KOMMENTARER TILL KAPITEL 6

Relevanta dokument
KOMMENTARER TILL KAPITEL 6

Tentamensmoment: Rättningspoäng:...av max 25 p. Namn:. Pnr:. Betyg:... Distanskurs. Lärare: Malte Hermansson

Fråga 3 Varje korrekt besvarad delfråga ger 0,4 p. Det är inget avdrag för felaktigt svar. (2p) En organism som bara kan växa i närvaro kallas

Cellen och biomolekyler

Så började det Liv, cellens byggstenar. Biologi 1 kap 2

Energi, katalys och biosyntes (Alberts kap. 3)

KOMMENTARER TILL KAPITEL 9 OCH KAPITEL 16

NAMN:. PERSON NR:.. TERMIN DÅ KURSEN LÄSTES:

Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p,

Kemiska reaktioner och reaktionshastigheter. Niklas Dahrén

Biologi. Läran om livet. En naturvetenskap. Terminologi ett viktigt verktyg Var behöver vi biologi?

LIVSMEDELS MIKROBIOLOGI

KOMMENTARER TILL KAPITEL 1, 2, 11

Biologi 2. Cellbiologi

Övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012

RÖTNINGENS MIKROBIOLOGI NÄRINGSLÄRA BIOGASPROCESSEN PROCESSDRIFTPARAMETRAR PROCESSTÖRNING

Välj rätt typ av bakteriepreparat vid ensilering av din vallgröda

Prokaryota celler. Bakterier och arkéer

Cellens metabolism (ämnesomsättning) Kap8 Sidor i boken Enzymer: Metabolism: , , ,257,

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT PROTEINER OCH ENZYMER (sid )

Medicinsk grundkurs. Cellen och genetik. Datum

PROVGENOMGÅNG AVSNITT 1 BIOLOGI 2

Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Fråga 1 (2p) Fråga 2 (2p) Fråga 3 (2p)

Översikt metabolismen

Cellens metabolism (ämnesomsättning)

Biomolekyler & Levande organismer består av celler. Kapitel 3 & 4

Tentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Fråga 1 (2p) Fråga 2 (2p) Fråga 3 (2p)

Tenta i växtfysiologi (BL3005)

Enzymer Farmaceutisk biokemi. Enzymet pepsin klyver proteiner i magsäcken till mindre peptider

NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra

Dessa bildar i sin tur stärkelse som växten lagrar som näring.

Innehåll. Cellfysiologi och mikrobiologi. Humana cellers storlekar. Cellmembranets uppbyggnad Ambulans- och akutsjukvård

Hur celler får energi från föda (Alberts kap. 13) Introduktion

Biogasanläggning Energibesparing med avloppsvatten Peter Larsson ver 2

Lite basalt om enzymer

Fig 1-29 Alla celler har utvecklats från samma urcell för ca 3,5 miljarder år sedan Fem kungadömen och Tre domäner

Användning av kol och energikällor

DEN MINSTA BYGGSTENEN CELLEN

Inverkan av kylningsförloppet på tillväxt av bakterier i gårdstankmjölk.

Skrivet av: Anders Flodberg Galoppkurs

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT METABOLISM (sid )

Sockrets funktionella egenskaper

KEMA02 Föreläsningsant. F2 February 18, 2011

Driftoptimering hur säkerställer vi att vi gör rätt? Upplägg. Förutsättningar för en bra gasproduktion. Vem är jag och vad sker på SLU?

Laboration Enzymer. Labföreläsning. Introduktion, enzymer. Kinetik. Första ordningens kinetik. Michaelis-Menten-kinetik

KOMMENTARER TILL KAPITEL 7 OCH 8. Den centrala dogmen är gemensam för eukaryoter och prokaryoter.

10:40 11:50. Ekologi. Liv på olika villkor

Cellbiologi. Cellens delar (organeller)

BIOLOGI. Vår fantastiska kropp

Mikroorganismernas storlek och snabba förökning medför, att de kan uppnå stort antal i livsmedel under för mikroorganismerna gynnsamma betingelser.

lördag den 4 december 2010 Vad är liv?

