INCA Variabelbeskrivning

Transkript

1 INCA Variabelbeskrivning Cancerportalen ALK registrering och Molekylärpatologi för Lungcancer fr o m 2016 Variabelbeskrivningen ändrad

2 Cancerportalen i Nationella Lungcancerregistret Sammankallande i styrgruppen lungcancer Ansvarigt regionalt onkologiskt centrum Nationell koordinator: Registerkonstruktör: Nationellt ansvarig statistiker: Gunnar Wagenius, Onkologkliniken, Karolinska Universitetssjukhuset, Solna Stockholm gunnar.wagenius@onkologi.uu.se gunnar.wagenius@karolinska.se Regionalt cancercentrum, Uppsala/Örebroregionen Akademiska sjukhuset Uppsala Tel Fax Anna Pedersen, Regionalt cancercentrum, Uppsala/Örebroregionen anna.pedersen@akademiska.se Jonas Celander Guss, Regionalt cancercentrum, Uppsala/Örebroregionen jonas.celander.guss@akademiska.se Marit Holmqvist, Regionalt cancercentrum, Uppsala/Örebroregionen marit.holmqvist@akademiska.se Formulärförteckning Molekylärpatologi formulär... 4 Klinisk ALK registrering Variabelbeskrivningens innehåll Namn Namn i registret, visas vid sammanställning i webbgränssnittet Kortnamn Kortnamn i registret, visas vid export till XML- eller textfil Beskrivning Beskrivning av variabelns innehåll Typ Datatyp i registret, t ex text, datum, lista, kryssruta och variabelns längd Värdelista och värden Namnet på den värdelista som är kopplad till variabeln om den är av typen lista. De värden som värdelistan innehåller. Kommentar/ Giltighet Information om En variabel är obligatorisk, beroende av andra variabler eller beräknas Förändring av giltighet med datumangivelse Ändring av text i formulär eller variabelns värdelista

3

4 Molekylärpatologi formulär PERSNR PERSNR Personnummer (13) Hämtas automatiskt från ENAMN ENAMN Efternamn (36) Hämtas automatiskt från FNAMN FNAMN Förnamn (36) Hämtas automatiskt från KÖN KÖN Kön Heltal(1) 1=Man 2=Kvinna Hämtas automatiskt från GADRESS GADRESS Gatuadress (36) Automatiskt från befolkningsregister Hämtas automatiskt från PADRESS PADRESS Postadress (27) Automatiskt från befolkningsregister Hämtas automatiskt från POSTNR POSTNR Postnummer (6) Automatiskt från befolkningsregister Hämtas automatiskt från INRAPPENH INRAPPENH Inrapporterande enhet För inrapprotör visas systemvariabel för inrapporterande enhet. INRAPP INRAPP Inrapportör För inrapportör visas systemvariabeln. AVLIDDAT AVLIDDAT Dödsdatum (10) Hämtas automatiskt från LKF LKF LKF (10) Aktuell LKF. Hämtas automatiskt från MP_Initierat MP_Initierat Initierad av MP_Inrapp MP_Inrapp Inrapporterad av MP_InrappDtm MP_InrappDtm Inrapporteringsdatum Datum MP_InrappEnh MP_InrappEnh Inrapporterande enhet

5 MP_Klinik MP_Klinik Inrapporterande klinikkod MP_MonKom MP_MonKom Monitors kommentar MP_Sjukhus MP_Sjukhus Inrapporterande sjukhuskod MP00_AnalysDtm MP00_AnalysDtm Datum då analysen utfördes Datum MP00_InternId MP00_InternId Intern identifiering MP00_MorfKlass MP00_MorfKlass Morfologisk klassning 1 - Adenocarcinom 2 - Skivepitel 3 - NSCLS NOS 4 - Okänd MP00_PAD MP00_PAD PAD/identifiering av material MP00_ProvMtrl MP00_ProvMtrl Typ av provmaterial 1 - OP 2 - PX-bronk 3 - Cytologi 4 - Transtorakalbiopsi 5 - Okänt 6 - Annat MP00_ProvMtrlVad MP00_ProvMtrlVad Typ av provmaterial annat, vad MP00_TumLok MP00_TumLok Tumörlokal 1 - Primärtumör 2 - Metastas 3 - Okänd MP00_UppTumHalt MP00_UppTumHalt Uppskattad tumörcellshalt (efter ev makrodisektion) MP01_Andra MP01_Andra Andra gener 1 - <10% % % 4 - >50% 5 - Okänt MP01_MutAnalys MP01_MutAnalys Är mutationsanalys genomförd

