Analys och simulering av en cerebellär krets

Relevanta dokument
SF1905 Sannolikhetsteori och statistik: Lab 2 ht 2011

Välkomna till TSRT15 Reglerteknik Föreläsning 2

Diskussionsproblem för Statistik för ingenjörer

SF1901: SANNOLIKHETSTEORI OCH STATISTIKTEORI KONSTEN ATT DRA INTERVALLSKATTNING. STATISTIK SLUTSATSER. Tatjana Pavlenko.

Datorövning 1: Fördelningar

Inledning till statistikteorin. Skattningar och konfidensintervall för μ och σ

Välkomna till Reglerteknik Föreläsning 2

Neurovetenskap 30/08/2013. Kognitiv neurovetenskap. Lober. Olika färg, olika vävnadsstruktur. Hjärnbarken

Föreläsning 12: Repetition

Examinationsuppgifter del 2

Blandade problem från elektro- och datateknik

Välkomna till TSRT19 Reglerteknik Föreläsning 8. Sammanfattning av föreläsning 7 Framkoppling Den röda tråden!

Demonstration av laboration 2, SF1901

Matematikcentrum 1(6) Matematisk Statistik Lunds Universitet MASB11 - Biostatistisk grundkurs VT2014, lp3. Laboration 2. Fördelningar och simulering

En introduktion till och första övning for Excel

Stokastiska processer och simulering I 24 augusti

Regressionsmodellering inom sjukförsäkring

TDDB96 Projekt: Object priming med visuell stimuli

TSIU61: Reglerteknik. Sammanfattning av föreläsning 8 (2/2) Andra reglerstrukturer. ˆ Sammanfattning av föreläsning 8 ˆ Framkoppling från störsignalen

LÖSNINGSFÖRSLAG TILL TENTAMEN I MATEMATISK STATISTIK

Analys av egen tidsserie

Nedan redovisas resultatet med hjälp av ett antal olika diagram (pkt 1-6):

träna på att använda olika grafiska metoder för att undersöka vilka fördelningar ett datamaterial kan komma från

7.5 Experiment with a single factor having more than two levels

Lösningar till tentamensskrivning för kursen Linjära statistiska modeller. 14 januari

Välkomna till TSRT19 Reglerteknik Föreläsning 3. Sammanfattning av föreläsning 2 PID-reglering Blockschemaräkning Reglerdesign för svävande kula

Industriell reglerteknik: Föreläsning 6

Reglerteknik I: F1. Introduktion. Dave Zachariah. Inst. Informationsteknologi, Avd. Systemteknik

TSRT91 Reglerteknik: Föreläsning 9

Simulering och reglerteknik för kemister

Föreläsningsanteckningar till kapitel 8, del 2

Kort introduktion till Reglerteknik I

Enlagersnät Flerlagersnät Generalisering. Artificiella Neuronnät

Reglerteknik I: F10. Tillståndsåterkoppling med observatörer. Dave Zachariah. Inst. Informationsteknologi, Avd. Systemteknik

Föreläsning 7. Statistikens grunder.

TSIU61: Reglerteknik. Matematiska modeller Laplacetransformen. Gustaf Hendeby.

Tentamen i matematisk statistik (9MA241/9MA341, STN2) kl 14 18

Lärmål Sannolikhet, statistik och risk 2015

Grundläggande matematisk statistik

Mer om slumpvariabler

FACIT (korrekta svar i röd fetstil)

Introduktion. Konfidensintervall. Parade observationer Sammanfattning Minitab. Oberoende stickprov. Konfidensintervall. Minitab

Carl-Fredrik Lindberg, ABB Corporate Research. Automation Scandinavia, Trådlös kommunikation i industrin - ett PiiA-projekt

LKT325/LMA521: Faktorförsök

Datorövning 1 Fördelningar

Lö sningsfö rslag till tentamen i matematisk statistik Statistik öch kvalitetsteknik 7,5 hp

Statistiska metoder för säkerhetsanalys

I vår laboration kom vi fram till att kroppstemperaturen påverkar hjärtfrekvensen enligt

Välkomna till TSRT19 Reglerteknik M Föreläsning 7. Framkoppling Koppling mellan öppna systemets Bodediagram och slutna systemets stabilitet

SF1901 Sannolikhetsteori och statistik I

Reglerteknik AK. Tentamen 24 oktober 2016 kl 8-13

LUNDS UNIVERSITET 1(6) STATISTISKA INSTITUTIONEN Per-Erik Isberg

Lektionsanteckningar 11-12: Normalfördelningen

Modellering av Dynamiska system Bengt Carlsson Rum 2211

A. Stationära felet blir 0. B. Stationära felet blir 10 %. C. Man kan inte avgöra vad stationära felet blir enbart med hjälp av polerna.

