Christer Jansson Utvärdering_skannande_LCMS_121210CJ.xlsx sid 1(5) Upphandling skannande LC-MS dnr SLU.ma.27/2012 Utvärderingskriterier: Funktionalitet (60 %) dvs Systemets funktionalitet bedöms efter i hur pass hög grad Systemet uppfyller ställda bör-krav enligt kapitel 4, resultat från instrumenttester enligt p. 3.1.5 och referenser enligt p. 3.2. Pris (30 %) Grund för utvärderingen är anbudsgivarens totalpris enligt specifikationen Service (10 %) Kriteriet utvärderas enligt p. 4.2.3. Thermo Electron org nr 556577-2364 556485-5657 556790-0922 556573-6773 556289-7396 Offererat MS-system maxis impact UHR QTOF Xevo G2-S QTOF Sciex TripleTOF 4600 6550iFunnel Q-TOF Q Exactive HCD - Equan Offererat LC-system Agilent 1260 ACQUITY UPLC H-Class Agilent 1260/1290 Agilent HPLC 1290 Accela UHPLC w/2d Kontaktperson Per Nilsson 0767-622 135 per.nilsson@bruker.se Anders Medin, tel. 070-710 22 92 anders.medin@absciex.com Anders Janesten tel: 08-555 11 503 anders_janesten@waters.co m Bengt Fridh tel: 08-5064 8769, 070-544 2340 Bengt_fridh@agilent.com Lage Thaning tel: 0705-44 20 03 lage.thaning@thermofisher.co m Egon Rosén tel: 08-556 468 00 egon.rosen@thermofisher.com 4 Funktionalitet, bör-krav 4.1 Systemets funktionalitet 4.1.1.a Ange masstalsupplösning vid m/z upp till 500! > 20 000 vid m/z 118 Ca 33.500 FWHM m/z 86 = < 18 000 (FWHM) m/z 195 = < 25 000 (FWHM) vid 10 msek ackumuleringstid 4.1.1.b Ange masstalsupplösning vid m/z över 500! > 40 000 vid m/z 1225 oberoende av scanhast upp till 50 Hz Ca 33.500-39.000 FWHM m/z 956 = 30 000 (FWHM) vid 10 msek ackumuleringstid m/z 286 = 35 000 m/z >500 = 35-42 000 FWHM m/z >500 = 35-42 000 FWHM Masstalsupplösningen är oberoende av skanhastighet m/z 200 = 140 000 m/z 500 = 100 000 m/z 800 = 70 000 m/z 1500 = 50 000 4.1.2.a 4.1.2.b 4.1.2.c 4.1.2.d Ange massnoggrannhet i MS-mode vid masstal över m/z 500! Ange massnoggrannhet i MS/MS-mode vid masstal över m/z 500! Ange massnoggrannhet i MS-mode vid masstal under m/z 500! Ange massnoggrannhet i MS/MS-mode vid masstal under m/z 500! <1 mda, påverkas inte av skanhast ell. Masstal se ovan se ovan se ovan <1 ppm <1ppm RMS <2 ppm <1ppm RMS <1 ppm <1ppm RMS <2 ppm <1ppm RMS
Christer Jansson Utvärdering_skannande_LCMS_121210CJ.xlsx sid 2(5) 4.1.3.a 4.1.3.b Ange skanhastighet tillsammans med massnoggrannhet vid aktuell skanhastighet i MS-mode vid masstal med högst m/z 500! Ange skanhastighet tillsammans med massnoggrannhet vid aktuell skanhastighet i MS/MSmode vid masstal med högst m/z 500! Upp till 50 Hz, massnoggrannhet < 1ppm Upp till 50 Hz, massnoggrannhet < 1ppm 30 skan/sekund och < 25 spektra/sekund 50 Hz i MS mode massnoggrannhet < 1 mda <1 ppm oberoende av skanhast, masstal, MS, MSMS samma som ovan < 100 spektra/sekund 30 Hz < 2 ppm Thermo Electron 12,5 spektra/sekund <1ppm RMS Fullskan med 70 000FWHM + 10st data dependent MSMS-skan/ 1 sekund 4.1.4 Systemet bör möjliggöra analys i MS/MS-mode 4.1.5 Systemet bör möjliggöra villkorsstyrd MS/MS-skan Datadependent mode. 4.1.6.a 4.1.6.b Ange signal till brus, s/n (peak-to-peak), för reserpine i MS-mode! Ange även mängd injicerad substans Ange signal till brus, s/n (peak-to-peak), för reserpine i