Sören Andersson. Professor, prefekt, överläkare. Institutionen för medicinska vetenskaper Örebro universitet & Laboratoriemedicin, Region Örebro län

Relevanta dokument
Droplet Digital PCR Ny metod för identifiering och kvantifiering av HTLV

Equalis kvalitetssäkringsprogram 2018

Gastro och lite annat

Ackrediteringens omfattning, klinisk mikrobiologi

Komponent/Undersökning System/Provtyp Metod/Mätprincip Utrustning Enhet

Kvalitetssäkring och Validering Molekylära Metoder. Susanna Falklind Jerkérus Sektionen för Molekylär Diagnostik Karolinska Universitetslaboratoriet

Ackrediterade analyser klinisk mikrobiologi

Ackrediterade analyser klinisk mikrobiologi

Ackrediterade analyser klinisk mikrobiologi

Quantiferon-TB Gold Plus

Screening av blodburna infektioner. HIV-screening, gammal och ny metodik

CMV/EBV Molekylär diagnostik. Annika Allard Klinisk Mikrobiologi/Virologi Norrlands Universitetssjukhus

Analyser klinisk mikrobiologi, centrallaboratoriet Aleris Medilab

L 39/34 Europeiska unionens officiella tidning BESLUT KOMMISSIONEN

Växt/ Ingen växt Respektive Bakterier/ Ej. bakterier - CFU <15 CFU CFU >100 CFU. - Växt/ Ingen växt - Kalmar

Växt/ Ingen växt Respektive Bakterier/ Ej. bakterier - CFU <15 CFU CFU >100 CFU. - CFU/mL 1x10 3-1x10 4 1x10 4-1x10 5 >1x10 5

Omfattning Legionella pneumophila, Chlamydophila psittaci, Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, m fl.

2 Biobanken - VIP-prov i blå Sofiabox till Biobanken norr

System Metod/ Mätprincip Utrustning Enhet undersökning Rubellavirus Anti-Rubella IgG. Blod Antikropps-bestämning (IgG)

Meddelande 6/2011. Från Unilabs Laboratoriemedicin Sörmland. Klinisk mikrobiologi

Bakterier (patogena) /jästsvamp Sekret urogenitalia allmän odling Örebro Växt/ ingen växt Bakterier, faecespatogena

Syfilis - diagnostik och fallbeskrivning Owe Källman, överläkare Specialistläkare i klinisk bakteriologi, klinisk virologi och infektionssjukdomar

Chlamydophila pneumoniaeantikroppar

Ackrediteringens omfattning

Mononukleostest, S- Rapportnamn. Provmaterial. Utförande. Typ av provmaterial. Typ av provrör och tillsatser. Provvolym. Provberedning och förvaring

Syfilis (lues) orsakas av syfilisspiroketen (Treponema pallidum). Vid syfilis bildas olika antikroppar mot den infekterande

3/20. Meddelande /2014. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Stockholm, gällande fr o m

Ackrediteringens omfattning Aleris Medilab, Klinisk mikrobiologi, Täby

- Sänkt pris för B-PEth den bästa alkoholmarkören. - Ändrade referensintervall för barn och vuxna: P-Kreatinin P-Ferritin P-Järn P-Transferrin

7/201. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Stockholm gällande fr.o.m

Meddelande 5/201. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Stockholm. Klinisk kemi. Metodbyte ANCA - serologi. Metodbyte antikroppar mot kardiolipin

Laboratorienytt. Nr 3, Maj Innehåll: Klinisk Mikrobiologi. - Ändrad analysmetod för streptokockserologi

Datum Diarienr: SkaS /2016. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Västra Götaland gällande fr.o.m

Prislista Klinisk mikrobiologi

FilmArray - helautomatiserad multiplex likvordiagnostik

Ackrediteringens omfattning Klinisk mikrobiologi

Ackrediteringens omfattning Klinisk mikrobiologi och imunologi

Laboratorienytt. Innehåll: Nr 1, Januari Klinisk Mikrobiologi

/2014. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Västra Götaland gällande fr.o.m (om inget annat datum anges i texten)

Chagas sjukdom: Aktuell serologisk diagnostik

Ackrediteringens omfattning Unilabs AB, Laboratoriemedicin, molekylärbiologi 1329

COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan HBV Test, version 2.0

Ackrediteringens omfattning

Laboratorienytt. Nr 3, Maj 2017, version 2 med tillägg från klinisk kemi, NUS. Innehåll: Klinisk Mikrobiologi

Kontaktuppgifter och tillgänglighet. Huvudansvarigt NRL Karolinska Universitetssjukhuset Klinisk mikrobiologi Verksamhetschef Tobias Allander

Varför vill vi veta något om vilka patogener som finns i avloppsvattnet och hur gör vi?

