Bill Ericsson beskrev och illustrerade
|
|
- Carina Larsson
- för 8 år sedan
- Visningar:
Transkript
1 Knisanycklarna härstammar från mossnycklar De avvikande nyckelblomster som förgyller Knisa mosse på norra Öland har kallats för både mossnycklar och sumpnycklar. Utrustade med den allra modernaste molekylära tekniken har nu tre lundaforskare tagit sig an problemet. MIKAEL HEDRÉN, SOFIE NORDSTRÖM & DAVID STÅHLBERG Bill Ericsson beskrev och illustrerade 1982 en population av hybridnycklar Dactylorhiza majalis s.l. (sensu lato, i vid mening) från Knisa mosse på Öland som han uppfattade som mossnycklar D. majalis ssp. sphagnicola (Ericsson 1982). Orkidén har även behandlats i Sterner (1986) och Mossberg & Lundqvist (1994) (figur 1). Populationen studerades senare av Per Bjurulf (Bjurulf 2005a, b), som emellertid med ledning av stödbladskantens utseende och vilka följeväxter som förekommer på lokalen drog slutsatsen att populationen inte kunde föras till mossnycklar utan snarare till sumpnycklar D. majalis ssp. traunsteineri. Vi har sedan några år tillbaka arbetat med molekylära markörer för att kunna beskriva släktskap och evolution inom orkidésläktet handnycklar Dactylorhiza. Inom ramen för detta arbete har vi nu studerat många populationer av såväl mossnycklar som sumpnycklar från olika delar av Skandinavien. I den här uppsatsen analyserar vi material från Knisa mosse och jämför det med ett urval av det material som vi tidigare har undersökt. För förklaring av begrepp och taxonomi som används hänvisas till Hedrén (2005) och till rutan på nästa sida. Hybridnycklar Dactylorhiza majalis s.l. omfattar ett flertal allotetraploida former som uppkommit från hybrider mellan ängsnycklar i vid mening D. incarnata s.l. och Jungfru Marie nycklar i vid mening D. maculata s.l. (inkl. skogsnycklar D. maculata ssp. fuchsii), eller nu utdöda former som har tillhört dessa två utvecklingslinjer, men som kan ha sett något annorlunda ut än dagens representanter. Mossnycklar och sumpnycklar är sådana hybridnycklar som har uppkommit oberoende av varandra, vilket återspeglas i deras molekylära karaktärer. Andra exempel på hybridnycklar är majnycklar D. majalis ssp. majalis, strandnycklar D. majalis ssp. purpurella, och baltnycklar D. majalis ssp. baltica (Hedrén 2005). Mossnycklar tycks ha uppkommit ur en hybrid som haft ängsnycklar som pollenförälder och en västeuropeisk form av Jungfru Marie nycklar i snäv mening (D. maculata ssp. maculata; jämför Ståhlberg 2007) som fröförälder (Hedrén 2003, Pillon m.fl. 2007). Sumpnycklar kan ha haft flera ursprung, och då snarast med fröföräldrar som liknat skogsnycklar (Hedrén m.fl. 2008). Vi har två syften med den här uppsatsen. Det första är att härleda ursprunget till den allotetraploida populationen på Knisa mosse, i det följande kallade knisanycklar. Dels undersöker vi om knisanycklarna tillhör mossnycklar eller sumpnycklar, dels undersöker vi om knisanycklarna kan ha uppkommit oberoende av någon av dessa. I det senare fallet kan de ha utvecklats ur lokala former av föräldralinjerna, eller också kan de ha utvecklats ur någon redan existerande form av hybridnycklar som förändrats till följd av hybridisering eller lokal differentiering. För att kunna skilja mellan dessa hypoteser har vi undersökt karaktärer från både plastidgenomet (som nedärvs från fröföräldern hos orkidéer) och det nukleära genomet (som nedärvs från både pollen- och fröföräldern). Det andra syftet är att mer allmänt illustrera vad som krävs för att kunna besvara en så pass alldaglig fråga som vilken art en viss population inom ett artkomplex kan tänkas tillhöra. 24 SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009)
2 KNISANYCKLAR Metodik Knisa mosse är belägen i Persnäs socken på norra Öland. Knisanycklar växer där tillsammans med ängsnycklar på den öppna myren och nära skogsnycklar som förekommer på fastmark i kanten av myren. Några exemplar av Jungfru Marie nycklar i snäv mening kunde inte påträffas i området. Tjugoen individ av handnycklar studerades från Knisa mosse. Tretton av dessa bedömdes som rena knisanycklar, fyra som eventuellt påverkade av hybridisering med ängsnycklar, tre som skogsnycklar och en som otvetydig hybrid mellan knisanycklar och skogsnycklar. Den senare växte på den öppna myren tillsammans med knisanycklar. Som referensmaterial av sumpnycklar gjordes ett urval av data från fem tidigare undersökta lokaler i södra Sverige: Rågöl nära Eksjö, Jättened strax norr om Falköping, Kärna mosse nära Linköping, Harudden på norra Gotland, samt Vedborms träsk på norra Öland (enda lokalen på Öland som ännu hyser några typiska sumpnycklar). Som referensmaterial av mossnycklar valde vi en population från sydvästra Småland, Gölsjö mosse, samt tre populationer från östra Småland, Jonsbo fly, Sjömaden och Berghem (tabell 1). Eftersom knisanycklar växer tillsammans med skogsnycklar på Knisa mosse och kanske kan ha uppkommit genom lokal hybridisering mellan denna och ängsnycklar redovisar vi även några referenspopulationer av skogsnycklar från Öland. En population, Knisa, samlades från en igenväxande hagmark strax öster om Knisa by, medan tre populationer, Kåtorp, Torp och Tveta, samlades på södra delen av ön nära Färjestaden. Jungfru Marie nycklar i snäv mening har inte påträffats på Knisa mosse och vi har därför inget skäl att tro att denna vore direkt inblandad om knisanycklar hade uppkommit lokalt. Vi har emellertid god kunskap om variationen inom Jungfru Marie nycklar sedan tidigare (Ståhlberg 2007) och kommer att referera till dessa studier i diskussionen. Vi redovisar inte heller data från något material av ängsnycklar i den här uppsatsen. Detta motiveras dels av att vi redan vet att plastid- Figur 1. Bo Mossbergs tolkning av nycklarna på Knisa mosse. Ur Mossberg & Lundqvist (1994). The enigmatic marsh orchid on Knisa mosse, northern Öland. SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009) 25
3 HEDRÉN m.fl. Ordförklaringar allel (pl. alleler) här: en viss variant av ett givet utsnitt av genomet. amplifiera att förmera ett givet DNA-fragment (vanligen genom PCR). cykel här: sluten ögla i ett haplotypnätverk där de haplotyper som ingår i cykeln kan ha uppkommit ur varandra på olika, men lika sannolika sätt. Exempel: I det haplotypnätverk som återges i den här artikeln (Fig. 2) utgör haplotyperna L, N, P, och Q en sådan cykel. Haplotyperna N och P hänger ihop med varandra genom en mellanliggande haplotyp som antingen är L eller Q. I det första fallet hänger Q ihop med antingen N eller P och i det senare fallet hänger L ihop med antingen N eller P. I exemplet sammanfattar alltså cykeln fyra alternativa haplotypträd som är lika långa. fixerad för en grupp individ, t.ex. en viss population, som av något skäl har förlorat alla andra alleler än den enda kvarvarande (alternativt alla andra karaktärsstadier än det enda kvarvarande). Alla individ i gruppen kommer därmed att vara lika med avseende på denna allel (detta karaktärsstadium). genom (uttalas jenå'm ) genmaterialet i en cell; kärnans och de olika cellorganellernas genom kan särskiljas som det nukleära genomet, mitokondriegenomet och plastidgenomet. genotyp här: en given kombination av alleler vid de loci som studerats. haplotyp här: en given kombination av alleler i enkelt genom, t.ex. plastidgenomet. (Eftersom plastidgenomet nedärvs från fröföräldern hos orkidéer, finns endast en variant av genomet i ett enskilt individ. Varje gen förekommer därmed i enkel uppsättning och man betecknar genomet som ett haploitt genom, därav benämningen. Det nukleära genomet hos ett enskilt individ är däremot sammansatt av gener från bägge föräldrarna.) hypervariabelt locus ett locus som varierar starkt mellan olika individ, i vissa fall även mellan olika individ inom en population och som kan antas ha en hög mutationsfrekvens. icke ordnad karaktär en karaktär (locus) där ett visst karaktärsstadium (allel) kan förändras (mutera) till vilket annat karaktärsstadium som helst, utan att behöva gå över något mellanliggande stadium jämför ordnad karaktär. ITS internal transcribed spacers. Områden i kärnans DNA som är inbäddade i gener som kodar för ribosomalt DNA. Dessa gener finns i tusentals kopior i varje enskild cell. Arter som uppkommit genom hybridisering innehåller till en början alleler