Hemoglobinutredningar på Karolinska. Christin Sisowath Sjukhuskemist Karolinska Universitetslaboratoriet, Klinisk kemi

Relevanta dokument
Hemoglobinsjukdomar. Innehåll. R Zenlander & S Saltvedt

Hemoglobinsjukdomar. Britta Landin & Sissel Saltvedt

HbA1c och Hb-varianter - erfarenheter och praktiska råd

Medfödda erytrocytdefekter - Hemoglobinopatier

Medicinsk service Hemoglobinopatiutredning Hemoglobinopatiutredning Bakgrund, indikation och tolkning

Annat än glukos som kan påverka HbA1c-resultatet. Britta Landin

HEMOGLOBINOPATI Medicinsk bakgrund och diagnostik. Camilla Valtonen-André

DNA-analyser: Diagnosticera cystisk fibros och sicklecellanemi med DNA-analys. Niklas Dahrén

Kan man verkligen ha så många röda? Om erytrocytos hos barn. Stefan Jacobsson Hematologiansvarig överläkare Sahlgrenska Universitetssjukhuset

Diagnosticera sicklecellsanemi med DNA-analys. Niklas Dahrén

Hemoglobinopatier Vanligaste ärftliga sjukdomarna Vanligaste anemiorsakerna globalt Två typer Kombinationer förekommer Hemoglobinopatier

Familjär hyperkolesterolemi med NGS-analys

Ylva Hedeland Niclas Rollborn Anders Larsson. Analys av HbA1c metodjämförelse mellan några sjukhuslabb i Sverige

DNA- alfa- 1- antitrypsin, sekvens med Big Dye Direct

Nomenklatur för vanliga SNP-analyser Gör vi rätt?

Cirkulerande cellfritt DNA

DNA HFE genotyp,taqman alleldiskriminering, Malmö

Diagnosticera cystisk fibros med DNA-analys. Niklas Dahrén

Skrivning för biolog- och molekylärbiologlinjen, genetik 5p.

Lever: Handläggningsrutin hereditär hemokromatos

Diskrepans mellan APC-Resistens och faktor V Leiden mutationen Några patientfall

Framtida tekniker MLPA (Multiplex Ligation Probe Amplification) med tillämpning inom Talassemi. Dick Nelson Klinisk kemi, Labmedicin Skåne

Genetik II. Jessica Abbott

Evolution, del 2: Evolutionsprocesser och förändringar i det genetiska materialet. Jessica Abbott Forskare Evolutionär Ekologi

B-HbA1c på Roche Cobas, Helsingborg, Ängelholm, Kristianstad (NPU Kod 27300)

Släktskap mellan människa och några ryggradsdjur

Delprov 3 Vetenskaplig artikel

Proteinstruktur och Hemoglobin

Karl Holm Ekologi och genetik, EBC, UU. ebc.uu.se. Nick Brandt. Populationsgenetik

Protein en livsviktig byggsten

DNA-sekvenserings utskick Carola Andersson KMP-lab Sahlgrenska Universitetssjukhuset

Vårdprogram för barn med trombocytos och polycytemi/erytrocytos

Mutationer. Typer av mutationer

Mini-vårdprogram för thalassemi

Leukemier. Leukemier och genetik. Metoder inom cancergenetik. Varför genetisk diagnostik? Konventionell cytogenetik. Translokation

Analys av hepariner, faktor Xahämmare och trombinhämmare

Cystnjursjukdomar och genetik. Carina Frykholm Klinisk genetik Akademiska sjukhuset, Uppsala

Rapport utfärdad av ackrediterat laboratorium. Report issued by Accredited Laboratory. Analysrapport ± 8% SS-EN ISO 13903: g/kg. 21.

Mitokondriella sjukdomar. Gittan Kollberg Avd för klinisk kemi Sahlgrenska Sjukhuset Göteborg

Regionala riktlinjer för utredning av patienter med misstänkt ärftlig demens i Region Skåne

Mini-vårdprogram för thalassemi

Proteinstruktur samt Hemoglobin

Utredningsfall 2016:01

The presence of haemoglobin variants in Sweden Detection by capillary zone. electrophoresis.