Fotosyntes i ljus och mörker

Omtenta NMET2 (datum 4/2 2012) (totalt 63 p)

Tentamen. Kurskod: MC1004. Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum Skrivtid 4h

Biologi är läran om livet. Vad är liv?? Alla organismer (levande varelser) har DNA

Tentamen i Cellbiologi:prokaryota fredagen den 13 januari 2012

onsdag 9 oktober 13 Ekologi

05/12/2014. Övervakning av processen. Hur vet vi att vi har en optimal process eller risk för problem? Hämning av biogasprocessen

Sterilisering. Desinfektionsmedel. Joniserande. Torrvärme. Ånga. - Djupfilter. - Strålning - Tryck. Endosporer (Bacillus, Clostridium, m.fl.

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

KOMMENTARER TILL KAPITEL

Helsingfors universitet Urvalsprovet Agrikultur-forstvetenskapliga fakulteten

När man pratar bakterier förknippar man det oftast med något negativt. Det finns många för oss positiva och livsnödiga bakterier.

Den allra första cellen bakteriecellen prokaryot cell

Övningar Homogena Jämvikter

Tentamen i Molekylär Cellbiologi 9 p Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Område: Ekologi. Innehåll: Examinationsform: Livets mångfald (sid ) I atomernas värld (sid.32-45) Ekologi (sid )

Konservering ur ett historiskt perspektiv

Felveckning och denaturering av proteiner. Niklas Dahrén

Kapitel Var är vi i kursen???

Vem tänder på flisstackar?

Tentamen i Molekylär Cellbiologi 9 p Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

1. a) Markera polära och icke-polära delar i nedanstående molekyl. Vilken typ av ämne är det, och vad heter molekylen? (2p)

EKOTOXIKOLOGISK TEST PÅ VATTEN TILLSATT PESTICIDER

TENTAMEN MEDICIN, MEDICINSK MIKROBIOLOGI 7,5 HP. Kurskod: MC1401. Kursansvarig: Nikolaos Venizelos (tfn: ) Totalpoäng: 63,5

Innehåll. Förord Inledning Tack Vidare läsning Illustrationer Register kapitel 1 Ursprung...

Cellbiologi. Cellens delar (organeller)

Elektrolysvatten. Miljövänlig teknologi för vattenrening,desinfektion och sterilisering

Elektron-absorbtionspektroskopi för biomolekyler i UV-VIS-området

Skrivning i termodynamik och jämvikt, KOO081, KOO041,

Studier av tillväxt, reproduktion, ämnesomsättning, utveckling, sjukdomar, ekologi och evolution av växter.

Konc. i början 0.1M 0 0. Ändring -x +x +x. Konc. i jämvikt 0,10-x +x +x

Preparation och spektroskopisk karakterisering av Myoglobin

Isomerer. Samma molekylformel men olika strukturformel. Detta kallas isomeri. Båda har molekylformeln C 4 H 10

Institutionen för laboratoriemedicin Bilaga 2 Biomedicinska analytikerprogrammet Analytisk Kemi och Biokemisk metodik Ht 2010, Termin 3

Biologiska membran Kap 10 fig10-1, 15, 18, 19 & med tillhörande beskrivningar. Övrigt är repetition.

Användning av fungicider på golfgreener: vilka risker finns för miljön?

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov 2010

Intermolekylära krafter

HELSINGFORSREGIONENS UTBILDNINGSPROGRAM I BIOTEKNIK 1 URVALSPROVET Efternamn Förnamn Personbeteckning

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen

Institutionen för biomedicin Avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi Läkarprogrammet termin 1

Kapitel Kapitel 12. Repetition inför delförhör 2. Kemisk kinetik. 2BrNO 2NO + Br 2

Totalt finns det alltså 20 individer i denna population. Hälften, dvs 50%, av dem är svarta.

