Motif-based Hidden Markov Models for Multiple Sequence Alignment
|
|
|
- Åke Åkesson
- för 6 år sedan
- Visningar:
Transkript
1 Motif-based Hidden Markov Models for Multiple Sequence Alignment William N. Grundy Charles P. Elkan Dept. of Computer Science & Engineering University of California, San Diego
2 Abstract Protein families are well characterized by a collection of motifs (Sonnhammer & Kahn 1994), sometimes referred to as the common core (Chothia & Lesk 1986). These motifs can have structural and functional significance, and they may frequently be operated upon as units by diverse evolutionary mechanisms. The quality of a multiple alignment depends upon how accurately it identifies an ordered series of motifs (McClure et al. 1994, 1995). Hidden Markov models (HMMs) provide a theoretically sound modeling paradigm for collections of motifs for which efficient algorithms exist. Meta-MEME (Grundy et al. 1996, 1997) is a software toolkit that builds left-to-right, motif-based HMMs that focus upon the common core. Meta-MEME has been shown to detect remote homologies using smaller training sets than are required by standard HMMs. In an analysis of four protein families, Meta-MEME alignments are shown to be of higher quality than those produced by standard HMMs. In a previous analysis of nine other multiple alignment methods (McClure et al. 1994), only one method yields significantly higher quality alignments than Meta-MEME.
3 Meta-MEME Step 1: MEME builds motif models with maximal posterior probability, given a set of related sequences. Step 2: MAST uses only the motifs that appear in more than half the training sequences to search a database for the typical order and spacing of those motifs. Step 3: Meta-MEME constructs a hidden Markov model that combines the motif models in a linear fashion according to the typical schema.
4 Methods Four families were analyzed: globins, eukaryotic kinases, aspartic acid proteases, and the RH domain of the RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase). Each family was represented by a test set of twelve sequences (McClure et al. 1994). Sequence identity among the sequences was 10-70% for the globins and 8-30% for all other families. Standard HMMs (Krogh et al. 1994) were created using the HMMER v1.8 tool hmmt (Eddy 1995). Meta-MEME and HMMER models were aligned using hmma with default parameter settings.
5 Multiple Alignments Pre-determined test motifs are indicated by color. The x s above the alignments indicate Meta-MEME motif positions or HMMER match state positions. Amino acids are unaligned outside of motifs in Meta- MEME alignments or within insertions in HMMER alignments.
6 Meta-MEME Alignment of Globin Sequences...xxxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxxxx... HAHU vlspa...dktnvkaawgkvgahag...eygaealermflsfpttktyfphfd... HAOR mltda...ekkevtalwgkaaghge...eygaealerlfqafpttktyfshfd... HADK vlsaa...dktnvkgvfskigghae...eygaetlermfiaypqtktyfphfd... HBHU vhltp...eeksavtalwgkvnvde...vggealgrllvvypwtqrffesfgdls HBOR vhlsg...geksavtnlwgkvnine...lggealgrllvvypwtqrffeafgdls HBDK vhwta...eekqlitglwgkvnvad...cgaealarllivypwtqrffasfgnls MYHU glsdg...ewqlvlnvwgkveadip...ghgqevlirlfkghpetlekfdkfkhlk MYOR glsdg...ewqlvlkvwgkvegdlp...ghgqevlirlfkthpetlekfdkfkglk IGLOB mkffavlalcivgaiaspltadeaslvqsswkavshn...eveilaavfaaypdiqnkfsqf... GPUGNI altek...qeallkqswevlkqnip...ahslrlfaliieaapeskyvfsflkds. GPYL gvl...tdvqvalvkssfeefnanipknthrfftlvleiapgakdlfsflkgs. GGZLB mldqqtin...iikatvpvlkehgvtit...ttfyknlfakhpevrplfdmg......xxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxx... HAHU...lshGSAQVKGHGKKVadalt...navaHVDDMPNALsa...lSDLHAHKLRVDPVNFk... HAOR...lshGSAQIKAHGKKVadals...taagHFDDMDSALsa...lSDLHAHKLRVDPVNFk... HADK...lshGSAQIKAHGKKVaaalv...eavnHVDDIAGALsk...lSDLHAQKLRVDPVNFk... HBHU tpdavmgnpkvkahgkkvlgafs...dglahldnlkgtfat...lselhcdklhvdpenfr... HBOR sagavmgnpkvkahgakvltsfg...dalknlddlkgtfak...lselhcdklhvdpenfn... HBDK sptailgnpmvrahgkkvltsfg...davknldnikntfaq...lselhcdklhvdpenfr... MYHU sedemkasedlkkhgatvltalggi..lkkkghheaeikplaq...shatkhkipvkylef... MYOR tedemkasadlkkhggtvltalgni..lkkkgqheaelkplaq...shatkhkisikfley... IGLOB...agkDLASIKDTGAFAt...HATRIVSFLse...vIALSGNTSNAAAVNSlvsklg GPUGNI.neipeNNPKLKAHAAVIfkticesatelrqkgHAVWDNNTLkr...lGSIHLKNKITDPHFEvmk... GPYL.sevpqNNPDLQAHAGKVfklt...yeaaIQLEVNGAVasdatlkslGSVHVSKGVVDAHFPvvk... GGZLB...rqeSLEQPKALAMTVlaa...aqNIENLPAILpav...kkiAVKHCQAGVAAAHYPi......xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxxx HAHU...lLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKfl...asVSTVLTSKYR HAOR...lLAHCILVVLARHCPGEFTPSAHAAMDKfl...skVATVLTSKYR HADK...fLGHCFLVVVAIHHPAALTPEVHASLDKfm...caVGAVLTAKYR HBHU...lLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKvv...agVANALAHKYH HBOR...rLGNVLIVVLARHFSKDFSPEVQAAWQKlv...sgVAHALGHKYH HBDK...lLGDILIIVLAAHFTKDFTPECQAAWQKlv...rvVAHALARKYH MYHU...ISECIIQVLQSKHPGDFGADAQGAMNKalelf..rkdmaSNYKELGFQG MYOR...ISEAIIHVLQSKHSADFGADAQAAMGKalelf..rndmaAKYKEFGFQG IGLOB ddhkargvsaaqfgefrtalvaylqanvswgdnvaaawnkal...dntfaivvprl GPUGNI...gaLLGTIKEAIKENWSDEMGQAWTEAYNQl...VATIKAEMKE GPYL...eaILKTIKEVVGDKWSEELNTAWTIAYDEla...iIIKKEMKDAA GGZLB...VGQELLGAIKEVLGDAATDDILDAWGKaygviadvfiqvEADLYAQAVE
