Kopiera DNA med hjälp av PCR-metoden. Niklas Dahrén



Relevanta dokument
DNA-analyser: Introduktion till DNA-analys med PCR och gelelektrofores. Niklas Dahrén

Diagnosticera sicklecellsanemi med DNA-analys. Niklas Dahrén

Diagnosticera cystisk fibros med DNA-analys. Niklas Dahrén

DNA-analyser: Diagnosticera cystisk fibros och sicklecellanemi med DNA-analys. Niklas Dahrén


DNA-labb / Plasmidlabb

JANINA WARENHOLT Molekylär patologi LUND

/LGM. Amplifiering och analys av humant mitokondrie-dna med hjälp av PCR teknik och agarosgelelektrofores

Från gen till protein. Niklas Dahrén

Totalt finns det alltså 20 individer i denna population. Hälften, dvs 50%, av dem är svarta.

Gener, genom och kromosomer , 6.6 och sid

Uppdatera)dina)kunskaper)i) molekylärbiologi,)genteknik)och) funk:onell)genomik )

Genetik, Gen-etik och Genteknik

Kopiera DNA med hjälp av PCR-metoden. Niklas Dahrén

DNA-analyser av biologiska spår

Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen

Jordprover. Ta lite jord från vardera provet och placera i små högar på den runda plastskålen.

Vid villainbrottet var det mycket som var omkringstökat.

DNA-registret. Polisutbildningen vid Umeå universitet Vårterminen, 2006 Moment 4:3 Fördjupningsarbete Rapportnummer: 318

Tidiga erfarenheter av arvets mysterier

Laboration DNA. Datum:16/11 20/ Labgrupp: 11 Laboranter: Johanna Olsson & Kent Johansson

Genetik - Läran om det biologiska Arvet

Bi-lagan. Genvägen till rättvisa s 2-3. Botkyrka kommunen som satsar på miljön s 4-5. Mångfotingar s Unga Forskare s 14-15

LAB 12. Preparation och analys av plasmid-dna från E.coli

NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra

Medicinsk genetik del 1: Introduktion till genetik och medicinsk genetik. Niklas Dahrén

Vad händer i ett genetiskt laboratorium?

DNA och dess betydelse för upplösningen av brott

BJÖRNSPILLNING. - insamling till DNA-analyser

Arvet och DNA. Genetik och genteknik

Medicinsk genetik del 3: Könsbunden nedärvning av färgblindhet och blödarsjuka. Niklas Dahrén

En bioinformatisk genjakt

Hur sitter DNA ihop? DNA betyder Deoxyribonukleinsyra.

Exoterma och endoterma reaktioner. Niklas Dahrén

Antikroppar:Från gen till protein skapande av diversitet. Kursbok: The immune system Peter Parham

Linköpings Universitet. Laboration i genteknik

Facit tds kapitel 18

Genetik. - cellens genetik - individens genetik. Kap 6

Medicinsk genetik del 2: Uppkomst och nedärvning av genetiska sjukdomar. Niklas Dahrén

Erik Eriksson VMD Enheten för Bakteriologi

Galvaniska element. Niklas Dahrén

tisdag 8 oktober 13 Carl Von Linné

Genetik en sammanfattning

DNA-molekylen upptäcktes DNA - varken protein, kolhydrat eller lipid.

Klipp-och-klistra DNA: fixa mutationen med gen editering DNA, RNA och Protein

Datorer och matematik hjälper oss att motverka sjukdomar

Riskbedömning avdelningen för Evolutionsbiologi Uppsala Universitet, EBC Norbyvägen 18 D, Uppsala

Proteiner. Biomolekyler kap 7

Regeringens proposition 2005/06:29

JURIDISKA FAKULTETEN vid Lunds universitet. Linda E. Jeppsson. Processen kring DNA-analys och dess bevisvärde i brottmål. Examensarbete 20 poäng

Best Practice - Kriminalteknik. Promemoria

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT GENETISK INFORMATION (sid )

DNA i brottmål - Ett bevismedel med framtidsutsikter?

