Alinhamentos de sequências e Busca de Similaridade
|
|
- Roger Sandström
- för 4 år sedan
- Visningar:
Transkript
1 Alinhamentos de sequências e Busca de Similaridade Ariane Machado Lima ariane.machado@usp.br Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP
2 Eu não vim para explicar, eu vim para confundir Chacrinha
3 Alinhamentos veremos em breve Primeiro: busca de similaridade
4 Contexto
5 Contexto
6 Buscas por sequências (o sentido biológico) Busca de identidade: SABER o que é, onde está, etc. Busca de similaridade: INFERIR o que é
7 Busca de identidade Comparar 2 sequências para saber se: são iguais possuem uma subsequência em comum
8 Exemplo 1 Localização de subsequência sequência genoma
9 Exemplo 1 Localização de subsequência sequência genoma
10 Exemplo 1 Localização de subsequência sequência BUSCA POR IDENTIDADE genoma
11 Exemplo 2 Como faço para saber que proteína é essa? MMETERLVLPPPDPLDLPLRAVELGCTGHWELLNLPGAPESSLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARKW QRKTDPWSLLAVLGAPVPSDLQAQRHPTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPASQSLWGNPTRYPFWPGGM DEPTITDLNTREEAEEEIDFEKDLLTIPPGFKKGMDFAPKDCPTPAPGLLSLSCLLEPLDLGGGDEDENEAVGQPGGPRG DTVSASPCSAPLARASSLEDLVLKEASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVDATSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAI LHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTT EILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVTRP VPLEHYLFTGNSSKTQGELFLLLDSRGAFHTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYLSLLASLRT RAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLQMSELLNRGLGVHHSGILPILK EIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRV PEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQALAELTKRLGALEEPDM TGQLVDLPEYYSWGEELTETQHMIQRRIMESVNGLKSLSAGRVVVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSRVFTTLVLCDKPL SQDPQDRGPATAEVPYPDDLVGFKLFLPEGPCDHTVVKLQPGDMAAITTKVLRVNGEKILEDFSKRQQPKFKKDPPLAA VTTAVQELLRLAQAHPAGPPTLDPVNDLQLKDMSVVEGGLRARKLEELIQGAQCVHSPRFPAQYLKLRERMQIQKEMER LRFLLSDQSLLLFPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSP GDAGDQLPNTLKQGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVR CIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ
12 Exemplo 2 Como faço para saber que proteína é essa? MMETERLVLPPPDPLDLPLRAVELGCTGHWELLNLPGAPESSLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARKW QRKTDPWSLLAVLGAPVPSDLQAQRHPTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPASQSLWGNPTRYPFWPGGM DEPTITDLNTREEAEEEIDFEKDLLTIPPGFKKGMDFAPKDCPTPAPGLLSLSCLLEPLDLGGGDEDENEAVGQPGGPRG DTVSASPCSAPLARASSLEDLVLKEASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVDATSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAI LHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTT EILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVTRP VPLEHYLFTGNSSKTQGELFLLLDSRGAFHTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYLSLLASLRT RAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLQMSELLNRGLGVHHSGILPILK EIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRV PEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQALAELTKRLGALEEPDM TGQLVDLPEYYSWGEELTETQHMIQRRIMESVNGLKSLSAGRVVVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSRVFTTLVLCDKPL SQDPQDRGPATAEVPYPDDLVGFKLFLPEGPCDHTVVKLQPGDMAAITTKVLRVNGEKILEDFSKRQQPKFKKDPPLAA VTTAVQELLRLAQAHPAGPPTLDPVNDLQLKDMSVVEGGLRARKLEELIQGAQCVHSPRFPAQYLKLRERMQIQKEMER LRFLLSDQSLLLFPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSP GDAGDQLPNTLKQGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVR CIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ Posso procurá-la em bancos de proteínas anotadas (procuro por ela, ou seja, por uma sequência idêntica)
13 Exemplo 2 Como faço para saber que proteína é essa? MMETERLVLPPPDPLDLPLRAVELGCTGHWELLNLPGAPESSLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARKW QRKTDPWSLLAVLGAPVPSDLQAQRHPTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPASQSLWGNPTRYPFWPGGM DEPTITDLNTREEAEEEIDFEKDLLTIPPGFKKGMDFAPKDCPTPAPGLLSLSCLLEPLDLGGGDEDENEAVGQPGGPRG DTVSASPCSAPLARASSLEDLVLKEASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVDATSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAI LHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTT EILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVTRP VPLEHYLFTGNSSKTQGELFLLLDSRGAFHTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYLSLLASLRT RAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLQMSELLNRGLGVHHSGILPILK EIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRV PEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQALAELTKRLGALEEPDM TGQLVDLPEYYSWGEELTETQHMIQRRIMESVNGLKSLSAGRVVVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSRVFTTLVLCDKPL SQDPQDRGPATAEVPYPDDLVGFKLFLPEGPCDHTVVKLQPGDMAAITTKVLRVNGEKILEDFSKRQQPKFKKDPPLAA VTTAVQELLRLAQAHPAGPPTLDPVNDLQLKDMSVVEGGLRARKLEELIQGAQCVHSPRFPAQYLKLRERMQIQKEMER LRFLLSDQSLLLFPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSP GDAGDQLPNTLKQGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVR CIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ Posso procurá-la em bancos de proteínas anotadas (procuro por ela, ou seja, por uma sequência idêntica) BUSCA POR IDENTIDADE
14 Exemplo 3 Como faço para saber que proteína é essa? MMETERLVLPPPDPLDLPLRAVELGCTGHWELLNLPGAPESSLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARKW QRKTDPWSLLAVLGAPVPSDLQAQRHPTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPASQSLWGNPTRYPFWPGGM DEPTITDLNTREEAEEEIDFEKDLLTIPPGFKKGMDFAPKDCPTPAPGLLSLSCLLEPLDLGGGDEDENEAVGQPGGPRG DTVSASPCSAPLARASSLEDLVLKEASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVDATSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAI LHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTT EILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVTRP VPLEHYLFTGNSSKTQGELFLLLDSRGAFHTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYLSLLASLRT RAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLQMSELLNRGLGVHHSGILPILK EIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRV PEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQALAELTKRLGALEEPDM TGQLVDLPEYYSWGEELTETQHMIQRRIMESVNGLKSLSAGRVVVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSRVFTTLVLCDKPL SQDPQDRGPATAEVPYPDDLVGFKLFLPEGPCDHTVVKLQPGDMAAITTKVLRVNGEKILEDFSKRQQPKFKKDPPLAA VTTAVQELLRLAQAHPAGPPTLDPVNDLQLKDMSVVEGGLRARKLEELIQGAQCVHSPRFPAQYLKLRERMQIQKEMER LRFLLSDQSLLLFPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSP GDAGDQLPNTLKQGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVR CIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ Posso procurá-la em bancos de proteínas anotadas (procuro por ela, ou seja, por uma sequência idêntica) E SE EU NÃO ENCONTRASSE UMA IDÊNTICA, MAS UMA SIMILAR?
