Vad är repetitionslängd?

Relevanta dokument
Klipp-och-klistra DNA: fixa mutationen med gen editering DNA, RNA och Protein

Huntingtons sjukdom - en hjärnsjukdom

Läkemedelsprövningar och slutsatser

Kalcium och nervceller

Fosfodiesterashämmare: nya läkemedel når kliniska prövningar inom kort Fosfo-di-vadå? fosfodiesterashämmare

Det magiska med färgat ljus

Huntingtons sjukdom forsknings nyheter. I klartext Skriven av forskare För de globala HS medlemmarna Huntingtons sjukdom - ett år av forskning

Huntingtons sjukdom forsknings nyheter. I klartext Skriven av forskare För de globala HS medlemmarna. EuroBuzz 2014: dag ett

Huntingtons sjukdom forsknings nyheter. I klartext Skriven av forskare För de globala HS medlemmarna. Att få barn: bilda familj

Lördag, 15 september 2012

HDYO har mer information om HD för ungdomar, föräldrar och yrkesverksamma på vår webbplats:

Vad händer i ett genetiskt laboratorium?

Genetisk testning av medicinska skäl

Regression med Genetiska Algoritmer

Ärftliga sjukdomar och egenskaper hos hund

Mutationer. Typer av mutationer

Information och samtyckesformulär inför genomisk utredning av ovanliga sjukdomar och syndrom med metoderna genomisk array och exomanalys

Situationen för yngre med demenssjukdom på Åland 2015 & Huntingtons sjukdom - en översikt

Tack. Eira-studien. Vi vill med denna broschyr tacka Dig för Din medverkan i vår studie över orsaker till ledgångsreumatism!

Deepti vill flytta fokus från huden

Under höstterminen 2015 arbetade lärare på mellan- och högstadiet på

Inbjudan till konferens för ungdomar/ unga vuxna berörda av Huntingtons sjukdom Dalheimers hus, Göteborg mars, 2014

Kopian Oskar 1.0 LÄSFÖRSTÅELSE. Elevmaterial SANDRA SCHWARTZ SIDAN 1. Namn: Utvald. Frågor på raden (Du hittar svaret på raden, direkt i texten.

En bioinformatisk genjakt


Svensk författningssamling

Regionala riktlinjer för utredning av patienter med misstänkt ärftlig demens i Region Skåne

Tolkning av resultat för genetiskt test av LPN1

Genetik en sammanfattning

Sjukvårdsperspektivet

Delprov 3 Vetenskaplig artikel

Datorer och matematik hjälper oss att motverka sjukdomar

Henrik Brändén. bioscience explained Vol 3 No 1. Undersökning av influensavirus med hjälp av släktträd. Vetenskapsrådet Stockholm Sverige

Cancer som en ämnesomsättningssjukdom del 1

Patientdatalag (2008:355)

Är det några som inte känner varandra i gruppen är det bra att hitta ett sätt att presentera deltagarna. Här kommer några förslag:

Olika perspektiv. Resurser

Datorer och matematik hjälper oss att motverka sjukdomar

MOD Tippan provar på en ny hobby, även om hon är jättenervös i början.

PROV 6 Bioteknik. 1. Hur klona gener med hjälp av plasmider?

Medicinsk genetik del 3: Könsbunden nedärvning av färgblindhet och blödarsjuka. Niklas Dahrén

ENKEL Programmering 3

Genetik. - cellens genetik - individens genetik. Kap 6

Pankreas är ett svåråtkomligt. organ som ligger bakom magsäck. funktion är att tillverka. matsmältningsenzym. Dessa. förs ut genom pankreas

EHDN Plenary Meeting Barcelona september 2014

Genetik, etik och samhälle Genetiska tester och vad händer sen?

Diabetes i media. -tips till dig som skriver om diabetes

Diagnosticera cystisk fibros med DNA-analys. Niklas Dahrén

Denna pdf-fil är nedladdad från Illustrerad Vetenskaps webbplats ( och får ej lämnas vidare till tredjepart.

