Calicivirus och andra virus Kjell-Olof Hedlund Enheten för Speciell Diagnostik Smittskyddsinstitutet
Tarmen kan liknas vid ett kärl som lämpar sig mycket väl för virusodling
Ryhovs sjukhus drabbat av vinterkräksjukan Länssjukhuset Ryhov har drabbats av flera fall av vinterkräksjuka. Nu tvingas sjukhuset införa restriktioner på två avdelningar Ett hundratal patienter och vårdpersonal har drabbats hittills, säger Per-Erik Åbom, smittskyddsläkare i Jönköpings län. Musslor och ostron kan orsaka vinterkräksjuka Musslor och ostron kan innehålla bakterier och virus som orsakar exempelvis vinterkräksjuka hos människor. Det visar en ny studie som genomförts av docent Bodil Hernroth vid Kristinebergs marina forskningsstation i Fiskebäckskil, rapporterar Ekot. Varning för extrem kräksjuke-epidemi Var tionde svensk riskerar att smittas i höst Hundratusentals svenskar riskerar drabbas av en extremt smittsam och svår form av vinterkräksjuka i höst. - I värsta fall kan tio procent av befolkningen smittas, säger Smittskyddsinstitutets chefsmikrobiolog.
Virus som orsakar magsjuka Rotavirus Adenovirus Astrovirus Calicivirus Norovirus, vinterkräksjuka Sapovirus
What virus have you got? Single case, no epidemiology. Community: Adult: Calicivirus Child: Calicivirus, rotavirus, astrovirus, adenovirus. Health care: Adult: Calicivirus, rotavirus, astrovirus. Child: Calicivirus, rotavirus, astrovirus, adenovirus.
Spridning norovirus och rotavirus (Moreno-Espinosa et al, 2004)
Frekvens norovirus och rotavirus i olika åldersgrupper
Virus som orsakar magsjuka Rotavirus Mkt virus; lång utsöndringstid; stabil Adenovirus Mkt virus; mkt lång utsöndringstid; stabil Astrovirus Mkt virus; utsöndringstid dåligt känd; stabil Calicivirus Relativt mkt virus; ofta lång utsöndringstid; relativt stabil; mkt stor variation
Diagnostikutveckling i Sverige; norovirus Under 1980 1995 diagnostik endast med elektronmikropskopi. 1995 2000 utvecklades PCR. 2004 känslig realtids-pcr. Resultatet: Diagnostiken hittar nu norovirus i patientprov under mycket lång tid. Skärpt uppmärksamhet på nya varianter Immunologisk påvisning; ingen större succé i Sverige, men i Tyskland..
Vad är vinterkräksjuka? Winter vomiting disease. Utbrott av kräkningar/diarré orsakade av norovirus. Vanligaste orsaken till livsmedelsburna utbrott. Vanligaste orsaken till vårdrelaterad smitta. Vanligaste skälet till föräldrars oro för dagissmitta. Vanligaste sökordet på Vårdguiden. En av de mest stabila patogener som sprids inom vården.
Vinterkräksjukan i backspegeln. 1929; Zahorsky beskriver Winter vomiting disease. 1963; Justus Ström beskriver vinterkräkningarna i sin bok Akuta infektionssjukdomar. 1972; Kapikian et al beskriver Norwalk agent efter ett skolutbrott i Norwalk (Ohio). 1990; Norwalkvirusets hela genom publiceras i Science (Jiang et al.). 2002- ; Humana blodgruppsantigen fungerar som receptorer för norovirusinfektion (Marionneau et al).
Number of patients 600 Calicivirus in Sweden 1986-2005 500 400 300 200 100 0 2002 1987 1994 2002
Varför är norovirusinfektioner så vanliga? Låg infektionsdos. Motståndskraftiga mot desinfektionmedel /stabila i miljön. Stor human reservoar, utdragen virusutsöndring. Kortvarig stamspecific immunitet (veckor till månader). Många smittvägar. Stamdiversitet, genetisk plasticitet.
Norovirus kan spridas mycket effektiv i vården. Utsöndras i mycket stort antal. Lång utsöndringstid hos normalt friska personer. Kroniska bärare; (A)symtomatiska. Asymtomatiska bärare vid utbrott. Lång överlevnad i miljön. Svårsanerad.
Efter vintern 2002-3 började SMI kartlägga norovirus inom vården: Labrapporter: Landets samtliga laboratorier rapporterar sina norovirusfynd varje vecka. Utbrott inom vården: Vårdhygien rapporterar veckovis utbrott inom olika vårdformer. Typning av virusstammar: Molekylär karaktärisering av cirkulerande virusstammar.