15 Inferência de função a partir de similaridade
16 Inferência de função a partir de similaridade
17 Inferência de função a partir de similaridade
18 Nem sempre funciona...
19 2 sequências cacttttaactctctttccaaagtccttttcatctttccttcacagtacttgttcactat cacttttaactctctttccaaagaacttttcatctttccctcacggtacttgtttgctat
20
21 Processo evolutivo
22 Homologia, paralogia e ortologia Homologia: 2 sequências são homólogas se elas possuem uma sequência ancestral comum Ortologia Paralogia
23 Ortologia: homologia por especiação
24 Paralogia: homologia por duplicação
25 Homologia, paralogia e ortologia Paralogia Ortologia
26 Aplicações de busca de similaridade?
27 Aplicações de busca de similaridade Predição de genes Predição de estrutura de proteínas de RNA/DNA Inferência de árvores filogenéticas Busca de polimorfismos / marcadores
28 Identidade, similaridade e homologia CUIDADO: Se duas (ou mais) sequências são parecidas: elas podem ser homólogas elas podem ter funções similares elas podem ter a mesma estrutura
29 Como encontrar identidade e similaridade?
30 Como encontrar identidade e similaridade? ALINHAMENTOS!
31 Alinhamentos de 2 sequências Deixar 2 sequências o mais parecidas possível Ajustando as posições de suas letras, se necessário usando espaços: ROSAVERMELHA AMOROSOVERME
32 Alinhamentos de 2 sequências Deixar 2 sequências o mais parecidas possível Ajustando as posições de suas letras, se necessário usando espaços: ROSAVERMELHA AMOROSOVERME ---ROSAVERMELHA AMOROSOVERME---
33 ROSAVERMELHA AMOROSOVERME ---ROSAVERMELHA AMOROSOVERME--- Alinhamentos permitem comparações entre as sequências Identidade Similaridade
34 ROSAVERMELHA AMOROSOVERME Identidade: 8% (1/12) ---ROSAVERMELHA AMOROSOVERME--- Identidade: 53% (8/15)
35 Sistema de scores Pontos para match (ex: +2) Penalidades para mismatch (ex: -1) Penalidades para gap abertura (ex: -3) extensão (ex: -1)
36 ROSAVERMELHA AMOROSOVERME Identidade: 8% (1/12) SCORE:??? ---ROSAVERMELHA AMOROSOVERME--- Identidade: 53% (8/15) SCORE:???
37 ROSAVERMELHA AMOROSOVERME Identidade: 8% (1/12) SCORE: ROSAVERMELHA AMOROSOVERME--- Identidade: 53% (8/15) SCORE:???
38 ROSAVERMELHA AMOROSOVERME Identidade: 8% (1/12) SCORE: ROSAVERMELHA AMOROSOVERME--- Identidade: 53% (8/15) SCORE: +3
39 ROSAVERMELHA AMOROSOVERME Identidade: 8% (1/12) SCORE: ROSAVERMELHA AMOROSOVERME--- Identidade: 53% (8/15) SCORE: +3 Para um dado sistema de score, calculo o alinhamento de maior score (alinhamento ótimo) PROBLEMA DE OTIMIZAÇÃO
40 Similaridade entre os aminoácidos
41 Identidade, similaridade e homologia Tipo de Medida Sentido Identidade Quantitativa quantos idênticos Similaridade Quantitativa quantos parecidos Homologia QUALITATIVA TEM ou NÃO TEM um ancestral comum
42 Matrizes de score (matrizes de substituição de aa) Matrizes 20x20 Algumas matrizes: PAMs BLOSUMs
43 Reference: Henikoff, S. and Henikoff, J. G. (1992). Amino acid substitution matrices from protein blocks. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X *
44 Matrizes de score (matrizes de substitição de aa) Matrizes 20x20 Algumas matrizes: PAMs BLOSUMs Também pode usar matrizes de nucleotídeos...
45 Matrizes de score (matrizes de substitição de aa) Matrizes 20x20 Algumas matrizes: PAMs BLOSUMs Veremos sobre essas matrizes mais adiante... Também pode usar matrizes de nucleotídeos...
46 Alinhamentos Pairwise: 2 sequências Múltiplo: mais de 2 sequências
47 Tipos de alinhamentos Global Semi-global Local
48 Alinhamento global QUERIDA---ROSAVERMELHA QUEROUMAMOROSOVERME---
49 Alinhamento global Aplicação: comparar 2 proteínas (ex. para inferir estrutura secundária)
50 Estrutura 3D de proteínas
51 Alinhamento global Aplicação: comparar 2 proteínas (ex. para inferir estrutura secundária)
52 Alinhamento múltiplo
53 Alinhamento global Outras aplicações Identificação de SNPs (single nucleotide polimorphism) e outros polimorfismos Identificação de domínios proteicos mais conservados Identificação de isoformas Construção de árvores filogenéticas
54 Helicases humanas (SNPs)
55 Várias helicases (domínios)
56 Várias helicases (domínios)
57 Identificação de isoformas
58 Identificação de isoformas
59 Alinhamento pairwise global Algoritmo Exato: Needleman-Wunsch (pairwise) Programas: needle (EMBOSS) stretcher (EMBOSS) (demora mais, mas economiza memória) FASTA ClustalW T-Coffee Muscle
60 Sobre alinhamentos múltiplos NÃO SÃO EXATOS! Necessita alguma edição manual Parece não haver um consistentemente melhor que todos
61
62 Outra aplicação Criação de modelos e identificação de RNAs não codificantes (ou outros elementos) com estrutura secundária Ex: micrornas
