Förläsningens innehåll. Cellsignalering och signaltransduktion. Cellsignalering

Relevanta dokument
Receptorer - tyrosinkinas

Signaltransduktion. Signalling by the membrane. Fosfatidylinositol och sekundära budbärare CMB

Receptorer - kinaser. Receptorer med kinas aktivitet. Cellsignalering. Celler är beroende av olika signaler (A-G) som kommer utifrån

5. Transkriptionell reglering OBS! Långsam omställning!

CELLSIGNALERING CELLSIGNALERING. alla levande celler tar emot och skickar signaler

CELLSIGNALERING CELLSIGNALERING. alla levande celler tar emot och skickar signaler

Cellbiologi: Intracellulär sortering och cellsignalering

Integrerad signaltransduktion

Signaltransduktion och Receptorfarmakologi. Signaltransduktion och Receptorfarmakologi. RTE-Modellen

Maria Nyström Jessica Leander Louise Danielsson. G-proteinet Ras. 3 juni Handledare: Hans Eklund

Kursbok: The immune system Peter Parham

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Grupp: Pyrola Sandberg, Hanna Norlin och Hanna Arvidsson Kurs: Biokemi VT 2003 Inlämningsdatum: Handledare: Hans Eklund

Proteiner. Kap 3,

STOCKHOLMS UNIVERSITET. Institutionen för biologisk grundutbildning. Tentamen i Molekylär cellbiologi 10 p Namn: _.. Personnummer:.

Lite basalt om enzymer

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Apoptos Kap 18. Alberts et al., Essential Cellbiology 4th ed, 2014 Apoptos kap 18, sid

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

Cell och molekylärbiologi (BL3008) Omtentamen CMB-II (11 hp) Kod: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Neuronens Fysiologi 1

Instuderingsfrågor till Cellbiologi av Charlotte Erlanson-Albertsson och Urban Gullberg

Tentamen i Molekylär Cellbiologi

CELLKÄRNAN INNEHÅLL CELLKÄRNAN. cellkärnan

Frå n åminosyror till proteiner

Omtenta NMET2 (datum 4/2 2012) (totalt 63 p)

Kapitel Var är vi i kursen???

Från receptorpotential till aktionspotential

Tentamen NMET2 VT2015 (17/4 2015) (Totalpoäng 55 p)

Cellcykeln. Cellcykelreglering. Signaler för reglerad celldelning. Skall cellen dela sig på nytt? Molekylär kontroll av cellcykeln CMB

IDENTITETSBLAD Dugga

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov 2010

Citronsyracykelns reaktioner sker i mitokondriematrix. Mitokondrierna kan sägas vara cellens kraftstationer p g a den stora produktionen av ATP.

De olika typer av T celler är specialiserade på att identifiera och bekämpa patogen på olika sätt.

Cellens energivaluta är främst ATP adenosintrifosfat. Finns även andra analoger till ATP, t ex UTP uridintrifosfat där kvävebasen adenin bytts mot

Delprov Dugga med svarsmallar Biokemi BI0968, 8:e dec 2008, Max poäng = 50 p. Preliminära betygsgränser: 3 = 27p; 4 = 35p; 5 = 43p.

Molekylärbiologi: Betygskriterier

Hierarkisk proteinstruktur. Hierarkisk proteinstruktur. α-helix Fig 3-4. Primärstruktur Fig 3-3

Biologi 2. Cellbiologi

Proteiner. Biomolekyler kap 7

KOMMENTARER TILL KAPITEL 7 OCH 8. Den centrala dogmen är gemensam för eukaryoter och prokaryoter.

Anatomi -fysiologi. Anatomy & Physiology: Kap. 18 The endocrine system (s ) Dick Delbro. Vt-11

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

RNA-syntes och Proteinsyntes

Cellen och biomolekyler

Cytostatika (vt -16) Kent Jardemark

Tentamen i Molekylär Cellbiologi 9 p Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Svar: 3. a) Vid enzymkatalys binder enzymet in substratet/substraten till aktiva ytan. Närhet och orientering är förutsättning för katalys.

Övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012

Biomolekyler & Levande organismer består av celler. Kapitel 3 & 4

Enzymer Farmaceutisk biokemi. Enzymet pepsin klyver proteiner i magsäcken till mindre peptider

Tentamen i Cellbiologi med Biokemi

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov

Tentamen. Lycka till! Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kurskod: MC1004. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum Skrivtid 4h

Tenta 1 Cellbiologi ht Grundbegrepp

Medicin A, Medicinsk temakurs 2, 30 högskolepoäng Tema Nutrition/Metabolism/Elimination

Översikt metabolismen

Tentamen i Molekylär Cellbiologi 9 p Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Sluttentamen Bke2/KE0003, 29:e Oktober 2003, Max poäng = 94 p. Preliminär gräns för godkänd = 50 p (53 %).

Poäng: Godkänt 35 p. Max 70 p.

Naturvetenskaplig fakultetsnämnd

Svarsmall Tentamen NME Termin 2, 22 november 2013

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT PROTEINER OCH ENZYMER (sid )

Från cell till individ. Kap 2

Skademekanismer i hjärnan efter hjärnischemi

VI MÅSTE PRATA MED VARANDRA CELLENS KOMMUNIKATION

1. a) Markera polära och icke-polära delar i nedanstående molekyl. Vilken typ av ämne är det, och vad heter molekylen? (2p)

Transkription och translation = Översättning av bassekvensen till aminosyrasekvens

Proteiner. Biomolekyler kap 7

Hastighet HOCH 2. *Enzymer är Katalysatorer. *Påverkar inte jämvikten

KARLSTADS UNIVERSITET

Tentamen. Kurskod: MC1004. Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum Skrivtid 4h

Neuronens Fysiologi 3. Receptorer G-protein kopplade Ligand aktiverade, dvs receptorkanaler

DIFFERENTIERING APOPTOS EMBRYOGENES STAMCELLER

LÄKEMEDELSMETABOLISM: MEKANISMER FÖR INTERINDIVIDUELL VARIABILITET

Kunskapsmål ht (reviderade )

Proteinernas uppbyggnad, funktion och indelning. Niklas Dahrén

Innehåll. Del 1 Cellbiologi. En del oligosackarider fungerar som adresslappar 28 Bakterier fäster till kolhydratstrukturer 28.

/Molekylär Fysiologi: version

Cellen och vävnader. Innehåll. Kursmål SJSE11 Människan: biologi och hälsa

Enzymologi och proteinsortering

Molekylär Fysiologi: version

Tentamen i Medicinsk kemi för biomedicinare 2010:

Tenta 2 Cellbiologi ht 2015

Cellen och vävnader. Innehåll. Cellernas storlekar SJSE11 Människan: biologi och hälsa

CELLKÄRNAN. kap 9 + fig 16.24, s , fig i 4th edition Chromatin: s , th edition. INNEHÅLL

Sluttentamen Biokemi BI1032, 14:e januari 2010, Max = 100 p. Preliminära gränser: 3 = 55p; 4 = 70p; 5 = 85p.

Innehåll. Cellfysiologi och mikrobiologi. Humana cellers storlekar. Cellmembranets uppbyggnad Ambulans- och akutsjukvård

Medicin, Molekylär cellbiologi, 15hp

Från cell till individ. Kap 2

Neuronens Fysiologi 3. Jonkanaler Ligand aktiverade

Kodnummer: 1) Beskriv processerna som sker i replikationsgaffel (eng. replication fork)? (3)

Tentamen i Cellbiologi med Biokemi

Tentamen i Biokemi 2, 7 juni Hur samverkar katabolismen och anabolismen i en cell? Vad överförs mellan dessa processer?

Preparat ur ett populärvetenskapligt perspektiv

IMMUNOLOGI. Anna Carlsson, Medical Manager

Namn:... Årskurs... Personnummer... Glöm inte skriva namn på immunologidelen också

Intracellulära organeller, proteinmodifiering och transport, endo/exocytos Kap10 + delar av kap 13

Preliminärt chema: kan förekomma små förändringar på kursstart

Användning av kol och energikällor

Transkript:

Cellsignalering och signaltransduktion CMB Förläsningens innehåll Cellsignalering begrepp Signalermolekyler / ligander Receptorer Signalvägar och signaltransduktion Förändring av proteiners aktivitet Fosforylering G-proteiner är On/Off switchar Celler är beroende av olika signaler (A-G) som kommer från andra celler Extracellulär signalering Cellsignalering a) Extracellulär signalering (cellkommunikation) b) Intracellulär signalering (signaltransduktion) a) b) I frånvaro av signaler kan celler dö/gå i apoptos 1

