Musselmatematik eller Stormusselstatistik
.Allmänt 2.Analys av förändringar (före efter) 3.Analys av förekomst och täthet vs omgivningsfaktorer
.Allmänt
Jämförelse av populationstäthet och minsta mussla mellan två vattendrag: Mann-Whitney U-test (Kruskal-Wallis test)
Jämförelse av populationstäthet och minsta mussla mellan tre eller fler vattendrag: Kruskal-Wallis test Nackdel: Man kan inte göra parvisa jämförelser
Jämförelse av populationstäthet och minsta mussla mellan tre eller fler vattendrag: Variansanalys (ANOVA) Fördel: Man kan göra parvisa jämförelser (SNK, Tukey, Duncan o.dyl.) Nackdel: Data är inte normalfördelat.
Normalfördelning är bra, men.. Det är inte rådata som ska vara normalfördelat, utan residualerna. Täthet blir bättre om det är log-transformerat. ANOVA är mer okänslig än man tror.
För att testa om andelen små musslor stämmer överens med den förväntade används chitvå-test (eller G-test, log likelihood). OBS. Signifikans innebär att det inte stämmer överens.
För att testa förändringar i ett vattendrag (före efter) används: Wilcoxon parade t-test???? Sign test Wilcoxon matched-pair signed-rank test Parad t-test
2. Analys av förändringar (före efter)
. Analys av förändringar (före efter) Parad t-test Fördelar: Kraftfull statistisk test ( hittar faktiska förändringar) Går att göra i Excel Nackdelar: Önskvärt med lika tidsspann mellan mätningarna Kan flippa ur om det är stor skillnad mellan par
. Analys av förändringar (före efter) Utgå från tabell tblstandmusseldata i Stormusseldatabasen Exportera tabellen till Excel Rensa bort de lokaler som endast har ett inventeringstillfälle Lägg inventeringarna från samma lokal på samma rad (i par) och fixa lite Räkna
. Analys av förändringar (före efter)
. Analys av förändringar (före efter) t-test: Parat två-sampel för medelvärde Täthet levande Medelvärde 24 8.6422 999 8.7757 Medelvärden Varians 259.75 227.363 Observationer 9 9 Pearson-korrelation.997732 Antagen medelvärdesskillnad fg 8 t-kvot -.2699 P(T<=t) ensidig.489565 t-kritisk ensidig.859548 P(T<=t) tvåsidig.9793 t-kritisk tvåsidig 2.366
. Analys av förändringar (före efter) t-test: Parat två-sampel för medelvärde Täthet levande 24 999 Medelvärde Varians Observationer Pearson-korrelation 8.6422 259.75 9.997732 8.7757 227.363 9 Varians, vill man ha standardavvikelse istället tar man bara roten ur dessa värden. Värdena bör vara ganska lika Antagen medelvärdesskillnad fg 8 t-kvot -.2699 P(T<=t) ensidig.489565 t-kritisk ensidig.859548 P(T<=t) tvåsidig.9793 t-kritisk tvåsidig 2.366
. Analys av förändringar (före efter) t-test: Parat två-sampel för medelvärde Täthet levande 24 999 Medelvärde 8.6422 8.7757 Varians Observationer 259.75 9 227.363 9 Antal obsar (= lokaler) Pearson-korrelation.997732 Antagen medelvärdesskillnad fg 8 t-kvot -.2699 P(T<=t) ensidig.489565 t-kritisk ensidig.859548 P(T<=t) tvåsidig.9793 t-kritisk tvåsidig 2.366