63 Alinhamento estrutural
64 Alinhamento semi-global ---ROSAVERMELHA AMOROSOVERME---
65 Alinhamento semi-global Aplicação: montagem de genomas!
66 Sequenciamento shot-gun
67 Alinhamento semi-global Aplicação: montagem de genomas!
68 Alinhamento local QUERIDA---ROSAVERMELHA QUEROUMAMOROSOVERME--- QUER QUER ROSAVERME ROSOVERME
69 Alinhamento local Aplicações: Encontrar um gene em um genoma sequência genoma
70 Alinhamento local Aplicações: Identificar possíveis homólogos em um banco de dados MMETERLVLPPPDPLDLPLRAVELGCTGHWELLNLPGAPESSLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARKWQ RKTDPWSLLAVLGAPVPSDLQAQRHPTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPASQSLWGNPTRYPFWPGGMDEPTIT DLNTREEAEEEIDFEKDLLTIPPGFKKGMDFAPKDCPTPAPGLLSLSCLLEPLDLGGGDEDENEAVGQPGGPRGDTVSASPCS APLARASSLEDLVLKEASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVDATSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAILHLERHDSVFVAA HTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTTEILRSMLYSGSDVIRDLE WVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVTRPVPLEHYLFTGNSSKTQGELF LLLDSRGAFHTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYLSLLASLRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGL TSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLQMSELLNRGLGVHHSGILPILKEIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNM PARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRVPEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMIL NLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQALAELTKRLGALEEPDMTGQLVDLPEYYSWGEELTETQHMIQRRIMESVN GLKSLSAGRVVVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSRVFTTLVLCDKPLSQDPQDRGPATAEVPYPDDLVGFKLFLPEGPCDHTV VKLQPGDMAAITTKVLRVNGEKILEDFSKRQQPKFKKDPPLAAVTTAVQELLRLAQAHPAGPPTLDPVNDLQLKDMSVVEGGL RARKLEELIQGAQCVHSPRFPAQYLKLRERMQIQKEMERLRFLLSDQSLLLFPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGTVKLAGRVACA MSSHELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSPGDAGDQLPNTLKQGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNF GLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVRCIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ
71 Alinhamento Local Algoritmo Smith-Waterman Programas BLAST (NCBI / WU) BLAT (mais preciso bom para localização) water (EMBOSS) matcher (demora mais, mas economiza memória) cross_match (swat) bom para mascaramento FASTA
72 BLAST Basic Local Alignment Search Tool NCBI BLAST ou WU-BLAST Heurísticas
73 Palavras do BLAST (W) MLIIKRDELVISWASHERE MLI LII IIK IKR KRD RDE DEL ELV LVI VIS ISW SWA WAS ASH SHE HER ERE sequência query todas as palavras de tamanho 3 com sobreposição
74
75
76 Formato FASTA >Identificador da sequência GCCCCCGGCCCCGCCCCGGCCCCGCCCCCGGCCCCGCCCCGCAAGGGTC ACAGGTCACGGGGCGGGGCCGAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGTACCG GCTCCTCCTGGGCTCCCTCTAGCGCCTTCCCCCCGGCCCGACTCCGCTG GTCAGCGCCAAGTGACTTACGCCCCCGACCTCTGAGCCCGGACCGCTAG
77
78
79 Significância de scores E-value (s): número de hits com score tão bom ou melhor que s puramente por chance em um banco de dados aleatório, do mesmo tamanho e com a mesma composição de bases Quanto menor...
80 Significância de scores E-value (s): número de hits com score tão bom ou melhor que s puramente por chance em um banco de dados aleatório, do mesmo tamanho e com a mesma composição de bases Quanto menor melhor!!!!
81 Significância de scores E-value (s): número de hits com score tão bom ou melhor que s puramente por chance em um banco de dados aleatório, do mesmo tamanho e com a mesma composição de bases P-value (s): probabilidade de obter um score tão bom ou melhor que s puramente por chance em um banco de dados aleatório, do mesmo tamanho e com a mesma composição de bases
82 Significância de scores E-value é um número real não negativo Quanto menor melhor!!!! E-value depende de... E(S) = Kmne - S... por isso não existe número mágico
83
84 Programas standalone Programas como Blast, BLAT e muuuuitos outros: via web server standalone (linha de comando) Perl scripts!!!! netblast: linha de comando, mas executa remotamente
85 BLAT Blast Like Alignment Tool Mais rápido e mais preciso (para sequências altamente similares) Aplicação: mapeamento de sequências (ex: transcritos) Mantém um índice de todo o banco em memória (non-overlapping k-mers)
86 Cuidado com anotações erradas!!! Cuidado com bancos não curados
87 Voltando ao sistema de score... Match/mismatch pode ser substituído por uma matriz 4x4 (nucleotídeos) uma matriz 20x20 (aminoácidos)
88 Similaridade entre os aminoácidos
89 Matrizes de score (matrizes de substituição)
90 Reference: Henikoff, S. and Henikoff, J. G. (1992). Amino acid substitution matrices from protein blocks. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X *
91 Matrizes de score (matrizes de substituição) q ij : probabilidade do aminoácido i ser substituído pelo aminoácido j p i : probabilidade do aminoácido i m ij = log (q ij / p i p j ) = m ij
92 Matrizes de score (matrizes de substituição) q ij : probabilidade do aminoácido i ser substituído pelo aminoácido j p i : probabilidade do aminoácido i m ij = log (q ij / p i p j ) = m ij
93 Matrizes de score (matrizes de substituição) q ij : probabilidade do aminoácido i ser substituído pelo aminoácido j p i : probabilidade do aminoácido i m ij = 1/ log (q ij / p i p j ) = m ij
94 Matrizes de score (matrizes de substitição) Como achar q ij, p i e p j? Algumas matrizes: PAMs BLOSUMs
95 Matrizes PAM de aminoácidos Point Accepted Mutation Dayhoff, 1978 Processo: Alinhamento de conjuntos de sequências relacionadas (85% id) Construção de árvores filogenéticas Cálculo da frequência de substituição de cada par de aminoácido Normalização das frequências: 1% de mudança ~ 50 milhões de anos (PAM1)
96 Matrizes PAM de aminoácidos Point Accepted Mutation Em um período de 2 PAMs, pode ter havido A?, e então? D Extrapolação: PAM2 = PAM1 x PAM1 PAMy = PAM1 x PAM1 x... x PAM1 PAM120: 40% de identidade PAM250: 20% de identidade
97 Diagonal PAM250 Hidrofóbicos Hidrofílicos
98 Problemas das PAMs Inferida por um conjunto restrito de proteínas Extrapolação Muitas novas proteínas foram sequenciadas desde 78...
99 Matrizes BLOSUM de aminoácidos Henikoff & Henikoff, 1992 Alinhamentos de blocos de vários grupos de proteínas relacionadas (banco de dados BLOCKS) Cálculo de frequência de substituição de cada par de aminoácido BLOSUMx: blocos de sequências com no máximo x% de identidade Ex: BLOSUM62 e BLOSUM85
100 BLOSUM62 Reference: Henikoff, S. and Henikoff, J. G. (1992). Amino acid substitution matrices from protein blocks. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X *
101 PAMs e BLOSUMs Para encontrar alinhamentos mais curtos e com maior similaridade: PAMs BLOSUMs Para encontrar alinhamentos mais longos e com menor similaridade: PAMs BLOSUMs
102 PAMs e BLOSUMs Para encontrar alinhamentos mais curtos e com maior similaridade: PAMs mais baixas BLOSUMs mais altas Para encontrar alinhamentos mais longos e com menor similaridade: PAMs BLOSUMs
103 PAMs e BLOSUMs Para encontrar alinhamentos mais curtos e com maior similaridade: PAMs mais baixas BLOSUMs mais altas Para encontrar alinhamentos mais longos e com menor similaridade: PAMs mais altas BLOSUMs mais baixas
104 Referências Básico: O'Reilly - Caprichado: Mount - Durbin R, Eddy S, Krogh A, Mitchison G. (1998). Biological sequence analysis: probabilistic models of proteins and nucleic acids, Cambridge University Press, BLAST:
105 Papel dos gaps Inserções / deleções MUITO ALTAS MUITO BAIXAS GLOBAL Inibir trechos de gap alinhamentos ruins (muitos mismatches) Muitos gaps espalhados pelo alinhamento (alinhamento ruim) LOCAL Inibir trechos de gap poucos blocos alinhados Muitos gaps espalhados pelo alinhamento (alinhamento ruim e possivelmente maior do que deveria)
Alinhamentos de sequências e Busca de Similaridade
Alinhamentos de sequências e Busca de Similaridade Ariane Machado Lima ariane.machado@usp.br Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP Eu não vim para explicar, eu vim para confundir Chacrinha Alinhamentos
Läs merMatemática A Extensivo V. 3
Matemática A Etensivo V. Resolva Aula 9 9.0) 0. Verdadeira E =. + 0 + 7 ( 7 ) = = + 7 7 + = 0 0. Verdadeira Se
Läs merMATERIAL SUPLEMENTAR
MATERIAL SUPLEMENTAR Tabela 1S. Dados de RMN de 1 H (400 MHz) e de 13 C (100 MHz) para a (E)-6-estirilpiran-2-ona (1) Posição do átomo de carbono δ 13 C* δ 1 H* 5 105,03 6,15 (d, J=6,68 Hz, 1H) 7 114,30
Läs merImmigration Bank. Bank - Allmänt. Bank - Öppna ett bankkonto. Posso sacar dinheiro em [país] sem ter que pagar taxas?