Uppföljning av patienter med nedsatt njurfunktion. Hur används Ferritin och PTH?

Next Generation Sequencing. Anna Gréen, Klinisk Genetik, Linköping

HbA1c för att diagnostisera diabetes - EMOT

B-HbA1c Afinion (SKA09525)

Tentamen Biologi BI1112 Termin och år: Klockan:

NPU-koder för genetik


Forskning om diagnos och behandling vid Alzheimers sjukdom

Järnbestämning med MRT. 21 J Järnbestämning med MRT Röntgenveckan Karlstad Magnus Tengvar Karolinska Solna Centrala Röntgen

Medicinsk genetik del 5: Huntingtons sjukdom, sicklecellanemi och cystisk fibros. Niklas Dahrén

Hereditär nefrit Alport syndrom

GENETIK - Läran om arvet

Bestämning av antalet aktiva CYP2D6 genkopior (CNV) med Pyrosequencing. Anna-Lena Zackrisson PhD.

FINLANDS FÖRFATTNINGSSAMLING

B-HbA1c, DCA Vantage Metodbeskrivning Patientnära analysverksamhet

Familjär hyperkolesterolemi (FH) När skall man misstänka? Christer Lundin

Datum Diarienr: SkaS

Högt Hb hos vuxna och barn utredning och klinik. Jan Samuelsson Vetenskaplig sekreterare

Sammanfattning utveckling genetik

Genetik, Gen-etik och Genteknik

DNA sekvensning Primär Immunbrist Genetik till varje pris?

Gen Transkripterbar del. promotor exon intron exon intron exon Slut på transkription. av transkription, fixar rätt tid och rätt mängd.


En bioinformatisk genjakt

Föreläsning 17. Karbonylkolets kemi II Kapitel 17 F17

Förändringar i TakeCare:s beställningar av laboratorieanalyser

TENTAMEN för KMB056 - Molekylär Bioteknik

ELEMENTÄR - SVÅRARE FÄRGGENETIK. Del 4

Kodnummer: 1) Beskriv processerna som sker i replikationsgaffel (eng. replication fork)? (3)

PROVGENOMGÅNG AVSNITT 1.2 BIOLOGI 1

Vad händer i ett genetiskt laboratorium?

Förändringar i Webbremiss beställningar av laboratorieanalyser

Sara Ekvall, doktorand Inst. för immunologi, genetik & patologi Uppsala universitet Handledare: Marie-Louise Bondeson & Göran Annerén

Jämförelse mellan 5 patientnära D-Dimer metoder och standard metod på laboratoriet - erfarenhet från ett center

QIAsymphony DSP DNA Kits

Proteiner. Biomolekyler kap 7

BMT/SCT vid Thalassemi, SCA och DBA. Jacek Winiarski Barnens sjukhus Karolinska Huddinge VPH dagen feb 2007

Cellcykel/Celldöd. Laborationsrapport 20/2-14. Basgrupp 1

NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra

Förändringar i TakeCare:s beställningar av laboratorieanalyser

Information och samtyckesformulär inför genomisk utredning av ovanliga sjukdomar och syndrom med metoderna genomisk array och exomanalys

DNA-labb / Plasmidlabb

ChromoQuant In vitro diagnostiskt test kit för analys av vanligen förekommande aneuploidier i kromosomerna 13, 18 och 21 samt i X och Y.

11x6 mm stort hudexcisionspreparat med diffus förändring. Hela preparatet bäddas.

Proteiner. Biomolekyler kap 7

ELEMENTÄR - SVÅRARE FÄRGGENETIK. Del 3

Hundens evolution, genetik och beteende

DNA-ordlista. Amplifiera: Att kopiera och på så sätt mångfaldiga en DNA-sekvens med hjälp av PCR.