. Analys av förändringar (före efter) t-test: Parat två-sampel för medelvärde Täthet levande 24 999 Medelvärde 8.6422 8.7757 Varians Observationer Pearson-korrelation Antagen medelvärdesskillnad fg 259.75 9.997732 8 227.363 9 Korrelationskoefficient, säger hur pass lika ( i genomsnitt) antal musslor är mellan inventeringstillfällena ( är totalt missmasch, är skrämmande perfekt) t-kvot -.2699 P(T<=t) ensidig.489565 t-kritisk ensidig.859548 P(T<=t) tvåsidig.9793 t-kritisk tvåsidig 2.366
. Analys av förändringar (före efter) t-test: Parat två-sampel för medelvärde Täthet levande 24 999 Medelvärde 8.6422 8.7757 Varians 259.75 227.363 Observationer 9 9 Pearson-korrelation Antagen medelvärdesskillnad fg t-kvot.997732 8 -.2699 Det s.k. H, det man testar är sannolikheten att det inte är skillnad P(T<=t) ensidig.489565 t-kritisk ensidig.859548 P(T<=t) tvåsidig.9793 t-kritisk tvåsidig 2.366
. Analys av förändringar (före efter) t-test: Parat två-sampel för medelvärde Täthet levande 24 999 Medelvärde 8.6422 8.7757 Varians 259.75 227.363 Observationer 9 9 Pearson-korrelation.997732 Antagen medelvärdesskillnad fg t-kvot P(T<=t) ensidig 8 -.2699.489565 Antalet frihetsgrader (på engelska degrees of freedom; d.f.) t-kritisk ensidig.859548 P(T<=t) tvåsidig.9793 t-kritisk tvåsidig 2.366
. Analys av förändringar (före efter) t-test: Parat två-sampel för medelvärde Täthet levande 24 999 Medelvärde 8.6422 8.7757 Varians 259.75 227.363 Observationer 9 9 Pearson-korrelation.997732 Antagen medelvärdesskillnad fg t-kvot P(T<=t) ensidig t-kritisk ensidig 8 -.2699.489565.859548 T-värdet, detta är testvärdet, det bör anges vid redovisning tillsammans med antal obs och/eller frihetsgrader P(T<=t) tvåsidig.9793 t-kritisk tvåsidig 2.366
. Analys av förändringar (före efter) t-test: Parat två-sampel för medelvärde Täthet levande 24 999 Medelvärde 8.6422 8.7757 Varians 259.75 227.363 Observationer 9 9 Pearson-korrelation.997732 Antagen medelvärdesskillnad fg 8 t-kvot -.2699 P(T<=t) ensidig t-kritisk ensidig P(T<=t) tvåsidig.489565.859548.9793 Specialfall, överkurs, kan man glatt strunta i t-kritisk tvåsidig 2.366
. Analys av förändringar (före efter) t-test: Parat två-sampel för medelvärde Täthet levande 24 999 Medelvärde 8.6422 8.7757 Varians 259.75 227.363 Observationer 9 9 Pearson-korrelation.997732 Antagen medelvärdesskillnad fg 8 t-kvot P(T<=t) ensidig t-kritisk ensidig P(T<=t) tvåsidig t-kritisk tvåsidig -.2699.489565.859548.9793 2.366 Detta är p-värdet, signifikansen, bör anges tillsammans med t-värdet och antalet obsar och/eller frihetsgrader
. Analys av förändringar (före efter) t-test: Parat två-sampel för medelvärde Täthet levande 24 999 Medelvärde 8.6422 8.7757 Varians 259.75 227.363 Observationer 9 9 Pearson-korrelation.997732 Antagen medelvärdesskillnad fg 8 t-kvot -.2699 P(T<=t) ensidig t-kritisk ensidig P(T<=t) tvåsidig t-kritisk tvåsidig.489565.859548.9793 2.366 Om det skulle vara signifikant skillnad ska t- värdet vara lika med eller större än detta värde
. Analys av förändringar (före efter) t-test: p =.979 Sign test: p =.84 Wilcoxon matched-pair sign-rank test: p =.98
3. Analys av förekomst och täthet vs omgivningsfaktorer
Längddata 95.22 4.27 4.99 Medelvärde Standardavvikelse Varianskoefficient
Längddata 95.22 4.27 9.43 52.6 Medelvärde Standardavvikelse Varianskoefficient
Vad är noll och vad är saknat värde?