- Allmänt Kan jag ta ut pengar i [land] utan att behöva betala extra avgifter? Fråga om det är extra kostnader när du tar ut pengar i ett visst land Vad är avgifterna om jag använder bankautomater från
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Kan du vara snäll och hjälpa mig? Fråga om hjälp Talar du engelska? Fråga om en person talar engelska Talar du _[språk]_? Fråga om en person talar ett visst språk Jag talar inte _[språk]_.
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Kan du vara snäll och hjälpa mig? Fråga om hjälp Talar du engelska? Fråga om en person talar engelska Talar du _[språk]_? Fråga om en person talar ett visst språk Jag talar inte _[språk]_.
Läs merBiochemistry 201 Advanced Molecular Biology (
Biochemistry 201 Advanced Molecular Biology (http://cmgm cmgm.stanford.edu/biochem201/) Bioinformatics: Discovering Function from Sequence Doug Brutlag Departments of Biochemistry June 4, 1999 Discovering
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Podría ayudarme? Fråga om hjälp Habla inglés? Fråga om en person talar engelska Habla_[idioma]_? Fråga om en person talar ett visst språk No hablo_[idioma]_. Förtydliga att du inte talar
Läs merResa Logi. Logi - Hitta boende. Logi - Boka. Fråga om vägen till olika former av boenden
- Hitta boende Onde eu posso encontrar? Fråga om vägen till olika former av boenden Hvor kan jeg finde?... um quarto para alugar?... et værelse som man kan leje?... um hostel?... et vandrehjem?... um hotel?...
Läs merResa Logi. Logi - Hitta boende. Logi - Boka. Fråga om vägen till olika former av boenden
- Hitta boende En dónde puedo encontrar? Fråga om vägen till olika former av boenden Onde eu posso encontrar?... una habitación para rentar?... um quarto para alugar?... un hostal?... um hostel?... un
Läs merImmigration Studera. Studera - Universitet. Ange att du vill anmäla dig. Ange att du vill anmäla dig till en kurs. Kurs.
- Universitet Jeg vil gerne indskrives på et universitet. Ange att du vill anmäla dig Jeg vil gerne søge faget. Ange att du vill anmäla dig till en kurs bachelor Kurs kandidatstuderende ph.d.-studerende
Läs merViajar Circulando. Circulando - Localização. Sem saber onde você está. Perguntando por uma locação específica no mapa
- Localização Jag har gått vilse. Sem saber onde você está Kan du visa mig var det är på kartan? Perguntando por uma locação específica no mapa Var kan jag hitta? Perguntando por um determinado local Jeg
Läs merFísica D Semi-Extensivo V. 2
Semi-xtensivo V. xercícios 0) C 0) 0) F M = n FR FR 6 n n = 6 n = n = 0) 05) 06) C Roldana 08) D arra de suorte de e F y 0 = N m m. ( 0 ) m = kg = 80 N D 0 cm 0 cm Cálculo da tração () Roldana móvel (eixo
Läs merHuvudansökan, kandidatprogrammet i språk: portugisiska
Huvudansökan, kandidatprogrammet i språk: portugisiska Urvalsprov 22.5.2019 kl. 14.00 18.00 Skriv ditt namn och dina personuppgifter med tryckbokstäver. Skriv ditt namn med latinska bokstäver (abcd...),
Läs merNegócios Carta. Carta - Endereço
- Endereço Mr. J. Rhodes Rhodes & Rhodes Corp. 212 Silverback Drive California Springs, CA 92926 Formato de endereço nos E.U.A.: número da rua + nome da rua nome da cidade + abreviação do estado + código
Läs merVar kan jag hitta formuläret för? Onde posso encontrar o formulário para? Fråga var du kan få ett formulär
- Allmänt Var kan jag hitta formuläret för? Onde posso encontrar o formulário para? Fråga var du kan få ett formulär När var ditt [dokument] utfärdat? Fråga när ett dokument var utfärdat Vart var ditt
Läs merVar kan jag hitta formuläret för? Onde posso encontrar o formulário para? Fråga var du kan få ett formulär
- Allmänt Var kan jag hitta formuläret för? Onde posso encontrar o formulário para? Fråga var du kan få ett formulär När var ditt [dokument] utfärdat? Fråga när ett dokument var utfärdat Vart var ditt
Läs merResa Att ta sig runt. Att ta sig runt - Platser. Du vet inte var du är. Be om att bli visad en viss plats på en karta. Fråga om en viss servicepunkt
- Platser Jag har gått vilse. Du vet inte var du är Kan du visa mig var det är på kartan? Be om att bli visad en viss plats på en karta Var kan jag hitta? Fråga om en viss Eu estou perdido (a). Você pode
Läs merObjetivos. Princípios da Epidemiologia. Bibliografia básica: Bibliografia básica: Epidemiologia
Objetivos Princípios da Dirce M.T. Zanetta 2019 Oferecer aos alunos conhecimentos básicos do método epidemiológico de forma a familiarizá-los com a quantificação e caracterização de agravos à saúde na
Läs merDa Transformada de Distância à Dimensão Fractal: Uma Abordagem em Hardware. Maximiliam Luppe 12 / 2015
03-2015 12 / 2015 Da Transformada de Distância à Dimensão Fractal: Uma Abordagem em Hardware Maximiliam Luppe Copyright 2015 pelos autores Todos os direitos reservados. Da Transformada de Distância à Dimensão
Läs merMr. Adam Smith Smith's Plastics 8 Crossfield Road Selly Oak Birmingham West Midlands B29 1WQ
- Adress Mr. J. Rhodes Rhodes & Rhodes Corp. 212 Silverback Drive California Springs, CA 92926 Amerikanskt adressformat: Företagsnamn Stadens namn + statens namn + statens förkortning + postnummer Mr.