Satsa på omvårdnadsforskning för att förbättra vården

A-vitaminbehandling vid RP

HDYO har mer information om HD för ungdomar, föräldrar och yrkesverksamma på vår webbplats:

Pass 2: Datahantering och datahanteringsplaner

FINLAND I EUROPA 2004 UNDERSÖKNING

Tankar om elevtankar. HÖJMA-projektet

Ataxier Vad händer i nervsystemet? Sakkunnig: docent Tor Ansved, specialist i neurologi och klinisk neurofysiologi, Läkarhuset Odenplan, Stockholm

Spelutveckling - Gameplay. Design och produktion

HUGO-projektet. Kartläggningen av det mänskliga genomet

OBS! Under rubriken lärares namn på gröna omslaget ange istället skrivningsområde.

Det finns flera böcker om Lea. Du kan läsa dem i vilken ordning som helst! De böcker som kommit ut hittills heter Lea, Lea på läger och Lea, vilse!

Genetik - Läran om det biologiska Arvet

Den enkla guiden till ert nya kontor

Mäns upplevelse i samband med mammografi

10 tips för ökad försäljning

Lutande torn och kluriga konster!

Vinnare Barnnefrologiverksamheten, Verksamhetsområde barnmedicin Skånes universitetssjukhus

Episoderna i denna artikel är hämtade

Vanliga familjer under ovanliga omständigheter

Hundar hjälper oss att förstå människans sjukdomar. Kerstin Lindblad-Toh

Hälsopartiet 2014 översikt av svaren

Exempel på observation

En vetenskaplig uppsats

Att leva med ME/CFS. STEG-FÖR-STEG-FÖRBÄTTRING av Diane Timbers

Atomer, molekyler, grundämnen. och kemiska föreningar. Att separera ämnen. Ämnen kan förändras. Kemins grunder

Bipolär sjukdom. Läs- och länktips. Böcker. Sjukhusbiblioteket/PIL

Epidemiologi/ Evidensbaserad medicin Del 4

Referat från Claire Rusbridges föredrag om SM

Vad handlar boken om?

Multipel tilldelning. Introduktion till programmering D0009E. Föreläsning 6: Iteration. while-satsen. Kom ihåg. Snurror kontra rekursion

Med hopp om framtiden transposoner, DNA som flyttar sig själv

År 2011 skrev man fram bildämnet som ett kommunikationsämne i den nya läroplanen.

IBSE Ett självreflekterande(självkritiskt) verktyg för lärare. Riktlinjer för lärare

OTW UTBILDNING SÅ BESTÄLLER DU EN BRA KURS

Resultatnivåns beroende av ålder och kön analys av svensk veteranfriidrott med fokus på löpgrenar

Kristen etisk front. i samarbete med Vetenskapsrådet 13. Rollspelet om etik & genetik Bilaga 6

Regionala riktlinjer för utredning av patienter med misstänkt ärftlig demens

LnuOpen Open Access-tidskrifter och konferenspublikationer från Linnéuniversitetet

Sammanfattning Arv och Evolution

Feedbackfrågor för personlig utveckling.

DEMENS. Demensstadier och symptom. Det finns tre stora stadier av demens.

Handbok Kanagram. Danny Allen Översättare: Stefan Asserhäll

Föreläsning 3.1: Datastrukturer, en översikt

Rapport för Andrew Jones

Uppgift 1 (grundläggande konstruktioner)

Störningar i ureacykeln och organiska acidurier För barn och ungdomar

Nej, farfar. Det är en mus, inte en elefant! GRÅ STARR KATARAKT. Hindrar din grå starr dig från att se livets alla små underverk?

Kimmo Eriksson Professor i tillämpad matematik

Implementering hur gör man (inte)?

VI LÄR DIG MER OM. Makuladegeneration. [förändringar i gula fläcken]

Vad är en genetisk undersökning?

