Laboration DNA. Datum:16/11 20/ Labgrupp: 11 Laboranter: Johanna Olsson & Kent Johansson
|
|
- Birgit Bergström
- för 7 år sedan
- Visningar:
Transkript
1 Laboration DNA Datum:16/11 20/ Labgrupp: 11 Laboranter: Johanna Olsson & Kent Johansson
2 Material och metod Materiallista hänvisas till labhandledning s.3 (BIMA15 ht 2015, Lab III: DNA.) Uppsamling och isolering av DNA Laborationen inleds med toppsning av laboranternas insida av kinder för att samla in celler som sedan DNA ska utvinnas från. Bomullstoppsen får lufttorka för att undvika nedbrytande enzymer från saliv i 2h, och därefter stoppas bommulsänden ner i 400 µl PBS. Anledningen till att bomullstoppsen fick stå i PBS var för att så många celler som möjligt skulle släppa från bomulstoppsen. 400µl lyseringsbuffert tillsätts för att spränga cellkärnorna, och 20µl QIAGEN Protease tillsätts för att bryta ned kärnmembran och proteiner. Blandningen puls mixas i 15s och inkuberas i 56 C i 10min. Anledningen till att provet inkuberas i just 56 C är för att QIAGEN Proteaset har störst reaktionsförmåga vid denna temperatur. 400 µl etanol tillsätts för att fälla ut DNA från lösningen som sedan pulsmixas innan 700µl av provet överförs i en QIAamp kolonn som centrifugeras 6000 x g i 1min. Vätskan i uppsamlingsröret hälls ut och resterande prov tillsätts. Provet centrifugeras åter i 1min och vätskan i uppsamlingsröret hälls ut. Syftet med dessa 2 centrifugeringar är att skilja DNA från lösningen på PBS, lyseringsbuffert AL, etanol och QIAGEN Protease. Detta för att DNA:et ska renas ytterligare genom att tvättas med tvättbuffert AW1. DNA:et tvättas med tvättbuffert AW1 genom att tvättbufferten hälls på och provet centrifugeras i 6000g i 1min. Vätskan i uppsamlingsröret hälls ut och tvättbuffert AW2 hälls på och provet centrifugeras i 3min för att bli av med all tvättbuffert som innehåller oönskade ämnen. QIAamp kolonnen placerades i ett rent 1,5ml eppendorfrör och 150µl elueringsbuffert tilsätts och inkuberas i 5min. Elueringsbufferten lösgör DNA:et från kiselmembranet i QIAamp kolonnen. Provet centrifugeras igen för att få ut DNA:et i eppendorfröret.
3 Spektrofotometri Spektrofotometri utförs för att undersöka hur rent det utvunna DNA:et är och hur koncentretrat det är. Därför görs två mätningar, en med 260nm och en med 280nm. Med 260nm mäts koncentrationen DNA och med 280nm mäts renheten på provet. Renheten beräknas genom att räkna ut absorbanskvoten, A bskvot = 260nm 280nm. DNA koncentrationen beräknas genom: A spädningsfaktorn, där spädningsfaktorn är 10. * 5 * Proven späds till 1:10 med TE buffert för att fylla ut kyvetterna till en volym av 1mL. Proven hålls som nämt i kyvetter som placeras i spektrofotometern. Ljus med längd av 260nm sänds genom provet och absorbansen mäts upp. Därefter sänds ljus med längd av 280nm genom provet och absorbansen mäts. PCR PCR(polymerase chain reaction) är en metod för att duplicera en utvald DNA region. Metoden använder sig av cykliska temperaturskiftningar för att styra processen, där varje komplett cykel ger en fördubbling av mängden DNA. Tillväxttakten är alltså exponentiell och därför kan stora mängder DNA produceras relativt snabbt från en liten startmängd. Detta görs genom att denaturera DNA:et, alltså sära strandsen vid en temperatur på C. Därefter tillsätter man en primer som binder in till en viss gensekvens för att ringa in vilken del av genen som ska dupliceras. Detta görs vid en temperatur på C. Därefter höjs temperaturen till den optimala arbetstemperaturen, vilken är 72 C, för polymeraset som skapar en ny kopierad DNA sträng. Temperaturen höjs åter till C för att upprepa processen tills önskad mängd DNA erhållits. I detta specifika fallet upprepades processen 35ggr. I första processen använde vi en temperatur på 96 C. I andra processen krävde våra primers, MA090 och MA025, 60 C. MA090 och MA025 avgränsar DNA regionen för en del av cystatin C genen.
