BIOLOGISK SYNTES AV PROTEIN
|
|
- Eva Dahlberg
- för 8 år sedan
- Visningar:
Transkript
1 UMEÅ UNIVERSITET LABORATIONSHANDLEDNING Biokemi Farmaceutisk kemi 1 Lars Backman BIOLOGISK SYNTES AV PROTEIN Utblick Våra gener innehåller all information som behövs för att tillverka en ny kopia av oss själva. Genom att generna blandas från båda föräldrarna blir våra avkommor exakt kopior av oss. Genom den mycket snabba utvecklingen inom det som allmänt kallas bioteknik kan man med mycket enkla medel göra nästan vad som helst med en uppsättning gener hos en levande varelse. Många av dessa möjligheter som i grunden är postiva för oss, som t ex sjukdomsdiagnostik, kan samtidigt användas för helt andra ändamål. Hur mycket vill vi veta om de sjukdomsanlag som vi kanske bär på? Ökad kunskap inom det här området, tillsammans med den information om det mänskliga genomets bassekvens som följer av HUGO-projektet, leder till svåra etiska frågor som vi måste ta ställning till. Målsättning Efter laborationen skall du: Förstå hur information förs från DNA till RNA till protein Veta var och hur proteiner tillverkas i en levande cell Ha viss kunskap om proteiners struktur Känna till hur man klonar en gen Lab - Protein syntes.docx
2 Proteinsyntes 2(5) TEORI Introduktion Sedan början av 1970-talet har en fullkomlig revolution ägt rum inom modern biologi och biokemi. En helt ny metodik har utvecklats. Metoderna kallas för rekombinant-dna-teknik eller genetisk ingenjörskonst och grundas på möjligheten till genkloning. Genkloning är en teknik där man preparerar fram en specifik gen från större DNA-molekyler och mångfaldigar den. Tekniken spelar en viktig roll i dagens forskning; den används för att studera geners sekvens och struktur liksom kontroll av genuttryck men även proteiners och peptiders primärstruktur. Specifika genmodifieringar som riktad mutagenes eller deletioner har också blivit möjliga att göra. Rekombinant-DNA-tekniken är även viktig inom industrin, t ex för produktion av antibiotika, vacciner, hormoner, enzymer som bryter ned miljöfarligt avfall etc. Genkloning Vid genkloning måste rent DNA med de specifika generna prepareras fram. Arbetar man med högre eukaryota organismer så måste man ta hänsyn till att generna består av både exoner och introner. Exonerna är de delar av DNA som innhåller den information som translateras, dvs översätts till protein, och mellan dessa finns introner. Introner är DNA som inte översätts utan transkriberas och klipps bort via splicing när exonerna sätts ihop. Eftersom splicing inte sker hos bakterier kommer det inte att ske syntes av något funktionellt protein vid uttryck av eukaryota gener. För att undvika detta problem går man bakvägen istället. Först isoleras moget mrna vilka innehåller RNA med bortklippta introner sedan låter man enzymet omvänt transkriptas ( reverse transcriptase ) använda detta mrna som mall för syntesen av komplementärt DNA (cdna). Därigenom får man ett DNA-fragment som bara innehåller den kodande delen av genen. Vektorer Vektorer eller plasmider används som redskap för uttryck av gener till proteiner. Dessa vektorer har viktiga egenskaper: i) de kan överföras till bakterier; ii) de hålls stabila i värdcellen; och iii) de innehåller information för uttryck av proteiner. Vektorer finns naturligt i en mängd olika organismer, både prokaryota och eukaryota, och man brukar prata om två huvudgrupper, plasmider och bakteriofager. Plasmider kan replikera sig oberoende av värdcellens kromosom och finns naturligt hos en del bakterier liksom hos jäst. Bakteriofager är virus som infekterar bakterier. Virus injicerar sin kromosom in i värdcellen och replikeras där, antingen som egen DNA-molekyl eller inkorporerat i värdcellens kromosomala DNA. Det finns en mängd olika vektorer tillgängliga. Alla kommer ursprungligen från naturligt förekommande plasmider eller virus och har modifierats på olika sätt för att passa genkloningstekniken. Inkorporering av DNA i en vektor För att praktiskt inkorporera ett DNA-fragment i en vektor så klipper man upp den med ett eller två restriktionsenzymer. Restriktionsenzymer är enzymer som hydrolyserar fosfodiesterbindningen vid vissa speciella DNA-bassekvenser och de benämns utifrån vilken bakterie de härstammar från. EcoR I (från Escherichia coli) klyver vid sekvensen GAATTC och BamH I (från Bacillus amyloliquefaciens) klyver vid GGATCC. Det finns olika typer av restriktionsenzymer: enzymer som klyver dubbelsträngat DNA så att det sticker ut en bit enkelsträngad DNA, vilket ger sticky ends, och enzymer som klyver DNAs båda