Institutionen för biomedicin Avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi Läkarprogrammet termin 1

Transkript

1 Avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi Läkarprogrammet termin 1 Delförhör 1 i Molekylär cellbiologi kl Namn:.. Personnr:. Detta delförhör har kodnummer OBS! Skriv ditt kodnummer på samtliga sidor Namn och personnummer endast på denna sida Denna sida kommer att avlägsnas före rättning Svaren måste alltid skrivas på samma papper som frågan. Om utrymmet ev. inte räcker till, använd papperets baksida. Resultatet kommer att anslås senast 15 dagar efter att delförhöret skrevs. Tot 28 p: 0-5p = 0 bonuspoäng 6-13 = = = 3 LYCKA TILL! RIV AV OCH SPARA Kom ihåg-lapp för kod Delförhör 1 T DIN KOD:

2 1. (CG 2p) 2 a. Kan man ärva mutationer i det mitokondriella genomet från både sin mor och far? (1 p) svar: a. Nej. Det mitokondriella genomet är maternellt nedärvt, d.v.s. kommer bara från modern. b. Hur många kopior av det mitokondriella genomet (mtdna) återfinns i en cell? (1p) Svar: b tals (Var liberal i rättningen. Antalet varierar mellan 100 tals till )

3 3 2. (ST 2p) Lipider Ange strukturformeln för kolesterol. Svar Stryer sid 362

4 4 3. (PE 4p) Aminosyror. Struktur, syntes och funktion a. Ange strukturformeln för dipeptiden Gly Ala vid ph p Svar: se lärobok för aminosyror observera laddningar på n och C terminal. b. Vilka är de två mest basiska aminosyrorna? 2p Svar: Lysin, arginin

5 5 4. (ST 2p) Kolhydrater. Struktur, syntes och funktion Glykoproteiner kan ha N linkade och/eller O linkade kolhydrater. Vad innebär att ett socker är N linkat? Svar: Det sitter bundet till kvävet i sidokedjan på en asparagin. (Stryer sid 340)

6 6 5. (PE 4p) Från aminosyror till 3D struktur a.vad benämnes det smittämne, tidigare kallat "slow virus", som kan förorsaka Kuru, BSE samt Creutzfeldts-Jakobs sjukdom? Förklara den sjukdomsframkallande mekanismen! 2p Svar: Prioner. Den normala konformation PrPC ändras till PrpSC vilket medför att prionproteiner bildar filament som i sin tur kan fragmenteras och bilda nya filament. Processen medför celldöd bland neuroner och ger ett ʺtvättsvampslikanandeʺ utseende av infekterad vävnad. b. Beskriv en alfa-helix. Visa hur vätebindingarna som stabiliserar helixen förlöper samt vis hur aminosyrornas sidokedjor är orienterade. 2p Svar: se lärobok.

7 7 6. (BM 2p) Att utforska proteiner Vad är det för skillnad mellan en polyklonal respektive monoklonal antikropp med avseende på antigen igenkänning? Svar: saknas

8 8 7. (DB 2p) Enzymer 1. Diagrammet nedan visar koncentrationen av produkten P som en funktion av tiden i reaktionen R P Den inritade kurvan visar förloppet för en okatalyserad reaktion. Rita in ett exempel på hur kurvan skulle se ut för en katalyserad reaktion. Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan kurvorna/förloppen. [P] Svar: tid Någonting i den här stilen. Den katalyserade reaktionen går fortare, därför stiger kurvan brantare. Men katalysen påverkar inte jämvikten, därför har kurvorna samma platå nivå (jämviktskonc.)

9 8. (DB 2p) Enzymklasser och co-faktorer 9 I det aktiva centret på chymotrypsin finns en kritisk serin sidokedja som katalysen är beroende av. a vad är det för reaktion som serinet genomgår i katalysens startskede som gör den så reaktiv att den kan attackera substratet? Svar: a) Serinet avger en vätejon och bildar en alkoxidjon ( CH2 O ) (ordet ʺalkoxidjon ʺ är inte nödvändigt för poäng). b. Varför är det så viktigt att miljön kring serinet är hydrofob? Svar: b) Serinet måste ha en vattenfattig miljö annars skulle den bli protonerad igen av en vattenmolekyl eller H3O + jon innan den hinner reagera med substratet.

10 10 9. (ST 2p) Hemoglobin Om man tillbringar en eller flera dagar på mycket hög höjd (där partialtrycket för syre är 75 torr) så kommer koncentrationen av 2.3bifosfoglycerat (2,3 BPG) inuti erytrocyterna att öka. Vad får det för effekt på hemoglobinets syrebindande förmåga? Svar: Hemoglobinets syrebindande förmåga kommer att minska så att en större andel syre avges till vävnaderna (Stryer Sid A5 (Answer to problems) Chapter 7 fråga 5.

11 (PE 2p) Nukleotider: Struktur, syntes och funktion. Visa på den strukturella skillnaden mellan än ribonukleosid och en deoxyribonukleosid. Vad kallas det enzym som bildar deoxyribonukleotider (rndp blir dndp)? Svar: 2 OH mot 2 H. Ribonukleotidreduktas.

12 (ST 2p) Proteinreglering Beskriv hur proteasomen är uppbyggd. Svar Stryer sid 701

13 12. (JC 2p) Datalab hemoglobin 13 Kolmonoxid är en gas som är toxisk för människan. Dess toxiska effekt är beror på dess bindning till hemoglobinets hemegrupp. a. Kolmonoxid vill helst binda till hemegruppens järn i 180 grader. Vad hindrar kolmonoxid från att göra det? Svar: Det distala histidinet är fysiskt i vägen för kolmonoxid om den skulle binda i 180 grader. 1p b. Varför krävs det låga mängder kolmonoxid för att blockera hemoglobinets syre transport? Svar: När kolmonoxid binder till en subenhet på hemoglobinet sker en allosterkonformations förändring i de andra subenheterna som binder in syre starkar. Den starkabindingen av kolmonoxid hindrar syrena i de andra subenheterna att avges ute i vävnaden. 1p