16 januari, Bästa therascreen pyrosekvenseringskund,

Transkript

1 QIAGEN GmbH QIAGEN Strasse Hilden Germany 16 januari, 2018 Brådskande fältsäkerhetsmeddelande: therascreen KRAS Pyr Kit (24) CE (REF ), therascreen BRAF Pyr Kit (24) CE (REF ), therascreen EGFR Pyr Kit (24) CE (REF ), therascreen GIST RapidScreen Pyr Kit (REF ), therascreen NRAS Pyr Kit (24) CE (REF ), therascreen RAS Extensin Pyr Kit (REF ), PyrMark Gld Q24-reagenser (5 x 24) CE (REF ) Bästa therascreen pyrsekvenseringskund, Med detta brådskande fältsäkerhetsmeddelande vill vi infrmera m att vi har identifierat ett ökat antal fall med förändrade prprtiner i pyrgrammens tppmönster vid therascreen pyrsekvenseringsanalyser. Användning av de prduktlter sm anges nedan förknippas med en ökad andel giltiga resultat ch behv av ny testning. Användning av de prduktlter sm anges nedan skapar ckså en högre risk för A59T falskt psitiva resultat vid pyrsekvenseringsanalys av NRAS kdn 59 med therascreen RAS Extensin Pyr Kit (REF ). För andra mutatiner i therascreen RAS Extensin Pyr Kit eller andra therascreen Pyr Kit förekmmer inga tecken på ökad risk för sådana falska psitiva resultat. Enligt vår utredning gäller prblemet vissa lter av PyrMark Q24 Gld-reagenser (art. nr ) enligt listan nedan. De förekmmer i flera lter med therascreen pyrbuffertar ch -reagenser (art. nr ) sm levereras med CE-märkta IVD therascreen Pyr Kit sm anges i rubriken van. Alla prduktlter lanserades i enlighet med QC-specifikatinerna. Enligt våra register har du fått minst ett kit med de berörda prduktlterna. Översikt över berörda material: Material Ltnr (LOT) Ingår i Lter PyrMark Gld Q24 Reagents (Mat. N ) therascreen Pyr , Buffers and Reagents (Nº Mat ) , , , PROM

2 Beskrivning av prblemet Vid pyrsekvensering med det berörda materialet ökas tpphöjden för datp-tppar i pyrgram artificiellt medan tpphöjden för dgtp kan minskas parallellt med detta. Det kan rsaka förändrade prprtiner mellan tpphöjderna vilket i sin tur leder till felaktig fastställning av frekvensen av allelmutatin. Om den fastställda frekvensen av allelmutatin överskrider detektinsgränsen (limit f detectin, LOD) kan det rsaka en felaktig manuell eller autmatisk angivelse av mtsvarande ptentiella lågnivåmutatiner eller i vissa fall en mutatin av pyrsekvenseringsprgrammet. Felet kan även påverka kvalitetsbedömningen via mtsvarande algritmer i pyrsekvenseringsprgrammet. Felet påverkar avhängigt vildtypskntrller (wild type, WT) ch kända prver. För alla analyser utm NRAS59 leder detta inte, såvitt vi vet, till någn ptentiellt ökad frekvens av falska psitiva resultat vid bedömning av pyrsekvenseringsresultat sm görs i enlighet med mtsvarande bruksanvisning. För samtliga analyser kan det dck finnas ett ökat behv av att göra m analysen i dessa fall. Vid mutatinsresultat i NRAS kdn 59-mutatiner (A59T) i berörda lter: Sannlikheten för en mutatin A59T med mutatinsallelfrekvens under 15 % ökar, medan WT-kntrllen är giltig (ingen mutatin har upptäckts) ch kvalitetsberäkningen påverkas inte. Åtgärder sm ska vidtas av kunden/användaren Säkerställ att analysens mtsvarande plugin-rapprter för autmatiserad resultattlkning används. Dessa plugin ger ckså exempel på pyrgram för att göra det enklare att identifiera avvikelser i tppmönstret. Aktuella plugin kan hämtas direkt från QIAGEN:s företagswebbplats ( på sidan (sidrna) m relaterade prdukter, genm att gå till fliken Prduct Resurces (Prduktresurser), i avsnittet Analysis Sftware (Analysprgram). Om du har kvar prdukter från de berörda lterna ska du inte använda dem. Kntakta vår tekniska service för att få kstnadsfria ersättningsprdukter för de Pyrmark Gld-reagenslter sm du har kvar. Ange ltnummer för Pyrmark Gld, samt referensnummer ch kitnamn för therascreen-kitet. Uppge ckså en exempelfil på en pyrkörning med krrekt etiketterade kända prver ch WT-kntrller. Om du har använt de berörda lterna rekmmenderar vi starkt att de aktuella resultaten granskas. För att identifiera prblemet med det förändrade tppförhållandet i pyrsekvenseringskörningarna ska du använda följande kriterier: Att ett högre antal DNA-prver med WT-kntrll än vanligt hamnar över LOD ch leder till ptentiell lågnivåmutatin eller mutatin är ett tecken på detta fel. Att ett högre antal prver än vanligt flaggas med försämrad kvalitetsbedömning sm check (kntrllera) eller failed (misslyckades) enligt den autmatiska bedömningsalgritmen i prgrammet är ett tecken på detta fel. 2