strängar på samma ställe så att ändarna är trubbiga, blunt ends. STICKY ENDS -N-G-A-A-T-T-C-N- EcoRI -N-G A-A-T-T-C-N- -N-C-T-T-A-A-G-N- -N-C-T-T-A-A G-N- BLUNT ENDS -N-A-G-C-T-N- AluI -N-A-G C-T-N- -N-T-C-G-A-N- -N-T-C G-A-N- Det här kan man utnyttja när man vill sätta ( klistra ) ihop två fragment som tidigare inte har suttit ihop. Man klyver vektorn och DNA med enzymer som ger samma sorts ändar. Även om man kan få sticky ends att sitta ihop genom basparning så krävs det att man fyller igen hålen ( nicks ) i DNAet genom att återskapar fosfodiesterbindningarna. Dessa nicks repareras av enzymet DNA-ligas. Den konstruktion som nu skapats av plasmiden och det nya DNA-fragmentet kallas för en rekombinant DNA-molekyl. Ofta innehåller vektorerna en gen som kodar för resistens mot en viss antibiotika. Bakterierna kan då överleva i ett medium som innehåller just den antibiotikan. Antibiotikan ampicillin (och andra penicillinderivat) binder till och inhiberar enzymer som deltar i syntesen av bakteriens cellvägg och hindrar därigenom bakterierna att växa. Genen för resistens mot ampicillin kodar för ett enzym, β-lactamas, som utsöndras i periplasman hos bakterien och katalyserar hydrolys av β-lactamringen på
3 Proteinsyntes 3(5) ampicillin vilket medför att ampicillinet förlorar sin funktion. Eukaryot cell Prokaryot cell DNA prepareras Klyva med restriktionsenzymer m-rna Reverse Transkriptas c-dna (ev. konstruera linkers) Separera fragment genom gelelektrofores Preparera fragment av en viss storlek lacz ATG ACC ATG ATT ACG CCA AGC TTG CAT GCC TGC AGG Hind III Oligerad vektor Normal cell RbCl, 0 C DNA-Ligas Kompetent cell Självligerad vekto r "Fel" rekombinerad DNA-molekyl "Rätt" rekombinerad DNA-molekyl TCG ACT CTA GAG GAT CCC CGG GTA CCG GTA GAA GFPuv ATG ATG TAA TGA ATT CCA ACT GAG stopp EcoR I Figur 2. Restriktionskarta över pgfpuv Amp r - genen för ampicillinresisten; P lac - lac-operonets promotor; puc ori - start för replikation av plasmiden. 42 C Transformering Klon med "fel" vektor Klon med "rätt" vektor Figur 1. Grundläggande steg inom genkloning Plasmiden pgfpuv cell utan vektor överlever inte Klon med självligerad vektor Agar med antibiotika Plasmiden (pgfpuv) innehåller flera viktiga gensekvenser. Bl a finns genen för ampicillinresistens (amp r ), origin för replikationen (puc ori) och en inducerbar promotor för lac operonet (P lac ). Efter promotorn finns den kodande DNA-sekvensen för Green fluorescent protein (GFP). DNA-sekvensen som vi ska undersöka innehåller informationen för GFP, ett protein som normalt finns i manter av familjen Aequorea victoria. Om man belyser GFP med UV-ljus så börjar proteinet fluoresera, vilket kan utnyttjas för att t ex följa reningen av GFP. Den rekombinanta plasmiden överförs till en värdcell via transformering. Man använder ofta bakterier som värdceller för främmande DNA eftersom bakterier är lätta att odla och manipulera. Först måste man behandla bakterien så att den kan släppa in plasmiden, dvs göra cellerna kompetenta. Kompetenta celler utsätts sedan för en iskall saltlösning (ofta RbCl) varefter man utsätter cellerna för en värmechock (42 C). Detta gör små hål i cellhöljet och plasmiden kan tas upp. Celler kan även transformeras med elektroporering, vilket innebär att cellerna får en elektrisk chock istället för värmechock. Elektropoering är ofta både enklare och effektivare än värmechock. När en cell tagit upp en plasmid kallar man den för en transformerad cell. Varje cell som överlever odling i medium med ampicillin (eller annan lämplig antibiotika) kommer att innehålla en plasmid och ger upphov till identiska kopior när den delar på sig. På en agarplatta kan detta ses som kolonier av celler där varje koloni är en klon. Uttryck av proteinet Efter att ha isolerat en klon med den rekombinanta genen kan man börja studera genen eller proteinet. För studier av proteinet odlas cellerna så att proteinet produceras. Uttryck av främmande proteiner är ofta toxiskt för bakterierna. För att undvika detta brukar man låta bakteriekulturen växa till en viss densitet (ca 1x10 7 celler/ml) och först därefter inducerar man produktionen av proteinet. Har man använt en plasmid med lac-
4 Proteinsyntes 4(5) operonets promotor framför genen sätter inducerar man syntes av proteinet genom att tillsätt IPTG (isopropylthiogalactopyranos) till bakteriekulturen. IPTG binder till lacrepressorn och förhindrar repressorn att inhibera proteinsysntes. Efter induktion låter man bakterierna producerar proteinet under en viss tid och skördar (centrifugera ner cellerna) därefter.
