Fisk, kräftor & musslor som edna Patrik Bohman, SLU Aqua Sötvattenslaboratoriet
|
|
|
- Hugo Ivarsson
- för 5 år sedan
- Visningar:
Transkript
1 Fisk, kräftor & musslor som edna Patrik Bohman, SLU Aqua Sötvattenslaboratoriet
2 edna projekt ( ) Fisk, musslor och kräftor som edna Frågeställningar: 1. Kan vi upptäcka arter DNA kvalitativt (JA/NEJ)? 2. Kan vi utveckla en generell edna-metodik (snabb/enkel/kostnadseffektiv)? 3. Kan DNA-metodik ersätta/komplettera trad MÖ?
3 edna projekt ( ) 2014 Hoppfullt fältarbete! Litteratursammanställning Fältarbete (4 sjöar & 2 vdrag) Workshop med forskare och myndigheter Resultat: JA, vi kan detektera fisk & musslor i naturvatten! Låg DNA-koncentration i naturvatten (dålig träffbild) Metodik måste revideras = icke publicerat är intressant! Nyfunnen kunskap om processen (provtagning sekvensering)
4 edna projekt Back to basics! Kontrollerat akvarieexperiment Noggranna tester av edna-protokoll Fältarbete (4 sjöar & 2 vdrag) Resultat: Experiment: alla målarter identifierades (god träffbild) Metodik reviderades helt (från fält till labb) Bättre hantering av felkällor i fält (mindre kontamination) Organismgrupperna får olika protokoll
5 edna projekt Finjustering av rutiner Fältstudie: Några få målarter väljs ut Justering av edna-protokoll beroende på organismgrupp ny provtagningsutrustning (mindre kontamination) 2017: Rapport (metodik och genomförbarhet) Resultat: Förslag på generella principer Aqua Reports om edna
6 Aqua Reports 2017 edna Fisk, musslor och kräftor som edna Resultat från projektet - Vad har fungerat och inte - Ställ i kontrast till dagens forskning - Litteratursammanställning Anpassa edna till MÖ - Var befinner vi oss idag - Vad är möjligt med edna - Kvarstående forskningsområden
7 Aqua Reports 2017 edna Transparens av edna-protokoll Behov att jämföra studier: Review över 60 publicerade artiklar (baserat på Adrian-Kalchhauser): 1. Syfte: Målarter; miljö 2. Förarbete (lab): markörområde; primer design; specificitet (in silico/in vitro/in situ) 3. Provtagning: design; volym; typ av prov; antal replikat; poolning 4. Förvaring: Typ av lagring; temp; tid 5. Fällning: EtOH/NaOAc volym; centrifugering (hastighet, tid); temp 6. Filtrering: filtreringsmetod; material; porstorlek; förvaring 7. Lysis buffert: typ av buffert; vol; ProtK; skakning/centrifug; förvaring 8. Extraktion: fabrikat (kit); resusp buffert; volym 9. PCR: metod; system; PCR volym; provvolym 10. Sekvensering: metod; antal läsningar 11. Efterbehandling: typ av statistik; modeller (ex artdistribution); 12. Hantering av felkällor: Referens; provtagning; laboratorium; neg/pos kontroll Adrian-Kalchhauser, I. & Burkhardt-Holm, P. (2016) An edna assay to monitor a globally invasive fish species from flowing freshwater
8 Provtagning (design) Frågeställning (en art/flera arter ) Art/plats distributions modellering Fundering: Hur uppträder DNA i naturen? Bild: Barnes, MA. & Turner, CR. (2016) The ecology of environmental DNA for conservation genetics
9 Provtagning Områdets storlek Arternas ekologi (vilka arter) Vilket vatten Tid på säsongen = VAR/NÄR/HUR?
10 Aqua Reports 2017 edna Ändrade rutiner & alt metoder Det finns behov av att hämta vatten på olika djup, för punktinsamling eller kontinuerlig insamling.