från bägge föräldraarterna, men kan med tiden komma att fixeras för alleler från endera föräldern. ITS är inte kodande områden, utan varierar ofta mellan närbesläktade arter och kan användas att spåra släktskap på låg taxonomisk nivå. Varianter av ITS kallas här ITS-alleler. Hos unga polyploider, som mossnycklar, speglar ITS bägge föräldraarterna. ITS-sekvens DNA-sekvens vid ITS. locus (pl. loci) här: ett specifikt område i genomet som studeras för längdvariation; olika längdvarianter vid ett locus betecknas alleler. längdvariation variation i längden av ett DNAutsnitt (locus) vid vilket olika individ jämförs. median-joining en metod som förbinder de funna haplotyperna i ett näverk där noderna är haplotyper och grenarna är hypotetiska mutationsvägar. Direkt förbundna haplotyper kan antas vara nära besläktade med varandra, medan haplotyper som förbinds av flera mellanliggande haplotyper är mer avlägset besläktade. medianvektor hypotetisk haplotyp med en viss förmodad kombination av karaktärsstadier vid olika loci. Sådana haplotyper medger att de funna haplotyperna som ingår i nätverket förbinds på bäst möjliga sätt. microsatellitlocus Ett locus där allelerna varierar i antal repeterade korta genavsnitt (genavsnitt som är upp till 6 baspar långa). nukleärt genom kärnans genom; se genom. ordnad karaktär en karaktär (locus) vid vilken olika möjliga stadier (alleler) kan ordnas i en given sekvens. Förändringar (mutationer) mellan ett stadium och ett annat anses därvid förlöpa över mellanliggande stadier. Exempel: om man i ett släkte där arterna har antingen små, mellanstora, eller stora blommor drar slutsatsen att arter med små blommor har uppkommit ur arter med stora blommor, måste förändringen ha skett via en art med mellanstora blommor. PCR polymeraskedjereaktionen (polymerase chain reaction), en molekylärbiologisk teknik att skapa många kopior av av givet utsnitt av genomet. PCR-produkt det DNA som förmeras genom PCR. plastid typ av cellorganeller som omfattar bl.a. kloroplaster. Plastiderna förekommer i ett stort antal kopior i varje cell och har sitt eget DNA. Plastiderna nedärvs från fröförälderna hos orkidéer och de flesta andra högre växter. Plastid-DNA kan därför användas för att spåra fröföräldern. plastid-dna det DNA som ingår i plastidens genom. plastidgenom plastidens genom. plastidhaplotyp en given kombination av alleler i plastidgenomet. plastidlocus här: ett specifikt område i plastidgenomet som studeras för längdvariation. principalkoordinatanalys en matematisk teknik som sammanfattar parvisa jämförelser sammanställda i en avståndstabell till ett mindre antal axlar där så stor del som möjligt av den totala variationen återspeglas. Vanligen redovisas variationen längs de två första axlarna som därvid kan återges i ett plan. restriktionslocus klippställe för restriktionsenzym. Ett restriktionsenzym är ett bakterieenzym som klipper sönder DNA-strängen vid specifika sekvenser om mellan fyra och sex baser. Om någon bas är annorlunda i sekvensen klipper inte enzymet. Vi har undersökt om enzymet klipper eller inte. 26 SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009)
4 KNISANYCKLAR Tabell 1. Lokaldata för alla populationer. Antal individ som undersökts för plastidhaplotyp respektive ITSalleler från varje lokal har angivits. Locality data. Numbers of individuals studied for plastid haplotype and ITS alleles, respectively, have been given. Antal undersökta individ Population Lokal Position Knisanycklar (Knisa mosse allotetraploid) Plastid- DNA ITS Knisa mosse, Öland N, O Mossnycklar D. majalis ssp. sphagnicola Sumpnycklar D. majalis ssp. traunsteineri Skogsnycklar D. maculata ssp. fuchsii Gölsjö mosse, Småland N, O 9 8 Sjömaden, Småland N, O Jonsbo fly, Småland N, O Berghem, Småland N, O Vedborms träsk, Öland N, O 2 1 Rågöl, Småland N, O 3 3 Jättened, Västergötland N, O Kärna mosse, Östergötland N, O Harudden, Gotland N, O Knisa mosse, Öland N, O 3 3 Knisa, Öland N, O Kåtorp, Öland N, O 6 6 Torp, Öland N, O Tveta, Öland N, O 3 0 sphagnicola ( incarnata?) Knisa mosse, Öland N, O 4 4 sphagnicola fuchsii Knisa mosse, Öland N, O 1 1 genomet hos hybridnycklar nästan undantagslöst nedärvs från Jungfru Marie nycklar i vid mening och dels av att ängsnycklar varierar mycket lite i de karaktärer vi studerat här. Vi har god kunskap även om ängsnycklar sedan tidigare (Hedrén, under arbete) och kan därför utan problem identifiera eventuella plastidhaplotyper eller ITS-alleler med ursprung från ängsnycklar. Totalt redovisas data för 145 individ. Samtliga analyserades för plastidhaplotyp, medan 140 undersöktes för ITS (tabell 1). Det material som samlades in bestod av några få blommor. Den mängd material som samlades bedömdes inte äventyra de undersökta individens långsiktiga överlevnad. Plastidgenomet undersöktes för tolv loci, elva loci med mikrosatellit- eller annan typ av längdvariation, och ett restriktionslocus. Variationen inom varje enskilt individ beskrivs av en haplotyp, som alltså är en given kombination av varianter över alla tolv loci. Varje individ kan bara innehålla en enda haplotyp. De haplotyper som påträffats i det material som beskrivs här har betecknats med versaler (se tabell 2). Det nukleära genomet undersöktes för längdvariation i ITS (internal transcibed spacers) och olika längdvarianter urskildes som alleler med samma beteckningar som i Pillon m.fl. (2007). ITS förekommer i tusentals kopior i kärnans DNA och ett enskilt individ kan alltså innehålla flera olika alleler samtidigt. De relativa mängderna av olika alleler kan sannolikt förändras ganska snabbt från generation till generation och olika individ inom en population innehåller ofta starkt varierande frekvenser av enskilda ITS-alleler. Vi har mätt de relativa mängderna SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009) 27
5 HEDRÉN m.fl. B C D H F G mv1 Knisanycklar Knisa mosse allotetraploid Mossnycklar D. majalis ssp. sphagnicola Sumpnycklar D. majalis ssp. traunsteineri Skogsnycklar D. maculata ssp. fuchsii (Öland) A E Knisanycklar skogsnycklar Knisanycklar ( ängsnycklar?) Q P O mv3 M N R K J I L Figur 2. Nätverk som visar släktskapet mellan de funna haplotyperna. Symbolernas storlek visar antalet individ som bär en viss haplotyp. Avståndet mellan haplotyperna är proportionellt mot antalet mutationer som skiljer dem. Sektorernas färger visar hos vilka taxa en viss haplotyp påträffats. mv markerar så kallade medianvektorer, hypotetiska knutpunkter i nätverket. Haplotype network based on Median Joining. The size of each symbol is proportional to the number of individuals carrying the particular haplotype and the distance between haplotypes is proportional to the number mutational steps. Colours denote different taxa, mv denote median vectors. mv2 S T av olika alleler från de PCR-produkter som bildades vid analysen. Släktskapet mellan olika plastidhaplotyper beskrevs genom median joining (Bandelt m.fl. 1999), en metod som kopplar samman alla haplotyper i ett nätverk (figur 2). Ett sådant nätverk har ingen evolutionär riktning och kan också innehålla cykler där haplotyperna kopplas samman i ringstrukturer som anger alternativa mutationsvägar. Haplotyper kan antingen uppträda ytterst på grenarna i nätverket, eller uppträda som länkar mellan andra haplotyper inne i nätverket. De senare kan uppfattas som föräldrahaplotyper som ännu lever kvar tillsammans med yngre haplotyper som de givit upphov till. Inne i nätverket finns också placerade några medianvektorer, vilka kan tolkas som hypotetiska haplotyper som visserligen inte påträffats under studien, men som kopplar samman olika delar av nätverket på enklast möjliga sätt. Vid analysen betraktade vi varje plastidlocus som en ordnad karaktär där längdvarianter som följer direkt efter varandra i storlek är nära besläktade, medan längdvarianter som åtskiljs av andra längdvarianter är mer avlägset besläktade. Vi har också beskrivit hur allotetraploida populationer som helhet differentierats i såväl ITS som i plastid-dna. För ITS räknade vi först ut det genetiska avståndet (Rogers 1972) mellan alla par av populationer baserat på ITSfrekvenserna. Detta resulterade i en avståndstabell som i sin tur användes i en principalkoordinatanalys (PCA). I en sådan söker man sammanfatta en så stor del som möjligt av variationen längs några få axlar, och vi har valt att visa de två första axlarna (figur 4b). 28 SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009)