MS/MS-mode! Ange även mängd injicerad substans Ja Standardfunktion i programvaran >100:1 vid 1 pg Reserpin injicerat (RMS) Ja, även samtidigt med låg/hög kollisonsenegi Ja Ja Ja >500:1 vid 1 pg Ej uppmätt 500:1 vid 1 pg Reserpin (RMS) ej specificerat för reserpin Ej uppmätt 20:1/ 200 fg = 100:1 / 1 pg reserpin 1000:1 vid 1 pg Reserpin (RMS) 100:1 / 500 fg reserpin = 200:1 / 1 pg Full-MS SIM: 100:1/50 fg Ej uppmätt 4.1.7 Ange Systemets dynamiska område! > 10 exp 4 >5 magnituder med bibehållen upplösning 4.1.8 Ange hur datafilstorleken per tid, påverkas av olika skan-inställningar, ange värden! Direkt proportionell mot scanområde och -hastighet. 20 Hz: 2 x större än vid 10Hz Ex: 20 min datainsamling, 20 Hz, m/z 50-600 genererar en datafil på ca 1 GB 50MB/min vid 20 Hz 7 MB/min vid 3 Hz Vid demo: 75 MB/min vid 3 Hz 17 min körning, m/z 50 och m/z 1200 i centroid-läge, scan tid = 0.3 sekunder ger ca 600 MB. Insamling av Continium -data ger större filer. Centroid-data ger mindre filer. Lägre skan-hastighet ger större filer. Större skan-område ger större filer. MSe ger större filer än MS men mindre än DDA. MS/MS ger mindre filer än MS. Processade data i TargetLynx ger filer i storleksordning som MRM-analyser (två-dimensionella data) och tre-dimensionell data kan därmed raderas. 35MB/min vid 3Hz >4 dekader "interscan" maximalt 5 dekader >5000:1 inom samma spektra "Information Dependent Acquisition" = 35 MB/ 5 min MRM high res = 20MB/ 5 min 7MB/min vid IDA 1-10 MB/min för centroiddata 10-100 MB/min för profile Auto-MSMS ger större filer > 100MB/min med auto-ms (profile) Kraftig reduktion med SIM Full-skan: 20MB/min (70 000 FWHM) SIM: 1MB/min 20 MB/min (70 000 FWHM) 1 MB/min vid SIM 4.1.9 Ange vilka interface som kan användas med Systemet! APCI, APPI, nanospray, Captivespray, GC-APCI, interface for capillary electrophoresis ESI, APCI, ESCi, APPI/APCI, LockSpray,nanoFlow ESI, APGC, TRIZAIC, ASAP, DESI, DART API, APPI, APCI, nano source APCI, APPI, Multimode, ESI, APCI, APPI, DESI, DART mfl HPLC-Chip, GC-APCI, DART mfl
Christer Jansson Utvärdering_skannande_LCMS_121210CJ.xlsx sid 3(5) 4.1.10 Beskriv kortfattat rengöring av interface, utförande och tidsåtgång! Snabbkoppling, skölj m lämpligt lm, Tot ca 5 minuter Sample cone rengörs i Hänvisar till manual. 1-2ggr/vecka: Avsköljning av ultraljudsbad => några min Ser relativt enkelt ut jonkälla 1ggr/2 veckor: Ultraljudsbad av Capillary cap och Spray shield, ca 15 min Thermo Electron Rengöring av API Ion Max Source med MeOH samt kapillären i ultraljudsbad, Totalt c:a 5 minuter 4.1.11 Ange normal spridning, % RSD, för repetitiv injektion av standard! Vid extern kalibrering 5-10% 2% <5% < 3% RSD c:a 5%. Hänvisar till Pest Screen w QExactive, Ej bifogat 4.1.12 Ange masstabilitet över tid! spridningen är ca 0,3 ppm över 2500 scan 0,5 mda (RMS) för 10 provreplikat i en serie av 300 injektioner över 60 timmar <2ppm RMS/ 100 timmar vid m/z 136; 315 o 455 = c:a 0,6 mda RMS <1 ppm inom ±3ºC Använder normalt lock-mass med två joner, hög/låg < 3ppm / 24 h Normalt ej lock-mass 4.1.13 Pos-neg-switch; Ange kortast rekommenderad tid! 10 sekunder Pos/neg-swithchning kan ske mellan injektioner Går inte att switcha pos/neg inom en körning 1,5 sekunder Fullskan i pos + neg inom 1 sekund 4.1.14 Ange systemets ljudnivå i db vid normal drift! ca 52 db 62-65 db(a) på 1 m avstånd 63 db <70 db 57 db 4.1.15 Ingående autosampler börv ara försedd med termostaterat utrymme för vialerna. 