11 Aqua Reports 2017 edna Transparens av edna-protokoll Behov att jämföra studier: Review över 60 publicerade artiklar (baserat på Adrian-Kalchhauser): 1. Syfte: Målarter; miljö 2. Förarbete: Markörområde; primer design; specificitet (in silico/in vitro/in situ) 3. Provtagning: volym; typ av prov; antal replikat; poolning 4. Förvaring: Typ av lagring; temp; tid 5. Fällning: EtOH/NaOAc volym; centrifugering (hastighet, tid); temp 6. Filtrering: filtreringsmetod; material; porstorlek; förvaring 7. Lysis buffert: typ av buffert; vol; ProtK; skakning/centrifug; förvaring 8. Extraktion: fabrikat (kit); resusp buffert; volym 9. PCR: metod; system; PCR volym; provvolym 10. Sekvensering: metod; antal läsningar 11. Efterbehandling: typ av statistik; modeller (ex artdistribution); 12. Hantering av felkällor: Referens; provtagning; laboratorium; neg/pos kontroll Adrian-Kalchhauser, I. & Burkhardt-Holm, P. (2016) An edna assay to monitor a globally invasive fish species from flowing freshwater
12 Direkt-filtrering: Aqua Reports 2017 edna Ändrade rutiner & alt metoder Punktinsamling (olika djup) Kontinuerlig insamling (båt/strand & ROV) Information: Smith-root.com, Cole-Palmer portable sampler, NINA (ROV)
13 Aqua Reports 2017 edna Filterkapslar i fält Sterivex Merck Millipore (mindre kapslar för ca 1L) + Bra för mindre volymer + Kloggar lätt igen >3dL + Billig + Specifikt extraktionskit (Millipore) + Flera studier har använt filtret Envirochek Pall Life Sciences (större kapslar för poolade prover upp till 50L) + Bra för större volymer >20L + OK för poolning av prover + Dyr + Lätt att extrahera DNA Efter W.W. Woessner (2007) Building a compact, low-cost, and portable peristaltic sampling pump
14 Flödesdiagram edna-metodik Aqua Reports 2017:XX: edna i en droppe vatten
15 Aqua Reports 2017 edna Transparens av edna-protokoll Behov att jämföra studier: - Stora olikheter i hela processen - Saknas ofta detaljer och transparens i studierna - Generalisera delar i processen (vilka är noderna)? - Olika organismer ger olika protokoll Påverkar träffbilden & mängden påträffad målarts-dna
16 Aqua Reports 2017 edna Transparens av edna-protokoll Flera grupper, bl.a. inom EU arbetar idag med att ta fram gemensamma strategier ibol/fish-bol (plocka fram markörbibliotek för världens fiskarter CO1 ) COST DNAqua-Net (hitta noderna i edna-metodiken & generalisera/standardisera) EDNA Barcodinggrupp: 27-28/11 (UMBLA /SLU barcoding laboratory) Universitet, myndigheter, utförare och privata aktörer behöver samarbeta!
17 Aqua Report 2017 edna Det finns en del obesvarade frågor ålder kön storleksfördelning antal beståndens status Kvantifiering? Ursprung (vilka celler)? Hur mycket (relativt inom ett prov OK)? Hur nära? Hur gammalt? Ny metodik Ännu i utvecklingsfasen (standardiserade protokoll saknas) Utveckling av nya markörer (som ökar precisionen än mer) Lägg stor fokus vid provhantering och kontamination Labb-analyserna är omfattande (god infrastruktur) Hantera stora mängder data (sekvensering)
18 TACK! edna för fisk, kräftor och musslor:
edna i en droppe vatten
edna i en droppe vatten Patrik Bohman SLU Institutionen för akvatiska resurser Sötvattenslaboratoriet Källa: https://www.slu.se/institutioner/akvatiska-resurser/sok-publikation/aqua_reports/ edna projekt
Foton; Creative Commons, Jacob Berggren, Naturforskarna. edna paradigmskifte för inventering av akvatisk biologisk mångfald
Foton; Creative Commons, Jacob Berggren, Naturforskarna edna paradigmskifte för inventering av akvatisk biologisk mångfald Biologisk mångfald och edna Ofta problematiskt att mäta biologisk mångfald - hur
DNA-baserad identifiering av invasiva arter i akvatisk miljö
DNA-baserad identifiering av invasiva arter i akvatisk miljö Per Sundberg SEAN ALYTICS AB Species and Ecosystem Analyses Invasiva arter hur kommer dom hit Övervakning hamnar/farleder Hur upptäcker vi dom
edna paradigmskifte för inventering av biologisk mångfald Micaela Hellström Johan Näslund Johan Spens
edna paradigmskifte för inventering av biologisk mångfald Micaela Hellström Johan Näslund Johan Spens AquaBiota 2018-11-21 Micaela Hellström Johan Spens Johan Näslund Kartering och analyser i GIS Traditionella
Centrum för genetisk identifiering Fisk, kräftor och musslor som edna metod och fältprover
RAPPORT Datum Dnr 1(11) 2016-12-31 4.1-33-2015, 4.1-728-2015 (NRM). SLU.aqua.2015.5.1-188 (SLU) Centrum för genetisk identifiering Fisk, kräftor och musslor som edna metod och fältprover Postadress: Besöksadress:
edna paradigmskifte för inventering av akvatisk biologisk mångfald
edna paradigmskifte för inventering av akvatisk biologisk mångfald Foto:Joel Berglund Johan Näslund Micaela Hellström Johan Spens Biologisk mångfald och edna Ofta problematiskt att mäta biologisk mångfald
VISK. Hur går vi tillväga för att analysera virus från. Oslo Slutkonferens VISK 19 mars 2013. vattenprover? Fredrik Nyström
VISK Hur går vi tillväga för att analysera virus från vattenprover? Oslo Slutkonferens VISK 19 mars 2013 Fredrik Nyström Agenda Problematiken kring virusanalyser i råvatten Analysmetodik för virus i: Råvatten
Cirkulerande cellfritt DNA
Cirkulerande cellfritt DNA - en introduktion Anne Ricksten Equalismöte 2016-11-14 Vad är cirkulerande fritt DNA (cfdna)? Extracellulärt DNA som finns i cirkulationen Fragmenterat DNA, medelstorlek på ca
cristatus) vid Storsjöns fiskevårdsområde, Sandviken
edna-inventering av Större vattensalamander (Triturus cristatus) vid Storsjöns fiskevårdsområde, Sandviken AquaBiota Rapport 2018:06 Författare: Micaela Hellström, Johan Näslund och Johan Spens AquaBiota
Illustrerad noggrannhet
Illustrerad noggrannhet riktighet och precision med mål och mening Equalis Allmän klinisk kemi 15-16 november 2012 Mikaela Norman, Sjukhuskemist, Klinisk kemi, Falu Lasarett mikaela.norman@ltdalarna.se
edna-inventering av fisk, flodkräfta och groddjur i fyra lokaler på Näsudden, Skellefteå
edna-inventering av fisk, flodkräfta och groddjur i fyra lokaler på Näsudden, Skellefteå AquaBiota Rapport 2018:04 Författare: Micaela Hellström, Nicklas Wijkmark, Johan Näslund AquaBiota Report 2018:04
Molekylärbiologisk diagnostik av tarmparasiter
Molekylärbiologisk diagnostik av tarmparasiter Vad, När, Var och Hur? Jessica Ögren Länssjukhuset Ryhov Juni 2012 Molekylärbiologiska metoder De senaste två decennierna har molekylärbiologiska tekniker
Polymerase Chain Reaction
Polymerase Chain Reaction The Polymerase Chain Reaction Molekylärbiologisk metodik T3 ht 11 Märit Karls Kunskapsmål för detta avsnitt Från kursplan: Studenten skall kunna: förklara grundläggande principer
Denna rapport får endast återges i sin helhet, om inte utfärdat laboratorium i förväg skriftligt godkänt annat.
