Schema: Bevarandebiologi 15 hp, VT 2012 Kursen arrangeras av Avdelningen för populationsgenetik, Zoologiska institutionen, Stockholms universitet

Transkript

1 OBS: Ändringar kan bli aktuella Schema: Bevarandebiologi 15 hp, VT 2012 Kursen arrangeras av Avdelningen för populationsgenetik, Zoologiska institutionen, Stockholms universitet Johan Charlier (JC) - kursledare Linda Laikre () - kursansvarig Lovisa Wennerström (LW) Anna Palmé (AP) Mija Jansson (MJ) Peter Guban (PG) Anastasia Eklund (AE) Karin Norén (KN) Bodil Elmhagen (BE) Sven Jakobsson (SJ) Peter Hambäck (PH) Helena Larsdotter Mellström (HLM) rum F518, tel , johan.charlier@zoologi.su.se rum F520, tel , linda.laikre@popgen.su.se rum F511b, tel , lovisa.wennerstrom@zoologi.su.se rum F518, tel , anna.palme@popgen.su.se rum F511a, tel , mija.jansson@zoologi.su.se rum F509, peter.g.99@gmail.com rum F509, saphierwolf@hotmail.com karin.noren@zoologi.su.se bodil.elmhagen@zoologi.su.se sven.jakobsson@zoologi.su.se peter.hamback@botan.su.se helena.mellstrom@zoologi.su.se Gästföreläsare: Studiebesök: Ann Dahlerus, Svenska Rovdjursföreningen Thord Fransson, Naturhistoriska riksmuseet Mats Amundin, Kolmårdens djurpark Anders Lekander, Lantrasforum Helena Olsson, Djurparkschef, Parken Zoo, Eskilstuna Jennie Westander, Forskningschef, Parken Zoo, Eskilstuna Sandra Jönsson, Zoolärare, Kolmårdens djurpark Parken Zoo, Eskilstuna SLU - Sötvattenslaboratoriet, Drottningholm Lokaler: Föreläsningar D508 Datorlaborationer D334 Hemsida: Självstudier: Litteratur: Kursen förutsätter självstudier på icke-schemalagd tid Primack, R.B A primer of conservation biology. Sinauer Associates, Inc. Publishers Frankham, R., Ballou, J.D., Briscoe, D.A A primer of conservation genetics. Cambridge University Press. Båda böckerna går att köpa på Akademibokhandeln, Frescati. Litteraturhänvisningar: Obs - hänvisningarna är ungefärliga. Föreläsningarnas kronologi följer inte nödvändigtvis böckernas. Böckerna är ett viktigt komplement till föreläsningarna. Böckerna ger fördjupning och bredd inom vissa områden som vi inte kommer att hinna behandla så utförligt på kursen.

2 1. Vecka Måndag Introduktion av kursen JC Föreläsning: Introduktion till bevarandebiologi och bevarandegenetik Datorlab 1: Deterministiska processer som styr populationers genetiska sammansättning JC/AE Litteratur: Primack kap. 1: 1-15, 34-54, 2, Frankham et al. kap Tisdag Föreläsning: Genomgång Datorlab 1 JC Föreläsning: Bevarandebiologi, bevarandegenetik, forts Datorlab 2: Stokastiska processers betydelse JC/PG Litteratur: Frankham et al. kap. 2, 1-21, kap Onsdag Inläsning, Räkneövningar, BIG-information fr BÄR eftermiddag, sal E Studentinflytande Jobb efter examen Rebecka Salamon redovisar sitt exjobb, "Spatial genetic structure of the Swedish moose", Frescati backe sal 107 Litteratur: Frankham et al. kap. 2, 1-21, kap Torsdag Föreläsning: Populations- och bevarandegenetik, forts Föreläsning: Genomgång av datorlab 2 JC Genomgång: Problemlösning 1 JC Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 52-59, Fredag Föreläsning: Molekylära metoder JC Datorlab 3: Populationssystem JC/PG Föreläsning: Populationsstruktur, små populationers genetik, pedigree-analys Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 63-75, kap 6 Vecka Måndag Föreläsning: Genomgång datorlab 3 JC Genomgång: Problemlösning 2 JC em Räkneövningar - självständigt arbete Litteratur: Frankham et al. kap 4 sid 59-65, kap 5

