpersonal och 90,7 respektive 84,5 % för självtagna vaginala pinnprover. För den testade populationen resulterade detta i ett positivt prediktivt värde (PPV) på 89,0 % och 88,1 % för prover som tagits av klinikpersonal respektive självtagna prover. Negativa prediktiva värden (NPV) på 87,7 % och 87,8 % erhölls för prover som tagits av klinikpersonal respektive självtagna prover. BV-prevalens var 55,8 % för patienter med godkända referensmetodresultat. Tabell 5: BV-prestandaresultaten efter provtagningstyp och provtagningsplats Plats 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Sammanlagt a KI: Konfidensintervall Tagna av klinisk personal Självtagna Sensitivitet Specificitet Sensitivitet Specificitet 76,5 96,6 80,0 94,1 26/34 113/117 28/35 111/118 (60,0, 87,6) (91,5, 98,7) (64,1, 90,0) (88,3, 97,1) 92,3 48/52 (81,8, 97,0) 92,3 36/39 (79,7, 97,3) 92,3 12/13 (66,7, 98,6) 89,6 199/222 (84,9, 93,0) 87,1 81/93 (78,8, 92,5) 95,7 44/46 (85,5, 98,8) 93,4 198/212 (89,2, 96,0) 96,0 144/150 (91,5, 98,2) 45,0 9/20 (25,8, 65,8) 90,5 797/881 (88,3, 92,2) 78,9 30/38 (63,7, 88,9) 81,0 17/21 (60,0, 92,3) 66,7 4/6 (30,0, 90,3) 87,9 131/149 (81,7, 92,2) 87,8 72/82 (79,0, 93,2) 84,8 28/33 (69,1, 93,3) 75,0 87/116 (66,4, 82,0) 77,6 52/67 (66,3, 85,9) 98,0 48/49 (89,3, 99,6) 85,8 582/678 (83,0, 88,3) 88,5 46/52 (77,0, 94,6) 92,3 36/39 (79,7, 97,3) 84,6 11/13 (57,8, 95,7) 89,1 197/221 (84,4, 92,6) 88,3 83/94 (80,2, 93,3) 47/47 (92,4, ) 93,5 201/215 (89,4, 96,1) 97,3 145/149 (93,3, 99,0) 45,0 9/20 (25,8, 65,8) 90,7 803/885 (88,6, 92,5) 76,9 30/39 (61,7, 87,4) 70,0 14/20 (48,1, 85,5) 66,7 4/6 (30,0, 90,3) 88,0 139/158 (82,0, 92,2) 85,4 70/82 (76,1, 91,4) 80,0 28/35 (64,1, 90,0) 78,5 95/121 (70,4, 84,9) 73,5 50/68 (62,0, 82,6) 96,0 48/50 (86,5, 98,9) 84,5 589/697 (81,6, 87,0) 12
Tabell 6 visar BV-prestanda uppdelad efter åldersgrupper. Alla åldersgrupper visade sensitiviteter från 89,9 % till 94,9 % förutom för patienter från 50 års ålder, vilka visade en sensitivitet på 68,8 % och 62,5 % för prover som tagits av klinikpersonal resp. självtagna prover. Specificiteten varierar från 84,2 % till 91,4 % för prover som tagits av klinikpersonal och från 83,0 % till 91,7 % för självtagna prover. Tabell 6: BV-prestandaresultat efter åldersgrupp Åldersgrupp 18 29 30 39 40 49 50 och äldre a KI: Konfidensintervall Tagna av klinisk personal Självtagna Sensitivitet Specificitet Sensitivitet Specificitet 90,3 84,2 91,2 83,0 531/588 341/405 539/591 347/418 (87,6, 92,4) (80,3, 87,4) (88,6, 93,2) (79,1, 86,3) 91,0 182/200 (86,2, 94,2) 94,8 73/77 (87,4, 98,0) 68,8 11/16 (44,4, 85,8) 86,7 130/150 (80,3, 91,2) 89,8 79/88 (81,7, 94,5) 91,4 32/35 (77,6, 97,0) 89,9 179/199 (85,0, 93,4) 94,9 75/79 (87,7, 98,0) 62,5 10/16 (38,6, 81,5) 85,0 130/153 (78,5, 89,8) 87,8 79/90 (79,4, 93,0) 91,7 