Spårsäkring och DNA-analys efter sexualbrott

Sammanfattning Arv och Evolution

DNA som bevis i brottmål

Genkloning och PCR av tetracyklinresistensgen. från pacyc184 till puc19

DNA-LABORATION Southern blot / PCR

Klippa, klistra och hitta en gen

DNA-analyser av brottsbevis inom polisen

IT-baserat DNA-register

Translationen. Niklas Dahrén

genvägar arv facit.notebook December 02, 2009 Genvägar arv mar 11 10:20

Vad kan vi lära om sambandet mellan skolelever miljö och psykisk hälsa med hjälp av epigenetik?

Pappers- och tunnskiktskromatografi. Niklas Dahrén

Ärftliga sjukdomar och egenskaper hos hund

UPPGIFT 1 TVÅPOTENSER. UPPGIFT 2 HISSEN I LUSTIGA HUSET.

Galvaniska element. Niklas Dahrén

Lärarhandledning gällande sidorna 6-27 Inledning: (länk) Läromedlet har sju kapitel: 5. Celler och bioteknik

Datorer och matematik hjälper oss att motverka sjukdomar

DNA-analys av blod - från tvättade kläder

Bruksanvisning till Biofortuna SSPGo TM HLA Typing Kits. CE revision 5, januari 2014

ELISA-test för att diagnosticera diabetes typ 1. Niklas Dahrén

Genetik Detta kapitel innehåller följande avsnitt i faktaboken. Pilarna visar hur avsnitten i Läs mer-delen är kopplade till avsnitten i Baskursen.

Erfarenheter från övergången till den nya typningsmetodiken MIRU-VNTR

Grunderna i programmering loopar (lektion 2 av 5)

CELLDELNING 1 MITOS EUKARYOT CELLDELNING. Eukaryot celldelning. 1. cellcykeln 2. mitos 3. cytokinesis

Identifiera blod med Kastle-Meyertestet. Niklas Dahrén

Den flytande brottsplatsen Brottsplatsundersökning ombord på passagerarfartyg

Fragil X. Genetik, diagnostik och symptom. A marker X chromosome Am J Hum Genet May;21(3): Fragilt X - Historik. Förekomst av fragilt X

Spädningsserier och spädningsfaktorn. Niklas Dahrén

C V C. Bruksanvisning till Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF Revision 3. Juli 2014

rapport 2013/6 FISKUNDERSÖKNINGAR I FYRISÅN 2012

Cellcykel/Celldöd. Laborationsrapport 20/2-14. Basgrupp 1

Medicinsk genetik del 4: Tolka genetiska släkttavlor (pedigreen) Niklas Dahrén

Detektera blod med luminoltestet. Niklas Dahrén

Genetik. Gregor Mendel onsdag 12 september 12

Hur påverkar strålning celler och organismer?

Mitokondriella sjukdomar. Gittan Kollberg Avd för klinisk kemi Sahlgrenska Sjukhuset Göteborg

Till statsrådet och chefen för Justitiedepartementet

Genetisk testning av medicinska skäl

Med hopp om framtiden transposoner, DNA som flyttar sig själv

ChromoQuant In vitro diagnostiskt test kit för analys av vanligen förekommande aneuploidier i kromosomerna 13, 18 och 21 samt i X och Y.

DNA-ordlista. Amplifiera: Att kopiera och på så sätt mångfaldiga en DNA-sekvens med hjälp av PCR.

Crafoordpriset i biovetenskaper 2015

Område: Ekologi. Innehåll: Examinationsform: Livets mångfald (sid ) I atomernas värld (sid.32-45) Ekologi (sid )

Brottsplatsundersökning

DNA Att ta tillvara DNA på ett rättssäkert sätt

Kalla fall blir heta. Reportage

Kodnummer: 1) Beskriv processerna som sker i replikationsgaffel (eng. replication fork)? (3)

Transkript:

Kopiera DNA med hjälp av PCR-metoden Niklas Dahrén

Först lite allmän kunskap om kromosomer, DNA, gener etc.

Varje kromosom består av en lång DNAmolekyl som är lindad runt histoner

En gen är en liten del av en DNA-molekyl och varje gen fungerar som en ritning för ett specidikt protein

Våra kromosomer innehåller stora mänger skräp-dna

Den genetiska variationen är högre i skräp-dna:t jämfört med i de delar som innehåller gener

Skräp-DNA består av STR-områden Dessa utnyttjas vid en kriminalteknisk DNA-analys 0 STR-områden (short tandem repeat) består av korta sekvenser som upprepas ett visst antal gånger. Antalet upprepningar och därmed längden av ett STR-område skiljer sig ofta mellan personer.

