KLINISKA ASPEKTER PÅ VIRALA MULTIPLEX- PANELER NICKLAS SUNDELL INFEKTIONSKLINIKEN SAHLGRENSKA UNIVERSITETSSJUKHUSET / ÖSTRA

Relevanta dokument
Diagnostik av luftvägsinfektioner i Umeå. Urban Kumlin Klinisk mikrobiologi Umeå 2016

Ingående agens i Luftvägspanel 17 agens analyserat med FilmArray

Pneumoni - diagnostik och behandling hos immunkompetenta

Respiratory Viruses Associated with Community-Acquired Pneumonia in Children Matched Case-Control Study

Nedre luftvägsinfektioner hos barn och vuxna. Carl Spindler Karolinska Universitetssjukhuset 2013

EQUALIS användarmöte patientnära analyser Sara Karlsson Söbirk Klinisk mikrobiologi Lund / Infektionskliniken Helsingborg

Virusinfektioner hos immunsupprimerade. Infektionsläkareföreningens Vårmöte Maj 2012 Maria Rotzén Östlund Malin Ackefors

FilmArray - helautomatiserad multiplex likvordiagnostik

Mikrobiologisk diagnostik av sjukhusförvärvad pneumoni

Nedre luftvägsinfektioner. Katarina Hedin specialist i allmänmedicin, docent Växjö

Ny faecesdiagnostik med PCR

Infektionsbenägenhet och vaccinationer

Projektplan Fynd av bakterier och virus vid halsont hos barn mellan 0 och 14 år

Chlamydophila pneumoniaeantikroppar

PCP, Aspergillus och Candida

RATIONELL DIARRÉUTREDNING (HOS VUXNA )

FilmArray. Magnus Lindh Equalismöte

Ackrediteringens omfattning Unilabs AB, Laboratoriemedicin, molekylärbiologi 1329

Antibiotikabehandling på sjukhus vid samhällsförvärvad pneumoni

STRAMA 2004 Luftvägsinfektioner hos vuxna

Svar från mikrobiologenur labbets och klinikens perspektiv

Sjukhusförvärvad pneumoni - behandlingsrekommendation

Luftvägsinfektioner Folke Lagerström Vivalla VC

a. Låg risk för smitta om fästingen avlägsnas från huden inom 24 timmar

Gastro och lite annat

Sjukhusförvärvad pneumoni Nya behandlingsrekommendationer från Läkemedelsverket

Optimalt omhändertagande av pneumonipatienter. Jessica Kaminska

MCQ Nr... Facit. (max 20p) (7) Flera rätta svar. 1. Vilka av dessa antibiotika har vanligtvis effekt mot pseudomonas aeruginosa?

Enterovirus D68 diagnostik vid utbrott. Malin Grabbe Klinisk mikrobiologi, Solna Karolinska Universitetslaboratoriet

Influensarapport vecka 45 Säsongen

Influensarapport för vecka 44, 2016 Denna rapport publicerades den 10 november 2016 och redovisar influensaläget vecka 44 (31 oktober 6 november).

Candida- Hur optimera diagnostik och behandling på IVA? Symposium Infektionsveckan och mikrobiologiskt vårmöte Karlstad 2018

Strama för sjuksköterskor

Diskussion kring tonsilliter. Pär-Daniel Sundvall, allmänläkare Jesper Ericsson, infektionsläkare

Influensarapport för vecka 14-15, 2018 Denna rapport publicerades den 19 april 2018 och redovisar influensaläget vecka (2 15 april).

MIKR BLADET. Nr

Calicivirus och andra virus. Kjell-Olof Hedlund Enheten för Speciell Diagnostik Smittskyddsinstitutet

Provtagningsanvisningar Norovirus (Calicivirus) Avgränsning/Bakgrund. Provtagning. Ange på remissen

Powerpointpresentation som kan användas vid fortbildning av vårdcentralens personal. Anteckningarna under bilderna är ett stöd för den som håller i

Antibiotikabehandling på sjukhus vid samhällsförvärvad pneumoni

Herpes simplexmeningit

Mässling. primärinfektion eller genombrottsinfektion? -erfarenheter från utbrottet i Göteborg 2017/2018

Akut otit. Janne Friis-Liby Avdelningen för ÖNH-sjukdomar, Sahlgrenska Akademin vid Göteborgs Universitet & Liby&Rönndahl läk.mott

Varför vill vi veta något om vilka patogener som finns i avloppsvattnet och hur gör vi?

