Nationellt referenslaboratorium (NRL) för Herpesvirus (HSV-1, HSV-2, VZV, CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8, HVS)

Transkript

1 Nationellt referenslaboratorium (NRL) för Herpesvirus (HSV-1, HSV-2, VZV, CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8, HVS) Huvudansvarigt NRL Klinisk mikrobiologi Verksamhetschef Christina Welinder Olsson Kompletterande NRL Avdelningen för mikrobiologi Avdelningschef Karin Tegmark Wisell Fördelning av uppdrag Vid frågor kontaktas huvudansvarigt NRL, om det inte är tydligt att frågan hanterades av kompletterande NRL. Viruslaboratoriet i Göteborg har avsikt att på sikt ta över alla funktioner. Kontaktuppgifter och tillgänglighet Kontaktperson Jan-Åke Liljeqvist Virologiska laboratoriet har 24-timmars jour och nås via växeln vid Vid behov tar jourhavande virolog kontakt med ansvariga medarbetare för herpesvirusdiagnostiken på laboratoriet. Kontaktperson Mia Brytting Kontakt nås via kundtjänst telefon måndag-fredag 08:00-12:00 12:30-16:30 och vid brådskande behov utanför kontorstid kan fråga anmälas till KMiB för vidareförmedling till NRL med svar under kontorstid. Referensdiagnostik Svarstider och slutsvar. Alla analyser, som specificeras enligt nedan, förutom genotypisk antiviralresistens CMV (tar 1-2 veckor), kan besvaras inom 24 timmar måndag lördag från det att provet anlänt till laboratoriet. Svar kommer att levereras som pappers- och vid behov som telefonsvar. Agens/Analyskod Analys Pris Cytomegalovirus ACMVGAR CMV; IgG-antikroppar AU/ml (CMIA) 364 kr ACMVMAR CMV; IgM-antikroppar (CMIA) 443 kr FCMVM CMV; IgM-antikroppar, konfirmation (IFL) 443 kr

2 DCMV CMV; Påvisning av DNA (realtids PCR) 566 kr KCMVTQ CMV; kvantifiering (realtids PCR) kr CMVDNAUL54 CMV; UL54 (PCR inför sekvensering) 873 kr CMVDNAUL97 CMV; UL97 (PCR inför sekvensering) 873 kr CMVUL54 Sekvensering UL kr CMVUL97 Sekvensering UL kr Genotypisk antiviralres. CMV om pos PCR kr Epstein-Barr virus AEBNAGAR EBV, kärnantigen; IgG-antikroppar (CMIA) 364 kr AEBGAR EBV, kapsidantigen; IgG-antikroppar (CMIA) 364 kr AEBMAR EBV, kapsidantigen; IgM-antikroppar (CMIA) 364 kr DEB EBV; Påvisning av DNA (realtids PCR) 604 kr KEBVTQ EBV; DNA-kvantifiering (realtids PCR) 566 kr Herpes simplex virus EHSG HSV; IgG-antikroppar (ELISA) 283 kr EHSM2 HSV; IgM-antikroppar (ELISA) 443 kr FHSM HSV; IgM-antikroppar, konfirmation (IFL) 443 kr DHSV HSV; Påvisning av DNA (realtids PCR) 724 kr VILHSV HSV; isolering 530 kr Herpes simplex virus 1 EHS1G HSV typ 1; IgG-antikroppar (ELISA) 283 kr KHS1TQ HSV typ 1; DNA kvantifiering (realtids PCR) 690 kr Herpes simplex virus 2 EGG2 HSV typ 2, konfirmation; IgG-antikroppar (ELISA) 389 kr EHS2G HSV typ 2; IgG-antikroppar (ELISA) 283 kr KHS2TQ HSV typ 2; DNA kvantifiering (realtids PCR) 690 kr Humant herpes virus 6 FHHV6G HHV-6; IgG-antikroppar (IFL) 443 kr DHHV6 HHV-6; Påvisning av DNA (realtids PCR) 566 kr KHHV6TQ HHV-6; DNA kvantifiering (realtids PCR) 690 kr Varicella zoster virus EVZG2 VZV; IgG-antikroppar (ELISA) 283 kr VZVM VZV; IgM-antikroppar (CLIA) 319 kr FVZG VZV; IgG-antikroppar, konfirmation (IFL) 443 kr

