Omtentamen DSM1.1 10080 1 frågor Max 44 poäng, Godkänt = 0 p Lycka till! 1 Vilka tre former av infektion kan Leishmania parasiten orsaka i människokroppen? 1 Kutan, mukokutan och visceral infektion Du har rest till Malawi (i Afrika) med AfricaTours resebyrå som arrangerar ryggsäcksturism. Under andra veckan av resan har du haft chansen att bada i olika sötvattensjöar och några timmar efter sista badet har du upplevt ganska obehagliga kliande utslag över hela kroppen. Baserad på epidemiologin och symtomen, vilken parasit har du troligen blivit smittad av? 1 Schistosoma Vad är en vektor (inom mikrobiologin)? 1 Det är en transportmekanism som överför smitta mellan djur (eller människor), ofta är det en levande organism. 4 Nämn två olika parasiter som påverkar levern eller orsakar leversjukdom. Echinococcus, Toxocara, Entamoeba histolytica, Leishmania, Schistosoma, Fasciola. 5 Ange minst två karakteristika som skiljer virus från andra mikroorganismer. a) filtrerbara, obligata parasiter, b) endast en typ av nukleinsyra, c) reproduceras genom hopsättning istället för delning, d) saknar förmåga att generera metabolisk energi och egen proteinsyntes
6 Lista huvudstegen (7 st) vid virusreplikationen. 4 "- Bindning till cellulär receptor, - Penetration av målcell, - Virushölje och kapsid försvinner (avklädning/uncoating), - Makromolekylär syntes (inkluderande mrna syntes, syntes av strukturella samt icke-strukturella proteiner, replikation av virusgenom), - Sammansättning av viruspartiklar (ihopsättning), - Mognad, - Utsöndring/lys alt. utknoppning/budding av viruspartiklar. (minst 6 steg ger full poäng) 7 Varför är det nödvändigt för alla virus med negativa RNA-genom att viruspartikeln innehåller ett RNA-beroende RNA-polymeras? Varför gäller detta ej virus med RNA-genom av positiv polaritet? Detta enzym finns ej i värdcellen; genomet hos positiva RNA virus kan fungera direkt som mrna i värdcellen. 8 Ange två faktorer som bestämmer celltropismen för ett specifikt virus. a) Närvaron av virusreceptor på cellens yta, b) Virus förmåga att använda cellulära mekanismer för replikation av nukleinsyra och proteinsyntes. 9 Vad är CPE? Orsakar alla virus CPE? 1 Cytopatogen effekt. Nej, många (långsamväxande) virus orsakar ej CPE 10 Picornavirus uppvisar stor genomisk variation medan Epstein-Barr virus varierar förhållandevis lite. Vad beror denna fundamentala skillnad mellan RNA-virus och DNA-virus på? Replikation av RNA virusgenomet är beroende av enzymet RNA-beroende polymeras, som är ett slarvigt enzym och gör misstag. 11 Ange minst fyra olika smittvägar som virus använder för att etablera en infektion hos människan. 1 Hud, andningsvägar, mag/tarmkanalen, blod, vektorer
1 Två cellulära funktioner som är kritiska för tumörutveckling påverkas av cancerassocierade virus. Vilka är dessa två funktioner? Ange minst två virus som påverkar dessa funktioner. a) cellproliferation, b) apoptos. EBV, HPV, HHV8, HBV, HCV 1 Det konstitutiva (innate) och det adaptiva försvarets komponenter samverkar ofta. Illustrera detta påstående genom att ange något som a) en konstitutiv cell kan göra för att initiera eller förstärka en aktivitet hos någon typ av adaptiv cell, samt b) en adaptiv cell kan göra för att initiera eller förstärka en aktivitet som en konstitutiv cell kan göra. Svara kort, men så specifikt som möjligt, genom att ange namn på de celler och molekyler/molekylgrupper som används. a) Makrofager/dendritiska celler kan presentera antigen med sina MHC molekyler och på så sätt aktivera T-celler till proliferation. Makrofager/dendritiska celler kan presentera antigen med sina MHC molekyler och på så sätt aktivera T-celler till proliferation b) B-celler kan utsöndra antikroppar som genom opsonisering hjälper makrofager att fagocytera mer effektivt. T-celler kan utsöndra cytokiner som påverkar makrofager att mer effektivt oskaddliggöra fagocyterade mikroorganismer 14 Vilken är den dominerande typen av isotyp på antikroppar i slemhinnorna? Vilken effektorfunktion använder denna antikropp huvudsakligen för att oskadliggöra mikroorganismer? IgA. Neutralisation. 15 Definiera en plasmid samt ge exempel på egenskaper som kan kodas av sådana. Plasmider är en oftast ringsluten DNA-molekyl som replikeras oberoende av bakteriens kromosom. Den finns som regel i flera kopior per cell och kodar bl.a. för antibiotikaresistens samt olika virulensfaktorer. Plasmider innehåller definitionsmässigt inga essentiella gener, house keeping genes.