3 Tisdag Inläsning, Räkneövningar Seminarium, Kjell Danell, "Efforts to exterminate the large predators - our last war?", sal D Onsdag Föreläsning: Effektiv populationsstorlek. Avel av hotade djur Datorlab 4: Pedigree-analys MJ/LW Litteratur: Frankham et al. kap 5, Torsdag Föreläsning: Genomgång av datorlab 4 LW Föreläsning: Pedigree-analys för bevarande av hotade lantraser LW/MJ Gästföreläsning: Bevarande av hotade husdjursraser Fredag Grupp 1: Laboration: start av proteinelektrofores Grupp 1: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data Föreläsning: Statistisk analys av molekylärgenetisk data, tolkning av labresultat Grupp 1: Laboration: proteinelektrofores, forts Litteratur: Labhandledning Vecka Måndag Inläsning, Räkneövningar Tisdag Grupp 2: Laboration: start av proteinelektrofores Grupp 3: Laboration: start av proteinelektrofores Grupp 2: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data Grupp 2: Laboration: proteinelektrofores, forts Grupp 3: Datorlaboration 5: analys av populationsgenetiska data Grupp 3: Laboration: proteinelektrofores, forts. Litteratur: Labhandledning Anders Lekander KT/PG AE/JC JC KT/PG AE + LW el. PG AE + LW el. PG

4 Onsdag Studiebesök: Sötvattenslaboratoriet Torsdag Egen analys av labresultat. Skriftlig redovisning lämnas/mailas till JC senast måndag 16 april kl Fredag Långfredagen Vecka 15 PÅSKLOV Vecka Måndag Egen analys av labresultat. Skriftlig redovisning lämnas/mailas till JC senast måndag 16 april kl Litteratur: Frankham et al. kap 1: 22-28, kap Tisdag Föreläsning: Moderna djurparker, organisationer och bevarandearbete Föreläsning: Svenska djurparkers bidrag till bevarande av kattdjur Genomgång: Problemlösning 3 LW Seminarium, Hans Ellegren, "The genomics of species divergence in flycatchers", sal D Onsdag Föreläsning: Sårbarhetsanalys med Vortex JC Sandra Jönsson Sandra Jönsson em Datorlab 6: Sårbarhetsanalys med Vortex Litteratur: Frankham et al. kap 5, sid JC/AE Torsdag Datorlab 6, forts.: Sårbarhetsanalys med Vortex Genomgång: Problemlösning 4 LW Presentation av projektarbeten JC JC/AE Fredag Vargtema Föreläsning: Den svenska vargstammen el. MJ Föreläsning: Djurparkernas roll Mats Amundin Föreläsning: Rovdjurens roll i ekosystemet SJ Föreläsning: Bevarande av varg i Sverige Ann Dahlerus Vecka Måndag Datorlab 6, forts.: Sårbarhetsanalys med Vortex Lämna in protokoll, datorlab 6: senast Litteratur: Frankham et al. kap 5, sid JC/AE

5 Tisdag INLÄSNING Onsdag INLÄSNING Torsdag INLÄSNING Fredag Skrivning Bevarandegenetik och bevarandebiologi KT/PG/AE mfl Vecka Måndag Valborg Tisdag Första maj Onsdag Föreläsning: Introduktion till bevarandeekologi KN em Inläsning: två bevarandebiologiska fallstudier Litteratur: Fallstudier + Primack kap , 54-49, kap 2, Torsdag Föreläsning: Bevarandeekologi hos fisk SJ Föreläsning: Bevarande av marina däggdjur Christina Geijer Fredag Föreläsning: Bevarande av ängs- och hagmarker Diskussion om de två inlästa bevarandebiologiska fallstudierna Litteratur: Primack kap , kap 4-5 Vecka Måndag Föreläsning: Bevarandeekologi hos insekter HLM AP KN Diskussion: Etik och bevarande KN Litteratur: Primack kap Tisdag Studiebesök: Parken Zoo, Eskilstuna: praktiskt bevarandearbete i djurparksvärlden Helena Olsson, Jennie Westander Onsdag Föreläsning: Bevarandeekologi hos däggdjur BE em Grupparbete om utdelade artiklar Litteratur: Primack kap Torsdag Grupparbete om utdelade artiklar Grupparbete om utdelade artiklar Litteratur: Primack kap , kap 4-5

6 Fredag Föreläsning: Bevarandeekologi hos växter PH Litteraturseminarie Litteratur: Primack kap 4-5 Vecka Måndag Redovisning av grupparbete KN em Inläsning/projektarbete Tisdag Föreläsning: Bevarandeekologi hos fåglar Thord Fransson em Inläsning/projektarbete Onsdag Exkursion till Tyresta / Naturum KN Torsdag Kristi himmelfärds dag Fredag INLÄSNING Vecka Måndag INLÄSNING Tisdag Skrivning Bevarandeekologi och bevarandebiologi Onsdag Projektarbete Torsdag Projektarbete Fredag Projektarbete Vecka Måndag Projektarbete Tisdag Inlämning av projektarbete Onsdag Förberedelse opposition/redovisning Torsdag Redovisning KN/JC mfl Fredag Redovisning KN/JC mfl.