5 Proteinsyntes 5(5) EXPERIMENTELL DEL: BIOLOGISK SYNTES AV PROTEIN Lösningar och kemikalier Sterila lösningar DNA (plasmid pgfpuv) 1 ng/µl (i TE) LA 100/Amp och LA 100/Amp/IPTG plattor (100 µg amp/ml och 0.5 mμ IPTG) kompetenta celler (E. coli/jm109) plastinöser SOB-medium (komplementerat med Mg 2+ ) Sterila glasvaror mm Övrigt Pipettspetsar (200 µl) Eppendorfrör rackla (plast, glas) Kylblock (kylt -20 C) eller isbad Värmeblock eller vattenbad (42 C) UV-lampa Automatpipetter (20 µl och 200 µl) "rackelsnurra" Transformering och odling Tina 200 µl JM109 kompetenta celler på is. Torka under tiden 1 LA 100/Amp-platta och 1 LA 100/Amp/IPTG-platta i 37 C. Blanda 10 µl pgfpuv med 100 µl tinade kompetenta celler i två sterila Eppendorfrör. Inkubera båda proven på is i minuter. Heat-shock Värm cellerna ( heat-shock ) vid 42 C i 90 sec i ett värmeblock eller vattenbad. Kyl på is i 5 min. Tillsätt 0.2 ml SOB och blanda om. Inkubera rören i minuter på skak vid 37 C. Rackla ut lösningarna på LA-plattorna med och utan IPTG. Skriv upp namn, datum och typ av kultur på plattans undersida. Inkubera plattorna upp- och nervända i 37 C över natt. Analys av syntetiserat protein För att analysera om bakterierna har tillverkat GFP utnyttjas GFP fluorescerande egenskap. Beräkna hur många kolonier som har växt på de båda agar-plattorna. Belys sedan plattorna med UV-ljus och beräkna hur många kolonier som fluorescerar. Laborationsredogörelsen ska innehålla Teori: Beskriv teori och syftet med laborationen. Resultat: Diskussion: Referenser Beskriv resultaten och jämför speciellt tillväxten på de båda plattorna. Diskutera resultaten med utgångspunkt från teorin. Besvara även följande: Varför ger man bakteriecellerna en chock i samband med transformeringen? Vilken funktion har IPTG? Vad skulle hända om IPTG utelämnades? Varför tillverkas inte GFP på båda agar-plattorna? Brown, T.A. Gene Cloning and DNA analysis. An Introduction. 4th ed. (2001) Blackwell Science. Maniatis, T., Fritsch, E.F. & Sambrook, J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 3rd ed. (2001) Cold Spring Harbor Laboratory Press (USA)
DNA-labb / Plasmidlabb
Översikt DNA-labb Plasmidlabb Preparation och analys av -DNA från Escherichia coli Varför är vi här idag? Kort introduktion till biokemi och rekombinant DNA- teknologi Vad skall vi göra idag? Genomgång
Läs merGenkloning och PCR av tetracyklinresistensgen. från pacyc184 till puc19
Umeå Universitet Biomedicinska analytikerprogrammet Genkloning och PCR av tetracyklinresistensgen från pacyc184 till puc19 Årskull: Laborationsrapport i Molekylärbiologisk laboratoriemetodik, termin 3
Läs merLAB 12. Preparation och analys av plasmid-dna från E.coli
Institutionen för biokemi och biofysik LAB 12 Preparation och analys av plasmid-dna från E.coli Basåret 2012 (finns på basårshemsida: www.kemi.su.se, välj Basår) INTRODUKTION I denna laboration ska vi
Läs merMolekylär bioteknik. Vad är en gen? Molekylärbiologiska verktygslådan. Eukaryot transkription/translation. Prokaryot transkription/translation
Molekylär bioteknik Föreläsning 1 Molekylär Bioteknik 2008 Molekylärbiologi Mikrobiologi Biokemi enetik Kemiteknik ellbiologi ransgena djur -växter -djur Diagnostik -genetisk predisposition -detektion
Läs merTFKE32/TFKI09/9KEA21. Laboration i Genteknik
TFKE32/TFKI09/9KEA21 Laboration i Genteknik Denna laboration består av tre delar: A. Restriktionsklyvning av plasmiden pcantab samt konstruering av restriktionskarta. B. Preparation av plasmiden pcantab
Läs merBASÅRET KEMI B BIOKEMI VT 2012. GENETISK INFORMATION 191-210 (sid. 157-177)
BASÅRET KEMI B BIOKEMI GENETISK INFORMATION 191-210 (sid. 157-177) DNA/RNA, Transkription, Translation VAR I CELLEN SKER DETTA? Replikation - kopiering av DNA, sker i cellkärnan Transkription - avläsa
Läs merInstuderingsfrågor avsnitten Molekylär genetik och Rekombinant DNA tekniker, MCB
Instuderingsfrågor avsnitten Molekylär genetik och Rekombinant DNA tekniker, MCB Molekylärgenetikdelen 1. Vad är DNA? 2. Vad heter byggstenarna i DNA? 3. Vad är RNA? 4. Vad är en bas, nukleosid, nukleotid
Läs merOmentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Fråga 1 (2p) Fråga 2 (2p) Fråga 3 (2p)
Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, 050402 Fråga 1 Eukaryota och prokaryota celler har vissa saker gemensamt men skiljer sig markant i många avseenden. Markera vilka av nedanstående alternativ
Läs merPROV 6 Bioteknik. 1. Hur klona gener med hjälp av plasmider?
För essäsvaren 1 2 kan den sökande få högst 9 poäng/fråga. Vid poängsättningen beaktas de exakta sakuppgifter som den sökande gett i sitt svar. För dessa kan den sökande få högst 7 poäng. Dessutom 1. Hur
Läs merLadokkod: TK151C Tentamen ges för: Bt3. Namn: Person nummer: Tentamensdatum: 17/12 2012. Tid: 09:00-13:00. Hjälpmedel
Molekylärbiologi 7.5 ECTS Ladokkod: TK151C Tentamen ges för: Bt3 Namn: Person nummer: Tentamensdatum: 17/12 2012 Tid: 09:00-13:00 Hjälpmedel Tillåtna hjälpmedel är lexikon. Dock EJ elektroniskt lexikon
Läs merGenkloning och PCR av tetracyklinresistensgen från pacyc184
Umeå Universitet Biomedicinska analytikerprogrammet Genkloning och PCR av tetracyklinresistensgen från pacyc184 Årskull: Laborationsrapport i molekylärbiologisk labmetodik, termin 4 Laborationsdatum: Inlämnad:
Läs merPROV 6 Bioteknik. 1. Hur klona gener med hjälp av plasmider?
För essäsvaren 1 2 kan den sökande få högst 9 poäng/fråga. Vid poängsättningen beaktas de exakta sakuppgifter som den sökande gett i sitt svar. För dessa kan den sökande få högst 7 poäng. Dessutom får
Läs merTillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen
IFM/Kemi Linköpings Universitet September 2011/LGM Projektlaboration i genteknik Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen Innehållsförteckning Inledning... 3 Amplifiering
Läs merDNA-molekylen. 1869 upptäcktes DNA - varken protein, kolhydrat eller lipid.
