Stomach Biopsy Cohort en nationell studie om Helicobacter pylori och dess betydelse i utvecklingen av magcancer

Transkript

1 Stomach Biopsy Cohort en nationell studie om Helicobacter pylori och dess betydelse i utvecklingen av magcancer Joar Franzén Doktorand Institutionen för Medicinsk Epidemiologi och Biostatistik Karolinska Institutet

2 Vem är jag? Joar från Gotland Karolinska Institutet Bachelor i Biomedicin 2014 Master i Biomedicin 2016 Doktorand Weimin Ye s grupp sedan 2017 Bild från: maps.google.com,

3 Bakgrund Magcancer Epidemiologi Incidens i Sverige : 5 te vanligaste cancern (2012) 2-2 dra ledande orsak till cancerrelaterad dödlighet (2012) - Incidensen för Atrofisk Gastrit ökar 1. Statistikdatabas för cancer [Internet]. [cited 2017 Nov 7]. Available from: 2. Worldwide data World Cancer Research Fund International [Internet]. [cited 2017 Nov 20]. Available from:

4 Bakgrund Magcancer Kliniska egenskaper Symptom Diagnos - biopsier Behandling Prognos Bild från:

5 Bakgrund Magcancer Anatomi och Provtagning Fundus Cardia Corpus Pylorus Antrum Bild från:

6 Bakgrund Magcancer Riskfaktorer Helicobacter pylori Upp till 80% infekterade, varför utvecklar endast 2-3% magcancer? Rökning Strålning Diet Tabell från: Textbook of Cancer Epidemiology, Chapter 10, Adami et Al

7 Bakgrund Magcancer Cancerprogression - Correa s Kaskad Fundus Cardia Corpus Pylorus Antrum Bild från:

8 Bakgrund Magcancer Cancerprogression - Correa s Kaskad Non-atrophic Gastritis Intestinal Metaplasia Stomach cancer Normal Gastric Mucosa Multifocal Atrophic Gastritis Dysplasia Bilder från Fig 1: Fox J, C Wang T. Dietary Factors Modulate Helicobacter-Associated Gastric Cancer in Rodent Models. Toxicologic pathology Dec 3;

9 Vad är Stomach Biopsy Cohort (SBC)? Magcancer näst dödligaste cancern Helicobacter pylori involverad i flesta (alla?) fall Å andra sidan, en övervägande majoritet av de infekterade med Helicobacter pylori utvecklar inte cancer Skiljer sig cancerrisken mellan olika stammar av H. pylori? 14/10/2015 9

10 Hur studerar vi detta? Jämföra bakterieflora mellan magcancerpatienter och kontroller?

11 Hur studerar vi detta? Problem: Cancer Påbörjas År Senare Cancer Mikrobiom Bilder från:

12 Biopsy Cohort Stomach SBC-studien som tidsmaskin

13 Studiepopulation Stomach Biopsy Cohort Från individer: 796 cancerblock 4610 block totalt

14 Metod Snittning av block Få snitt från biobankerna/snitta block

15 Metod Anrikning av Helicobacter pylori Immunohistokemi av Helicobacter pylori Lasermikrodissektion Bild från:

16 Metod Laborativa processen DNA-extraktion Helgenomsamplifikation med Sigma WGA4 Förbereder för sekvensering med Nextera Sekvenserar med Illumina MiSeq Analyserar resultat

17 I vilket stadie är vi nu? Provinsamling Pilotstudie med Stockholmsavdelningen 14/10/

18 Stomach Biopsy Cohort Varför är det viktigt? Magcancer näst dödligaste cancern Antibiotikaresistens ökar kraftigt Tidig upptäckt och eradikering av cancerorsakande H. pylori kan rädda och motarbeta onödig användning av antibiotika Framtiden: lära oss om etiologin och drivkrafterna bakom magcancer

19 Tack så mycket för er uppmärksamhet!

20 Metod Patologanalys för val av block Vi begär diagnosglas Patolog analyserar och väljer ut block baserat på Sydney- Systemets kriterier

21 Metod Snitt Om det inte finns tillräcklig material för snittning: Skippa snitt 9-15, snitt 1-8 är de essentiella snitten för studien Finns andra block från samma biopsitillfälle med mer material? Om kontroll: se om vi kan byta mot annan kontroll