33/36 (78,2, 97,1) Tabell 7 visar BV-prestanda uppdelad efter etnicitet. För prover som tagits av klinikpersonal varierar specificiteten från 79,3 % till 91,9 % och specificiteten varierar från 79,1 % till % i de mest prevalenta etniska grupperna i den kliniska studien. PPV varierar från 78,3 % till % och NPV varierar från 82,4 % till 93,3 %. För självtagna prover varierar specificiteten från 79,3 % till 92,5 % och specificiteten varierar från 77,0 % till 90,4 % i de mest prevalenta etniska grupperna. PPV varierar från 81,4 % till 88,3 % och NPV varierar från 80,6 % till 92,9 %. Etnicitet Asiatisk Svart eller afroamerikansk Spansk/ latinamerikansk Vit (inte spansk/ latinamerikansk) Övriga/blandad/ okänd Prevalens a 50,9 % 29/57 65,2 % 559/857 39,5 % 58/147 41,3 % 164/397 58,6 % 89/152 Tabell 7: BV-prestandaresultat uppdelad efter etnicitet Prov tagna av klinisk personal Självtagna prov Sensitivitet Specificitet PPV NPV Sensitivitet Specificitet PPV NPV 79,3 82,4 79,3 88,9 88,1 80,6 23/29 26/26 23/29 24/27 (61,6, 90,2) (87,1, ) (87,3, ) (70,8, 92,4) (61,6, 90,2) (71,9, 96,1) (73,3, 97,0) (68,3, 91,1) 91,9 79,1 89,2 84,0 92,5 77,0 88,3 84,6 502/546 223/282 506/547 224/291 (89,4, 93,9) (74,0, 83,4) (86,9, 91,3) (79,8, 87,6) (90,0, 94,4) (71,8, 81,4) (86,0, 90,4) (80,4, 88,2) 83,9 84,9 78,3 89,0 83,9 87,5 81,4 89,3 47/56 73/86 47/56 77/88 (72,2, 91,3) (75,8, 90,9) (69,1, 86,5) (82,5, 94,2) (72,2, 91,3) (79,0, 92,9) (72,2, 89,2) (82,9, 94,4) 90,7 92,0 88,9 93,3 90,2 90,4 86,9 92,9 146/161 207/225 148/164 207/229 (85,2, 94,3) (87,7, 94,9) (84,0, 92,8) (89,9, 96,0) (84,7, 93,9) (85,9, 93,6) (81,9, 91,0) (89,5, 95,7) 88,8 89,8 92,5 85,0 88,8 91,9 94,0 85,3 79/89 53/59 79/89 57/62 (80,5, 93,8) (79,5, 95,3) (86,0, 96,9) (76,7, 91,8) (80,5, 93,8) (82,5, 96,5) (87,8, 97,8) (77,0, 91,8) a Prevalens beräknades för prover med godkända referensmetodresultat. b KI: Konfidensintervall 13
Tabell 8 visar BV-prestanda uppdelad efter subgrupper relevanta för hälsotillstånd. För prover tagna av klinikpersonal varierar specificiteten från 80,4 % till 90,8 % och specificiteten varierar från 68,3 % till 93,8 % i subgrupperna. För självtagna prover varierar specificiteten från 80,0 % till 91,0 % och specificiteten varierar från 69,8 % till 90,9 % i subgrupperna. Tabell 8: BV-prestanda uppdelad efter subgrupper relevanta för hälsotillstånd Subgrupp Gravida patienter Patienter med östrogenbehandling Patienter som använder anti svampläkemedel Patienter med oskyddat samlag under de senaste 24 timmarna Patienter med återkommande symtom Patienter som tar oral antibiotika Patienter med menstruation Patienter utan menstruation a KI: Konfidensintervall Tagna av klinisk personal Självtagna Sensitivitet Specificitet Sensitivitet Specificitet 88,9 90,9 88,9 90,0 8/9 10/11 8/9 9/10 (56,5, 98,0) (62,3, 98,4) (56,5, 98,0) (59,6, 98,2) 86,4 57/66 (76,1, 92,7) 80,4 45/56 (68,2, 88,7) 89,7 61/68 (80,2, 94,9) 87,6 162/185 (82,0, 91,6) 82,3 79/96 (73,5, 88,6) 83,3 40/48 (70,4, 91,3) 90,8 754/830 (88,7, 92,6) 84,3 75/89 (75,3, 90,4) 93,8 75/80 (86,2, 97,3) 68,3 28/41 (53,0, 80,4) 87,1 155/178 (81,4, 91,2) 93,8 76/81 (86,4, 97,3) 86,5 32/37 (72,0, 94,1) 85,7 546/637 (82,8, 88,2) 91,0 61/67 (81,8, 95,8) 80,0 44/55 (67,6, 88,4) 89,6 60/67 (80,0, 94,8) 86,1 161/187 (80,4, 90,3) 84,4 81/96 (75,8, 90,3) 85,7 42/49 (73,3, 92,9) 91,0 758/833 (88,9, 92,8) 82,0 73/89 (72,8, 88,6) 90,9 80/88 (83,1, 95,3) 69,8 30/43 (54,9, 81,4) 85,9 159/185 (80,2, 90,2) 83,3 70/84 (73,9, 89,8) 86,8 33/38 (72,7, 94,2) 84,3 552/655 (81,3, 86,9) 14
Cgroup-prestandaresultat Cgroup (Candida albicans, Candida tropicalis, Candida parapsilosis och/eller Candida dubliniensis) per plats och övergripande prestandaresultat visas i Tabell 9. Känslighet och specificitet var 90,9 respektive 94,1 % för vaginala pinnprov som tagits av klinikpersonal och 92,2 respektive 91,9 % för självtagna vaginala pinnprover. För den testade populationen resulterade detta i ett positivt prediktivt värde (PPV) på 87,8 % och 84,1 % för prover som tagits av klinikpersonal respektive självtagna prover. NPV på 95,7 respektive 96,2 % erhölls för vaginalprover som tagits av klinikpersonal. Prevalensen för dessa Candida-species tillsammans var 31,6 % för patienter med godkända referensmetodresultat. Tabell 9: Cgroup-prestandaresultat efter provtagningstyp och provtagningsplats Plats 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Sammanlagt a KI: Konfidensintervall Tagna av klinisk personal Självtagna Sensitivitet Specificitet Sensitivitet Specificitet 96,4 97,0 98,2 93,1 53/55 98/101 54/55 95/102 (87,7, 99,0) (91,6, 99,0) (90,4, 99,7) (86,5, 96,6) 82,8 24/29 (65,5, 92,4) 61,5 8/13 (35,5, 82,3) 3/3 (43,9, ) 96,1 99/103 (90,4, 98,5) 91,9 57/62 (82,5, 96,5) 90,9 30/33 (76,4, 96,9) 95,4 104/109 (89,7, 98,0) 86,4 70/81 (77,3, 92,2) 70,0 14/20 (48,1, 85,5) 90,9 462/508 (88,1, 93,1) 93,9 62/66 (85,4, 97,6) 89,1 41/46 (77,0, 95,3) 17/17 (81,6, ) 94,4 268/284 (91,0, 96,5) 96,6 114/118 (91,6, 98,7) 93,9 46/49 (83,5, 97,9) 93,9 214/228 (90,0, 96,3) 89,1 131/147 (83,1, 93,2) 54/54 (93,4, ) 94,1 1 045/1 110 (92,6, 95,4) 93,1 27/29 (78,0, 98,1) 83,3 10/12 (55,2, 95,3) 3/3 (43,9, ) 91,3 95/104 (84,4, 95,4) 85,2 52/61 (74,3, 92,0) 91,2 31/34 (77,0, 97,0) 96,4 107/111 (91,1, 98,6) 90,0 72/80 (81,5, 94,8) 90,5 19/21 (71,1, 97,3) 92,2 470/510 (89,5, 94,2) 93,9 62/66 (85,4, 97,6) 91,3 42/46 (79,7, 96,6) 94,1 16/17 (73,0, 99,0) 90,9 259/285 (87,0, 93,7) 91,6 109/119 (85,2, 95,4) 87,8 43/49 (75,8, 94,3) 91,0 212/233 (86,6, 94,0) 93,9 138/147 (88,8, 96,7) 96,3 52/54 (87,5, 99,0) 91,9 1 028/1 118 (90,2, 93,4) 15