1 Mätdata och statistik

Rättningstiden är i normalfall 15 arbetsdagar, till detta tillkommer upp till 5 arbetsdagar för administration, annars är det detta datum som gäller:

7,5 högskolepoäng. Statistisk försöksplanering och kvalitetsstyrning. TentamensKod: Tentamensdatum: 28 oktober 2016 Tid: 9.

Föreläsning 1. Repetition av sannolikhetsteori. Patrik Zetterberg. 6 december 2012

Institutionen för teknikvetenskap och matematik, S0001M LABORATION 2

EXEMPEL PÅ FRÅGESTÄLLNINGAR INOM STATISTIK- TEORIN (INFERENSTEORIN):

Datorövning Power curve 0,0305 0, Kvantiler, kritiska regioner

Läs noggrant informationen nedan innan du börjar skriva tentamen

SF1901: Sannolikhetslära och statistik. Statistik: Intervallskattning (konfidensintervall) Jan Grandell & Timo Koski

Lösningar till tentamen i Industriell reglerteknik TSRT07 Tentamensdatum: Martin Enqvist

Modellering av Dynamiska system Bengt Carlsson Rum 2211

Introduktion och laboration : Minitab

Datorövningar i systemidentifiering Del 2

Systemteknik/Processreglering F2

Obligatorisk uppgift, del 1

SF1901: Sannolikhetslära och statistik. Statistik: Intervallskattning (konfidensintervall)

Laboration 2. i 5B1512, Grundkurs i matematisk statistik för ekonomer

Tentamen MVE302 Sannolikhet och statistik

Välkomna till TSRT15 Reglerteknik Föreläsning 12

REPETITION (OCH LITE NYTT) AV REGLERTEKNIKEN

Tentamen MVE302 Sannolikhet och statistik

Laboration 3: Enkla punktskattningar, styrkefunktion och bootstrap

Två innebörder av begreppet statistik. Grundläggande tankegångar i statistik. Vad är ett stickprov? Stickprov och urval

Metod för beräkning av potentiella variabler

Artificiella Neuronnät

Matematikcentrum 1(5) Matematisk Statistik Lunds Universitet MASB11 HT Laboration P3-P4. Statistiska test

Reglerteori. Föreläsning 4. Torkel Glad

Datorövning 6 Extremvärden och Peak over Threshold

Uppgift 1. f(x) = 2x om 0 x 1

Datorbaserad mätteknik

Kurskod: TAIU06 MATEMATISK STATISTIK Provkod: TENA 15 August 2016, 8:00-12:00. English Version

Thomas Önskog 28/

ANN fk. Örjan Ekeberg. Framåtkopplade Nät. återkopplade nät. Olika arkitekturer. BackPropagation through Time. Kalman-Filter tekniker

Del 2 tillsammans med förberedelsefrågor - tid för inlämning och återlämning meddelas senare.

Industriell reglerteknik: Föreläsning 4

dametric GMS-SD1 Gap Control Beskrivning GMS-SD1 GapControl SE.docx / BL Sida 1 (5)

LABORATION 1. Syfte: Syftet med laborationen är att

Modellering av Dynamiska system Bengt Carlsson Rum 2211


PROGRAMFÖRKLARING I. Statistik för modellval och prediktion. Ett exempel: vågriktning och våghöjd

Klinisk testning. Tony Pansell Universitetslektor, Med dr

Tentamen i Statistik, STA A13 Deltentamen 2, 5p 21 januari 2006, kl

Bild 1. Bild 2 Sammanfattning Statistik I. Bild 3 Hypotesprövning. Medicinsk statistik II

Föreläsning 6: Hypotestester (forts.)