RAPPORT utfärdat av ackrediterat laboratorium REPORT issued by an Accredited Laboratory DGE Mark och Miljö RAPPORT Periodisk mätning 1 vid Hovhultsverket 2013 Uddevalla Kraft AB, Uddevalla 2013-04-12 Rapport
Presentation av EDNA & dagens schema, övergripande presentation av COST
Presentation av EDNA & dagens schema, övergripande presentation av COST Maria Kahlert EDNA-möte 2017: 28 April Lokal: Havs- och Vattenmyndigheten (HaV), Göteborg Konferensrum Åskan EDNA syfte & mål Nätverk
DNA-ordlista. Amplifiera: Att kopiera och på så sätt mångfaldiga en DNA-sekvens med hjälp av PCR.
DNA-ordlista Alignment: Att placera DNA-sekvenser intill varandra. Detta gör att man kan urskilja var och hur mycket de skiljer sig från varandra, vilket är ett av de mest grundläggande sätten att analysera
FAKTABLAD Genetiskt provinsamling i rovdjursinventeringen
1(5) FAKTABLAD Genetiskt provinsamling i rovdjursinventeringen Målsättning Syftet med detta faktablad är att ge en översikt av den genetiska provtagningen som tillämpas vid rovdjursinventeringen i Sverige
MSB PROJEKT: MOBIL RESURS VID MISSTÄNKT FARLIG SMITTA. Tobias Lilja
MSB PROJEKT: MOBIL RESURS VID MISSTÄNKT FARLIG SMITTA Tobias Lilja ÖVERBLICK AV PROJEKTET Projektet löper under två år. 2017-2018 Motsvarande 1 1/10 heltidstjänst delat på tre personer på SVA Mikhayil
Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen
IFM/Kemi Linköpings Universitet September 2011/LGM Projektlaboration i genteknik Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen Innehållsförteckning Inledning... 3 Amplifiering
MÅLARMUSSLANS ÅTERKOMST
MÅLARMUSSLANS ÅTERKOMST - Musslor och människor i Fyledalen Kids having fun(?) sampling @ Fyleån Creek Glochidia waiting for host-fish MÅLARMUSSLANS ÅTERKOMST Upplägg - Projektet - Syfte - Fyledalen -
edna-inventering av groddjur och fiskar på två lokaler i Skåne
edna-inventering av groddjur och fiskar på två lokaler i Skåne AquaBiota Rapport 2018:05 Författare: Micaela Hellström och Johan Näslund AquaBiota Report 2018:05 STOCKHOLM, AUGUSTI 2018 Beställare: Undersökningen
Hur vet man att man kan lita på ett labresultat? Kan man lita på de resultat andra rapporterar?
Kvalitetssäkring Hur vet man att man kan lita på ett labresultat? Kan man lita på de resultat andra rapporterar? Inte ovanligt att: Olika lab rapporterar olika resultat (från exakt samma prov!) Olika analystekniker
Utvärdering av BD MAX enteric parasite panel på ett kliniskt laboratorie
Utvärdering av BD MAX enteric parasite panel på ett kliniskt laboratorie Georgina Isak a, Leigh Davidsson a, Stina Boräng b, Silvia Botero-Kleiven b a Enhet för parasitologi och vattenburen smitta, Folkhälsomyndigheten
Provtagning av mikroorganismer. Erfarenheter från ett fältförsök
Provtagning av mikroorganismer Erfarenheter från ett fältförsök Mikroorganismer Äldre prokaryoter utan cellkärna Yngre eukaryoter med cellkärna Bakterier Arkaeer Eukaryoter 1-10 µm 1-10 µm 2 µm 10 cm +
Laboration v.40 Detektion av Legionella pneumophilia med nestad PCR
Avdelningen för kemi och biomedicin Karlstads universitet Laboration v.40 Detektion av Legionella pneumophilia med nestad PCR Frågeställning: Vattenlednings system med tillväxt av Legionella pneumophilia
Generell detektion av patogen med metagenomik
Generell detektion av patogen med metagenomik Maria Lind Karlberg Björn Hallström Avdelningen för mikrobiologi Enheten för laboratorieutveckling Hur identifieras en patogen hos en patient med infektion?