På samma sätt ges ph för en lösning av en svag bas och dess salt av:

DNA-labb / Plasmidlabb

Kapitel Repetition inför delförhör 2

Transkription och translation. DNA RNA Protein. Introduktion till biomedicin Jan-Olov Höög 1

Cellbiologi: Intracellulär sortering och cellsignalering

Bröstmjölkens sammansättning och rekommendation. Elisabeth Kylberg 2011

Transkript:

KOMMENTARER TILL KAPITEL 6 Skilj mellan tillväxt av en enskild cell och tillväxt av en population av celler. Vid tillväxt av en enskild cell ökar dess storlek och vikt vilket oftast är ett förstadium till själva celldelningen. Tillväxt av en population resulterar i att antalet celler ökar. Studier av tillväxt av mikroorganismer innebär i de flesta fall populationsstudier individuella variationer förbises. De flesta bakterier förökar sig genom enkel tudelning, jfr fig. 6.1, enl: 1 2 4 8 2 n Om - n = antal generationer; N = antal bakterier; N 0 = antal bakterier från början erhålls följande ekvation: N = N 0 2 n - exponentiell tillväxt g = t/n; g = generationstiden; t = tid (timmar eller minuter av exponentiell tillväxt) TILLVÄXTKURVA FÖR BAKTERIER När man beräknar tillväxt av bakterier använder man sig oftast av ett slutet system - en batchodling = satsvis odling. Man ympar (inoculate) då en kolv med näringsmedium med en renkultur av bakterier. Därefter inkuberar man kolven vid en lämplig temperatur. Prov ur kolven tas vid lämpliga tidpunkter. Log N II III IV I Tid N = antal levande bakterier

Olika faser i tillväxten: I: Lagfas. Anpassningsfas. I denna fas ökar inte antalet bakterier utan det sker endast en ökning av cellvolymen. Bakterierna anpassar sig till det näringsmedium som de har ympats till. De gör sig också av med slaggprodukter. II: Exponentiell fas. Här sker det en exponentiell ökning av antalet bakterier. Endast i denna fas kan man beräkna tillväxthastighet och generationstid. III: Stationär fas. I denna fas är antalet bakterier oförändrat - lika många celler dör som nybildas. Här är det maximala cellutbytet. Ympen består i de flesta fall av bakterier som befinner sig i den stationära fasen. Övergången från exponentiell fas till stationär fas kan ha flera orsaker. Det kan ha bildats slaggprodukter som hämmar tillväxten, något näringsämne har blivit begränsande etc. IV: Avdödningsfas. Energikällan är slut. Avdödningen är till en början ofta exponentiell. Om tillväxtmediet är lämpligt sker en balanserad tillväxt, vilket innebär att alla cellkomponenter kan användas för beräkning av tillväxthastighet i den exponentiella fasen. Tillväxtkurvans utseende varierar beroende på vilken typ av cellräkningsmetodik man har använt. Observera att fig. 6.8 inte är helt riktig. I den röda kurvan där man har räknat antalet levande celler (viable count) saknas lagfasen. För den gröna kurvan har man använt celltätheten, mätt med en spektrofotometer, som cellräkningsmetodik. Med denna metodik kan man inte skilja mellan levande och döda celler och av denna anledning är det svårt att se någon nedgång i avdödningsfasen (även döda celler absorberar ljus). Stationärfasen bör också luta svagt uppåt av denna anledning. OMGIVNINGSFAKTORERS INVERKAN PÅ MIKROORGANISMER Temperatur En av de faktorer som påverkar mikroorganismer mest. Bakterier som grupp tål större miljövariationer än andra grupper av organismer.

I det här sammanhanget är det viktigt att skilja mellan överlevnad och tillväxt. Brett område inom vilket mikroorganismer kan växa -4 o C - drygt 100 o C. Undre gräns: Fryspunkt för intracellulärt vatten + salter. Övre gräns: Denaturering av proteiner, nukleinsyror etc. En enda mikroorganism kan inte växa i hela spannet. För en enskild bakterie är spannet ca 30-40 o C. Tillväxten styrs av en mängd enzymatiska reaktioner. Mikroorganismer har en minimitemperatur, en optimumtemperatur och en maximumtemperatur. Kardinaltemperaturer. Tillväxthastigheten minskar snabbt vid temperaturer över optimumtemperaturen optimum- och maximumtemperaturen ligger nära varandra, jfr fig. 6.16. Minimitemperaturen beror på transitionstemperaturen för membranet. Fluiditeten minskar vid sjunkande temperatur - bakterien kompenserar detta genom att öka mängden omättade fettsyror - till slut övergår membranet i ett kristallint stadium transport ej möjlig. Elektrontransportkedjan fungerar ej. Det sker en försvagning av hydrofoba bindningar i proteiner + förändring av proteinkonformationen. Allosteriska proteiner är köldkänsliga. Maximumtemperaturen beror på stabiliteten hos proteiner - katalytisk eller strukturell. Dessutom har membranlipiderna betydelse. Kardinaltemperaturerna är karaktäristiska för en bakterie men är inte helt fixa - kan förändras av faktorer i omgivningen. Psykrofiler uppvisar en hög halt av omättade fettsyror medan termofiler har en hög halt mättade. Prokaryoter kan växa vid högre temperaturer än eukaryoter. Mindre strukturellt komplex organismer kan växa vid högre temperaturer än mer komplexa organismer. Icke-fotosyntetiserande organismer kan växa vid högre temperaturer än fotosyntetiska.