7 HMMER Alignment of Globin Sequences xxxxxxxxxxx.xxxxxxxxx.xxxxx...xxxxxx.xxxxxxx.xxxxxxxxxx.xxxxxxxxx HAHU V.LSPADKTN..VKAAWGKVG.AHAGE...YGAEAL.ERMFLSF..PTTKTYFPH.FDLS.HGSA HAOR M.LTDAEKKE..VTALWGKAA.GHGEE...YGAEAL.ERLFQAF..PTTKTYFSH.FDLS.HGSA HADK V.LSAADKTN..VKGVFSKIG.GHAEE...YGAETL.ERMFIAY..PQTKTYFPH.FDLS.HGSA HBHU VHLTPEEKSA..VTALWGKVN.VDEVG...G.EAL.GRLLVVY..PWTQRFFES.FGDL.STPD HBOR VHLSGGEKSA..VTNLWGKVN.INELG...G.EAL.GRLLVVY..PWTQRFFEA.FGDL.SSAG HBDK VHWTAEEKQL..ITGLWGKVNvAD.CG...A.EAL.ARLLIVY..PWTQRFFAS.FGNL.SSPT MYHU G.LSDGEWQL..VLNVWGKVE.ADIPG...HGQEVL.IRLFKGH..PETLEKFDK.FKHL.KSED MYOR G.LSDGEWQL..VLKVWGKVE.GDLPG...HGQEVL.IRLFKTH..PETLEKFDK.FKGL.KTED IGLOB M.KFFAVLALCiVGAIASPLT.ADEASlvqsswkavsHNEVEIlAAVFAAY.PDIQNKFSQFaGKDLASIKD GPUGNI A.LTEKQEAL..LKQSWEVLK.QNIPA...HS.LRL.FALIIEA.APESKYVFSF.LKDSNEIPE GPYL GVLTDVQVAL..VKSSFEEFN.ANIPK...N.THR.FFTLVLEiAPGAKDLFSF.LKGSSEVPQ GGZLB M.L.DQQTIN..IIKATVPVLkEHGVT...ITTTF.YKNLFAK.HPEVRPLFDM.GRQ..ESLE xxxxx.xxxxxxxxxxxxx..xxxxxxxxxxxxxxx..xxxxxxx.xxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxxx HAHU QVKGH.GKKVADA.LTN...AVA.HVDDMPNA...LSALS.D.LHAHKL...RVDPVNF.KLLSHCLL HAOR QIKAH.GKKVADA.L.S...TAAGHFDDMDSA...LSALS.D.LHAHKL...RVDPVNF.KLLAHCIL HADK QIKAH.GKKVAAA.LVE...AVN.HVDDIAGA...LSKLS.D.LHAQKL...RVDPVNF.KFLGHCFL HBHU AVMGNpKVKAHGK.KVLGA..FSDGLAHLDNLKGT...FATLS.E.LHCDKL...HVDPENF.RL.LGNVL HBOR AVMGNpKVKAHGA.KVLTS..FGDALKNLDDLKGT...FAKLS.E.LHCDKL...HVDPENFNRL..GNVL HBDK AILGNpMVRAHGK.KVLTS..FGDAVKNLDNIKNT...FAQLS.E.LHCDKL...HVDPENF.RL.LGDIL MYHU EMKASeDLKKHGA.TVL...TALGGILKKKGHH..EAEIKPL.AQSHATK...HKIPVKYLEFISECII MYOR EMKASaDLKKHGG.TVL...TALGNILKKKGQH..EAELKPL.AQSHATK...HKISIKFLEYISEAII IGLOB T.GA...FATHATRIVSFLseVIALSGNTSNAAAV...NSLVSKL.GDDHKA...R.GVSAA.QF..GEFR GPUGNI NNPK...LKAHAAVIFKTI...CESATELRQKGHAVwdNNTLKRL.GSIHLK...N.KITDP.HF.EVMKG GPYL NNPD...LQAHAG.KVFKL..TYEAAIQLEVNGAVAs.DATLKSL.GSVHVS...K.GVVDA.HF.PVVKE GGZLB Q...PKALAM.TVL...AAAQNIENLPAIL..PAVKKIAvKHCQAGVaaaH.YPIVGQEL.LGAIK xxxxxxxxx.xxxxxxxxx.xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx..x HAHU VT.LAA.H..LPAEFTPA..VHASLDKFLASV.STVLTS..KY..R HAOR VV.LAR.H..CPGEFTPS..AHAAMDKFLSKV.ATVLTS..KY..R HADK VV.VAI.H..HPAALTPE..VHASLDKFMCAV.GAVLTA..KY..R HBHU VCVLAH.H..FGKEFTPP..VQAAYQKVVAGV.ANALAH..KY..H HBOR IVVLAR.H..FSKDFSPE..VQAAWQKLVSGV.AHALGH..KY..H HBDK IIVLAA.H..FTKDFTPE..CQAAWQKLVRVV.AHALAR..KY..H MYHU QV.LQSKHPgDFGADAQGA.MNKALELFRKDM.ASNYKELGFQ..G MYOR HV.LQSKHSaDFGADAQAA.MGKALELFRNDM.AAKYKEFGFQ..G IGLOB TA.LVA.Y..LQANVSWGDnVAAAWNKA.LDN.TFAIVV..PR..L GPUGNI ALLGTIKEA.IKENWSDE..MGQAWTEAYNQLVATIKAE..MK..E GPYL AILKTIKEV.VGDKWSEE..LNTAWTIAYDELAIIIKKE..MKdaA GGZLB EVLGDAAT..DDILDAWGK.AYGVIADVFIQVEADLYAQ..AV..E
8 Meta-MEME Alignment of RH Sequences...xxxxxxxx...xxxxxxxx HTLV-II ldt...apclfsdgspqkaayvlwdqtilqqd...itplpshethsaqkgellalicg SRV-I lnn...allvftdgsstgmaaytladtti...kfqtnlnsaqlvelqaliav RSV pvp...gptvftdasssthkgvvvwregprw...eikeiadlgasvqqlearavama HIV-II ipg...aetfytdgscnrqskegkagyvtdrg...kdkvkkleqttnqqaeleafama MoMLV pda...dhtwytdgssllqegqrkagaavttet...eviwakaldagtsaqraelialtqa Ingi pre...hyklwtdgsvslgeklgaaallhrnntl...icapktgagelscsyraecvaleig CAMV pee...kliietdasddywggmlkaikinegtntelicryasgsfkaaeknyhsndketlavint 17.6 ftk...kftlttdasdvalgavlsqdghplsyi...srtlneheinystiekellaivwa MAUP fnnstnlqepsdsrllyrkgswvnirfaay...lysklseekhglvpk HBV rpg...lcqvfadatptgwglvmghqrmr...gtfsaplpihtaellaacfa Copia fen...kiigyvdsdwagseidrksttgylfkmfdf.nlicwntkrqnsvaassteaeymalfea E.coli mlk...qveiftdgsclgnpgpggygailryrg...rektfsagytrttnnrmelmaaiva x...xxxxxxxxxx... HTLV-II Lraak...pwpsLNIFLDSKYLikylhslaigaflgtsahqtlqaalp... SRV-I Lsafp...nqpLNIYTDSAYLahsiplletvaqikhisetaklflqcqq... RSV Lllwp...ttpTNVVTDSAFVakmllkmgqegvpstaaafiledal... HIV-II Ltds...gpkVNIIVDSQYVmgisasqpteseskivnqiie... MoMLV Lkmae...gkkLNVYTDSRYAfatahihgeiyrrrglltsegkeiknkdeil... Ingi Lqrllkwlp...ryrstpsrLSIFSDSLSMltalqtgplavtdpilrrlwrll... CAMV Ikkfsiy...ltpvhFLIRTDNTHFksfvnlnykgdsklgrnir Tktfrhy...llgrhFEISSDHQPLswlyrmkdpnskltrwr... MAUP Flek...lreINFALDKVDVteidsklsrlmkfsvsaaydevgtlalkslfkfrnseres HBV