Metodutveckling för detektion av jordbundna sjukdomar för optimering av platsspecifik produktion av vete, ärt och oljeväxter
Metodutveckling för detektion av jordbundna sjukdomar för optimering av platsspecifik produktion av vete, ärt och oljeväxter Ann-Charlotte Wallenhammar 1, Charlotta Almquist 2,3 and Anders Jonsson 2,3
KOMIN Kompetenscentrum för Inomhusmiljö och Hälsa som samlar ett nätverk av praktisk och forskningsmässig kompetens under ett tak med uppgift att
KOMIN Kompetenscentrum för Inomhusmiljö och Hälsa som samlar ett nätverk av praktisk och forskningsmässig kompetens under ett tak med uppgift att bistå näringslivet och allmänheten med information, råd
Aqua reports 2018:21
Aqua reports 2018:21 Jakten på solabborren (Lepomis gibbosus) En edna-studie i Kungsbackaån Patrik Bohman, Per Sundberg, Mårten Klinth, Matthias Obst Jakten på solabborren (Lepomis gibbosus) En edna-studie
Fisk - Åtgärder för a1 skydda akva4ska miljöer. Ulf Bergström Hav och samhälle Marstrand 2014-10- 16
Fisk - Åtgärder för a1 skydda akva4ska miljöer Ulf Bergström Hav och samhälle Marstrand 2014-10- 16 Mål för fisk Na#onella miljömålen naturlig rekrytering, livskrajiga bestånd Gemensamma fiskeripoli#ken
MÅLARMUSSLANS ÅTERKOMST
MÅLARMUSSLANS ÅTERKOMST TILL NYTTA FÖR MÄNNISKA, DJUR OCH NATUR Kids having fun(?) sampling @ Fyleån Creek Glochidia waiting for host-fish MÅLARMUSSLANS ÅTERKOMST Upplägg - Projektet - Syfte - Fyledalen
Vad är risk? Exempel misslyckande. Olika synsätt och möjligheter för undersökning och efterbehandling. Vad är riskbaserad beslutsanalys?
Riskbaserad beslutsanalys vid undersökningar och efterbehandling Lars Rosén Olika synsätt och möjligheter för undersökning och efterbehandling Säkerhetsnivå (UCLM 95 )? Kostnadseffektivitet t ex bästa
Molekylärgenetiskt verktyg för diagnos av T- resp. B-cellslymfom i vävnad/paraffin Diagnostik av Lymfom. Olika ingångar för B-, resp. T-cellslymfom Metodiker: - Morfologi (Mikroskopi) - Immunohistokemi
Norvid norovirus i svenska råvattentäkter
Norvid norovirus i svenska råvattentäkter Fredrik Nyström, Elisabet Athley, Per Ericsson, Peder Häggström, Britt-Marie Pott, Johanna Ansker, och Per-Eric Lindgren Nationell Dricksvattenkonferens, 17 april
Handlingsplan för plast som synliga föroreningar
Handlingsplan för plast som synliga föroreningar Version Certifierad återvinning SPCR 120 och SPCR 152 Handlingsplan för plast som synliga föroreningar Denna handlingsplan är ett levande dokument som revideras
Potentials for monitoring gene level biodiversity: using Sweden as an example
Biodivers Conserv (2008) 17:893-910 DOI 10.1007/s10531-008-9335-2 SUPPLEMENTARY TABLES AND REFERENCES Potentials for monitoring gene level biodiversity: using Sweden as an example Linda Laikre Lena C.
WATERS: Förslag på enhetlig hantering av osäkerhet inom statusklassning och uppföljning
WATERS: Förslag på enhetlig hantering av osäkerhet inom statusklassning och uppföljning Mats Lindegarth Institutionen för Biologi och Miljövetenskap, Tjärnö Havsmiljöinstitutet WATERS is coordinated by
En miniprovtagare för svetsaerosol. innanför svetsskärmen
En miniprovtagare för svetsaerosol placerad ad nära näsan/munnen innanför svetsskärmen Göran Lidén 1 & Jouni Surakka 2 1 Institutionen för tillämpad miljövetenskap, Stockholms universitet 2 Arbetsmiljöverket,
Återintroduktion av flodpärlmussla i Bulsjöån. Effektuppföljning av den parasitiska fasen
Återintroduktion av flodpärlmussla i Bulsjöån Effektuppföljning av den parasitiska fasen Sportfiskarna Text: Niklas Wengström, Bild: Jakob Bergengren Tel: 031-83 44 64 E-post: niklas.wengstrom@sportfiskarna.se
DNA FRÅN BLOD & KINDCELLER
EQUALIS Användarmöte, Molekylärdiagnostik 2012 Quality Hotel, Ekoxen, Linköping 7 8 november, 2012 DNA FRÅN BLOD & KINDCELLER Majid Osman, kemist, PhD Klinisk kemi, Linköping DNA stabilitet Provtagning
Bakgrund. Bomullsmögel- ny metod ger ökad precision och förbättrad riskbedömning. Bomullsmögel är en sjukdom som vissa år
Bomullsmögel- ny metod ger ökad precision och förbättrad riskbedömning Rapsarealen i Sverige 2008 Ann-Charlotte Wallenhammar, 2 Charlotta Almquist, Anna Redner och 3 Anki Sjöberg HS Konsult AB, Örebro
1970 Lungcancer = DÖD
Molekylär Patologi DNA från vävnad (och celler) Martin Hallbeck Docent. MD. PhD. Klinisk Patologi, Linköping 1970 Lungcancer = DÖD 2 IPASS-studien Probability of PFS 1.0 0.8 0.6 0.4 0.2 Gefitinib EGFR
PROVTAGNINGSANVISNINGAR
PROVTAGNINGSANVISNINGAR Dessa anvisningar ersätter tidigare utgåva, daterad 2007-12-18. Provförteckning Se www.skane.se/usil/klingen För vårdgivare Analyser och tjänster som utförs av Genetiska kliniken.