Signalmolekyl Receptor Aktiverad signalväg (amplifiering) Effektorer Extracellulär signalering Utsöndrade lösliga signaler Endokrin signalering Parakrin signalering Autokrinsignalering Signalerna! 1. Utsöndrade lösliga molekyler 2. Bundna molekyler (t ex cellytan) 2

Utsöndrade extracellulära signalmolekyler - endocrina & parakrina Stor variation, exempel: Små molekyler: (transmittorsubstanser; GABA, DOPA, Acetylcholin, Glutamat, ATP mm) Lipofila hormoner (steroidhormoner, corticoider, thyroxin mm) Peptider (neuropeptider) Proteiner (proteinhormoner, tillväxtfaktorer, cytokiner, morfogener) Polysackarider (heparin, heparansulfat) Bundna extracellulära signaler Bundna till celler Membran proteiner Glykoproteiner Bundna till extracellulärt matrix (ECM) Proteiner Glycoproteiner Proteoglykaner Extracellulära signalerna kallas ligander och binder till receptorer Receptorer Några begrepp: Ligandspecificitet: Receptorer är protein som binder specifika ligander Aktiverad receptor : Receptor som bundit ligand Jämvikt mellan inaktiva och aktiva receptorer beror av [ligand] Receptor - Ligand interaktion Affinitet (Kd, bindningskonstant) Bindningsställen (antal receptorer/cell) 3

Receptorer Huvudklasser av receptorer Ligandspecifika (extracellulär domän) Aktiverar specifika svar i cellen (inåt) Aktiverar intracellulär signalering sk. Signaltransduktion Enzym-kopplade receptorer Jonkanal-kopplade receptorer G-protein-kopplade receptorer (7-TM) 7-TM receptorer utan G-protein Andra.. ex nukleära receptorer Heterogena klasser baserade på strukturella och funktionella likheter Enzym-kopplade receptorer Extracellulär-, transmembran- och intracellulär domän Receptorerna kan själva vara ett enzym Kinas, fosfatas, cyclas Receptorerna kan binda/associera med ett enzym Kinas, fosfatas, proteas Receptorer med enzymaktivitet (enzym-kopplade receptorer) Receptor tyrosin kinaser (RTKs) tillväxtfaktorreceptorer Cytokin-receptorer (typ I och typ II) TGF-ß receptorer (Transforming growth factor-ß) Receptorfosfataser TNFR (Tumour necrosis factor receptors) 4

Growthhormone (GH) and its receptor (GHR) Jonkanal-kopplade receptorer Ligand-reglerad jon-transport/flöde över membran Ofta på nervceller Receptortyp: cytokinreceptor (typ 1) G protein-kopplade receptorer 7-TM struktur Binder till och reglerar tri-meriska G protein G-protein= GTP bindande protein Affinitet och Dissociationskonstant" Ligand-receptor binding - enkel reversibel reaktion/jämvikt R + L κ off κ on RL κ d = [R][L] [RL] 5

EPO: erythropoietin reglerar bildandet av röda blodkroppar Intracellulär signalering Aktiverade receptorer orsakar ett cellulärt svar: Effekter i cytoplasman eller på membranet Snabbt svar Aktivering eller hämning av enzymaktivitet. Förändrad aktivitet av cytoskelett / cellrörelser (motilitet). Effekter på genuttryck (i kärnan) Varaktigt svar Aktivering eller inhibering av gener. Påverkan av transkriptionsfaktorer. 6

Signaltransduktion Signalering och effektorer: förändrade protein aktiviteter/funktioner Leder till: 1. Snabbt cellsvar (Kap 15) Short-term cellular responses metabolt svar, cell form, cellrörelser, kontraktioner, frisättning av joner/signaler, modulering av signaltransduktion etc. Signalmolekyl Receptor Aktiverad signalväg (amplifiering) Effektorer 2. Varaktigt cellsvar (Kap 16) Long-term Reglering av genexpression: Celldelning, Celldifferentiering, Varaktiga förändringar i cellen. Etc. nucleus Cellulärt svar: olika effektorer 1) Aktivering av proteinkinaser Nästan alla signalvägar aktiverar kinaser 2) G-proteiner (molekylära switchar ) 3) Aktivering av second messengers 4) Aktivering av transkriptionsfaktorer (nukleära/cytosolreceptorer) 5) Öppning av jonkanaler 6) Proteolytisk aktivering 1. Aktivering av proteinkinaser PROTEINKINASERING Reglering av proteiners funktion och aktivitet Enskilt viktigaste regleringsmekanismen Leder i många fall till förändrad proteininteraktion hur proteiner binder till varandra 7