Genetik Ärftlighetslära - hur går det till när egenskaper går i arv? Molekylär genetik - information i DNA och RNA Klassisk genetik - hur olika egenskaper ärvs Bioteknik - Hur DNA flyttas mellan olika
Läs merLinköpings Universitet. Lägesspecifik Mutagenes av proteiner
IFM/Kemi Linköpings Universitet Augusti 2007/LGM Lägesspecifik Mutagenes av proteiner Lägesspecifik mutagenes Introduktion In vitro lägesspecifik mutagenes är en ovärderlig teknik för att t.ex. studera
Läs merRNA-syntes och Proteinsyntes
RNA-syntes och Proteinsyntes Jenny Flygare (jenny.flygare@ki.se) Genexpression - översikt 5 (p) A T G T C A G A G G A A T G A 3 (OH) T A C A G T C T C C T T A C T 3 (OH) 5 (p) VAD TRANSLATERAS DEN HÄR
Läs merSTOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING
STOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING TENTAMEN Kurs: Prokaryot cell- och molekylärbiologi (PCMB) Datum: 2006-10-07 kl. 9-12 Visat betald terminsräkning och legitimation signatur
Läs merNUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra
NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra Monomererna som bygger upp nukleinsyrorna kallas NUKLEOTIDER. En nukleotid består av tre delar: en kvävebas
Läs merKOMMENTARER TILL KAPITEL 9 OCH KAPITEL 16
1 KOMMENTARER TILL KAPITEL 9 OCH KAPITEL 16 Vad är virus? Förpackat genetiskt material Obligata intracellulära parasiter Virus kan bara förökas i levande celler. Som värdceller fungerar människor, djur,
Läs merLinköpings Universitet. Lägesspecifik mutagenes av proteiner
IFM/Kemi Augusti2011/LGM Linköpings Universitet Lägesspecifik mutagenes av proteiner Figur1. Flödesschema över lägesspecifik mutagenes laboration. Lägesspecifik mutagenes Introduktion In vitro lägesspecifik
Läs merLärarhandledning gällande sidorna 6-27 Inledning: (länk) Läromedlet har sju kapitel: 5. Celler och bioteknik
Senast uppdaterad 2012-12-09 55 Naturkunskap 1b Lärarhandledning gällande sidorna 6-27 Inledning: (länk) Celler och bioteknik C apensis Förlag AB Läromedlet har sju kapitel: 1. Ett hållbart samhälle 2.
Läs merLinköpings Universitet. Laboration i genteknik
IFM/Kemi Linköpings Universitet Maj 2008/LGM Laboration i genteknik Restriktionskarta av pcantab Restriktionsklyvning samt separation av DNA-fragment mha agarosgelelektrofores Material: pcantab (minst
Läs merSTOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING
STOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING TENTAMEN Kurs: Prokaryot cell- och molekylärbiologi (PCMB) Datum: 2007-06-19 kl. 10-13 Visat betald terminsräkning och legitimation _
Läs merTentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Fråga 1 (2p) Fråga 2 (2p) Fråga 3 (2p)
Tentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, 050308 Fråga 1 Du har isolerat en bakterie och vill titta på om den kan förflytta sig, vilken/vilka metoder använder du? a Elektronmikroskopi b Gramfärgning c
Läs merDelprov l, fredag 11/11,
Delprov l, fredag 11/11, 14.00-17.00 Fråga 1 (5 p). Ringa in ett av alternativen (endast ett): A. Vilket påstående är falskt? l. Aminosyror är byggstenar till proteiner 2. Membraner består av peptidoglykan
Läs mer1(5) En GMM-verksamhet: - bedrivs i en anläggning som är fysiskt avgränsad på en viss adress,
1(5) Exempel på organisationen av en hypotetisk universitetsinstitutions inneslutna användningar av genetiskt modifierade mikroorganismer (GMM) i olika verksamheter För att ge vägledning om vad som är
Läs merMolekylärbiologins centrala dogma
Molekylärbiologins centrala dogma m Replikation:Bassekvensen i DNA står för den genetiska informationen. När en cell ska delas måste DNA:tdupliceras man måste få nytt DNA med exakt samma bassekvens som
Läs merFråga 3 Varje korrekt besvarad delfråga ger 0,4 p. Det är inget avdrag för felaktigt svar. (2p) En organism som bara kan växa i närvaro kallas
Tentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, 040622 Fråga 1 a Gram-positiva bakterier har en tjockare cellvägg än Gram-negativa. b Gram-positiva bakterier har ett yttermembran utanför peptidoglykanet c Gram-karaktäriseringen
Läs merOmentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p,
Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, 050621 Fråga 1 Markera vilka av nedanstående alternativ som är Sanna eller Falska. För varje felaktigt alternativ ges 0.4p avdrag, dock kan frågan ej ge mindre
Läs merTillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen
IFM/Kemi Linköpings Universitet September 2004/LGM Projektlaboration i genteknik Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen Innehållsförteckning Inledning... 3 Amplifiering
Läs merDEN MINSTA BYGGSTENEN CELLEN
DEN MINSTA BYGGSTENEN CELLEN MÅL MED DETTA AVSNITT När vi klara med denna lektion skall du kunna: Förklara funktion och utseende för följande delar i cellen: cellkärna, cellmembran, cellvägg, cellvätska
Läs merMolekylärbiologi: Betygskriterier
Molekylärbiologi: Betygskriterier De obligatoriska momenten laboration och presentationsövningar examineras separat (endast G). Se separat utdelade anvisningar. Betygskriterier för teoridelen (se nedan).
Läs merfå se en naturvetenskaplig forskningsmiljö och träffa människorna i den miljön.
