Forskningsdokumentation - Labböcker Föreläsning: Johan Weigelt, PhD Biomedicinarutbildningen, Termin 1, 19 september 2012
Översikt Vad är en labbok? Varför labböcker? Labboksanvändning på MBB Hur? Foskningsfusk och Patent Labboksanvändning på MBB, forts. Johan Weigelt 19 september 2012 2
Vad är en labbok? (Lab Journal, Laboratory Notebook) Fullständig dokumentation av: Experimentalla procedurer/utförande Primärdata och andra observationer Dataanalys Reflektioner och idéer Används framförallt inom forsknings och analysverksamhet men också t.ex. vid kvalitetsarbete. Johan Weigelt 19 september 2012 3
Varför labböcker? Verktyg för dokumentation av experimentellt arbete Återupprepning av experiment Analys av utfört arbete felsökning Inlärning Patentsökning, Innovation God forskningssed säkerställa att experiment verkligen har utförts och att data ej är falsifierade eller plagierade Utdrag ur KI:s riktlinjer för forskningsdokumentation: Johan Weigelt 19 september 2012 4
Labboksanvändning på MBB Fr.o.m. HT 2011 används en personlig labbok vid samtliga laborationer på MBB Målsättning att införa på hela biomedicinarutbildningen Två huvudsyften Träning i att föra labboksanteckningar. Viktig yrkeskunskap för experimentellt arbete inom forskning, utveckling och analysarbete (universitet, industri, sjukvård) Förbättrad inlärning vid laborativa kursmoment Stimulerar bättre förberedelser Kräver förståelse av experimenten som utförs när de utförs initierade reflektioner under laborationen Bättre underlag för laborationsrapporter Johan Weigelt 19 september 2012 5
Hur för man labboksanteckningar? Fullständig dokumentation av: Experimentalla procedurer/utförande; Primärdata och andra observationer; Dataanalys; Reflektioner och idéer Traditionellt förs labboksanteckningar i en inbunden anteckningsbok med numrerade sidor. Kulspetspenna Kronologisk ordning Anteckningar i realtid Specifika krav kan variera från organisation till organisation Elektroniska Labböcker (ELNs) blir mer och mer vanlilgt förekommande Johan Weigelt 19 september 2012 6
Hur för man labboksanteckningar - Vad skall tas med? Datum - när utfördes experimentet (på varje sida) Kort beskrivande titel (på varje sida) Syfte: Vad är avsikten med experimentet? Kortfattad bakgrundsinformation. Utförande: Detaljerad beskrivning av det experimentella utförandet. Vilka reagens har använts? Hur har experimentet utförts? All information som krävs för att repetera experimentet måste finnas med i labboken. Referenser till standardmetoder eller standardreagens som finns beskrivna på andra sidor i labboken kan dock göras. Beräkningar (spädningar etc.) Johan Weigelt 19 september 2012 7
Hur för man labboksanteckningar - Vad skall tas med? forts. Observationer: Primärdata Bilder, grafer etc. (klistra in om möjligt) Allt som händer: förändringar i utförandet, misstag/fel etc. Tolkning av resultaten: Beräkningar Slutsatser Kommentarer, t.ex. kring oväntade resultat, möjliga felkällor, möjliga förändringar av det experimentella upplägget, idéer Johan Weigelt 19 september 2012 8
Hur för man labboksanteckningar? - Regler Använd kulspetspenna (blyerts är förbjudet, filtpenna olämpligt) Anteckningar skall göras i kronologisk ordning samtidigt som experimentet utförs Om tomma ytor blir över dra ett streck tvärs över området Om du skriver fel dra ett streck över felet och skriv den rätta texten bredvid (vad du skrev först måste fortfarande var läsligt) Vid inklistring av bilder etc. dra två streck över bildkanten och sätt din signatur bredvid Johan Weigelt 14 september 2011 9
Exempel ett enkelt experiment Johan Weigelt 19 september 2012 10
Exempel ett enkelt experiment Johan Weigelt 19 september 2012 11
Exempel Do s and don ts Rätt Fel Tomma ytor Felskrivning Bilder Johan Weigelt 19 september 2012 12
Labboken när experimentet är klart Det vanligaste är att anteckningarna används som underlag för en rapport (t.ex. en vetenskaplig publikation) Felsökning: Varför funkar inte mitt experiment idag när det gick bra för 2 månader sedan? Vad gör jag annorlunda? Referensmaterial för andra personer i laboratoriet. Hur utförde person X som jobbade här för 3 år sedan det här experimentet? Labboken kan också användas som bevismaterial i patentstrider eller som mekanism att förebygga forskningsfusk Johan Weigelt 19 september 2012 13
