Förvaltning Ägare Reviderat datum Emma Johansson 2018-12-06 Verksamhet Laboratoriemedicinska kliniken Universitetssjukhuset,Klinisk mikrobiologi Slutgranskare Emma Johansson Diarienr Dokumentkategori Fastställare Giltigt datum fr o m Rutiner Emma Johansson 2018-12-06 Klinisk bakteriologi Bakterier (luftvägspatogena) Bakterier (luftvägspatogena)/ jästsvamp Svalgsekret, NP-sekret/aspirat, nässekret Sputum, trackeal-/tub-/bronksekret, BAL-vätska, skyddad borste Allmän odling WASP Växt/ ingen växt Allmän odling Växt/ ingen växt Bakterier (patogena) /jästsvamp Sekret urogenitalia allmän odling WASP Växt/ ingen växt Bakterier, faecespatogena (salmonella, shigella/eiec, campylobacter, yersinia, aeromonas, plesiomonas, Aeromonas, Vibrio cholerae, ETEC, EHEC) Faeces PCR/Specifik odling BDMAX Påvisat/Negativ/Växt Bakterier/jästsvamp Blod Allmän odling BACTEC FX Växt/ingen växt / Karlskoga Bakterier/jästsvamp Sår/sekret, punktat, vävnad, biopsi, dränage, kateterspets Allmän odling WASP Växt/ ingen växt Bakterier/jästsvamp Urin Allmän odling WASP Semikvantitativ växt/ ingen växt Bordetella pertussis NP-aspirat, NP-sekret i NaCl Loop-Medierad Isotermal Ampli- Illumipro-10, Meridian Pos/neg Kopia utskriftsdatum 2018-12-06 Sidan 1 av 5
fication Borrelia burgdorferi, IgG-ak Serum EIA VirClia Enh Borrelia burgdorferi, IgM-ak Serum EIA VirClia Enh Clostridium difficile Faeces Specifik odling Växt/ingen växt Clostridium difficile toxin A genen (tcda) Faeces Loop-Medierad ESBLcarba karaktärisering Bakterier Loop-Medierad Neisseria gonorrhoeae (gonokocker) Illumipro-10, Meridian Pos/neg Amplex Pos/neg Sekret urogenitalia, svalgsekret Specifik odling Växt/ingen växt Klamydia Urin, uretra/cervix/vaginalsekret Nucleic Acid Amplification Test, NAAT Neisseria gonorrhoeae Urin, uretra/cervix/vaginalsekret Nucleic Acid Amplification Test, NAAT Legionella Sputum, bronksekret, BAL-/pleuravätska Panther (Hologic) Pos/neg Panther (Hologic) Pos/neg Specifik odling Växt/ingen växt MIC-bestämning Bakterier E-test MIC mg/l, SIR MRSA, screening svalg, näsa, axill, ljumske, perineum, sår, urin mm MRSA, verifiering Bakterier Loop-Medierad Selektiv odling WASP Pos/neg Amplex Pos/neg Kopia utskriftsdatum 2018-12-06 Sidan 2 av 5
N. gonorrhoeae karakterisering N gonorrhoeae isolat Klassifikation N. meningitidis karakterisering N meningitidis isolat Klassifikation Resistensbestämning Bakterier Diskdiffusion enl EUCAST SIR Rapid Plasma Reagin (RPR) Serum/plasma Flockningsreaktion Pos/neg, titer Syfilis (anti-treponema pallidum) Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg Syfilis (anti-treponema pallidum) Serum/plasma Partikelagglutination Pos/neg, titer VRE, screening faeces, urin, sår, sputum/ trach/bronksekret VRE, verifiering Bakterier Loop-Medierad Mykoplasma pneumonieae Serum Komplementbindning Luftvägsbakterier Sputumprov, nasopharynxprov, bronk, prov från bakre svalgvägg Realtids-PCR RotorgeneQ Pos/neg Amplex Pos/neg Spädningsfaktor värde Realtids-PCR BD Max Pos/neg Kopia utskriftsdatum 2018-12-06 Sidan 3 av 5
Hygiendiagnostik Bakterier, jästsvamp Förvaringsvätska för hornhinnor, benmärg, blodprodukter Allmän odling BACTEC FX Växt/ingen växt Bakterier/svamp, luftsedimentation Luft Allmän odling CFU/provtagningsplats Klinisk virologi Blodgivar/plasma-screening (HBs-antigen, anti-hcv, anti-hiv, anti HTLV I/II, anti-hbc, Syfilis Serum/plasma (se respektive ingående komponent) CMIA, EIA (se respektive ingående komponent) Architect i2000 Pos/neg CMV, IgG-ak Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg CMV, IgM-ak Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg EBV, EBNA IgG ak Serum/plasma CMIA Architecti2000 Pos/neg EBV VCA IgG Serum/Plasma CMIA Architect I2000 Pos/neg EBV VCA IgM Serum/Plasma CMIA Architect I2000 Pos/neg Gastroenterit (norovirus, rotavirus, sapovirus, astrovirus, adenovirus) Faeces/kräk Realtids PCR BD Max Pos/neg HCV-RNA, kvantifiering Plasma Realtids PCR Panther, Hologic IU/mL HBV-DNA, kvantifiering Plasma Realtids PCR Panther, Hologic IU/mL HIV-RNA, kvantifiering Plasma Realtids PCR Panther, Hologic c/ml Kopia utskriftsdatum 2018-12-06 Sidan 4 av 5
Hepatit A, anti-hav (IgG) Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg Hepatit A, anti-hav (IgM) Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg Hepatit B, anti-hbc Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg Hepatit B, anti-hbe Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg Hepatit B, anti-hbs Serum/plasma CMIA Architect i2000 IU/L Hepatit B, HBe-antigen Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg Hepatit B, HBs-antigen Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg Hepatit C, anti-hcv Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg Hepatit C, anti-hcv konfirmation Serum/plasma Immunoblot (Inno- Lia) AutoBlot 3000 Pos/neg Herpes simplex virus 1 och 2 Blåsmaterial Realtids PCR Simplexa Pos/neg HIV Ag/Ak Serum/plasma CMIA Architect i2000 Pos/neg HIV konfirmation Serum/plasma Immunoblot (Inno- Lia) AutoBlot 3000 Pos/neg HTLV-1/2 Ak Serum CMIA Architect i2000 Pos/neg Influensa A och B NP-aspirat, NP-sekret i NaCl Realtids PCR Simplexa Pos/neg RS-virus NP-aspirat, NP-sekret i NaCl Realtids PCR Simplexa Pos/neg Rubella, IgG-ak Serum CMIA Architect i2000 IU/mL Varicella zoster virus Blåsmaterial Realtids PCR Simplexa Pos/neg HIV, HBV, HCV-multiplex Serum/plasma samt serum/plasma från avliden Realtids PCR Rotogene Q Pos/neg Kopia utskriftsdatum 2018-12-06 Sidan 5 av 5