KOMMENTARER TILL KAPITEL 6

Relevanta dokument
KOMMENTARER TILL KAPITEL 6

Cellen och biomolekyler

NAMN:. PERSON NR:.. TERMIN DÅ KURSEN LÄSTES:

Tentamensmoment: Rättningspoäng:...av max 25 p. Namn:. Pnr:. Betyg:... Distanskurs. Lärare: Malte Hermansson

Övningstentafrågor i Biokemi, Basåret VT 2012

Fråga 3 Varje korrekt besvarad delfråga ger 0,4 p. Det är inget avdrag för felaktigt svar. (2p) En organism som bara kan växa i närvaro kallas

Biologi. Läran om livet. En naturvetenskap. Terminologi ett viktigt verktyg Var behöver vi biologi?

Så började det Liv, cellens byggstenar. Biologi 1 kap 2

Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p,

Kemiska reaktioner och reaktionshastigheter. Niklas Dahrén

Cellens metabolism (ämnesomsättning) Kap8 Sidor i boken Enzymer: Metabolism: , , ,257,

Energi, katalys och biosyntes (Alberts kap. 3)

KOMMENTARER TILL KAPITEL 9 OCH KAPITEL 16

DEN MINSTA BYGGSTENEN CELLEN

Biomolekyler & Levande organismer består av celler. Kapitel 3 & 4

LIVSMEDELS MIKROBIOLOGI

Biologi 2. Cellbiologi

Medicinsk grundkurs. Cellen och genetik. Datum

Cellens metabolism (ämnesomsättning)

Översikt metabolismen

Prokaryota celler. Bakterier och arkéer

Tenta i växtfysiologi (BL3005)

PROVGENOMGÅNG AVSNITT 1 BIOLOGI 2

Fig 1-29 Alla celler har utvecklats från samma urcell för ca 3,5 miljarder år sedan Fem kungadömen och Tre domäner

RÖTNINGENS MIKROBIOLOGI NÄRINGSLÄRA BIOGASPROCESSEN PROCESSDRIFTPARAMETRAR PROCESSTÖRNING

KOMMENTARER TILL KAPITEL 1, 2, 11

Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Fråga 1 (2p) Fråga 2 (2p) Fråga 3 (2p)

Cellbiologi. Cellens delar (organeller)

Tentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Fråga 1 (2p) Fråga 2 (2p) Fråga 3 (2p)

Innehåll. Cellfysiologi och mikrobiologi. Humana cellers storlekar. Cellmembranets uppbyggnad Ambulans- och akutsjukvård

Välj rätt typ av bakteriepreparat vid ensilering av din vallgröda

Dessa bildar i sin tur stärkelse som växten lagrar som näring.

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT PROTEINER OCH ENZYMER (sid )

lördag den 4 december 2010 Vad är liv?

Användning av kol och energikällor

Hur celler får energi från föda (Alberts kap. 13) Introduktion

NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra

Biogasanläggning Energibesparing med avloppsvatten Peter Larsson ver 2

Tentamen i Molekylär Cellbiologi 9 p Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Helsingfors universitet Urvalsprovet Agrikultur-forstvetenskapliga fakulteten

Enzymer Farmaceutisk biokemi. Enzymet pepsin klyver proteiner i magsäcken till mindre peptider

BASÅRET KEMI B BIOKEMI VT METABOLISM (sid )

Lite basalt om enzymer

10:40 11:50. Ekologi. Liv på olika villkor

Område: Ekologi. Innehåll: Examinationsform: Livets mångfald (sid ) I atomernas värld (sid.32-45) Ekologi (sid )

Tentamen. Kurskod: MC1004. Medicin A, Molekylär cellbiologi. Kursansvarig: Christina Karlsson. Datum Skrivtid 4h

Tentamen i Cellbiologi:prokaryota fredagen den 13 januari 2012

HELSINGFORSREGIONENS UTBILDNINGSPROGRAM I BIOTEKNIK 1 URVALSPROVET Efternamn Förnamn Personbeteckning

Cellbiologi. Cellens delar (organeller)

Kapitel Var är vi i kursen???

Citronsyracykelns reaktioner sker i mitokondriematrix. Mitokondrierna kan sägas vara cellens kraftstationer p g a den stora produktionen av ATP.

onsdag 9 oktober 13 Ekologi

Den allra första cellen bakteriecellen prokaryot cell

Omtenta NMET2 (datum 4/2 2012) (totalt 63 p)

Sockrets funktionella egenskaper

Resultat:... (Cellbiologi:... Immunologi...) Betyg...

