Tentamen Biokemi 2 KEM090

Relevanta dokument
STORSEMINARIET 3. Amplitud. frekvens. frekvens uppgift 9.4 (cylindriskt rör)

Webbregistrering pa kurs och termin

NMR Nuclear Magnetic Resonance = Kärnmagnetisk resonans

Tentamen Molekylärbiologi X3 (1MB608) 10 March, 2008 Page 1 of 5. Skriv svaren på varje fråga på SEPARATA blad.

Sannolikhetsteori. Tentamenskrivning: TMS145 - Grundkurs i matematisk statistik och bioinformatik,

Elektron-absorbtionspektroskopi för biomolekyler i UV-VIS-området

Tentamen i Modern fysik, TFYA11/TENA

Radioaktivt sönderfall Atomers (grundämnens) sammansättning

Styrteknik: Binära tal, talsystem och koder D3:1

CHANGE WITH THE BRAIN IN MIND. Frukostseminarium 11 oktober 2018

Övergångar mellan vibrationsnivåer i grundtillståndet. Infraröd spektroskopi

Föreläsning 2. Att uppbygga en bild av atomen. Rutherfords experiment. Linjespektra och Bohrs modell. Vågpartikel-dualism. Korrespondensprincipen

MOLECULAR SHAPES MOLECULAR SHAPES

1. Compute the following matrix: (2 p) 2. Compute the determinant of the following matrix: (2 p)

Webbreg öppen: 26/ /

Tentamen i Materia, 7,5 hp, CBGAM0

En bild säger mer än tusen ord?

Elektron-absorbtionspektroskopi för biomolekyler i UV-VIS-området

Tentamen i Matematik 2: M0030M.

Writing with context. Att skriva med sammanhang

Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg: SKRIV NAMN PÅ ALLA SIDOR ÄVEN OM FRÅGAN LÄMNAS OBESVARAD.

TILLÄMPAD ATOMFYSIK Övningstenta 2


FÖRBERED UNDERLAG FÖR BEDÖMNING SÅ HÄR

Preschool Kindergarten

Kvantmekanik och kemisk bindning I 1KB501

Analys och bedömning av företag och förvaltning. Omtentamen. Ladokkod: SAN023. Tentamen ges för: Namn: (Ifylles av student.

8 < x 1 + x 2 x 3 = 1, x 1 +2x 2 + x 4 = 0, x 1 +2x 3 + x 4 = 2. x 1 2x 12 1A är inverterbar, och bestäm i så fall dess invers.

LUNDS TEKNISKA HÖGSKOLA Inst. for Elektro- och Informationsteknik. SIGNALBEHANDLING I MULTIMEDIA, ETI265 Inlämningsuppgift 1 (av 2), Task 1 (out of 2)

VIKTIGT ATT DU FYLLER I DETTA PÅ SAMTLIGA SIDOR SOM LÄMNAS IN!

80 poäng. För att få godkänd kurs måste man få minst 40 poäng på examen.

Labokha AA et al. xlnup214 FG-like-1 xlnup214 FG-like-2 xlnup214 FG FGFG FGFG FGFG FGFG xtnup153 FG FGFG xtnup153 FG xlnup62 FG xlnup54 FG FGFG

TTM011 Students in the BSc program Textile engineering

Kurskod: TAMS28 MATEMATISK STATISTIK Provkod: TEN1 05 June 2017, 14:00-18:00. English Version

Module 6: Integrals and applications

Tentamenskrivning: TMS145 - Grundkurs i matematisk statistik och bioinformatik,

Number 14, 15, 16, and 17 also in English. Sammanställning av tentamensuppgifter Kvant EEIGM (MTF057).

TENTAMEN I FYSIKALISK KEMI KURS: KEM040 Institutionen för kemi Göteborgs Universitet Datum: LÄS DETTA FÖRST!

Materialplanering och styrning på grundnivå. 7,5 högskolepoäng

Pre exam I PATHOLOGY FOR MEDICAL STUDENTS

Discovering!!!!! Swedish ÅÄÖ. EPISODE 6 Norrlänningar and numbers Misi.se

INSTALLATION INSTRUCTIONS

Kurskod: TAIU06 MATEMATISK STATISTIK Provkod: TENA 31 May 2016, 8:00-12:00. English Version

Ett hållbart boende A sustainable living. Mikael Hassel. Handledare/ Supervisor. Examiner. Katarina Lundeberg/Fredric Benesch

LUNDS TEKNISKA HÖGSKOLA Institutionen för Elektro- och Informationsteknik

TENTAMEN I ALLMÄN OCH ORGANISK KEMI

How to study for History

Från extern till intern på tre dagar Erfarenheter från externa lärares pedagogiska kompetensutveckling

TENTAMEN. Institution: DFM, Fysik Examinator: Pieter Kuiper. Datum: 1 november 2010

Kristina Säfsten. Kristina Säfsten JTH

Observera att uppgifterna inte är ordnade efter svårighetsgrad!