ph På samma sätt som för temperatur har mikroorganismer ett ph-spann för tillväxt samt ett ph-optimum. De flesta bakterier trivs bäst runt ett neutralt ph. Jästsvampar trivs bäst vid ett lägre ph (4.7-6.0) och mögelsvampar vid ett ännu lägre ph (3.9-6.0). Vattenaktivitet Vatten är den viktigaste beståndsdelen i celler - stora vattenkrav. En cells vattenbehov beskrivs ofta mha vattenaktiviteten i det medium där cellerna befinner sig. a w : Mått på tillgängligt vatten. Dest.vatten: a w = 1.0 De flesta bakterier: a w > 0.9 Svamp växer vid lägre a w än bakterier Jästsvampar: a w 0.88 Mögelsvampar: a w 0.80 Salt och socker sänker vattenaktiviteten Vissa bakterier kan öka sin interna saltkoncentration för att kunna ta upp vatten (ersätter H 2 O). Kräver energi. En del organismer bättre än andra kan växa vid låga a w. Halofila bakterier: a w 0.75 Ändring av koncentrationen lösta ämnen ändrar också det osmotiska trycket. Cellväggen utgör ett skydd mot förändringar av det osmotiska trycket.

Ämnen som pumpas in i cellen eller syntetiseras inne i cellen som svar på sänkt vattenaktivitet kallas compatible solutes (den engelska benämningen används i detta fall) Ex. Compatible solutes, jfr tabell 6.3 1. Halobacterium - ökar K + -koncentrationen inne i cellen 2. Vissa osmotoleranta jästsvampar syntetiserar polyalkoholer (ex. glycerol, ribitol och arabinitol). 3. Den halofila algen Dunaliella syntetiserar glycerol. Gasmiljö CO 2 Måste ibland tillföras för att stimulera tillväxten - speciellt autotrofer. O 2 Se fig 6.25 Obligata aeroba organismer - många bakterier, de flesta svampar, protozoer, alger. Fakultativt anaeroba organismer - vissa bakterier och jästsvampar. Obligata anaeroba organismer - vissa bakterier. Mikroaerofila bakterier - växer vid låga O 2 -koncentrationer Aerotoleranta bakterier t ex mjölksyrabakterier. Använder inte O 2 men är inte heller känsliga mot det. Varför tål inte alla organismer syre? Vid reduktionen av O 2 till H 2 O bildas det flera intermediära former t ex superoxidanjon(o 2.- ) och väteperoxid(h2 O 2 ) O 2 + e - O 2.-

O 2 + 2 H + + 2 e - H 2 O 2 Både O 2.- och H2 O 2 är kraftiga oxidationsmedel och O 2.- kan dessutom förorsaka lipidperoxidationer H 2 O 2 och O 2.- kan vidare reagera enligt: H 2 O 2 + O 2.- O2 + OH. + OH - Exakt hur denna reaktion sker vet man inte men den katalyseras troligen av metalljoner (järnkelater). OH. kan skada nästan alla molekyler som finns i levande celler t ex hydroxylera purin- och pyrimidinbaser i DNA mutationer Enzymet katalas omvandlar H 2 O 2 till H 2 O och O 2, jfr fig. 6.28 Enzymet superoxiddismutas kan omvandla superoxidanjonen, jfr fig. 6.28 Obligata anaeroba bakterier saknar båda dess enzym. Vissa fakultativt anaeroba organismer samt aerotoleranta organismer saknar katalas (kan ha peroxidas istället) ev. klarar cellen låga halter av H 2 O 2.