3 En högre detektinsfrekvens än genmsnittet för ptentiell lågnivåmutatin eller mutatin för kända prver jämfört med den naturliga förekmsten av denna mutatin i den cancersjukdm ch den etnicitet sm undersöks. Den naturliga förekmsten av vissa mutatiner sm analyseras genm pyrsekvensering kan ligga under 5 %. Eventuell ökad frekvens av mutatin för sådana sällsynta varianter (t.ex. flera förekmster under en krt tidsperid) kan vara ett tecken på prblemet). Förekmst av flera (2 eller fler) mutatiner eller ptentiella lågnivåmutatiner i lika kdn på samma gen från samma prv kan vara ett tecken på prblemet. Om du identifierar prblemet med hjälp av ett eller flera av vanstående kriterier rekmmenderar vi starkt att de berörda pyrsekvenseringsresultaten bedöms en gång till. Följ nggrant tlkningen av analysresultat enligt beskrivningen i mtsvarande bruksanvisning till therascreen Pyr Kit ch var uppmärksam på bservatinerna nedan ch mtsvarande åtgärder: Ny bedömning Observatin Åtgärd för prver med A59T-mutatin under 15 % mutatinsfrekvens för NRAS59 1. Ny bedömning av WTkntrller berende av mutatinsresultatet för ett känt prv 2. Ny bedömning av kända prver med mutatinsallelfrekvens mellan LOD ch 15 % mutatinsfrekvens men med giltiga WT-kntrllresultat Detekterad mutatinsfrekvens för någt DNA med WT-kntrll i en körning ligger över LOD. Det leder till en ptentiell lågnivåmutatin eller mutatin för denna WTkntrll. 1) De uppmätta tpparna i pyrgrammet matchar inte höjden på histgramstaplarna ch kan inte förklaras av sällsynta eller väntade mutatiner. Om du använder autmatiserade rapprtplugin kan du jämföra varje enskilt pyrgram med ett exempelpyrgram för att identifiera sådana avvikelser. 2) Ett ökat bakgrundsvärde för en mutatin sm anges av allelfrekvenser för DNA med WT-kntrll mellan blankgränsen (LOB) ch detektinsgränsen (LOD) enligt handbken för denna mutatin. Enligt bruksanvisningen är körningen giltig för denna analys. För eventuell ny testning, använd nya, utbytta PyrMark Q24 Gldreagenslter. Var medveten m att risken är större för falska psitiva resultat. Kntrllera alla psitiva resultat för A59T mutatin ch ptentiell lågnivåmutatin under 15 % allelfrekvens ch där minst en av bservatinerna föreligger, genm att testa igen med nya, utbytta Pyrmark Gldreagenslter. Om ny testning inte kan genmföras ska du bedöma varje fall individuellt. Åtgärd för andra therascreen-analyser Enligt bruksanvisningen är körningen giltig för denna analys. För eventuell ny testning, använd nya, utbytta PyrMark Q24 Gldreagenslter. Om de analyseras i enlighet med bruksanvisningen behövs ingen ytterligare testning för att bekräfta. 3