Datum /2016. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Sörmland gällande fr.o.m

Meddelande 8/2010. Från Unilabs Laboratoriemedicin Sörmland. Klinisk kemi. Hantering av spinalvätskeprover.

Laboratorienytt. Innehåll: 2 Klinisk Patologi. - Telefontider - Öppettider. 3 Klinisk Kemi

Metod/Mätprincip Utrustning Enhet Lab/Ort Bihålesekretodling Sekret Speciell odling/ VITEK MS Biomerieux Växt av/ingen växt

Nationellt referenslaboratorium (NRL) för retrovirus (HIV-1, HIV-2, HTLV-I/II)

Biobankning av mikrobiologiska prover en resurs för klinisk forskning

/2012. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Västra Götaland - gällande fr.o.m (om inget annat datum anges)

Hepatit C Smittspårning efter blodtransfusion Ann Söderström Smittskyddsläkare Västra Götalandsregionen

PROVTAGNINGSANVISNINGAR

Bakteriologiska undersökningar

Landstinget Dalarna 1(10) Laboratoriemedicin Nyhetsblad nr 5 SEPTEMBER 2013

Bakterier, allmän diagnostik

Koagulationsanalyser. Serumanalyser, används endast i undantagsfall inom landstinget Dalarna.

Läkarrollen vid ett kliniskt mikrobiologiskt laboratorium

/2013. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Västra Götaland, - gällande fr.o.m (om inget annat datum anges)

Landstinget Dalarna 1(5) Laboratoriemedicin, Patologi och Cytologi Nyhetsblad 5 APRIL 2017

lokaler, kroppsvätskor, främmande kroppar, kateterspetsar, ögonsekret mm Bakterier och jästsvamp Blod, blodpåsar 0173 Allmän odling Växt/Ingen växt

AMA + SMA AMASMA SST rör gul kork

HCC-övervakning (surveillance)

Kvalitativa undersökningar. uppskattning och kontroll av. osäkerhet inom Laboratoriemedicin

Användning av hiv snabbsvarstester; När? Var? Hur? Varför?

Aeromonas Faeces Specifik odling Kvalitativ Lund

Provtagningsanvisning Diarienr: Ej tillämpligt 1(5)

Prov kommer inte analyseras om det inte transporteras med en ytterburk som även den märks med patient id!

lokaler, kroppsvätskor, främmande kroppar, kateterspetsar, ögonsekret mm Bakterier och jästsvamp Blod, blodpåsar 0173 Allmän odling Växt/Ingen växt

/2012. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Västra Götaland - gällande fr.o.m (om inget annat datum anges)

Från Unilabs Laboratoriemedicin, Stockholm gällande fr.o.m (om inget annat datum anges i texten)

Laboratorium för klinisk Mikrobiologi 1 Borås Lasarett Utgiven

Ackrediteringens omfattning

Molekylärbiologisk diagnostik av tarmparasiter

Tentamen i Immunteknologi 28 maj 2003, 8-13

Cirkulerande cellfritt DNA

Varför vill vi veta något om vilka patogener som finns i avloppsvattnet och hur gör vi?

Validering och Verifiering: Vad är det och hur bör det utföras? Kerstin Elvin EQUALIS användarmöte 18 april 2013

Innehåll i mikrobiologens beställarkatalog Cambio Cosmic (observera att grupp 13 saknas!).

Hepatit B och C. Smittspårningsutbildning 10 november 2011 Staffan Sylvan. Smittskyddsenheten

BDD-studien. när forskning blir klinisk rutin. ANDIS-dagen 22 mars Annelie Carlsson

Datum Diarienr: SkaS /2014

Landstinget Dalarna 1(7) Laboratoriemedicin Nyhetsblad nr 1 FEBRUARI 2009

Ansvarig utgivare: Verksamhetschefer 1(6) Redaktör: Carina Wallner Labnytt nr 10, november 2017

Aptima HCV Quant Dx Assay

Omfattning Campylobacter, Salmonella, Shigella, Yersinia non-pestis, Vibrio cholerae, EHEC. Dessutom ingår Helicobacter.