4 I tre rör tillsätts en PCR blandning innehållande DNA, 5 µl polymeraset AmpliTaq Gold spädd 1:10 för att kopiera DNA, 1 µl var av primers MA090 och MA025 för att välja vilken region som skall kopieras, 2,5 µl vatten för att spä ut provet, 2µl dntp(deoxynucleotide mix) som utgör byggstenarna till det nya DNA:et, 1µl DMSOsom underlättar inbindningen av primers, 2,5µl PCR buffert spädd 1:10 för att ge optimalt ph förhållande för reaktionen. PCR bufferten innehåller även MgCl 2, som är en kofactor till polymeraset och underlättar för en fullständig denaturering av DNA. Utöver detta tillsätts 10µl DNA koncentrat i två av rören och 10µl vatten i det tredje röret. Provröret inehållande vatten agerar blank. Klyvning med restriktionsenzym För att avgöra vilken genotyp en person har kan PCR produkten klyvas med ett restriktionsenzym. Restriktionsemzymet försöker klyva på den sekvens som är utmärkande för ena genotypen men saknas i den andra. I detta fall används SacII och klyningsstället försvinner om basen G ersatts med A på den platsen. I fallet att SacII inte klyver på klyvningsstället påvisas att personen i fråga innehar B allelen. Om däremot SacII klyver på klyvningsstället är det en påvisning om att personen innehar A allelen. Det finns en möjlighet att vara heterocygot i detta fall. Det innebär att DNA biten klyvs delvis. Man kan genom gelelektrofores ta reda på om man är homocygot A, homocygot B eller heterocygot A/B. Ursprungssekvensen är 493bp och vid ett homozygot B resultat kommer ingen klyvning att ske och endast ett DNA band av storleken 493bp att kunna detekteras. Vid ett homozygot A resultat kommer en total klyvning att ske, vilket resulterar i två DNA band med storlekarna 350 respektive 143bp. Vid ett heterozygot resultat kommer tre band av storlek 493, 350 samt 143bp att återfinnas. Experimentellt blandades 12 µl PCR produkt, 1,5µl buffert C spädd 1:10 samt 1,5 µl enzym SacII i ett eppendorfrör. Blandningen inkuberades i 37 C över natten.
5 Gelelektrofores Gelelektrofores är en metod man kan använda för att separera DNA fragment med avseende på storlek. Tekniken utnyttjar det faktum att DNA är negativt laddat genom att sätta en spänning över ett medium. DNA fragmenten vandrar då genom mediet i riktning mot anoden med en hastighet beroende på deras storlek. Ju mindre fragment, desto snabbare vandrar det. Valet av medium avgörs av storleken på fragmenten. I detta fall används agaros, då det täcker storleken bp. Våra fragment förväntas kunna variera mellan bp i storlek. Ramen för gelgjutning sätts ihop. 1g agaros och 50mL TBE buffert hälldes i en E kolv och värmdes 2 x 30min i microvågsugn till lösningen blivit klar och ganska lättflytande. 5 µl SYBR safe DNA gel stain och den lösta gelen får en rödaktig färg. SYBR safe DNA gel stain tillsätts för att vid fotografering med UV eller blått ljus, kunna se var DNA banden befinner sig. Lösningen hälls i ramen och ramen täcks med aluminiumfolie då SYBR safe DNA gel stain är ljuskänslig. Ramen får stå och stelna i ca 30min. Efter 30min monteras ramen isär och en fast gel av agaros, TBE buffert och SYBR safe DNA gel stain har erhållits. Proven tillreds enligt tabell 1.
6 Prov nr Prov Prov volym H 2 O 6 x Ficoll 1 Markör 10µl 5µl 3µl 2 Blank 10µl 5µl 3µl 3 Kontroll Allt (15µl) 3µl 4 PCR produkt 1 10µl 5µl 3µl 5 Klyvning 1 Allt (15µl) 3µl 6 PCR produkt 2 10µl 5µl 3µl 7 Klyvning 2 Allt (15µl) 3µl Tabell 1 : Mängder till tillredning av prov för elektrofores på agarosgel. Ficoll lösning tillsätts till proven för att dels tynga ner proverna så de ej rinner ut i bufferten samt för att den ger en blå färg som vandrar lite snabbare än DNA banden och påvisar ungefär hur långt elektroforesen har gått. Gelen läggs i elektroforeskärlet och TBE buffert hälls på tills brunnarna täcks. Därefter adderas proverna till brunnarna med pipett. Proverna vandrar under 45minuter under 100 V spänning, och fotograferas därefter på UV ljusbord.
7 Resultat Resultaten för spektrofotometri återfinns i tabell 2. Kvoterna avviker något från optimalkvoten på 1,8 men är inte så pass avvikande att det skulle påvisa avsaknad av DNA. Koncentrationerna styrker även att det finns DNA i proven. Prov 260nm 280nm Kvot DNA ABS Johanna 0,0282 0,0180 1,567 14,1 konc( µg/ml) ABS Kent 0,0401 0,0210 1,910 20,05 Tabell 2: Resultat för spektrofotometriska mätningar av DNA koncentration och renlighet av prov vid 260nm och 280nm. Resultaten för gelelektrofores återfinns i bild 1. Det framgår tydligt ur klyvningsmönstret att båda laboranterna är av genotyp homozygot A. Bild 1: Prov fr. v. markör(1), blank(2), kontrol(3), PCR produkt 1(4), klyvning 1(5), PCR produkt 2(6), klyvning 2(7). Bilden är ett fotografi av agarosgelen efter elektroforesen. Gelen visar att både Johanna (klyvning 1) och Kent (klyvning 2) är homocygota A.
Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen
IFM/Kemi Linköpings Universitet September 2011/LGM Projektlaboration i genteknik Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen Innehållsförteckning Inledning... 3 Amplifiering
Läs merLAB 12. Preparation och analys av plasmid-dna från E.coli
Institutionen för biokemi och biofysik LAB 12 Preparation och analys av plasmid-dna från E.coli Basåret 2012 (finns på basårshemsida: www.kemi.su.se, välj Basår) INTRODUKTION I denna laboration ska vi
Läs mer/LGM. Amplifiering och analys av humant mitokondrie-dna med hjälp av PCR teknik och agarosgelelektrofores
2008-01-18/LGM Amplifiering och analys av humant mitokondrie-dna med hjälp av PCR teknik och agarosgelelektrofores Syfte: Med två olika DNA extraktionsmetoder försöka få fram tillräckligt mycket celler
Läs merLaboration v.40 Detektion av Legionella pneumophilia med nestad PCR
Avdelningen för kemi och biomedicin Karlstads universitet Laboration v.40 Detektion av Legionella pneumophilia med nestad PCR Frågeställning: Vattenlednings system med tillväxt av Legionella pneumophilia
Läs merDNA-labb / Plasmidlabb
Översikt DNA-labb Plasmidlabb Preparation och analys av -DNA från Escherichia coli Varför är vi här idag? Kort introduktion till biokemi och rekombinant DNA- teknologi Vad skall vi göra idag? Genomgång
Läs merPreparation och spektroskopisk karakterisering av Myoglobin
Datum på laborationen: 2010-11-16 Handledare: Alexander Engström Preparation och spektroskopisk karakterisering av Myoglobin Namn/Laborant: Jacob Blomkvist Medlaborant: Emmi Lindgren Antonia Alfredsson
Läs merLinköpings Universitet. Laboration i genteknik
IFM/Kemi Linköpings Universitet Maj 2008/LGM Laboration i genteknik Restriktionskarta av pcantab Restriktionsklyvning samt separation av DNA-fragment mha agarosgelelektrofores Material: pcantab (minst
Läs merTFKE32/TFKI09/9KEA21. Laboration i Genteknik
TFKE32/TFKI09/9KEA21 Laboration i Genteknik Denna laboration består av tre delar: A. Restriktionsklyvning av plasmiden pcantab samt konstruering av restriktionskarta. B. Preparation av plasmiden pcantab
Läs merPolymerase Chain Reaction
Polymerase Chain Reaction The Polymerase Chain Reaction Molekylärbiologisk metodik T3 ht 11 Märit Karls Kunskapsmål för detta avsnitt Från kursplan: Studenten skall kunna: förklara grundläggande principer
Läs merDNA-analyser: Introduktion till DNA-analys med PCR och gelelektrofores. Niklas Dahrén
DNA-analyser: Introduktion till DNA-analys med PCR och gelelektrofores Niklas Dahrén Användningsområden för DNA-analys Ta reda på vems DNA som har hittats på en brottsplats. Faderskapsanalys. Identifiera
Läs merInstitutionen för laboratoriemedicin Bilaga 2 Biomedicinska analytikerprogrammet Analytisk Kemi och Biokemisk metodik Ht 2010, Termin 3
Institutionen för laboratoriemedicin Bilaga 2 Biomedicinska analytikerprogrammet Analytisk Kemi och Biokemisk metodik Ht 2010, Termin 3 Laborationsdatum: 17 22 november 2010 Grupp: 2 Projekt: Rening och
Läs merLinköpings Universitet. Lägesspecifik Mutagenes av proteiner
IFM/Kemi Linköpings Universitet Augusti 2007/LGM Lägesspecifik Mutagenes av proteiner Lägesspecifik mutagenes Introduktion In vitro lägesspecifik mutagenes är en ovärderlig teknik för att t.ex. studera
Läs merGenkloning och PCR av tetracyklinresistensgen. från pacyc184 till puc19
Umeå Universitet Biomedicinska analytikerprogrammet Genkloning och PCR av tetracyklinresistensgen från pacyc184 till puc19 Årskull: Laborationsrapport i Molekylärbiologisk laboratoriemetodik, termin 3
Läs merJANINA WARENHOLT Molekylär patologi LUND
MPCR Multiplex Polymerase Chain Reaktion JANINA WARENHOLT Molekylär patologi LUND Vad är multiplex PCR Variant av PCR Möjliggör samtidigt att amplifiera (masskopiera) många målsekvenser i en enda reaktion.
Läs merTillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen
IFM/Kemi Linköpings Universitet September 2004/LGM Projektlaboration i genteknik Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen Innehållsförteckning Inledning... 3 Amplifiering
Läs merLaboratoriemetod för att manuellt rena DNA från ett prov på 0,5 ml
Laboratoriemetod för att manuellt rena DNA från ett prov på 0,5 ml För att rena genomiskt DNA från insamlingssatser tillhörande Oragene och ORAcollect -familjerna. Besök vår hemsida, www.dnagenotek.com,
Läs merBIMA15 HT Säkerhetsföreskrifter och kompletterande laborationer 1
BIMA15 HT 2015. Säkerhetsföreskrifter och kompletterande laborationer 1 Innehåll: 1. Säkerhet på labbet 2. Övning: spädning och spektrofotometer 3. Övning: att väga och ställa ph 4. Labrapport Laborationerna
Läs merKopiera DNA med hjälp av PCR-metoden. Niklas Dahrén
Kopiera DNA med hjälp av PCR-metoden Niklas Dahrén Först lite allmän kunskap om kromosomer, DNA, gener etc. Varje kromosom består av en lång DNAmolekyl som är lindad runt histoner En gen är en liten del
Läs merExpression, produktion och rening av Fatty acid binding protein (FABP) från ökenmyran Cataglyphis fortis
UNIVERSITETET I LINKÖPING Proteinkemi Kemiavdelningen 2011-02-04 Expression, produktion och rening av Fatty acid binding protein (FABP) från ökenmyran Cataglyphis fortis Produktion av FABP i E. coli bakterier
Läs merDiagnosticera sicklecellsanemi med DNA-analys. Niklas Dahrén
Diagnosticera sicklecellsanemi med DNA-analys Niklas Dahrén Sicklecellsanemi Erytrocyterna ser ut som skäror : Sjukdomen innebär a0 de röda blodkropparna (erytrocyterna) ser ut som skäror (eng. sickle)
Läs merDNA-ordlista. Amplifiera: Att kopiera och på så sätt mångfaldiga en DNA-sekvens med hjälp av PCR.