Läs merInscrição Carta de Apresentação Motivacional
- Introdução Bäste herrn, Dear Sir, Formal, destinatário do sexo masculino, nome desconhecido Bästa fru, Dear Madam, Formal, destinatário do sexo feminino, nome desconhecido Bästa herr eller fru, Formal,
Läs merValmor Burkhardt Junior. Orientador: Prof. Wilson Pedro Carli
Valmor Burkhardt Junior Orientador: Prof. Wilson Pedro Carli 1 Introdução e Objetivos Fundamentação Teórica Especificações do Protótipo Desenvolvimento e Operacionalidade do Protótipo Resultados e Discussões
Läs mer300 Compact
300 Compact 1233 300 535 GB p. 1 DE p. 2 FR p. 4 NL p. 5 IT p. 7 ES p. 8 PT p. 10 SV p. 11 DA p. 13 NO p. 14 FI p. 16 HR p. 17 PL p. 19 RO p. 20 CZ p. 22 HU p. 23 GR p. 25 RU p. 26 Figures p. 29 RIDGE
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Você pode me ajudar, por favor? Fråga om hjälp Você fala inglês? Fråga om en person talar engelska Você fala _[idioma]_? Fråga om en person talar ett visst språk Eu não falo_[idioma]_.
Läs merResa Äta ute. Äta ute - Vid entrén. Äta ute - Beställa mat
- Vid entrén Jag skulle vilja reservera ett bord för _[antal personer]_ till _[tid]_. Göra en reservation Ett bord för _[antal personer]_, tack. Fråga efter ett bord Accepterar ni kreditkort? Fråga om
Läs merResa Äta ute. Äta ute - Vid entrén. Äta ute - Beställa mat
- Vid entrén Eu gostaria de reservar uma mesa para _[número de pessoas]_ às _[hora]_. Göra en reservation Uma mesa para _[número de pessoas]_, por favor. Fråga efter ett bord Você aceita cartão de crédito?
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Você pode me ajudar, por favor? Fråga om hjälp Você fala inglês? Fråga om en person talar engelska Você fala _[idioma]_? Fråga om en person talar ett visst språk Eu não falo_[idioma]_.
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Voisitko auttaa minua? Fråga om hjälp Puhutko englantia? Fråga om en person talar engelska Puhutteko _[kieltä]_? Fråga om en person talar ett visst språk En puhu _[kieltä]_. Förtydliga
Läs merResa Att ta sig runt. Att ta sig runt - Platser. Du vet inte var du är. Be om att bli visad en viss plats på en karta. Fråga om en viss servicepunkt
- Platser I am lost. Du vet inte var du är Can you show me where it is on the map? Be om att bli visad en viss plats på en karta Where can I find? Fråga om en viss Eu estou perdido (a). Você pode me mostrar
Läs merResa Hälsa. Hälsa - Nödsituation. Hälsa - Hos doktorn. Be om att bli förd till sjukhuset. Be om omedelbar medicinsk vård
- Nödsituation Jag måste fara till sjukhuset. Be om att bli förd till sjukhuset Jag mår illa. Eu preciso ir ao hospital. Me sinto doente. Jag måste till en doktor med en gång! Be om omedelbar medicinsk
Läs merLigia Aparecida Inhan Matos. Renata Lèbre La Rovere. Resumo: Abstract: Keywords: Palavras-chave:
CONCEITOS DOS IRMÃOS POLANYI COMO FERRAMENTAS DE ANÁLISE DE INDICAÇÕES GEOGRÁFICAS: O CASO DA INDICAÇÃO DE PROCEDÊNCIA DO QUEIJO MINAS ARTESANAL DA REGIÃO DA CANASTRA/MG Concepts of polish siblings as
Läs merPersonligt Brev. Brev - Adress. Mr. N. Summerbee Tyres of Manhattan 335 Main Street New York NY 92926
- Adress Mr. N. Summerbee Tyres of Manhattan 335 Main Street New York NY 92926 Sr. Vítor Silva Av. Alagoas 546 Bairro Alegria Vitória da Conquista BA 45025-440 Standard engelskt adressformat:, företagets
Läs merViajar Circulando. Circulando - Localização. Sem saber onde você está. Perguntando por uma locação específica no mapa
- Localização Ich habe mich verirrt. Sem saber onde você está Können Sie mir zeigen, wo das auf der Karte ist? Perguntando por uma locação específica no mapa Wo kann ich finden? Perguntando por um determinado
Läs merDE Gebrauchsanweisung en Instructions for use fr Instructions d utilisation es Manual de instrucciones it Istruzioni per l uso dk Brugsvejledning nl
smoov one O10 DE Gebrauchsanweisung en Instructions for use fr Instructions d utilisation es Manual de instrucciones it Istruzioni per l uso dk Brugsvejledning nl Gebruiksaanwijzing no Bruksanvisning se
Läs merARBETSBLAD KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA. El corredor (lätt)
ARBETSBLAD PEDAGOG: ERIK CARDELÚS PROJEKTLEDARE: GABRIELLA THINSZ BESTÄLLNINGSNUMMER: 101545/TV42 KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA El corredor (lätt) Innehåll 1) Var utspelar sig filmen? Beskriv miljön. 2) Vilka
Läs merPersonligt Lyckönskningar
- Giftermål Gratulerar. Jag/Vi önskar er båda all lycka i världen. Används att gratulera ett nygift par Vi vill gratulera och framföra hjärtliga lyckönskningar till er båda på er bröllopsdag. Används att
Läs merPersonligt Lyckönskningar
- Giftermål Desejando a vocês toda felicidade do mundo. Används att gratulera ett nygift par Parabéns e votos calorosos aos dois no dia do seu casamento. Används att gratulera ett nygift par Gratulerar.
Läs merResa Att ta sig runt. Att ta sig runt - Platser. Du vet inte var du är. Be om att bli visad en viss plats på en karta. Fråga om en viss servicepunkt
- Platser Jeg er faret vild. Du vet inte var du är Kan du vise mig hvor det er på kortet? Be om att bli visad en viss plats på en karta Hvor kan jeg finde? Fråga om en viss Eu estou perdido (a). Você pode
Läs merARBETSBLAD KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA. 16 semanas (lätt)
ARBETSBLAD PEDAGOG: ERIK CARDELÚS PROJEKTLEDARE: EVA BLOMBERG KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA 16 semanas (lätt) 1) Innehållsfrågor på filmen a) I vilken situation utspelar sig filmen? Beskriv. b) Vilka är filmens
Läs merIs it worth to parameterize sequence alignment with an explicit evolutionary model?