Ackrediteringens omfattning Klinisk immunologi och transfusionsmedicin. Utrustning Enhet Laboratorium 1 Ort NÄL US
Monospecifik DAT Anti-IgG och Anti-C3d Utrustning Enhet Laboratorium 1 Direkt antiglobulintest, DAT ABO-gruppering, erytrocyter Direkt platta eller ABO-gruppering, plasma Direkt platta eller D-gruppering
Storskalig analys av biomarkörer på UCR Laboratory, Uppsala. Birgitta Högberg Laboratoriechef
Storskalig analys av biomarkörer på UCR Laboratory, Uppsala Birgitta Högberg Laboratoriechef Sveriges största ARO UCR är organiserat som ett självständigt, icke-vinstdrivande forskningscentrum inom Uppsala
Spårsäkring och DNA-analys efter sexualbrott
Spårsäkring och DNA-analys efter sexualbrott Ricky Ansell Verksamhetsexpert Biologienheten, SKL Statens kriminaltekniska Statens laboratorium kriminaltekniska - SKLlaboratorium 1 Statens kriminaltekniska
Disposition. snabb bedömning med ny metod. Jordbundna sjukdomar Detektionsteknik Markartor Jordanalyser Ärtrotröta
Risken för f klumprotsjuka säker och snabb bedömning med ny metod Disposition Jordbundna sjukdomar Detektionsteknik Markartor Jordanalyser Ärtrotröta Ann-Charlotte Wallenhammar HS Konsult AB Örebro Kravet
Fotograf: M. Husander. Faroanalys och riskhantering vid toxisk algblomning i vattentäkt
Fotograf: M. Husander Faroanalys och riskhantering vid toxisk algblomning i vattentäkt 2016 2018 Algblomning i sötvatten Orsakas av cyanobakterier 500 arter i Sverige Betydligt fler 175 ytvattenverk 65
Modell och verklighet och Gy2011
Modell och verklighet och Gy2011 Innehållet i Modell och verklighet stämmer väl överens med ämnesplanen och det centrala innehållet i Gy2011. I ämnesplanen för Kemi, www.skolverket.se, betonas att undervisningen
Restoration of the freshwater pearl mussel populations with new methods Vattenparlamentet, Pajala, 2011-11-02
Restoration of the freshwater pearl mussel populations with new methods Vattenparlamentet, Pajala, 2011-11-02 Kort bakgrund Varför så mycket fokus på flodpärlmussla? Komplicerad livscykel Kort bakgrund
HMK. HMK-Geodesi Workshop. 17 juni 2013 GRUPPDISKUSSION GRUPP 3. HMK Geodesi, Workshop KTH 2013-06-17. - en handbok i mät- och kartfrågor
HMK - en handbok i mät- och kartfrågor HMK-Geodesi Workshop 17 juni 2013 GRUPPDISKUSSION GRUPP 3 HMK Geodesi, Workshop KTH 2013-06-17 Diskussion 1 - Struktur och kärndokument Struktur: Synpunkter på strukturen
Verktygslåda för fekal källspårning på laboratorium och i fält
Vattenburna smittor hur kan vi hjälpas åt för att bedöma och hantera risker? Verktygslåda för fekal källspårning på laboratorium och i fält Avlopps? rening Vattentäkt Bakgrund Förorenat råvatten är ofta
KI Biobank Tjänstekatalog
KI Biobank Tjänstekatalog Version: 2, 2015 KI Biobank är en core facilitet som erbjuder service för provinsamling, provförvaring och provdistribution. I samarbete med: Innehåll KI Biobank och BBMRI...4
Sammanställning resultat workshop Viltkameror och medborgarforskning
Sammanställning resultat workshop Viltkameror och medborgarforskning Organiserad av Scandcam och Beyond Moose projekt, Olofsfors Bruk, 28 september 2018 Ledd av Tim Hofmeester & Joris Cromsigt, SLU Umeå
CMV/EBV Molekylär diagnostik. Annika Allard Klinisk Mikrobiologi/Virologi Norrlands Universitetssjukhus
CMV/EBV Molekylär diagnostik Annika Allard Klinisk Mikrobiologi/Virologi Norrlands Universitetssjukhus De flesta CMV infektioner hos immunkompetenta individer är asymtomatiska eller ger bara en mkt mild
Urin-DNA från varg utvärdering av användbarhet och analysframgång
Urin-DNA från varg utvärdering av användbarhet och analysframgång Eva Hedmark, Linn Svensson, Anna Danielsson och Mikael Åkesson Grimsö forskningsstation, Ekologiska institutionen, SLU Bakgrund I Sverige
Kontinuerlig lönsamhetsanalys med ABC/ABM. Hellen Wohlin, Pointer
Kontinuerlig lönsamhetsanalys med ABC/ABM Hellen Wohlin, Pointer Pointer Sweden AB 2003 POINTERS KOMPETENS OCH KONCEPT Kompetens Koncept Styrkort Verksamhetsanalys VCA ABC CI Design och utveckling Data
Mikrobiologins tekniksprång Dr. Erik Nygren SP Food and Bioscience
Mikrobiologins tekniksprång Dr. Erik Nygren SP Food and Bioscience Mikrobiologins tekniksprång Den högteknologiska mikrobiologin erbjuder idag nya verktyg för att förebygga smittspridning och öka produktsäkerhet.