6 MP01_Mutation MP01_Mutation Uppvisar mutation MP01_Egfr MP01_Egfr EGFR-mutation 1 - Normal 2 - Ej analyserad 3 - Ej bedömbar 4 - EGFR exon 19 del 5 - EGFR p.l858r 6 - EGFR p.l861q 7 - EGFR p.g719x 8 - EGFR p.t790m 9 - EGFR p.s768i 10 - EGFR exon 20 ins 11 - Annan MP01_EgfrVad MP01_EgfrVad Annan EGFR-mutation, vad MP01_Raf MP01_Raf RAF-mutation 1 - Normal 2 - Ej analyserad 3 - Ej bedömbar 4 - BRAF p. T599X 5 - BRAF p.v600d 6 - BRAF p.v600e 7 - BRAF p.v600k 8 - Annan MP01_RafVad MP01_RafVad Annan RAF-mutation, vad

7 MP01_Ras MP01_Ras RAS-mutation 1 - Normal 2 - Ej analyserad 3 - Ej bedömbar 4 - KRAS p.g12a 5 - KRAS p.g12c 6 - KRAS p.g12d 7 - KRAS p.g12r 8 - KRAS p.g12s 9 - KRAS p.g12v 10 - KRAS p.g13a 11 - KRAS p.g13c 12 - KRAS p.g13d 13 - KRAS p.g13r 14 - KRAS p.g13s 15 - KRAS p.g13v 16 - KRAS p.a59e 17 - KRAS p.a59g 18 - KRAS p.a59t 19 - KRAS p.q61h 20 - KRAS p.q61l 21 - KRAS p.q61r 22 - KRAS p.k117x 23 - KRAS p.146x 24 - NRAS p.g12a 25 - NRAS p.g12c 26 - NRAS p.g12d 27 - NRAS p.g12r 28 - NRAS p.g12s 29 - NRAS p.g12v 30 - NRAS p.g13a 31 - NRAS p.g13c 32 - NRAS p.g13d 33 - NRAS p.g13r 34 - NRAS p.g13s 35 - NRAS p.g13v 36 - NRAS p.a59e 37 - NRAS p.a59g 38 - NRAS p.a59t 39 - NRAS p.q61h 40 - NRAS p.q61l 41 - NRAS p.q61r 42 - NRAS p.146x 43 - Annan

8 MP01_RasVad MP01_RasVad Annan RAS-mutation, vad MP01_TekMutDet MP01_TekMutDet Teknik för mutationsdetektion MP01_TekVad MP01_TekVad Annan teknik, vad 1 - NGS 2 - Allelspecifik 3 - Sanger sekvensering 4 - Annan MP01_Panel MP01_Panel Allelspecifik, vad 1 - Pyroseq 2 - Entrogen 3 - Dxs 4 - Annan MP01_AllelVad MP01_AllelVad Vad för annan allelspecifik teknik MP01_NGSVad MP01_NGSVad Vad för annan NGS panel MP02_Alk MP02_Alk Uppvisar ALKrearrangemang MP02_AnnFusion MP02_AnnFusion Annan fusion 2 - Okänt MP02_AnnFusionVad MP02_AnnFusionVad Vad för annan fusion MP02_FusGenAnalys MP02_FusGenAnalys Har fusiongensanalys genomförts MP02_FusionPart MP02_FusionPart Känd fusionspartner MP02_FusionPartVilken MP02_FusionPartVilke n Annan känd fusionspartner, vilken MP02_PadKloss MP02_PadKloss Har annan PAD-kloss än ovan använts MP02_PadKlossVilken MP02_PadKlossVilken Annan PAD-kloss, vilken