Martin Andersson 780920-1978 Kurs 3, Professionen Lärarutbildningen Malmö högskola NO-relaterat studiebesök Jag tänkte att mina gymnasieelever skulle få göra ett studiebesök på en universitetsavdelning
Läs merTranskrip1on och transla1on
Transkrip1on och transla1on Den centrala dogmen De.a gäller för alla celler Ø De har DNA som ärhlighetsmaterial Ø DNA:t läses av 1ll mrna och deca i sin tur läses av 1ll protein Transkrip1on = avskrivning
Läs merGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCC CTGGCCCACCCTCGTGACCACCCTGACC TACGGCGGT TGCAGTGCTTCAGCCGCTACCCCGA CCACATGAAGCAGCCGACTTCTTCAAGT CCGCCATTT -35
TAGTTATTAATAGTAATCAATTACG GGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGG AGTTCCGCG TTACAACTTACGGTAAATGGCCGCC TGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCA TTGACGTCA ATATGACGTATGTTCCCATAGTAAC GCCAATAGGGAC TTGACA TTGACGTCAATGGGTGGAG TATAAT
Läs merPersonnummer. DUGGA Molekylärbiologi T3 / HT p (G = 28 p)
KORTSVARSFRÅGOR 1. Restriktionsenzymet KpnI klyver sekvensen 5 -GGTACC-3 och lämnar ett fyra basers 3 -överhäng. Enzymet BamHI klyver sekvensen 5 -GGATCC-3 och lämnar ett fyra basers 5 överhäng. Ange det
Läs merGener, genom och kromosomer , 6.6 och sid
Gener, genom och kromosomer 6.1-6.3, 6.6 och sid 263-265 En gen är en DNA-sekvens som kan.. En kromosom är en DNA-molekyl. I cellen finns det lika mycket protein som DNA i kromosomerna, se fig6-1. Ett
Läs merAnalys av nukleinsyra. Molekylärbiologisk metodik T3 ht 11 Märit Karls
Analys av nukleinsyra Molekylärbiologisk metodik T3 ht 11 Märit Karls Studietips Detta kompendium är INTE en lärobok. Det är inte meningen att man skall kunna läsa kompendiet och förstå innehållet. Ni
Läs merGenetik I. Jessica Abbott
Genetik I Jessica Abbott Att kunna/förstå efter föreläsningarna i genetik: DNA och RNA Packning av DNA Replikation Transkription och translation Cellcykeln Mitos och meios Översikt över genetiska verktyg
Läs merFrån gen till protein. Niklas Dahrén
Från gen till protein Niklas Dahrén Innehållet i denna undervisningsfilm: Vad är skillnaden mellan kromosom, DNA- molekyl, gen och protein? Hur kan vårt DNA avgöra hur vi ser ut och fungerar? Proteinernas
Läs merTENTAMEN för KMB056 - Molekylär Bioteknik
TENTAMEN för KMB056 - Molekylär Bioteknik 2013-01-15 em (V-salar) Totalt 60 poäng (Frågor 1-8: Joakim Norbeck, totalt 45 poäng; Frågor 9-12: Lisbeth Olsson, totalt 15 poäng). Betygsgränser: 30-38.5 poäng
Läs merMed hopp om framtiden transposoner, DNA som flyttar sig själv
Med hopp om framtiden transposoner, DNA som flyttar sig själv Jessica Bergman Populärvetenskaplig sammanfattning av Självständigt arbete i biologi VT 2008 Institutionen för biologisk grundutbildning, Uppsala
Läs merRening av proteiner: hur och varför?
Rening av proteiner: hur och varför? (och lite biologiska grunder) Joakim Norbeck! norbeck@chalmers.se! Grunder! Plasmider! Protein-rening! Detektion!!!!! Mest relevanta sidor i "Cell" är 510-518 & 532-552!
Läs merTentamen Biologi BI1112 Termin och år: Klockan:
Tentamen Biologi BI1112 Termin och år: 120312 Klockan: 0800-13.15 Betygsgränser:!!! 50-66%! Betyg 3!!!!! 67-83%! Betyg 4!!!!! 84-100%! Betyg 5 Fråga 1-4 Cellbiologi Fråga 5-7 Genetik Fråga 8-10 Växtfysiologi!!!!
Läs merSammanfattning Arv och Evolution
Sammanfattning Arv och Evolution Genetik Ärftlighetslära Gen Information om ärftliga egenskaper. Från föräldrar till av komma. Tillverkar proteiner. DNA (deoxiribonukleinsyra) - DNA kan liknas ett recept
Läs merExpression, produktion och rening av Fatty acid binding protein (FABP) från ökenmyran Cataglyphis fortis
UNIVERSITETET I LINKÖPING Proteinkemi Kemiavdelningen 2011-02-04 Expression, produktion och rening av Fatty acid binding protein (FABP) från ökenmyran Cataglyphis fortis Produktion av FABP i E. coli bakterier
Läs merKOMMENTARER TILL KAPITEL 7 OCH 8. Den centrala dogmen är gemensam för eukaryoter och prokaryoter.