Sammanfattning utveckling genetik
Sammanfattning utveckling genetik Total volymökning 19% jmf 2016-2017 (Verklig data fram till 13/9, resten prognos) Fosterdiagnostik ökar, ca 23% NGS (kardio främst) ökar med 17 resp 27%, väntetid minskat
använda kunskaper i biologi för att granska information, kommunicera och ta ställning i frågor som rör hälsa, naturbruk och ekologisk hållbarhet,
Arbetsområde: Huvudsakligt ämne: Biologi åk 7-9 Läsår: Tidsomfattning: Ämnets syfte Undervisning i ämnet biologi syftar till: länk Följande syftesförmågor för ämnet ska utvecklas: använda kunskaper i biologi
Equalis kvalitetssäkringsprogram 2018
Equalis kvalitetssäkringsprogram 2018 Meticillinresistenta Staphylococcus aureus Christina Welinder Olsson Equalis användarmöte 12 mars 2019 Meticillinresistenta Staphylococcus aureus MRSA 2018:01A-E Molekylärbiologisk
Miljööver- vaknings- dagar
Nytt från Naturvårdsverket Manuela Notter, NV Miljööver- vaknings- dagar 2018 Naturvårdsverket Swedish Environmental Protection Agency 2018-10-03 1 2018 år nya medel +25 Mkr 2018 för Naturvårdsverket Miljögifter
Arbetet med att få till en riskbaserad övervakning
Arbetet med att få till en riskbaserad övervakning Miljökvalitetsnormer för vatten Ställs krav på en övervakning av miljötillståndet som ger hög och/eller känd konfidens och noggrannhet. Den övervakning
Sjöprovfisken Planering och utförande i korthet
Sjöprovfisken Planering och utförande i korthet Uppdaterad 2016-02-10 Metodik för provfiske i sjöar finns beskriven i Undersökningstyp: Provfiske i sjöar, version 1:3, 2013-04-11. (https://www.havochvatten.se/download/18.2a9b232013c3e8ee03e828c/1369232502309/
Pedagogisk planering Bi 1 - Individens genetik
Centralt innehåll Genetik Arvsmassans uppbyggnad samt ärftlighetens lagar och mekanismer. Celldelning, dnareplikation och mutationer. Genernas uttryck. Proteinsyntes, monogena och polygena egenskaper,
Projektplan. Projektnamn: Projektägare: Dokumenthistorik 1(7) PA 1. Pike-reg Munksjön. Länsstyrelsen i Jönköpings län
1(7) Projektplan Projektnamn: Pike-reg Munksjön Projektägare: Länsstyrelsen i Jönköpings län Dokumenthistorik Datum Ändringar & kommentarer 2011-10-14 Dokumentet upprättades PROJEKTiL LstIT ver 1.4 (källa
Fekal källspårning i ytråvatten
Kunskapsseminarium om mikrobiologiska dricksvattenrisker 20161025, Hotel Clarion WINN, Gävle Fekal källspårning i ytråvatten Rikard Dryselius Varför källspåra? Vid inrapporterade dricksvattenburna sjukdomsutbrott
Droplet Digital PCR Ny metod för identifiering och kvantifiering av HTLV
Droplet Digital PCR Ny metod för identifiering och kvantifiering av HTLV Sara Thulin Hedberg, Molekylärbiolog, PhD Lorraine Eriksson, Kerstin Malm, Maria A Demontis*, Paula Mölling, Martin Sundqvist, Graham
Metodik och genomförande - kiselalger (Amelie Jarlman, Jarlman Konsult AB)
Metodik och genomförande - kiselalger (Amelie Jarlman, Jarlman Konsult AB) Allmänt om kiselalger Kiselalger är ofta den dominerade gruppen inom de s.k. påväxtalgerna, vilka sitter fast på eller lever i
Undersökning av kräftbeståndet i Lejondalssjön 2018
Undersökning av kräftbeståndet i Lejondalssjön 2018 Undersökning av kräftbeståndet i Lejondalssjön 2018 Författare: Ulf Lindqvist och Tommy Odelström fredag 7 december 2018 Rapport 2018:29 Naturvatten
Rapport avseende DNA-analys av spillningsprover från järv och lo
KDB 541/11: Rapport 1 Rapport avseende DNA-analys av spillningsprover från järv och lo Jämförelse av två inlämningsmetoder 212-1-26 Innehållsförteckning 1. Bakgrund 3 2. Metod 3 3. Resultat 3 4. Slutsats
