Delprov l, fredag 11/11, 14.00-17.00 Fråga 1 (5 p). Ringa in ett av alternativen (endast ett): A. Vilket påstående är falskt? l. Aminosyror är byggstenar till proteiner 2. Membraner består av peptidoglykan 3. Nukleotider är byggstenar till RNA 4. A och G är puriner 5. Ribos är ett socker B. Vilket påstående är falskt om en eukaryot cell? l. Vissa celler kan röra sig med hjälp av cilier 2. Ribosomerna sitter ibland fast på ER (endoplasmatic reticulum) 3. RNA kan transporteras ut ur kärnan och protein kan transporteras in i kärnan 4. En plasmid kan överföras från en givar-cell till en mottagar-cell genom pili 5. Mitokondrierna innehåller eget DNA C. Vilket påstående är sant om cellcykeln? l. Cellcykeln regleras av tre initieringsfaktorer (IF) 2. Alla celler, från alla organismer, delar sig med hjälp av ett protein som heter FtsZ 3. Under S-fasen i eukaryota celler föreligger DNA:t som heterokromatin 4. Under vissa förhållanden kan en omgång replikation ibland initieras (startas) i E. coli redan innan föregående omgång är avslutad (terminerad) 5. Under cellcykeln växer inte cellen i storlek D. Vilket påstående om lac-operonet är sant? l. IPTG kan binda till repressom 2. Operatorn i fungerar i trans 3. Repressom binder till mrna och blockerar transtationen 4. De tre lac-generna, laca, lacyoch lacz, translateras till ett protein som sen klyvs i 3 delar 5. Laktosmolekylen är en co-repressor E. Vilket påstående är sant när det gäller bakteriell transtations-initiering (start)? l. Det finns en bit icke-kodande RNA (en "leader") innan startkodonet i 3 '-änden av mrna-molekylen 2. Sigma-faktorn hjälper ribosomen att hitta rätt bindnings-ställe 3. Ribosomen känner igen 5' -cap på mrna-molekylen 4. Tre olika elongeringsfaktorer (EF) deltar i initieringen 5. Shine-Dalgarno sekvensen i mrna basparar med 3'-änden av 16S rrna
Fråga 2 (5 p). (O - l rätt = O p; 2-3 rätt = 0,5 p; 4-5 rätt = l p) A. Ange i vilken position i en nukleotid följande element återfinns: l. Kvävebas 2. Fosfatgrupp(er) 3. "deoxy-position" (=skillnad mellan RNA och DNA) 4. Inbindningsposition for nästa inkommande nukleotid under DNA-syntes 5. Kemiska grupper som bildar vätebindningar med en komplementär nukleotid (vilken del av nukleotiden, ej exakt position) B. Ange antal kromosomer i respektive fall: l. En nyfddd E. coli-cell i en långsamt växande kultur 2. En human kroppscell (ej könscell) som befinner sig i Gt-fasen av cellcykeln 3. En human kroppscell som befinner sig i mitos-stadiet 4. En fårdigbildad human spermie 5. En nyligen befruktad human äggcell Rätt eller fel? Skriv R eller F efter varje påstående: C. mrna splicing: l. Finns i eukaryoter och arkeer 2. Kan leda till att proteiner med olika sekvens kan bildas från samma gen 3. Sker i cellkärnan 4. Sker innan poly-adenyleringen 5. Tar bort exonema från pre-mrna:t Rätt eller fel? Skriv R eller F efter varje påstående: D. Det finns: l. Fler aminosyror än kodon 2. Fler kodon än antikodon 3. Fler trna-varianter än kodon 4. Fler kodon än aminoacyl-trna-syntetaser 5. Fler trna-varianter än aminoacyl-trna-syntetaser E. Välj två (korrekta fdrstås) termer från de fyra i följande lista och skriv in dem efter respektive organism: autotrof l fototrof l heterotror l kemotrof l. En bäver 2. Ett grässtrå 3. En kantarell 4. En bakterie som växer i en miljö där det finns svavelföreningar men inga organiska föreningar 5. En blågrön (cyano) bakterie
Fråga 3 (5 p). Vilken term eftersöks? A. Samlingsnamn för biokemiska nedbrytningsprocesser: B. Den uppluckrade formen av eukaryot DNA under interfas: C. Området i en prokaryot cell där DNA:t (kromosomen) är lokaliserad: D. Den period i den eukaryota cellcykeln då de replikerade kromosomerna separeras från varandra: E. Förklara Chargaffs regel (det finns flera, här avses enbart den vi diskuterade under kursen).
IBGlOl: Genetik och Genteknik, HT 2011 Fråga 4 (5 p). Vad händer med transkriptionsaktiviteten (expressionen; genuttrycket) i fdljande fall? (Svara med "ökar", "minskar" eller "ofdrändrad".) A. lac-operonet: halten laktos ökar från mycket låg till mycket hög: B. /ac-operonet: repressorn har muterats så att den inte längre kan binda till operatorn och halten laktos ökar från mycket låg till mycket hög: C. lac-operonet: halten cykliskt AMP i cellen minskar från mycket hög till mycket låg: D. trp-operonet: halten av tryptafan minskar från mycket hög till mycket låg: E. trp-operonet: de två kodon i learler-sekvensen som normalt kodar for tryptafan har båda muterats tillleucin-kodon, och halten av arginin ökar från mycket låg till mycket hög (tryptofan-halten är ofdrändrad):
Fråga 5 (5 p). Rita en replikationsgaffel (replisom) som replikerar kromosomen i E. coli. Namnge minst 5 av de proteiner som ingår och beskriv med ord funktionen för respektive protein. Obs: komponenter som endast ingår i initieringsfasen (starten) av replikationen ger inga poäng.
Fråga 6 (5 p). Beskriv eukaryot transkriptions-initiering (start). Ange vilka element och proteiner som är inblandade och beskriv kortfattat hur processen (enbart initiering, elongering och terminering ger inga poäng) går till i stora drag. Rita en skiss (måste ingå om du vill ha full poäng) som illustrerar ditt svar och markera tydligt de olika komponenternas beteckningar och positioner.
Fråga 7 (5 p). Beskriv pågående translation ( elongering) i en bakterie. Rita en skiss (måste ingå om du vill ha full poäng) där du anger alla komponenter som deltar i processen och förklarar de olika molekylära stegen. Obs: beskrivningar av initiering (start) och terminering (stopp) av translation ger inga poäng, frågan avser endast elongeringsfasen.
Fråga 8 (5 p). Förklara vad som menas med fenomenet "wobble". Börja med att forklara med ord vad det betyder: vad är det som avses och vilka är konsekvenserna? Rita sedan en skiss (måste ingå om du vill ha full poäng) där du visar i detalj hur det sker. Glöm inte att ange 5' och 3' på ingående komponenter!