Avd. Matematisk statistik

Transkript:

Analys och simulering av en cerebellär krets Populärvetenskaplig sammanfattnng Cerebellum, eller lillhjärnan, är en del av hjärnan som aktivt deltar i utförandet och koordineringen av rörelser. Genom att bidra till regleringen av en rörelse som kommenderas från en högre nivå i hjärnan, exempelvis vid en viljestyrd rörelse, ser lillhjärnan till att rörelsen kan utföras på ett välkoordinerat sätt [5]. Utöver detta finns det dessutom även indikationer på att lillhjärnan aktivt deltar i regleringen av flertalet kognitiva funktioner i hjärnan [6]. Vad som också är speciellt för lillhjärnan är dess unika förmåga att genom inlärning bättre bidra till rörelseregleringen om regleringen ursprungligen ej är tillräckligt god. Historiskt sett har dock det exakta förfarandet som lillhjärnan utför regleringen och inlärningen på varit okänt av flera anledningar. Svårigheter med att göra detaljerade datainsamlingar från nervceller under naturliga förhållanden har exempelvis krävt att insamlingen istället sker under strikt kontrollerade förhållanden, där möjligtvis värdefull information kan gås till spillo. Därutöver har det exakta utseendet på den interna kretsstrukturen i lillhjärnan ej heller varit fullständigt känd. Detta har lett till att det idag existerar en stor mängd förslag, baserade på experimentella fynd och matematisk analys, till vad den exakta funktionen hos lillhjärnan är (se exempelvis [3] och [11]). Figuren nedan visar ett exempel på en förenklad kretsstruktur som lillhjärnan kan vara en del av. e C 1/s uc + y P + - Figur 1: Figuren visar en förenklad reglerstruktur för hur lillhjärnan, C, kan bidra till reglering av processen P. Målet är att få P att följa referenssignalen u c, mätt genom avvikelsen e = y u c där y är utsignalen från P. Lillhjärnan tar emot u c och dess integral u c 1/s och ställer ut en signal som går vidare till P. Avvikelsen e används för inlärning av C för att bättre kunna reglera processen. Idag sker en stor del av tolkningen av lillhjärnans funktionalitet genom införandet av koncept ursprungligen utvecklade inom reglertekniken, vilket har lett till möjligheterna att utveckla komplexa matematiska modeller av lillhjärnan, men som ändå är solitt förankrade i biologin. Dock är skillnaderna mellan klassiska, rent tekniska reglerproblem och biologiska reglerproblem för rörel- 1

ser stora. Bland ett antal skillnader kan nämnas att man i den klassiska reglertekniken ofta kan förutsätta att eventuellt förekommande återkopplingskretsar har en kort svarstid, vilket man sällan kan förutsätta för biologiska rörelsereglersystem. Långa svarstider i en återkopplingskrets kan leda till stabilitetsproblem i regleringen av en process, eftersom regulatorn tvingas agera på processinformation, som när den når regulatorn, kan vara inaktuell..35.3 Probability density functions ISI histogram Gamma Lognormal 1.9.8 Distribution functions.25.7.2.6.5.15.4.1.3.2.5.1 2 4 6 8 1 ISI length [msec] 5 1 15 ISI length [msec] Figur 2: Vänster: resulterande histogram och anpassade täthetsfunktioner för mätdata från cerebellärt interneuron. Höger: empirisk fördelningsfunktion för mätdata och anpassade fördelningsfunktioner. Inledningsvis i det här arbetet har insamlad mätdata från ett antal cerebellära nervcellstyper betraktats (för experimentbeskrivning, se [4], [8], [9], [1] och [2]), med målet att ge en grundläggande statistisk karakterisering av deras spontanaktivitet. Stationära segment i dataserien isolerades och studerades närmare. Fördelningen för spikintervallstider skattades med ett vanligt histogram, kompletterat med den empiriska fördelningsfunktionen, eftersom histogrammet ej är väntevärdesriktigt. Då de flesta histogram över spikintervallstider från olika nervcellstyper uppvisar en skev form anpassades till varje mätserie en gammafördeling och en lognormalfördelning, två vanliga skeva fördelningar. Huruvida statistiskt signifikant skillnad mellan mätserien och de anpassade fördelningarna kunde påvisas testades med ett Kolmogorov- Smirnovtest. För att ge en mer fullständig karakterisering av spontanaktiviteten undersöktes även beroendet mellan i mätserien intilliggande spiktidsintervall med en skattning av det betingade väntevärdet av spiktidsintervall i, τ i, betingat föregående spiktidsintervall τ i 1 : E [τ i τ i 1 ]. I de fall där inget beroende kan påvisas innebär det att de individuella spiktidsintervallen är dragna oberoende av varandra ur den underliggande fördelningen. Detta innebär att mätserien kan betraktas som realiseringen av en statistisk förnyelseprocess [7]. I de fall där beroende finns måste mer komplexa modeller tas till för att till fullo 2