Is it worth to parameterize sequence alignment with an explicit evolutionary model? Sean Eddy & E.R. p. 1/33 Channelrhodopsin-1 adapted from www.calvin.edu p. 2/33 Bacterial Rhodopsins BACS2_HALSA.TWFWVGAVGMLAGTVLPI..RD
Läs merMr. Adam Smith Smith's Plastics 8 Crossfield Road Selly Oak Birmingham West Midlands B29 1WQ
- Endereço Mr. J. Rhodes Rhodes & Rhodes Corp. 212 Silverback Drive California Springs CA 92926 Formato de endereço nos E.U.A.: número da rua + nome da rua nome da cidade + abreviação do estado + código
Läs merInstruções de operação Instrucciones de funcionamiento Bruksanvisning Betjeningsvejledning
Instruções de operação Instrucciones de funcionamiento Bruksanvisning Betjeningsvejledning For PC Connection Antes do uso, por favor leia atentamente estas instruções. Antes de utilizarlo, lea completamente
Läs merPT-054. Manual de instruções
PT-054 Manual de instruções PT Agradecemos a compra da Caixa Subaquática PT-054 (aqui designada por Caixa). Leia este manual de instruções atentamente e utilize o produto de modo seguro e correcto. Guarde
Läs merKabelhantering. Kabelflänsplattorna kännetecknas av:
580 Produktkatalog 06 Eldon erbjuder ett brett sortiment av kabelgenomföringsprodukter för att uppfylla många olika kundkrav. De produkter som erbjuds är indelade i två grupper: kabelgenomföringar kabelflänsar.
Läs merARBETSBLAD KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA. La orquídea (lätt) Ordkunskap
ARBETSBLAD PEDAGOG: ERIK CARDELÚS PROJEKTLEDARE: CHARLOTTE SIFVERT KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA La orquídea (lätt) Innehållsfrågor på filmen 1) Var utspelar sig filmen? Beskriv miljön. 2) Vilka är filmens
Läs merVad heter antagligen på spanska? Vad heter under (om tid) på spanska? Vad heter plötsligt på spanska? Vad heter mer på spanska?
Spanska småord Spanska småord - en övning gjord av linaboman på Glosor.eu. 1. Vik bak högra delen av pappret så att svaren inte syns. 2. Skriv ner svaren på frågorna i utrymmet under dem. 3. Vik tillbaka
Läs merSannolikhetsteori. Tentamenskrivning: TMS145 - Grundkurs i matematisk statistik och bioinformatik,
Tentamenskrivning: TMS145 - Grundkurs i matematisk statistik och bioinformatik, 5p. Tid: Lördag den 29 mars, 2008 kl 14.00-18.00 i V-huset. Examinator: Olle Nerman, tel 7723565. Jour: Alexandra Jauhiainen,
Läs merMillennium Ecosystem Assessment
capítulo 1 Millennium Ecosystem Assessment Este capítulo é uma tradução do Sumário do livro Ecosystems and Human Well-Being: A Framework for Assessment (Island Presss, 2003), pp. 1-25, preparado por uma
Läs merTravel Health. Health - Emergency. Health - At the Doctor's. Asking to be brought to the hospital. Asking for immediate medical care
- Emergency Eu preciso ir ao hospital. Asking to be brought to the hospital Me sinto doente. Jag måste fara till sjukhuset. Jag mår illa. Eu preciso ir ao médico imediatamente! Asking for immediate medical
Läs merMapping sequence reads & Calling variants
Universitair Medisch Centrum Utrecht Mapping sequence reads & Calling variants Laurent Francioli 2014-10-28 l.francioli@umcutrecht.nl Next Generation Sequencing Data processing pipeline Mapping to reference
Läs merRoom E3607 Protein bioinformatics Protein Bioinformatics. Computer lab Tuesday, May 17, 2005 Sean Prigge Jonathan Pevsner Ingo Ruczinski
Room E3607 Protein bioinformatics 260.841 Protein Bioinformatics Computer lab Tuesday, May 17, 2005 Sean Prigge Jonathan Pevsner Ingo Ruczinski Outline of today s lab Topic Suggested time 1 Find a protein
Läs merResa Hälsa. Hälsa - Nödsituation. Hälsa - Hos doktorn. Be om att bli förd till sjukhuset. Be om omedelbar medicinsk vård
- Nödsituation Eu preciso ir ao hospital. Be om att bli förd till sjukhuset Me sinto doente. Necesito ir al hospital. Me siento mal. Eu preciso ir ao médico imediatamente! Be om omedelbar medicinsk vård
Läs merLigas internas. Completar todos los datos de los jugadores en letras mayúsculas. Imprescindible datos completos del delegado, incluido su .
Ligas internas Fecha límite de inscripción día 20/10/09 a las 14:00 h Completar todos los datos de los jugadores en letras mayúsculas. Imprescindible datos completos del delegado, incluido su e-mail. Rellenar
Läs merARBETSBLAD. La bien querida. Una canción, un artista. Palabras. todo el mundo 1(6)
ARBETSBLAD PRODUCENT: FREDRIK JANSSON REPORTER: ALEXANDRA RUBIO ACEITUNO ARBETSUPPGIFTER: FREDRIK JANSSON PROJEKTLEDARE: GABRIELLA THINSZ PROGAMNUMMER: 68510441502 SÄNDNINGSDATUM: 2015-12-19 Una canción,
Läs merHigh Efficiency System 6 Sistema de Alta Eficiência 6
High Efficiency System 6 Sistema de Alta Eficiência 6 fpsbr.com.br Índice High Efficiency System 6...3 Vantagens do Sistema... 3 Especificações Técnicas... 3 Opções... 4 Modelos... 4 Modos de Controle
Läs merViaggi Salute. Salute - Emergenza. Salute - Dal dottore. Chiedere di essere portati in ospedale. Chiedere cure mediche immediate.
- Emergenza Eu preciso ir ao hospital. Chiedere di essere portati in ospedale Me sinto doente. Jag måste fara till sjukhuset. Jag mår illa. Eu preciso ir ao médico imediatamente! Chiedere cure mediche
Läs merUniversidad de Lund Español 1. Studiekurs: SPAB01. Namn: Mailadress: Personnummer: Total poäng: / 100 15/12/12
Studiekurs: SPAB01 Namn: Mailadress: Personnummer: Total poäng: / 100 15/12/12 1 I. Vocabulario y gramática: 1) Svara på frågorna på spanska. (6 poäng) a) Qué te interesa? b) Qué te encanta? c) Qué te
Läs merViajar Acomodações. Acomodações - Procurando. Acomodações - Reservando. Pedindo por orientações para uma acomodação
- Procurando Var hittar jag? Pedindo por orientações para uma acomodação Waar kan ik vinden?... ett rum att hyra?... een kamer te huur?... ett vandrarhem?... een hostel?... ett hotell?... een hotel?...
Läs merAuswandern Studieren. Studieren - Universität. Angeben, dass man sich einschreiben will
- Universität Gostaria de me matricular em uma universidade. Angeben, dass man sich einschreiben will Jag vill anmäla mig till universitetet. Gostaria de me inscrever no curso de. Angeben, dass man sich
Läs merARBETSBLAD: QUÉ PASA?
