BIOBANKER OCH REGISTER I SKÖN FÖRENING Ingvar Bergdahl Enheten för biobanksforskning, Umeå universitet
INNEHÅLL Hur vi tänker grejen med en biobank Biobankskohorter vid Umeå universitet Två exempel Samköra register-biobank: Vad görs på verkstaden? Lite om vad som byggs idag Behov av stöd Frysar och register Lagar och avtal
GREJEN MED EN BIOBANK
ANVÄND TIDEN!? As the years go passing by
KOHORTSTUDIEN MED EN NÄSTAD (INBYGGD) FALL- KONTROLLSTUDIE 1
IDAG: LOKALT SAMLAD KOHORT IMORGON: BIOBANK SVERIGE- SAMLING? NSHDS = VIP + MONICA + MSP 134.ooo individer, ca. 1/3 med upprep Ca 2 miljoner personår mogna prover! Ven-till-frys-tid: 1 tim Täckning i Västerbottens befolkning >40 år: ca 60% o o Klinisk karaktärisering av fall Koppling till nya studier (Gamla siffror, ännu äldre i figuren fler individer idag)
NSHDS EPIC 90 kontroller N=63 Lungcancer inom 1 år Rökare? 1 Integrative Analysis of Lung Cancer Etiology and Risk (INTEGRAL) JAMA Oncology doi:10.1001/jamaoncol.2018.2078
Integrative Analysis of Lung Cancer Etiology and Risk (INTEGRAL) JAMA Oncology 2018
1 N=334 Två kontroller per fall Validering: N=106 Ljungberg J et al., Circulation 2018;138:590
ANSÖKNINGAR OCH AVTAL Vetenskaplig bedömning i expertgrupp av projektplan Etikprövning Biobanken Tillgångsavtal och Material Transfer Agreement Personuppgiftsbiträdesavtal universitet-lab PUL-anmälan till universitetet
HITTA FALLEN 1
HITTA FALLEN (PLASMA) Provlagerregister Klaffoperationsregister Regionalt tumörregister 1
VÄLJ KONTROLLER 1
VÄLJ KONTROLLER För varje fall: Identifiera alla med samma: o o o o o o Delkohort (VIP, MO, MA) Kön Ålder vid prov (+-2 år) Provdatum (+-4 mån) Kommun Enkättyp Relax, om det behövs o o o Krav o o o Kommun blir älvdal, fri enkättyp Älvdal blir län Inget geografiskt, dubblade tidsgränser Vid liv och bo i länet när fallet blev fall Ej i klaffregister Markera tumörfall 1
VÄLJ KONTROLLER Provlagerregister Klaffoperationsregister Regionalt tumörregister Befolkningsregistret Enkätdataregister med enkättyper Inte ovanligt att överraskningar orsakar omtag 1
Sällsynta diagnoser Reserverat prov för annan studie Likviditet (prov kvar) Tinat-otinat Blodsmitta KOLLA VALBARHET (KORSTRÄFFAR) Avsagt sig deltagande Ibland ommatchning 1
Regionalt tumörregister Flaggade fall Provlagerregister Pipelinefiler KOLLA VALBARHET (KORSTRÄFFAR) 1
INTE BARA PLASMA Plasma: prospektiva fall + 2 kontroller DNA: alla fall + 2 kontroller Enkät: prospektiva fall + 4 kontroller Görs parallellt för att i möjligaste mån få samma kontroller.
BATCHNING OCH SORTERING Plasmaprov till olika labb: flera alikvoter Rör och plattor Begränsa rumstemperaturstid Önskad analysordning (fall-kontroll, slumpat) Informationsfil från forskarna Analyser, plattor eller rör, etc. Fall-kontrollfil
Baslinjedata levereras Delvis harmoniserade DATASET Datasetet för publikationen kan lagras och registreras på SND (nytt) Bruttoanalysdata katalogiseras och sparas (skärpning pågår)
TIDSKRIFTENS GRANSKARE: VALIDERA! Öppen- och slutenvårdsregister Västerbotten och Norrbotten Den definierade fall-kontrollstudien och alla de andra N=334 Validering: N=106 Två kontroller per fall 1
Prospektiv (biobank) Många Bakgrundsfaktorer Separat validering Klinisk karaktärisering (journaler) Bra prover
? As the years go passing by
? As the years go passing by