STOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING

Transkript

1 STOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING TENTAMEN Kurs: Prokaryot cell- och molekylärbiologi (PCMB) Datum: kl Visat betald terminsräkning och legitimation _ signatur (tentamensvakt) Tillåtna hjälpmedel: inga Födelsedatum Namn Ifylles av examinator Adress Poäng Postnummer Postadress Betyg Antal besvarade uppgifter Antal inl. lösa blad Max poäng Godkändgräns VG-gräns

2

3 1. Vilket av följande antibiotika inhiberar peptidoglykansyntes? (Kryssa för det rätta alternativet) (2p): a) kloramfenicol b) tetracyklin c) penicillin d) polymyxin e) nystatin 2. Ange Rätt eller Fel för varje påståenden om det bakteriella RNA polymeraset/transkriptionsprocessen. För varje felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. Det lönar sig alltså bättre att lämna alternativ obesvarade än att gissa fel. (2p) a) En mrna molekyl, som är resultatet av transkriptionen, innehåller hos bakterien ofta information för flera olika proteiner b) Under transkriptionsprocessen exponeras den ena kodande DNA strängen för RNA polymeraset genom att strängarna tas isär (en bubbla bildas). Bubblan flyttas alleftersom RNA polymeraset avläser längs den kodande DNA tråden. c) För att kunna känna igen en promotorsekvens krävs en σ-faktor förutom RNA polymerasets core-enzym. d) Ofta transkriberade gener, för t.ex. ribosomproteiner, ligger ofta nära origin of replication e) RNA bildas under transkriptionsprocessen med en hastighet av ungefär 50 nukleotider per sekund. 3. Många bakterier kan simma.. Ange Rätt eller Fel för varje påståenden. För varje felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. (2p) a) rörelseorganen kallas fimbrier b) då rörelseorganen roterar åt ena hållet drivs bakterien framåt c) då rörelseorganen roterar åt andra hållet drivs bakterien bakåt d) rörelseorganens svans består av proteinet flagellin e) det måste finnas en protongradient över plasmamembranet för att bakterien ska simma

4 4. Ett medium består av följande i vatten: glucose, NaCl, K 2 HPO 4, KH 2 PO 4, MgSO 4, FeSO 4, CaCl 2. Ange Rätt eller Fel för varje påståenden. För varje felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. (2p) Detta är ett: a) syntetiskt medium b) komplext medium c) LB medium d) selektivt medium e) definierat medium 5. Vid en Hfr x F - korsning mellan två E. coli stammar överförs en markör efter 5 min och en annan efter 25 min. Ange Rätt eller Fel för varje påståenden. För varje felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. (2p) a) Det ligger 4000 gener mellan de två markörerna b) Då korsningen avbryts efter 50 min har de flesta mottagarna blivit Hfr c) Mottagarstammen har sex-pili d) En enkelsträngad DNA molekyl har förts över i en cytoplasmatisk brygga e) Efter överföringen kan homolog rekombination ske 6. Ange Rätt eller Fel för varje påstående om en virulent fag. För varje felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. (2p) a) Den kan gå in i lytisk tillväxt b) Den kan göra en bakterien lysogen c) Den ger klara plack d) Den sprutar in sitt DNA i bakterien e) Den kan föröka sig som en del av bakteriens kromosom

5 7. Ange Rätt eller Fel för varje påståenden om translationen. För varje felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. (2p) a) Initieringen av translationen sker med hjälp av ett visst start-kodon. Detta kodon är unikt för initiering och finns ej inuti den kodande delen av mrna. b) Translokering under translationsprocessen innebär att mrna förflyttas relativt till ribosomen med ett kodon. c) Som hjälp vid termineringen läser en speciell stopp-trna av stoppkodonet varpå terminering sker. d) Laddningen av rätt aminosyra till rätt trna görs av ett enzym som känner igen såväl aminosyran som trna molekylen, varpå aminosyran kopplas ihop med sin rätta trna. e) mrna förankras till ribosomen under initieringsskedet genom komplementär basparning till ribosomens 16S rrna. 8. Vid en laboration spädde du bakterierna på följande sätt: 0.05 ml av kulturen sattes till 5 ml SB. Från detta rör togs 0.1 ml och sattes till 0.9 ml SB. Från det sista röret togs 0.1 ml som spreds på en agarplatta. Efter inkubering kunde du räkna 14 kolonier på plattan. Hur stor var bakteriekoncentrationen (ml -1 ) i den ursprungliga kulturen? (2p) a) 1.4 x 10 3 O b) 1.4 x 10 4 O c) 1.4 x 10 5 O d) 1.4 x 10 6 O e) 1.4 x 10 7 O 9. Vad innebär transduktion? (Kryssa för det rätta alternativet) (2p) a) Att DNA endast överförs när en cell kommer i direkt kontakt med en annan. O b) Att DNA överförs efter att cellerna fått en elektrisk stöt. O c) Plasmid-upptag med hjälp av kalcium fosfat. O d) DNA förs från en bakteriecell till en annan med ett virus. O e) Upptag av naket DNA. O

6 10. Ange Rätt eller Fel för varje påståenden rörande transposoner. För varje felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. (2p) a) Transposonen bär på en egen gen, som kodar för det enzym som behövs för dess överföring till nya positioner b) Transposoner kan flyttas från plasmid till kromosomen hos värdbakterien c) Transposoner kan överföras med hjälp av ett bakterievirus från en bakterieindivid till en annan av samma art. d) Transpositionen är beroende av RecA och homologa sekvenser e) Targetsekvensen dupliceras vid transpositionen

7 Obs! Läs detta innan du börjar besvara följande två essäfrågor: Försök skriva koncist och inte alltför ordrikt. Skriv bara sådant som du är någorlunda säker på är rätt - felaktiga uppgifter drar ner helhetsintrycket. Var särskilt noga med att använda facktermer på ett korrekt sätt. För att få högsta poäng måste man visa att man kan sätta in faktakunskaper i ett sammanhang. Dessutom ska man kunna uttrycka sig klart och strukturera svaret väl. 11. Just nu finns en risk att en influensapandemi skulle kunna uppstå. Beskriv så noga du kan de virus som skulle kunna vara inblandade och mekanismen för hur ett nytt farligt virus skulle kunna skapas. Vad kallas förloppet? Beskriv också hur ett influensavirus kommer ut ur värdcellen. (7p)

8

9 12. Beskriv noga hur du skulle undersöka om en bakterie har ett restriktionsmodifikationssystem. Förklara också vad som händer i bakterien. (8p)