6 KNISANYCKLAR Figur 3. Frekvensen av sex ITS-alleler i alla undersökta populationer. Relative frequencies of six ITS alleles in all studied populations. Knisanycklar Knisa mosse allotetraploid Knisanycklar (x incarnata?) sphagnicola, Gölsjö mosse sphagnicola, Sjömaden sphagnicola, Jonsbo fly sphagnicola, Berghem traunsteineri, Vedborms träsk traunsteineri, Rågöl traunsteineri, Jättened traunsteineri, Kärna mosse traunsteineri, Harudden fuchsii, Knisa mosse fuchsii, Knisa fuchsii, Kåtorp fuchsii, Torp Knisanycklar x fuchsii I III V VI X XI För plastidhaplotyperna räknade vi först ut medelantalet skillnader mellan haplotyperna i varje par av populationer och sammanställde dessa parvisa skillnader i en avståndstabell. Här betraktade vi varje locus som en icke ordnad karaktär och beaktade enbart andelen loci där haplotyperna skilde sig åt. Därefter gjorde vi en principalkoordinatanalys på samma sätt som för ITS-datat (figur 4a). Resultat Tjugo haplotyper kunde urskiljas i det undersökta materialet (tabell 2). Knisanycklar var fixerad för haplotyp M, som också påträffades i misstänkta hybrider med ängsnycklar samt i den enda undersökta hybriden med skogsnycklar på Knisa mosse. Haplotyp M förekom också som dominerande eller ensam haplotyp i samtliga undersökta populationer av mossnycklar, men inte i någon population av sumpnycklar eller skogsnycklar. Haplotyper besläktade med M (figur 2) påträffades dock i andra populationer av mossnycklar och i skogsnycklar. I sumpnycklar förekom helt andra haplotyper. Vissa av dessa fanns även hos skogsnycklar. Vid ITS hittades sex alleler (tabell 2, figur 3). Fyra var relativt vanliga sett över hela materialet. ITS-I påträffades huvudsakligen i knisanycklar, i de misstänkta hybriderna med ängsnycklar, i hybriden med skogsnycklar, samt i alla populationer av mossnycklar. Därutöver påträffades den i ytterst låg frekvens i sumpnycklar från Rågöl och i en av populationerna av skogsnycklar. ITS-III påträffades i samtliga populationer av alla taxa i måttlig till hög frekvens. ITS-V förekom i hög frekvens i samtliga populationer av skogsnycklar, i måttlig till relativt hög frekvens i sumpnycklar, i låg frekvens i hybriden mellan knisanycklar och i skogsnycklar, men däremot inte alls i rena knisanycklar, i misstänkta hybrider med ängsnycklar eller i mossnycklar. ITS-X förekom i relativ hög till hög frekvens i knisanycklar, i de misstänkta hybriderna med ängsnycklar, i samtliga populationer av mossnycklar och i populationen av sumpnycklar från Rågöl. Allelen var emellertid sällsynt eller förekom inte alls i resterande populationer av sumpnycklar eller i skogsnycklar. De två sällsynta allelerna påträffades i låg frekvens i en population vardera, ITS-VI i mossnycklar från Jonsbo fly och allel ITS-XI i sumpnycklar från Harudden. Den ordination som baserades på allelfrekvenser av ITS visas i figur 4a. Populationerna av sumpnycklar är väl samlade till vänster, med undantag för populationen från Rågöl som återfinns långt ner. Populationerna av mossnycklar hamnar alla långt till höger, men är utspridda längs axel 2. Knisapopulationen befinner sig till- SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009) 29
7 HEDRÉN m.fl. Tabell 2. Haplotypfördelning och ITS-allelfrekvenser i det undersökta materialet. För varje haplotyp och population har angivits antal individ som har haplotypen i fråga. Under ITS-alleler har angivits medelfrekvens av varje allel uttryckt i procent. Plastid haplotype distribution and ITS allele frequencies in the investigated material. For each haplotype and population, numbers of individuals carrying the particular haplotype is reported. ITS allele frequencies are reported as mean population values given in per cent. Taxon Lokal Haplotyp ITS-alleler (%) Knisanycklar [Knisa mosse allotetraploid] Mossnycklar D. majalis ssp. sphagnicola Sumpnycklar D. majalis ssp. traunsteineri Skogsnycklar D. maculata ssp. fuchsii sphagnicola ( incarnata?) sphagnicola fuchsii A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T I III V VI X XI Knisa mosse Gölsjö mosse Sjömaden Jonsbo fly Berghem Vedborm Rågöl Jättened Kärna mosse Harudden Knisa mosse Knisa Kåtorp Torp Tveta 1 Knisa mosse Knisa mosse sammans med mossnycklar och närmast populationerna från Berghem och Sjömaden. I den ordination som baserades på plastidhaplotypdata (figur 4b) är återigen sumpnycklar och mossnycklar åtskilda längs axel 1. Här är emellertid populationen av sumpnycklar från Harudden, uppe till vänster, väl skild från övriga populationer som är samlade i figurens nedre del. Populationerna från Kärna mosse, Vedborms träsk och Rågöl är fixerade för haplotyp C och hamnar därmed i samma punkt. Populationerna av mossnycklar är något utspridda till höger. Knisanycklar hamnar i samma punkt som populationen från Berghem eftersom de bägge är fixerade för haplotyp M. Diskussion Innan vi diskuterar knisanycklarnas status vill vi först beskriva den utbredning som de karaktärer vi studerat har hos de potentiella föräldraarterna. De plastidhaplotyper vars släktskap återges i figur 2 kan sorteras i tre olika grupper. Haplotyperna A H har vi valt att benämna grupp I-haplotyper. Sådana haplotyper dominerar inom sumpnycklar, är vanliga i skogsnycklar, men är sällsynta i Jungfru Marie nycklar i snäv mening i södra Skandinavien och i Västeuropa i övrigt. De är vidare de vanligast förekommande haplotyperna i hybridnycklar som förekommer i Skandinavien, undantaget mossnycklar. Vissa grupp I-haplotyper, här representerade av haplo- 30 SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009)
8 KNISANYCKLAR Figur 4. Ordination av allotetraploida populationer. Analysen åskådliggör vilka populationer som hör ihop baserat på olika kriterier. Blå prickar: sumpnycklar; rosa prickar: mossnycklar; röd prick: knisanycklar. a) Ordination baserad på ITS-allelfrekvenser. b) Ordination baserad på medelantal olika loci mellan plastidhaplotyper. Populationer som är fixerade för samma haplotyp ligger i samma punkt. Principal coordinates analysis of allotetraploid Dactylorhiza populations based on a) ITS allele frequencies and Rogers genetic distances, and b) mean pairwise haplotype differences between populations. Populations fixed for the same haplotype are located in the same point. Blue dots: D. majalis ssp. traunsteineri; pink dots: D. majalis ssp. sphagnicola; red dot: Knisa mosse allotetraploid. axel 2 (18,1 %) axel 2 (12,0 %) a) Vedborms träsk Harudden Kärna mosse b) Jättened Harudden Rågöl 0 axel 1 (68,0 %) Berghem Sjömaden Knisa mosse Jonsbo fly Gölsjö mosse Jonsbo fly Berghem, Knisa mosse Jättened Kärna mosse, Rågöl, Vedborms träsk 0 Gölsjö mosse Sjömaden 5 axel 1 (79,7 %) typerna F H, har vi dock inte påträffat hos Jungfru Marie nycklar i vid mening, utan bara i vissa av allotetraploiderna. Detta visar sannolikt att allotetraploiderna innefattar material av ganska hög ålder och att de aktuella haplotyperna förlorats inom de representanter för Jungfru Marie nycklar-linjen som finns kvar idag. Haplotyperna I R har vi kallat grupp IIhaplotyper. Dessa återfinns framför allt i Jungfru Marie nycklar i snäv mening, men är heller inte sällsynta i skogsnycklar. Vissa grupp IIhaplotyper förekommer också hos mossnycklar, men inga av dessa är unika för denna. Anledningen till att både grupp I- och grupp II-haplotyper förekommer inom bägge underarterna av Jungfru Marie nycklar tror vi beror på att de två haplotypgrupperna hade uppstått redan innan underarterna uppkom och att det observerade mönstret därmed är en ursprunglig polymorfi (Ståhlberg 2007). Haplotyperna R och S betecknar vi ängsnycklar-haplotyper. Sådana haplotyper karaktäriserar ängsnycklar i vid mening men förekommer ibland även i hybridnycklar, synbarligen till följd av lokal hybridisering och introgression. Av ITS-allelerna är ITS-I vanlig inom Jungfru Marie nycklar i snäv mening i Västeuropa (Ståhlberg 2007), liksom i den besläktade SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009) 31
