BIOBANKER OCH REGISTER I SKÖN FÖRENING. Ingvar Bergdahl Enheten för biobanksforskning, Umeå universitet

HTML
DOWNLOAD

Storlek: px

Starta visningen från sidan:

Download "BIOBANKER OCH REGISTER I SKÖN FÖRENING. Ingvar Bergdahl Enheten för biobanksforskning, Umeå universitet"

Ove Berg
för 6 år sedan
Visningar:

1 BIOBANKER OCH REGISTER I SKÖN FÖRENING Ingvar Bergdahl Enheten för biobanksforskning, Umeå universitet

2 INNEHÅLL Hur vi tänker grejen med en biobank Biobankskohorter vid Umeå universitet Två exempel Samköra register-biobank: Vad görs på verkstaden? Lite om vad som byggs idag Behov av stöd Frysar och register Lagar och avtal

3 GREJEN MED EN BIOBANK

5 ANVÄND TIDEN!? As the years go passing by

6 KOHORTSTUDIEN MED EN NÄSTAD (INBYGGD) FALL- KONTROLLSTUDIE 1

IDAG: LOKALT SAMLAD KOHORT IMORGON: BIOBANK SVERIGE- SAMLING? NSHDS = VIP + MONICA + MSP 134.ooo individer, ca. 1/3 med upprep Ca 2 miljoner personår mogna prover!

7 IDAG: LOKALT SAMLAD KOHORT IMORGON: BIOBANK SVERIGE- SAMLING? NSHDS = VIP + MONICA + MSP 134.ooo individer, ca. 1/3 med upprep Ca 2 miljoner personår mogna prover! Ven-till-frys-tid: 1 tim Täckning i Västerbottens befolkning >40 år: ca 60% o o Klinisk karaktärisering av fall Koppling till nya studier (Gamla siffror, ännu äldre i figuren fler individer idag)

8 NSHDS EPIC 90 kontroller N=63 Lungcancer inom 1 år Rökare? 1 Integrative Analysis of Lung Cancer Etiology and Risk (INTEGRAL) JAMA Oncology doi: /jamaoncol

9 Integrative Analysis of Lung Cancer Etiology and Risk (INTEGRAL) JAMA Oncology 2018

11 1 N=334 Två kontroller per fall Validering: N=106 Ljungberg J et al., Circulation 2018;138:590

12 ANSÖKNINGAR OCH AVTAL Vetenskaplig bedömning i expertgrupp av projektplan Etikprövning Biobanken Tillgångsavtal och Material Transfer Agreement Personuppgiftsbiträdesavtal universitet-lab PUL-anmälan till universitetet

13 HITTA FALLEN 1

14 HITTA FALLEN (PLASMA) Provlagerregister Klaffoperationsregister Regionalt tumörregister 1

15 VÄLJ KONTROLLER 1

16 VÄLJ KONTROLLER För varje fall: Identifiera alla med samma: o o o o o o Delkohort (VIP, MO, MA) Kön Ålder vid prov (+-2 år) Provdatum (+-4 mån) Kommun Enkättyp Relax, om det behövs o o o Krav o o o Kommun blir älvdal, fri enkättyp Älvdal blir län Inget geografiskt, dubblade tidsgränser Vid liv och bo i länet när fallet blev fall Ej i klaffregister Markera tumörfall 1

17 VÄLJ KONTROLLER Provlagerregister Klaffoperationsregister Regionalt tumörregister Befolkningsregistret Enkätdataregister med enkättyper Inte ovanligt att överraskningar orsakar omtag 1

18 Sällsynta diagnoser Reserverat prov för annan studie Likviditet (prov kvar) Tinat-otinat Blodsmitta KOLLA VALBARHET (KORSTRÄFFAR) Avsagt sig deltagande Ibland ommatchning 1

19 Regionalt tumörregister Flaggade fall Provlagerregister Pipelinefiler KOLLA VALBARHET (KORSTRÄFFAR) 1

20 INTE BARA PLASMA Plasma: prospektiva fall + 2 kontroller DNA: alla fall + 2 kontroller Enkät: prospektiva fall + 4 kontroller Görs parallellt för att i möjligaste mån få samma kontroller.

21 BATCHNING OCH SORTERING Plasmaprov till olika labb: flera alikvoter Rör och plattor Begränsa rumstemperaturstid Önskad analysordning (fall-kontroll, slumpat) Informationsfil från forskarna Analyser, plattor eller rör, etc. Fall-kontrollfil

22 Baslinjedata levereras Delvis harmoniserade DATASET Datasetet för publikationen kan lagras och registreras på SND (nytt) Bruttoanalysdata katalogiseras och sparas (skärpning pågår)

23 TIDSKRIFTENS GRANSKARE: VALIDERA! Öppen- och slutenvårdsregister Västerbotten och Norrbotten Den definierade fall-kontrollstudien och alla de andra N=334 Validering: N=106 Två kontroller per fall 1

28 Prospektiv (biobank) Många Bakgrundsfaktorer Separat validering Klinisk karaktärisering (journaler) Bra prover

29 ? As the years go passing by

30 ? As the years go passing by

Relevanta dokument

Forskning: Ansökan om registeruppgifter från kvalitetsregister

Version april 2016 Forskning: Ansökan om registeruppgifter från kvalitetsregister För ytterligare information om definitioner se ansökan till etikprövningsnämnderna. Ansökan ska skickas till det RCC som