7 1-order conditional mean 55 Short-term average 6 5 Conditional ISI length [msec] 5 4 3 2 1 Time [msec] 45 4 35 3 25 2-1 2 4 6 8 1 Previous ISI length [msec] 15 2 4 6 8 group of 1 intervals Figur 3: Vänster: tjocka linjen indikerar det skattade betingade väntevärdet för längden av spiktidsintervallet för intilliggande spiktidsintervall. De streckade linjerna utgör konfidensintervall med konfidensgrad.95. Om skattningen ligger konsekvent innanför konfidensintervallet kan inget beroende påvisas och mätdatan kan betraktas som realiseringen av en förnyelseprocess, vilket är fallet här. Höger: Tjocka linjen indikerar att medelvärdet för konsekutiva grupper av 1 spiktidsintervall ligger i stort samlat innanför konfidensintervallen (streckade linjer). Därmed kan mätserien betraktas som stationär. kunna beskriva mätseriens beteende, och resultatet från analysen här kan tjäna som grund för sådana modeller. I figur 2 och figur 3 visas resultatet av denna analys för mätdata från ett cerebellärt interneuron. Kolmogorov-Smirnovtestet indikerade att fördelningen av spiktidsintervall rimligen kan förklaras med en lognormalfördelning, och vänstra bilden i figur 3 indikerar att mätserien kan ses som realiseringen av en förnyelseprocess eftersom inget beroende mellan intilliggande spiktidsintervall kan påvisas. Det ska dock påpekas att för flertalet undersökta nervcellstyper kunde inte sådana slutsatser dras, utan där behövs mer komplexa modeller. Vidare undersöktes även, genom simulering, en möjlig struktur för cerebellärt bidrag i regleringen av den vestibulo-okulära reflexen (VOR), [1]. Denna reflex, som är en av flera reflexer kopplade till synen, ser till att kompensera små huvudrörelser med motsvarande och motsatta ögonrörelser, för att på så sätt bibehålla en stabil bild på näthinnan. Avkänningen av huvudrörelser görs av balansorganen, vars signal, efter att ha passerat genom hjärnstammen, kopplas till de nervceller som driver aktiviteten i de muskler som styr ögonglobens rörelser. Vidare går de huvudrörelserelaterade signalerna även till lillhjärnan, där de behandlas. Slutligen används utsignalen från lillhjärnan för att modulera aktiviteten i hjärnstammen, och på så vis får den även påverkan på ögonrörelsen. I de fall där den kompenserade ögonrörelsen ej fullt ut motsvarar huvudrörelsen uppstår en glidning av näthinnebilden. Denna glidning, 3