Övergödda sjöar: diagnostik och uppföljning av åtgärder -exempel från Växjö- Andreas Hedrén Växjö kommun
Övergödda sjöar: diagnostik och uppföljning av åtgärder -exempel från Växjö- Andreas Hedrén Växjö kommun Problemet: Övergödning Litet ARO= Känsliga recipienter. Övergödda i + 100 år Decennier av arbete:
När, var, hur? DNA-Barcoding av kiselalger
Från vattendrag till kust Maria Kahlert Institution för Vatten & Miljö När, var, hur? DNA-Barcoding av kiselalger och andra organismer Maria Kahlert Miljöövervakning med ett klimat i förändring. Miljöövervakningsdagarna
Kvalitetssäkring och Validering Molekylära Metoder. Susanna Falklind Jerkérus Sektionen för Molekylär Diagnostik Karolinska Universitetslaboratoriet
Kvalitetssäkring och Validering Molekylära Metoder Susanna Falklind Jerkérus Sektionen för Molekylär Diagnostik Karolinska Universitetslaboratoriet Vem/Vad styr oss? 98/79/EG - IVD direktivet Lagen (1993:584)
Vindel River LIFE. Work plan för 2011 Action C2-C4
Vindel River LIFE Work plan för 2011 Action C2-C4 Action C2: ROTENTRÄSKDAMMEN Sökande: Åtgärd: Lycksele kommun / Vindelälvens Fiskeråd Uppförande av överfallströskel vid utloppet av Rotenträsket (Sikbäcken)
Användning av PCR i växtodlingen. Anders Jonsson, SLU/ JTI, Skara
Användning av PCR i växtodlingen Anders Jonsson, SLU/ JTI, Skara Innehåll Introduktion qpcr och andra DNA-metoder Biologisk markkartering av jordburna patogener DNA-baserade diagnos av bladfläckar på vete
Sample to Insight. VirusBlood200_V5_DSP-protokoll. December 2017 QIAsymphony SP -protokollblad
December 2017 QIAsymphony SP -protokollblad VirusBlood200_V5_DSP-protokoll Detta dokument är VirusBlood200_V5_DSP QIAsymphony SP:s protokollblad R2, för QIAsymphony DSP DNA Mini Kit, version 1. Sample
Påvisande av Echinococcus multilocularis med specifikt fiske av mitokondrie-dna
Påvisande av Echinococcus multilocularis med specifikt fiske av mitokondrie-dna Åsa Hagström Statens Veterinärmedicinska Anstalt Avdelning för virologi, immunbiologi och parasitologi Innehåll Bakgrund
Analys av råvatten och dricksvatten vid oväntad mikrobiologisk förorening
Analys av råvatten och dricksvatten vid oväntad mikrobiologisk förorening Anette Hansen, Folkhälsomyndigheten 171130 Svenskt Vatten Forskning och innovation för säkert dricksvatten Anette.Hansen@folkhalsomyndigheten.se
i samverkan med det omgivande samhället.
SLU utvecklar kunskapen om de biologiska naturresurserna och människans hållbara nyttjande av dessa. Detta sker genom utbildning, forskning och miljöanalys i samverkan med det omgivande samhället. Skoglig
Slutrapport - Förstudie om Alternariaförekomst i potatis och behandlingseffekter 2013 i Mellansverige.
1 Slutrapport - Förstudie om Alternariaförekomst i potatis och behandlingseffekter 2013 i Mellansverige. Lisa Andrae, Rådhuset Nordfalan Eva Edin, Institutionen för Skoglig mykologi och växtpatologi, SLU
Vägledning för formulering av individuella lärandemål för att nå examensmål
Rådet för forskarutbildning Vägledning SLU ID: SLU.[Skriv numret här] 2019-01-02 Vägledning för formulering av individuella lärandemål för att nå examensmål Vad är individuella lärandemål? Vid examen ska
Centrum för genetisk identifiering Teknisk rapport Björnspillningsinventering 2015
RAPPORT Datum Dnr 1(7) 2017-11-07 4.1-628-2015 Centrum för genetisk identifiering Teknisk rapport Björnspillningsinventering 2015 Postadress: Besöksadress: Telefon: 08-519 540 00 Box 50007 Frescativägen
Vad finns att berätta om denna rapport?