4 Läs igenm detta meddelande tillsammans med din labratriechef/medicinska chef. VIKTIGT: Vidarebefrdra denna infrmatin till alla individer ch avdelningar inm rganisatinen sm använder de kit sm anges van. Om du inte är slutanvändaren ska du vidarebefrdra detta meddelande till prduktens slutanvändare. Om du är en handelspartner måste du vidarebefrdra denna infrmatin till dina kunder. Kassera prdukten i enlighet med natinella ch lkala föreskrifter m säkerhet ch miljöskydd. Fyll i mttagningskvittt sm medföljer detta brev. Handelspartners: Avbryt distributinen av de prdukter sm angetts i det här meddelandet. Vidarebefrdra denna infrmatin till dina kunder. Kntrllera att dina kunder har fyllt i mttagningskvittt. Ifyllning av mttagningskvitt För att säkerställa att alla berörda användare har meddelats, ch i enlighet med tillämplig natinell lagstiftning, är vi skyldiga att tillhandahålla myndigheterna ett bevis på att marknaden har mttagit detta meddelande. Därför ber vi dig att fylla i ch underteckna det medföljande mttagningskvittt senast den 29 januari 2018 ch skicka det med e-pst till: quality.cmmunicatins@qiagen.cm. Åtgärder sm QIAGEN har vidtagit Det återstående lagret av det berörda materialet har blckerats vid alla QIAGEN:s lager. Sm en medelbar krrigerande åtgärd har ett ytterligare kvalitetskntrlltest införts för alla PyrMark Gldreagenslter. Den underliggande rsaken till prblemet utreds för tillfället. Vi ber m ursäkt för de eventuella lägenheter detta kan ha gett upphv till ch tackar på förhand för din förståelse ch ditt samarbete. Kntakta QIAGEN:s lkala tekniska serviceavdelning m du har några frågr. Kntaktinfrmatin finns på följande webbsidr: Dtterblag till QIAGEN: Handelspartner till ch imprtörer av QIAGEN: Med vänlig hälsning, QIAGEN 4

5 Brådskande fältsäkerhetsmeddelande: therascreen KRAS Pyr Kit (24) CE (REF ), therascreen BRAF Pyr Kit (24) CE (REF ), therascreen EGFR Pyr Kit (24) CE (REF ), therascreen GIST RapidScreen Pyr Kit (REF ), therascreen NRAS Pyr Kit (24) CE (REF ), therascreen RAS Extensin Pyr Kit (REF ), PyrMark Gld Q24-reagenser (5 x 24) CE (REF ) Mttagningskvitt (Fyll i frmuläret med versaler ch ange med ett X att du har följt varje anvisning.) Vi har vidtagit de nödvändiga åtgärder sm rekmmenderas i meddelandet: Vi har inte använt några kvarvarande uppsättningar av de berörda lterna. Om vi har använt de berörda lterna har vi granskat de aktuella resultaten. Vi har övervägt att analysera A59T-mutatinsprver med mutatinsfrekvenser på under 15 %. Vi har läst igenm detta meddelande tillsammans med vår labratriechef/medicinska chef. Meddelandet har vidarebefrdrats till alla individer ch avdelningar inm rganisatinen sm använder dessa prdukter. Vi har kasserat den berörda prdukten i enlighet med natinella ch lkala föreskrifter m säkerhet ch miljöskydd. Handelspartners: Vi har avbrutit distributinen av de berörda prdukterna. Denna infrmatin har vidarebefrdrats till våra kunder/partners. Vi har kntrllerat att våra kunder har fyllt i mttagningskvittt. Labratriets namn: Adress: Kntaktpersn: Titel: E-pstadress: Telefnnummer: Namnteckning: Datum: 5