1 KOMMENTARER TILL KAPITEL 7 OCH 8 Den centrala dogmen är gemensam för eukaryoter och prokaryoter. DNA transkriberas till RNA som i sin tur translateras till proteiner. Genetiska skillnader mellan prokaryoter
Läs merKap 26 Nukleinsyror och proteinsyntes. Bilder från McMurry
Kap 26 Nukleinsyror och proteinsyntes Bilder från McMurry Namn Efternamn 26 februari 2011 2 Varje DNA molekyl är uppbyggd av många gener induviduella DNA segmant som innehåller instruktioner för syntes
Läs merPersonnummer. DUGGA Molekylärbiologi T3 / HT p (G = 24 p)
KORTSVARSFRÅGOR 1. Restriktionsenzymet HindIII klyver sekvensen 5 -AAGCTT-3 och lämnar ett fyra basers 5 -överhäng. Rita ut hur DNA-ändarna ser ut på ett fragment som klyvts med HindIII. (2p) SV: 5 -A
Läs merDNA-analyser: Diagnosticera cystisk fibros och sicklecellanemi med DNA-analys. Niklas Dahrén
DNA-analyser: Diagnosticera cystisk fibros och sicklecellanemi med DNA-analys Niklas Dahrén Diagnosticera cystisk fibros med DNA-analys Cystisk fibros Vad innebär sjukdomen?: Sjukdomen innebär att de epitelceller
Läs merDUGGA Molekylärbiologi T2 / VT p (G = 25 p)
KORTSVARSFRÅGOR 1. Restriktionsenzymet BamHI klyver sekvensen 5 -G*GATCC-3 och lämnar 4 basers 5' överhäng. Rita upp det längsta DNA-fragmentet som bildas efter klyvning av nedanstående given sekvens med
Läs merTENTAMEN för KMB056 - Molekylär Bioteknik
TENTAMEN för KMB056 - Molekylär Bioteknik 2012-10-23 em (V-salar) Totalt 60 poäng (Frågor 1-9: Joakim Norbeck, totalt 45 poäng; Frågor 10-11: Lisbeth Olsson, totalt 15 poäng). Betygsgränser: 30 poäng =
Läs merChapter 5-7. Introduction. Content. Double helix, Watson and Crick + Maria Bolin + fig 5-2
Chapter 5-7 Introduction Double helix, Watson and Crick + Maria Bolin + fig 5-2 On Feb. 28, 1953, Francis Crick walked into the Eagle pub in Cambridge, England, and, as James Watson later recalled, announced
Läs merGenetik. - cellens genetik - individens genetik. Kap 6
Genetik - cellens genetik - individens genetik Kap 6 Vad bestämmer hur en organism (cell) ser ut och fungerar? Generna (arvsanlagen) och miljön Hur går det till? En gen är en ritning för hur ett protein
Läs merMutationer. Typer av mutationer
Mutationer Mutationer är förändringar i den genetiska sekvensen. De är en huvudorsak till mångfalden bland organismer och de är väsentliga för evolutionen. De här förändringarna sker på många olika nivåer
Läs merBiologi och miljövetenskaper: urvalsprovs modellsvar 2019
Biologi och miljövetenskaper: urvalsprovs modellsvar 2019 Uppgift 1. 1. (i) Det finns ingen målsättning med naturligt urval, men det gynnar de dugligaste/ bästa individerna och leder på längre sikt till
Läs merProkaryota celler. Bakterier och arkéer
Prokaryota celler Bakterier och arkéer Det finns tre domäner Bakterier Arkéer Eukaryota Kännetecken Domän: Eukaryoter Cellkärna Organeller Domän: Bakterier Kallades tidigare eubakterier = "Äkta" bakterier
Läs merDiagnosticera sicklecellsanemi med DNA-analys. Niklas Dahrén
Diagnosticera sicklecellsanemi med DNA-analys Niklas Dahrén Sicklecellsanemi Erytrocyterna ser ut som skäror : Sjukdomen innebär a0 de röda blodkropparna (erytrocyterna) ser ut som skäror (eng. sickle)
Läs merDNA- analyser kan användas för att
Genteknik DNA- analyser kan användas för att -identifiera och koppla misstänkta till brottsplats -fria oskyldigt utpekade och oskyldigt fällda -personidentifiering vid masskatastrofer, krig, massgravar
Läs merRNA och den genetiska koden
RNA och den genetiska koden Table of Contents Struktur... 1 DNA och RNA... 2 Puriner och Pyrimidiner... 2 Watson-Crick baspar... 2 RNA som molekyl... 2 Primär struktur... 2 Sekundära strukturer... 2 Typer
Läs merTranskriptionen. Niklas Dahrén
Transkriptionen Niklas Dahrén Innehållet i denna undervisningsfilm: Översikt över proteinsyntesen Transkrip1onen Modifiering (bearbetning) av mrna Fler filmer på samma tema: Från gen 1ll protein Den gene1ska
Läs merFrån DNA till protein, dvs den centrala dogmen
Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen DNA RNA Protein Biochemistry, kapitel 1 5 samt kapitel 29 31. Kapitel 2 5 samt 29 31 berörs även i kommande föreläsningar. Transkription och translation Informationsflödet
Läs merTentamen Introduktion till Bioteknik och Bioinformatik 5hp 1MB101
Tentamen Introduktion till Bioteknik och Bioinformatik 5hp 1MB101 23 oktober, 2009 kl. 8.00-13.00 Uppsala universitet Svara på svenska eller engelska. Skriv ditt namn på varje sida. För resultat, kontakta
Läs merTENTAMEN för KMB056 - Molekylär Bioteknik
TENTAMEN för KMB056 - Molekylär Bioteknik 2011-10-22 em (V-salar) Totalt 60 poäng (Frågor 1-8: Joakim Norbeck, totalt 45 poäng; Frågor 9-12: Lisbeth Olsson, totalt 15 poäng). Betygsgränser: 30 poäng =
Läs merOmråde: Ekologi. Innehåll: Examinationsform: Livets mångfald (sid. 14-31) I atomernas värld (sid.32-45) Ekologi (sid. 46-77)
Område: Ekologi Innehåll: Livets mångfald (sid. 14-31) I atomernas värld (sid.32-45) Ekologi (sid. 46-77) Undervisningen i kursen ska behandla följande centrala innehåll: Frågor om hållbar utveckling:
Läs merTENTAMEN för KMB056 - Molekylär Bioteknik
TENTAMEN för KMB056 - Molekylär Bioteknik 2012-10-23 em (V-salar) Totalt 60 poäng (Frågor 1-9: Joakim Norbeck, totalt 45 poäng; Frågor 10-11: Lisbeth Olsson, totalt 15 poäng). Betygsgränser: 30 poäng =
Läs merTentamen: Biologi 1TV001 Termin och år: VT08
Tentamen: Biologi 1TV001 Termin och år: VT08 7/3-08, klockan 08.00-13.00 Skriv svar på alla frågor på separata papper, märk varje papper med kod: Betygsgränser: 50-66% Betyg 3 67-83% Betyg 4 84-100 % Betyg
Läs merEvolution i molekylärbiologiskt perspektiv
Nutidens upptäcktsfärder går till organismernas minsta beståndsdelar. Evolution i molekylärbiologiskt perspektiv En viktig milstolpe i vetenskapens historia är sekvenseringen av det mänskliga genomet.
