Strategi för utvecklande av molekylärgenetisk diagnostik Utredare: Anita Bergsell Fredrik Enlund, DC Docent molekylär patologi 181205 Carola.Andersson@gu.se
Sjukvårdsdiagnostik är komplex atologi Radiologi Mikrobiologi Klinisk kemi Allt i syfte att erbjuda patienten bra sjukvård! Fysiologi Genetik 2018-12-03 Fredrik Enlund
DNA är byggmallen för allt levande Individ Cell Kromosom Gen Bas 2018-12-03 Fredrik.Enlund@ltkalmar.se
Vår gemensamma utmaning Sjukvårdsdiagnostik blir mer och mer specifik http://www.puhuahospital.com
Framåt för genetisk profilering i sjukvård Sjukvården behöver arbeta annorlunda Från att diagnostisera och behandla till att Förutse och undvika Genetik blir viktigare i flera fält Cancerbehandling är numera beroende av genetisk profilering Syndromutredning snabbare och mer distinkt diagnostik och osäker diagnos blir bekräftad Mikrobiologisk typning Transplantationstypning (HLA) och farmakogenetisk typning ( tex CY)
Molekylär genetisk diagnostik Tre sätt att se på DNA! Ärftlighetsutredningar (Hereditet) Cancers DNA (förvärvad) Bakteriers och virus DNA
Ärftlig genetik hereditära utredningar Samlas till Linköping inom SÖSR
Slutsats 1 av utredningen ärftlig genetik Tätare samarbete med klinisk genetik i Linköping Etablera en filial för genetisk mottagning vid LSK HSF bör anställa en genetisk samordnare som koordinerar de ärftliga utredningarna inom LtK
Cancergenetik - varför?
I3k IGF-1R/ IR EGFR -HER C-MET EGF HGF IGF-1/ Insulin Src Ras Ras Raf MEK Erk I 3 TEN I 2 DK-1 Akt raptor mtor rictor mtor p70s6k 4EB Hif-1α rotein Translation FoxO3a Transcription Angiogenesis Cell Cycle rogression roliferation BAD Apoptosis IRS FGFR FGF VEGF VEGR VEGF mab Bevacizumab Anti-VEGFR Sunitinib ABT869 AZD2171 Anti-HER Lapatinib BMS599626 BMS690514 F00299804 XL647 BIBH2992 ARRY334543 Anti-cMET XL880 ARQ197 F02341066 JNJ388 MGCD265 SU11274 HA665752 HGF mab AMG102 OA5D5 IGF-1 mab C721871 AMG479 IMC-A12 R1507 BIIB022 Anti-IGF-1R XL228 OSI906 NDGA Anti-Src Bosutinib XL999 AZD0530 KX010107 Anti-mTOR Everolimus Deforolimus Anti-Chk-1 UCN01 AZ7762 Anti-Akt erifosine GSK690693 MK-2206 Anti-I3k I103 BGT226 BEZ235 XL765 XL147 Anti-Ras Tipifarnib Lonafarnib BMS214662 Anti-DNMT 5-azacitadine 5-aza-2 - deoxycitidine Anti-HDAC SNDX275 CI994 Apicidin Desipeptide Trapoxin Depeudecin SK7068 Vorinos, tat ro-apoptptics ABT263 AMG655 Anti-FGFR R0438 EGFR mab Cetuximab Anti-Raf Sorafenib RAF265 XL281 LX4032 Anti-MEK AZD6244 RDEA119 XL518 FGFR mab AV-370 2010 Molecular Targets 2015 Drugable Targets? Gandara et al: CLC 2009 Fredrik.Enlund@ltkalmar.se Fig: Adopted from Simon Ekman, KS 2018-12-03
Gliom 1p/19q LOH MGMT-met Lungcancer EGFR (12%) EML4-ALK (4%) ROS/RET/NTKR1 BRAF (1%) Koloncancer KRAS (40%) NRAS/BRAF (5%) Exempel på genetiska biomarkörer Bröstcancer HER2-amplifiering (15-20%) IC3CA mutationer Kronisk Myeloisk leukemi BCR-ABL fusion (90%) Mjukdelstumörer (sarkom) Fusionsgener Hudcancer BRAF(50%) ckit (5%) Ovarietumörer BRCA1/2 Gastroint.stromcancer CKIT/DGFRA1
Cancergenetik (behandlingsvägledning) Utförs lokalt i Kalmar för LtK Men i samarbete med SÖSR
Slutsats 2 av utredningen - cancergenetik Etablera/stärka ett molekylärgenetiskt laboratorium vid Diagnostiskt centrum, HSF för att kunna utföra bl.a. cancergenetiska utredningar inom landstinget
Varför nu - vad är nytt? Nya tekniska möjligheter (NGS-tekniken) + Nya målstyrda behandlingar 2018-12-03 Fredrik.Enlund@ltkalmar.se
Effektivare genetisk analys NGS - Next Generation Sequencing Lab on a chip 1 analys/brunn (6.000.000 brunnar/körning) 2018-12-03 Fredrik.Enlund@ltkalmar.se
Landstinget i Kalmar har sedan i söndags en NGSutrustning och även en anställd expert på cancergenetik med NGS NGS-låneutrustning från Sahlgrenska Universitetssjukhus Carola Andersson, Molekylärbiolog DC. LtK NGS-utrusning GM
Konceptet Genomic Medicine Sweden (GMS) 2018-12-03 Fredrik.Enlund@ltkalmar.se Gemensam nationell infrastruktur med regionala medicinska genomikcentra Figur från Richard Rosenqvist Brandell, KI
GMS i interaktion tillsammans med SÖSR Genomic Medicine Sweden Figur från Richard Rosenqvist Brandell, KI
Slutsats av utredningen o Tätare samarbete med klinisk genetik i Linköping o Etablera en filial för genetisk mottagning vid LSK o HSF bör anställa en genetisk samordnare som koordinerar de ärftliga utredningarna inom LtK o Etablera/stärka ett molekylärgenetiskt laboratorium vid Diagnostiskt centrum, HSF, för att kunna utföra bl.a. cancergenetiska utredningar inom landstinget o Samverka med Nationellt initiativ GMS/GMC via Linköping Uppskattad total kostnad 2019/20 - ca 5.000 tkr/2.600 kr
Utmärkta möjligheter att bli det andra regionsjukhuset i Sverige som etablerar NGSteknik i sjukvårdsdiagnostik Möjligheter för sjukvården Teknisk utrustning NGS Teknisk nationell toppkompetens Intresserade läkare inom LtK Hemtagning av externt utförda analyser Kostnadsneutralt inom 2 år Bättre diagnostik för patienten Målstyrd cancerbehandling Exaktare cancerdiagnostik Förkortade ledtider från diagnos till behandlingsstart för tumörsjukdom Exaktare smittspridningsanalys och t.ex. MRSA-bestämning