OM FÖRETAGET REFERENSER R

Transkript

1 OM FÖRETAGET Om testet Sequenom Laboratories är ett helägt dotterbolag till Sequenom, Inc. och är ett laboratorium för molekylär diagnostik som är CAP-auktoriserat och certifierat enligt tillägget för förbättring av kliniska laboratorier CLIA (Clinical Laboratory Improvement Amendments), och som arbetar med att förbättra patientresultat genom sina revolutionerande laboratorieutvecklade tester för en rad prenatala tillstånd. Sequenom Laboratories ledde vägen för NIPT när de lanserade testet MaterniT21 PLUS för fosteravvikelser och erbjuder ett brett utbud av prenatala tester. SEQUENOM, MaterniT, MaterniT21 och Sequenom Laboratories är varumärken som tillhör Sequenom, Inc. Alla andra varumärken tillhör sina respektive ägare. 201 Sequenom Laboratories. Med ensamrätt. Testet MaterniT GENOME är ett laboratorieutvecklat test som utvecklades, validerades och utförs exklusivt av Sequenom Laboratories. Testet har inte intygats eller godkänts av den amerikanska livsmedels- och läkemedelsmyndigheten FDA (U.S. Food and Drug Administration). Även om laboratorieutvecklade tester till dags dato inte har varit föremål för FDA-reglering krävs att laboratoriet är certifierat enligt amerikanska tillägget för förbättring av kliniska laboratorier CLIA (Clinical Laboratory Improvement Amendments) för att på så sätt garantera testets kvalitet och giltighet. Sequenom Laboratories är certifierade enligt CLIA som behöriga att utföra kliniska laboratorietester med hög komplexitet och är godkända av amerikanska patologsällskapet (College of American Pathologists). Inget test är perfekt. Även om resultaten från testet MaterniT GENOME är mycket noggranna kan icke överensstämmande resultat, inklusive inkorrekt förutsägelse av fostrets kön, inträffa på grund av: mosaicism eller neoplasma i placenta, i modern eller i fostret, försvinnande tvilling, tidigare organtransplantation hos modern eller av andra orsaker. DNA fritt från celler (cfdna) ersätter inte noggrannheten och precisionen hos prenatala diagnoser med CVS eller amniocentes. Om en patient visar ett positivt MaterniT GENOME-testresultat ska patienten hänvisas till genetisk rådgivning och erbjudas invasiv prenatal diagnos för att bekräfta testresultaten. Ett negativt MaterniT GENOME-testresultat garanterar inte att graviditeten inte är angripen. Det kan hända att ett icke-informativt resultat meddelas. Anledningen till detta kan vara, men är inte begränsat till, otillräcklig sekvenstäckning, brus eller artefakter i området, avvikelser i amplifiering eller sekvensering, eller otillräcklig fetal fraktion. Testet MaterniT GENOME är inte avsett för att identifiera graviditeter som riskerar defekter i nervrör eller bukvägg. cfdna-tester för avvikelser på hela kromosomer (inklusive könskromosomer) och för avvikelser på underkromosomer kan eventuellt leda till upptäckten av genomavvikelser såväl hos fostret som hos modern, och som kan ha liten eller ingen klinisk signifikans. För att utvärdera signifikansen av ett positivt eller icke rapporterbart testresultat kan både invasiva prenatala tester och ytterligare studier på modern komma att krävas. Sådana undersökningar kan leda till att kromosom- eller underkromosomavvikelser upptäcks hos modern, vilket ibland kan associeras med godartad eller malign neoplasma hos modern. Det kan hända att cfdna-tester inte korrekt identifierar triploidi hos fostret, balanserade translokationer eller underkromosomduplikationers eller -deletioners exakta position. Detta kan detekteras genom prenatal diagnos med CVS eller amniocentes. Möjligheten att meddela resultat kan påverkas av moderns kroppsmasseindex (BMI), moderns vikt och/eller systemisk lupus erythematosus (SLE) hos modern. Resultaten från de här testerna, inklusive deras fördelar och begränsningar, bör diskuteras med en kvalificerad vårdgivare. Beslut om graviditetshanteringen, inklusive om att avbryta graviditeten, ska inte baseras enbart på resultatet från detta test. REFERENSER 1. Di Gregorio E o.a. Large cryptic genomic rearrangements with apparently normal karyotypes detected by array-cgh. Mol Cytogenet. 201, 7(82). 2. Zhao C o.a. Detection of fetal subchromosomal abnormalities by sequencing circulating cell-free DNA from maternal plasma. Clin Chem. Apr 201, 1(): R