9 MP02_Teknik MP02_Teknik Teknik 1 - IHC 2 - In situ hybridisering (ISH) 3 - IHC och ISH 4 - NGS 5 - RT PCR 6 - Annat MP02_TeknikVad MP02_TeknikVad Annan teknik, vad MP03_Biobank MP03_Biobank Finns ytterligare material på fallet 2 - Okänt MP03_BiobankMtrl MP03_BiobankMtrl Material i biobank 1 - Paraffinmaterial 2 - DNA/RNA 3 - Cytologi 4 - Annat MP03_BiobankMtrlVad MP03_BiobankMtrlVad Annat biobanksmaterial, vad

10 Klinisk ALK registrering PERSNR PERSNR Personnummer (13) Hämtas automatiskt från ENAMN ENAMN Efternamn (36) Hämtas automatiskt från FNAMN FNAMN Förnamn (36) Hämtas automatiskt från KÖN KÖN Kön Heltal(1) 1=Man 2=Kvinna Hämtas automatiskt från GADRESS GADRESS Gatuadress (36) Automatiskt från befolkningsregister Hämtas automatiskt från PADRESS PADRESS Postadress (27) Automatiskt från befolkningsregister Hämtas automatiskt från POSTNR POSTNR Postnummer (6) Automatiskt från befolkningsregister Hämtas automatiskt från INRAPPENH INRAPPENH Inrapporterande enhet För inrapprotör visas systemvariabel för inrapporterande enhet. INRAPP INRAPP Inrapportör För inrapportör visas systemvariabeln. AVLIDDAT AVLIDDAT Dödsdatum (10) Hämtas automatiskt från LKF LKF LKF (10) Aktuell LKF. Hämtas automatiskt från UN_EML4 UN_EML4 EML4-ALK test utfört UN_EML4Dtm UN_EML4Dtm Datum för ALK test Datum UN_EML4PosNeg UN_EML4PosNeg Resultat av ALK test 1 - Positiv 2 - Negativ 3 - INKONKLUSIV 4 - Svar ej inkommit UN_ALKBehandling UN_ALKBehandling Patient satt på ALK behandling Kryssruta

11 UN_ALKLinje UN_ALKLinje Behandlingslinje som ALKbehandlingen startas i UN_ALKLakemedel UN_ALKLakemedel Cytostatikasubstans som satts in för den målstyrda behandlingen UN_ALKLakemStudie UN_ALKLakemStudie Vad för studieläkemedelssubstans sattes in UN_ALKLakemAnnat UN_ALKLakemAnnat Vad för annan läkemedelssubstans sattes in UN_ALKBehBeslutDtm UN_ALKBehBeslutDtm Datum för behandlingsbeslut UN_ALKMDT UN_ALKMDT Har multidisciplinär terapikonferens hållits? UN_ALKBehStart UN_ALKBehStart Datum för start av behandling Datum Datum UN_ALKStartDos UN_ALKStartDos Startdos för behandlingen Decimaltal 1-1:a linjen 2-2:a linjen 3-3:e linjen 4-4:e linjen 5-5:e linjen 6 - Ytterl Crizotinib 24 - Ceritinib 50 - Studieläkemedel 99 - Annat UN_ALKBehIndikation UN_ALKBehIndikation Behandlingsintention 1 - Kurativ 2 - Palliativ UN_ALKStadium UN_ALKStadium Stadium vid start av aktuell behandling UN_ALKMottBesDtm UN_ALKMottBesDtm Datum för mottagningsbesök med patienten Datum 1 - IA 2 - IB 3 - IIA 4 - IIB 5 - IIIA 6 - IIIB 7 - IV