UTLYSNING AV UTBYTESPLATSER VT12 inom universitetsövergripande avtal

Halogenlampa Spektrometer Optisk fiber Laserdiod och UV- lysdiod (ficklampa)

The Arctic boundary layer

Country report: Sweden

This exam consists of four problems. The maximum sum of points is 20. The marks 3, 4 and 5 require a minimum

Tentamen. TFYA35 Molekylfysik, TEN1 24 oktober 2016 kl Skrivsal: G34, G36, G37

What Is Hyper-Threading and How Does It Improve Performance

Här kan du checka in. Check in here with a good conscience

Tentamen i Matematik 3: M0031M.

The cornerstone of Swedish disability policy is the principle that everyone is of equal value and has equal rights.

Tentamen i Modern fysik, TFYA11, TENA

KTH MMK JH TENTAMEN I HYDRAULIK OCH PNEUMATIK allmän kurs kl

D-RAIL AB. All Rights Reserved.

Tentamen i Matematik 2: M0030M.

Exempel på uppgifter från 2010, 2011 och 2012 års ämnesprov i matematik för årskurs 3. Engelsk version

Adding active and blended learning to an introductory mechanics course

Har Du frågor angående uppgifterna: kontakta någon av lärarna, vid lektionerna, via e-post eller på deras rum:

Information technology Open Document Format for Office Applications (OpenDocument) v1.0 (ISO/IEC 26300:2006, IDT) SWEDISH STANDARDS INSTITUTE

Högskolan i Skövde (SK, JS) Svensk version Tentamen i matematik

Försättsblad Tentamen (Används även till tentamenslådan.) Måste alltid lämnas in. OBS! Eventuella lösblad måste alltid fästas ihop med tentamen.

6 th Grade English October 6-10, 2014

Consumer attitudes regarding durability and labelling

This is England. 1. Describe your first impression of Shaun! What kind of person is he? Why is he lonely and bullied?

Module 1: Functions, Limits, Continuity

Tentamen MMG610 Diskret Matematik, GU

Questionnaire for visa applicants Appendix A

Pre-Test 1: M0030M - Linear Algebra.

Att använda flipped classroom i statistisk undervisning. Inger Persson Statistiska institutionen, Uppsala

Calculate check digits according to the modulus-11 method

Appendix 1. Swedish translation of the Gastrointestinal Quality of Life Index (GIQLI)

Jag läser kursen på. Halvfart Helfart

Read Texterna består av enkla dialoger mellan två personer A och B. Pedagogen bör presentera texten så att uttalet finns med under bearbetningen.

Ready for Academic Vocabulary?

TENTAMEN I STRUKTURBIOLOGI

Tentamen, Kvantfysikens principer FK2003, 7,5 hp

Accomodations at Anfasteröd Gårdsvik, Ljungskile

Supplementary Data. Figure S1: EIMS spectrum for (E)-1-(3-(3,7-dimethylocta-2,6-dienyl)-2,4,6-trihydroxyphenyl)butan-1-one (3d) 6'' 7'' 3' 2' 1' 6

Användning av Erasmus+ deltagarrapporter för uppföljning

SUPPLEMENTARY INFORMATION

State Examinations Commission

Förskola i Bromma- Examensarbete. Henrik Westling. Supervisor. Examiner

EXTERNAL ASSESSMENT SAMPLE TASKS SWEDISH BREAKTHROUGH LSPSWEB/0Y09

FK Kvantfysikens principer, Fysikum, Stockholms universitet Tentamensskrivning, onsdag 16 december 2015, kl 17:00-22:00

Lite basalt om enzymer

Tentamen i Fotonik , kl

Service och bemötande. Torbjörn Johansson, GAF Pär Magnusson, Öjestrand GC

Exam Molecular Bioinformatics X3 (1MB330) - 1 March, Page 1 of 6. Skriv svar på varje uppgift på separata blad. Lycka till!!

