Övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012 1. Förklara kortfattat följande ord/begrepp. (4p) - gen - genom - proteom - mutation - kofaktor - prostetisk grupp - ATP - replikation Celler: 2. Rita en eukaryot cell och namnge de komponenter du ritar ut. (4p) 3. Nämn tre skillnader mellan en eukaryot och en prokaryot cell. (3p) 4. Vad är det som skiljer en växtcell från en djurcell? (2p) 5. Namnge tre olika delar av en eukaryot cell och beskriv kortfattat en funktion i respektive del. (6p) 6. Neutrallipider och fosfolipider har olika funktioner i levande celler. Vilka funktioner har de? Vilka egenskaper hos de två olika lipiderna gör dem lämpliga för sina respektive funktioner? Förklara. (6p) 7. Virus definieras vanligen inte som liv. Förklara? (2p) Proteiner och membraner: 8. Aminosyrorna kan delas in i fyra grupper baserade på sina kemiska egenskaper. Vilka är dessa? (4p) 1
9. Aminosyror har olika egenskaper. Var i ett globulärt protein är det störst chans att du hittar en hydrofob respektive en hydrofil aminosyra? (2p) 10. Namnge en aminosyra som saknar stereogent centrum och en som har ett stereogent centrum? (2p) 11. Hur många N-terminala aminosyror finns det i ett protein med 4 subenheter? (1p) 12. Var i ett globulärt protein förväntar du dig att finna aminosyrorna Arg, Leu, Asp, Val, Ser respektive Thr? (3p) 13. Rita strukturformeln för en tripeptid, som har en polär oladdad aminosyra som N-terminal, en basisk i mitten och en opolär, som C-terminal vid ph 7.0. (5p) 14. På bilden ovan ser ni en peptid med aminosyrorna serin, lysin och glycin. Definiera vad som menas med ryggrad, C-terminal, N- terminal och sidokedja i samband med proteiners struktur. (4p) 15. Proteiner kan denatureras. Nämn två faktorer, som denaturerar proteiner? Beskriv kortfattat vad som händer med proteinet under denatureringsprocessen. (4p) 16. Biologiska membraner består av lipider och proteiner. Vilken är den vanligaste lipiden i ett membran? Nämn två faktorer, som 2
påverkar membranrörligheten? Beskriv hur de påverkar rörligheten. (8p) 17. Rita en skiss av ett biologiskt membran och förklara vad som menas med ett perifert respektive integralt membranprotein. (5p) 18. En fosfolipid är en amfipatisk molekyl. Beskriv hur en fosfolipiden ser ut och förklara varför den är amfipatisk. Rita gärna. (3p) 19. En annan vanlig lipid i membranet är utgångssubstans för syntes av steroidhormoner. Vilken? (1p) 20. Vad menas med fluid mosaic model. (2p) 21. Proteiner kan anta en väldigt ordnad 3-dimensionell struktur. Vilka typer av sekundärstruktur har detta protein? Beskriv dessa kortfattat. (4p) 22. Ett protein har fyra strukturella nivåer, sekundär struktur är en av dem. Namnge de tre andra strukturerna, som ett protein kan anta och beskriv alla fyra strukturerna kortfattat. (5p) 23. Har alla proteiner kvartär-struktur? Vilka bindningar och krafter stabiliserar proteinstrukturen? Vad är den specifika funktionen för cysteiner? (6p) 24. Var i ett globulärt protein är det störst chans att du hittar en hydrofob respektive en hydrofil aminosyra? (4p) 3
Enzymer: 25. Vad är ett enzym? (3p) 26. Vad är ett aktivt centrum hos ett enzym. Måste aminosyror i det aktiva centret vara nära varandra i primärsekvensen? (3p) 27. Vissa proteiner är enzymer och har katalytisk förmåga. Nämn tre egenskaper, som karakteriserar ett enzym. Vilken annan typ av molekyl har också katalytisk förmåga? (4p) 28. Enzymaktiviteten kan påverkas? Nämn 3 faktorer. (3p) 29. Kofaktorer behövs för att många proteiner ska fungera effektivt. Ge exempel på två olika grupper av kofaktorer? (2p) 30. Varför tror du att absoluta merparten av enzymer är proteiner? (2p) Genetisk information: DNA/RNA 31. I genomet finns den genetiska informationen lagrad. DNA och RNA är makromolekyler, som består av nukleinsyror. Ange tre strukturella skillnader mellan DNA och RNA. Det finns tre sorters RNA i en cell. Vilka? (6p) 32. Förklara begreppet komplementaritet i samband med nukleinsyror. (2p) 33. Beskriv kortfattat genetikens centrala dogm (lärosats). (2p) 34. Vilken funktion har trna i proteinsyntesen? (2p) Metabolism, kolhydrater och lipider: 35. Beskriv kortfattat skillnaden mellan anabolism och katabolism. (4p) 4
36. ATP kan bildas på tre principiellt olika sätt, substratnivå fosforylering, fotofosforylering och oxidativ fosforylering. Vad skiljer de tre olika processerna. Förklara och berätta var de kan ske. (6p) 37. Varför är fett mer energirikt än kolhydrater? (2p) 38. Beskriv kortfattat hur kan ATP utföra arbete? (2p) 39. Är syre ett oxidationsmedel eller ett reduktionsmedel? (1p) Glykolysen: 40. Var i cellen sker glykolysen? (1p) 41. Under vilka betingelser sker bildningen av laktat i glykolysen? Vad är netto utbytet av ATP under dessa betingelser? (4p) 42. Vilken molekyl bryts ned i glykolysen och vilken produkt erhålls i slutet? Hur många ATP erhålls? (3p) 43. Visa de reaktioner i glykolysen där ATP bildas respektive förbrukas. (4p) 44. Viket enzym är ett viktigt nyckelsteg i glykolysen? Hur påverkas enzymet av ATP, AMP och citrat? (4p) 45. Nämn två elektronbärare? (2p) 46. Vilka två molekyler är kopplingen mellan glykolysen och citronsyracykeln? (2p) Citronsyracykeln, β-oxidationen och andningskedjan: 47. Var finns de enzymer som behövs för citronsyracykeln och β-oxidationen? Vilken molekyl bryts ned under β-oxidationen? (3p) 5
48. Mitokondrierna kallas för kraftstationen. I mitokondrien utvinns djurcellens huvudsakliga energi (ATP). Rita och beskriv de olika delarna i en mitokondrie. Visa var i mitokondrien citronsyracykeln och β-oxidation sker. (6p) 49. Citronsyracykeln är beroende av syre för att kunna fungera, även fastän inget syre ingår i dess reaktionssteg. Förklara varför? (2p) 50. Andningskedjan sker i mitokondrierna. Rita schematiskt de fem komponenterna i andningskedjan. Ange var andningskedjan sker. Rita in hur protonerna pumpar och elektronernas transport. Förklara kortfattat med hjälp av bilden hur ATP bildas. (6p) 51. Vad är det som energimässigt driver ATP syntesen i oxidativ fosforylering. (2p) 52. Hur många acetyl-coa kan man få från en fettsyra med 18C? (2p) Fotosyntesen: 53. Fotosyntesen i gröna växter sker i de organeller, som kallas kloroplaster. Fotosyntesen delas upp i två faser. Varför är koldioxid-fixeringen beroende av ljusfasen i fotosyntesen? Vad gör en klorofyll-molekyl? (5p) 54. Rita en kloroplast, ange de olika delarna och beskriv var koldioxid-fixeringen (mörkerfasen) respektive ljusfasen sker. (7p) Lycka till! 6