Rsrs...gaNIIGTDNSVVlsrkytsfpwllgcaanwilrgtsfvyvpsa... Copia VrealwlkflltsiniklenpIKIYEDNQGCisiannpschkrakhidiky... E.coli Lealk...ehceVILSTDSQYVrqgitqwihnwkkrgwktadkkpvknvd......xxxxxxxxx... HTLV-II...pllqgktiylhhvrshtnlpdpistfNEYTDSLILapl... SRV-I...liynrsipfyighvrahsglpgpiahgNQKADLATKtvasn... RSV...sqrsamaavlhvrshsevpgfftegNDVADSQATfqay... HIV-II...emikkeaiyvawvpahkgiggNQEVDHLVSqgirqvl... MoMLV...allkalflpkrlsiihcpghqkghsaeargNRMADQAARkaaitetpdtstll... Ingi...lqvqrrkirirlqfvfdhcgvkrNEVCDEMAKkaadlpql... CAMV...wqawlshysfdvehikgtdNHFADFLSRefnkvns vklsefdfdikyikgkeNCVADALSRikleety... MAUP ikasfkqlrengkiaefsearrlwfeilklirldlfnasslacddllshlqdrrsi... HBV...lnpaddpsrgrlglsrpllrlpfrpttgrtSLYADSPSVpshlpdrvh... Copia...hfareqvqnnvicleyipteNQLADIFTKplpaarfve... E.coli...lwqrldaalgqhqikwewvkghaghpeNERCDELARaaamnptledtgyqvev
9 HMMER Alignment of RH Sequences #=RF xxxxxxxxxxxxxx.xxxxxxx..xxxxx.xxxx..x...xxxx...xxxxxxxx...xxxxx..x HTLV-II LDTAPCLFSDGSPQ.KAAYVLW..DQTIL.QQDI..T...PLP...SH.ETHS...AQ...K SRV-I LNNALLVFTDGSS...TGMAA...YTL.A..D..T...TIKF...QT.NLNS...AQ...L RSV PVPGPTVFTDASSS.THKGVVV...W.R.E.GP..R...WEIK...EIADLGA...SVQQ... HIV-II IPGAETFYTDGSCN.RQSKEGK..AGY.V.T.DR..G...KDKV...KKLEQTT...NQQ... MoMLV PDADHTWYTDGSSL.LQEGQRK..AGAAV.T.TE..T...EVIW...AK.ALDAG...TSAQ...R Ingi PREHYKLWTDGSVS.LGEKLGA...AALL.H.RN..N...TLIC...AP.KTGA...GELSCsyR CAMV PEEKLIIETDASDD.YWGGMLK..AIKIN.EGTN..T...ELICryasgsfkAA.EKNY...HSND FTKKFTLTTDASDVaLGAVLSQ..DGHPL.S.YIs.R...TLN...EH.EINY...STI...E MAUP FNNSTNLQEP.SDS.RLLYRKG...SWVN.I.RFaaY...LYSK...LSEEKHGLvpkfLEKL...R HBV RPGLCQVFADATP..TGWGLVM...GHQR.M..R..G...TFSA...PL.PIHT...AELL... Copia FENKIIGYVDSDWA.GSEIDRKstTGYLFkMFDF..N...LICW...NTKRQNSVa...ASST...E E.coli MLKQVEIFTDGSCL.GNPGPGG..YGAIL.R.YR..GrekTFSA...GYTRTTNNr...MELM... #=RF xxxxxxx...xxxxxx.xxxxxxx.xxx.xxxxxxx..xxxx.xxxxxxxxxxxx...xxxxxxxx.. HTLV-II GELLAL...ICGLRAaKPWPSL..NI..FLD.S...KYLI.KYL.HSLAIGAFl...GTSAHQ... SRV-I VELQAL...IAVLSA.FPNQPL..NI..YTD.S...AYLA.HSI.PLLETVAQikhiSETAKL... RSV LEARAV...AMAL...LLWPTTP.TNV.VTDSAF...VAKM.LLK.MGQEGV.P...STAAAF... HIV-II AELEAF...AMAL...TDSGPKV.NI..IVD.S...QYVM.GIS.ASQPTESE...SKIVNQ... MoMLV AELIALTqa...lKMAEGK.KLNVYTD.SRYaFATAHI...HGEI.YRR.RGLLTS.E...GKEIKN... Ingi AECVALE...IGLQRL.LKWLPRYrST..PSRLSIFs.DSLS.MLT.ALQTGPLA...VTDPIL... CAMV KETLAV...INTI.K.KFSIYL..TPVhFLI.R...TDNT.HFK.SFVNLN.Y...KGDSKL KELLAI...VWAT.K.TFRHYLL.GRH.FEISSD...HQPL.SWL.YR.M.KD...PNSKL... MAUP EINFALDkvdvteIDSKLS.RLMKFSV.SA..AYDEVGTl.ALKS.LFKFRNSERESI...KASFKQLRen HBV AACFARSr...SGANIIgTDNSVVL.SR..KYTSFPWllGCAA.NWILRGTSFV.Y...VPSALNPA.. Copia AEYMAL...FEAVREaLWLKFLL.TS..INIKL...ENPI.KIYEDNQGCISIa..nNPSCHKRAk. E.coli AAIVALE...ALKEHC.EVILSTD.SQ..YVRQGI...TQWIhNWKKRGWKTADK...KPVKNV... #=RF...xxxxxxxxxxxxxxxxx.xxxxxx.xxxxxxxxx..xxxxxxxxxxxx...xxxx.xxx...xxxx HTLV-II...TLQA..ALPPLLQGKT...IYLH.HVRSHT...N.LPDPISTFN...EYTDsLIL...APL. SRV-I...FLQCQ.QLIYNRSIPF...YIGH.V.RAHS...G.LPGPIAHGN...QKAD.LATktvASN. RSV...ILED..ALS..QRSAM...AAVLH.V.RSHSEVPgfFT.EGNDVADS...QAT..F...QAY. HIV-II...IIEEM.IKK..EAIYV...AWVPA.H.KGIGG...NQEV.D.HLV...SQG...IR...QVL. MoMLV...KDEIL.ALLKALFLPKRlSIIHCPgHQKGHSAEAr.GN.RMADQAARKaaiTET..PDT...STLL Ingi...RRLWR.LLLQVQRRKI...RIRLQ.FVFDHCGVK..RN.EVCD.EMA...KKA..ADL...PQL. CAMV...GRNIRWQAW..LSHYS...FDVEH.I.KGTD...N.HFAD.FLS...REF..N...KVNS TRWRV.KLS..EFDFD...IKY..I.KGKE...N.CVAD.ALSR...IKL..E...ETY. MAUP gkiaefsear.rlw.feilkl...irld.l.fnas...s.lacd.dll...shl..qdr...rsi. HBV...DDPSRGRLG..LSRPL...LRLP.F.RPTTGR...TSLYAD.SPSV...PSHL.PD...RVH. Copia...hIDIKYHFAR.EQVQNN...VICLE.Y.IPTE...N.QLADIFTK...PLP..AAR...FVE. E.coli...DLWQRLDAALGQHQIKW.EWVKGH.AGHPENER...CDELAR.AAAM...NPTL.EDTg.yQVEV
10 Alignment Scores Globins Total META-MEME * 11* 12* 57 HMMER 11 12* 11* 10* 11* 55 AMULT ASSEMBLE CLUSTAL V DFALIGN GENALIGN 11*' ' MULTAL MACAW PIMA PRALIGN 8 8* 9* 8* Kinases Total META-MEME HMMER 12 12* 12* AMULT ASSEMBLE * 87 CLUSTALV * * 94 DFALIGN GENALIGN 12' 9* * 11* 90 MULTAL 12 9* 10* * MACAW PIMA PRALIGN 12 10* 6* 4 9* 9* Proteases Total META-MEME 12 4*' 9* 25 HMMER * 25 AMULT ASSEMBLE 0 CLUSTALV 12 9* 6* 27 DFALIGN 12 12* GENALIGN 11 8*' 7* 26 MULTAL 10 7* 9* 26 MACAW PIMA 12 5* 5* 22 PRALIGN 8* 4* 8* 20 RHs Total META-MEME HMMER 11 10* 5*' 7* 33 AMULT 11 9* 8* 7* 35 ASSEMBLE 0 CLUSTALV * 9* 39 DFALIGN GENALIGN 12*' 7 8*' 9*' 36 MULTAL 11* 11* 9* MACAW PIMA * 11* 38 PRALIGN 9 8* 6* 3 26 Scores represent the number of sequences in which each motif was correctly aligned. Scores for non-hmm methods are from (McClure et al. 1994). A * indicates that the motif was correctly aligned in two or more misaligned subsets of the test sequences. A indicates that a gap was inserted into the motif.