ARBETSBLAD: QUÉ PASA? PRODUCENT: FREDRIK JANSSON ARBETSUPPGIFTER: FREDRIK JANSSON PROJEKTLEDARE: GABRIELLA THINSZ PROGAMNUMMER:68510441501 SÄNDNINGSDATUM: 2015-11-07 Una canción, un artista Amaral Palabras
Läs merARBETSBLAD. KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA Rocco (lätt)
ARBETSBLAD PEDAGOG: ERIK CARDELÚS PROJEKTLEDARE: EVA BLOMBERG KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA Rocco (lätt) 1) Innehållsfrågor på filmen a) Var utspelar sig filmen? Beskriv miljön. b) Vilka är filmens huvudpersoner?
Läs merMicro Hi-Fi System. Register your product and get support at
Micro Hi-Fi System MCM204 Register your product and get support at www.philips.com/welcome User manual Manuel d'utilisation Manual de usuario Benutzerhandbuch Gebruikershandleiding Manuale dell'utente
Läs merun comportamiento (beteende) así. no hace nada para ayudar.
ARBETSBLAD PEDAGOG: ERIK CARDELÚS PROJEKTLEDARE: EVA BLOMBERG KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA Lo cotidiano (lätt) 1) Innehållsfrågor på filmen a) Vilka är filmens huvudpersoner? Beskriv dem kort. b) Vad händer
Läs merJoana Reina Maia e Silva Porto, Outubro de 2011
- Dissertação apresentada com vista à obtenção de grau de Mestre em Actividade Física e Saúde, ao abrigo do Decreto-Lei n.º 74/2006 de 24 de Março. Orientador: Professor Doutor Jorge Augusto Pinto Silva
Läs merPT User manual 3. PL Brugervejledning 77. CS Manuale utente 97. SV Mode d emploi 21. EL Användarhandbok 37. SK Gebruiksaanwijzing 115
Register your product and get support at www.philips.com/welcome DC291 PT User manual 3 SV Mode d emploi 21 EL Användarhandbok 37 RU Benutzerhandbuch 57 PL Brugervejledning 77 CS Manuale utente 97 SK Gebruiksaanwijzing
Läs merResa Äta ute. Äta ute - Vid entrén. Äta ute - Beställa mat
- Vid entrén Eu gostaria de reservar uma mesa para _[número de pessoas]_ às _[hora]_. Göra en reservation Uma mesa para _[número de pessoas]_, por favor. Fråga efter ett bord Você aceita cartão de crédito?
Läs merI. Flersekvensjämförelser, sekvensmotiv och profiler. II. Fylogenetisk analys
I. Flersekvensjämförelser, sekvensmotiv och profiler II. Fylogenetisk analys I. Flersekvensjämförelser (multiple sequence alignments, MSA) Jämföra tre eller fler sekvenser samtidigt (homologer eller funktionellt
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Podría ayudarme? Fråga om hjälp Habla inglés? Fråga om en person talar engelska Habla_[idioma]_? Fråga om en person talar ett visst språk No hablo_[idioma]_. Förtydliga att du inte talar
Läs merSTART STOP M EDIT M 0 0 0 04 05 06 07 08 09 0 4 5 6 7 8 9 0 4 5 6 7 8 9 0 4 5 6 7 8 9 40 4 4 4 44 45 46 47 48 49 50 5 5 5 54 55 56 57 58 59 60 6 6 6 64 65 66 67 68 69 70 7 7 7 74 75 76 77 78 79 80 8
Läs merKunskapsläget på kärnavfallsområdet 2012 (SOU 2012:7) : långsiktig säkerhet, haverier och global utblick PDF ladda ner
Kunskapsläget på kärnavfallsområdet 2012 (SOU 2012:7) : långsiktig säkerhet, haverier och global utblick PDF ladda ner LADDA NER LÄSA Beskrivning Författare: Rapport Från Kärnavfallsrådet Miljödepartementet.
Läs merARBETSBLAD KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA. Amores perros (lätt)
ARBETSBLAD PEDAGOG: ERIK CARDELUS PROJEKTLEDARE: EVA BLOMBERG KORTFILMSKLUBBEN SPANSKA Amores perros (lätt) Innehållsfrågor på filmen 1) Var utspelar sig filmen? Beskriv miljön. 2) Vilka är filmens huvudpersoner?
Läs merStatistical modelling and alignment of protein sequences
Statistical modelling and alignment of protein sequences Martin Weigt Laboratoire de Biologie Computationnelle et Quantitative Université Pierre et Marie Curie Paris ENS Paris 11 July 2016 What is the
Läs merMicro Hi-Fi System. Register your product and get support at
Micro Hi-Fi System MCM177 Register your product and get support at www.philips.com/welcome User manual Manuel d'utilisation Manual de usuario Benutzerhandbuch Gebruikershandleiding Manuale dell'utente
Läs merBRUKSANVISNING BALLONGLAMPA VID BYGGARBETEN. ballong. stativ. Ballast
12 avenue des Coquelicots 94380 BONNEUIL SUR MARNE - FRANKRIKE tel. +33 (0) 1 49 81 69 55 - fax. +33 (0) 1 48 98 40 88 e-post: sales@paclite-equip.com BALLONGLAMPA VID BYGGARBETEN ballong stativ Ballast
Läs merHidden Markov Models and other Multiple-sequence Profile approaches
Hidden Markov Models and other Multiple-sequence Profile approaches Mount, Chapter 4, pp. 185-192 Durbin et al, Chapter 5 (also earlier chapters) taken from Sean Eddy Dept. of Genetics Washington U., St.
Läs merREHABILITERINGS- PROTOKOLL
REHABILITERINGS- PROTOKOLL EFTER IMPLANTERING AV Det är mycket viktigt att följa programmet som läggs fram i denna ereerde broschyr med en sjukgymnast, för att garantera korrekt implementering onder av
Läs merUm estudo nas empresas da BM & FBovespa
Folga organizacional versus Fecha de recepción: 12.10.2012 Fecha de aceptación: 04.03.2013 Ilse Maria Bueren Universidade Federal do Paraná ilse.beuren@gmail.com Loriberto Starosky Filho Universidade Regional
Läs merReizen De weg vinden De weg vinden - Locatie Portugees Zweeds Jag har gått vilse. Kan du visa mig var det är på kartan? Var kan jag hitta?
- Locatie Eu estou perdido (a). Niet weten waar je bent. Você pode me mostrar onde é isso no mapa? Vragen naar een bepaalde op de kaart Onde eu encontro? Naar een bepaalde vragen Jag har gått vilse. Kan
Läs merEn bioinformatisk genjakt
En bioinformatisk genjakt Efter en ide från: CUSMOBIO, Milano, Italien. Hur man kan söka i databaser efter information om en gen som kan ge ökad risk för bröstcacer. Bakgrund Människor utan symptom men
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Kan du vara snäll och hjälpa mig? Fråga om hjälp Talar du engelska? Fråga om en person talar engelska Talar du _[språk]_? Fråga om en person talar ett visst språk Jag talar inte _[språk]_.