Rapport från Pneumoniregistret för år 2008

Övre luftvägsinfektioner hos barn

Influensarapport för vecka 18-19, 2018 Denna rapport publicerades den 17 maj 2018 och redovisar influensaläget vecka (30 april 13 maj).

Vanligaste odlingsfynden i primärvården. Martin Sundqvist Överläkare, Med Dr Laboratoriemedicinska kliniken, Klinisk Mikrobiologi, Region Örebro Län

Influensarapport för vecka 46, 2017 Denna rapport publicerades den 23 november 2017 och redovisar influensaläget vecka 46 (13 19 november).

Äldre och infektioner. -enbart ett institutionsproblem? Johan Struwe Smittskyddsintitutet

Influensarapport vecka 50 Säsongen

Meddelande 1/2013. U-Proteinprofil ersätter Pt(U)-Proteinfraktioner fr o m

Fecesdiagnostik i multiplexeran Annika Ljung Klinisk Mikrobiologi Sahlgrenska Universitetssjukhuset

Datum /2016. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Sörmland gällande fr.o.m (om inget annat datum anges i texten)

Rekommendationer för handläggning av misstänkta fall av allvarlig luftvägsinfektion associerad med nytt. reviderad version

Influensarapport för vecka 6, 2018 Denna rapport publicerades den 15 februari 2018 och redovisar influensaläget vecka 6 (5-11 februari).

Legionella-legionärssjuka

Pneumonier i öppen och slutenvård Strama

Procalcitonin Stramadagen 26 maj 2010

Vinterkräksjuka. Säsongen Fredrik Idving Hygiensjuksköterska

Akut och kronisk diarré orsaker och utredning

Influensarapport för vecka 2, 2017 Denna rapport publicerades den 19 januari 2017 och redovisar influensaläget vecka 2 (9 15 januari).

Retrospektiv studie av akuta och långsiktiga komplikationer av venportar

PM Medicinskt. Gastroenterit

Ackrediteringens omfattning

Diskussion kring tonsilliter. Pär-Daniel Sundvall, allmänläkare Jesper Ericsson, infektionsläkare

Utvärdering av BD MAX enteric parasite panel på ett kliniskt laboratorie

Influensarapport för vecka 9, 2017 Denna rapport publicerades den 9 mars 2017 och redovisar influensaläget vecka 9 (27 februari 5 mars).

Tecken till allvarlig infektion hos vuxna, riktlinjer från Programråd Strama

Ciprofloxacin-resistens hos E. coli i blodisolat hur påverkar det vår handläggning? Anita Hällgren Överläkare Infektionskliniken i Östergötland

Legionärssjuka Björn K Eriksson Bitr smittskyddsläkare Smittskydd Stockholm bjorn.k.eriksson@sll.se

Influensarapport vecka 40 Säsongen

LOCID Late-Onset Combined Immune Deficiency

Intraabdominella infektioner - mikrobiologi

PM Medicinskt. Pneumokocker- Akut sjukdomsdebut, hållsmärta och LPK>15x10 9. Ses i alla åldrar. Haemophilus influenzae- Vanlig hos patienter med KOL

Kartläggning av virusförekomst i Göta älvregionen

Nedre luftvägsinfektioner hosta, akut bronkit, pneumoni. Sigvard Mölstad Lunds Universitet, CRC, Malmö

Återkoppling av resistensdata, diagnostic stewardship

Luftvägsinfektioner hos förskolebarn

Influensarapport vecka 8 Säsongen

Ful urinsticka- vem har inte det? Läkarmöte Blå korset 5 juni 2013 Thomas Tängdén, Infektionskliniken och Strama

FilmArray i praktiken

Levnadsregler vid neuropeni; tro eller vetande?

av molekylär diagnostik om luftvägsinfektioners Luftvägsinfektioner är de vanligaste infektionerna

Nedre luftvägsinfektioner hosta, akut bronkit, pneumoni. Sigvard Mölstad Lunds Universitet, CRC, Malmö

Expertgruppen för medicinsk mikrobiologi EQUALIS-representanter Eva Burman, Karin Dahlin-Robertsson och Keng-Ling Wallin.

Kroniskt Obstruktiv Lungsjukdom (KOL)

Långvarig hosta - Mycoplasma, TWAR, kikhosta? Eller något annat? Niclas Johansson Infektionskliniken Karolinska Solna 2014

Nya behandlingsschema de senaste åren

Kunskapsveckan ht 2018

Flervalsfrågor (endast ett rätt svar)

Virala CNS infektioner hos barn. - prognos efter encefalit i barndomen

Varför vill vi veta något om vilka patogener som finns i avloppsvattnet och hur gör vi?