4.1.16 Ingående HPLC bö rvara försedd med en termostaterad kolonnugn. 4.1.17 Integrerad mjukvara börkunna styra, spara instrumentparametrar och samla information från ett komplett System 4.1.18 Mjukvaran bör ha rutiner för automatiserad kvantifiering och kvalitetssäkring. Det är en fördel om mjukvaran är väl beprövad, användarvänlig och är baserad på Microsoft Windows Ja MassLynx 4.1, MSe och POSI±IVE-mjukvara. POSI±IVE möjliggör kvalitativ och kvantitativ exaktmassanalys för id/ kvant av både "targeted" och "untargeted" baserat på exakt massa för molekyljon, dess fragment samt rettid. Ja Ja Ja 4.1.19 Systemets dator bör ha DVD-brännare eller annat lagringsmedia installerat. 4.1.20 Systemet bör vara utrustat med funktioner som möjliggör detektion av okända organiska föreningar utifrån grupptillhörighet, targetlist, till exempel pesticider, medicinska preparat drugs, steroider och organiska flor- och brom-föreningar. Ja Tre "target lists" ingår Ja, med POSI±IVE och Mse för fragmenteringsinformation Ja Ja Ja
Christer Jansson Utvärdering_skannande_LCMS_121210CJ.xlsx sid 4(5) 4.1.21 Ange vilka förutsättningar Systemet ger för att bestämma enskilda okända-okända föreningar i komplexa prov! I MS-mode utnyttjas molekylviktsinformation och det faktum att instrumentet generar korrekta isotopförhållanden till begränsa antalet möjliga kandidater. MS/MS data som genereras, med korrekt masstal och isotopmönster kan med hjälp av funktionen " smart formula 3D" ge strukturen Data används för att söka på Chemspider som är web baserad databas för slutgiltig identifiering av den okända substansen Insamling med Mse ger låg/hög kollisionsenergi => information om moderjon och fragment. Kan anlysera både höga och låga konc. I samma prov Antingen med "Formula Finder" vilket ger den elementära sammansättningen utifrån massnoggrannhet av precursoroch fragment-joner. Med "Chemspider" utforskas fragmenetringen. Eller med "XIC Manager", en algoritm listar funktionaliteten i provet, söker med bibliotek Med algoritmen "MFEmolecular features extraction" kan helt okända föreningar upptäckas. Matchning med eller utan MS/MS mot databas eller bibliotek Thermo Electron Full-skan + data dependent MSMS-skan för ex de 10 högsta jonerna under 1 sek Samma joner kan undantas från MSMS-skan under t.ex 30 sek Vidare utvärdering med mjukvaran 4.1.22 Ange vilka databaser som ingår! pesticider, toxikologi, dopingpreparat och "drugs of abuse" Ca 700 i pesticid-bibliotek en tox -screening databas (850 ämnen) och en pesticid + vet.med databas (550 ämnen) "LC/MS/MS Meta Library Version 1.0" (2340 droger, bekämpningsmedel, antibiotika och mykotoxiner) Biblioteksdata för steroider kan erhållas utan kostand, fn under upparbetening. Forensic/Tox PCDL med >7.000 substanser varav >3000 har MS/MS spektra vid minst tre olika kollisionsenergier. Pesticiddatabas (1609 pest, 500 MS/MS) Environmental and Food Safety