Minst tio STR-områden analyseras 0 Man analyserar minst tio STR-områden när man ska göra en DNAanalys. 0 Om man bara analyserar ett STR-område Dinns det en risk att längden av detta område är exakt lika för två personer. Däremot är sannolikheten att två personer har exakt lika lång längd av tio olika STR-områden väldigt liten.

Kriminalteknisk DNAanalys i fem steg!

Kriminalteknisk DNA-analys i fem steg: 1. Samla in DNA:t: Polisen samlar in celler från brottsplatsen och/eller från misstänkta personer. Det kan vara celler som Dinns i sperma, blod, saliv etc. 2. Extrahera DNA (rena fram): DNA:t renas sedan fram ur cellerna med hjälp av olika ämnen som tillsätts och med hjälp av en centrifug. 3. Kopiera STR-områdena med PCR: De tio STR-områdena kopieras upp i stora mängder med hjälp av en s.k. PCR-maskin. Det innebär att det kommer endast vara dessa DNA-områden som ingår i den avslutande analysen. Dessa områden kommer även Dinnas i stora mängder så att de syns ordentligt när man gör själva analysen.

Genetiska Dingeravtryck i fem steg (forts.): 4. Sortera STR-områdena efter storlek: Nästa steg är att sortera STRområdena utifrån storlek med antigen en gelelektrofores eller en kapillärelektrofores. 5. Jämföra DNAt: Sista steget är att jämföra det uppkomna bandmönstret från den misstänka personen med mönstret från brottsplatsen. Om mönstren överensstämmer kan personen bindas till brottsplatsen och ev. till brottet.

Principen bakom gelelektrofores 0 I elektroforesen tvingar man STR-områdena att vandra genom en gel. 0 Vandringen sker p.g.a. att en spänning kopplas på. DNAt är negativt laddat och kommer därför vandra mot pluspolen. 0 Gelen som STR-områdena ska vandra genom liknar en djungel. Ju större STR-områdena är desto svårare är det för dessa att ta sig igenom djungeln. 0 Efter en bestämd tid stänger man av spänningen. Korta STR har då vandrat långt i gelen medan långa har vandrat en kort bit.

Korta STR-områden vandrar snabbast genom gelen

Resultatet av gelelektroforesen visas genom fotografering av DNA-banden 0 Gelen läggs på ett UV-bord och fotograferas med en datorkamera. 0 UV-ljuset får DNA-banden att Dluorescera. En kamera kan då fotografera av gelen. 0 Först måste dock gelen behandlas med ett ämne för att DNA-banden ska kunna Dluorescera (etidiumbromid för bäst resultat).

Statens kriminaltekniska laboratorium använder dock kapillärelektrofores istället!

Resultatet av kapillärelektroforesen visas genom ett elektroferogram 0 Varje topp visar ett STRområde. 0 Två toppar alldeles nära varandra är samma STRområde fast på olika kromosomer (den ena från pappan och den andra från mamman). 0 Den gröna siffran anger längden av STR-området (egentligen antalet ggr som den repetitiva sekvensen upprepar sig).

Resultatet kan även presenteras i en tabell 0 Tabellen visar 10 olika STR-områden som har analyserats. 0 Siffrorna anger längden av STR-området (egentligen antalet ggr som den repetitiva sekvensen upprepar sig). 0 Varje individ har förstås två exemplar av varje STR (en från mamman och en från pappan) och därför syns två siffror i varje ruta.

Fördelen med kapillärelektrofores jämfört med gelelektrofores 1. Mycket känsligare metod: Kan separera DNA-fragment som endast avviker från varandra i längd med ett fåtal kvävebaser. 2. Kan analysera ett stort antal DNA-prover samtidigt. 3. Analysen är datoriserad: Resultatet av analysen blir ett diagram med toppar och siffror (s.k. elektroferogram) som enkelt och smidigt kan jämföras med diagram från andra analyser.

Se gärna fler filmer av Niklas Dahrén: h"p://www.youtube.com/kemilek4oner h"p://www.youtube.com/medicinlek4oner