Influensarapport för vecka 2, 2018 Denna rapport publicerades den 18 januari 2018 och redovisar influensaläget vecka 2 (8 14 januari).

Influensarapport vecka Säsongen

Chlamydia pneumoniae (TWAR) kan orsaka såväl akuta som kroniska luftvägsinfektioner.

Smittskydd Stockholm. Tarminfektioner. Maria Rotzén Östlund Biträdande smittskyddsläkare

Pneumokockvaccination. Christer Mehle Infektionskliniken, NUS

Rekommendationer för handläggning av misstänkta fall av allvarlig luftvägsinfektion associerad med nytt coronavirus

Transkript:

KLINISKA ASPEKTER PÅ VIRALA MULTIPLEX- PANELER NICKLAS SUNDELL INFEKTIONSKLINIKEN SAHLGRENSKA UNIVERSITETSSJUKHUSET / ÖSTRA

Parainfluensavirus typ 2 Giardia duodenalis Legionella pneumophila Cyclospora cayetanensis Adenovirus Chlamydophila pneumoniae RS virus Metapneumovirus Norovirus GI Influensa B Bocavirus Sapovirus Coronavirus 229E Rotavirus Coronavirus HKU1 Coronavirus OC43 Coronavirus NL63 Astrovirus Pneumocystis Cryptococcus neoformas Parainfluensavirus typ 1 Mycoplasma pneumoniae Parainfluensavirus typ 4 Influensa A Parainfluensavirus typ 3 Crytosporidium Entamoeba histolytica Blastocystis hominis Pneumokocker Diantamoeba fragilis Heamophilus influenzae

konventionell diagnostik snabb-paneler

Några kliniska aspekter på snabb-paneler Fördelar Nackdelar Snabb turn-over Minskad / smalare behandling / utsättning av antibiotika? Isolering Tidigt insatt antiviral? Överdiagnostik? Signifikans? Resistensdata / SIR Ökad ab användning? Cost/benefit

Vi har lärt oss mycket genom multiplex-paneler..

NYTTA VID LVI I PRIMÄRVÅRD Prospektiv studie 202 randomiserades till multiplex PCR med snabbt svar (inom 24h) 204 med delayed result Signifikant minskad ab förskrivning i gruppen med snabbt svar Antibiotikaförskrivning i primärvård går att påverka genom tillgång till PCR med snabbt svar Stewardship behövs dock! Brittain-Long et al. BMC Medicine 2011

ANVÄNDBART ÄVEN INOM SLUTENVÅRD 323 vuxna med röntgen-verifierad CAP Med PCR-panel (26 agens) detekterades bakterie i 81% av fallen Med vanlig odling 32% Möjlighet till de-eskalering och riktad behandling (smalare spektra) Men vilka fynd är signifikant? Gadsby et al. CID 2016

Fler patienter med immunosuppression Influensa A och B Parainfluensa RSV Metapneumo Coronavirus Rhinovirus mfl Waghmare et al. Blood. 2016

Förlängd utsöndring vid nedsatt immunförsvar FilmArray Resp panel Median 14d (5-58) Median 17d (5-45) 265 onkologpatienter (högrisk) med LVI Särskilt RSV och parainfleunsa var kopplat till lång utsöndring Median 16d (5-50) Median 14d (5-42) Richardson et al. Clinical Microbiology and Infection 2016

tolkning. ct-värden. POC lite mer Luftvägar om luftvägar prevalens..

Viktigt att ha kunskap om epidemiologin underlättar tolkning Sundell et al. Journal of Clinical virology 2016

Behöver vi luftvägspaneler för barn? Review där man undersökte association mellan 30 symtom och 41 tecken på ÖLI samt 23 patogener hos barn som söker pga akut hosta 1704 associationer varav 13% är undersökta 2% statistisk säkerställd Slutsats: wheezing, indragningar och krepitationer var sign associerat med RSV men i övrigt mycket svårt att veta orsakande patogen PCR behövs för att identifiera vilken patogen Thornton et al. Br J Gen Pract 2015

så då kör vi PCR på barnen

FilmArray respiratory panel 775 barn med LVI Totalt 81% positiva för patogen Multipla agens: 25.5% Många fynd! Möjlighet till isolering och initial behandling Li et al BMC Infectious Diseases 2018

asymtomatiska barn då

Totalt hade 44% virusfynd (13% multipla fynd) 30% av asymtomatisk var positiva för virus men.. Rhinovirus och enterovirus dominerar (26% av de asymtomatiska!) Moe et al PLOS ONE 2016

Prospektiv case-control Barn <6 år 141 fall (LVI) 157 kontroller Totalt 27% av kontrollerna positiva för virus MEN majoriteten rhinovirus (14%) IFA, RSV etc sågs primärt hos hos fall Jansen et al. Journal of Clin Microbiology 2011

Men vuxna då?