Transkript:

Huntingtons sjukdom forsknings nyheter. I klartext Skriven av forskare För de globala HS medlemmarna. Ny analys visar att den korta CAG-längden inte spelar roll Storleken är inte allt: forskning tyder på att bara den långa, inte den korta kopian av Huntingtongenen som spelar ro Av Dr Ed Wild på 7 juli 2012 Redigerad av Dr Jeff Carroll ; Översatt av Dr Jimmy Sundblom Först publicerad den 18 februari 2012 Huntingtons sjukdom orsakas av att en av de två kopiorna av Huntingtongenen är större än normalt. Huruvida den mindre kopian spelar någon roll har diskuterats en hel del. En färsk analys av stora mängder data tyder på att den korta kopian inte påverkar när sjukdomen bryter ut. Vad är repetitionslängd? När den felaktiga genen som orsakar Huntingtons sjukdom upptäcktes 1993, var en detalj som stack ut att det inte bara var ett vanligt stavfel. De flesta genetiska sjukdomarna orsakas av enkla felstavningar i vår genetiska kod - en enda av de kemiska baser som utgör vårt DNA är ändrad, borttagen eller tillagd. Vid Huntingtons sjukdom, är förändringen mer som en kemisk stamning. Nära början på Huntingtongenen finns en sekvens av bokstäver - CAG - som upprepas ett antal tillfällen - vanligtvis mellan tio och Den kortare varianten av en persons två CAGrepetitionslängder tros inte längre påverka när symptomen bryter ut 1 / 6

tjugo gånger. Teamet som upptäckte mutationen insåg att alla med Huntingtons sjukdom hade en ovanligt lång sådan här sekvens - trettiosex eller fler. Alla har två Huntingongener Vi har alla två kopior av Huntingtongenen - en som vi ärvt från mamma, den andra från pappa. Det krävs bara en förlängd sådan för att man ska få sjukdomen. Vi kallar antalet CAG-upprepningar i vardera kopia för CAGrepetitionslängd, och alla har två repetitionslängder. De flesta har två normala repetitionslängder. De flesta med Huntingtons sjukdom har en normal och en expanderad repetitionslängd. Väldigt få har faktiskt två expanderade repetitionslängder. Storleken spelar roll Innan vi ger oss in på själva nyheten, ska vi bara kika på vad som inte har förändrats. Ganska snart efter att mutationen upptäcktes, märkte forskare att personer som drabbades av Huntingtons sjukdom i unga år tenderade att ha längre repetitionslängder i den expanderade kopian. När man undersökte detta noggrant, fann man att längden på den expanderade/muterade kopian hade stor betydelse för när symptomen debuterade och hur snabbt de förvärrades. Ju längre repetitionslängd, desto tidigare drabbades man av sjukdomen. Detta förklarade inte allt - repetitionslängden i sig kunde inte användas för att förutsäga när symptomen skulle uppträda. Det fanns fortafarnde en hel del variation som inte berodde på repetitionslängden i det expanderade kopian. 2 / 6

I många år har man nu försökt identifiera vad som orsakar resterande variation. Är det kost, livsstil, läkemedel eller andra gener förutom Huntingtongenen? Vi vet ännu inte svaret. De korta repetitionslängden Naturligtvis har forskare funderat på om skillnader i den korta Huntingtongenen kan förklara varför personer med lika stora expansioner i den långa kopian kan få symptom vid helt olika tidpunkter. Men när olika Tillbaks till enkelheten: en persons större CAGlängd påverkar debuten, men den korta verkar inte spela roll 2009 undersökte nederländska forskare data från nästan tusen patienter forskarlag tittade på effekten av den korta kopian fick de olika resultat. som deltog i den jättelika REGISTRY-studien. Som man förväntade, var den långa kopians CAG-repetitionslängd den viktigaste faktorn som påverkade när en person drabbades av sjukdomen. Inga överraskningar. När de tittade på den korta kopian upptäckte de däremot något oväntat. För de flesta, verkade det vara bra föpr hjärnan om den korta kopian var speciellt kort. För personer med speciellt långa expanderade kopior, gällde det omvända däremot - det var bättre om den andra repetitionslängden var i den högre delen av normalintervallet. Alltså, om en persons längre repetitionslängd var 41, verkade det vara bättre om den andra repetitionslängden var 12 istället för 20. Men om de hade en väldigt lång expanderad kopia - med en repetitionslängd på till exempel 60 eller 70 - så verkade det av någon orsak vara bra om den korta repetitionslängden var 20 istället för 12. Konstigt - men uppenbarligen övertygande bevis för att båda CAG-längder betyder någonting. 3 / 6