Vetenskapliga artiklar Vetenskapliga artiklar/uppsatser/publikationer ( pek ) har en struktur som i mycket påminner om det som bör finnas med i en labboksanteckning av ett experiment Introduction Materials and Methods Results Discussion Dock är det förstås oftast inte bara ett experiment som rapporteras utan en större analys av många försök. Johan Weigelt 19 september 2012 14
Rapport ett exempel på ett PEK Johan Weigelt 19 september 2012 15
Rapport ett exempel på ett PEK Material och metoder i huvudtext och Supporting information Johan Weigelt 19 september 2012 16
Labböcker och forskningsfusk Från Vetenskapsrådets hemsida: NIH Office of Research Integrity: The integrity of research depends on accurate, detailed, organized, complete, and accessible data Labboken är ett mycket viktigt instrument för att skydda mot forskningsfusk Johan Weigelt 19 september 2012 17
Labbokspraxis för att säkerställa god forskningssed Ta aldrig bort data, bilder eller sidor från labboken Lämna ej tomma sidor Stryk över tomma ytor Var så detaljerad och exakt som möjligt då du för anteckningar Utelämna aldrig data, observationer eller resultat oberoende av hur märkliga de verkar Skriv läsligt Det sagt, KOM IHÅG: Labboken är en anteckningsbok som framförallt är till för att att vara ett personligt verktyg i det dagliga arbetet. Den viktigaste läsaren är du själv! Johan Weigelt 19 september 2012 18
Labböcker och patent Patent på innovationer ges till den som ansöker först ( first to file ). Tills nyligen följde tillämpade dock USA en annan konvention ( first to invent/record ) Korrekt nedtecknade labboksanteckningar används om underlag för en patentansökan och styrker att den som söker patent också har gjort innovationen. Därför är det viktigt att: Alla anteckningar är daterade, signerade och gärna bevittnade av en oberoende person. Anteckningar är gjorda i kronologisk ordning. Om en ändring måste göras, så görs en ny anteckning med korsreferens till det som skall ändras. Göra anteckningar om diskussioner, möten etc. där data diskuterats. Vara så detaljerad som möjligt. Ovanstående är praxis inom industrin Johan Weigelt 19 september 2012 19
Labboksanvändning på MBB Syftet med laborationer Träning i experimentella metoder och analys av experimentella data Förankring av teoretiskt stoff med praktiskt arbete Träning i forskningsdokumentation och rapportskrivning Det är viktigare att man lär sig, och förstår, metoderna som används och de bakomliggande teorierna, än att resultaten blir exakt de förväntade. Labboken är ett verktyg för att åstadkomma detta. Johan Weigelt 19 september 2012 20
Labboksanvändning på MBB All studenter får kvittera ut en personlig labbok (KI:s standardutförande) Skriv namn på boken så fort du får den Department: MBB Laboratory Journal No: unikt nummer. Förslag: initialer + löpnummer (t.ex. JoW001) Group: Biomedicinarutbildningen Labboken skall medföras vid samtliga laborationer Samtliga i varje labgrupp skall föra fullständiga anteckningar Anteckningar skall göras i realtid och måste vara klara vid dagens slut då sidorna kontrolleras och kontersigneras av amanuens Johan Weigelt 19 september 2012 21
Labboksavändning på MBB, forts. För många laborationer kommer en fullständig rapport ej att krävas. Istället sker examination genom kontersignering av labboken av amanuens. Detta gäller både syra-bas och enzymlaborationerna En förutsättning för godkännande är att anteckningarna håller hög kvalitet Syfte och bakgrund Reagens och utförande (tillräckligt detaljerat för att experimentet skall kunna återupprepas utan tillgång till labinstruktionen) Primärdata, eventuella ändringar i utförandet och andra observationer Tolkning och slutsatser I de fall fullständiga rapporter skall lämnas in så skall labboken finnas tillgänglig för amanuensen ifall behov av att kontrollera utförandet uppstår. Johan Weigelt 19 september 2012 22