Ackrediteringens omfattning

Nationellt referenslaboratorium (NRL) för Herpesvirus (HSV-1, HSV-2, VZV, CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8, HVS)

Medicinsk service Labmedicin

Vaksiner og framtidens diagnostikk. Johan Berglund Professor, MD, PhD

Polymerase Chain Reaction

update Epigenetik Genekspression Go with the Flow våren 2014 Den kompletta verktygslådan Se sid 2 Från cell och kärna till high throughput Se sid 6-7

Från Unilabs Laboratoriemedicin, Stockholm gällande fr.o.m (om inget annat datum anges i texten)

Patientsäkerhet Provtagning skall ske i enlighet med SOSFS 2007:21 Provtagning för blodgruppering och BAS-test (förenlighetsprövning) skall ske vid

Diagnostik av subarachnoidalblödning ur laboratoriets synvinkel. Peter Ridefelt Klinisk kemi och farmakologi, Akademiska sjukhuset, Uppsala

Utvärdering av HTLV-I/II ELISA 4.0 (MP Diagnostics)

1/20 /2013. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Stockholm, gällande from

Provtagningsanvisningar Norovirus (Calicivirus) Avgränsning/Bakgrund. Provtagning. Ange på remissen

Transkript:

Konfirmation av HIV och HTLV Sören Andersson Professor, prefekt, överläkare Institutionen för medicinska vetenskaper Örebro universitet & Laboratoriemedicin, Region Örebro län

Diagnostiska principer HIV & HTLV Screening Enkel, storskalig, billig [Enzyme Immunoassay (EIA, ELISA etc)] Konfirmation Avancerad, detaljerad, kostsam [Western blot, Line immunoassay, PCR]

Screeningmetoder HIV kombination antikropp/antigen HTLV endast antikroppar

HIV-1 Western blot

Inno-LIA HIV I/II score

Resultat Inno-LIA HTLV Synliga band Resultat Inga synliga band Negativt för HTLV-antikroppar Ett synligt band ( +/-) - p19 I/II eller p24 I/II eller gp46 I/II Negativt för HTLV-antikroppar - gp 21 I/II Indeterminant Två synliga band ( +/-) - Exklusive gp21 Indeterminant - Inklusive gp21 Positivt för HTLV-antikroppar Tre eller fler band ( +/-) Positivt för HTLV-antikroppar

HIV konfirmering 2015 Av 12 lab knutna till Equalis använder 10 Inno-LIA och 2 Geenius

Geenius HIV 1/2 confirmatory system (BIO RAD 2015). 9 HIV-2 (2 dubbelinfektion HIV-1 och HIV-2) alla korrekt detekterade, men relativt hög korsreaktivitet med HIV-1?

Geenius HIV-1/2 confirmatory assay Konfirmering och differentiering mellan HIV-1 och HIV-2 Rekomb & syntetiska peptider 20-30 minuter Serum, plasma, helblod

WHO rekommendationer för HIVkonfirmering Prevalens <5% - tre sekventiella tester, helst kombotest (ag/ak) först Prevalens >5% - två sekventiella tester Testerna ska helst ha olika principiell uppbyggnad olika antigener Consolidated Guidelines on HIV Testing Services. WHO 2015

WHO rekommenderad HIV-teststrategi för lågprevalenta områden (<5%) WHO 2015

HIV kombotest Antigen vs antikroppar måste utredas - Antigentest - PCR (NAT)

AmpliSens HCV/HBV/HIV-FRT realtime PCR Multiplex Kvalitativ detektion av blodburna virus Vävnadsdonation, t ex bendonatorer SoS föreskrift om 180 dagars karantän Nationellt initiativ

Analysens känslighet (Amplisens multiplex) IU/mL Ct HBV-DNA 263 000 11,77 Sp 1/10 26 300 15,04 1/100 2630 18,11 1/1000 263 22,01 1/10 000 26,3 24,02 1/10 5 2,6 27,71 1/10 6 0,26 29,71 1/10 7 0,026 Neg 1/10 8 0,0026 Neg c/ml ct HIV-RNA 1 500 000 Sp 1/10 150 000 20,4 1/100 15 000 23,67 1/1000 1 500 26,26 1/10 000 150 29,07 1/10 5 15 30,53 1/10 6 1,5 31,45 1/10 7 0,15 Neg IU/mL Ct 453000 HCV-RNA 0 Sp 1/10 453000 14,92 1/100 45300 18,77 1/1000 4530 21,41 1/10000 453 24,33 1/10 5 45,3 27,28 1/10 6 4,53 29,05 1/10 7 0,453 Neg