Läs merGenetiskt modifierade mikroorganismer (GMM)
Säkerhetsaspekter på praktiskt arbete med biologi i skolan 1. Introduktion Intresset för att arbeta praktiskt med genteknik ökar snabbt i skolan, mycket beroende på att genteknik ingår i kursplanerna för
Läs merTranskription och translation = Översättning av bassekvensen till aminosyrasekvens
Transkription och translation = Översättning av bassekvensen till aminosyrasekvens OBS! Grova drag för prokaryota system! Mycket mer komplicerat i eukaryota system! RNA: Tre huvudtyper: trna transfer RNA
Läs merMedicinsk grundkurs. Cellen och genetik. Datum
Medicinsk grundkurs Cellen och genetik Datum Lektion 2 Cellens byggnad Cellens genetik Storleksskalan Kolatom Vattenmolekyl Klorofyllmolekyl Ribosom Virus Minsta bakterien Mitokondrie De flesta bakterierna
Läs merProv Genetik. Max: 8G+7VG+2MVG G: 7G VG: 7G+4VG MVG: 8G+4VG+1MVG
Prov Genetik Namn: Max: 8G+7VG+2MVG G: 7G VG: 7G+4VG MVG: 8G+4VG+1MVG 1. Vad kallas den delning som ger upphov till haploida könsceller (G) (a) Mitos (b) Milos (c) Meilos (d) Meios 3. Polymera gener (polygener)
Läs merProjektarbete 100p Carl Jaede 2010-05-07
[Type text] [Type text] [Type text] Abstract This report describes the procedure and result of a laboratory experiment where GFP has been cloned inside living bacteria. It also contains a large theoretical
Läs merPROVGENOMGÅNG AVSNITT 1 BIOLOGI 2
PROVGENOMGÅNG AVSNITT 1 BIOLOGI 2 RESULTAT 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 E C A 26 % valde att inte göra provet ATT GÖRA
Läs merPolymerase Chain Reaction
Polymerase Chain Reaction The Polymerase Chain Reaction Molekylärbiologisk metodik T3 ht 11 Märit Karls Kunskapsmål för detta avsnitt Från kursplan: Studenten skall kunna: förklara grundläggande principer
Läs merKloning och rening av GFP
Kloning och rening av GFP Ida Harila Projektarbete 100p Luleå 2012 Handledare: Marcus Wallgren Sammanfattning Upptäckten och användningsområden för det grönt fluorescerande proteinet, GFP har visat ha
Läs merKlipp-och-klistra DNA: fixa mutationen med gen editering DNA, RNA och Protein
Huntingtons sjukdom forsknings nyheter. I klartext Skriven av forskare För de globala HS medlemmarna. Klipp-och-klistra DNA: fixa mutationen med gen editering Forskare gör exakta ändringar av DNA i ett
Läs merGenexpressions analys - RNA-uttryck
Genexpressions analys - RNA-uttryck Alla gener som är aktiva transkriberas: det bildas ett RNA (transkript). Proteinkodande gener transkriberas till mrna, ribosomalrna gener till rrna osv. Man pratar ofta
Läs merTentamen Introduktion till Bioteknik och Bioinformatik 5hp 1MB101. 23 oktober, 2008 Kl. 9-14 Uppsala universitet
Tentamen Introduktion till Bioteknik och Bioinformatik 5hp 1MB101 23 oktober, 2008 Kl. 9-14 Uppsala universitet Svara på svenska eller engelska. Skriv ditt namn på varje sida För resultat, kontakta Ylva
Läs merTranskription och translation. DNA RNA Protein. Introduktion till biomedicin 2010-09-13. Jan-Olov Höög 1
Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen DNA RNA Protein Biochemistry, kapitel 1 (delvis), kapitel 2 (ingående) samt kapitel 3 (delvis, kommer att behandlas mer) Transkription och translation Informationsflödet
Läs merKOMMENTARER TILL KAPITEL 10
1 KOMMENTARER TILL KAPITEL 10 Bakterier saknar sexuella processer - förökar sig genom enkel tudelning ingen förändring av det genetiska materialet bakterier är i princip klonala. Högre organismer har sexuella
Läs merSluttentamen Bke2/KE0003, 28:e Oktober 2004, Max poäng = 89 p. Preliminär gräns för godkänd = 48 p (54 %).
Sluttentamen Bke2/KE0003, 28:e Oktober 2004, 09 00-15 00 Max poäng = 89 p. Preliminär gräns för godkänd = 48 p (54 %). Ingen får lämna skrivsalen före 9:30. För toalettbesök måste du meddela skrivningsvakt
Läs merRisk- och nyttovärdering - allmänt om risker med genförändring beträffande livsmedel och foder. Christer Andersson Livsmedelsverket
Bild 1 Risk- och nyttovärdering - allmänt om risker med genförändring beträffande livsmedel och foder Christer Andersson Livsmedelsverket Lund 2015-11-11 Bild 2 Historisk bakgrund för modern växtförädling
Läs merTentamensmoment: Rättningspoäng:...av max 25 p. Namn:. Pnr:. Betyg:... Distanskurs. Lärare: Malte Hermansson
INSTITUTIONEN FÖR CELL- OCH MOLEKYLÄRBIOLOGI Tentamensmoment: Rättningspoäng:...av max 25 p. Kurs, linje etc: Cellbiologi del 2 Baskurs Biologi, 40 p Tentamensdatum: Namn:. Pnr:. Betyg:... Termin då kursen
Läs merTentamen i Molekylär Cellbiologi
Tentamen i Molekylär Cellbiologi 1 juni 2007 MCB 13p Biomedicinarprogrammet Märk alla papper med din tentamenskod. Extrablad ska dessutom märkas med MCB och frågans nummer. Frågorna skall besvaras på frågebladet.