11 Results Globins Kinases Proteases RHs Total DFALIGN CLUSTALV META-MEME MULTAL AMULT PIMA HMMER GENALIGN MACAW PRALIGN ASSEMBLE Meta-MEME ranks third overall. MEME discovers 19 of the 20 motifs in the test set. Only DFALIGN (Feng & Doolittle, 1987) significantly outperforms other methods.
12 Discussion Meta-MEME s focus on the common core allows accurate models to be trained from fewer sequences than are required by standard HMMs. By focusing its models on highly conserved regions of the training set, Meta-MEME effectively ignores noisy portions of the data, thereby allowing the software to properly align distant homologs. Meta-MEME alignments could be extended by running another alignment program on the unaligned, non-motif regions. A server for MEME and MAST, as well as the source code for Meta-MEME, is available at
13 References Bailey, T. L. and C. P. Elkan. Fitting a mixture model by expectationmaximization to discover motifs in biopolymers. 2nd ISMB, Chothia, C. and A. M. Lesk. The relation between the divergence of sequence and structure in proteins. EMBO, 5: , Eddy, S. R. Multiple Alignment Using Hidden Markov Models. 3rd ISMB, , Feng, D.-F. and R. F. Doolittle. Progressive sequence alignment as a prerequisite to correct phylogenetic trees. J. Mol. Evol., 25: , Grundy, W. N., T. L. Bailey, C. P. Elkan and M. E. Baker. Meta- MEME: Motif-based hidden Markov models of protein families. CABIOS, To appear. Grundy, W. N., T. L. Bailey, C. P. Elkan and M. E. Baker. Hidden Markov model analysis of motifs in steroid dehydrogenases and their homologs. BBRC, 231(3): , Krogh, A., M. Brown, I. Mian, K. Sjolander and D. Haussler. Hidden Markov Models in Computational Biology: Applications to Protein Modeling. JMB, 234: , McClure, M. A., T. K. Vasi and W. M. Fitch. Comparative analysis of multiple protein-sequence alignment methods. Mol. Bio. Evol., 11(4): , McClure, M. A. and R. Raman. Parametrization studies of hidden Markov models representing highly divergent protein sequences. 28th HICSS, , Sonnhammer, E. and D. Kahn. The modular arrangement of proteins as inferred from analysis of homology. Protein Science, 3: , 1994.
Biochemistry 201 Advanced Molecular Biology (
Biochemistry 201 Advanced Molecular Biology (http://cmgm cmgm.stanford.edu/biochem201/) Bioinformatics: Discovering Function from Sequence Doug Brutlag Departments of Biochemistry June 4, 1999 Discovering
Exam Molecular Bioinformatics X3 (1MB330) - 1 March, Page 1 of 6. Skriv svar på varje uppgift på separata blad. Lycka till!!
Exam Molecular Bioinformatics X (MB) - March, - Page of Skriv svar på varje uppgift på separata blad. Lycka till!! Write the answers to each of the questions on separate sheets of paper. ood luck!! ) Sequence
Health café. Self help groups. Learning café. Focus on support to people with chronic diseases and their families
Health café Resources Meeting places Live library Storytellers Self help groups Heart s house Volunteers Health coaches Learning café Recovery Health café project Focus on support to people with chronic
Isolda Purchase - EDI
Isolda Purchase - EDI Document v 1.0 1 Table of Contents Table of Contents... 2 1 Introduction... 3 1.1 What is EDI?... 4 1.2 Sending and receiving documents... 4 1.3 File format... 4 1.3.1 XML (language
Documentation SN 3102
This document has been created by AHDS History and is based on information supplied by the depositor /////////////////////////////////////////////////////////// THE EUROPEAN STATE FINANCE DATABASE (Director:
Viktig information för transmittrar med option /A1 Gold-Plated Diaphragm
Viktig information för transmittrar med option /A1 Gold-Plated Diaphragm Guldplätering kan aldrig helt stoppa genomträngningen av vätgas, men den får processen att gå långsammare. En tjock guldplätering
Michael Q. Jones & Matt B. Pedersen University of Nevada Las Vegas
Michael Q. Jones & Matt B. Pedersen University of Nevada Las Vegas The Distributed Application Debugger is a debugging tool for parallel programs Targets the MPI platform Runs remotley even on private
Module 6: Integrals and applications
Department of Mathematics SF65 Calculus Year 5/6 Module 6: Integrals and applications Sections 6. and 6.5 and Chapter 7 in Calculus by Adams and Essex. Three lectures, two tutorials and one seminar. Important
1. Compute the following matrix: (2 p) 2. Compute the determinant of the following matrix: (2 p)
UMEÅ UNIVERSITY Department of Mathematics and Mathematical Statistics Pre-exam in mathematics Linear algebra 2012-02-07 1. Compute the following matrix: (2 p 3 1 2 3 2 2 7 ( 4 3 5 2 2. Compute the determinant
PORTSECURITY IN SÖLVESBORG
PORTSECURITY IN SÖLVESBORG Kontaktlista i skyddsfrågor / List of contacts in security matters Skyddschef/PFSO Tord Berg Phone: +46 456 422 44. Mobile: +46 705 82 32 11 Fax: +46 456 104 37. E-mail: tord.berg@sbgport.com
Is it worth to parameterize sequence alignment with an explicit evolutionary model?