ANALYSFÖRTECKNING GENETISKA KLINIKEN I LUND

Instuderingsfrågor avsnitten Molekylär genetik och Rekombinant DNA tekniker, MCB

Mångfald inom en art. Genotyp. Genpool. Olika populationer. Fig En art definieras som

NGS i sjukvård next generation sequencing. Jan Söderman Medicinsk diagnostik Länssjukhuset Ryhov Jönköping

Genetik. Generna finns i DNA-molekylen. DNA=deoxyribonukleinsyra

1970 Lungcancer = DÖD

Erfarenheter från övergången till den nya typningsmetodiken MIRU-VNTR

Regionala riktlinjer för utredning av patienter med misstänkt ärftlig demens

Transkript:

Hemoglobinutredningar på Karolinska Christin Sisowath Sjukhuskemist Karolinska Universitetslaboratoriet, Klinisk kemi

Analyser på Karolinska för hemoglobinutredningar Hemoglobinfraktioner HPLC (HbA 2 och HbF) Elektrofokusering (IEF) Hb, MCH och Ret He Masspektrometri PCR-RFLP Hb S Hb E Hb Lepore Hb Tacoma Sekvensering (HBA1, HBA2, HBB) www.uic.edu α-thalassemi (α-globin Strip Assay) β-thalassemi (Klinisk genetik, Karolinska)

Hemoglobinfraktioner Vid utredning av hemoglobinvarianter och thalassemi Hemoglobinfraktioner innefattar Hemoglobin A 2 (α 2 δ 2 ) Hemoglobin F (α 2 γ 2 ) Elektrofokusering

HbA2 och HbF mäts kvantitativt med jonbyteskromatografi (HPLC) HbA 2 och HbF separeras från övriga hemoglobinfraktioner och elueras med saltgradient Eluatet passerar en flödescell och absorbansen mäts Ytan under topparna beräknas och svaret fås i % av totalt hemoglobin

HbA 2 Vuxna normalt: 2-3% av totala hemoglobinmängden Högre halt HbA 2 Heterozygot β-talassemi (β-thalassemia minor) ca dubblerad halt Vissa β-varianter, såsom HbS lätta stegringar Lätt sänkt halt HbA 2 α-talassemi järnbrist

HbF Vuxna normalt: <1% av totala hemoglobinmängden Högre halt HbF β -thalassemia major vid vissa genetiska tillstånd (hereditär persistens av HbF, HPFH) ibland vid β -thalassemia minor (lätt förhöjd) olika speciella sjukdomstillstånd

Elektrofokusering Elektrofokusering, IEF, för att utesluta tillstånd utan HbA 2 - ökning som fenotypiskt liknar heterozygot β -thalassemia (β -thalassemia minor), som t.ex. förekomst av Hb Lepore. Vi överväger att avstå från rutinmässig IEF

Hemoglobinfraktioner Utöver HPLC och elektrofokusering görs även Hb MCH (Hemoglobinmassa) Ret He (Retikulocythemoglobin equivalent) och ibland (Hb, instabilt)

masspektrometri Hemoglobinfraktioner

Masspektrometri Analys av Hb-fraktioner på masspektrometri utförs vid fall med oklar erytrocytos där elektrofokusering gett normalt resultat när elektrofokusering eller kromatografi inger misstanke om förekomst av hemoglobinvariant och man önskar kartlägga om α- eller β-variant

Masspektrometri Medelmassan av α- och β-globin kedjan förändras lika mycket som masskillnaden mellan den nya och den utbytta aminosyra Skillnaden i molekylmassan som uppstår vid utbyte av en aminosyra är mellan 0 till 129 Da. α-globin kedjan:15126.38 Da β-globin kedjan: 15867.24 Da

Masspektrometri Samma masskillnad kan uppstå vid olika aminosyrautbyten Undersökning av intakt globin ger inte information om var i peptiden utbytet skett.

