Bevarandegenetik och de svenska nationalraserna: lägesrapport. Mija Jansson

Transkript

1 Bevarandegenetik och de svenska nationalraserna: lägesrapport Mija Jansson

2 Inavel F = 0.125

3 Sjuka/friska hundraser, inavel

4 Förlust av genetisk varation: Founder Genom Ekvivalenter 1 FGE

5 Sjuka/friska hundraser, genetisk variation

6 Flaskhalsar Vargen blev hund Hunden delades i hundraser

7 Nationella och internationella konventioner Konventionen om biologisk mångfald Svenska miljömål Jordbruksverket

8 Hundraser Sverige har bevarandeansvar för (1/3)

9 Hundraser Sverige har bevarandeansvar för (2/3)

10 Hundraser Sverige har bevarandeansvar för (3/3)

11 Metod /Mija Jansson

12 Slump /Mija Jansson

13 Exempel: dansk-svensk gårdshund och västgötaspets

14 Inavelsgrad, Dansk-Svensk gårdshund, 2012 Inavelsgrad 2012: 0,041 Avelsdata 2012: 0,014 Nuläge, medelsläktskap (mean kinship): 0,044 MK är medelinavelsgraden i nästa generation, om alla individer används i avel. Detta innebär att inavelsgradsökningen inte kommer att bli lägre om man inte selekterar individer med lågt mean kinship.

15 Kontroll på skadliga anlag HD hälsoprogram (Polygent +Miljö. Ta hänsyn till släktingars resultat) Kryptorkism Epilepsi Allergi När man inte riktigt vet nedärvningen då är den genetiska variationen i sig extra viktig, som försäkran för framtiden. Med mera?

16 HD Om man exkluderar alla Dansk-Svenska gårdshundar med C, D eller E - Inavelsgrad: 4.0 till 4.1 % - Mean kinship, lika - FGE mot Onödigt att röntga små och lätta hundar? Fjant

17 Genetisk variation, Dansk-Svensk gårdshund FGE (Lacy, 1995) = 11,32 N e /N ~ 1 % N e /N är antagligen den största anledningen till förlust av genetisk variation. N e är här baserat på tikar och hanar använda i aveln. N antal levande djur... Det är en vanlig /miss/uppfattning att den effektiva populationsstorleken är den del av populationen som används i avlen. Den effektiva populationsstorleken är snarare hur stor population populationen fungerar som rent genetiskt.

18 Flaskhalsar Vargen blev hund Hunden delades i hundraser Inmönstringen

19 27,6% av alla födda valpar i Sverige 2014 var i rakt nedstigande led efter Nydningens Dirck.

20 Inavelsgrad, Västgötaspets Nuläge: 0,2702 (Avelsdata: 0,015) 2012: 0,25 (PMx, SKK: 0,09) Utökade träd reducerade antalet founders från 98 (varav 34 svenskreggade) till 18. Nuläge, medelsläktskap (mean kinship): 0,2575 MK är medelinavelsgraden i nästa generation, om alla individer används i avel. Detta innebär att det är svårt att göra väldigt mycket åt den reella inavelsgraden. Men man kan göra sitt bästa., Zoologiska institutionen

21 Kontroll på skadliga anlag HD (Polygent + Miljö. Ta hänsyn till släktingars resultat! Skillnad på genotyp och fenotyp.) Näthinnor (Resultat av studier av stamtavlor antyder en autosomal-recessiv typ av nedärvning?) När man inte riktigt vet nedärvningen då är den genetiska variationen i sig extra viktig, som försäkran för framtiden. Stubbsvans (Letal i dubbel uppsättning.) Med mera?, Zoologiska institutionen

22 Genetisk variation, västgötaspets FGE (Lacy, 1995) = 1,94 N e /N ~ 13 % N e /N är antagligen den största anledningen till förlust av genetisk variation. N e är här baserat på tikar och hanar använda i aveln. N antal levande djur... Effective Population Size (N e ): The size of a randomly mating population of constant size with equal sex ratio and a Poisson distribution of family sizes that would: a) result in the same mean rate of inbreeding as that observed in the population, or b) result in the same rate of random change in gene frequencies (genetic drift) as observed in the population. These two definitions are identical only if the population is demographically stable (because the rate of inbreeding depends on the distribution of alleles in the parental generation, whereas the rate of gene frequency drift is measured in the current generation) /Mija Jansson, Zoologiska institutionen

23 Svensk stövare Medelsläktskapet skulle, som förväntat, minska och den genetiska variationen öka i en sammanslagen stövarpopulation. Stövarraserna lider INTE av några större hälsoproblem.

24 Evolutionärt sett nylig hybridisering mellan hund och varg i Skandinavien (Klütsch et al. 2010) Ny domesticering av varg eller hybridisering år sedan i norra Skandinavien Troligtvis hade den varghund-fenotypen en selektiv fördel då den är väl representerad

25 Diskussion och slutsats Av vilka fler anledningar än sjukdom utesluts djur idag ur aveln? Använd så många av de friska djuren som möjligt i aveln för att bevara så stor del av den genetiska variationen som möjligt.

26 Frågor?