Is it worth to parameterize sequence alignment with an explicit evolutionary model? Sean Eddy & E.R. p. 1/33 Channelrhodopsin-1 adapted from www.calvin.edu p. 2/33 Bacterial Rhodopsins BACS2_HALSA.TWFWVGAVGMLAGTVLPI..RD
State Examinations Commission
State Examinations Commission Marking schemes published by the State Examinations Commission are not intended to be standalone documents. They are an essential resource for examiners who receive training
CUSTOMER READERSHIP HARRODS MAGAZINE CUSTOMER OVERVIEW. 63% of Harrods Magazine readers are mostly interested in reading about beauty
79% of the division trade is generated by Harrods Rewards customers 30% of our Beauty clients are millennials 42% of our trade comes from tax-free customers 73% of the department base is female Source:
Measuring child participation in immunization registries: two national surveys, 2001
Measuring child participation in immunization registries: two national surveys, 2001 Diana Bartlett Immunization Registry Support Branch National Immunization Program Objectives Describe the progress of
FORSKNINGSKOMMUNIKATION OCH PUBLICERINGS- MÖNSTER INOM UTBILDNINGSVETENSKAP
FORSKNINGSKOMMUNIKATION OCH PUBLICERINGS- MÖNSTER INOM UTBILDNINGSVETENSKAP En studie av svensk utbildningsvetenskaplig forskning vid tre lärosäten VETENSKAPSRÅDETS RAPPORTSERIE 10:2010 Forskningskommunikation
SVENSK STANDARD SS-EN ISO 19108:2005/AC:2015
SVENSK STANDARD SS-EN ISO 19108:2005/AC:2015 Fastställd/Approved: 2015-07-23 Publicerad/Published: 2016-05-24 Utgåva/Edition: 1 Språk/Language: engelska/english ICS: 35.240.70 Geografisk information Modell
Swedish framework for qualification www.seqf.se
Swedish framework for qualification www.seqf.se Swedish engineering companies Qualification project leader Proposal - a model to include the qualifications outside of the public education system to the
Adding active and blended learning to an introductory mechanics course
Adding active and blended learning to an introductory mechanics course Ulf Gran Chalmers, Physics Background Mechanics 1 for Engineering Physics and Engineering Mathematics (SP2/3, 7.5 hp) 200+ students
Kursplan. MT1051 3D CAD Grundläggande. 7,5 högskolepoäng, Grundnivå 1. 3D-CAD Basic Course
Kursplan MT1051 3D CAD Grundläggande 7,5 högskolepoäng, Grundnivå 1 3D-CAD Basic Course 7.5 Higher Education Credits *), First Cycle Level 1 Mål Studenten ska efter avslutad kurs ha inhämtat grunderna
Installation Instructions
Installation Instructions (Cat. No. 1794-IE8 Series B) This module mounts on a 1794 terminal base unit. 1. Rotate keyswitch (1) on terminal base unit (2) clockwise to position 3 as required for this type
12.6 Heat equation, Wave equation
12.6 Heat equation, 12.2-3 Wave equation Eugenia Malinnikova, NTNU September 26, 2017 1 Heat equation in higher dimensions The heat equation in higher dimensions (two or three) is u t ( = c 2 2 ) u x 2
Könsfördelningen inom kataraktkirurgin. Mats Lundström
Könsfördelningen inom kataraktkirurgin Mats Lundström Innehåll Fördelning av antal operationer utveckling Skillnader i väntetid Effekt av NIKE Skillnader i synskärpa före operation Skillnader i Catquest-9SF
Room E3607 Protein bioinformatics Protein Bioinformatics. Computer lab Tuesday, May 17, 2005 Sean Prigge Jonathan Pevsner Ingo Ruczinski
Room E3607 Protein bioinformatics 260.841 Protein Bioinformatics Computer lab Tuesday, May 17, 2005 Sean Prigge Jonathan Pevsner Ingo Ruczinski Outline of today s lab Topic Suggested time 1 Find a protein
FÖRBERED UNDERLAG FÖR BEDÖMNING SÅ HÄR
FÖRBERED UNDERLAG FÖR BEDÖMNING SÅ HÄR Kontrollera vilka kurser du vill söka under utbytet. Fyll i Basis for nomination for exchange studies i samråd med din lärare. För att läraren ska kunna göra en korrekt
Styrteknik: Binära tal, talsystem och koder D3:1
Styrteknik: Binära tal, talsystem och koder D3:1 Digitala kursmoment D1 Boolesk algebra D2 Grundläggande logiska funktioner D3 Binära tal, talsystem och koder Styrteknik :Binära tal, talsystem och koder
Resultat av den utökade första planeringsövningen inför RRC september 2005
Resultat av den utökade första planeringsövningen inför RRC-06 23 september 2005 Resultat av utökad första planeringsövning - Tillägg av ytterligare administrativa deklarationer - Variant (av case 4) med
Den framtida redovisningstillsynen
Den framtida redovisningstillsynen Lunchseminarium 6 mars 2015 Niclas Hellman Handelshögskolan i Stockholm 2015-03-06 1 Källa: Brown, P., Preiato, J., Tarca, A. (2014) Measuring country differences in
Tentamen Molekylärbiologi X3 (1MB608) 10 March, 2008 Page 1 of 5. Skriv svaren på varje fråga på SEPARATA blad.
Tentamen Molekylärbiologi X3 (1MB608) 10 March, 2008 Page 1 of 5 Skriv svaren på varje fråga på SEPARATA blad. Skriv namn på VARJE blad. Du kan svara på engelska eller svenska. Motivera eller förklara
8 < x 1 + x 2 x 3 = 1, x 1 +2x 2 + x 4 = 0, x 1 +2x 3 + x 4 = 2. x 1 2x 12 1A är inverterbar, och bestäm i så fall dess invers.
MÄLARDALENS HÖGSKOLA Akademin för utbildning, kultur och kommunikation Avdelningen för tillämpad matematik Examinator: Erik Darpö TENTAMEN I MATEMATIK MAA150 Vektoralgebra TEN1 Datum: 9januari2015 Skrivtid:
SVENSK STANDARD SS
Provläsningsexemplar / Preview SVENSK STANDARD Handläggande organ Fastställd Utgåva Sida Allmänna Standardiseringsgruppen, STG 1998-01-30 1 1 (13) SIS FASTSTÄLLER OCH UTGER SVENSK STANDARD SAMT SÄLJER
Technique and expression 3: weave. 3.5 hp. Ladokcode: AX1 TE1 The exam is given to: Exchange Textile Design and Textile design 2.