Masspektrometri Bedömningen av möjliga aminosyrautbyten med avseende på: Vilka som är förenliga med kända punktmutationer Utifrån variantens isoelektriska punkt, IEF

Hemoglobinfraktioner masspektrometri DNA-analyser: PCR-RFLP Sekvensering hybridisering

Hb S med PCR-RFLP I β-globinkedjan: glutaminsyra valin, aminosyraposition 6 För att skilja på homozygot Hb S och heterozygot Hb S och β-noll-thalassemi Vid misstänkt mönster vid elektrofokusering eller HPLC DNA analys

15* 37 53 88 99 199 297 1500* 0 Fluorescence Hb S med PCR-RFLP Ej muterad HbS 201, 96, 89/88, 49/37 297 89/88, 49/37 100 Htz kontr.hbs 90 80 70 297 60 50 40 30 20 10 96 201 0-10 20 40 60 80 100 120 Time (seconds)

HbE med PCR-RFLP I β-globinkedjan: glutaminsyra lysin, aminosyraposition 26 För att skilja mellan homozygoti för HbE respektive kombination av heterozygoti för HbE och beta-noll-thalassemi i de fall där HbE är den helt dominerande hemoglobinformen. Vid misstänkt mönster vid elektrofokusering eller HPLC DNA analys

Hb Lepore med PCR-RFLP Samma fenotyp som heterozygot β-thalassemi (βthalassemia minor). Ingen HbA 2 -stegring 3 olika Hb Lepore: Hb Lepore Boston/Washington: δ-globin (aa 1-87) och β-globin (aa 116-146) Hb Lepore Baltimore: δ-globin (aa 50) och β-globin (aa 86) Hb Lepore Hollandia: δ-globin (aa 22) och β-globin (aa 50)

Hb Lepore Boston/Washington med PCR-RFLP Del av -genen 417 bp Del av -genen Ingen PCR produkt bildas PVU II klyvningsställe Fusion av - och -generna Efter klyvning med PVU II 249 bp 166 bp

Hb Tacoma med PCR-RFLP Analys av HbA1c med HPLC patienten har minst 30% lägre nivå.

Hb Tacoma med PCR-RFLP I β-globinkedjan: arginin serin, aminosyraposition 30 1612 bp stort fragment amplifieras från β-globingenen Klyver med restriktionsenzymet Bsl I Vildtyp 168 130 704 610 Tacoma 168 834 610

α-thalassemi Oftast större deletioner Multiplex-PCR (Tan et al, Blood. 2001 Jul 1;98(1):250-1 ) α- globin strip assay (ViennaLab) 3 PCR reaktioner 2 hybridiseringsstrip

α-thalassemi α- globin strip assay (ViennaLab)

β-thalassemi Herlev Karolinska, Klinisk genetik Sekvensering och gap PCR enligt Chan et al (Am J Clin Pathol 2010;133:700-707)

Sekvensering Alfaglobin HBA2 kodande delen av exon 1, 2 och 3 HBA1 exon 1, 2 och 3 Betaglobin: exon 1, 2 och 3

Erytrocytosutredning Lokalt intresse för familjär erytrocytos (högt Hb, ej PCV)

Utredning av högt Hb-värde S-EPO lågt normalt- högt ja JAK2 mutation nej Polycytemia vera EPO-receptorn Sekvensering av del av exon 8 Hb-variant VHL mutation: PCR-RFLP för Chuvash (Arginin tryptofan i aminosyraposition 200) Sekvensering av exon 1, 2 och 3 (kodande delen)

Sammanfattning Hemoglobinfraktioner HPLC (HbA 2 och HbF) Elektrofokusering (IEF) Hb, MCH och Ret He Masspektrometri PCR-RFLP Hb S Hb E Hb Lepore Hb Tacoma Sekvensering (HBA1, HBA2, HBB, VHL, EPOR) α-thalassemi (α-globin Strip Assay) inkl Hb Constant Spring β-thalassemi (Klinisk genetik, Karolinska)

TACK! Frågor? Maila christin.sisowath@karolinska.se