2 VETEN- SKAPEN OM Enastående insyn x y x y Icke-invasivt prenatalt test för kromosomavvikelser i fostrets hela genom 1 Laboratories 13 quality of science 12 7

3

4 17 3 Ert och vårt gemensamma mål: ge så avancerad vård som möjligt till varje patient. För att hjälpa er att uppnå detta mål: det laboratorieutvecklade testet MaterniT GENOME ett nytt icke-invasivt prenatalt test (NIPT) som analyserar alla kromosomer i genomet. För första gången finns det nu ett NIPT som ger dig denna enastående insyn, och som för patientvården till en helt ny nivå. MaterniT GENOME är det enda NIPTtestet som ger insyn på karyotypnivå för hela genomet X Y MaterniT GENOME analyserar alla kromosomer 1 1 Maximalt antal kromosomområden som analyseras av andra NIPT:er

5 Få större insyn än någonsin tidigare Testet MaterniT GENOME börjar så tidigt som i tionde graviditetsveckan med något så enkelt som ett vanligt blodprov. Trots att det inte rör sig om en fosterkaryotyp är det för närvarande det enda NIPT:et som erbjuder en informationsmängd som tidigare bara kunde uppnås med en karyotypanalys. Det ger information om ökning eller minskning i kromosommaterial 7 Mb över hela genomet. Testet analyserar även sju kliniskt signifikanta mikrodeletionsområden. Genom att kombinera ökat sekvenseringsdjup med branschledande expertis erbjuder MaterniT GENOME en mycket större täckning än vad något annat icke-invasivt prenatalt test hittills har kunnat ge. Komplicerad vetenskap. Okomplicerade rapporter. Testet MaterniT GENOME ger avancerad DNA-analys på ett lättfattligt sätt. Den enkla rapportstilen är utformad för att förenkla kommunikationen mellan dig och din patient. Varje målkromosom får ett specifikt resultat: positivt eller negativt Innehåll Resultat Innehåll Resultat AUTOSOMALA ANEUPLOIDIER Trisomi 21 (Downs syndrom) Trisomi 18 (Edwards syndrom) Trisomi 13 (Pataus syndrom) Andra autosomala aneuploidier KÖNSKROMOSOMANEUPLOIDIER Fostrets kön Monosomi X (Turners syndrom) XYY (cobs syndrom) XXY (Klinefelters syndrom) XXX (XXX-syndrom) Konsistent med kvinnan VARIATION I ANTAL KOPIOR I HELA GENOMET 7 Mb Ökningar/minskningar 7 Mb Positivt UTVALDA MIKRODELETIONER 22q11-deletion (associerad med DiGeorges syndrom) 1q11-deletion (associerad med Prader-Willis och Angelmans syndrom) 11q23-deletion (associerad med cobsens syndrom) 8q2-deletion (associerad med Langer-Giedions syndrom) p1-deletion (associerad med Cri-du-chatsyndromet) p1-deletion (associerad med Wolf-Hirschhorns syndrom) 1p3-deletionssyndromet KR 1 Duplikation Rapporten har ett kromosomideogram som visar avvikande resultat för att underlätta förståelsen p3.2 p3 p3.2 p33 p32.2 p3.3 p31.3 p31.1 p22.2 p3.1 p21 p3.3 p13.2 p12 q11 p3.1 q21 p32.3 p32.1 p31.2 q23.1 q23.3 q2.1 q2.3 p22.3 p22.1 p13.3 p13.1 p11 q32.1 q32.3 q12 q22 q23.2 q2 q2.2 q31 q32.2 q1 q2.1 q2.3 q2.2 q3 q Beskrivning: Ungefär 1,3 Mb ökning av kromosom 1-material observerades, vilket antyder en duplikation i området p3.3 p3.1.