DNA-ordlista Alignment: Att placera DNA-sekvenser intill varandra. Detta gör att man kan urskilja var och hur mycket de skiljer sig från varandra, vilket är ett av de mest grundläggande sätten att analysera
Läs merMolekylärgenetiskt verktyg för diagnos av T- resp. B-cellslymfom i vävnad/paraffin Diagnostik av Lymfom. Olika ingångar för B-, resp. T-cellslymfom Metodiker: - Morfologi (Mikroskopi) - Immunohistokemi
Läs merCirkulerande cellfritt DNA
Cirkulerande cellfritt DNA - en introduktion Anne Ricksten Equalismöte 2016-11-14 Vad är cirkulerande fritt DNA (cfdna)? Extracellulärt DNA som finns i cirkulationen Fragmenterat DNA, medelstorlek på ca
Läs merGenkloning och PCR av tetracyklinresistensgen från pacyc184
Umeå Universitet Biomedicinska analytikerprogrammet Genkloning och PCR av tetracyklinresistensgen från pacyc184 Årskull: Laborationsrapport i molekylärbiologisk labmetodik, termin 4 Laborationsdatum: Inlämnad:
Läs merLAB 11 STUDIER AV TEMPERATUR OCH
Institutionen för biokemi och biofysik LAB 11 STUDIER AV TEMPERATUR OCH ph-beroende HOS ENZYMET AMYLAS Basåret 2011 (finns på basårshemsida: www.kemi.su.se, välj basår) Introduktion Enzymet α-amylas som
Läs merSammanställning över alternativ till etidiumbromid
1 (6) Sammanställning över alternativ till etidiumbromid I nedanstående tabeller har leverantörerna VWR, Invitrogen och Sigma-Aldrich lämnat uppgifter om produkter/n de saluför som alternativ till etidiumbromid.
Läs merDNA-analyser: Diagnosticera cystisk fibros och sicklecellanemi med DNA-analys. Niklas Dahrén
DNA-analyser: Diagnosticera cystisk fibros och sicklecellanemi med DNA-analys Niklas Dahrén Diagnosticera cystisk fibros med DNA-analys Cystisk fibros Vad innebär sjukdomen?: Sjukdomen innebär att de epitelceller
Läs merChromoQuant In vitro diagnostiskt test kit för analys av vanligen förekommande aneuploidier i kromosomerna 13, 18 och 21 samt i X och Y.
Bruksanvisning revision 6 (December 2008) ChromoQuant In vitro diagnostiskt test kit för analys av vanligen förekommande aneuploidier i kromosomerna 13, 18 och 21 samt i X och Y. Se förpackning Se förpackning
Läs merLinköpings Universitet. Lägesspecifik mutagenes av proteiner
IFM/Kemi Augusti2011/LGM Linköpings Universitet Lägesspecifik mutagenes av proteiner Figur1. Flödesschema över lägesspecifik mutagenes laboration. Lägesspecifik mutagenes Introduktion In vitro lägesspecifik
Läs merDiagnosticera cystisk fibros med DNA-analys. Niklas Dahrén
Diagnosticera cystisk fibros med DNA-analys Niklas Dahrén Cystisk fibros Vad innebär sjukdomen?: Sjukdomen innebär att de epitelceller som bekläder kroppens ytor (inkl. luftvägarna och matsmältningssystemet)
Läs merMolekylärbiologisk diagnostik av tarmparasiter
Molekylärbiologisk diagnostik av tarmparasiter Vad, När, Var och Hur? Jessica Ögren Länssjukhuset Ryhov Juni 2012 Molekylärbiologiska metoder De senaste två decennierna har molekylärbiologiska tekniker
Läs merDNA-LABORATION Southern blot / PCR
Författare: xxx, yyy, zzzz, nnn Grupp: NR, DFM1, termin??? Namn och OBS student e-mail för de medlemmar i gruppen som godkänt rapporten skall stå på framsidan. DNA-LABORATION Southern blot / PCR Stockholm
Läs merCSI - Katte DNA-fingerprinting Välkänt från polisarbete. Metoden föddes 1985 i England. Från början krävdes stora mängder DNA, men nu funkar även mycket små mängder. DNA-sekvens Användning Metoden
Läs merIsolering och rening av proteinet tiopurinmetyltransferas
Isolering och rening av proteinet tiopurinmetyltransferas Inledning och syfte Proteinet tiopurinmetyltransferas (TPMT) är ett humant enzym vars naturliga funktion ännu är okänd. Proteinet katalyserar överföring
Läs merMångfaldigande av mänskligt mitokondrie-dna
John Schollar och Andy Harrison NCBE, The University of Reading Mångfaldigande av mänskligt mitokondrie-dna Syfte Med denna procedur kan du mångfaldiga ett 460 baspar långt stycke DNA, som finns i kontrollregion
Läs merChromoQuant In vitro diagnostiskt test kit för analys av vanligen förekommande aneuploidier i kromosomerna 13, 18 och 21 samt i X och Y.
Bruksanvisning revision 7 (Februari 2009) ChromoQuant In vitro diagnostiskt test kit för analys av vanligen förekommande aneuploidier i kromosomerna 13, 18 och 21 samt i X och Y. Se förpackning Se förpackning
Läs merIntroduktion till laboration Biokemi 1
Introduktion till laboration Biokemi 1 Annica Blissing IFM Biochemistry Upplägg Laborationen sträcker sig över flera tillfällen Isolering, gelfiltrering, absorbansmätning och påvisande av sulfat Provberedning,
Läs merOBS! Under rubriken lärares namn på gröna omslaget ange istället skrivningsområde, ex Lösningsberedning. Totalt ska ni använda 9 gröna omslag.