12 UN_ALKPerfStatus UN_ALKPerfStatus Patientens performance status enligt ECOG-WHO UN_ALKDosAndr UN_ALKDosAndr Är dosen ändrad inför eller vid besöket UN_ALKNyDos UN_ALKNyDos Ny dosering av läkemedlet Decimaltal 0-0. Klarar all normal aktivitet utan begränsning Klarar inte fysiskt krävande aktivitet men Är uppegående och kan sköta sig själv men Kan endast delvis sköta sig själv, är bunden Klarar inte någonting, kan inte sköta sig själv... UN_ALKDosAndrOrsak UN_ALKDosAndrOrsak Varför har dosen ändrats 1 - Progress 2 - Toxicitet 3 - Patientens val 4 - Läkare 5 - Annan UN_ALKDosAndrOrsVad UN_ALKDosAndrOrsVa d Vad för annan anledning till dosändring UN_ALKUtsattning UN_ALKUtsattning Har läkemedlet satts ut inför eller vid besöket UN_ALKUtsDtm UN_ALKUtsDtm Datum för utsättning av läkemedlet UN_ALKUtsTyp UN_ALKUtsTyp Stoppas läkemedelinsättningen definitivt eller görs en paus i behandlingen Datum 1 - Definitiv 2 - Paus UN_ALKSubjRespons UN_ALKSubjRespons Klinisk responsbedömning 1 - Oförändrat 2 - Förbättrat 3 - Försämrat 4 - Ej bedömbart UN_ALKRadResp UN_ALKRadResp Radiologisk responsbedömning 1 - CR 2 - PR 3 - SD 4 - PD 5 - Ej bedömbart 9 - Ej utfört

13 UN_ALKRadRespDtm UN_ALKRadRespDtm Datum för radiologisk responsbedömning UN_ALKRadRespMod UN_ALKRadRespMod Modalitet för radiologisk undersökning UN_ALKRespStatus UN_ALKRespStatus Förändring av responsbedömning av status per tumörlokal, sedan föregående besök UN_ALKRespPrim UN_ALKRespPrim Responsbedömning av primärtumören UN_ALKMetLok UN_ALKMetLok Vilka metastaser har patienten UN_ALKMetLokAnnat UN_ALKMetLokAnnat Vad för annan metastaslokal UN_ALKMetLokResp UN_ALKMetLokResp Responsbedömning av metastaser UN_ALKBiv UN_ALKBiv Har patienten biverkningar, som är kopplade till cytostatikabehandlingen UN_ALKBivAndrad UN_ALKBivAndrad Har biverkningsbilden förändrats sedan föregående besök Datum 1 - Rtg 2 - CT 3 - Pet 4 - Mrt 1 - Ökat 2 - Minskat 3 - Oförändrat 4 - Ej bedömbart 1 - Lymfkörtlar mediastinum 2 - Lymfkörtlar övriga 3 - Lunga 4 - Skelett 5 - Lever 6 - Hjärna 7 - Binjure 9 - Annat 1 - Ökat 2 - Minskat 3 - Oförändrat 4 - Ej bedömbart

14 UN_ALKBivTyp UN_ALKBivTyp Vilka biverkningar har patienten? UN_ALKBivTypAnnat UN_ALKBivTypAnnat Vilken annan biverkning 0 - Förekomst av perifera ödem 1 - Illamående 10 - Njurcysta 11 - Neutropeni 12 - Feber 13 - QTc-förlänging 14 - Bradykardi 15 - ALAT-stegring 16 - Bilirubinstegring 17 - Hypofysfatemi 18 - Kräkningar 19 - Minskad aptit 2 - Dimsyn 20 - Buksmärta 21 - Hudutslag (acneiform eller makulopapulöst) 22 - Perikardit 23 - Anemi 24 - Hyperglykemi 25 - Nedsatt njurfunktion 26 - Njursvikt 3 - Diplopi 4 - Andra synrubbningar 5 - Diarré 6 - Förstoppning 7 - Trötthet 8 - GI-perforation 9 - Pneumonitbild 99 - Annat UN_ALKBivGrad UN_ALKBivGrad Vilken grad av biverkning upplever patienten? UN_ALKPerfOdem UN_ALKPerfOdem S-Albumin, om perifera ödem förekommer 1 - Grad Grad Grad Grad Grad Normalt S-Albumin 1 - Sänkt S-Albumin