444 vuxna utan luftvägssymtom 103 med luftvägssymtom

Förekomst av virus i den asymtomatiska gruppen (n=444) 4.3% (36% pos bland symtomatiska) Utan rhinovirus (prolonged shedding / asymtomatiska re-infektioner av andra serotyper) så var förekomsten 1.1% Inga fynd av multipla virus! Ovanligt med virusfynd hos asymtomatiska vuxna Sundell et al. Journal of Clin Microbiology 2019

Slutsats virusfynd/multipla virusfynd är vanligt hos barn med eller utan symtom ofta rhino/enterovirus + ex RSV eller influensa = sistnämnda är sannolikt det som är signifikant fynd virusfynd hos asymtomatiska vuxna är ovanligt! positivt fynd hos vuxna således med stor sannolikhet av klinisk signifikans

Har klinikern nytta av ct-värden?

FALL 50-årig kvinna med myelom neutropen efter benmärgstransplantations på CIVA i respirator med 100% O2, bukläge meropenem, vancomycin, trim-sulfa erytromycin, mycafungin narkos vill addera antibiotika. PCR på BAL-vätska: parainfluenzae ct-värde 15

FALL 55-årig man med lungfibros dubbel lungtransplantation för 8 månader sedan försämrad lungfunktion sista tiden positiv PCR luftvägssekret : coronavirus NL63 sen 6 veckor addera antiviral undrar transplantation (som ej finns)? ct-värden 19-27-33-32-35

Ct-värden hos barn med röntgenverifierad pneumoni jämfört med barn med/utan ÖLI Något lägre ct-värden i pneumoni-gruppen Men ingen cut-off gick att urskilja Feikin et al. Clin Infect Dis 2017

Vuxna då? Virusfynd och ct-värde 312 vuxna militärer utan symtom jämf med 145 med akuta luftvägssymtom. (FTD Resp Path 33) Inget signifikant skillnad utöver rhinovirus Tam et al. BMC Infectious Diseases 2018

Vi såg samma trend men ej signifikant.. ct-värden för rhinovirus Asymtomatiska vuxna (n=14) Symtomatiska vuxna med LVI (n=23) Högre ct-värde hos asymtomatiska men skillnaden ej signifikant

Slutsats ct-värden kan vara värdefullt vid den kliniska bedömningen i individuella fall svårt att urskilja cut-off för virusmängd: - asymtomatiska vs symtomatiska - ÖLI vs viral pneumoni för klinikern viktigt att komma ihåg att en skillnad på 3 cykler motsvarar en faktor 10 = ändå stor skillnad i virusmängd!

Har vi nytta av point-of-care tester?

545 vuxna med influensa-symtom/urti +/- LRTI 211 kontroller (sedvanlig PCR diagnostik) 334 multiplex panel (FilmArray ) Ingen effekt på primära utfallsmåttet (length of stay) Förkortade till tid till antiviral behandling Korrekt behandling av mycoplasma Andrews et al. BMC Infectious Diseases 2017

360 point-of-care (FilmarrayPanel) 354 rutindiagnostik Ingen signifikant skillnad mellan grupperna avseende andel som fick antibiotika Length of stay kortare i POC gruppen Snabbare antiviral behandling vid influensa i POC gruppen Snabbare tid till isolering hos Influensa patienter i POC gruppen Brendish et al. Lancet Respir Med 2017

Pneumokocker då?? 3 månaders flicka som inkommer med bronkiolit. Äldre syskon hemma. CRP 12. Syrgas och inhalation. Snabb-panel påvisar RS-virus och pneumokocker. Antibiotika? 77-årig man med hjärtsjukdom. Inkommer med 3 dagars måttlig feber och LVI. CRP 48. Snabb-panel påvisar rhinovirus och pneumokocker. Antibiotika?

Vuxna då? oberoende riskfaktorer för detektion av pneumokocker och HI hos asymtomatiska vuxna -rökning samt co-morbiditet Sundell et al. Journal of Clin Microbiology 2019

Pneumokocker och snabb-paneler? JA NJA

Vi stannar där.. Tack för uppmärksamheten!