Library med ca 1000 föreningar MS och MSMS. Se bifogad lista 4.1.22.b Kan de användas för sökning i MS-mode? 4.1.22.c Kan de användas för sökning i MS/MS-mode? Nej Ja Ja Ja Ja Bruker arbetar med det 4.1.23 Ange vilka övriga sökbara databaser som finns tillgängliga! Dataformat gör det möjligt att söka i alla publika web-baserade databaser Kan även komplettera/skapa egna Förutom att man kan komplettera de medföljande databaserna med egna data så är mjukvaran är öppen för andra externa databaser, t.ex. Chemspider DOIS databas, Norman database link: http://www.normandata.eu/empom ass_index.php Chemspider, Lipidmaps, Veterinary drugs, Pesticides Tox ID Database for Drugs of Abuse ca 300st Vissa MSMS HCD-library (pharma/clin/tox) 1007 st Pharmacological Library 650st Går att skapa/importera nya databaser 4.2 Leveranstid och kostnader 4.2.1.a Ange leveranstid ca 8 veckor 8 veckor 4-6 veckor Anges ej 8-10 veckor
Christer Jansson Utvärdering_skannande_LCMS_121210CJ.xlsx sid 5(5) 4.2.1.b Bifoga införandeplan och/eller beskriv leveransförfarandet! Installation: 3-5dgr, med kortare introduktionsträning Efter installation: 3 dgr utbildning på plats. Införandeplan ingår. Installation 1-2 veckor Installation påbörjas 1 vecka Grundutb. vid installation efter leverans "Post-install-visit"utbildning för 3-dgrs kurs hos Sciex för 1 våra specifika områden. person 3 dagars utbildning hos oss Dessutom: 3-dgrs utb onsite 20 kkr - rabatt Thermo Electron Installation: ca 3dgr, och 2-3dgr familjärisering Efter installation: 3 dgr utbildning på plats. 4.2.2 Pris 4.2.2 Anbudets totalpris 2,193 milj kr 2.722 milj kr 3.030 milj kr 2,561 milj kr 2,975 milj kr 4.2.3 Pris fullservicekontrakt 189 kkr/år 162 kkr/år Obs! Bara QTof 211 kkr/år för QTof+UPLC 138 kkr/år 237 kkr/år 195 kkr/år Totalpris för 3 år med fullservicekontrakt 2.571 milj kr 3.144 milj kr 3.307 milj kr 3.036 milj kr 3.365 milj kr 4.2.3.b Vilka kostnader täcks inte vid fullservice? Förbrukningsvaror Ingen begränsning i TAW Ingen begränsning Ingen begrändning Ingen begränsning (Advantage Silver) 4.2.4 Ange priser för tillkommande offline licenser 39 kkr/st 31 kkr/st Analyst TF 1.5.1 Processing-only License 11 090SEK; MultiQuantTM Software V2.1 - Base Version License 20 916 SEK; MultiQuantTM Software v2.1-scheduled MRM version License 42267 SEK (samtliga efter 50% rabatt) Ingående offline-linser? Ingen MassLynx med POSITIVE: Obegränsat antal Analyst TF: 2 st MultiQuant: 1 st PeakWiew Software: 2 st 8 kkr/extra licens Xcalibur: Gratis TraceFinder: 18 kkr/st 3 st ingår i offerten 5 st TraceFinder samt obegränsat "provapå-licenser" under 1 månad 4.2.5 Garanti 4.2.5 Ange er garantitid 12 månader 12 månader 12 månader 12 månader 1 år Vikt och mått MS 220 kg 120x80x198 (bxdxh) 266 kg + 48 kg (pump) 102x69x152 cm (bxdxh) 458+45 kg (pump) 141x83x136 (bxdxh) 165 kg 122x74x193 cm (bxdxh) 182 kg 91x82x114 (bxdxh) Poängsättning Funktionalitet (max poäng 100 ) 69 84 67 78 72 viktad poäng (60%) 41 50 40 47 43 Pris (max poäng 100) 100 82 78 85 76 viktad poäng (30%) 30 25 23 26 23 Service, tillgänglighet, pris (max poäng 100) 73 65 100 58 71 viktad poäng (10%) 7 7 10 6 7 Summa viktade poäng 78 82 73 79 73