Sakta i backarna! Om det här med små och stora siffror verkar knepigt att hänga med i - koppla av! Tack vare en ny studie som publicerats i tidskriften Neurology, har det blivit lättare att hänga med. Ett forskarlag lett av Jim Gusella vid Massachusetts General Hospital i Boston genomförde en ännu större studie, med över 4000 deltagare från REGISTRY, COHORT och PREDICT-studierna. Den här innehöll alla data från studien från 2009 - och en hel del nya data också. Gusella ville gå tillbaks till ritbordet, så de ifrågasatte allt när det gällde de statistiska modeller som tidigare hade använts. Deras resultat är lite nördiga men rätt intressanta. När statistikgalningar analyserar data, måste de göra vissa antaganden för att kunna använda matematiska modeller för att göra förutsägelser.. Vanligtvis är det helt OK, eftersom stora mängder data brukar bete sig som förväntat. I det här fallet däremot, Hittade de ett antagande som inte var korrekt. Framför allt, insåg de att en enda ovanlig patient - men en väldigt hög repetitionslängd på den expanderade kopian på 120, och en väldigt låg, 11, på den andra - var orsaken till att man såg den övergripande effekten av den korta kopians längd. När de analyserade alla data igen, men tog bort den enskilda personen, hittade de ingen effekt av den korta kopian. Det enda som spelade roll var längden på den långa kopian. Börja om från början Bekymrade över att en enstaka individ kunde ha så vilseledande effekt på en samling bestående av närapå tusen personer, satte Gusellas grupp igång med att designa en statistisk modell för att titta på deras stora material, vilken skulle påverkas mindre av enstaka extremfall såsom detta. 4 / 6

Vad de fann var rätt förtröstansfullt. Det fanns ingen effekt beroende på den korta kopian, inte heller några tecken till att den långa och korta kopian interagerade på något sätt. Till och med i de tio individer med abnormt långa repetitionslängder i den expanderade kopian, var den enda faktor som påverkade debutåldern den långa kopians längd. Åter alltså till den relativt lättbergipliga situation som rådde tidigare: den långa CAG-längden påverkar Gusellas grupp återvände till ritbordet för att designa nya, pålitliga sätt att studera hur genetiska faktorer påverkar Huntingtons sjukdom symptomdebuten, men inte så starkt att man kan göra förutsägelser för individuella patienter. Samtidigt verkar inte den korta kopian spela någon roll alls. Framgång eller bakslag? Det här kan man såklart se som ett bakslag: någonting vi trodde vi visste stämmer inte längre. Vi tycker annorlunda. Vi tror att det viktigaste är att ta reda på sanningen om vad som orsakar Huntingtons sjukdom, även om det betyder att vi måste ifrågasätta även de mest grundläggande antaganden. Egentligen var fynden från 2009 om att den långa och korta kopian samverkar lite obekväma, och svåra att förklara med vad vi vet om det muterade huntingtinproteinet (äggviteämnet som tillverkas utifrån Huntingtongenen). Nu när vi vet att den korta kopians längd återgått till sin obskyra tillvaro har vi ju faktiskt en sak mindre att oroa oss för. Vi kan dessutom vara säkra på att statistiken bakom våra antaganden är korrekt. 5 / 6

Ytterligare ett plus med den här studien är att vi nu har nya, mer pålitliga matematiska instrument för att titta på de genetiska olikheter som kanske kan påverka symptomdebuten. Eftersom stora studier pågår, där man letar igenom hela det mänskliga genomet (alla människans gener) för att hitta gener som påverkar symptomdebuten, så kommer dessa metoder med all säkerhet att vara mycket värdefulla inom kort. Det är ett väldigt bra exempel på det som vi påpekat tidigare: vetenskap är en kumulativ process. Varje dag lär vi oss lite mera om Huntingtons sjukdom. Och för varje dag kommer vi närmare en effektiv behandling. Författarna har inga intressekonflikter att uppge. För mer information om vår informationspolicy se våra FAQ HDBuzz 2011-2015. Innehållet på HDBuzz är fritt att dela,under en licens Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License. HDBuzz är inte en källa för medicinska råd. Mer information tillgänglig från hdbuzz.net Skapad 4 oktober 2015 Nedladdad från http://sv.hdbuzz.net/073 6 / 6