3 FVZM VZV; IgM-antikroppar, konfirmation (IFL) 443 kr DVZV VZV; Påvisning av DNA (realtids PCR) 566 kr KVZTQ VZV; DNA kvantifiering (realtids PCR) 690 kr TILLÄGG AKUTPROV 503 kr Viruslaboratoriet i Göteborg avser att sätta upp metoder för att påvisa HHV-7 och HHV-8 DNA under Vi planerar även att utföra genotypisk antiviralresistens-analys för HSV där bistår med kompetens och ev. reagens och metoder. Kompletterande serologisk diagnostik; Om behov uppkommer för serologisk diagnostik av IgM- antikroppar mot HHV-6 och/eller IgG och IgM-antikroppar mot HHV-7 har vi kontakt med Public Health England, Virus reference department (VRD), reference-microbiology-laboratory-tests-and-services. Diagnostik av herpes simian B virus: Laboratoriet har kontakt med Robin Gopal, ansvarig vid High Containment Microbiology, National Infections Service Public Health England, Tel: +44(0) or 6222 Serologisk diagnostik är osäker och utförs ej. Om misstanke om herpes B virus infektion uppkommer, får kontakt tas med viruslaboratoriet i Göteborg för vidare diskussion om PCR alt. virusisolering i samråd med Robin Gopal PHE. Hänvisar också till dokument från PHE ang. Monkey bite guidance som är tillgänglig vid virologiska laboratoriet i Göteborg och vid FOHM. PCR. Det material som den exponerade kommit i kontakt med t.ex. saliv, urin, blod eller nervvävnad kan analyseras med PCR. Hos en infekterad individ kan virus ibland påvisas i hudlesioner, ögonsekret eller saliv. Virusisolering kräver säkerhetsklass 3 på laboratoriet och utförs vid PHE efter kontakt. Analys Tillgänglighet Avgift Cytomegalovirus, genotypisk resistensbestämning, kinas Cytomegalovirus, genotypisk resistensbestämning, polymerasgen Herpes simplexvirus, genotypisk resistensbestämning, kinas Herpes simplexvirus, genotypisk resistensbestämning, polymerasgen 3410:- 4160:- 4475:- 5010:- Då ingått avtal med de nordiska länderna för komplett genotypisk resistensbestämning för CMV och HSV kommer myndigheten att fortsätta med dessa till avtalen löper ut. Vi ser dock gärna att dessa med tiden överförs till NRL för herpesvirus vid Klinisk mikrobiologi och därefter avvecklas vid. utför även PCR påvisning av EBV, HHV-6, HHV-7 och HHV-8 (1285:- /analys). Dessa analyser planeras överföras till Klinisk mikrobiologi Sahlgrenska Universitetssjukhuset under 2017 och därefter avvecklas vid.

4 sekvenserar även VZV för att kunna skilja på vaccinstam samt vildtypsstam vid misstanke om vaccinbiverkan. Denna metod är etablerad för den nationella vaccinövervakning och ingår i myndighetens uppdrag och utförs utan avgift. Utsvar på papper/elektroniskt via Labportalen från hösten 2017/För Karolinska, Sahlgrenska, Uppsala, Linköping kopplas E-svar till journalsystemet. Referensmaterial På laboratoriet sparas alla prover med klinisk herpesvirus frågeställning 15 år i en biobank. Det finns därför omfattande referensmaterial för HSV-1, HSV-2, VZV, CMV, EBV och HHV-6 vilka kan användas vid utvärdering av ny metodik eller som positiv kontroll, samt tillhandahålla referensmaterial för serologiska kvalitetspaneler. Vid finns olika referensstammar för merparten av herpesvirus. Vi har även väl karaktäriserade känsliga/resistenta CMV och HSV-stammar. Expertstöd Expertis inom fältet finns på laboratoriet för stöd vid särskilda frågeställningar via telefon eller e-post. För akut rådgivning finns möjlighet att nå jourläkare dygnet runt. Personal vid myndigheten har många års erfarenhet av att bistå med expertstöd för antiviral behandling och resistensfrågeställningar för CMV och HSV samt PCR diagnostik för EBV, HHV-6, HHV-7 och HHV-8. Utveckling och samverkan Laboratoriet har omfattande erfarenhet av utveckling och validering av metoder för påvisande av herpesvirus med serologi och med realtids-pcr. Utvärderar nya diagnostiska metoder inom fältet. Det finns en bred erfarenhet och kunskap som tillsammans med kan stödja andra laboratoriers metodutveckling och validering av tester och metoder. Viruslaboratoriet i Göteborg avser att sätta upp metoder för att påvisa HHV-7 och HHV-8 DNA under Vi planerar även att utföra genotypisk antiviralresistens-analys för HSV där bistår med kompetens och ev. reagens och metoder. Docent Mia Brytting deltar i RAVs metodgrupp samt huvudgrupp som hanterar frågor om diagnostik, behandling mm.

5 Omvärldsbevakning och beredskap Laboratoriet har ett nära samarbete med Smittskyddsenheten i regionen. Vi följer noga forskningsfältet genom att ta del av publikationer och genom att medverka i nationella och internationella möten och konferenser. Vad gäller förekomsten av herpesvirus inom landet ska vi samarbeta med som kommer att bistå med överföring av metoder och kompetens av diagnostik enligt ovan. Den omfattande erfarenheten av egenutvecklade diagnostiska metoder gör att vi snabbt kan anpassa eller vid behov utveckla nya metoder. har nyligen ingått avtal med de nordiska länderna för att utföra genotypisk antiviral resistens-analys av HSV och CMV. Denna funktion kommer att på sikt överföras till Viruslaboratoriet i Göteborg. samt Avdelningen för Mikrobiologi bedriver kontinuerlig omvärldsbevakning för att hålla mutationslistor samt läkemedelslistor uppdaterade för relevant resistensanalys.