Vad är noll och vad är saknat värde? Noll () innebär att man veta att det inte finns (finns ingen myr, inga lövträd, etc. )
Vad är noll och vad är saknat värde? Saknat värde (t.ex. tom cell) innebär att man inte vet om det finns eller inte
Vad är noll och vad är saknat värde? Saknat värde kan uppkomma på flera olika sätt; man har glömt att kolla, mäta eller tappat anteckningarna eller det är slumpartad information (ibland hittar man utterspillning, men att man inte hittat utterspillning innebär inte att det inte finns utter)
5 4 3 2 r s =.72, p=.52 2 3 BeskrBlSkog Täthet levande (antal / m 2 )
5 4 3 2 r=.45 2 3 BeskrBlSkog Täthet levande (antal / m 2 )
5 4 3 2 r 2 =.38 2 3 4 BeskrBlSkog Täthet levande (antal/m 2 )
5 4 3 2 r s =.72, p=.52 2 3 BeskrBlSkog Täthet levande (antal / m 2 )
5 4 3 2 r=.34 2 3 BeskrBlSkog Täthet levande (antal / m 2 )
5 4 3 2 r s =.72, p=.52 2 3 BeskrBlSkog Täthet levande (antal / m 2 )
Täthet levande (antal / m 2 ) 5 rs=.297; p=.58 4 3 2 2 4 6 8 2 Vattendragsbredd (m)
3 rs=.23, p=.2 BeskrPavAlger 2 2 3 BeskrBlSkog
Storlek minsta (mm) 2 8 6 4 2 r s =-.263, p=.7 2 3 4 5 Täthet levande (antal/m 2 )
Storlek minsta (mm) 2 8 6 4 2 rs=.277 p=.8 2 3 BeskrVHast
3. Analys av förekomst och täthet vs omgivningsfaktorer Ordinationsanalys (canonical correspondens analysis) Hur förekomst och täthet är kopplat till olika omgivningsfaktorer
28 melength 28 BeskrBebyggVag 6 BeskrSubHel 9 BeskrBerg 27 BeskrFlBlVaxt 4 BeskrKFjall 54 BeskrOvVaxt 25 BeskrAker 6 BeskrHall 8 BeskrMyr 76 BeskrGrBlock 28 BeskrKalHyg 83 BeskrFBlock 63 BeskrBlSkog 86 BeskrGrSten 78 BeskrBaSkog 9 BeskrFSten 73 BeskrLskog 96 BeskrGrus 78 bredd 92 BeskrSand 79 length 59 BeskrMjLer 25 minst 9 BeskrFinDet 26 dod 9 BeskrGrDet 27 lev 29 BeskrVHast 29 day 88 BeskrLokDjupMax 29 mon 93 BeskrPavAlger 29 year 85 BeskrBuskar 29 lokal N Variable N Variable
Täthet Omgivningsfaktor t.ex ph
Finns Finns inte Omgivningsfaktor t.ex ph
Täthet Utan gran Med gran
Finns Finns inte Utan gran Med gran
<. 2.67 -.326 BeskrGrBlock <. 96.38.8873 BeskrGrus.59 2.6 -.289 BeskrVHast <. 32.2.427 BeskrPavAlger.4 8.3.552 BeskrBlSkog.734 3.2 -.857 BeskrBaSkog.34 2.28 -.67 BeskrLskog.2 5.33.544 bredd <. 8.4.279 year tidigt mon2.2.45.4238 sent mon2 <. 8.88-54.958 Intercept P Chi-Square Estimate DF Parameter Wald Standard Poisson Distribution Täthet levande
.2498.32.2885 BeskrGrBlock.2 2.69.4473 BeskrGrus.85.79 -.4788 BeskrVHast.656.2 -.46 BeskrPavAlger.4889.48.384 BeskrBlSkog.727.4 -.737 BeskrBaSkog.5574.34 -.59 BeskrLskog.4692.52 -.736 bredd.2467.34.347 year tidigt mon2.558.42.375 sent mon2.2452.35-27.63 Intercept Pr Chi-Square Estimate DF Parameter Wald Standard Poisson Distribution Täthet döda
.35 2.65 5.57 BeskrGrBlock.422.65 2.937 BeskrGrus.2 5.32 -.549 BeskrVHast.75 3.7-6.923 BeskrPavAlger.793.3.878 BeskrBlSkog.3934.73 -.932 BeskrBaSkog.553.35 -.283 BeskrLskog.5432.37 -.696 bredd.5388.38 -.84 year tidigt mon2.442.59 5.998 sent mon2.5248.4 2246.3 Intercept Pr Chi-Square Estimate DF Parameter Wald Normal Distribution Längd minsta
.393 4.25 4.9 BeskrGrBlock.768.4.873 BeskrGrus.5775.3.632 BeskrVHast.7847.7.68 BeskrPavAlger.2732.2 -.688 BeskrBlSkog.7683.9 -.42 BeskrBaSkog.6 5.79 3.329 BeskrLskog.6846.7 -.293 bredd.93 5.47 2.62 year tidigt mon2.2347.4-5.93 sent mon2.25 5.29-54.4 Intercept Pr Chi-Square Estimate DF Parameter Wald Normal Distribution Medellängd
Logistisk analys Eget litet fuskantagande: Reproducerande bestånd: Antal levande / kvadratmeter > 6 Minsta<5;
.3.25.2.5..5. p=.43 2 3 BeskrGrus Sannolikhet för reproduktion
Hela databasen: Vattentemp Latitud, longitud (x, y) och höjd över havet