Vad finns att berätta om denna rapport? Del i rapportserie om kalkningens effekter på biologin Fisk i rinnande vatten Bottenfauna i rinnande vatten Fisk i sjöar Flodpärlmussla (Flodkräfta) Baserade på
Inventering av fiskarter med fokus på lax (Salmo salar) m.h.a edna i Piteälv, Norrbottens Län. Micaela Hellström & Johan Spens
Inventering av fiskarter med fokus på lax (Salmo salar) m.h.a edna i Piteälv, Norrbottens Län. Micaela Hellström & Johan Spens AquaBiota Report 2018:12 STOCKHOLM, NOVEMBER 2018 Beställare: Rapporten är
Metaller i Vallgravsfisk 2011. Ett samarbete mellan Göteborgs Naturhistoriska museum och Göteborgs Stads miljöförvaltning. Miljöförvaltningen R 2012:9
ISBN nr: 1401-2448 R 2012:9 Foto: Peter Svenson Metaller i Vallgravsfisk 2011 Ett samarbete mellan Göteborgs Naturhistoriska museum och Göteborgs Stads miljöförvaltning Miljöförvaltningen Karl Johansgatan
Workshop om kursplaner åk 7 9
NO biennal Luleå 3 4 april 2011 Workshop om kursplaner åk 7 9 Struktur för kursplanen i biologi: Syfte och mål Centralt innehåll Kunskapskrav för 4 6 och 7 9 Mål för undervisningen i biologi i grundskolan:
Karin Beronius Erkenlaboratoriet. Öppet vatten, fisk
Öppet vatten, fisk Vem har inte suttit i en eka en ljummen sommarkväll och metat eller fiskat med kastspö? Några har kanske till och med testat att pimpla på vintern? Men att lägga nät för att studera
Vad händer i ett genetiskt laboratorium?
12 utveckla nya metoder eller låta sådana prover delta i kvalitetskontrollprogram, såvida inte patienten har uttryckt att man inte vill att ens prov ska vara del av sådan verksamhet. Som alla andra sparade
Namn: student x & student y Kurs: FAGBH0 Utförd: 090526
Laboration: Isolering av kinin Namn: student x & student y Kurs: FAGBH0 Utförd: 090526 Handledare: Patrik Holm 1 Innehållsförteckning Innehållsförteckning... 2 Sammanfattning... 3 Inledning... 3 Utförande...
Biologisk markkartering
Biologisk markkartering - för att styra mot rätt odlingsåtgärd - Ann-Charlotte Wallenhammar Anders Jonsson Odling i Balans 20 januari 2010 2004-04-17 Disposition Jordbundna sjukdomar Detektionsteknik Markartor
BREEAM communities vs MKB Betraktelser och framtidsspaningar Åsa Norman
FÖR BÄTTRE SAMHÄLLEN BREEAM communities vs MKB Betraktelser och framtidsspaningar Åsa Norman Upplägg Kort om systemet Breeam communities Relation till MKB-processen likheter, skillnader Framtidsspaning
GIS, dammar, flodpärlmusslor och öring
GIS, dammar, flodpärlmusslor och öring Erik Degerman & Carl Tamario Sötvattenslaboratoriet Vattendagarna 14-16 november 2017 En studie om öring: En öringpopulation behöver en viss strömsträcka för att
Från Växt till Läkemedel - en resa med kvalitetskontroll
Från Växt till Läkemedel - en resa med kvalitetskontroll Michelle Co (PhD Analytisk Kemi) & Nora Åhlander (leg. Apotekare) Enheten för växtbaserade läkemedel, Läkemedelsverket michelle.co@mpa.se, nora.ahlander@mpa.se
Utveckling och utvärdering av indikatorer för kustfisk : Lena Bergström, SLU Martin Karlsson, SLU Leif Pihl, Göteborgs universitet Jacob Carstensen,
Utveckling och utvärdering av indikatorer för kustfisk : Lena Bergström, SLU Martin Karlsson, SLU Leif Pihl, Göteborgs universitet Jacob Carstensen, Aarhus universitet, Ulf Bergström, Jens Olsson, Patrik
Kvalitetsutveckling i frivilligbaserad miljöövervakning
Kvalitetsutveckling i frivilligbaserad miljöövervakning Workshop i samband med SLU- Foma:s konferens Smartare miljöanalysmetoder Ultuna, 2014-11- 18 Sammanställda minnesanteckningar från gruppdiskussioner
POCKETGUIDE FÖR TRANSMITTER Hantering och konfigurering av displayer. IM-SV-DTR-PG Version 1.01
POCKETGUIDE FÖR TRANSMITTER Hantering och konfigurering av displayer IM-SV-DTR-PG Version 1.01 Tangentbordsfunktioner Obs. Displayen är inte en pekskärm. Använd siffrorna, ENTER, BACK och de fyra funktionsknapparna
Provtagning i vatten. Jens Fölster Inst. För vatten och miljö, SLU
Provtagning i vatten Jens Fölster Inst. För vatten och miljö, SLU Utbyggningen av reningsverket gav omedelbar effekt i Fyrisån! Tot-P i Fyrisån Flottsund 1600 1100 Tot-P µg/ l 600 100 1965 1970 1975 1980
Metodik och genomförande - kiselalger (Amelie Jarlman, Jarlman Konsult AB)
Rönne å - Vattenkontroll 2014 Metodik och genomförande - kiselalger (Amelie Jarlman, Jarlman Konsult AB) Provtagningspunkter År 2014 insamlades påväxtprov för kiselalgsanalys på åtta lokaler i Rönne ås
Patientnära analyser en introduktion
Per Simonsson Docent, klinisk kemist Siemens Healthcare AB Patientnära analyser en introduktion Restricted Siemens AG 2014 All rights reserved. Answers for life. Ta med sig hem budskap Limited data indicate