9 HEDRÉN m.fl. Madeira-endemen D. foliosa (Pillon m.fl. 2007). Allelen är också vanlig i mossnycklar i Skandinavien samt i ytterligare ett par västeuropeiska hybridnycklar. Den förekommer dock knappast alls i sumpnycklar eller några andra skandinaviska hybridnycklar än mossnycklar. Allelerna ITS-III och ITS-V är vanliga inom bägge underarterna av Jungfru Marie nycklar, liksom i de flesta hybridnycklar. ITS-V förekommer dock uppenbarligen inte alls i mossnycklar i östra Småland, men finns i andra populationer i Sverige. ITS-VI är en sällsynt allel med ojämn spridning. Den påträffas främst i den sydösteuropeiska D. maculata ssp. saccifera, men även i viss utsträckning inom Jungfru Marie nycklar i snäv mening. ITS-X är den helt dominerande allelen inom ängsnycklar och återkommer i olika hög frekvens hos olika hybridnycklar. Skandinaviska populationer av mossnycklar har en hög frekvens av allelen, men hos andra hybridnycklar är den sällsynt. ITS-XI är en allel som inte påträffats i tidigare studier (jämför Pillon m.fl. 2007), men som vi hittat i några få populationer av sumpnycklar från Gotland och Estland. Knisanycklarnas ursprung Vi kan konstatera att knisanycklar såväl i plastid- DNA som i ITS överensstämmer fullständigt med mossnycklar från Småland, och att knisanycklar omöjligt kan ha något att göra med sumpnycklar. Innan vi slutligt identifierar knisapopulationen som mossnycklar vill vi emellertid också diskutera möjligheten att knisanycklar (i) har uppkommit oberoende av de bägge namngivna underarterna av hybridnycklar, eller (ii) att populationen uppkommit till följd av sekundärt genflöde mellan en ursprunglig hybridnyckel lik mossnycklar och någon representant för de diploida föräldralinjerna som växer på lokalen. (i) Kan knisanycklar ha uppkommit oberoende av andra hybridnycklar? Eftersom knisanycklar innehåller allelen ITS-I (tabell 2) måste den i så fall ha uppkommit ur kombinationen Jungfru Marie nycklar i snäv mening ängsnycklar. Knisanycklar kännetecknas emellertid också av haplotyp M i plastid-dna. Denna haplotyp är en dominerande haplotyp inom mossnycklar, medan den är långt mindre vanlig inom Jungfru Marie nycklar i snäv mening, vilken också innehåller en lång räcka av andra haplotyper. Vi kunde heller inte hitta någon Jungfru Marie nycklar i snäv mening på Knisa mosse och vi har därmed inga belägg för att knisanycklar skulle kunna ha uppkommit lokalt på detta sätt. Sannolikheten att knisanycklar skulle ha uppkommit oberoende av mossnycklar snarare än att den härstammar direkt från mossnycklar förefaller därmed vara liten. (ii) I vilken grad kan knisanycklar ha påverkats av lokal hybridisering med skogsnycklar eller ängsnycklar? Populationen av skogsnycklar på Knisa mosse hade allelen ITS-V i likhet med övriga öländska populationer, medan denna allel saknades hos knisanycklar (tabell 2). Omvänt förekom ITS-I hos knisanycklar, men saknades hos skogsnycklar på lokalen. Vidare hade knisanycklar och skogsnycklar genomgående olika haplotyper. Det finns därmed ingenting som tyder på att knisanycklar skulle vara påverkade av hybridisering med skogsnycklar. Ängsnycklar och knisanycklar delar ITS-X och denna allel kan därför inte användas som skiljekaraktär. Vidare har knisanycklar en plastidhaplotyp som aldrig förekommer hos ängsnycklar, men eftersom plastiderna nedärvs från fröföräldern kan det inte uteslutas att det förekommer genflöde från ängsnycklar via pollen. Det finns emellertid inget skäl att tro att hybrider bara skulle bildas i en riktning. Av de misstänkta hybriderna mellan knisanycklar och ängsnycklar finns ett individ med ängsnyckelhaplotyp. Detta individ har även allelen ITS-I och måste därför säkert vara en hybrid. De övriga tre misstänkta hybriderna har haplotyp M. De har inte högre andel ITS-X än fullt typiska knisanycklar och det finns därmed inget stöd för att de verkligen skulle vara hybrider, utan de kan lika gärna vara klent utvecklade exemplar av knisanycklar. Sammanfattningsvis kan det inte uteslutas att viss hybridisering med ängsnycklar förekommer på Knisa mosse, men inget tyder på att sådan hybridisering skulle ha påverkat populationen av knisanycklar i någon större utsträckning. 32 SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009)
10 KNISANYCKLAR Knisanycklar bör uppenbarligen knytas ihop mossnycklar, i enlighet med Ericsson (1982). Mossnycklar från andra delar av Sverige varierar i de molekylära karaktärer som studerats här och det finns populationer som har andra haplotyper eller en högre frekvens av ITS-V. Knisanycklar är emellertid mest lik populationer från östra Småland och det är troligt att den ursprungligen kommer från detta område. De argument som Bjurulf anförde (2005a, b) att knisanycklar inte kunde räknas till mossnycklar var dels ståndorten, som han ansåg hysa alltför många rikkärrsväxter för att kunna passa mossnycklar, dels stödbladens tandning som avvek från typiska mossnycklar och som snarast påminde om den hos sumpnycklar. Vi har inga ytterligare data när det gäller dessa två observationer, men mot bakgrund av vår slutsats att knisanycklar måste sorteras med mossnycklar, kan vi konstatera (i) att mossnycklar ibland kan växa i kärr av medelrikkaraktär i enlighet med Bjurulf & Thorell (2005) och (ii) att stödbladens tandning lika lite som andra morfologiska karaktärer kan användas för att säkert skilja mellan olika former av hybridnycklar. Knisanycklar är fixerad för en enda haplotyp i plastidgenomet, vilket antyder att populationen kan ha genomgått en genetisk flaskhals då de först etablerades på Knisa mosse. Ett sådant scenario kan också förklara varför den kommit att avvika i stödbladstandning från populationer av mossnycklar i östra Småland. Slutsatser Molekylära karaktärer visar att hybridnycklar på Knisa mosse med all sannolikhet har sitt ursprung ur mossnycklar. Det är fullständigt uteslutet att den tillhör sumpnycklar, och det är knappast troligt att den uppkommit lokalt genom hybridisering och kromosomtalsfördubbling ur de potentiella föräldrar som växer på lokalen, skogsnycklar och ängsnycklar. Det finns heller inget som tyder på att de har ett regionalt ursprung ur dessa taxa. Några av de undersökta exemplaren skulle kunna ha påverkats av lokal hybridisering med ängsnycklar, men graden av genflöde från ängsnycklar tycks vara låg och det finns därmed inget skäl att tro att populationen som helhet skulle ha uppkommit genom hybridisering och återkorsning mellan mossnycklar och ängsnycklar. Knisanycklar har en avvikande stödbladstandning, men vi uppfattar inte skillnaden gentemot typisk mossnycklar som särskilt stor i andra karaktärer och föreslår därför att knisanycklar helt enkelt räknas som mossnycklar. Allmän problemställning När det gäller starkt variabla växtsläkten, som till exempel handnycklar, är det mycket vanligt att man ställer frågan vilket beskrivet taxon (art, underart, eller varietet) en viss given population tillhör eller är närmast besläktad med. Detta gäller inte bara grupper som innehåller polyploider, utan också många andra växtgrupper med till exempel småarter som förökar sig asexuellt, grupper som hybridiserar, arter som präglas av ekotypdifferentiering, eller arter med stor fenotypisk plasticitet. Problematiska eller kritiska växtgrupper har naturligtvis engagerat botanister sedan lång tid tillbaka och har delats in i taxa av olika rang som beskriver och systematiserar den variation som kan iakttas för blotta ögat. Det tar tid och är dyrt att reda ut sådana grupper med moderna metoder och för de flesta grupper finns ännu ingen kunskap om hur deras systematik stämmer överens med de släktskapsmönster som kan åskådliggöras med genetiska data. I de fall man har genetiska data kan man emellertid ofta se att systematik och släktskapsmönster stämmer dåligt överens. Så är även fallet inom Dactylorhiza, där det skrivits spaltkilometrar om morfologiska variationsmönster och släktets systematiska indelning. I den här uppsatsen har vi åskådliggjort hur mycket data som faktiskt krävs för att kunna beskriva ursprunget till en enda population. För det första krävs bra genetiska markörer som varierar tillräckligt mycket på låg taxonomisk nivå (inom artkomplex). Sådana markörer måste oftast tas fram specifikt för varje given växtgrupp. För det andra krävs ett omfattande referensmaterial av såväl snarlika populationer som möjliga föräldrataxa för att kunna utvärdera olika mer eller mindre rimliga alternativa SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009) 33
