RNA-syntes och Proteinsyntes Jenny Flygare (jenny.flygare@ki.se)
Genexpression - översikt
5 (p) A T G T C A G A G G A A T G A 3 (OH) T A C A G T C T C C T T A C T 3 (OH) 5 (p) VAD TRANSLATERAS DEN HÄR DNA DUBBELHELIXEN TILL FÖR RNA?
Transkription, basparning http://www.youtube.com/watch?v=vjsmz3 DsntU
Transkription = Avskrivning RNA-syntes med DNA som mall
Uppbyggnad av en eukaryot gen Reglerande sekvenser (promotor och andra sekvenser) Sekvenser som är mall för RNA syntes (exoner och introner). Intronerna kommer efter transkription spjälkas bort Exonerna ger upphov till protein
Transkription en stegvis process Igenkänning av specifika DNA sekvenser: RNA syntes börjar Initiering RNA syntes Elongering Igenkänning av specifika DNA sekvenser: RNA syntes slutar Terminering
Initiering TATA-box bindande protein (TBP) och transkriptionsfaktorer (TF) binder till promotorsekvensen på en gen
Initiering Transkriptionsfaktorer (TF) och andra faktorer binder till RNA-polymeras, som då binder till promotorn tillsammans med ytterligare TFs
Elongering, terminering Transkription börjar vid initieringsstället nedströms om promotorn. Nukleotider basparas med DNAt och sammanlänkas med fosfatgrupper. Transkriptionen slutar vid en GC-rik sekvens som formar hairpin loop
Hos eukaryoter finns det olika typer av RNA-polymeraser Typ av Polymeras RNA polymeras I RNA polymeras II RNA polymeras II Gener transkriberade rrna gener Alla proteinkodande gener trna gener
Transkription http://www.youtube.com/watch?v=wsofh4 66lqk
Pre-mRNA processning: Capping Capping: m7g = 7-metylguanylat
7-metylguanosin kopplas på 5 änden av premrna så fort den blir fri 5 cap struktur
5 cap funktion stabilitet transport ut ur kärnan bindning till ribosom
Klyvning Endonukleas klyver vid signalen AAUAAA
Polyadenylering Poly-A-polymeras syntetiserar en poly-a svans
Funktion poly-a svans stabilitet transport ut ur kärnan
RNA processing http://www.youtube.com/watch?v=yjwuvr zvzya
Splitsning = splicing Vad är exon? intron? Ribonukleoproteiner i spliceosomen klyver intron vid speciella sekvenser och sammanfogar exoner.
Spliceosome n sköter pre-mrna splicing
Alternativ splicing Flera exon (olika färger) Olika mrna Olika protein
I vilken ordning, och vad betyder det? Poly-adenylering Bindning av transkriptionsfaktorer Terminering av transkription Splicing RNA-syntes Klyvning Capping
Translation = översättning Proteinsyntes med mrna som mall
Genetiska koden; En triplett (kodon) på mrna molekylen motsvarar en aminosyra
Vilka tre tripletter är stopp-kodon? Vilken triplett är startkodon, som också kodar för metionin? (se tabell förra bilden)
transferrna (trna) molekylen Acceptor stem = aminosyraarmen
Genetiska koden; trna kopplas till sin rätta aminosyra och för den till rätt plats genom att antikodon på trna basparar med ett komplementärt kodon på mrna
Ribosomen Ribosomen är en komplex katalytisk maskin men mer än 50 olika proteiner och en mängd molekyler ribosomalt RNA (rrna) Aktiva ribosomer består av en liten (40S) och en stor (60S) subenhet i eukaryota celler I eukaryota celler är ribosomerna lokaliserade i cytoplasman eller ER
Ribosomen håller ihop translationskomplexet och katalyserar peptidbindningar mellan aminosyrorna
Translationen delas upp i initiering, elongering och terminering Start kodon: AUG Stopp kodon: UAG, UAA, UGA
Proteinsyntes
Protein synthesis http://www.youtube.com/watch?v=kvyeqgb 7XN8
Initiering av translation Initieringsfaktorer (IFs) och GTP binder till 40S, liksom mrna och initiator trna med aminosyran metionin
Initieringsfaktorer och GDP lossnar, och 60S subenheten binder Initiering av translation
Elongering vid translation P= peptid-site A = aminosyra site EF = elongeringsfaktor Vid elongering förankras nya trna vid ribosom-mrna komplexet
Elongering vid translation Nya aminosyror fogas samman till en växande polypeptidkedja mha peptidbindningar. trnat flyttar till peptid-site
Terminering av translation Vid terminering binder en release faktor in till stopp-kodon
Terminering av translation Detta leder till att proteinet och de övriga komponenterna blir fria
Vilka viktiga komponenter ingår vid translation? Vilka faser delas translation in i, och vad händer i de olika faserna? Hur startar och stoppar translationen?
Transcription and translation httwww.youtube.com/watch?v=bk7pw1fk MTIp://