BL1015, BMLV A, biomedicinsk laboratoriemetodik, 7,5hp. Prov 0101, H14. Kursansvarig: Siw Lunander Datum: 2014-11-22 Skrivtid: 4 timmar Totalpoäng: 51 p Lösningsberedning, 15 poäng Spektrofotometri, 5
Läs merBIMA12/13 ht 2012, Introduktionslab. 1. Teoretisk introduktion till laborativt arbete
BIMA12/13 ht 2012, Introduktionslab Innehåll: 1. Teoretisk introduktion till laborativt arbete 2. Praktisk labintroduktion 3. Labrapport 4. Bilaga: Kemiska hälsorisker i dagens laborativa arbete inom området
Läs merNUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra
NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra Monomererna som bygger upp nukleinsyrorna kallas NUKLEOTIDER. En nukleotid består av tre delar: en kvävebas
Läs merUttryck av kloratreduktas och kloritdismutas i Ideonella dechloratans odlade i aerob miljö med tillsatt klorat
Karlstads Universitet Fakulteten för teknik- och naturvetenskap Avdelningen för kemi Uttryck av kloratreduktas och kloritdismutas i Ideonella dechloratans odlade i aerob miljö med tillsatt klorat Laboranter
Läs merSyfte? Naturliga populationer i Trollsvattnen. Otoliter för åldersbestämning. Vävnadsprover för genetisk analys
Syfte? Inblick i vanlig genotypbestämningsmetod Allozymer har ofta använts som genetisk markör vid populationsgenetiska studier Studera genetisk variation inom och mellan populationer används inom bevarandebiologin
Läs merAnalys av nukleinsyra. Molekylärbiologisk metodik T3 ht 11 Märit Karls
Analys av nukleinsyra Molekylärbiologisk metodik T3 ht 11 Märit Karls Studietips Detta kompendium är INTE en lärobok. Det är inte meningen att man skall kunna läsa kompendiet och förstå innehållet. Ni
Läs merKoncentrationsbestämning med hjälp av spädningsteknik och spektrofotometri
Umeå universitet Biomedicinska Analytikerprogrammet Koncentrationsbestämning med hjälp av spädningsteknik och spektrofotometri Årskull: Laborationsrapport i Grundläggande laboratorievetenskap, termin 1
Läs merBestämning av fluoridhalt i tandkräm
Bestämning av fluoridhalt i tandkräm Laborationsrapport Ida Henriksson, Simon Pedersen, Carl-Johan Pålsson 2012-10-15 Analytisk Kemi, KAM010, HT 2012 Handledare Carina Olsson Institutionen för Kemi och
Läs merSverigefinal EUSO 2018: Biologi
Sverigefinal : A. Praktiskt arbete i grupp (1h) Det praktiska arbetet består av laborationerna 1 och 2. Diskutera och fundera tillsammans i gruppen. Fastna inte på någon uppgift för länge! Varje gruppmedlem
Läs merPreparation av hemoglobin med hjälp av gelfiltrering
Preparation av hemoglobin med hjälp av gelfiltrering Teori Vid preparation av ett protein används en rad olika metoder för att specifikt rena fram det önskade proteinet. I vårt fall ska hemoglobin från
Läs merGRÅÄRTERS BLOMNING - En studie i hur geografiskt ursprung påverkar den genetiska variationen
PROJEKTARBETESRAPPORT Läsåret 2010/2011 GRÅÄRTERS BLOMNING - En studie i hur geografiskt ursprung påverkar den genetiska variationen Projektgrupp: Louise Dahlin, Sanna Renius och Frida Ulander, NV3E Handledare:
Läs merCellcykel/Celldöd. Laborationsrapport 20/2-14. Basgrupp 1
Cellcykel/Celldöd Laborationsrapport 20/2-14 Basgrupp 1 Louise Andersson Alexander Barhebreus Pontus Boberg Amanda Dahl Simon Ingves Christina Larsson Kajsa Lethin Thea Wennman Syfte Se skillnad på hur
Läs merNamn: student x & student y Kurs: FAGBH0 Utförd: 090526
Laboration: Isolering av kinin Namn: student x & student y Kurs: FAGBH0 Utförd: 090526 Handledare: Patrik Holm 1 Innehållsförteckning Innehållsförteckning... 2 Sammanfattning... 3 Inledning... 3 Utförande...
Läs merSPEKTROFOTOMETRISK BESTÄMNING AV KOPPARHALTEN I MÄSSING
1 SPEKTROFOTOMETRISK BESTÄMNING AV KOPPARHALTEN I MÄSSING Spektrofotometri som analysmetod Spektrofotometrin är en fysikalisk-kemisk analysmetod där man mäter en fysikalisk storhet, ljusabsorbansen, i
Läs merRealtids-PCR. icycler BioRad, mikrotiterplattor. LightCycler Roche, kapillärer. ABI Prism 7000 Applied Biosystem mikrotiterplattor
Realtids-PCR icycler BioRad, mikrotiterplattor LightCycler Roche, kapillärer ABI Prism 7000 Applied Biosystem mikrotiterplattor Molekylärbiologisk metodik T3 ht 2011 Märit Karls Kunskapsmål för detta avsnitt
Läs merRening av proteiner: hur och varför?