16 Hos gramnegativa bakterier kan det förekomma tre olika typer av extracellulära polysackarider i form av lipopolysackarid (LPS=endotoxin), kapsel respektive slime. Beskriv väsentliga egenskaper och funktion hos dessa. LPS är förankrad i yttre membranet, känns igen av TLR på makrofager, dendritiska celler, m.fl. vilket leder till syntes av proinflammatoriska cytokiner (feber och chock). Kapseln är förankrad vid bakteriens cellvägg och har ofta en antifagocytär effekt. Slime är fri extracellulär polysackarid som håller samman bakterierna i s.k. biofilm. 17 Nämn 4 olika strategier/metoder som bakterier har utvecklat för att undgå att bli fagocyterade av neutrofila granulocyter. 4 Bilda kapselsubstans som ej binder komplement eller andra opsoniner. Maskering med med kroppsegna molekyler gör att naturliga opsoniner ej kan fastna. Bilda enzymer som bryter ner opsonin eller kemotaxiner (ex c5a-peptidas). Binda komplementinhibitorer till sin yta och därmed förhindra komplementaktvering och opsonisering. Bilda toxiner (t.ex. leukocidin) som dödar neutrofiler. Bilda toxin som paralyserar neutrofilerna (adenylatcyklas från B. pertussis ) 18 Lysosym är en viktig faktor i det konstitutiva immunförsvaret mot bakterier. Lysozym klyver β1-4-glykosidiska bindningar mellan N-acetyl-muraminsyra och N-acetyl-glukosamin. Vad kallas den bakteriella substans som bryts ner av lysozym? Förklara varför gramnegativa bakterier som regel är okänsliga för lysozym Det yttre membranet hos Gramnegativa bakterier förhindrar lysozym från att nå peptidoglykanet, vilket bryts ner av lysozym. 19 Flera bakteriella organeller som projicerar sig på bakteriens yta är förankrade i cytoplasmamembranet. Nämn två sådana funktionellt olika organeller samt beskriv kortfattat deras funktion. Fimrier/pili som förmedlar adhesion till eukaryota celler. F-pili som förmedlar adhesion till andra bakterier och krävs för konjugation. Flageller som är rörelseorgan. Typ--sekretionssystem som används för injektion av proteiner/toxiner i eukaryota celler 0 Beskriv kortfattat strukturen och funktionen hos s.k. insertionssekvenser (IS-element). IS-element kan integrera på olika ställen (hoppande gen) i bakteriens genom. Består av DNA-fragment som kodar för enzym (transposas) som krävs för integrering och utklippning av IS. ISelementet flankeras av korta inverterade DNA-sekvenser.(För poäng krävs hoppande gen plus transposas(alt. enzym) och/eller inverterade DNA-sekvenser).
1 Beskriv kortfattat tre olika mekanismer för antibiotikaresistens hos bakterier (inte gener, utan hur det fungerar). 1) Produktion av nedbrytande/modifierande enzymer ) Förändring av målmolekyl ) Uttransport av antibiotikat ur cellen 4) Stoppat upptag av antibiotikat in i cellen 5) Förändrad metabolism