Antal Fynd av norovirus per vecka 500 450 400 Norovirus 2005-06 Norovirus 2006-07 Norovirus 2007-08 Norovirus 2008-09 Norovirus 2009-10 Norovirus 2010-11 350 300 250 200 150 100 50 0 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51 53 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 Vecka
Antal fynd Antal rapporterade fynd av norovirus per säsong 9000 8000 7000 6000 5000 4000 3000 2000 1000 0 2003-4 2004-5 2005-6 2006-7 2007-8 2008-9 2009-10
27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51 1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 Antal fynd per vecka Lokala variationer i norovirusfynden 160 140 120 HS+KS 2007-8 Västra Götaland 2007-8 Umeå 2007-8 Malmö 2007-8 100 80 60 40 20 0
Antal virusfynd under säsongen Jämförelse säsongerna 2008-9 och 2009-10 1600 1400 1200 2008-2009 2009-2010 1000 800 600 400 200 0 Malmö Göteborg Solna Huddinge Linköping Uppsala Borås Skövde Jönköping Halmstad Karlstad Umeå SMI Västerås Laboratorieort
Incidens per landsting; vecka 01-22 (fynd/100 000 invånare) 120 100 80 60 40 20 0 Gotland Skåne Östergötland Västra Götaland Gävleborg Jönköping Värmland Uppsala Halland Stockholm Örebro Västmanland Södermanland Västernorrland Västerbotten Jämtland Kronoberg Dalarna Kalmar Norrbotten Blekinge
Antal fynd per vecka Åldersfördelning fynd av norovirus 2003-2009 600 500 65+ år 0-64 år 400 300 200 100 0 2004 2005 2006 2007 2008 2009
Belastningen på vården under säsongstopp 400-500 diagnostiserade fall varje vecka 4000-5000 sjuka. 20-40 rapporterade utbrott varje vecka ett par hundra pågående utbrott. Kostnader???
Rapporterade labfynd av norovirus England/Wales
Genogroups/genotypes of the human norovirus based on capside sequences Genogroup I Genotype Norwalk GI:1 Southampton GI:2 Desert Shield GI:3 Queen s Arms GI:4 Musgrove GI:5 BS 5/98 GI:6 Winchester GI:7 Sindlesham GI:8 GI:9-14 Genogroup II Genotype Hawaii GII:1 Melksham GII:2 Mexico GII:3 Lordsdale GII:4 Hillingdon GII:5 Miami GII:6 Leeds GII:7 Amsterdam GII:8 GII:9-17
45 40 35 30 25 20 15 10 5 0 Årsvarianter norovirus GII.4 samt övriga genotyper Antal typade stammar per månad 2010 2008 2007 2006b 2006a 2004 2002 Icke GII.4
2010
Norovirussäsongen 2010-2011: Relativt tidig start. Ny dominant variant. Norovirus GII.4 variant 2010 blir helt dominerande. Började cirkulera sent förra säsongen, undantaget Skåne. Skapa stora bekymmer inom vården. Nya varianter ger höga rapporteringssiffror vartannat år.
Smittsamhet utan symtom? Volontärstudie (1994) 56% (28/50) med symtom. 26% (13/50) infekterade utan symtom. Sjukhusstudie (2004) under utbrottsäsong 26% (23/87) personal utan symtom; positiva med PCR. 33% (4/12) patienter utan symtom; positiva med PCR. Alla GII.4 Ingen misstanke om att dessa orsakade utbrott.
Klinisk bild vid olika genotyper av norovirus Friesema et al (2009) J Clin Virol 46; 341-44. Men, liten studie, begränsad i tid! Kraftigare symtom (kräkning/illamående) vid GII.4 än andra (GI.3, GI.6, GIIb, GII.3, GII.7). Högre AR hos boende vid GII.4. Mer illamående/feber vid variant 2004 än 2006a. Stora skillnader i ct-värde gav ingen skillnad i AR eller symtom. Virusinnehåll ~100 större vid GGII infektion än vid GGI.
Viruskontamination inom en isoleringsenhet för immundefekta barn Inga bevis för gastroenterit hos patienter. Svabbprov togs från 11 ytor under 10 veckor. Virus påvisades i 20 svabbprov. Norovirus 6%. Rotavirus 10%. Kontaminerade platser var ofta knutna till föräldrars passage genom enheten.
Smittade bakelser 30 sjuka efter att ha ätit rosa bakelser. Rosa bakelser med mosade hallon, gröna med päronextrakt. Calicivirus hos de sjuka, hallonen skickas till Frankrike. Två typer av calicivirus påvisas i hallonen!
Smittöverföring av rotavirus Fekal-Oral Person-till-person smitta Objektsmitta (t ex leksaker) Aerosol Hög smittsamhet 10-100 viruspartiklar är tillräckligt för smittöverföring upp till 10,000,000,000 viruspartiklar/ml utsöndras i avföringen Hög viabilitet, rotavirus kan överleva i veckor I tex kontaminerat vatten eller på objekt Asymtomatiska individer kan sprida smitta 3
Number of Patients Age and Serotypes; Rotavirus 30 G9 G4 G1 25 20 15 10 5 0 0-10 11-20 21-30 31-40 41-50 51-60 61-70 71-80 81-90 91-100 Age group
Number of patients Age of patients with sapovirus infection 40 35 Period 1 (Oct 1994-Oct 2002) Period 2 (Nov 2002-July 2004) 30 25 20 15 10 5 0 0-10 11-20 21-30 31-40 41-50 51-60 61-70 71-80 81-90 91-100