2014-03-28 Please note: changes may occur Schedule: Conservation biology 15 hp, VT 2014 Kursen arrangeras av Zoologiska institutionen, Stockholms universitet The course is arranged by the Department of Zoology, Stockholm University This course will be taught partly in English and partly in Swedish Teachers, Conservation at the levels of genes and populations Linda Laikre (LL), course leader and director D453, tel 16 42 83, linda.laikre@popgen.su.se Chris Wheat () D551, tel: 16 40 20 chris.wheat@zoologi.su.se Jason Hill (JH) jason.hill@zoologi.su.se Peter Pruisscher (PP) D544, tel 08-16 40 47, peter.pruisscher@zoologi.su.se Alyssa Woronik (AW) D548, tel 08-16 40 52, alyssa.woronik@zoologi.su.se Naomi Keehnen (NK) D525, tel 08-16 40 58, naomi.keehnen@zoologi.su.se Anastasia Andersson (AE) D447, tel 16 42 79, anastasia.andersson@zoologi.su.se Lovisa Wennerström (LW) D447, tel 16 42 79, lovisa.wennerstrom@zoologi.su.se Sandra Jönsson (SJ) sajo8208@student.su.se Lärare, bevarande på art- och ekosystemnivå: Tomas Meijer (TM) - kursledare tomas.meijer@zoologi.su.se Studiebesök: Kolmården Svenska Jägareförbundet, Öster Malma Tarby gård, Vallentuna Lecture rooms Lectures D502 Computer lab D334 Webpage: Self studies: Course structure Literature, part 1: www.popgen.su.se/bevbio The course requires reading and self-directed learning outside scheduled course activities. The course consists of two parts: 1. Conservation at gene and population levels 7.5 ECTS 2. Conservation at species and ecosystem levels 7.5 ECTS Frankham, R., Ballou, J.D., Briscoe, D.A.2004. A primer of conservation genetics. Cambridge University Press. Literature, part 2: Articles that will be distributed during the course.
1. Week 13 - Conservation at gene and population levels/bevarande på gen- och populationsnivå 2014-03-24 Monday 13 00-14 30 Introduction to the course, population genetics quiz LL 2014-03-25 Tuesday 10 00-12 00 Lecture: Introducing conservation biology and conservation genetics 15:30-16:30 Master thesis presentation: "TBA." TBA Room: D502 Christopher Wheat & Jason Hill 2014-03-26 Wednesday 10 00-12 00 Lecture: Genetic Diversity I 15 30-17 00 BIG seminar: Biologer i samhället 2014-03-27 Thursday 13 00-15 00 Literature review project I. Separate write up on one of a possible three different subjects. Leaders: Alyssa and Naomi, planning material and presentation. 2014-03-28 Friday 10 00-12 00 Lecture: Genetic consequences of small populations Peter Pruisscher 13 00-15 00 Computer simulation workshop: Genetic drift I Jason Hill Vecka 14 - Conservation at gene and population levels/bevarande på gen- och populationsnivå 2013-03-31 Monday Morning Time for reading and catching up. 13 00-15 00 Computer simulation workshop: Genetic drift II Jason Hill 2013-04-01 Tuesday 10 00-12 00 Lecture: Evolutionary Genetics I 13 00-15 00 Research presentation: "Mammoths and their extinction: what can we learn"& student projects planning Room: E314 2013-04-02 Wednesday 10 00-12 00 Lecture: Resolving taxonomic uncertainties 13 00-16 00 Research presentation: "A population genomics study of butterfly flight in a metapopulation" Alyssa Woronik Love Dalen Naomi Keehnen 2013-04-03 Thursday 10 00-12 00 Lecture: Evolutionary Genetics II 13 00-16 00 Workshop on conservation planning: choosing the PP topic, groups, and starting research. 2013-04-04 Friday 10 00-12 00 Lecture: Molecular genetics in forensics 13 00-15 00 Literature review project II. Checking in on progress. JH AW & NK
2. Vecka 15 - Conservation at gene and population levels/bevarande på gen- och populationsnivå 2014-04-07 Monday 10 00-12 00 Lecture: Population genomics 13 00-14 00 Seminar: Ecological genomics of plant adaptation. Lilla Frescati Room 540 14 00-17 00 Workshop on conservation planning: student presentations followed by debate. 2014-04-08 Tuesday 10 00-11 00 Lecture: Molecular tools to model species movements. 