HCV NIBSC 06/102 Dilution Quantity IU/mL Ct 1/10 1 26 000 19.25 1/10 2 2600 22.42 1/10 3 260 25.75 1/10 4 26 27.98 1/10 5 2,6 30.78 1/10 6 0,26 Negative HBV NIBSC 10/264 Dilution Quantity IU/mL Ct 1/10 1 85 000 18.80 1/10 2 8500 22.83 1/10 3 850 25.43 1/10 4 85 28.83 1/10 5 8,5 29.62 1/10 6 0,85 31.05 NIBSC WHOstandards HIV NIBSC 10/152 Dilution Quantity IU/mL Ct 1/10 1 18 500 23.95 1/10 2 1850 26.27 1/10 3 185 29.56 1/10 4 18,5 31.04 1/10 5 1,85 Negative 1/10 6 0,185 Negative

Analysen infördes sept 2013 EDTA-plasma, minst 2 ml plasma. Skickas inom 48 timmar, vanlig post. Om provet centrifugeras och plasma avskiljes kan det stå i kyl upp till 5 dygn, skickas med vanlig post. Om längre förvaring fryses plasman i -70 C, skickas fryst. Analys utförs c:a 1 gång per vecka (vanligen onsdag) Svaras Negativ om samtliga agens är ej detekterbara, Positiv, med uppgift om agens om reaktiv. Papperssvar. Remiss finns att hämta: http://www.orebroll.se/filessv/uso/kliniker_enheter/laboratoriemedicin/provtagningsanvisningar /Remisser/AnabestSpecialus.pdf Rör märkes med personnummer, gärna streckkod.

DxN VERIS System (Beckman Coulter) Helautomatisk PCR för kvantitativ bestämning av HIV RNA HCV RNA HBV DNA CMV DNA Kan stå på bana Utvärderas nu i Örebro

Hologic Panther Gen-Probe GC HPV Chlamydia HIV

Referensdiagnostik för HLTV i Örebro 2012-15 Totalt antal prover 440 Negativa 291 Positiva 72 HTLV-1 60 HTLV-2 8 Ej typbara 4 Ej bedömbara (ID) 136

Ej bedömbara (indeterminanta) HTLV som följts upp Minst ett nytt prov 1 mån - > 1 år 27 individer Alla testade serologiskt, 15 med PCR Ingen blev positiv Oförändrat serologiskt PCR 10 negativa Negativa serologiskt Endast serologi 4 PCR + serologi (neg) 5 18 individer 9 individer

Prestanda i HTLV-diagnostiken Antal testade per år (ca) Nya blodgivare 40 000 IVF-utredningar 10 000 Klinik, övr 5 000 Totalt 55 000

Prestanda i HTLV-diagnostiken Ca 100 st ej bedömbara per år av ca 55 000 testade Specificitet 99,8% Positivt prediktivt värde 17% (andelen sant positiva av de som testats positivt i screening)

HTLV ej bedömbara Av prover skickade för konfirmering till Universitetssjukhuset, Örebro 80 70 60 50 40 30 End gp21 Alla med gp21 Tot ej bedömbara 20 10 0 2012 2013 2014 2015 Totalt

Samtliga ej bedömbara HTLV-prover 2012-15 Endast Alla med Ogiltiga gp46 + Gp46 + gp46 + gp21 + p19 + Summa ej gp21 gp21 Buffertband kontrollband gp21 p24 p19 p19 gp46 p24 bedömbara 2012 5 7 2 2 16 2013 9 10 2 2 1 1 1 26 2014 15 17 1 1 2 36 2015 22 26 3 2 4 1 58 Totalt 2012-15 51 60 4 4 2 2 4 7 1 1 136 Utreds vidare i ett studentprojekt vt 2016

HTLV PCR Internationellt referenslab: Imperial College at S:t Mary s Hospital, London (Prof Graham Taylor) Filterpapper Kvalitativ och kvantitativ Typning (HTLV-1 resp 2) I Örebro satt upp en PCR på digital droplet PCR plattform 2015 Kvantitativ (och kvalitativ) Typning Kvantifiering utan standardkurva Utbyte London/Örebro för kvalitetssäkring

Sammanfattning Enklare robusta metoder Automation Multiplex