TENTAMEN I ALLMÄN OCH ORGANISK KEMI

Lösenordsportalen Hosted by UNIT4 For instructions in English, see further down in this document

Transkript:

Tentamen Biokemi 2 KEM090 2011 10 28 Max: 70 poäng Godkänt: 35 poäng Väl godkänt: 52 poäng Inga hjälpmedel tillåtna OBS! Besvara inte mer än en fråga per sida! Markera varje sida med personlig kod, datum och uppgiftsnummer Följande initialer används: STH Susanna Törnroth Horsefield ÖH Örjan Hansson RN Richard Neutze MB Martin Billeter Lycka till! Susanna Törnroth Horsefield tornroth@chem.gu.se 031 786 39 23

Fråga 1: Separation av proteiner (STH) Ange två egenskaper hos proteiner som kan utnyttjas för att separera ett protein från ett annat. Redogör kortfattat för en metod som utnyttjar respektive egenskap (två metoder totalt). (10 poäng) Fråga 2: Centrifugering (STH) Förklara kortfattat de huvudsakliga skillnaderna mellan differentialcentrifugering och gradientcentrifugering. (5 poäng) Fråga 3: Spektroskopi (ÖH) a) Ordna följande kromoforer efter stigande våglängd hos maximum av den optiska absorptionen (den elektroniska övergång som har lägst energi): tryptofan, klorofyll, en peptidbindning. Ge en kvalitativ förklaring till ordningen! (3 poäng) b) Rita ett kvalitativt energinivådiagram för π elektronerna i klorofyll om vi antar att "frielektronmodellen" för elektroner på en ring kan användas. Markera vilka nivåer som är besatta med π elektroner i grundtillståndet. Ledning: det är 18 st π elektroner i klorofyll. (3 poäng) c) Vad menas med en "fluorescensprob"? Redogör för någon metod i biokemiskt arbete som baseras på användningen av en sådan. Redogörelsen skall omfatta metodbeskrivning, vilken typ av fluorescerande molekyl som används samt vilken slags information som kan erhållas med metoden. Illustrera gärna med figur. (4 poäng)

Fråga 4: NMR (MB) a) Stämmer följande påståenden? (svara med ja eller nej ) (1) NMR (kärnmagnetisk resonans) beror på växelverkan mellan atomkärnornas laddning och ett yttre magnetfält (från NMR instrument). (2) Kärnorna av väteatomerna i en proteinmolekyl har olika resonansfrekvenser (kemiskt shift) i ett yttre magnetfält. (3) I vanliga tvådimensionella NMR spektra visar båda axlar frekvenser. (4) NMR information om tredimensionella strukturer av proteiner kan man få genom mätningar av distanser mellan atomer. (5) NMR används ofta för bestämning av tredimensionella proteinstrukturer med atomär upplösning (d.v.s. man får (x,y,z) koordinater för varje atom i proteinet). För detta behövs som startstruktur en oberoende modell av den ungefära strukturen (t.ex. från röntgenkristallografi). (6) Med NMR kan man undersöka dynamiska ändringar i proteiner, d.v.s. interna rörelser i molekylen, som kan vara t.ex. så snabba som picosekunder eller så långsamma som millisekunder. b) Beskriv kort (en typ av) tillämpning av NMR inom drug discovery: vad är syftet, vilka NMR experiment (spektra) genomförs, vad betyder NMR signalerna i dessa spektra... (5 poäng)

Fråga 5: Structural principles (RN) a) Protein back bones have polar groups (N H and C=O) yet it is an important principle of protein structure that proteins contain a hydrophobic core. How do proteins bury the N H and C=O groups? (2 marks) b) Below is illustrated a normal right handed α helix, a 3 10 helix, and a π helix. Explain why the 3 10 and π helices are not very common (3 marks). c) Pick one protein from the course containing a significant amount of β structure (a blue copper protein or GFP). Explain its fold and discuss how its fold helps it to complete its function. (5 marks).

Fråga 6: Cytochrome c oxidase (RN) The picture below shows a schematic overview of the arrangement of co factors and sub units in the structure of cytochrome c oxidase. What is the function of cytochrome c oxidase? Explain the movement of electrons during this function: where do the electrons come from, how are they transported to the active site, and what happens to the electrons when they reach the active site? Proton movements are also believed to be important for the function of cytochrome c oxidase. Explain these movements and where the protons go. (10 marks)

Fråga 7: ATP synthase Below is an illustration of the structure of ATPsynthase. This is an energy transducing membrane protein that is often discussed in analogy with a windmill. Explain the function and structural mechanism of ATPsynthase. Explain why people often say that this is analogous to a windmill. Describe as many structural details in your answer as possible such as the particular arrangement of sub units and the key role played by charged amino acid residues. (10 Marks).

Fråga 8: Photosynthetic reaction centres The pictures below illustrate the oxygen evolving centre (OEC), the active sites of photosystem II. The left picture is a schematic of the calcium, manganese and water arrangement, whereas the right pictures are from a recent high resolution structure of this protein. What is the function of this active site? What are the roles of Tyr z and the histidine residues illustrated in the left figure. What are electrons removed from by this active site and where are they delivered to? What is the importance of the oxygen evolving centre for life on earth? (10 marks).