KOMMENTARER TILL KAPITEL 7 OCH 8. Den centrala dogmen är gemensam för eukaryoter och prokaryoter.

Driftoptimering hur säkerställer vi att vi gör rätt? Upplägg. Förutsättningar för en bra gasproduktion. Vem är jag och vad sker på SLU?

KOMMENTARER TILL KAPITEL

Laboration Enzymer. Labföreläsning. Introduktion, enzymer. Kinetik. Första ordningens kinetik. Michaelis-Menten-kinetik

BIOLOGI. Vår fantastiska kropp

Inverkan av kylningsförloppet på tillväxt av bakterier i gårdstankmjölk.

Skrivet av: Anders Flodberg Galoppkurs

Olika celltyper Indelningen av organismvärlden. Kap 2 s34-38, kap 3 sid i boken

Delprov l, fredag 11/11,

Fotosyntes i ljus och mörker

KEMA02 Föreläsningsant. F2 February 18, 2011

Biologi är läran om livet. Vad är liv?? Alla organismer (levande varelser) har DNA

Studier av tillväxt, reproduktion, ämnesomsättning, utveckling, sjukdomar, ekologi och evolution av växter.

Intermolekylära krafter

Felveckning och denaturering av proteiner. Niklas Dahrén

När man pratar bakterier förknippar man det oftast med något negativt. Det finns många för oss positiva och livsnödiga bakterier.

Cellbiologi: Intracellulär sortering och cellsignalering

Användning av fungicider på golfgreener: vilka risker finns för miljön?

Vad är liv? Vad skiljer en levande organism från en icke-levande?

Tentamen i Molekylär Cellbiologi 9 p Namn: Personnummer: Plats nr: Inlämnad kl: ID kollad: Poäng: Betyg:

Lärare: Jimmy Pettersson. Kol och kolföreningar

1. a) Markera polära och icke-polära delar i nedanstående molekyl. Vilken typ av ämne är det, och vad heter molekylen? (2p)

Cellbiologi. Maria Ankarcrona Nov 2010

Mikroorganismernas storlek och snabba förökning medför, att de kan uppnå stort antal i livsmedel under för mikroorganismerna gynnsamma betingelser.

Sterilisering. Desinfektionsmedel. Joniserande. Torrvärme. Ånga. - Djupfilter. - Strålning - Tryck. Endosporer (Bacillus, Clostridium, m.fl.

Info r prov i cellbiologi Biologi B

Skrivning i termodynamik och jämvikt, KOO081, KOO041,

Isomerer. Samma molekylformel men olika strukturformel. Detta kallas isomeri. Båda har molekylformeln C 4 H 10

Preparation och spektroskopisk karakterisering av Myoglobin

Biologiska membran Kap 10 fig10-1, 15, 18, 19 & med tillhörande beskrivningar. Övrigt är repetition.

Intermolekylära krafter

EKOTOXIKOLOGISK TEST PÅ VATTEN TILLSATT PESTICIDER

Från DNA till protein, dvs den centrala dogmen

Vem tänder på flisstackar?

Lärarhandledning gällande sidorna 6-27 Inledning: (länk) Läromedlet har sju kapitel: 5. Celler och bioteknik

samspel Fotosyntes och cellandning Äta och ätas Konkurrens och samarbete

Förra föreläsningen Introduktion - Principer

05/12/2014. Övervakning av processen. Hur vet vi att vi har en optimal process eller risk för problem? Hämning av biogasprocessen

Vilka ämnen finns det i maten och hur använder kroppen dem?

Kväve Metabolism. Elin Johansson, Maria Grahn och Beatrice Lundin. KE0026 Stefan Knight

Vad gör växten med vattnet?

Transkription och translation. DNA RNA Protein. Introduktion till biomedicin Jan-Olov Höög 1

Bröstmjölkens sammansättning och rekommendation. Elisabeth Kylberg 2011

Elektrolysvatten. Miljövänlig teknologi för vattenrening,desinfektion och sterilisering

Transkript:

KOMMENTARER TILL KAPITEL 6 Skilj mellan tillväxt av en enskild cell och tillväxt av en population av celler. Vid tillväxt av en enskild cell ökar dess storlek och vikt vilket oftast är ett förstadium till själva celldelningen. Tillväxt av en population resulterar i att antalet celler ökar. Studier av tillväxt av mikroorganismer innebär i de flesta fall populationsstudier individuella variationer förbises. De flesta bakterier förökar sig genom enkel tudelning, jfr fig. 6.1, enl: 1 2 4 8 2 n Om - n = antal generationer; N = antal bakterier; N 0 = antal bakterier från början erhålls följande ekvation: N = N 0 2 n - exponentiell tillväxt g = t/n; g = generationstiden; t = tid (timmar eller minuter av exponentiell tillväxt) TILLVÄXTKURVA FÖR BAKTERIER När man beräknar tillväxt av bakterier använder man sig oftast av ett slutet system - en batchodling = satsvis odling. Man ympar (inoculate) då en kolv med näringsmedium med en renkultur av bakterier. Därefter inkuberar man kolven vid en lämplig temperatur. Prov ur kolven tas vid lämpliga tidpunkter. Log N II III IV I Tid N = antal levande bakterier

Olika faser i tillväxten: I: Lagfas. Anpassningsfas. I denna fas ökar inte antalet bakterier utan det sker endast en ökning av cellvolymen. Bakterierna anpassar sig till det näringsmedium som de har ympats till. De gör sig också av med slaggprodukter. II: Exponentiell fas. Här sker det en exponentiell ökning av antalet bakterier. Endast i denna fas kan man beräkna tillväxthastighet och generationstid. III: Stationär fas. I denna fas är antalet bakterier oförändrat - lika många celler dör som nybildas. Här är det maximala cellutbytet. Ympen består i de flesta fall av bakterier som befinner sig i den stationära fasen. Övergången från exponentiell fas till stationär fas kan ha flera orsaker. Det kan ha bildats slaggprodukter som hämmar tillväxten, något näringsämne har blivit begränsande etc. IV: Avdödningsfas. Energikällan är slut. Avdödningen är till en början ofta exponentiell. Om tillväxtmediet är lämpligt sker en balanserad tillväxt, vilket innebär att alla cellkomponenter kan användas för beräkning av tillväxthastighet i den exponentiella fasen. Tillväxtkurvans utseende varierar beroende på vilken typ av cellräknings-metodik man har använt. Observera att fig. 6.8 inte är helt riktig. I den röda kurvan där man har räknat antalet levande celler (viable count) saknas lagfasen. För den gröna kurvan har man använt celltätheten, mätt med en spektrofotometer, som cellräkningsmetodik. Med denna metodik kan man inte skilja mellan levande och döda celler och av denna anledning är det svårt att se någon nedgång i avdödningsfasen (även döda celler absorberar ljus). Stationärfasen bör också luta svagt uppåt av denna anledning. Fig 6-2 och 6-3 visar hur själva celldelninen går till: FtsZ finns i alla prokaryoter och i mitokondrier & kloroplaster Strukturlikhet med tubilin; celldelningsprotein hos eukaryoter FtsZ binder till cellens mitt och polymeriseras till en ring runt cellen FtsZ-ringen attraherar andra enzymer och bildar en divisome Divisomen syntetiserar cellvägg & membraner tills cellen är dubbelt så stor FtsZ ringen krymper och formar ett septum Till slut bryts ringen ner och cellen delas

OMGIVNINGSFAKTORERS INVERKAN PÅ MIKROORGANISMER Temperatur En av de faktorer som påverkar mikroorganismer mest. Bakterier som grupp tål större miljövariationer än andra grupper av organismer. I det här sammanhanget är det viktigt att skilja mellan överlevnad och tillväxt. Brett område inom vilket mikroorganismer kan växa -4 o C - drygt 100 o C. Undre gräns: Fryspunkt för intracellulärt vatten + salter. Övre gräns: Denaturering av proteiner, nukleinsyror etc. En enda mikroorganism kan inte växa i hela spannet. För en enskild bakterie är spannet ca 30-40 o C. Tillväxten styrs av en mängd enzymatiska reaktioner. Mikroorganismer har en minimitemperatur, en optimumtemperatur och en maximumtemperatur. Kardinaltemperaturer. Tillväxthastigheten minskar snabbt vid temperaturer över optimumtemperaturen optimum- och maximumtemperaturen ligger nära varandra, jfr fig. 6.16. Minimitemperaturen beror på transitionstemperaturen för membranet. Fluiditeten minskar vid sjunkande temperatur - bakterien kompenserar detta genom att öka mängden omättade fettsyror - till slut övergår membranet i ett kristallint stadium transport ej möjlig. Elektrontransportkedjan fungerar ej. Det sker en försvagning av hydrofoba bindningar i proteiner + förändring av proteinkonformationen. Allosteriska proteiner är köldkänsliga. Maximumtemperaturen beror på stabiliteten hos proteiner - katalytisk eller strukturell. Dessutom har membranlipiderna betydelse. Kardinaltemperaturerna är karaktäristiska för en bakterie men är inte helt fixa - kan förändras av faktorer i omgivningen. Psykrofiler uppvisar en hög halt av omättade fettsyror för att göra membranet mer rörligt medan termofiler har en hög halt mättade för att stabilirera.