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Podría ayudarme? Fråga om hjälp Habla inglés? Fråga om en person talar engelska Habla_[idioma]_? Fråga om en person talar ett visst språk No hablo_[idioma]_. Förtydliga att du inte talar
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Kan du vara snäll och hjälpa mig? Fråga om hjälp Talar du engelska? Fråga om en person talar engelska Talar du _[språk]_? Fråga om en person talar ett visst språk Jag talar inte _[språk]_.
Läs merViajar Hospedaje. Hospedaje - Ubicación. Hospedaje - Reservar. Var hittar jag? Para preguntar direcciones hacia el lugar donde te hospedas.
- Ubicación Var hittar jag? Para preguntar direcciones hacia el lugar donde te hospedas.... ett rum att hyra?... ett vandrarhem?... ett hotell?... ett bed-and-breakfast?... en campingplats? Hur är priserna
Läs merMADE IN SWEDEN SIMSON KOMPAKT
MADE IN SWEDEN SIMSON KOMPAKT Exists as hollow jack that handles push and pull operations for stretching cables, rods, bolts, etc. and the drawing off bearings, sleeves, etc. O macaco hidráulico oco possui
Läs merPrueba de inglés. CAPÍTULO siete
CAPÍTULO siete 7 Prueba de inglés Ves la chica del centro? La chica rubia que lleva una camiseta blanca. Se llama Laura. Toda la clase tiene una prueba de inglés. Laura no ha estudiado mucho, por eso está
Läs merINFÖR PROV 3 VT14 Capítulo 11 Qué hacéis?
ÅK 9 INFÖR PROV 3 VT14 Capítulo 11 Qué hacéis? 1 GLOSOR som finns i texten på provet 1. ella es de 2. quiere ser 3. fotomodelo 4. quiere cantar como 5. él/ella dice 6. que su vida 7. es muy aburrida 8.
Läs mer4. Dialogövning Läroplanen säger: Olika former av samtal, dialoger och intervjuer.
ARBETSBLAD SÄNDNINGSDATUM: 2013-12-08 KONCEPTUTVECKLING AV ARBETSBLAD: JOHAN POPPEN & ANNA NYMAN PEDAGOG: EMMA BJARNEBY PROGRAMNR: 103259/TV8 KONTAKT: KUNDTJANST@UR.SE EL ATRACO AL BANCO EPISODE 8: LA
Läs merBioinformatisk metodik (1MB331) VT11 - Sammanfattning
Bioinformatisk metodik (1MB331) VT11 - Sammanfattning Per Enström & Eli Burell Innehåll 1 Inledning 2 2 Databastyper 2 2.1 Depåer (repositories)............................. 2 2.2 Vårdade (curated)..............................
Läs merCaro Senhor, Caro(a) Senhor(a), Prezado(a) Senhor(a),
- Einleitung Bäste herrn, Formell, männlicher Empfänger, Name unbekannt Bästa frun, Formell, weibliche Empfängerin, Name unbekannt Prezado Senhor, Caro Senhor, Prezada Senhora, Cara Senhora, Bästa herr
Läs merMolecular Biology Primer
Molecular Biology Primer Starting 19 th century Cellular biology: Cell as a fundamental building block 1850s+: ``DNA was discovered by Friedrich Miescher and Richard Altmann Mendel s experiments with garden
Läs merlos canis/merdellones/las bakalas ungdomsgrupp som bär guldkedjor, korta kjolar, tajta kläder mm
SÄNDNINGSDATUM: 2008-10-14 ARBETSUPPGIFTER: ERIK CARDELÚS PRODUCENT: LAURA ALBANESI Exprésate Vocabulario dar mucha importancia a la forma de vestir bry sig mycket om klädstilen ir vestido/a gå klädd cambiar
Läs merKroppen i psykoterapi : med en introduktion till andningsmetoden Energy Flow Breathing PDF ladda ner
Kroppen i psykoterapi : med en introduktion till andningsmetoden Energy Flow Breathing PDF ladda ner LADDA NER LÄSA Beskrivning Författare: Bertil Gyllensten. och de möjligheter och utmaningar som finns
Läs merAnimalitos Ejercicio 1 Ejercicio 2 la cabeza, el corazón, la lengua la cola la pata
Ejercicio 1 Lo sabes? 1. La hiena vive en Asia África Australia 2. Las hienas son atractivas son malas tienen mala fama son adorables 3. Uno de estos animales no vive en la sabana. la gacela la hiena el
Läs merEFICIÊNCIA DOS GASTOS MUNICIPAIS EM EDUCAÇÃO NO NORDESTE BRASILEIRO. Efficiency of Municipal Expenditure in Education in the Brazilian Northeast
EFICIÊNCIA DOS GASTOS MUNICIPAIS EM EDUCAÇÃO NO NORDESTE BRASILEIRO Efficiency of Municipal Expenditure in Education in the Brazilian Northeast Alessandra Maria Gomes Rodrigues Economista pela Universidade
Läs merResa Allmänt. Allmänt - Grundläggande. Allmänt - Konversation. Fråga om hjälp. Fråga om en person talar engelska
- Grundläggande Can you help me, please? Fråga om hjälp Do you speak English? Fråga om en person talar engelska Do you speak _[language]_? Fråga om en person talar ett visst språk I don't speak_[language]_.
Läs merHuvudansökan, kandidatprogrammet i språk: portugisiska Urvalsprov kl
Huvudansökan, kandidatprogrammet i språk: portugisiska Urvalsprov 23.5.2018 kl. 9.00 13.00 Skriv ditt namn och dina personuppgifter med tryckbokstäver. Skriv ditt namn med latinska bokstäver (abcd...),
Läs merSläktträd med hjälp av databaser och program från Internet
Övning: Släktträd sid 1 Övning i bioinformatik Släktträd med hjälp av databaser och program från Internet Det finns databaser som är fritt tillgängliga och innehåller nukleotid- och amino-syrasekvenser
Läs merPersonligt Brev. Brev - Adress. Cardinelli Domenico & Vittorio via delle Rose, 18 Petrignano Perugia
- Adress Cardinelli Domenico & Vittorio via delle Rose, 18 Petrignano 06125 Perugia Sr. Vítor Silva Av. Alagoas 546 Bairro Alegria Vitória da Conquista BA 45025-440 Standard engelskt adressformat:, företagets
Läs merResa Äta ute. Äta ute - Vid entrén. Äta ute - Beställa mat
- Vid entrén Me gustaría reservar una mesa para _[número de personas]_ a las _[hora]_. Göra en reservation Una mesa para _[número de personas]_, por favor. Fråga efter ett bord Aceptan tarjetas de crédito?
Läs mer