Genteknik i sjukvården

Transkript

1 Genteknik i sjukvården Nätverket för medicinsk etik i västra Sverige Seminarium Anna Öfverholm Överläkare, och Patologi, Sahlgrenska Universitetssjukhuset

2 Genetik och Genomik WHO definitions of genetics and genomics Genetics is the study of heredity.1 Genomics is defined as the study of genes and their functions, and related techniques. 1,2 The main difference between genomics and genetics is that genetics scrutinizes the functioning and composition of the single gene where as genomics addresses all genes and their inter relationships in order to identify their combined influence on the growth and development of the organism. National Institute of Health, USA, definition of genomics NIH, USA, defines genomic medicine as "an emerging medical discipline that involves using genomic information about an individual as part of their clinical care (e.g., for diagnostic or therapeutic decision-making) and the health outcomes and policy implications of that clinical use."

3 Patienter med sjukdom: -Ovanliga genetiska barnsjukdomar -Ovanliga genetiska diagnoser inom alla dicipliner; kvinnosjukvård, neurologi, ögon, öron-näsa-hals, internmedicin -Mer vanligt: ärftlig cancer, ärftlig hjärtsjukdom. Friska individer och familjer: - Vägledning, information, om genetisk sjukdom i familjen - Fastställande av måttlig eller hög risk att bli sjuk, möjlighet till genetiskt test - Hälso- och riskkontroller genom sjukvården. - Önskemål om fosterdiagnostik för ärftlig sjukdom

4 Cancersjukvård Terapistyrande välja läkemedel Behandlingsvägledande operation eller läkemedel Nya diagnoser och underdiagnoser Bred genetisk analys: högpenetranta, medelpenetranta anlag

5

6 Ca gener (en uppsättning i ägget och en uppsättning i spermien)

7 DNA är en kod, styr uppbyggnaden av proteinerna Proteiner är kroppens byggstenar -ex Muskelcell, enzym, nervsignaler, fosterutveckling

8

9

10 gener i ägget, gener i spermien, som tillsammans blev just du Ditt eget nationalbibliotek En gen är några tusen bokstäver lång: TTAGCGCGCTAGGTGA`TTTTTGCGCACTAAAAA En mutation, en sjukdomsorsakande variant, ett arvsanlag: Ett stavfel Ett textstycke som saknas Tre böcker i bokhyllan saknas

11 Filteringsträd 1) Enbart gener inkluderade i OMIM_morbid (ca3300 gener) kvalitetsfiltering 2) Populationsfiltrering Varianter som förekommer i >5% polymorfier Inkluderat i HGMD Inkluderat i ClinVardatbaseb som likely pathogenic eller pathogenic

12 Hur avgörs om en genetisk variant är sjukdomsorsakande? Sjukdomsorsakande Sannolikt sjukdomsorsakande Oklar variant Sannolikt normal variant Normal variant

13 Ethnic variation local polymorphism - founder mutations private variations Databaser av normal variation ju fler individer från hela världen analyseras, ju bättre kunskap om den normala variationen i befolkningen

14

15 Diagnostic odyssey

16 Yttre faktorer, miljöfaktorer, slumpen En enda gen motsvarar en sjukdom eller ett tillstånd Många genetiska förändringar i ett mönster

17

18

19 TACK!

20

21 Ca 5000 monogena sjukdomar: Exempel ovanliga diagnoser hos oss (2015) Mb Osler, hypertrof kardiomyopati, långt QT-syndrom, Fragilt X, Marfan syndrom, Gorlin syndrom, Lynch syndrom, Joubert syndrom, Von Hippel Lindau, Meretojas syndrom, Ataxia telangiektasia, Russel Silver syndrom, Alports sjukdom, Phelan McDermid syndrom, Lebers hereditära opticusneuropati (LHON), 16p13.11 mikrodeletion, Familjär amyloidos (FAP), DFNB1-mutation (hörselnedsättning), osteogenesis imperfecta, 22q11 deletion, Goltz syndrom, Leigh syndrom, 16p11.2 mikrodeletion, Creutzfeld Jacobs sjukdom, Huntington, Familjär adenomatos polypos, Ärftligt malignt melanom (CDKN2A), adrenoleukodystrofi, Duchennes muskeldystrofi, Wilsons sjukdom, 16p12.1 mikrodeletion, Ohdos syndrom, misstänkt Goldenhar, Williams syndrom, tuberös skleros, mosaik trippel X/monosomi, cerebellär ataxi, childhood ataxi with central nervous system hypomyelination, epidermalt nevus, kongenital adrenal hyperplasi, FAP, Birt-Hogg-Dubé, Dystrofia myotonica 1, AZF-deletion, trippel X, SCA 2, Beckwith-Wiedemann, balanserad translokation, Apert syndrom, myotonia congenita, andra ickedystrofa myotonier, Hereditär Spastisk Parapares, Limb girdle musk dystrofi, mitokondriell sjd (flera former/familjära), Charcot Marie Tooth, BH4 brist, CADASIL, Welander distal myopati, Fanconi syndrom, trisomi 9, Hunter, Beta thalassemi, Prader Willi, Succinyldehydrogenasbrist och ärftliga feokromocytom/paragangliom, NIPT vid x-bunden sjd, oklart syndrom, Meckel Gruber syndrom, Alport, Cardiofaciocutant syndrom, Retinitis pigmentosa, Retinoblastom (unilateralt), incontinentia pigmenti, Friedreich ataxi, okulokutan albinism, Kjers hereditära opticus atrofi, multipla hereditära exostoser, HUPRA syndrom, generalised arterial calcification of infancy, B6-beroende kramper, Limb-girdle muskeldystrofi typ 2I, Medfödd neutropeni med myelofibros, Dystrofisk epidermolysis bullosa, SMA, Gaucher sjd,, NF1, Metakromatisk leukodystrofi, cystisk fibros,, Mb Stargardt, X- bunden juvenile Retinoschisis, X-bunden Opitz BBB, 22q11 (CATCH22), Angelman sd, 16p11 mikrodel, 17p13 mikrodel, Cat-Eye syndrome/ partiell trisomi 22, triploidi vid gravidtet, monosomi 18p, Wolf-Hirschorn syndom vid obalanserad translokation, familjär inversion 1q med 2 barn med obalans och syndrom, trisomi 20 i mosaikform hos foster, 4q32 mikrodeletion, Marfan/Marfan-like/EDS typ IV, familjär isolerad Hirschsprung sjd, hyperglycinemi med fulminant pulmonell hypertension, SOX2-relaterad septooptisk dysplasi med bilateral anoftalmi, Schintzel-Giedion syndrom, Usher sd, Cri du Chat, OFD typ 11, Albinism, EDS typ 4, FSHD, LGMD, Sotos syndrom, Epilepsi med mutationer i KCNQ2, Angelman, 22q11, bilateral ptos, Loose Anagen syndrome, homocysteinuri, adrenoleukodystroi, 16p11.5 deletion.