Prokaryoter kan växa vid högre temperaturer än eukaryoter. Mindre strukturellt komplex organismer kan växa vid högre temperaturer än mer komplexa organismer. Icke-fotosyntetiserande organismer kan växa vid högre temperaturer än fotosyntetiska. ph På samma sätt som för temperatur har mikroorganismer ett ph-spann för tillväxt samt ett ph-optimum. De flesta bakterier trivs bäst runt ett neutralt ph. Jästsvampar trivs bäst vid ett lägre ph (4.7-6.0) och mögelsvampar vid ett ännu lägre ph (3.9-6.0). Vattenaktivitet Vatten är den viktigaste beståndsdelen i celler - stora vattenkrav. En cells vattenbehov beskrivs ofta mha vattenaktiviteten i det medium där cellerna befinner sig. a w : Mått på tillgängligt vatten. Dest.vatten: a w = 1.0 De flesta bakterier: a w > 0.9 Svamp växer vid lägre a w än bakterier Jästsvampar: a w 0.88 Mögelsvampar: a w 0.80 Salt och socker sänker vattenaktiviteten Vissa bakterier kan öka sin interna saltkoncentration för att kunna ta upp vatten (ersätter H 2 O). Kräver energi. En del organismer bättre än andra kan växa vid låga a w.

Halofila bakterier: a w 0.75 Ändring av koncentrationen lösta ämnen ändrar också det osmotiska trycket. Cellväggen utgör ett skydd mot förändringar av det osmotiska trycket. Ämnen som pumpas in i cellen eller syntetiseras inne i cellen som svar på sänkt vattenaktivitet kallas compatible solutes (den engelska benämningen används i detta fall) Ex. Compatible solutes, jfr tabell 6.3 1. Halobacterium - ökar K + -koncentrationen inne i cellen 2. Vissa osmotoleranta jästsvampar syntetiserar polyalkoholer (ex. glycerol, ribitol och arabinitol). 3. Den halofila algen Dunaliella syntetiserar glycerol. Gasmiljö CO 2 Måste ibland tillföras för att stimulera tillväxten - speciellt autotrofer. O 2 Se fig 6.25 som är mycket pedagogisk Obligata aeroba organismer - många bakterier, de flesta svampar, protozoer, alger. Fakultativt anaeroba organismer - vissa bakterier och jästsvampar. Växer både med och utan syre, men har ett högre energiutbyte med syre, därför är det kraftigare växt vid ytan i rör c. Obligata anaeroba organismer - vissa bakterier. Mikroaerofila bakterier - växer vid låga O 2 -koncentrationer Aerotoleranta bakterier t ex mjölksyrabakterier. Använder inte O 2 men är inte heller känsliga mot det., växer lika bra i hela röret (e).

Varför tål inte alla organismer syre? Vid reduktionen av O 2 till H 2 O bildas det flera intermediära former t ex superoxidanjon(o 2.- ) och väteperoxid(h2 O 2 ) O 2 + e - O 2.- O 2 + 2 H + + 2 e - H 2 O 2 Både O 2.- och H2 O 2 är kraftiga oxidationsmedel och O 2.- kan dessutom förorsaka lipidperoxidationer H 2 O 2 och O 2.- kan vidare reagera enligt: H 2 O 2 + O 2.- O2 + OH. + OH - Exakt hur denna reaktion sker vet man inte men den katalyseras troligen av metalljoner (järnkelater). OH. kan skada nästan alla molekyler som finns i levande celler t ex hydroxylera purin- och pyrimidinbaser i DNA mutationer Enzymet katalas omvandlar H 2 O 2 till H 2 O och O 2, jfr fig. 6.28 Enzymet superoxiddismutas kan omvandla superoxidanjonen, jfr fig. 6.28 Obligata anaeroba bakterier saknar båda dess enzym. Vissa fakultativt anaeroba organismer samt aerotoleranta organismer saknar katalas (kan ha peroxidas istället) ev. klarar cellen låga halter av H 2 O 2. Syre är energimässigt den bästa elektronacceptorn men är farlig i det att den ger radikaler som bryter ner proteiner och DNA. Dessa skador på celler gör att de åldras.