Technique and expression 3: weave 3.5 hp Ladokcode: AX1 TE1 The exam is given to: Exchange Textile Design and Textile design 2 ExamCode: February 15 th 9-13 Means of assistance: Calculator, colorpencils,
Mapping sequence reads & Calling variants
Universitair Medisch Centrum Utrecht Mapping sequence reads & Calling variants Laurent Francioli 2014-10-28 l.francioli@umcutrecht.nl Next Generation Sequencing Data processing pipeline Mapping to reference
LUNDS TEKNISKA HÖGSKOLA Institutionen för Elektro- och Informationsteknik
LUNDS TEKNISKA HÖGSKOLA Institutionen för Elektro- och Informationsteknik SIGNALBEHANDLING I MULTIMEDIA, EITA50, LP4, 209 Inlämningsuppgift av 2, Assignment out of 2 Inlämningstid: Lämnas in senast kl
Sri Lanka Association for Artificial Intelligence
Sri Lanka Association for Artificial Intelligence First Sinhala Chatbot in action Budditha Hettige Department of Statistics and Computer Science, Faculty of Applied Science, University of Sri Jayewardenepura,
Semantic and Physical Modeling and Simulation of Multi-Domain Energy Systems: Gas Turbines and Electrical Power Networks
DEGREE PROJECT IN ELECTRICAL ENGINEERING, SECOND CYCLE, 30 CREDITS STOCKHOLM, SWEDEN 2017 Semantic and Physical Modeling and Simulation of Multi-Domain Energy Systems: Gas Turbines and Electrical Power
Support Manual HoistLocatel Electronic Locks
Support Manual HoistLocatel Electronic Locks 1. S70, Create a Terminating Card for Cards Terminating Card 2. Select the card you want to block, look among Card No. Then click on the single arrow pointing
Kursplan. NA3009 Ekonomi och ledarskap. 7,5 högskolepoäng, Avancerad nivå 1. Economics of Leadership
Kursplan NA3009 Ekonomi och ledarskap 7,5 högskolepoäng, Avancerad nivå 1 Economics of Leadership 7.5 Higher Education Credits *), Second Cycle Level 1 Mål Studenterna skall efter genomgången kurs: kunna
Theory 1. Summer Term 2010
Theory 1 Summer Term 2010 Robert Elsässer 1 Introduction Summer Term 2010 Robert Elsässer Prerequisite of Theory I Programming language, such as C++ Basic knowledge on data structures and algorithms, mathematics
Module 1: Functions, Limits, Continuity
Department of mathematics SF1625 Calculus 1 Year 2015/2016 Module 1: Functions, Limits, Continuity This module includes Chapter P and 1 from Calculus by Adams and Essex and is taught in three lectures,
Windlass Control Panel v1.0.1
SIDE-POWER Windlass Systems 86-08950 Windlass Control Panel v1.0.1 EN Installation manual Behåll denna manual ombord! S Installations manual SLEIPNER AB Kilegatan 1 452 33 Strömstad Sverige Tel: +46 525
Oförstörande provning (NDT) i Del M Subpart F/Del 145-organisationer
Oförstörande provning (NDT) i Del M Subpart F/Del 145-organisationer Ref. Del M Subpart F & Del 145 2012-05-02 1 Seminarium för Teknisk Ledning HKP 3maj, 2012, Arlanda Inledning Allmänt Viktigare krav
SUPPLEMENTARY INFORMATION
SUPPLEMENTARY INFORMATION SUPPLEMENTARY METHODS Preparation of the cells for transmission electron microscopy - Cells grown on coverslips were fixed for 45 minutes with 2.5% glutaraldehyde (50 mm cacodylate
Manhour analys EASA STI #17214
Manhour analys EASA STI #17214 Presentatör Johan Brunnberg, Flygteknisk Inspektör & Del-M Koordinator Sjö- och luftfartsavdelningen Operatörsenheten Sektionen för teknisk operation 1 Innehåll Anmärkningen
Rättningstiden är i normalfall 15 arbetsdagar, annars är det detta datum som gäller:
Molekylärbiologi Provmoment: Ladokkod: Tentamen ges för: Tentamen TK151C Bt3 7,5 högskolepoäng TentamensKod: Tentamensdatum: 2016-01-12 Tid: 14:00 18:00 Hjälpmedel: Tillåtna hjälpmedel är lexikon. Dock
Läkemedelsverkets Farmakovigilansdag
Swedish Medical Products Agency s Patient- and Consumer Advisory Board Brita Sjöström May 29, 2018 Patientrådet@mpa.se https://lakemedelsverket.se/patient-konsument-rad The vision of the Swedish Medical
Quicksort. Koffman & Wolfgang kapitel 8, avsnitt 9
Quicksort Koffman & Wolfgang kapitel 8, avsnitt 9 1 Quicksort Quicksort väljer ett spcifikt värde (kallat pivot), och delar upp resten av fältet i två delar: alla element som är pivot läggs i vänstra delen
Kurskod: TAMS28 MATEMATISK STATISTIK Provkod: TEN1 05 June 2017, 14:00-18:00. English Version
Kurskod: TAMS28 MATEMATISK STATISTIK Provkod: TEN1 5 June 217, 14:-18: Examiner: Zhenxia Liu (Tel: 7 89528). Please answer in ENGLISH if you can. a. You are allowed to use a calculator, the formula and
Kurskod: TAIU06 MATEMATISK STATISTIK Provkod: TENA 15 August 2016, 8:00-12:00. English Version
Kurskod: TAIU06 MATEMATISK STATISTIK Provkod: TENA 15 August 2016, 8:00-12:00 Examiner: Xiangfeng Yang (Tel: 070 0896661). Please answer in ENGLISH if you can. a. Allowed to use: a calculator, Formelsamling
PORTSECURITY IN SÖLVESBORG
PORTSECURITY IN SÖLVESBORG Kontaktlista i skyddsfrågor / List of contacts in security matters Skyddschef/PFSO Joakim Nilsson Phone: +46 456 422 44. Mobile: +46 708 56 94 09 E-mail: joakim.nilsson@sbgport.com
CHANGE WITH THE BRAIN IN MIND. Frukostseminarium 11 oktober 2018
CHANGE WITH THE BRAIN IN MIND Frukostseminarium 11 oktober 2018 EGNA FÖRÄNDRINGAR ü Fundera på ett par förändringar du drivit eller varit del av ü De som gått bra och det som gått dåligt. Vi pratar om
EXPERT SURVEY OF THE NEWS MEDIA
EXPERT SURVEY OF THE NEWS MEDIA THE SHORENSTEIN CENTER ON THE PRESS, POLITICS & PUBLIC POLICY JOHN F. KENNEDY SCHOOL OF GOVERNMENT, HARVARD UNIVERSITY, CAMBRIDGE, MA 0238 PIPPA_NORRIS@HARVARD.EDU. FAX:
EXTERNAL ASSESSMENT SAMPLE TASKS SWEDISH BREAKTHROUGH LSPSWEB/0Y09
EXTENAL ASSESSENT SAPLE TASKS SWEDISH BEAKTHOUGH LSPSWEB/0Y09 Asset Languages External Assessment Sample Tasks Breakthrough Stage Listening and eading Swedish Contents Page Introduction 2 Listening Sample
REHAB BACKGROUND TO REMEMBER AND CONSIDER
Training in water REHAB BACKGROUND TO REMEMBER AND CONSIDER PHASE I: PROLIFERATION PROTECTION, 0-6 WEEKS PHASE II: TRANSITION PROGRESSION, 7-12 WEEKS PHASE III: REMODELLING FUNCTION, 13-32 WEEKS PHASE
Custom-made software solutions for increased transport quality and creation of cargo specific lashing protocols.
Custom-made software solutions for increased transport quality and creation of cargo specific lashing protocols. ExcelLoad simulates the maximum forces that may appear during a transport no matter if the
Taking Flight! Migrating to SAS 9.2!
Taking Flight! Migrating to SAS 9.2! Joel Orr, System Engineering Division June 1, 2011 Agenda Introduction Benefits of Migration Possible Migration Scenarios To Do List Potential Problems Resources Introduction
Mönster. Ulf Cederling Växjö University Ulf.Cederling@msi.vxu.se http://www.msi.vxu.se/~ulfce. Slide 1
Mönster Ulf Cederling Växjö University UlfCederling@msivxuse http://wwwmsivxuse/~ulfce Slide 1 Beskrivningsmall Beskrivningsmallen är inspirerad av den som användes på AG Communication Systems (AGCS) Linda
District Application for Partnership
ESC Region Texas Regional Collaboratives in Math and Science District Application for Partnership 2013-2014 Applying for (check all that apply) Math Science District Name: District Contacts Name E-mail
MONTERINGSINSTRUKTION ASSEMBLY INSTRUCTION
11/ 97 MONTERINGINTRUKTION AEMBLY INTRUCTION AGNPRIDARE / CHAFFPREADER Art. nr. 12313, 12314 CLAA LEXION 420-460 REKORDVERKEN weden AB Öttum E-535 92 KVÄNUM Tel. +46(0)511-37 01 00 Fax. +46(0)511-37 00
En bild säger mer än tusen ord?