Proteinkinasering Regulativ process Aktivera Inaktivera Kinasering av aminosyrarester med hydroxigrupp på sidokedjan, OH Tyrosin- (Y), Serin- (S), Threoninrester (T), Proteinkinasering Några begrepp: Proteinkinas = enzym som fosforylerar (kinaserar) ett substrat Proteinkinasering = Proteinfosforylering fosfo-tyrosin = kinaserad tyrosinrest.. fosfo-serin = kinaserad serinrest.. Proteinfosfatas = enzym som de-fosforylerar ett substrat (tar bort fosfatgrupper från substratet) (Histidinrester (H)) Proteinkinas fosforylerar specifika proteiner Substratspecificitet: Aminosyran: Serin/threoninrester (S/T) Tyrosinrester (Y) Tyrosin och Serin/Threonin (Y, S/T) Dual specificity kinaser - (Histidin (H)) Proteinet: omgivningen runt Y, S/T Proteinkinaset benämns utgående ifrån vilken aminosyra rest det fosforylerar Tyrosin (Y) kinaser Serin/threonin (S/T) kinaser Dual-specificity kinaser (både Y och S/T) Histidin (H) kinaser 8

Extra slide Cytosoliska kinaser och Receptorkinaser Cytosoliska Tyrosinkinaser Serin/threonin kinaser Dual-specificity kinaser Receptor- Tyrosinkinaser Serin/threonin kinaser a Fosforyleringen kan leda till ändrad proteinaktivitet / funktion genom: Ändrad protein-interaktion: se ex. i bild a ex. Fosforylering av tyrosin kan leda till att specifika proteiner (adaptorer) binder till regionen med fosfotyrosinresten Ändrad proteinkonformation: se ex. i bild b ex. Fosforylering av T och Y kan leda till konformationsändring i ett enzyms aktiva säte och därmed aktivera enzymet (ökar affiniteten mellan enzymet och dess substrat) b 2. G-proteiner är molekylära On-off switchar G-protein = GTP-bindande proteiner Trimeriska G-protein (GPCR) Små Ras -lika G-protein (Ras, Rho, Rac mfl ) PÅ och AV beroende på om de binder GTP eller GDP Deras förmåga att binda och aktivera andra proteiner regleras G-protein on off switchar 9

3) Syntes/aktivering av sekundära budbärare second messengers Second messengers cykliskt AMP (camp) cykliskt GMP (cgmp) DAG (diacylglycerol) IPs Fosfoinositider (IP 3 ) Ca 2+ Kväve oxid (NO) Höga konc. av 2d messengers sätter igång det cellulära svaret De vanligaste sekundära budbärarna Second messengers amplifierar och sprider ett svar i cellen från receptorer Animering Lodish 2d messengers NO Kväveoxid: påverkar bla glatt muskulatur 10

4a. Aktivering av transkriptionsfaktorer Ex. cytokinreceptorer Aktivering (ex. fosforylering) av transkriptionsfaktorer leder till translokation från cytoplasman in i kärnan Tex. Exponering av nukleär lokaliserings signal (NLS) I kärnan kan transkriptionsfaktorerna binda till regulativa element pch stimulera/inhibera transkriptionen 4b) Direkt Ligand-aktivering av transkriptionsfaktorer Nukleära receptorer är både receptor och transkriptionsfaktor Ligander: Steroidhormoner, tyroxin, retinoider 5) Öppning av jonkanaler Transmittorsubstanser (Ca 2+, Cl -, Na +, K + ) 11

6) Proteolytisk nedbrytning resp klyvning Ex Wnt signalering Aktivering genom att en inhibitor bryts ner Aktivering genom att blockera nedbrytningen av transkriptionsfaktor Inhibitorn = Protein som hindrar eller binder upp tex transkriptions co-aktivatorer och därmed hindrar dem att gå in i kärnan Reglerad nedbrytning sker med ubiquitinylering och proteasomen Kaskadeffekt amplifiering av signalen Sammanfattning Celler kommunicerar med varandra med hjälp av olika extracellulära signaler sk. ligander. Receptorer binder specifika ligander och förmedlar vanligtvis signalerna över cellmembranet. Ligandaktiverade receptorer startar intracellulära signalvägar sk. signaltransduktion. Olika receptorer använder sig av olika eller överlappande intracellulära signalvägar. 12