11 HEDRÉN m.fl. hypoteser. Frågan om vilken underart av hybridnycklar som knisanycklar egentligen tillhör är därför bara rimlig att besvara inom ramen för ett forskningsprojekt där man tagit fram lämpliga referensdata av andra skäl. Med den här uppsatsen hoppas vi att vi har kunnat förmedla något av dessa insikter till läsaren. Vi vill rikta ett varmt tack till Per Bjurulf som fäst vår uppmärksamhet på den problematiska populationen av hybridnycklar på Knisa mosse och vi vill också tacka Kenneth Erlandsson som väglett oss på lokalen. Studien har utförts inom ramen för ett anslag från Formas till MH. Citerad litteratur Bandelt, H.-J., Forster, P. & Röhl, A Medianjoining networks for inferring intraspecific phylogenies. Mol. Biol. Evol. 16: Bjurulf, P. 2005a. Växer mossnycklar på Öland? Krutbrännaren 14: Bjurulf, P. 2005b. Finns mossnycklar på Öland? Svensk Bot. Tidskr. 99: 133. Bjurulf, P. & Thorell, M Kan växtplatsen användas för att skilja på moss- och sumpnycklar? Svensk Bot. Tidskr. 99: Ericsson, B. C Mossnycklar och skogsfru växer på Öland. Svensk Bot. Tidskr. 76: 1 4. Hedrén, M Plastid DNA variation in the Dactylorhiza incarnata/maculata polyploid complex and the origin of allotetraploid D. sphagnicola (Orchidaceae). Mol. Ecol. 12: Hedrén, M Artbildning och släktskap inom orkidésläktet Dactylorhiza, handnycklar Svensk Bot. Tidskr. 99: Hedrén, M., Nordström, S. & Ståhlberg, D Polyploid evolution and plastid DNA variation in the Dactylorhiza incarnata/maculata complex in Scandinavia. Mol. Ecol. 17: Mossberg, B & Lundqvist, Å Öländska ängsnycklar. Svensk Bot. Tidskr. 88: Pillon, Y., Fay, M. F., Hedrén, M. m.fl Evolution and temporal diversification of western European polyploid species complexes in Dactylorhiza (Orchidaceae) Taxon 2007: Rogers, J. S Measures of genetic similarity and genetic distance. Stud. Genet. 7: Sterner, R Ölands kärlväxtflora. SBT-förlaget, Lund. Ståhlberg, D Systematics, phylogeography and polyploid evolution in the Dactylorhiza maculata complex (Orchidaceae). Doktorsavhandling, Ekologiska inst., Lunds universitet. ABSTRACT Hedrén, M., Nordström, S. & Ståhlberg, D Knisanycklarna härstammar från mossnycklar. [The allotetraploid marsh orchid at Knisa mosse, Öland, has been derived from Dactylorhiza majalis ssp. sphagnicola.] Svensk Bot. Tidskr. 103: Uppsala. ISSN X. The enigmatic allotetraploid marsh orchid population at Knisa mosse, northern Öland, was characterized for variation at 12 hypervariable plastid DNA loci and for nuclear ITS alleles in an attempt to trace the origin of the population. Comparison with other members of Dactylorhiza on Öland and southern Sweden reveals that the Knisa population agrees genetically with populations of D. majalis ssp. sphagnicola in eastern Småland. We also show that the Knisa population cannot belong to D. majalis ssp. traunsteineri and that it cannot be derived from hybridization between local D. maculata ssp. fuchsii and D. incarnata. Furthermore, we regard it unlikely that the morphological features of the Knisa population are derived by introgression from local D. incarnata, in spite of the fact that one indisputable hybrid with this species was identified at the locality. The hypothesis that it evolved independently from D. majalis ssp. sphagnicola by hybridization between D. maculata s.l. and D. incarnata somewhere outside its present locality is unlikely. We conclude that the allotetraploid at Knisa mosse is best regarded as a deviating form of D. majalis ssp. sphagnicola. Mikael Hedrén är docent i systematisk botanik. Han arbetar nu mest med finskalig variation, polyploid evolution och invandringshistoria inom Dactylorhiza och har tidigare bl.a. studerat Carex flava-komplexet. Adress: Ekologiska institutionen, Lunds universitet, Ekologihuset, Lund E-post: mikael.hedren@ekol.lu.se Sofie Nordström och David Ståhlberg är doktorand respektive nyligen disputerad i systematisk botanik vid Lunds universitet. De har arbetat med olika frågeställningar inom komplexen hybridnycklar och Jungfru Marie nycklar. 34 SVENSK BOTANISK TIDSKRIFT 103:1 (2009)
Mossnycklar Dactylorhiza majalis ssp.
Morfologiska skillnader mellan mossoch sumpnycklar i olika kärrtyper Per Bjurulf visar här att mossnycklar ser olika ut beroende på vilket sorts kärr de växer i. Ju rikare kärr, desto mer lika sumpnycklar
Svensk Botanisk Tidskrift 99(2): (2005) ISSN X, Uppsala 2005 INNEHÅLL. Volym 99 Häfte
Svensk Botanisk Tidskrift 99(2): 65 144 (2005) ISSN 0039-646X, Uppsala 2005 INNEHÅLL 65 Ordföranden har ordet: Nytt från styrelsen 66 Skogsfru Årets växt 2005 67 Stenberg, L: Baltnycklar i Norrbotten (Dactylorhiza
Karl Holm Ekologi och genetik, EBC, UU. ebc.uu.se. Nick Brandt. Populationsgenetik
Karl Holm Ekologi och genetik, EBC, UU karl.holm@ ebc.uu.se Nick Brandt Populationsgenetik Kursens upplägg Föreläsningar 24/4, 10:15-16:00 Friessalen Introduktion, HWE 27/4, 10:15-16:00 Inavel 28/4, 10:15-16:00
Skrivning för biolog- och molekylärbiologlinjen, genetik 5p.
Skrivning för biolog- och molekylärbiologlinjen, genetik 5p. Namn: Adress: Resultat: Betyg: Hjälpmedel: Miniräknare. Formelblad med tabell. Skrivtid: 9.00-13.00. Beräkningar och svar ska vara motiverade.
Syfte? Naturliga populationer i Trollsvattnen. Otoliter för åldersbestämning. Vävnadsprover för genetisk analys
Syfte? Inblick i vanlig genotypbestämningsmetod Allozymer har ofta använts som genetisk markör vid populationsgenetiska studier Studera genetisk variation inom och mellan populationer används inom bevarandebiologin
Henrik Brändén. bioscience explained Vol 3 No 1. Undersökning av influensavirus med hjälp av släktträd. Vetenskapsrådet 103 78 Stockholm Sverige
Henrik Brändén Vetenskapsrådet 103 78 Stockholm Sverige Undersökning av influensavirus med hjälp av släktträd Introduktion Influensavirus delas in i olika stammar beroende på vilka varianter viruset bär
Evolution. Hur arter uppstår, lever och försvinner
Evolution Hur arter uppstår, lever och försvinner Aristoteles 384-322 f.kr Idéhistoria Carl von Linné 1707-1778 Georges de Buffon 1707-1788 Jean Babtiste Lamarck 1744-1829 Idéhistoria Cuvier Malthus Lyell
Totalt finns det alltså 20 individer i denna population. Hälften, dvs 50%, av dem är svarta.
EVOLUTION Tänk dig att det på en liten ö i skärgården finns 10 st honor av den trevliga insekten långvingad muslus. Fem av dessa är gula med svarta fläckar och fem är helsvarta. Det är samma art, bara
Sik i Bottenhavet - En, två eller flera arter? Sammandrag
Sik i Bottenhavet - En, två eller flera arter? Rapport till länsstyrelsen i Gävleborgs län. Erica Holmqvist Självständigt arbete i Biologi Uppsala universitet VT 2010 En litteratursammanfattning om forskning
CSI - Katte DNA-fingerprinting Välkänt från polisarbete. Metoden föddes 1985 i England. Från början krävdes stora mängder DNA, men nu funkar även mycket små mängder. DNA-sekvens Användning Metoden
Att bygga ett fylogenetiskt träd
bioscience explained 134567 Wojciech Grajkowski Szkoła Festiwalu Nauki, ul. Ks. Trojdena 4, 02-109 Warszawa Att bygga ett fylogenetiskt träd Syfte Övningen visar hur man konstruerar fylogenetiska träd
Evolution. Hur arter uppstår, lever och försvinner
Evolution Hur arter uppstår, lever och försvinner Aristoteles 384-322 f.kr Idéhistoria Carl von Linné 1707-1778 Georges de Buffon 1707-1788 Jean Babtiste Lamarck 1744-1829 De fem rikena Växter Djur Svampar
Tomat och banan hur är de släkt?
Bildkälla: https://pixabay.com/ Alignment Introduktion Tomat och banan hur är de släkt? I denna övning studeras släktskapet mellan olika växtarter genom att jämföra DNA-sekvenser från olika växtarter (s
Evolution. Hur arter uppstår, lever och försvinner
Evolution Hur arter uppstår, lever och försvinner Aristoteles 384-322 f.kr Idéhistoria Carl von Linné 1707-1778 Georges de Buffon 1707-1788 Jean Babtiste Lamarck 1744-1829 1. Eukaryoter Tre domäner 2.
Simulera evolutionen Ett spel för att lära ut principerna kring evolutionen med hjälp av olika föremål.
bioscience explained 134567 John A. Barker Formerly of the Department of Education and Professional Studies King s College, London Simulera evolutionen Ett spel för att lära ut principerna kring evolutionen
PROV 6 Bioteknik. 1. Hur klona gener med hjälp av plasmider?