Faculteit Letteren en Wijsbegeerte Academiejaar 2009-2010 En bild säger mer än tusen ord? En studie om dialogen mellan illustrationer och text i Tiina Nunnallys engelska översättning av Pippi Långstrump
Förändrade förväntningar
Förändrade förväntningar Deloitte Ca 200 000 medarbetare 150 länder 700 kontor Omsättning cirka 31,3 Mdr USD Spetskompetens av världsklass och djup lokal expertis för att hjälpa klienter med de insikter
DE TRE UTMANINGARNA..
DE TRE UTMANINGARNA.. SYSTEM MATERIAL PROCESSER PROTOTYP UTVECKLING SERIE UTVECKLINGSFASER NY LEVERANTÖR System Process AS9100 NadCap Geometri Legering In718/ Ti Rf/ Al Standard ISO9000 TID RESAN MOT MÅLET
INTERAKTIVA UTBILDNINGAR. UPPDRAG: Trafikutbildning åt Örebro kommun. KUND: Agresso Unit4
ANTON IVANOV portfolio illustrationer 2000-2008 INTERATIVA UTBILDNINGAR UPPDRAG: Trafikutbildning åt Örebro kommun. UND: Agresso Unit4 2 ANTON IVANOV 2008 INTERATIVA UTBILDNINGAR UPPDRAG: Arbetsmiljöutbildning
Anders Persson Philosophy of Science (FOR001F) Response rate = 0 % Survey Results. Relative Frequencies of answers Std. Dev.
Anders Persson Philosophy of Science (FOR00F) Response rate = 0 % Survey Results Legend Relative Frequencies of answers Std. Dev. Mean Question text Left pole % % Right pole n=no. of responses av.=mean
Sammanfattning. Revisionsfråga Har kommunstyrelsen och tekniska nämnden en tillfredställande intern kontroll av att upphandlade ramavtal följs.
Granskning av ramavtal Januari 2017 1 Sammanfattning Uppdrag och Bakgrund Kommunen upphandlar årligen ett stort antal tjänster via ramavtal. Ramavtalen kan löpa under flera år och tjänster avropas löpande
SWESIAQ Swedish Chapter of International Society of Indoor Air Quality and Climate
Swedish Chapter of International Society of Indoor Air Quality and Climate Aneta Wierzbicka Swedish Chapter of International Society of Indoor Air Quality and Climate Independent and non-profit Swedish
JTS snabbstartsguide. Endast för användning av utbildad personal
JTS snabbstartsguide Endast för användning av utbildad personal Läs förlängningsprotokollet och bruksanvisningen för fullständiga instruktioner, tillsammans med varningar och försiktighetsåtgärder innan
!"#$ $ % &'(')*+* +, 012/( 3-0$ (4 (5 /& 0- -(4 (5 /& 06/7*)).)*+* 8 09
!!"#$ $ % &'(')*+* +, -./& 012/( 3-0$ (4 (5 /& 0- -(4 (5 /& 06/7*)).)*+* 8 0 Organisation/ Organization Linnéuniversitetet Institutionen för teknik Linnaeus University School of Engineering Författare/Author(s)
SVENSK STANDARD SS-ISO 8734
SIS - Standardiseringskommissionen i Sverige Handläggande organ SMS, SVERIGES MEKANSTANDARDISERING SVENSK STANDARD SS-ISO 8734 Fastställd Utgåva Sida Registering 1992-11-16 1 1 (1+8) SMS reg 27.1128 SIS
Sara Skärhem Martin Jansson Dalarna Science Park
Sara Skärhem Martin Jansson Dalarna Science Park Sara Skärhem Martin Jansson Vad är innovation? På Wikipedia hittar man: En innovation är en ny idé, till exempel i form av en produkt, lösning, affärsidé,
Methods to increase work-related activities within the curricula. S Nyberg and Pr U Edlund KTH SoTL 2017
Methods to increase work-related activities within the curricula S Nyberg and Pr U Edlund KTH SoTL 2017 Aim of the project Increase Work-related Learning Inspire theachers Motivate students Understanding
Isometries of the plane
Isometries of the plane Mikael Forsberg August 23, 2011 Abstract Här följer del av ett dokument om Tesselering som jag skrivit för en annan kurs. Denna del handlar om isometrier och innehåller bevis för
Information technology Open Document Format for Office Applications (OpenDocument) v1.0 (ISO/IEC 26300:2006, IDT) SWEDISH STANDARDS INSTITUTE
SVENSK STANDARD SS-ISO/IEC 26300:2008 Fastställd/Approved: 2008-06-17 Publicerad/Published: 2008-08-04 Utgåva/Edition: 1 Språk/Language: engelska/english ICS: 35.240.30 Information technology Open Document
Projektmodell med kunskapshantering anpassad för Svenska Mässan Koncernen
Examensarbete Projektmodell med kunskapshantering anpassad för Svenska Mässan Koncernen Malin Carlström, Sandra Mårtensson 2010-05-21 Ämne: Informationslogistik Nivå: Kandidat Kurskod: 2IL00E Projektmodell
Sannolikhetsteori. Tentamenskrivning: TMS145 - Grundkurs i matematisk statistik och bioinformatik,
Tentamenskrivning: TMS145 - Grundkurs i matematisk statistik och bioinformatik, 5p. Tid: Lördag den 29 mars, 2008 kl 14.00-18.00 i V-huset. Examinator: Olle Nerman, tel 7723565. Jour: Alexandra Jauhiainen,
Om oss DET PERFEKTA KOMPLEMENTET THE PERFECT COMPLETION 04 EN BINZ ÄR PRECIS SÅ BRA SOM DU FÖRVÄNTAR DIG A BINZ IS JUST AS GOOD AS YOU THINK 05
Om oss Vi på Binz är glada att du är intresserad av vårt support-system för begravningsbilar. Sedan mer än 75 år tillverkar vi specialfordon i Lorch för de flesta olika användningsändamål, och detta enligt
Examensarbete i matematik på grundnivå med inriktning mot optimeringslära och systemteori
Examensarbete i matematik på grundnivå med inriktning mot optimeringslära och systemteori (kurskod SA104X, 15hp, VT15) http://www.math.kth.se/optsyst/grundutbildning/kex/ Förkunskaper Det är ett krav att
Högskolan i Skövde (SK, JS) Svensk version Tentamen i matematik
Högskolan i Skövde (SK, JS) Svensk version Tentamen i matematik Kurs: MA152G Matematisk Analys MA123G Matematisk analys för ingenjörer Tentamensdag: 2012-03-24 kl 14.30-19.30 Hjälpmedel : Inga hjälpmedel
Tulldeklarationernas datainnehåll
UCC, IA, DA, WP och TDA Ändringarna och hur de tillämpas Tulldeklarationernas datainnehåll 4.11.2015 UCC/IA/DA/WP/TDA 1 Inga ändringar 1.5.2016 Tilanne 11/2015 Huvudregeln: Inga ändringar börjar tillämpas
Enterprise App Store. Sammi Khayer. Igor Stevstedt. Konsultchef mobila lösningar. Teknisk Lead mobila lösningar
Enterprise App Store KC TL Sammi Khayer Konsultchef mobila lösningar Familjen håller mig jordnära. Arbetar med ledarskap, mobila strategier och kreativitet. Fotbollen ger energi och fokus. Apple fanboy
Labokha AA et al. xlnup214 FG-like-1 xlnup214 FG-like-2 xlnup214 FG FGFG FGFG FGFG FGFG xtnup153 FG FGFG xtnup153 FG xlnup62 FG xlnup54 FG FGFG
xlnup214 FG-like-1 (aa 443-69) TSVSAPAPPASAAPRSAAPPPYPFGLSTASSGAPTPVLNPPASLAPAATPTKTTSQPAAAATSIFQPAGPAAGSLQPPSLPAFSFSSANNAANASAPSSFPFGA AMVSSNTAKVSAPPAMSFQPAMGTRPFSLATPVTVQAATAPGFTPTPSTVKVNLKDKFNASDTPPPATISSAAALSFTPTSKPNATVPVKSQPTVIPSQASVQP
1. Varje bevissteg ska motiveras formellt (informella bevis ger 0 poang)
Tentamen i Programmeringsteori Institutionen for datorteknik Uppsala universitet 1996{08{14 Larare: Parosh A. A., M. Kindahl Plats: Polacksbacken Skrivtid: 9 15 Hjalpmedel: Inga Anvisningar: 1. Varje bevissteg
Det här med levels.?
