FilmArray. Magnus Lindh Equalismöte

Transkript

1 FilmArray Magnus Lindh Equalismöte

2 Akuta CNS-infekBoner Meningit Typfall: bakterie som passerat BBB och förökar sig i likvorrummet Nackstyvhet, ola markant cellstegring i CSV Tryckstegring, inklämningsrisk Encefalit Typfall: virus som infekterar nerv- eller gliaceller; fokal vävnadsskada, virus läcker ut Bll likvor (CSV)Desorientering, kramper, pares Meningoencefalit Många LP; många får cefotaxim och aciclovir

3 Symtom Feber Huvudvärk Neurologiska symtom Desorientering/förvirring Medvetandesänkning Kramper Förlamning

4 DifferenBaldiagnoser IntoxikaBon + febril infekbon Skalltrauma + febril infekbon Stroke + febril infekbon Annan febril infekbon som ger mental påverkan (UVI, pneumoni) Malaria

5 DiagnosBk Klinisk undersökning (nackstyv? pares? hudutslag?medvetandepåverkan?) LumbalpunkBon, analys av CSV LPK, glukos, protein (< 1 Bm) Mikrobiologisk analys Blodanalyser, tex. CRP, TBE-serologi Datortomografi/MR EEG

6 Mikrobiella orsaker (akut infekbon) Fall/år i Sverige Pa.entgrupp Presenta.on An.mikrobiell behandling HSV1 40 Alla Encefalit Aciclovir Nej HSV2 100 Alla Meningit/encefalit Aciclovir Nej VZV 200 Alla Encefalit/meningit Aciclovir Nej HHV6? Alla? Saknas Nej Enterovirus Alla Meningit/ meningoencefalit Parechovirus 40? Spädbarn Meningit/ meningoencefalit Saknas Saknas TBE 400 Alla Encefalit Saknas Ja Meningokocker 20 Alla Meningit Bensyl-pc (Ja) Pneumokocker 100 Äldre Meningit Bensyl-pc Ja Hemophilus influenzae Listeria monocytogenes 50 Alla Meningit Ampicillin Ja 70 Immunsuppr Meningit Ampicillin Nej GBS 50 Nyfödda Meningit Bensyl-pc Nej E coli 30 Nyfödda Meningit Cefotaxim Nej Kryptokocker (svamp) 20? Immunsuppr Meningit Fungicid Nej Vaccin Nej Nej

7 Tidigare mikrobiologisk diagnosbk Metod Svars.d Virus RealBds-PCR (x flera) <24 Bm Bakterier Odling <1-2 d PCR (riktad eller 16S) <24 Bm

8 Varför bred, snabb diagnosbk? Bred Många patogener kan vara orsaken Fördel ao inte göra flera parallella analyser Snabb Undvika onödiga undersökningar Förkorta vårdbden Ge mer adekvat anbmikrobiell terapi Säoa ut Fokusera

9 FilmArray (Biofire, Biomerieux) Integrerad extrakbon och PCR Sluten reakbonsbehållare ( pouch ) ExtrakBon, mulbplex 1:a-PCR, separata 2:a PCR (tre reakboner per agens) Eo prov per reakbon (men flera sambdigt om flera moduler) Smältpunktsanalys (2 av 3 ska vara posibva) Inget Ct-värde (eller annan kvanbtabv info)

10 Instrumentet och tekniken

11 FilmArray i Gbg Infördes Analys med FilmArray snart eler ankomst Bll lab Kompleoering med realbds-pcr nästa dag HSV1, HSV2, VZV, enterovirus Bakterieodling ola redan beställd vid FilmArray-fynd av bakterie (för verifiering och resistensmönster)

12 Proverna Alla prover som analyserats med FilmArray n= % kvinnor Medianålder 44 år Totalt 239 posibva fynd (7.4%)

13 Resultat (n=3227) Agens Antal HSV1 13 HSV2 25 VZV 44 Enterovirus 105 HHV6 10 Parechovirus 5 CMV 3 Pneumokocker 24 H influenzae 3 Listeria 4 GBS 1 E coli 2 NegaBv 2988

14 Sammanfaoning Få falskt posibva virusfynd (specificitet >99%) Ganska många falskt negabva virusanalyser 15% (2/13) HSV1; 11% (3/28) HSV2; 6% (3/47) VZV; 10% (12/117) enterovirus Parechovirus vikbg patogen hos spädbarn HHV6 svårtolkat fynd Avsaknad av kvanbtabv info en svaghet Många falskt posibva bakterier, särskilt pneumokocker (40%) och H influenzae

15 Tidigare studie; n=1560 Leber et al. JCM 2016

16 Slutsats Med tanke på ao falskt negabva var ganska vanliga kommer vi i så fall Bllfoga kommentar: kompleoerande analys med realbds-pcr bör övervägas om det finns klinisk misstanke Vi kommer fortsäoa ao göra realbds-pcr på alla posibva virusfynd för ao konfirmera och kvanbfiera Pneumokockfynd kommer ao kompleoeras med egen realbds-pcr