För essäsvaren 1 2 kan den sökande få högst 9 poäng/fråga. Vid poängsättningen beaktas de exakta sakuppgifter som den sökande gett i sitt svar. För dessa kan den sökande få högst 7 poäng. Dessutom får
Hardy-Weinberg jämnvikt Processer som minskar genetisk variation: Inavel Genetisk drift
Populationsgenetik Hardy-Weinberg jämnvikt Processer som minskar genetisk variation: Inavel Genetisk drift Processer som ökar genetisk variation: Mutationer Migration Miljömässiga förändringar Balancen
Datorlaboration 5: Genetisk populationsstruktur
Datorlaboration 5: Genetisk populationsstruktur Syftet med denna laboration är att ni ska få prova på några vanligt förekommande statistiska analysmetoder som används vid studier av genetisk populationsstruktur.
Grafisk teknik IMCDP IMCDP IMCDP. IMCDP(filter) Sasan Gooran (HT 2006) Assumptions:
IMCDP Grafisk teknik The impact of the placed dot is fed back to the original image by a filter Original Image Binary Image Sasan Gooran (HT 2006) The next dot is placed where the modified image has its
MYSTERIER SOM ÅTERSTÅR
Matematiska institutionen Stockholms universitet C.G. Matematik med didaktisk inriktning 2 Problem i Algebra, geometri och kombinatorik Snedsteg 6 MYSTERIER SOM ÅTERSTÅR Mysteriet med matrisinversen. Det
Regression med Genetiska Algoritmer
Regression med Genetiska Algoritmer Projektarbete, Artificiell intelligens, 729G43 Jimmy Eriksson, jimer336 770529-5991 2014 Inledning Hur många kramar finns det i världen givet? Att kunna estimera givet
PROV 6 Bioteknik. 1. Hur klona gener med hjälp av plasmider?
För essäsvaren 1 2 kan den sökande få högst 9 poäng/fråga. Vid poängsättningen beaktas de exakta sakuppgifter som den sökande gett i sitt svar. För dessa kan den sökande få högst 7 poäng. Dessutom 1. Hur
7.5 Experiment with a single factor having more than two levels
7.5 Experiment with a single factor having more than two levels Exempel: Antag att vi vill jämföra dragstyrkan i en syntetisk fiber som blandats ut med bomull. Man vet att inblandningen påverkar dragstyrkan
Genetik II. Jessica Abbott
Genetik II Jessica Abbott Nukleosid Sockergrupp + kvävebas Kvävebaser: Puriner (adenin, guanin) Pyrimidiner (cytosin, thymin i DNA, uracil i RNA) Basparning A=T G C Packning av DNA i eukaryot cellkärna
Svensk Botanisk Tidskrift
Småtörel Småtörel Euphorbia exigua är vår minsta inhemska törel; den ett åriga arten blir oftast bara några centimeter hög. Småtörel är numera mycket sällsynt och hittas främst i sydvästra Skåne samt på
Tentamen i Matematik 3: M0031M.
Tentamen i Matematik 3: M0031M. Datum: 2009-10-26 Skrivtid: 09:00 14:00 Antal uppgifter: 6 ( 30 poäng ). Jourhavande lärare: Norbert Euler Telefon: 0920-492878 Tillåtna hjälpmedel: Inga Till alla uppgifterna
Tentamen Biologi BI1112 Termin och år: Klockan:
Tentamen Biologi BI1112 Termin och år: 120312 Klockan: 0800-13.15 Betygsgränser:!!! 50-66%! Betyg 3!!!!! 67-83%! Betyg 4!!!!! 84-100%! Betyg 5 Fråga 1-4 Cellbiologi Fråga 5-7 Genetik Fråga 8-10 Växtfysiologi!!!!
2010-09-13 Resultatnivåns beroende av ålder och kön analys av svensk veteranfriidrott med fokus på löpgrenar
1 2010-09-13 Resultatnivåns beroende av ålder och kön analys av svensk veteranfriidrott med fokus på löpgrenar av Sven Gärderud, Carl-Erik Särndal och Ivar Söderlind Sammanfattning I denna rapport använder
Grundläggande Idéer Algoritmens komponenter Numerisk optimering Genetisk Programmering. Genetiska Algoritmer
Genetiska Algoritmer 1 Grundläggande Idéer 2 3 4 Exempel Parallell optimering inspirerad av biologisk evolution Parallell optimering inspirerad av biologisk evolution Population av hypoteser Urvalprocess
DNA-ordlista. Amplifiera: Att kopiera och på så sätt mångfaldiga en DNA-sekvens med hjälp av PCR.
DNA-ordlista Alignment: Att placera DNA-sekvenser intill varandra. Detta gör att man kan urskilja var och hur mycket de skiljer sig från varandra, vilket är ett av de mest grundläggande sätten att analysera
Vad är en art? morfologiska artbegreppet
Vad är en art? Vad är en art? Du tycker kanske att det är uppenbart vad som är olika arter? En hund är en annan art än en katt det ser man ju på långt håll. De flesta arter är så pass olika att man på
Den evolutionära scenen
Den evolutionära scenen Det finns en del att förklara Där allt händer Skapande Evolutionsteorin Gibboner Orangutang Gorilla Människa Schimpans Bonobo Naturligt urval Artbildning Livet har en historia Gemensamt
inte följa någon enkel eller fiffig princip, vad man nu skulle mena med det. All right, men
MATEMATISKA INSTITUTIONEN STOCKHOLMS UNIVERSITET Christian Gottlieb Gymnasieskolans matematik med akademiska ögon Induktion Dag 2. Explicita formler och rekursionsformler. Dag mötte vi flera talföljder,
Grafisk teknik IMCDP. Sasan Gooran (HT 2006) Assumptions:
Grafisk teknik Sasan Gooran (HT 2006) Iterative Method Controlling Dot Placement (IMCDP) Assumptions: The original continuous-tone image is scaled between 0 and 1 0 and 1 represent white and black respectively
Second handbook of research on mathematics teaching and learning (NCTM)
Second handbook of research on mathematics teaching and learning (NCTM) The effects of classroom mathematics teaching on students learning. (Hiebert & Grouws, 2007) Inledande observationer Undervisningens
FAKTABLAD Genetiskt provinsamling i rovdjursinventeringen
1(5) FAKTABLAD Genetiskt provinsamling i rovdjursinventeringen Målsättning Syftet med detta faktablad är att ge en översikt av den genetiska provtagningen som tillämpas vid rovdjursinventeringen i Sverige
En typisk medianmorot
Karin Landtblom En typisk medianmorot I artikeln Läget? Tja det beror på variablerna! i Nämnaren 1:1 beskrivs en del av problematiken kring lägesmått och variabler med några vanliga missförstånd som lätt
Evolution, del 1: Evolution och naturlig selektion. Jessica Abbott Forskare Evolutionär Ekologi
Evolution, del 1: Evolution och naturlig selektion Jessica Abbott Forskare Evolutionär Ekologi Kanada Peterborough liftlocks Johnson Hall University of Guelph Lund Ekologihuset Erik Svensson Ischnura elegans
Ärftliga sjukdomar och egenskaper hos hund
Engelsk bulldog Tibetansk terrier Västgötaspets Dvärgpinscher Chow chow Foto: Pleple2000 Foto: Flickr user skaty222 Foto: Sören T Eriksson Foto: Entheta Foto:Jurriaan Schulman Alla bilder Wikimedia commons
Kodnummer: 1) Beskriv processerna som sker i replikationsgaffel (eng. replication fork)? (3)
Bi 75hp / Lärarprogrammet Tentamen i BL2018 CMB; Molekylär cellbiologi & genetik, 10,5 hp 2018-01-13 1) Beskriv processerna som sker i replikationsgaffel (eng. replication fork)? (3) Bi 60hp Tentamen i
Föreliggande arbete beskriver tandningen av
Stödbladens tandning hos svenska handnycklar Tandningen på blommornas stödblad, braktéerna, hos handnycklarna har visat sig vara en användbar karaktär för att skilja vissa arter åt. Fenomenet har hittills
*****************************************************************
Umeå universitet EMG Barbara Giles Kod nummer: Tentamensformalia Kursens namn: 5BI110 Genetik och evolution 15 hp, moment evolution HT12 Datum: 2012-12-21 Tid: 09.00-14.00 Tillåtna hjälpmedel: miniräknare
Grafisk teknik. Sasan Gooran (HT 2006)
Grafisk teknik Sasan Gooran (HT 2006) Iterative Method Controlling Dot Placement (IMCDP) Assumptions: The original continuous-tone image is scaled between 0 and 1 0 and 1 represent white and black respectively
Mångfald inom en art. Genotyp. Genpool. Olika populationer. Fig En art definieras som
Mångfald inom en art Population och art. Vad är skillnaden? Vad är en art? Genetisk variation Genetiskt olika populationer Tillämpningar av genetisk variation Etiska problem En art En art definieras som
Erfarenheter från övergången till den nya typningsmetodiken MIRU-VNTR