Rening av proteiner: hur och varför? (och lite biologiska grunder) Joakim Norbeck! norbeck@chalmers.se! Grunder! Plasmider! Protein-rening! Detektion!!!!! Mest relevanta sidor i "Cell" är 510-518 & 532-552!
Läs merUTVECKLING AV EN PCR METOD FÖR IDENTIFIERING AV NYUPPTÄCKTA MJÖLKSYRABAKTERIER
Hälsa och samhälle UTVECKLING AV EN PCR METOD FÖR IDENTIFIERING AV NYUPPTÄCKTA MJÖLKSYRABAKTERIER MARIA CELANDER Examensarbete Biomedicinsk Laboratorievetenskap Malmö högskola 15 hp Hälsa och samhälle
Läs merBestämning av totalkolesterol, HDL-kolesterol samt triglycerider i blodet
Bestämning av totalkolesterol, HDL-kolesterol samt triglycerider i blodet Biomedicinsk vetenskap II för receptarier VT 2011 maria.liljeqvist@molbiol.umu.se sofie.ekestubbe@molbiol.umu.se christopher.andersson@molbiol.umu.se
Läs merSyra/bas och Energi Kurskod 1BA001
Institutionen för Laboratoriemedicin Biomedicinsk analytikerutbildningen Termin 2 Syra/bas och Energi Kurskod 1BA001 Laboration: Reduktion av pyruvat med NADH Ulla Andersson Ulla.K.Andersson@ki.se 1 Arbetsplan
Läs merLaboration om cellskada och manipulering av cellers känslighet för stress
Laboration om cellskada och manipulering av cellers känslighet för stress Laborationen kommer att utföras av en basgrupp och pågå under fyra dagar. Två personer ur basgruppen närvarar vid varje tillfälle
Läs merC V C. Bruksanvisning till Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01. Revision 3. Juli 2014
Dot159v1 Instructions for Use for Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01 Sidan 1 av 8 Bruksanvisning till Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01 Revision 3 Juli 2014 Dot159v1 Instructions for Use
Läs merRAPD-PCR för storskalig typning av Bacillus cereus
Rapport nr 4988 2000-12-15 RAPD-PCR för storskalig typning av Bacillus cereus En metod att skilja olika stammar åt med genetiska fingeravtryck Birgitta Svensson, Kerstin Ekelund, Anders Christiansson,
Läs merSeparation av plasmaproteiner med elektrofores, HYDRAGEL PROTEIN(E) K20
Umeå Universitet Biomedicinska analytikerprogrammet Separation av plasmaproteiner med elektrofores, HYDRAGEL PROTEIN(E) K20 Årskull: Laborationsrapport i Klinisk laboratoriemetodik 1, termin 4 Laborationsdatum:
Läs merSeparation av plastidfärgämnen
Separation av plastidfärgämnen Hos fotoautotrofer fångas energin i ljuset upp av speciella pigment-proteinkomplex. De pigment som framförallt absorberar ljuskvanta till fotosyntesen är klorofyllerna. Dessutom
Läs merLaboration Enzymer. Labföreläsning. Introduktion, enzymer. Kinetik. Första ordningens kinetik. Michaelis-Menten-kinetik
Labföreläsning Maria Svärd maria.svard@ki.se Molekylär Strukturbiologi, MBB, KI Introduktion, er och kinetik Första ordningens kinetik Michaelis-Menten-kinetik K M, v max och k cat Lineweaver-Burk-plot
Läs merNO-kemi 2017 Utvinning av ett bakteriedödande protein från ägg - en enkel och billig laboration med jonbyteskromatografi
NO-kemi 2017 Utvinning av ett bakteriedödande protein från ägg - en enkel och billig laboration med jonbyteskromatografi Rickard Hedman 2017 augusti 9 Introduktion Visste du att äggvita, saliv och tårvätska
Läs merASFALTBELÄGGNING OCH -MASSA
Sid 1 (5) ASFALTBELÄGGNING OCH -MASSA Återvinning av bindemedel från asfaltmassor, utförd med rotationsindunstare. Recovery of binder from bituminous mixes: procedure with rotary evaporator. 1. ORIENTERING
Läs merKromatografi. Kromatografi
Kromatografi Tekniker för att Rena Ex. inför vidare studier, terapeutisk användning etc. Fraktionera Ex. inför vidare analys, Depletion av HAPs från plasma inför 2D-gel (max-kapacitet
Läs merDatum 131018 Skrivtid 4 tim. Charlotte Sahlberg Bang
Örebro universitet Institutionen för hälsovetenskap och medicin Enheten klinisk medicin Tentamen Kursens namn: BMLV A, Biomedicinsk laboratoriemetodik Kurskod: BL 1015 Kursansvarig: Siw Lunander Datum
Läs merIsolering av Eugenol
Isolering av Eugenol Läkemedelskemi 2011-04-07 Författare: Student x Student y Handledare: Z Karlstads Universitet Innehållsförteckning Sammanfattning... 3 Inledning... 4 Utförande... 5 Resultat och diskussion...