som tjänar som fel- eller inlärningssignal, vidarebefordras till lillhjärnan genom klättertrådar. Genom ett upprepat utförande av rörelsen kommer lillhjärnan tack vare träningssignalen att adapteras till att bättre bidra till regleringen av ögonrörelsen, för att till slut kunna fullständigt kompensera för huvudrörelserna. Med kännedom om de långa svarstiderna hos återkopplingskretsarna i hjärnan måste således lillhjärnan kunna aktivt bidra till regleringen genom framkoppling. I det här arbetet har en simulering gjorts där en population av cerebellära nervceller mottar huvudrörelserelaterade signaler (huvudhastighet och huvudposition). Den cerebellära utsignalen utgjordes sedan av deras sammanvägda aktivitet, och adderades till insignalen till en linjär modell av ögonmuskulaturen och ögondynamiken. Utsignalen från denna modell jämfördes med huvudets hastighet, och skillnaden däremellan användes för att modifiera de relativa vikterna av de individuella nervcellerna i simuleringen. Resultatet för den simulerade ögonhastigheten före och efter träning visas nedan i figur 4 och figur 5. Det syns tydligt hur inlärningen gör det möjligt för lillhjärnan att bättre reglera ögonrörelsen för att kompensera för huvudrörelsen, även om resultatet inte är perfekt. Det ska nämnas att totala antalet nervceller som bidrar till regleringen i verkligheten är mångfaldigt fler än som utnyttjats här (248 stycken), vilket till en viss del skulle kunna förklara det brusiga utseendet hos ögats utsignal. Output signal 1 5 Plant output and reference 1 2 3 4 5 6 7 8 Error signal -5-1 1 2 3 4 5 6 7 8 Purkinje cell output 4 2 1 2 3 4 5 6 7 8 Granule cell outputs.4.2 1 2 3 4 5 6 7 8 Figur 4: Simuleringsresultat före inlärning. Översta figuren visar ögonhastighet (blå linje) och huvudhastighet (röd linje). Det finns en stor skilnad mellan dem, vilket indikeras av figuren nedanför, som visar felsignalen som skillnaden mellan signalerna i översta figuren. Tredje figuren visar lillhjärnans utsignal, medan nedersta figuren visar aktiviteten hos de individuella nervcellerna som ingick i simuleringen. Totala antalet nervceller i simuleringen var 248. 4

Plant output and reference Output signal 4 2 1 2 3 4 5 6 7 8 Error signal -2-4 1 2 3 4 5 6 7 8 Purkinje cell output 15 1 5 1 2 3 4 5 6 7 8 Granule cell outputs.4.2 1 2 3 4 5 6 7 8 Figur 5: Simuleringsresultat efter inlärning. I översta figuren är det nu tydligt att efter den initiala uppgången följer ögonhastigheten huvudhastigheten betydligt bättre än i föregående fall. Detta syns även i figuren direkt nedanför, där felsignalen befinner sig närmare noll-strecket än i föregående fall. Referenser [1] Vestibulo-ocular reflex. http://en.wikipedia.org/ wiki/vestibulo-ocular_reflex, Last checked: June 24th 21. [2] F. Bengtsson and H. Jörntell. Sensory transmission in cerebellar granule cells relies on similarly coded mossy fiber inputs. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Vol. 16:2389 2394, 29. [3] P. Dean, J. Porrill, C.-F. Ekerot, and H. Jörntell. The cerebellar microcircuit as an adaptive filter: experimental and computational evidence. Nature Reviews Neuroscience, Vol. 11:3 44, 21. [4] C.-F. Ekerot and H. Jörntell. Parallel fibre receptive fields of purkinje cells and interneurons are climbing fibre-specific. European Journal of Neuroscience, 13(7):133 131, 21. [5] M. Ito. Cerebellar circuitry as a neuronal machine. Progress in Neurobiology, Vol. 78:272 33, 26. [6] M. Ito. Control of mental activities by internal models in the cerebellum. Nature reviews. Neuroscience, Vol. 9:34 313, 28. 5

[7] D. H. Johnson. Point process models of single-neuron discharges. Journal of Computational Neuroscience, Vol. 3:275 299, 1996. [8] H. Jörntell and C.-F. Ekerot. Reciprocal bidirectional plasticity of parallel fiber receptive fields in cerebellar purkinje cells and their afferent interneurons. Neuron, Vol. 34:797 86, 22. [9] H. Jörntell and C.-F. Ekerot. Receptive Field Plasticity Profoundly Alters the Cutaneous Parallel Fiber Synaptic Input to Cerebellar Interneurons In Vivo. J. Neurosci., Vol. 23:962 9631, 23. [1] H. Jörntell and C.-F. Ekerot. Properties of somatosensory synaptic integration in cerebellar granule cells in vivo. Journal of Neuroscience, Vol. 26:24 25, 26. [11] R.C. Miall, D.J. Weir, D.M. Wolpert, and J.F. Stein. Is the cerebellum a smith predictor? Journal of Motor Behavior, Vol. 25:23 216. 6