Erfarenheter från övergången till den nya typningsmetodiken MIRU-VNTR Ramona Groenheit PhD, Mikrobiolog 2012-12-05 Med molekylära typningsmetoder kan vi: Upptäcka och övervaka utbrott Övervaka behandlingen
tidskrift för politisk filosofi nr årgång 9
tidskrift för politisk filosofi nr 1 2005 årgång 9 Bokförlaget thales om den personliga egalitarismen om den personliga egalitarismen replik till rabinowicz Jonas Gren, Niklas Juth och Ragnar Francén i
Bevarande och uthålligt nyttjande av en hotad art: flodkräftan i Sverige
Bevarande och uthålligt nyttjande av en hotad art: flodkräftan i Sverige Lägesrapport 2015-12-08 Här kommer den 4:e lägesrapporten från forskningsprojektet Bevarande och uthålligt nyttjande av en hotad
Klipp-och-klistra DNA: fixa mutationen med gen editering DNA, RNA och Protein
Huntingtons sjukdom forsknings nyheter. I klartext Skriven av forskare För de globala HS medlemmarna. Klipp-och-klistra DNA: fixa mutationen med gen editering Forskare gör exakta ändringar av DNA i ett
Erik Eriksson VMD Enheten för Bakteriologi
Diagnostik VTEC/EHEC Erik Eriksson VMD Enheten för Bakteriologi SVA Tänker prata om VTEC / EHEC Sjukdomsframkallande faktorer PCR Magnetiska kulor (Immunomagnetisk separation) Diagnostik de vanligaste
ELEMENTÄR - SVÅRARE FÄRGGENETIK. Del 5
ELEMENTÄR - SVÅRARE FÄRGGENETIK Del 5 av Maria Grönkvist Det har blivit dags för den sista delen av min artikelserie. Denna gång tänkte jag delge er läsare mina funderingar angående en del färger, ge ett
Bioresursdagarna 2017 Digerdödens offer hjälper oss att förstå utvecklingen av humanpatogena bakterier. Brittmarie Lidesten, Bioresurs
Bioresursdagarna 2017 Digerdödens offer hjälper oss att förstå utvecklingen av humanpatogena bakterier Brittmarie Lidesten, Bioresurs Artikel i Science in School inklusive referenser: Tales from a plague
Snabbguide till GlobalTwitcher (Juni 2012)
Snabbguide till GlobalTwitcher (Juni 2012) Denna snabbguide är avsedd att hjälpa nya medlemmer att komma igång med huvudfunktionerna på GlobalTwitcher (GT). Siten innehåller dock ett stort antal funktioner
För att komma till källan måste man gå mot strömmen
För att komma till källan måste man gå mot strömmen D GENETICA FÄRGER OCH HÅRLAG HOS BELGISK VALLHUND Belgisk vallhund omfattar de fyra raserna malinois, laekenois, tervueren och groenendael. I ursprungslandet
Släktskap mellan människa och några ryggradsdjur
Övning: Släktskap mellan människa och några ryggradsdjur sid 1 Övning Släktskap mellan människa och några ryggradsdjur En manuell jämförelse mellan hemoglobinets aminosyrasekvenser hos några organismer
Bevarandegenetik och de svenska nationalraserna: lägesrapport. Mija Jansson
Bevarandegenetik och de svenska nationalraserna: lägesrapport Mija Jansson Inavel F = 0.125 Sjuka/friska hundraser, inavel Förlust av genetisk varation: Founder Genom Ekvivalenter 1 FGE Sjuka/friska hundraser,
Mångfald inom en art. Genotyp. Genpool. Olika populationer. Fig En art definieras som
Mångfald inom en art Population och art. Vad är skillnaden? Vad är en art? Genetisk variation Genetiskt olika populationer Tillämpningar av genetisk variation Etiska problem En art En art definieras som
EVOLUTIONENS DRIVKRAFTER ARTBILDNING
EVOLUTIONENS DRIVKRAFTER ARTBILDNING Evolutionen på 60 sek https://www.youtube.com/watch?v=oiwde6opvz U Vad är evolutionen (8 min)? https://www.youtube.com/watch?v=ghhojc4oxh8 Hur fungerar evolutionen
Skolan skall i sin undervisning i biologi sträva efter att eleven
Biologi inrättad 2000-07 Ämnets syfte och roll i utbildningen Biologiämnet syftar till att beskriva och förklara naturen och levande organismer ur ett naturvetenskapligt perspektiv. Samtidigt skall utbildningen
Föreläsning 8. Kapitel 9 och 10 sid Samband mellan kvalitativa och kvantitativa variabler
Föreläsning 8 Kapitel 9 och 10 sid 230-284 Samband mellan kvalitativa och kvantitativa variabler 2 Agenda Samband mellan kvalitativa variabler Chitvåtest för analys av frekvenstabell och korstabell Samband
DNA-ordlista. 16S: Egentligen 16S rrna. Mitokondriell gen med förhållandevis liten variation som ofta används för att artbestämma DNA från däggdjur.
DNA-ordlista 16S: Egentligen 16S rrna. Mitokondriell gen med förhållandevis liten variation som ofta används för att artbestämma DNA från däggdjur. Alignment: Att placera DNA-sekvenser intill varandra.
Bootstrapping i fall-/kontrollstudier av genetiska markörer
Bootstrapping i fall-/kontrollstudier av genetiska markörer Håkan Lövkvist RSKC 2011-03-09 Vad är bootstrapping? Bootstrap = stövelstropp Annan översättning: Ta sig i kragen, vara självbärande Litterär
Evolution, del 2: Evolutionsprocesser och förändringar i det genetiska materialet. Jessica Abbott Forskare Evolutionär Ekologi
Evolution, del 2: Evolutionsprocesser och förändringar i det genetiska materialet Jessica Abbott Forskare Evolutionär Ekologi Naturlig selektion Alleler som ger bättre överlevnad och/eller reproduktionsförmåga
ELEMENTÄR - SVÅRARE FÄRGGENETIK. Del 3
ELEMENTÄR - SVÅRARE FÄRGGENETIK Del 3 av Maria Grönkvist Efter det att jag i förra numret av HR skrev en lista på den genetiska koden för en del färgvarianter har jag fått en fråga som lyder: hur får man
FARLIGA TANKAR EVOLUTIONEN
FARLIGA TANKAR EVOLUTIONEN Charles Darwin (1809-1882) NÄR VI ÄR KLARA MED DETTA AVSNITT SKALL DU KUNNA: Ge en beskrivning av hur evolutionsteorin växt fram Visa skillnader och likheter mellan riktat och
Pelagia Miljökonsult AB
KOMPLETTERANDE NATURVÄRDESINVENTERING OCH MYRKARTERING I LIDENOMRÅDET MED OMNEJD 2014 Pelagia Miljökonsult AB Adress: Sjöbod 2, Strömpilsplatsen 12, 907 43 Umeå, Sweden. Telefon: 090-702170 (+46 90 702170)
Hur stor är sannolikheten att någon i klassen har en katt? Hur stor är
Karin Landtblom Hur sannolikt är det? Uttrycket Hur sannolikt är det på en skala? använder många till vardags, ofta med viss ironi. I denna artikel om grunder för begreppet sannolikhet åskådliggör författaren
11. Feminism och omsorgsetik
11. Feminism och omsorgsetik Nästan alla som har utövat inflytande på den västerländska moralfilosofin har varit män. Man kan därför fråga sig om detta faktum på något sätt återspeglar sig i de moralteorier
1 Minkostnadsflödesproblem i nätverk
Krister Svanberg, april 2012 1 Minkostnadsflödesproblem i nätverk Ett nätverk består av en given mängd noder numrerade från 1 till m (där m är antalet noder) samt en given mängd riktade bågar mellan vissa
Pedagogisk planering Bi 1 - Individens genetik
Centralt innehåll Genetik Arvsmassans uppbyggnad samt ärftlighetens lagar och mekanismer. Celldelning, dnareplikation och mutationer. Genernas uttryck. Proteinsyntes, monogena och polygena egenskaper,
Idag. EDAA35, föreläsning 4. Analys. Kursmeddelanden. Vanliga steg i analysfasen av ett experiment. Exempel: exekveringstid
EDAA35, föreläsning 4 KVANTITATIV ANALYS Idag Kvantitativ analys Slump och slumptal Analys Boxplot Konfidensintervall Experiment och test Kamratgranskning Kursmeddelanden Analys Om laborationer: alla labbar
DNA-analyser: Introduktion till DNA-analys med PCR och gelelektrofores. Niklas Dahrén
DNA-analyser: Introduktion till DNA-analys med PCR och gelelektrofores Niklas Dahrén Användningsområden för DNA-analys Ta reda på vems DNA som har hittats på en brottsplats. Faderskapsanalys. Identifiera
FACIT (korrekta svar i röd fetstil)
v. 2013-01-14 Statistik, 3hp PROTOKOLL FACIT (korrekta svar i röd fetstil) Datorlaboration 2 Konfidensintervall & hypotesprövning Syftet med denna laboration är att ni med hjälp av MS Excel ska fortsätta
Idag. EDAA35, föreläsning 4. Analys. Exempel: exekveringstid. Vanliga steg i analysfasen av ett experiment
EDAA35, föreläsning 4 KVANTITATIV ANALYS Idag Kvantitativ analys Kamratgranskning Analys Exempel: exekveringstid Hur analysera data? Hur vet man om man kan lita på skillnader och mönster som man observerar?
skapat bristande förtroende för politiken och förvaltning.