11 00-12 00 Lecture: Genetic diversity II John Stinchcombe, University of Toronto, Canada all Aaron Shafer 13 00-16 00 Master thesis presentations: "NK presentaiton on crow speciation", "PP on flycatcher", "Estimating population size of Leapords by CH", Luke presentation. Room: E314 2014-04-09 Onsdag 13 00-15 00 Lecture: Inbreeding, inbreeding depression, effective LL population size, pedigree-analysis & conservation breeding 15 30-17 00 BIG-seminarium: Biologer i samhället 2014-04-10 Torsdag 10 00-12 15 Lecture: Pedigree-analysis & conservation breeding, cont. 13 00-16 00 Computer lab: pedigree analysis LW, AA LL 2014-04-11 Fredag 9 30-12 00 Excercise: The case of the Swedish wolf population 13 00-14 30 MSc thesis presentation: Temporal change in genetic Georgios Xenikoudakis structure in the Scandinavian brown bear Vecka 16 - Påsklov - Easter vacation Vecka 17 - Bevarande på gen- och populationsnivå 14 30-16 00 Conservation in Costa Rica Ev 2014-04-21 Monday Public holiday 2014-04-22 Tuesday 11 00-12 00 Föreläsning: Praktiskt arbete med bevarande av hotade djur i djurpark I 13 00-14 00 Föreläsning: Praktiskt arbete med bevarande av hotade djur i djurpark II 14 00-15 30 MSc thesis presentation: Changes in genetic variation and structure in the Swedish otter population over the last 100 years 2014-04-23 Wednesday Studiebesök på Kolmården - praktiskt bevarande av hotade djur i djurpark Sandra Jönsson Sandra Jönsson Victor Blennow Sandra Jönsson och Mats Amundin 2014-04-24 Thursday Tema: bevarande av hotade lantraser 13 00-14 00 Föreläsning: Bevarande av hotade lantraser - Anders Lekander internationell och nationell policy, myndighetsarbete och praktiskt bevarande 14 15-15 00 Föreläsning: Case-study Gotlandskanin - genetiskt bevarande och kartläggning av beteendevariation 15 15-16 15 Föreläsning: Praktiskt bevarande av gotlandsstövaren och andra nationella hundraser LW, AA Anders Lekander
3. 2014-04-25 Friday 10 00-14 00 Case study: Conservation genetics of the Swedish wolf population Vecka 18 - Bevarande på gen- och populationsnivå 2014-04-28 Monday Inläsning/Exam preparations 2014-04-29 Tuesday 9 00-12 00 Written exam - Conservation at the levels of genes and populations LL & coworkers 15 00-17 00 Licentiate seminar: Personality and its effect on survival in captive-born European mink following release into the wild. Marianne Haage 2014-04-30 Wednesday Valborg 2014-05-01 Torsdag May 1 public holiday 2014-05-02 Fredag Inläsning: två bevarandebiologiska fallstudier Vecka 19 - Bevarande på art- och ekosystemnivå 2014-05-05 Måndag 9 30-12 00 Föreläsning: Introduktion bevarandebiologi i samhället TM 13 00-15 00 Inläsning: bevarandebiologiska fallstudier 2014-05-06 Tisdag 930-1100 Föreläsning: Bevarandeekologi hos däggdjur TM 1100-1200 Diskussion: Fallstudier 13 00-16 00 Re-examination/Omtenta Bevarandegenetik KT/PG 2014-05-07 Onsdag 9 30-12 00 Föreläsning: Viltdjukdomar TM Föreläsning: Jakt- hur fungerar det i praktiken? TM em Inläsning: fallstudier gällande viltsjukdommar 15 30-17 00 BIG seminar: Biologer i samhället 2014-05-08 Torsdag 9 30-12 00 Föreläsning: Bevarande i praktiken samt diskussion TM 13 00-16 00 Grupparbete om förvaltning av svenska rovdjur 2014-05-09 Fredag 9 30-12 00 Grupparbete om förvaltning av svenska rovdjur 13 00-16 00 Grupparbete om förvaltning av svenska rovdjur Vecka 20 - Bevarande på art- och ekosystemnivå 2014-05-12 Måndag 9 30-12 00 Grupparbete om förvaltning av svenska rovdjur 13 00-15 00 Grupparbete om förvaltning av svenska rovdjur 1500- Inlämning av skriftlig redovisning på mondo 2014-05-13 Tisdag 930-1600 Redovisning samt diskussion: förvaltning av svenska rovdjur
4. 2014-05-14 Onsdag 9 30-12 00 Föreläsning: Jord och skogsbruk samt lantraser em Eget arbete: vad ska vi bevara? Skriva PM 2014-05-15 Torsdag Heldag Studiebesök/Fältdag 2014-05-16 Fredag INLÄSNING Vecka 21 - Bevarande på art- och ekosystemnivå 2014-05-19 Måndag INLÄSNING 2014-05-20 Tisdag 9 00-14 00 Skrivning Bevarandeekologi och bevarandebiologi Rum: E314 2014-05-21 Onsdag Studiebesök/Fältdag 2014-05-22 Torsdag Eget arbete- Åtgärdsprogramm 2014-05-23 Fredag Eget arbete- Åtgärdsprogramm Vecka 22 - Bevarande på art- och ekosystemnivå 2014-05-26 Måndag Eget arbete- Åtgärdsprogramm 2014-05-27 Tisdag 1400 Inlämning: Eget arbete- Åtgärdsprogramm 2014-05-28 Onsdag Redovisning-opposition av projektarbete åtgärdsprogramm 2014-05-29 Torsdag Kristi himmelfärd 2014-05-30 Fredag Kristi himmelfärd Vecka 23 - Bevarande på art- och ekosystemnivå 2014-06-02 Måndag 2014-06-03 Tisdag Heldag Studiebesök/Fältdag 2014-06-04 Onsdag Dugga på fältmoment 2014-06-05 Torsdag Omtenta 2014-06-06 Fredag Public holiday