6 Se bortom prenatal karyotyp Bestämdheten för prenatal karyotyp är ofta sämre än för karyotyp för perifert blod. Svårtolkade deletioner eller duplikationer större än 7 Mb kan undgå detektion vid vanlig prenatal karyotyp¹. Detta kan få kliniska konsekvenser som kan vara dödliga eller leda till komplexa, svåra fosteravvikelser. Testet MaterniT GENOME erbjuder nya möjligheter för icke-invasiva tester, och identifierar > 9 % av deletioner i hela genomet eller duplikationer 7 Mb. Detta gör testet till det mest kompletta fosterkromosomtestet som för närvarande finns tillgängligt på icke-invasiv väg. Fosterkaryotyptest Testet MaterniT GENOME Analyserar alla kromosomer Kräver en invasiv procedur Nej Detekterar stora, obalanserade translokationer Vi förstår att avancerad genetisk rapportering kan vara en utmaning i patientrådgivningen, särskilt när du behöver ytterligare kontext för ett visst resultat. Du har tillgång till direktkonsultation med våra rådgivare, specialiserade på genetik, för att få djupare kunskap helt enligt dina behov. Om du har frågor om testet MaterniT GENOME eller om du vill prata med en genetisk rådgivare om resultat kan du kontakta oss på genome@sequenom.com. Detekterar markörkromosomer Detekterar balanserade translokationer eller inversioner Detekterar så små kromosomökningar eller -minskningar som 7 Mb Detekterar utvalda mikrodeletioner Nej Nej Nej Detekterar triploidi Nej Anses diagnostiskt Nej

7 Fortsätt som ledare för ditt verksamhetsområde Testet MaterniT GENOME slår ihop ledande teknik med enastående insyn och erbjuder den vetenskapligt mest avancerade information som ett icke-invasivt test kan ge. Det är ett spjutspetsverktyg som tillsammans med din expertis hjälper dig att förbättra din praktik och din patienthantering.

8 Sequenom Laboratories erfarenhet av ansvarsfull innovation inom NIPT Kromosomavvikelser i hela genomet Första NIPT Trisomi 21 Trisomi 18 Trisomi 13 Fostrets kön Graviditeter med flera foster Könskromosomaneuploidier Mikrodeletioner: 22q, 1q, p, 1p3 Trisomi 22 Trisomi 1 Ytterligare mikrodeletioner: 11q, 8q, p Pålitlig prestanda Sequenom Laboratories har lång erfarenhet av ansvarsfull innovation, och varje framsteg inom NIPT har utmärkt sig för sina pålitliga resultat och varit uppbyggt på utförliga valideringsstudier. Valideringstester på testet MaterniT GENOME bygger på denna erfarenhet och på tidigare arbete inom analys av hela genomet, vilket garanterar mycket noggranna resultat. Prestanda över hela genomet Prestandautvärdering Prestanda Sensitivitet 100 % 92,9 % 80 % 0 % 0 % 20 % 0 % Specificitet > 99,9 % 98,1 % > 99,9 % 99, % > 99,9 % 7 10 Mb 11 1 Mb 1+ Mb Underkromosomhändelser i hela genomet Initial studie på hela genomet Tidigare arbete 2 innebar de första stegen när det gäller analys över hela genomet. Genomt DNA och plasmablandningar från modern användes. Titrationsserie för att efterlikna spridning av fetal fraktion. Omfattande modellering med ISCA-data ISCA-databasen användes som källa för > händelser. In silico-modellering av dessa händelser i > sekvenser i moderns plasma. Gjorde över 2 miljoner analyser möjliga. Underlättar förståelsen av algoritmprestanda. Analysvalidering gånger fler gdna-prover analyserades än i tidigare arbeten. Prover med händelser som bekräftats med microarray eller karyotyp. Titrationsserie för att efterlikna spridning av fetal fraktion. In silico-modellering som bekräftats med prestandamätning. Händelsens storlek Trisomierna 21, 18, 13, SCA och fostrets kön Ekvivalensstudie Studie av 8 kliniska prover. Dubbelt så djup sekvensering som med MaterniT21 PLUS. Jämförelse mellan resultat från MaterniT21 PLUS och MaterniT GENOME för trisomierna 21, 18 och 13, könskromosomaneuploidier samt bestämning av fostrets kön. 100 % överensstämmelse mellan de två testerna.