Läs merGrundläggande molekylära genetiska mekanismer Kap 4,
Grundläggande molekylära genetiska mekanismer Kap 4, 4.1-4.6. DNA tinnehåller den genetiska informationen. I en prokaryotcell finns DNA ti cytosolen, i en eukaryotcell finns det i. För att DNA t ska kunna
Läs merBiologi breddning (mikrobiologi och immunologi) Kurskod: BI 1203-A Poäng: 50 Program: Förkunskapskrav: Biologi A och Biologi B
KURSBESKRIVNING Ämne: Biologi Kurs: Biologi breddning (mikrobiologi och immunologi) Kurskod: BI 1203-A Poäng: 50 Program: NV Förkunskapskrav: Biologi A och Biologi B Mål Kurserna Biologi breddning A och
Läs merKromosomer, celldelning och förökning
Kromosomer, celldelning och förökning Kromosomen Hur ligger DNA lagrat? DNA 2 nm Prokaryota celler har vanligtvis endast en kromosom. I eukaryota celler finns alltid mer än en DNA-molekyl som bildar olika
Läs merFacit tds kapitel 18
Facit tds kapitel 18 Testa dig själv 18.1 1. Arvsanlagen finns i cellkärnan. Inför celldelningen samlas de i kromosomer. 2. Det kemiska ämne som bär på arvet kallas DNA. 3. Instruktionerna i DNA är ritningar,
Läs merHUGO-projektet. Kartläggningen av det mänskliga genomet
Vem är HUGO? HUGO-projektet Kartläggningen av det mänskliga genomet Kartläggning av genom Genom= allt DNA hos en organism. Kartläggningen sker genom att man bestämmer DNA-sekvensen för hela genomet och
Läs merOmtentamen DSM frågor Max 44 poäng, Godkänt = 30 p Lycka till!
Omtentamen DSM1.1 10080 1 frågor Max 44 poäng, Godkänt = 0 p Lycka till! 1 Vilka tre former av infektion kan Leishmania parasiten orsaka i människokroppen? 1 Kutan, mukokutan och visceral infektion Du
Läs merMolekylärbiologins centrala dogma
Molekylärbiologins centrala dogma m Replikation:Bassekvensen i DNA står för den genetiska informationen. När en cell ska delas måste DNA:tdupliceras man måste få nytt DNA med exakt samma bassekvens som
Läs merINSTITUTIONEN FÖR BIOMEDICIN
INSTITUTIONEN FÖR BIOMEDICIN CEB210 Cellen och dess arvsmassa, 10,5 högskolepoäng The cell and its genetic material, 10.5 higher Fastställande Kursplanen är fastställd av Institutionen för biomedicin 2015-08-18
Läs merKontroll av genuttrycket på transkriptionsnivå
Kontroll av genuttrycket på transkriptionsnivå 7.1-7.6 Vägen från gen till funktionellt protein består av många steg, fig1-11. Det finns exempel på kontrollmekanismer för alla dessa steg. Transkriptionsstart
Läs merKodnummer: 1) Beskriv processerna som sker i replikationsgaffel (eng. replication fork)? (3)
Bi 75hp / Lärarprogrammet Tentamen i BL2018 CMB; Molekylär cellbiologi & genetik, 10,5 hp 2018-01-13 1) Beskriv processerna som sker i replikationsgaffel (eng. replication fork)? (3) Bi 60hp Tentamen i
Läs merFrån DNA till protein, dvs den centrala dogmen
Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen DNA RNA Protein Biochemistry, kapitel 1 5 samt kapitel 29 31. Kapitel 2 5 samt 29 31 berörs även i kommande föreläsningar. ph, kapitel 1, gås igenom i separata
Läs merVirus. Inledning. Ett antal exempel på virusgenoms typ och storlek kan ses i tabell 9.1. Virus har en mellanställning mellan levande organismer
Virus Inledning Virus har en mellanställning mellan levande organismer och dött material. De har ingen egen ämnesomsättning och kan inte dela sig som vanliga celler. Däremot har de ärftlighetsmaterial
Läs merErik Eriksson VMD Enheten för Bakteriologi
Diagnostik VTEC/EHEC Erik Eriksson VMD Enheten för Bakteriologi SVA Tänker prata om VTEC / EHEC Sjukdomsframkallande faktorer PCR Magnetiska kulor (Immunomagnetisk separation) Diagnostik de vanligaste
Läs merMarie Nyman. bioscience explained Vol 8 No 1. GMO eller inte GMO? Nya tekniker sätter lagstiftningen på prov. Gentekniknämnden, Stockholm, Sverige
Marie Nyman Gentekniknämnden, Stockholm, Sverige GMO eller inte GMO? Nya tekniker sätter lagstiftningen på prov Inom EU finns en gemensam lagstiftning som reglerar användningen av genetiskt modifierade
Läs merEn bioinformatisk genjakt
En bioinformatisk genjakt Efter en ide från: CUSMOBIO, Milano, Italien. Hur man kan söka i databaser efter information om en gen som kan ge ökad risk för bröstcacer. Bakgrund Människor utan symptom men
Läs mer