Läs merCellodling Laborationskompendium
Cellodling Laborationskompendium Sammanställd av Birgitta Sundström Material och lösningar: Odlingsmedium 50 ml Falconrör (blå skruvkort) Finns färdigt. DMEM:F12 1:1 med tillsats av 10% (v/v) fetalt kalvserum
Läs merDetektion av Borrelia burgdorferi IgG. med hjälp av ELISA
Umeå Universitet Biomedicinska analytikerprogrammet Detektion av Borrelia burgdorferi IgG med hjälp av ELISA Årskull: Laborationsrapport i immunologi termin 3 Laborationsdatum: Inlämnad: Godkänd: Handledare:
Läs merÖvningsuppgifter Syror och baser
Övningsuppgifter Syror och baser Litterarum radices amarae, fructus dulces 1. Beräkna ph i en lösning med vätejonkoncentrationen: a) 0,036 mol/dm 3 b) 2 10-5 mol/dm 3 c) 2,0 mol/dm 3 d) 2,35 10-8 mol/dm
Läs merLagerrensning! Upp till 70% rabatt!
Chemagen Prepito Halvautomatiserad extraktion. Oslagbar renhet. Kit för kombinerat DNA och RNA. För humant DNA/RNA, bakterier, virus mm. Ilumina Eco QPCR-instrument med dator QPCR till PCR-maskinspris!
Läs merTentamen i Molekylär Cellbiologi
Tentamen i Molekylär Cellbiologi 1 juni 2007 MCB 13p Biomedicinarprogrammet Märk alla papper med din tentamenskod. Extrablad ska dessutom märkas med MCB och frågans nummer. Frågorna skall besvaras på frågebladet.
Läs merDNA-ordlista. 16S: Egentligen 16S rrna. Mitokondriell gen med förhållandevis liten variation som ofta används för att artbestämma DNA från däggdjur.
DNA-ordlista 16S: Egentligen 16S rrna. Mitokondriell gen med förhållandevis liten variation som ofta används för att artbestämma DNA från däggdjur. Alignment: Att placera DNA-sekvenser intill varandra.
Läs merKromatografi. Idag
Lärarfortbildning 2019-05-07 Marie Danielsson 08 790 97 32 marie.danielsson@vetenskapenshus.se Idag Inledning - kromatografi Extraktion av växtfärgämnen Pappers- och tunnskiktskromatografi Fika Kolonnkromatografi
Läs merTentamen i Cellbiologi med Biokemi
Del 1, Del 2, Totalt Tentamen i Cellbiologi med Biokemi 4 juni 2010 CMB 22,5 hsp Biomedicinarprogrammet U / G / VG Märk alla papper med din tentamenskod. Extrablad ska dessutom märkas med datum, CMB och
Läs merOBS! Under rubriken lärares namn på gröna omslaget ange istället skrivningsområde.
BMLV A, biomedicinsk laboratoriemetodik, 7,5hp. Kurskod: BL1015, HK 2014 Kursansvarig: Siw Lunander Datum: 2014-10-17 Skrivtid: 4 timmar Totalpoäng: 54 p Lösningsberedning, 15 poäng Spektrofotometri, 6
Läs merAbsorbansmätningar XXXXXX och YYYYYY
Umeå Universitet Biomedicinska analytikerprogrammet Absorbansmätningar XXXXXX och YYYYYY Årskull: Laborationsrapport Laborationsdatum: Inlämnad Godkänd Handledare: Moment I: Ljusabsorption i kyvetter 1)
Läs merLaborationshandledning, Njurfunktion Termin 3, läkarprogrammet
Laborationshandledning, Njurfunktion Termin 3, läkarprogrammet Välkomna till dagens laboration i Klinisk Kemi, som i huvudsak kommer att beröra analyser som syftar till att bedöma njurarnas tillstånd.
Läs merLaborationshandledning, Njurfunktion Termin 3, läkarprogrammet
Laborationshandledning, Njurfunktion Termin 3, läkarprogrammet Välkomna till dagens laboration i Klinisk Kemi, som i huvudsak kommer att beröra analyser som syftar till att bedöma njurarnas tillstånd.
Läs merIDENTIFIERING AV 13 NYA MJÖLKSYRA- BAKTERIER MED DHPLC
Hälsa och samhälle IDENTIFIERING AV 13 NYA MJÖLKSYRA- BAKTERIER MED DHPLC EXAMENSARBETE I BIOMEDICINSK LABORATORIEVETENSKAP 15 HP RUZICA LIVAJA Handledare: Alejandra Vàsquez, Tobias C. Olofsson Examensarbete
Läs merProjektarbete 100p Carl Jaede 2010-05-07
[Type text] [Type text] [Type text] Abstract This report describes the procedure and result of a laboratory experiment where GFP has been cloned inside living bacteria. It also contains a large theoretical
Läs merFotoelektriska effekten
Fotoelektriska effekten Bakgrund År 1887 upptäckte den tyska fysikern Heinrich Hertz att då man belyser ytan på en metallkropp med ultraviolett ljus avges elektriska laddningar från ytan. Noggrannare undersökningar
Läs merInstuderingsfrågor avsnitten Molekylär genetik och Rekombinant DNA tekniker, MCB
Instuderingsfrågor avsnitten Molekylär genetik och Rekombinant DNA tekniker, MCB Molekylärgenetikdelen 1. Vad är DNA? 2. Vad heter byggstenarna i DNA? 3. Vad är RNA? 4. Vad är en bas, nukleosid, nukleotid
Läs merElektron-absorbtionspektroskopi för biomolekyler i UV-VIS-området
Elektron-absorbtionspektroskopi för biomolekyler i UV-VIS-området Principer Koncentrationsmätning Detektion Kromoforer, kolorimetriska assays DNA Komparativ analys Proteinrening Jonbindning Peptidgruppens