Det här med levels.? Eller: När ska det vara praktik i Modulen? 1 Appendix I Basic knowledge requirements 1. KNOWLEDGE LEVELS CATEGORY A, B1, B2 AND C AIRCRAFT MAINTENANCE LICENCE Basic knowledge for categories
The Municipality of Ystad
The Municipality of Ystad Coastal management in a local perspective TLC The Living Coast - Project seminar 26-28 nov Mona Ohlsson Project manager Climate and Environment The Municipality of Ystad Area:
Questionnaire on Nurses Feeling for Hospital Odors
J. Japan Association on Odor Environment Vol. -1 No. 0,**0 437 *, ** * * Questionnaire on Nurses Feeling for Hospital Odors Tomoyo ITAKURA*, **, Megumi MITSUDA*, Takuzo INAGAKI*,,/. + +-/ 13.+... + +,,
What Is Hyper-Threading and How Does It Improve Performance
What Is Hyper-Threading and How Does It Improve Performance Ali Muthanna, Lunds Universitet, IDA2, EDT621 Abstract Hyper-Threading (HT) is Intel s version of simultaneous multi-threading (SMT). Hyper-Threading
TAKE A CLOSER LOOK AT COPAXONE (glatiramer acetate)
TAKE A CLOSER LOOK AT COPAXONE (glatiramer acetate) A TREATMENT WITH HIDDEN COMPLEXITY COPAXONE is a complex mixture of several million distinct polypeptides. 2 State-of-the-art analytics cannot distinguish
PEC: European Science Teacher: Scientific Knowledge, Linguistic Skills and Digital Media
PEC: Fredagen den 22/9 2006, Forum För Ämnesdidaktik The aim of the meeting A presentation of the project PEC for the members of a research group Forum För Ämnesdidaktik at the University of Gävle. The
The present situation on the application of ICT in precision agriculture in Sweden
The present situation on the application of ICT in precision agriculture in Sweden Anna Rydberg & Johanna Olsson JTI Swedish Institute for Agricultural and Environmental Engineering Objective To investigate
Företagsekonomi, allmän kurs. Business Administration, General Course. Business Administration. 2004-07-01 until further notice
1(6) School of Management and Economics Course syllabus Course Code FEA330 Reg.No. EHVd 2004:35 Date of decision 2004-09-06 Course title in Swedish Course title in English Företagsekonomi, allmän kurs
Senaste trenderna inom redovisning, rapportering och bolagsstyrning Lars-Olle Larsson, Swedfund International AB
1 Senaste trenderna inom redovisning, rapportering och bolagsstyrning Lars-Olle Larsson, Swedfund International AB 2 PwC undersökning av börsföretag & statligt ägda företag Årlig undersökning av års- &
Arbetstillfällen 100 000.
2 3 4 Arbetstillfällen 100 000. 5 6 7 Vissa anspråk ställs I de internationella direktiv och konventioner Sverige antingen är ålagt att följa eller frivilligt valt att följa. Här har jag listat några exempel
Calculate check digits according to the modulus-11 method
2016-12-01 Beräkning av kontrollsiffra 11-modulen Calculate check digits according to the modulus-11 method Postadress: 105 19 Stockholm Besöksadress: Palmfeltsvägen 5 www.bankgirot.se Bankgironr: 160-9908
SUPPLEMENTARY FIGURE LEGENDS
SUPPLEMETARY FIGURE LEGEDS Supplementary Fig. 1. Flow cytometric analysis of wildtype, mutant and chimeric protein surface expression. Cells transduced with the individual constructs indicated were stained
(D1.1) 1. (3p) Bestäm ekvationer i ett xyz-koordinatsystem för planet som innehåller punkterna
Högsolan i Sövde (SK) Tentamen i matemati Kurs: MA4G Linjär algebra MAG Linjär algebra för ingenjörer Tentamensdag: 4-8-6 l 4.-9. Hjälpmedel : Inga hjälpmedel utöver bifogat formelblad. Ej ränedosa. Tentamen
Accessing & Allocating Alternatives
Accessing & Allocating Alternatives MODERATOR Keith Gregg President Aequitas Capital Partners PANELISTS Robert Worthington President Hatteras Funds William Miller Chief Investment Officer Brinker Capital
Kursplan. PR1017 Portugisiska: Muntlig språkfärdighet II. 7,5 högskolepoäng, Grundnivå 1. Portuguese: Oral Proficiency II
Kursplan PR1017 Portugisiska: Muntlig språkfärdighet II 7,5 högskolepoäng, Grundnivå 1 Portuguese: Oral Proficiency II 7.5 Higher Education Credits *), First Cycle Level 1 Mål Efter avslutad kurs ska den
Vilka ska vi inte operera?
Vilka ska vi inte operera? Mats Lundström Analyser baserat på data i Nationella Kataraktregistret För vilka patienter finns en förhöjd risk att det blir sämre efter operation än det var före? Indikationer
Statistical modelling and alignment of protein sequences
Statistical modelling and alignment of protein sequences Martin Weigt Laboratoire de Biologie Computationnelle et Quantitative Université Pierre et Marie Curie Paris ENS Paris 11 July 2016 What is the
Course syllabus 1(7) School of Management and Economics. FEN305 Reg.No. EHVc 2005:6 Date of decision 2004-12-22. Course Code. Företag och Marknad I
1(7) School of Management and Economics Course syllabus Course Code FEN305 Reg.No. EHVc 2005:6 Date of decision 2004-12-22 Course title in Swedish Course title in English Language of instruction Subject
Övning 5 ETS052 Datorkommuniktion Routing och Networking
Övning 5 TS5 Datorkommuniktion - 4 Routing och Networking October 7, 4 Uppgift. Rita hur ett paket som skickas ut i nätet nedan från nod, med flooding, sprider sig genom nätet om hop count = 3. Solution.