2009-05-28 Miljödepartementet Politiska staben PM: Sammanfattande del av propositionen En ny rovdjursförvaltning Sverige ska ha livskraftiga stammar av björn, varg, järv, lodjur och kungsörn och varje
1. Inledning, som visar att man inte skall tro på allt man ser. Betrakta denna följd av tal, där varje tal är dubbelt så stort som närmast föregående
MATEMATISKA INSTITUTIONEN STOCKHOLMS UNIVERSITET Christian Gottlieb Gymnasieskolans matematik med akademiska ögon Induktion Dag 1 1. Inledning, som visar att man inte skall tro på allt man ser. Betrakta
4 grundregler. Minneshantering. Problemet. Windows minkrav
4 grundregler 1. Man kan aldrig få för mycket minne 2. Minnet kan aldrig bli för snabbt Minneshantering 3. Minne kan aldrig bli för billigt 4. Programmens storlek ökar fortare än minnet i datorerna (känns
Björnstammens storlek i Västerbotten 2014
Björnstammens storlek i Västerbotten 2014 Rapport 2015-6 från det Skandinaviska björnprojektet Jonas Kindberg och Jon E. Swenson www.bearproject.info English summary: The bear scat survey in Västerbotten
Köldformer av påfågelöga Inachis io ett experiment
Köldformer av påfågelöga Inachis io ett experiment FREDRIK PERSSON F ör över hundra år sedan upptäcktes att temperaturchocker sent i larvstadiet kan orsaka tydliga förändringar i färg och mönster hos flera
En liten krysslista för stora och små
En liten krysslista för stora och små Träd 1. ASP Aspen får sprakande höstfärger. De har en mycket rak stam och det finns aspar som blivit hela 35 meter höga. Det brukar heta att asplöven darrar och det
Miljöövervakning av genetisk mångfald. Linda Laikre Stockholms universitet
Miljöövervakning av genetisk mångfald Linda Laikre Stockholms universitet Genetisk variation osynliga verktyg för överlevnad och anpassning Genetisk variation = förekomst av varianter av enskilda gener/arvsanlag
Kromosom translokationer
12 Uppsala Örebroregionen: Klinisk Genetik Rudbecklaboratoriet Akademiska barnsjukhuset 751 85 Uppsala Tel: 018-611 59 40 Fax: 018-55 40 25 http://www.scilifelab.uu.se/ Genetiska patientföreningars paraplyorganisation:
Isometries of the plane
Isometries of the plane Mikael Forsberg August 23, 2011 Abstract Här följer del av ett dokument om Tesselering som jag skrivit för en annan kurs. Denna del handlar om isometrier och innehåller bevis för
SVENSK STANDARD SS-EN ISO 19108:2005/AC:2015
SVENSK STANDARD SS-EN ISO 19108:2005/AC:2015 Fastställd/Approved: 2015-07-23 Publicerad/Published: 2016-05-24 Utgåva/Edition: 1 Språk/Language: engelska/english ICS: 35.240.70 Geografisk information Modell
Metoder för att identifiera genetisk sjukdomar
Hunden människans sjukaste vän Olof Vadell Populärvetenskaplig sammanfattning av Självständigt arbete i biologi 2012 Institutionen för biologisk grundutbildning, Uppsala universitet Hunden har varit en
Lektionsanteckningar 11-12: Normalfördelningen
Lektionsanteckningar 11-12: Normalfördelningen När utfallsrummet för en slumpvariabel kan anta vilket värde som helst i ett givet intervall är variabeln kontinuerlig. Det är väsentligt att utfallsrummet
En bioinformatisk genjakt
En bioinformatisk genjakt Efter en ide från: CUSMOBIO, Milano, Italien. Hur man kan söka i databaser efter information om en gen som kan ge ökad risk för bröstcacer. Bakgrund Människor utan symptom men
SBR SV / Lotta Fabricius Kristiansen Drottningodling för nybörjare
Drottningodling för nybörjare Introduktion till drottningodling -kursöversikt Biologin bakom drottningodlingen Förädling och avel Utrustning Metoder till husbehov och yrkesmässigt Parning och drönarsamhällen
Bearbetning och Presentation
Bearbetning och Presentation Vid en bottenfaunaundersökning i Nydalasjön räknade man antalet ringmaskar i 5 vattenprover. Följande värden erhölls:,,,4,,,5,,8,4,,,0,3, Det verkar vara diskreta observationer.
RAPPORT 2008/8 FÖREKOMSTEN AV ÄNGSNÄTFJÄRIL Melitaea cinxia på norra Gräsö och Örskär. Petter Haldén
RAPPORT 2008/8 FÖREKOMSTEN AV ÄNGSNÄTFJÄRIL Melitaea cinxia på norra Gräsö och Örskär Petter Haldén FÖRFATTARE Petter Haldén FOTO FRAMSIDA Ängsnätfjäril, Petter Haldén KARTOR Pers Stolpe Lantmäteriet 2008,
Moult migration of Latvian Whooper Swans Cygnus cygnus
Ornis Fennica 89:273 280. 2012 Brief report Moult migration of Latvian Whooper Swans Cygnus cygnus 1. Introduction ð ð 274 ORNIS FENNICA Vol. 89, 2012 Table 1. Known moulting sites of Whooper Swan cygnets
Arkeologisk utredning Svalsta, Grödinge socken Stockholms län December 2004
Arkeologisk utredning Svalsta, Grödinge socken Stockholms län December 2004 ArkeoDok Rapport 2005:2 Visby 2005-01-24 Arkeologisk utredning över Svalsta, Grödinge socken, Botkyrka kommun, Stockholms län
Olika celltyper Indelningen av organismvärlden. Kap 2 s34-38, kap 3 sid i boken
Olika celltyper Indelningen av organismvärlden Kap 2 s34-38, kap 3 sid 74-78 i boken Den minsta levande enheten? Cellen - encelliga organismer - flercelliga organismer Rita en cell med olika celldelar
Aborter i Sverige 2008 januari juni
HÄLSA OCH SJUKDOMAR 2008:9 Aborter i Sverige 2008 januari juni Preliminär sammanställning SVERIGES OFFICIELLA STATISTIK Statistik Hälsa och Sjukdomar Aborter i Sverige 2008 januari juni Preliminär sammanställning
Upprepade mönster (fortsättning från del 1)
Modul: Algebra Del 2: Resonemangsförmåga Upprepade mönster (fortsättning från del 1) Anna-Lena Ekdahl och Robert Gunnarsson, Högskolan i Jönköping Ett viktigt syfte med att arbeta med upprepade mönster
2 Dataanalys och beskrivande statistik
2 Dataanalys och beskrivande statistik Vad är data, och vad är statistik? Data är en samling fakta ur vilken man kan erhålla information. Statistik är vetenskapen (vissa skulle kalla det konst) om att
Coalescent trees in phylogenetic inference
Serik Sagitov Matematiska Vetenskaper, Chalmers Coalescent trees in phylogenetic inference 1 Example of a species tree and 3 gene trees Species tree S Gene trees G 2 Liang Liu and Dennis K. Pearl Systematic
VARGAR OCH DNA ANALYS
VARGAR OCH DNA ANALYS KAJ GRANLUND FIL.MAG, PENSIONÄR I DAG VARGAR, I MORGON NÅGOT NYTT Junseletiken Värmlandsvarg, Sverige Min jycke från 1965 Nord Odal ulven fra Norge Auli, Finland - När allt som
Tidiga erfarenheter av arvets mysterier
Cellens genetik Cellen Växtcellen Växtcellen Tidiga erfarenheter av arvets mysterier Artförädling genom riktad avel Religiösa förbud mot syskongiftemål Redan de gamla grekerna.. Aristoteles ~350 år före
Metod och teori. Statistik för naturvetare Umeå universitet
Statistik för naturvetare -6-8 Metod och teori Uppgift Uppgiften är att undersöka hur hjärtfrekvensen hos en person påverkas av dennes kroppstemperatur. Detta görs genom enkel linjär regression. Låt signifikansnivån
Laboration 3. Övningsuppgifter. Syfte: Syftet med den här laborationen är att träna på att analysera enkätundersökningar. MÄLARDALENS HÖGSKOLA
MÄLARDALENS HÖGSKOLA Akademin för ekonomi, samhälle och teknik Statistik och kvantitativa undersökningar, A 15 p Höstterminen 2016 Laboration 3 Övningsuppgifter Baserade på datasetet energibolag.rdata