Läs merGlukosdehydrogenas. Laktos och Galaktos. Enzymatisk bestämning i livsmedel
Glukosdehydrogenas Laktos och Ga. Enzymatisk bestämning i livsmedel Innehållsförteckning 1. Ändamål och Användningsområde...1 2. Princip...1 3. Reagens...1 3.1 Citratbuffert...1 3.2 NAD-Citratbuffert...2
Läs merCellskada och manipulering av cellers känslighet för stress
Cellskada och manipulering av cellers känslighet för stress Bakgrund En cellskada kan uppstå på många olika sätt, till exempel exponering för kemikalier, värme, kyla, hypoxi, ischemi eller strålning. Hur
Läs merSTOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING
STOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING TENTAMEN Kurs: Prokaryot cell- och molekylärbiologi (PCMB) Datum: 2007-06-19 kl. 10-13 Visat betald terminsräkning och legitimation _
Läs merSelektiv och katalytisk hydrogenering av 4-vinylcyklohexen
Selektiv och katalytisk hydrogenering av 4-vinylcyklohexen Simon Pedersen 27 februari 2012 Chalmers Tekniska Högskola Institutionen för Kemi och Bioteknik Oorganisk och Organisk Kemi Handledare Andreas
Läs merHLA SSP Kits. Kit klart för användning med SSP reagens för DNA baserad HLA typning. [IVD] For In Vitro Diagnostic Use
[SE] HLA SSP Kits Kit klart för användning med SSP reagens för DNA baserad HLA typning [IVD] For In Vitro Diagnostic Use HLA-A SSP [REF] 826 201 0197 HLA-B SSP [REF] 826 206 0197 HLA-C SSP [REF] 826 212
Läs merBestäm koncentrationen av ett ämne med spektrofotometri. Niklas Dahrén
Bestäm koncentrationen av ett ämne med spektrofotometri Niklas Dahrén Spektrofotometri Syftet med spektrofotometri är att mäta koncentrationen av ett ämne i en lösning. Det sker genom att vi bestrålar
Läs merDUGGA Molekylärbiologi T2 / VT p (G = 25 p)
KORTSVARSFRÅGOR 1. Restriktionsenzymet BamHI klyver sekvensen 5 -G*GATCC-3 och lämnar 4 basers 5' överhäng. Rita upp det längsta DNA-fragmentet som bildas efter klyvning av nedanstående given sekvens med
Läs merUndersökning av förekomst av okända virus hos svenska fjällrävar med encefalit
Undersökning av förekomst av okända virus hos svenska fjällrävar med encefalit Helena Thörnvall Handledare: Mikael Berg Inst. för Biomedicin och Veterinär Folkhälsovetenskap, avdelningen för Parasitologi
Läs merUndersökning av växternas evolution
134567 Andy Harrison, John Schollar and Dean Madden NCBE, The University of Reading, Earley Gate, Reading, RG6 6BZ, UK Undersökning av växternas evolution Mångfaldigande av kloroplast-dna med hjälp av
Läs merRiskbedömning Coomassie-infärgning av gel
Sida 1( 5) Riskbedömning Coomassie-infärgning av gel Utförd 2014-09-15 Av Charlotte Welinder på Bo Baldetorps grupp. Andrad senast 2014-09-19 Av Lars Ekblad Slutlig bedömning av hela metoden 1. Acceptabel
Läs merCELLDELNING 1 MITOS EUKARYOT CELLDELNING. Eukaryot celldelning. 1. cellcykeln 2. mitos 3. cytokinesis
CELLDELNING 1 MITOS EUKARYOT CELLDELNING 1. cellcykeln 2. mitos 3. cytokinesis Eukaryot celldelning självreplikering celldelning ett villkor för liv skapa liv, växa i storlek, eller ersätta döda celler
Läs merCentrum för genetisk identifiering Fisk, kräftor och musslor som edna metod och fältprover
RAPPORT Datum Dnr 1(11) 2016-12-31 4.1-33-2015, 4.1-728-2015 (NRM). SLU.aqua.2015.5.1-188 (SLU) Centrum för genetisk identifiering Fisk, kräftor och musslor som edna metod och fältprover Postadress: Besöksadress:
Läs merÖrebro universitet Institutionen för hälsovetenskap och medicin Enheten klinisk medicin. Datum 131123 Skrivtid 240 minuter. Charlotte Sahlberg Bang
Örebro universitet Institutionen för hälsovetenskap och medicin Enheten klinisk medicin Tentamen Kursens namn: BMLV A, Biomedicinsk laboratoriemetodik Kurskod: BL 1015 (BL1001) Kursansvarig: Siw Lunander
Läs merKloning och rening av GFP
Kloning och rening av GFP Ida Harila Projektarbete 100p Luleå 2012 Handledare: Marcus Wallgren Sammanfattning Upptäckten och användningsområden för det grönt fluorescerande proteinet, GFP har visat ha
Läs merImmunologi. Laboration; Epstein Barr Virus (EBV) serologi. Oxblodshemolysat test (OCH) Epstein Barr Virus ELISA (EBNA)
Immunologi Laboration; Epstein Barr Virus (EBV) serologi. Oxblodshemolysat test (OCH) Epstein Barr Virus ELISA (EBNA) 1 OCH Referenser. Jawas et al: Medical Microbiology. Delves, Martin, Burton and Roitt:
Läs merCellskada och manipulering av cellers känslighet för stress
Linköpings universitet 2014-02-19 Cellskada och manipulering av cellers känslighet för stress Henrik Lindholm, Ebba Bagge, Mariel Nehme, Moa Bydén, Julia Dahlgren Solberg, Felicia André, Mustafa Al-Attar,
Läs mer